The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
AEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis for the specific interaction of lysine-containing proline-rich peptides with the N-terminal SH3 domain of c-Crk.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
C-CRK N-TERMINAL SH3 DOMAIN
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| molecule tags |
Complex (oncogene protein/peptide)
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| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
9
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1995-01-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K9G A; 4RTX A; 1AZE A; 1ZX6 A; 2NWM A; 2DJQ A; 4JJC A; 2DL8 A; 2FO0 A; 2FRW A; 4AG2 C; 2MOX A; 4EIK A; 2ED0 A; 2DA9 A; 3M0P A; 1GFD A; 2O88 A; 1U3O A; 2EW3 A; 3C0C A; 3PE0 A; 4ESR A; 2L3S A; 4KRT A; 4ZNX A; 4DEY A; 1H8K A; 4HXJ A; 1SRM A; 3EG0 A; 1NYG A; 1NG2 A; 1JQQ A; 3RBB B; 2RQT A; 2EGE A; 1JXO A; 2LJ0 A; 1MV0 B; 1I1J A; 2DYB A; 1CSK A; 1PKT A; 3QWX X; 1M3A A; 2BZY A; 1XOV A; 2LQW A; 3TSW A; 2RPN A; 1U5S A; 1X6B A; 1S1N A; 1NM7 A; 2D1X A; 1Y57 A; 2VWF A; 3H0H A; 5ECA A; 4HVW A; 1B3Q A; 1UGV A; 1UHF A; 4OML A; 1T0J A; 1T0H A; 3VS0 A; 3EGU A; 2J6F A; 1FMK A; 1KJW A; 1RUW A; 1SHF A; 1WXB A; 1A0N B; 2PNI A; 1AVZ C; 1WA7 A; 1TUC A; 2KRO A; 2SRC A; 4CC7 A; 2J06 A; 4J9H A; 4JJB A; 2KRN A; 1QWE A; 2L0A A; 2O31 A; 2C0O A; 2HEQ A; 3H41 A; 2GTJ A; 2DE0 X; 2EQI A; 2SEM A; 2OI3 A; 2YUO A; 1JO8 A; 5IH2 A; 2DLP A; 2FRY A; 2JXB A; 4HCK A; 3M0R A; 2RNA A; 1PRL C; 4K11 A; 2KGT A; 4LUD A; 2RQR A; 1K4U S; 2L2P A; 2AKL A; 1ZLM A; 3H0F A; 5FWB A; 1GFC A; 1ZSG A; 2DBM A; 3NHN A; 2LJ1 A; 1KSW A; 2KYM A; 1PNJ A; 1CKA A; 1RLQ C; 1H92 A; 1I07 A; 2O9V A; 1K0S A; 1UJY A; 2KEA A; 1X2K A; 2J6O A; 2KR3 A; 4GBQ A; 4RUG A; 2BZX A; 4F14 A; 2ESW A; 