1CJ7A

T11v mutant human lysozyme
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARVLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Contribution of intra- and intermolecular hydrogen bonds to the conformational stability of human lysozyme(,).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1cj7A00
4HP0A 3WVXA 2BPUA 4DT3A 2YBLA 4DD3A 2BLXA 1C46A 1IIZA 1HERA 3CT5A 1HC0A 4ETCA 3D9AC 4R0FA 1CNSA 3A93A 3RNXA 1UC0A 3CSQA 1GXXA 2BQBA 5B1FA 1D9UA 2BAAA 2D6BA 4WLYA 3N9EA 1TCYA 5EBHA 1UIHA 4XYYA 1IR7A 2FYCA 1GEVA 3QE8A 1LPIA 1REZA 4B1AA 1TBYA 4NGLA 4YEMA 4HJYA 4HTKA 1B5XA 2LYZA 3TXBA 4DWXA 1LKRA 1TEWA 1IP6A 1GF5A 1B7OA 1HEMA 3AW6A 4OOOA 4DD1A 4DYGA 5LYZA 1LHIA 3WPJA 4UWNA 4GCBA 1GFEA 1LTMA 3WW6A 4TWSA 1DPXA 3EBAB 4I0CA 1BB4A 1YKZX 2LZ2A 4OWAA 5APCA 1OUEA 2DQFC 4XADA 4BADA 4ZEEA 1GB6A 2EPEA 2YBNA 1XGQC 1IR8A 4B4EA 3AGHA 2BQOA 1J1XY 1DKKA 1REMA 2HUBA 3P4ZA 4DD7A 1KIQC 1RE2A 2CJLA 2HEEA 4FDYA 4NHSA 1UICA 3CT0A 4LGKA 1QSAA 4NHPA 2CWIA 5HMVA 1QUSA 2MEEA 3B0IA 1HMLA 1DKJA 2YDGA 3J4GA 3IWRA 4QY9A 1GBYA 1GF8A 1LKSA 4IJ4A 1IO5A 2W1MA 4DD2A 5FCPA 4J0LA 5LVGA 1GFUA 1QTEA 3ULRA 134LA 1CJ8A 3B6LA 1LCNA 4GLAA 4XJBA 4AXTA 4XENA 2BQJA 3AW7A 3D3DA 3CT1A 4B4IA 1LZGA 1DI3A 1LJ3A 5B1GA 1NMMA 2MEBA 4PGJB 4HJZA 4ANRA 4QGZA 1IX0A 4H9BA 2C8PA 1JSEA 1ZMYL 4QEQA 5B05A 1JUGA 1SLYA 4GN3A 4OOTA 1RCMA 3B0OA 1GB2A 1UA6Y 4WM1A 3WPKA 1LZ9A 1VAUA 1H87A 4HV2A 5KXOA 1QSWA 2HEAA 3A90A 4WLXA 4WM3A 5C6LA 2N5ZA 2ZQ3A 4TSBA 1GBXA 5FDJA 1G7JC 4CHXA 5LXWA 5DN5A 1V7SA 1UIAA 1VDSA 1B7SA 1NF5A 2DQEY 4RLMA 5B07A 2BQEA 1G7MC 1KIPC 4ETAA 1T6VL 1P2CC 4GN5C 3WUNA 1FDLY 1B7PA 5KY1A 1B7QA 5F81A 1KXYA 4ETEA 1HF4A 5F14A 1GFAA 3AZ7A 4B49A 1LZNA 4OWBA 1C43A 1I20A 5E4PA 2BQHA 5I5QA 1C7PA 1YROA 1GAYA 2HEBA 1LZTA 3SP3A 1LSAA 1WTMA 3CQLA 3VWOA 1LSEA 4Z41A 3BKHA 2XBRA 2AUBA 3WU9A 