1CKCA

T43a mutant human lysozyme
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRAANYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Contribution of intra- and intermolecular hydrogen bonds to the conformational stability of human lysozyme(,).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ckcA00
1B5WA 1UBZA 1FLWA 1LYSA 1NF5A 1INUA 1NWGA 1C10A 1RE2A 1BWHA 2BQIA 2MECA 3F6ZA 4LGKA 4B49A 4H8ZA 4RLMA 1E8LA 1V7SA 3A8ZA 4H92A 1NHEA 1JJ1A 5KXLA 3M3UA 3LYOA 1JPOA 4OW1A 1BVXA 1B5UA 1GEVA 1LJ4A 1XGPC 4M6DA 3RW8A 1LCNA 3KAMA 1LZGA 3WVYA 4DD1A 1TBYA 3AB6A 1EL1A 3N9AA 4HV1A 4DD2A 4J1AA 1LMCA 4BS7A 3QE8A 4N1EI 5T3FA 3T6UA 5A3ZA 1AZFA 207LA 1B7RA 3BKVA 4C5FA 1AM7A 1CKHA 1BGIA 1GFVA 1DXJA 2N5ZA 2BLXA 5KJ9A 1LSDA 1UIFA 1DKJA 1VEDA 4H9EA 2LZTA 1IC4Y 1GE3A 3TXFA 4HV2A 1LMTA 4KXIA 3P4ZA 2YBIA 4LFXA 1GFJA 4PPOA 1YL0X 3MGWA 1CJ7A 1CKDA 1GXV2 2F2NA 4HPIA 1QSWA 3HBDA 1WQRA 4NG8A 1LZ4A 5I54A 1DI4A 1B5ZA 2W1XA 3AZ4A 1VATA 5LVHA 2BQNA 1LHKA 4OOOA 1B7SA 4W96A 1CKCA 1SLYA 3LYZA 3TMVA 1LZAA 3WW5A 5I4YA 4TX7A 4NHPA 4A7DA 4WLDA 5LVIA 1IOCA 1XFPL 1FDLY 3LN2A 4NEBA 3P66A 1J1OY 2BQBA 2MEDA 1ZVHL 4QGZA 1G7LC 1KIPC 1GWDA 1PS5A 1FKVA 4GLAA 3RU5A 4WM3A 5KXTA 1AKIA 1GFKA 2DQCY 4G49A 4UWNA 4DD3A 3A93A 2DBTA 4LYMA 3W3EA 1LHMA 1NBYC 4XN6A 4LYTA 1F0WA 1KXYA 2IFFY 1IEEA 2G4NA 2HU3A 3RNXA 1LPIA 3A67Y 1LJ3A 3WMKA 2ZWBA 4OWBA 3A6BY 5FELA 3ULRA 4MR1A 3SP3A 1FBIX 2YBHA 4YF2A 1CNSA 1LJFA 4OWEA 1LYZA 4NHQA 4PHIA 4LYBA 5A3EA 1DI3A 4HJYA 4TSCA 1YAQA 1DZBX 4R6CA 133LA 3WUMA 3CT1A 4NG1A 1JIYA 1IP1A 4FDYA 1XGQC 1HEOA 4W94A 1JITA 5APFA 1IC7Y 1LHLA 2DQFC 1IWTA 1LJGA 4NY5A 1CJ6A 4WLYA 3A3QA 4LFPA 2W1LA 1D0KA 3WULA 1VDTA 4DYGA 1IY3A 5D5CA 2BPUA 1HEMA 4DT3A 5J7CA 1GF3A 2ZNXY 4CJ2A 4HTKA 1OUJA 2H9JA 2HTXA 3WVXA 1LZ1A 4LYOA 3E3DA 1B5XA 5LVKA 2ZNWY 4N1CC 5LYMA 1JKBA 1KIQC 1LSAA 2MEGA 4OOTA 1UUZC 5FSTA 2EKSC 3WU7A 4DDBA 3A95A 4WMGA 1OUAA 2ZYCA 3CT5A 5L9JA 1IWVA 1XGUC 5E9RA 1LZ5A 1BWJA 1VFBC 1GF0A 134LA 4NWHA 4EOFA 1HERA 1GB6A 3AZ6A 1F6RA 2I6ZA 1HNLA 4RW1A 4C3WA 4HJZA 5E4PA 3FI7A 1I1ZA 4Z98A 1BB6A 4AGAA 3AZ7A 4LYZA 1GF6A 1HEWA 4X3BA 3W6CA 5KKJA 1UIHA 3WU8A 1LMQA 4HTNA 4MCKA 4GN3A 4WM2A 1TAYA 154LA 1LYYA 1WQMA 1WQPA 2Z37A 5DLAA 