4JJD A; 2A37 A; 4CC4 B; 2B86 A; 4CC2 A; 2HCK A; 2LCS A; 3I5S A; 2BZ8 A; 5HCK A; 1GL5 A; 2DL4 A; 2KT8 A; 2P4R A; 3I5R A; 1WDX A; 2JS2 A; 2L3P A; 1E6G A; 1UEC A; 2X3W D; 4OMN A; 1SHG A; 2RN8 A; 1Z9Q A; 2CT4 A; 2DM1 A; 2EYY A; 2O9S A; 2LNH B; 2K2M A; 2GBQ A; 2DIL A; 2KXD A; 5EC7 A; 2A28 A; 2ECZ A; 2DRK A; 1M3C A; 2DX1 A; 2RQV A; 1UG1 A; 3NGP A; 2E5K A; 3NMZ C; 2A08 A; 2D8J A; 1Y0M A; 2JTE A; 2LQN A; 4Z88 A; 2VKN A; 5I11 A; 1G2B A; 1GBQ A; 2W0Z A; 4J9D A; 5IHN A; 3VS5 A; 1BB9 A; 2VVK A; 2DL5 A; 2J6K A; 3THK A; 1OV3 A; 2LJ3 A; 1AEY A; 2CRE A; 3GBQ A; 4RTT A; 1ZUU A; 1WXU A; 2JM9 A; 1WYX A; 3VS3 A; 4J9E A; 4LUE A; 1QKX A; 4OMP A; 1ABO A; 1FYN A; 4LNP A; 1QKW A; 1BU1 A; 1GCQ A; 3U23 A; 1K0X A; 2DF6 A; 2JS0 A; 2C0I A; 2DMO A; 3EHQ A; 2K79 A; 5FWC A; 2KRS A; 3VS4 A; 2EGA A; 2KXC A; 2J7I A; 1PWT A; 4Z89 A; 3VS7 A; 2AKK A; 1NLO C; 1TG0 A; 4WCI A; 1Z9Z A; 3REB B; 3LH5 A; 1OPK A; 4RTU A; 2RQW A; 1X6G A; 2FEI A; 4RTY A; 1JEG A; 1WFW A; 2MIO A; 5L23 A; 1X69 A; 4JPB W; 3UA7 A; 4LN2 A; 3VS1 A; 2LMJ A; 4RTW A; 1BBZ A; 2BTT A; 2F2X A; 2YUN A; 3PVQ A; 3TSZ A; 2CH4 A; 1EFN A; 1G83 A; 2EBP A; 1I0C A; 1UJ0 A; 4J9B A; 1IO6 A; 1HD3 A; 1T3S A; 2CUB A; 2NUZ A; 2JM8 A; 4JZ3 A; 1QLY A; 1NYF A; 2DVJ A; 2X3X D; 1AD5 A; 3EG1 A; 3FJ5 A; 3O5Z A; 2EYW A; 1SPK A; 4J9F A; 3EG2 A; 4CC3 A; 2KRM A; 2JMA A; 2F2W A; 2YDL A; 1AZG B; 1WXT A; 1AWJ A; 2GQI A; 1GCQ C; 2OAW A; 1N5Z A; 2DBK A; 2ROT A; 1VYU A; 4Y92 A; 2H8H A; 2J05 A; 4IIO A; 3VS6 A; 2FPD A; 2CDT A; 5IHK A; 2JW4 A; 4D8K A; 3KFV A; 5GJV B; 3A98 A; 2EKH A; 4QT7 A; 3M0T A; 1X43 A; 4OMO A; 2W10 A; 3I9Q A; 1VA7 A; 2HDA A; 2RMO A; 1M30 A; 4OMM A; 4ORZ A; 1W70 A; 1MUZ A; 2I0N A; 2F2V A; 3H0I A; 1OOT A; 1YCS B; 2YUQ A; 2D0N A; 4AFZ C; 1E6H A; 2HBW A; 2XMF A; 2PTK A; 1RLP C; 3M0S A; 1OEB A; 2MCN A; 1B07 A; 2JMC A; 3M0U A; 3ZL7 C; 4FSS