1YANA 4LT1A 1AKIA 1HELA 4G49A 2I6ZA 5DLAA 1GFTA 9LYZA 4CJ2A 3HFMY 4DD9A 1UUZC 1UIGA 1JHLA 3TXGA 5JENB 5L3HA 1BWIA 3B72A 2DQAA 2DKVA 1BB3A 4NG8A 2YBIA 2F2NA 1D6QA 2DBTA 2HTXA 3BKVA 4NWHA 3FI7A 4N9RA 3HBEX 3IJUA 1LSZA 5HMJA 3ZEKA 1UIFA 3A96A 4H8ZA 1IP1A 4EMNA 5C6JA 1BVXA 3M3UA 1JKBA 1B7NA 3G3BB 1EQEA 1IWWA 3FE0A 1C45A 1GB7A 4NWEA 4KT3A 4NHIA 4OWCA 3LN2A 5F9UA 1LZEA 1CKHA 1LZ8A 2DQDY 1LJKA 4H9AA 1JTPL 1MLCE 5L9JA 1XEKA 1AT6A 1JKAA 1GE1A 2BQIA 1GF7A 1FLUA 4LZTA 1HSWA 5DL9A 1B5VA 5FSTA 3WUMA 3CSZA 5KJ9A 2EQLA 1GB0A 2Z39A 1B5YA 3G3AB 5LYTA 1YKXX 1LSBA 5KXPA 5M1YA 2F30A 1YILA 5APDA 2HECA 2BLYA 4NGIA 1YKYX 4NEBA 2YVBA 1BHZA 1EL1A 4N1EI 3W6BA 1LHHA 4PHIA 1F6RA 3T6UA 3A67Y 4HV1A 4C3WA 1I56A 1H6MA 4TTDA 1TAYA 3ATNA 1JSFA 4NGVA 5KXXA 1OQMA 1LJGA 4YEOA 1HFYA 2BQLA 1IOCA 1B9OA 1BWJA 1IWTA 4NSHA 4NY5A 1AT5A 2G4PA 1B2KA 1XEJA 1UACY 3HBDA 4LFPA 2A7DA 1XSFA 3P66A 4H1PA 4WLTA 4UWUA 1YAPA 4UWVA 4W96A 4J1BA 5D5FA 5IDDA 3RZ4A 2GV0A 4LT0A 1FLYA 1YAQA 3LHMA 4LYMA 3TXEA 3W6FA 1WVUA 5KKJA 4WO6A 1NDGC 1OUHA 1LMPA 3QY4A 1WVVA 1GWDA 2IFFY 4WLDA 1JISA 1C10A 1HENA 1DPWA 3LYTA 4TSCA 1IWZA 1IOTA 1G7LC 1GB8A 3TMXA 5A3EA 1VFBC 1XGUC 3LZ2A 5I4WA 4J1AA 4G4CA 3A95A 4LT3A 2CGIA 1INUA 1GBSA 5F16A 3T36A 4BAPA 1B5ZA 1IOQA 1VDQA 4G9SA 1QIOA 2X0AA 1IC7Y 3LZTA 1C08C 4H9FA 1EQ5A 1LZSA 2BQAA 1F0WA 4LYCA 4HSFA 1LSPA 5E9RA 2DQCY 1JIYA 4WM5A 1JWRA 2H5ZA 1LZAA 4P2EA 5KXYA 3WU7A 4DDBA 4MR1A 3WUAA 5HNLA 1LAAA 2G4NA 1IC5Y 5D5CA 1JTOL 1NDMC 3WW5A 1OUDA 5I4XA 1HEOA 4HJVA 2D91A 1IEEA 3WH1A 3E3DA 4RW2A 4WG1A 2BQGA 5IELA 1BB7A 3EXDA 4H91A 4CFPA 3GXRA 1UIEA 3A34A 3WULA 1GE3A 5LIOA 1KIRC 3CSRA 4H8XA 1KXXA 4II8A 5KXNA 1ZV5L 4ZFPA 3RT5X 1KXWA 5K7OA 1HHLA 5I53A 1O23A 4LYZA 1LMNA 1GFKA 1CKGA 1LHMA 4ZIXA 4N1CC 1LZRA 1FKVA 1WQPA 1JJ1A 4LFXA 3TMVA 3A3QA 4H9IA 3TXHA 4H90A 1NKHA 5IHGA 1LSNA 3LYZA 