A; 1PKS A; 1YN8 A; 1OPL A; 1ZUK A; 1QCF A; 4IIM A; 2DL7 A; 1H3H A; 1M8M A; 1W1F A; 2ABL A; 1JU5 C; 1AWX A; 1MV3 A; 1YP5 A; 2KE9 A; 2L3Q A; 3JV3 A; 2O2O A; 2CT3 A; 1KFZ A; 2K6D A; 2V1R A; 1KIK A; 2K3B A; 1NEB A; 1E7O A; 2PZ1 A; 1BK2 A; 1CKB A; 2M0Y A; 1SSH A; 2CSQ A; 2EGC A; 3VRZ A; 4Z8A A; 2EYZ A; 2AZS A; 2ED1 A; 2RF0 A; 1YNZ A; 4HVV A; 2KYB A; 2FPF A; 4A63 B; 1PHT A; 5IXF A; 4J9I A; 3NPF A; 1K9A A; 2EYX A; 2OJ2 A; 3CQT A; 3SEM A; 4J9C A; 2QDL A; 2DNU A; 2GTO A; 5IXB A; 2IIM A; 2K7A A; 4J9G A; 1AWW A; 1W6X A; 3UF4 A; 1UTI A; 1UE9 A; 1AOJ A; 2LP5 A; 2EVR A; 1QWF A; 2ENM A; 2V1Q A; 2LZ6 B; 1GRI A; 4AFQ C; 1HSQ A; 2FPE A; 1GCP A; 2AZV A; 1SRL A; 2GNC A; 4E6R A; 3VRY A; 4AG1 C; 2ROL A; 1ARK A; 1PRM C; 3UA6 A; 1LCK A; 2A36 A; 2KBT A; 1GBR A; 3PVL A; 2D8H A; 2CUD A; 4LE9 A; 1WIE A; 4F17 A; 4OMQ A; 1YWP A; 2LX7 A; 3UAT A; 3EG3 A; 4X1V A; 5I22 A; 3QWY A; 1M27 C; 1X27 A; 4F16 A; 2DL3 A; 4RTZ A; 1J3T A; 1K1Z A; 3VS2 A; 1UUE A; 2FG0 A; 1HJD A; 1X2Q A; 2GGR A; 3EHR A; 1YWO A; 1TUD A; 1VYT A; 2KNB B; 2YT6 A; 5IHI A; 4HVU A; 3RNJ A; 2C0T A; 2JT4 A; 1V1C A; 3M0Q A; 2HSP A; 4DEX A; 1VYV A; 2DRM A; 1M3B A; 5FW9 A; 2KT1 A; 2YUP A; 3ULR B; 2EPD A; 3SHW A; 1RI9 A; 3I35 A; 1T3L A; 1WI7 A; 1ZBJ A; 1NEG A; 4AFU C; 1UFF A; 4GLM A; 5GJW B; 2G6F X; 1UHC A; 3R6N A; 4D8D A; 4RTV A; 1ZUY A; 4R0K A; 1ABQ A; 1WLP B; 1AWO A; 4JZ4 A; 1UDL A; 1U06 A; 3REA B; 2M51 A; 3TVT A; 4M4Z A; 1JXM A; 2YSQ A; 3IQL A; 1K76 A; 2RQU A; 2AK5 A; 2CSI A; 1SEM A; 1NLP C; 1WX6 A; 4AFS C; 2CH4 W; #chains in the Genus database with same CATH topology 3D7S B; 4M7A D; 5GAM e; 2EIF A; 4GY5 A; 5A0G A; 2G3R A; 1ZX6 A; 2RH2 A; 4ZGE B; 1BYM A; 2MPX C; 1UGQ B; 3V8J A; 4JJC A; 4C8Q C; 4ELZ C; 2H3J A; 2MOX A; 3UT1 A; 4C92 B; 3M0P A; 1YI2 Q; 3EFO B; 4C8Q D; 3PE0 A; 1WHL A; 3LX7 A; 2QQ9 A; 4HXJ A; 2EQJ A; 4BE2 A; 1ZA2 B; 2CZ0 B; 3VV0 A; 1KD1 R; 2EGE A; 2R57 A; 5GAM h; 1MV0 B; 5M9O A; 3QWX X; 2CZ7 B; 5GAO l; 2COW A; 4KBM B; 4DBH A; 2JTM A; 3MJX A; 3TSW A; 2RPN A; 3QII A; 1U5S A; 1M1K R; 3CD6 A; 1S1N A; 1NM7 A; 2D1X A; 4Z02 A; 1Y57 A; 2VWF A; 2E1H A; 1ZHI A; 1B3Q A; 1UGV A; 4LD6 A; 2J6F A; 1FMK A; 4B9X A; 1K9M C; 4M78 G; 1AVZ C; 4XTX A; 2LNV A; 1K9M U; 5A0D A; 1HK9 A; 1TH7 A; 2SRC A; 2J06 A; 4J9H A; 4PJM A; 2KRN A; 1YBY A; 2CZ1 B; 2MYS A; 1BIA A; 2KDS A; 2HEQ A; 1VQ9 T; 1VOM A; 2DE0 X; 2EQI A; 2PVD B; 3GP8 A; 2YUO A; 3CMA A; 1QCN A; 5J3B A; 2RNA A; 4M7D A; 2LT4 A; 4LUD A; 3HRU A; 3P8B B; 2F1L A; 3RKY A; 1QCO A; 3OB9 A; 5J39 A; 2L2P A; 2YRD A; 3G71 T; 2OTL A; 2AKL A; 3HHT B; 4QQG A; 1VQ6 T; 1ZSG A; 1U1T A; 2MMP A; 3MEA A; 3EGD B; 2E12 A; 4FYV B; 5C0M A; 1W4S A; 1UGS B; 2ZCF B; 3L2Z A; 2JZ2 A; 2KEA A; 3KBG A; 2KR3 A; 3CC2 A; 4RUG A; 5I21 A; 4M78 B; 5DLO A; 2QA4 Q; 2PQW A; 4CC4 B; 4CC2 A; 2HCK A; 1YJW T; 5HCK A; 4IUR A; 1RAH B; 3FDR A; 2DL4 A; 2KT8 A; 1UGR B; 2P4R A; 5A0L A; 4N4I A; 2QEX T; 3L42 A; 2AHJ B; 3L2U A; 1UEC A; 3CCU T; 4L6V 5; 1RAD B; 4ZN1 A; 3G6E T; 2XG8 D; 2KXD A; 2DIL A; 3PTA A; 3RER A; 1MNE A; 3GNF B; 2RQV A; 4KUD K; 4IKF A; 2VKN A; 5I11 A; 2RJD A; 1K8A U; 4XTV A; 2BE7 D; 3JCM d; 1WXU A; 1VQ4 Q; 4M78 C; 1YJN Q; 4J83 A; 2A3L A; 3CCL Q; 4LDU A; 3JCM e; 4J9E A; 1WHK A; 1VQL T; 1QKX A; 2CKK A; 1GCQ A; 1K0X A; 4QW2 A; 2C0I A; 2DMO A; 1M2V B; 3C12 A; 4PLL A; 3VS4 A; 5FLX E; 3L1A A; 1PWT A; 1IGU A; 2XDD A; 5LJ3 g; 1Z9Z A; 3GOX A; 2VXE A; 3LLR A; 3JCM h; 1HXD A; 3GIB A; 1X6G A; 3CXC S; 2FEI A; 4C5E A; 2MIO A; 5L23 A; 1X69 A; 2Z0W A; 4ATO A; 2P84 A; 1GXI E; 3AT1 B; 1LOJ A; 2LMJ A; 4RTW A; 2MAM A; 2F2X A; 2HKN A; 1KQS S; 2CH4 A; 3CXC P; 3CME Q; 2CP6 A; 2RJE A; 1UJ0 A; 1N9S A; 3QJ6 A; 2V26 A; 4JRK A; 4EMK A; 2NUZ A; 4JZ3 A; 2DVJ A; 1NYF A; 1KQS P; 