193LA 4LYBA 2B5ZA 1GEZA 4ML7A 3TMWA 1IOSA 4NG1A 4PRQA 1LYSA 1GF4A 1BB6A 1LZCA 5LA5A 1LYOA 5LAFA 1DZBX 1LHLA 1YAMA 3AZ6A 4GLVA 2ZQ4A 1LSGA 2HU3A 4WOAA 4Z98A 3A91A 3LYMA 3AB6A 1LHJA 1GD6A 1HNLA 1SQ2L 2MEGA 3J6KA 8LYZA 3P65A 1D0LA 2ZYCA 1IP3A 1GF0A 1XGPC 1HEQA 4ETDA 4XJHA 1AZFA 1OP9B 3W6CA 1IR9A 1WQOA 1JPOA 4WM4A 1GE4A 1OUCA 1F6SA 1LYZA 1LZDA 4O34A 5L3IA 2W1LA 2A7FA 1B7MA 3AGGG 4WL7A 4KPMA 4N8ZA 2EIZC 1IY4A 5ILCA 2BQCA 4LYTA 4ETBA 1B0DA 4NFVA 1QDRA 4OWHA 1GFJA 3W6AA 5KXLA 4X3BA 1GXV2 1LJEA 1HFZA 2Z18A 2ZYPA 2YBMA 1JKDA 2FBDA 2MEHA 4LYOA 1OUJA 4BS7A 3AGIA 1V7TA 4HPEA 2NWDX 1FBIX 2H9JA 4RW1A 1N4FA 3WXUA 5LYMA 4XJGA 3TXJA 1LMOA 1IWUA 5T3FA 4N0JA 1PS5A 1QTKA 2H9KA 4R6CA 5KXTA 1LSDA 1UIDA 3W6EA 132LA 1AM7A 5B59A 1LJIA 4KL7A 1JJ3A 4A7DA 2RSCA 1B5UA 1LOZA 1IORA 2IHLA 2YBHA 3B0KA 4GCFA 4NGZA 1GB9A 5APFA 1A2YC 4OWEA 1G7IC 3CB7A 1QUTA 1RI8B 1JITA 2W1XA 1GE2A 1CJ6A 194LA 1OUGA 1BQLY 1PZYA 2Z2FA 1RFPA 2ZIJA 5A3ZA 1GB3A 3MGWA 1GF9A 1YAOA 1LSYA 4GN4A 4XJDA 2BQMA 208LA 2DQHY 4WL6A 1EQ4A 5KXMA 1IP5A 1OUIA 1RJCB 1GFRA 1D6PA 4IASA 5B06A 1IWXA 4DC4A 3WVYA 1HFXA 1LZ5A 1YQVY 1OUBA 1QDTA 3A8ZA 1CKFA 1GF6A 5KKIA 2CDSA 3N9AA 4XJFA 5LAGA 2Z37A 1GFHA 2Q0MX 2DQIY 1GHLA 1LJFA 4M6DA 1CJ9A 5LVKA 4H9EA 1YL1X 5AMYA 3WL2A 4MSTA 1LSMA 1NBZC 3AZ4A 3LYOA 1D0KA 3TMUA 1JKCA 2ZIKA 4CFOA 1DXJA 4H9CA 4DD0A 5I4YA 1D0MA 4NGKA 1UBZA 5KXWA 2MEAA 1GF3A 1BWHA 4NSJA 2ZNXY 1F10A 4HTQA 1B7LA 2MEIA 1J1PY 1OUAA 2XJWA 4NSIA 4Z46A 2D4JA 1FLWA 3A6BY 5FELA 1LZ1A 4GCDA 1GAZA 1IC4Y 1IP4A 4DDCA 1LSFA 1B5WA 4ET9A 1I1ZA 1XGTC 2HEDA 2W1YA 3WYHA 2FYDA 4NIJA 1LMQA 1LYYA 4L41A 5KXSA 1ALCA 4RDSA 4YENA 1LMAA 3AYQA 5LA8A 4PJ2C 1JJ0A 1NBYC 2DQGY 2Y8PA 4NGJA 153LA 1JTTL 1WTNA 207LA 1FKQA 1NHEA 1DQJC 1NWGA 1ZVYB 3A6CY 4PPOA 5HQ1A 1HMKA 2EKSC 4ET8A 2D4IA 1IP2A 5LINA 1HSXA 2G4QA 5KXZA 1GDWA 4GCEA 5C6IA 