1AD5 A; 3O5Z A; 4J9F A; 3V7R A; 5CVI A; 3L2V A; 2RK1 A; 2YDL A; 3CCM A; 1Q7Y C; 1N5Z A; 1TS9 A; 1JJ2 S; 2RHI A; 4J6Y A; 4EDU A; 2FPD A; 2YWW A; 2QXF A; 1KK7 A; 2RJF A; 1VQP A; 5IHK A; 3A8G B; 3MP6 A; 1OU8 A; 1PCX A; 4D8K A; 2QQR A; 3M53 A; 3KFV A; 4MMK A; 3A98 A; 3M0T A; 1JJ2 P; 3JCM b; 4DBF A; 2Y4Y A; 4M75 A; 5LJ3 j; 2RMO A; 2CP5 A; 4OMM A; 2VYT A; 2PUK B; 3PFS A; 1VQO T; 1YCS B; 1WQ7 A; 2HBW A; 3NFC A; 3OYG A; 4N0A C; 1O75 A; 1YI2 A; 2DTH A; 3BE3 A; 5FRO A; 1AWX A; 1G3T A; 2EKO A; 1K73 R; 1KIK A; 1NEB A; 2NYS A; 2XID A; 3CCJ T; 5CAI A; 3VRZ A; 2AZS A; 3OYE A; 2RF0 A; 2XDB A; 5LJ3 d; 4HVV A; 2FPF A; 1Y71 A; 2M0O A; 5LJ3 e; 5IXF A; 1LJO A; 3G7Z A; 3HTR A; 2DFU A; 2X4X A; 3SEM A; 3QJY A; 2DNU A; 3DLL A; 5IXB A; 2DEQ A; 4V2S A; 5HK0 A; 2IIM A; 2KSS A; 4FW2 A; 3RES A; 1UE9 A; 4M77 F; 2X9H A; 3QDR B; 3SDZ A; 4XTZ A; 2RI5 A; 1SRL A; 4F7U F; 1S72 Q; 3RUX A; 5GAN j; 1TSF A; 4JRI A; 3EGX B; 3E2U A; 4AG1 C; 4Y28 E; 1ARK A; 2JUF A; 3BW1 A; 3DB4 A; 2H3E B; 2KBT A; 7AT1 B; 2D8H A; 1ZQ1 A; 1X75 C; 4OMQ A; 1XQH A; 2WSE E; 2HD0 A; 1SKU B; 3QO3 A; 2QA4 A; 1K1Z A; 1HJD A; 1QVP A; 1X2Q A; 3V7C A; 3EHR A; 4RG2 A; 1SSF A; 1TUD A; 1VQ7 Q; 3EFS A; 5IHI A; 2JT4 A; 3M0Q A; 2HSP A; 3M4Y A; 1TTH B; 2KT1 A; 3ULR B; 3SWN B; 3CD6 T; 4FT4 A; 4FIB A; 4OB1 B; 3E9F A; 3RR6 A; 4AFU C; 4UC4 A; 1BKB A; 5GJW B; 4FU6 A; 3R6N A; 5KYW B; 2AT1 B; 4D8D A; 1WLP B; 5GAN d; 4JZ4 A; 1U06 A; 2M51 A; 2NUT B; 5GAN e; 1X01 A; 4M4Z A; 3OYC A; 1W2B S; 4C8Q F; 2HQH A; 5GAN 7; 2QYZ A; 2AK5 A; 2DTO A; 4PJO E; 1VQ4 A; 1YJN A; 1QVF S; 1SEM A; 2HBP A; 3QZ9 B; 3CCL A; 1WX6 A; 3LGL A; 4PJO D; 4ZGD B; 4AFS C; 1W2B P; 4FYY B; 1AZE A; 1B7T A; 1VQ5 Q; 3CMA T; 1QVF P; 4J7F A; 2DJQ A; 5GAN h; 3SWN C; 2DL8 A; 1DJ7 B; 2OTL T; 5GAM g; 5A2Q E; 4EIK A; 2CP3 A; 2EW3 A; 1W2B A; 4KRT A; 4ZNX A; 1ZSZ A; 1AHJ B; 4X9D A; 