4DDAA 1LZ4A 4GCCA 1BB5A 1GFVA 1Z55A 1BGIA 2HU1A 3AJNA 1GBOA 1WQQA 1VDPA 2I26L 4QDNA 1VDTA 1W6ZA 3P68A 2ZNWY 1LZ6A 1VATA 133LA 4YF2A 3TXKA 4KXIA 4U3XB 5J7CA 3EO5A 2XBSA 5LVJA 4WG7A 4NGWA 3RW8A 1GE0A 2XTHA 4H92A 4J7VA 1GBZA 1LZBA 4WM2A 4OW1A 5F9XA 4B0DA 1IP7A 1LMTA 3IJVA 1LJ4A 2D4KA 4WO9A 4XJIA 1YIKA 1B7RA 1JEFA 2ZILA 3GXKA 2MEFA 1LZYA 5HLLA 1LMCA 4H8YA 4NGYA 1XGRC 2Z19A 1GPQC 1UCOA 3W3EA 3EMSA 3A94A 2YSSC 3WPLA 2WARA 4BAFA 5II3A 1IVMA 1CJ7A 1FN5A 2F4AA 3QNGA 3OK0A 2F4GA 1LJNA 1REXA 1WQMA 1YL0X 4CGEA 1OUFA 4HTNA 2MECA 5APEA 1A4VA 154LA 4PRUA 4C5FA 4B4JA 1GFGA 5FHWA 5ILFA 1XEIA 6LYZA 1IWVA 7LYZA 1HEPA 5HNCA 4WMGA 1LJHA 3A3RX 1E8LA 2MEDA 1CKDA 1DI5A 2BQKA 2Z12A 2PC2A 3F6ZA 3P64A 4H93A 4H94A 3WU8A 4AGAA 1DI4A 2LYOA 4XN6A 1FLQA 5KXRA 1LJJA 5LVIA 1REYA 2DQJY 1XFPL 2Z38A 4N5RA 4D9ZA 3TXFA 4TUNA 5KXKA 3WMKA 3HBHA 2BQNA 1NQIA 1GDXA 1VEDA 2FBBA 3AZ5A 4Z3MA 3K3TA 1LHKA 2Z2EA 3A92A 4I8SA 5DN4A 5I54A 1HEWA 3M18B 135LA 4W94A 1W08A 1G7HC 4NHQA 2ZWBA 3TXIA 4WM6A 1TDYA 2BQDA 2VB1A 2BQFA 4FJRA 4HPIA 4G4HA 1IY3A 4M4OA 5LVHA 4H9HA 2LYMA 4NGOA 3RU5A 3WXTA 2C8OA 3KAMA 3W6DA 1J1OY 3ATOA 1IWYA 4RLNA 1GBWA 2I25L 1UIBA 1MELL 2LZTA 4TX7A 1ZVHL 4NHTA 3TXDA 4EOFA 4YOPA 3OJPA 1T3PA 1WQNA 4YM8A 4G4BA 4MCKA 2LHMA 4E3UA 1BVKC 1GB5A 5FEKA 1QQYA 1CKCA 4IATA 1LSCA 2HEFA 6LYTA 1WQRA 4LT2A 3ZVQB 3N9CA 4NSGA 2YBJA 3ZVQA 5DM9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HP0A 3WVXA 2BPUA 149LA 1C46A 1C64A 159LA 1GXXA 1P2LA 5B1FA 3C7ZA 1TCYA 3HU8A 2FYCA 3QE8A 1GEVA 1LI6A 4YEMA 248LA 4HJYA 4I7TA 2LYZA 4DWXA 1LKRA 3OE6A 1B7OA 3AW6A 3K2RA 130LA 1L50A 1QT8A 2B6YA 1SX7A 4PJZA 1DPXA 1OV7A 238LA 1L65A 1XJTA 2RBSA 1J1XY 1T6HA 2CJLA 181LA 1CX7A 4LGKA 258LA 177LA 1ZYTA 1HMLA 4YX7C 3IWRA 1GBYA 1LKSA 1IO5A 2HUMA 240LA 3B6LA 4GLAA 4XENA 2L78A 3CDTA 5B1GA 1NMMA 2MEBA 4ANRA 1JSEA 1ZMYL 122LA 1C6MA 1RCMA 1KW7A 4WM1A 2O4WA 1ZURA 2ZQ3A 3HTGA 1UIAA 146LA 1L82A 1NF5A 4I7NA 4ETAA 173LA 1L60A 1T6VL 1L77A 1P2CC 5KY1A 1B7QA 5F81A 2HUKA 1GFAA 112LA 3SP3A 1LSAA 3BKHA 2XBRA 2Q9DA 4G49A 3HFMY 1C6GA 2DQAA 3DN3A 3HT7A 2DKVA 1D6QA 2HTXA 4EPFA 1B6IA 5HMJA 3IJUA 1LSZA 178LA 1LGWA 1B7NA 3G3BB 1L28A 2OU8A 1L03A 2DQDY 1MLCE 1JKAA 2BQIA 5FSTA 1L57A 1B5YA 3G3AB 1YKXX 1LSBA 5M1YA 3C8QA 220LA 2BLYA 2YVBA 3OE0A 3A67Y 4S0WA 4C3WA 2RH1A 4TTDA 1OQMA 1IOCA 1B9OA 1BWJA 1IWTA 118LA 1CV4A 3HBDA 1UACY 4WLTA 4H1PA 4W96A 143LA 5IDDA 3RZ4A 2GV0A 3W6FA 4WO6A 1OUHA 1G0LA 1HENA 3EMLA 3LZ2A 1LI3A 3A95A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4HP0 A;  3WVX A;  2BPU A;  4DT3 A;  2YBL A;  4DD3 A;  2BLX A;  1C46 A;  1IIZ A;  1HER A;  3CT5 A;  1HC0 A;  4ETC A;  3D9A C;  4R0F A;  1CNS A;  3A93 A;  3RNX A;  1UC0 A;  3CSQ A;  1GXX A;  2BQB A;  5B1F A;  1D9U A;  2BAA A;  2D6B A;  4WLY A;  3N9E A;  1TCY A;  5EBH A;  1UIH A;  4XYY A;  1IR7 A;  2FYC A;  1GEV A;  3QE8 A;  1LPI A;  1REZ A;  4B1A A;  1TBY A;  4NGL A;  4YEM A;  4HJY A;  4HTK A;  1B5X A;  2LYZ A;  3TXB A;  4DWX A;  1LKR A;  1TEW A;  1IP6 A;  1GF5 A;  1B7O A;  1HEM A;  3AW6 A;  4OOO A;  4DD1 A;  4DYG A;  5LYZ A;  1LHI A;  3WPJ A;  4UWN A;  4GCB A;  1GFE A;  1LTM A;  3WW6 A;  4TWS A;  1DPX A;  3EBA B;  4I0C A;  1BB4 A;  1YKZ X;  2LZ2 A;  4OWA A;  5APC A;  1OUE A;  2DQF C;  4XAD A;  4BAD A;  4ZEE A;  1GB6 A;  2EPE A;  2YBN A;  1XGQ C;  1IR8 A;  4B4E A;  3AGH A;  2BQO A;  1J1X Y;  1DKK A;  1REM A;  2HUB A;  3P4Z A;  4DD7 A;  1KIQ C;  1RE2 A;  2CJL A;  2HEE A;  4FDY A;  4NHS A;  1UIC A;  3CT0 A;  4LGK A;  1QSA A;  4NHP A;  2CWI A;  5HMV A;  1QUS A;  2MEE A;  3B0I A;  1HML A;  1DKJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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