1YJ9 Q; 3R6O A; 3EG0 A; 2PUO B; 1NYG A; 1JQQ A; 3RBB B; 3MHX A; 4M7A G; 4QQ6 A; 2LJ0 A; 3SD4 A; 1I1J A; 1QP3 A; 2DYB A; 4F7U B; 5KE3 A; 1M1K C; 1M3A A; 4CI0 C; 2BZY A; 2LQW A; 1WJR A; 3BDU A; 3CME A; 4M7D G; 2JTF A; 3H0H A; 2K5I A; 5ECA A; 4HVW A; 2LX9 A; 3TU4 K; 4BB7 A; 1VQ5 T; 5GAO p; 3V8L A; 4KGX B; 1T0H A; 2OTJ Q; 3EGU A; 1KJW A; 1RUW A; 1SHF A; 3LYI A; 1RAC B; 2PNI A; 1M9S A; 3HP9 A; 4JRQ A; 2V8I A; 1OZ3 A; 3JCM J; 1TUC A; 4NL2 A; 3L2W A; 2K5L A; 2M9U A; 3M54 A; 4CC7 A; 3DKM A; 4QKU A; 3G1J A; 2ZGW A; 4RG8 A; 1YJ9 T; 1EX4 A; 4XK8 E; 2C0O A; 5AYF A; 4OMF B; 2Y90 A; 2GTJ A; 1VQ8 Q; 2ATC B; 4FYW B; 4HCB A; 4MZT A; 3BFM A; 3GLX A; 5IH2 A; 2DLP A; 2KAF A; 3P8D A; 2XDP A; 1PRL C; 2E5Q A; 4KUI A; 4M7A B; 2RQR A; 2DD4 A; 3H0F A; 4AMC A; 1KHI A; 1LVK A; 2DBM A; 1D0Y A; 2LJ1 A; 2EFI A; 3M9Q A; 3C94 A; 1H92 A; 4C8Q B; 4MDX A; 1I07 A; 2O9V A; 1K0S A; 5KH6 A; 4E2F B; 1X2K A; 2DET A; 3MP1 A; 4GBQ A; 4F14 A; 1NZ9 A; 2ESW A; 1NJI C; 5GAN 3; 1FWZ A; 2V8K A; 2BZ8 A; 1GL5 A; 1NJI U; 1R0B G; 1M90 R; 1MMD A; 2DXB A; 4OMN A; 1SHG A; 1VQN Q; 1VQM A; 2DM1 A; 4M7A C; 4C5I A; 2K2M A; 2GBQ A; 3EAE A; 3LW5 E; 5EC7 A; 2A28 A; 1KQ2 A; 2JN0 A; 4A4E A; 4M78 F; 2DX1 A; 3A5Z B; 3MCA B; 4JJN K; 4M7D C; 4M7D E; 3NMZ C; 2A08 A; 2VB6 A; 4BE1 A; 3I56 Q; 4Z88 A; 2ZPF B; 4M7D D; 3Q1J A; 3CCM T; 4XQ3 A; 1RL2 A; 2GFU A; 2LQK A; 3A8O B; 2J6K A; 2DIQ A; 3OA6 A; 3THK A; 2LJ3 A; 1AEY A; 1VQP T; 1P92 A; 2E41 A; 1C1A A; 2IVW A; 2FB7 A; 4M77 A; 3VJP A; 2QQA A; 1MMG A; 4OMP A; 1FYN A; 5KYY B; 2OAU A; 1IHV A; 3JCM g; 2LDM A; 2MWO A; 1BCO A; 5FWC A; 2KRS A; 1S72 A; 2QGF B; 2QK0 A; 2EGA A; 3EFR A; 1KC8 C; 2AKK A; 4WCI A; 4XU1 A; 3ZEH A; 1KC8 U; 4DOV A; 2FVU A; 1OPK A; 4RTU A; 3JCM P; 3LGF A; 4VUB A; 3S3N A; 3MEU A; 1YI2 T; 2KI7 A; 3UA7 A; 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