4B4JA 1JISA 1IP5A 5KXRA 3WYHA 1GAYA 1NDGC 4CHXA 1GB9A 5IDDA 3OJPA 4P2EA 3B72A 3AYQA 5APCA 1C46A 1QDTA 3B0IA 3WPJA 1JTPL 4NSGA 4TWSA 1IP2A 1GE1A 1LZCA 2CGIA 3A90A 5IHGA 2XBSA 4UWVA 1LKRA 1UA6Y 4H1PA 4H94A 2I26L 1GBOA 5LINA 1VDSA 2HEDA 4E3UA 1QQYA 5B59A 1WQQA 4H8YA 3TXGA 2CDSA 5F16A 1VAUA 1GFUA 2DQEY 1KIRC 2EPEA 1LSEA 2F30A 3A3RX 1RI8B 3J6KA 5KXMA 1YKYX 2PC2A 4ETEA 5JENB 2I25L 3WXUA 1UIEA 2BQKA 3WH1A 4NWEA 2NWDX 2YBJA 1OQMA 2BLYA 5F9XA 2YBMA 1GFGA 1LMAA 3B0KA 3QY4A 1B7QA 1GDWA 2F4AA 5KXKA 1IWZA 1REYA 1QUSA 1LJNA 1LZRA 3CSZA 3TXDA 4XJBA 3EMSA 1LSPA 1D6PA 1EQ4A 2YBLA 5HMVA 1BWIA 4H9BA 5C6LA 1REMA 5KXYA 1GBZA 4XJFA 1GBYA 1OUIA 4ETBA 3ZVQA 1NQIA 1LJIA 4N5RA 4DD7A 4CFPA 2BQEA 2CJLA 5HMJA 2Z19A 1HENA 5DM9A 1IP6A 1MELL 3M18B 1IWYA 4PRUA 1C08C 1Z55A 3N9CA 4QY9A 5LYZA 4TSBA 1GEZA 1QIOA 5F9UA 4LT0A 4XYYA 1QSAA 3P64A 1TCYA 1GBWA 2G4PA 1WVUA 3TMUA 5DN4A 1GAZA 4YM8A 4WM4A 1CKGA 1DPWA 5I53A 3ZVQB 5HNCA 1GB0A 4XADA 1BHZA 1IP3A 2Z38A 4GCEA 5ILCA 1YAOA 7LYZA 4MSTA 5KXZA 1UICA 2BQHA 4II8A 1WQOA 5D5FA 5KKIA 4IASA 4WG7A 1LSMA 1OUFA 1B7OA 1EQ5A 1YANA 2FYCA 4H9HA 1BB4A 1GPQC 1QDRA 2Z39A 3GXKA 4G9SA 1OUBA 5LAFA 1GFHA 3IJVA 1JKAA 6LYTA 1OUGA 1GE4A 1LJEA 4L41A 3AGIA 1GD6A 1HFZA 1T3PA 1IR9A 2D6BA 1FLQA 2YBNA 4YOPA 4NGWA 1T6VL 2BQLA 3QNGA 3IJUA 3WU9A 4HJVA 5FCPA 4R0FA 4RLNA 1JSFA 1LZDA 1ZVYB 2BQMA 1GFAA 1REXA 4N8ZA 208LA 3WPKA 2ZQ4A 4ZIXA 3G3AB 3HBHA 5ILFA 2CWIA 2BQDA 1QTKA 4RW2A 5B06A 1LMOA 1LZ9A 1LZ6A 4N9RA 1LZBA 3LZTA 4OWHA 1IVMA 1GFTA 1IWXA 2Z18A 1LHJA 1XEIA 2H5ZA 3LYMA 4NGLA 4NSHA 4I0CA 1RFPA 1WQNA 4NSJA 1QUTA 3AW6A 1HFXA 3D9AC 1LZSA 1HHLA 1ZMYL 4CFOA 5F81A 3J4GA 1B7NA 5LYTA 2D4KA 3TXBA 2C8PA 4XJHA 5HLLA 1LMPA 3B6LA 4WLXA 1B9OA 4FJRA 4WLTA 1JWRA 1IY4A 2H9KA 1OP9B 4NIJA 1O23A 3WXTA 1VDQA 2FBDA 2IHLA 3GXRA 1LYOA 5KXPA 1B0DA 3B0OA 4D9ZA 1XEJA 4O34A 1B5YA 2LYZA 2Z12A 1N4FA 1LOZA 1UIAA 1GB5A 1PZYA 1LHHA 1LKSA 1XGRC 2BQJA 2HEEA 4XJDA 4NGZA 5I5QA 2DQDY 4H90A 1GDXA 2YVBA 4G4CA 4LT2A 1IORA 2EQLA 4NGKA 1DKKA 1OUEA 4H9CA 3IWRA 4Z46A 5IELA 4NHIA 1UACY 3TXJA 2ZIKA 4GCDA 5M1YA 1LHIA 1YKXX 1CKFA 1HEQA 3W6FA 5LA5A 5APEA 1V7TA 1GB8A 2D91A 2EIZC 1AT6A 1LSFA 4PJ2C 1LJKA 1G7IC 4TUNA 1OUHA 3G3BB 3N9EA 2ZQ3A 1GFEA 3WUAA 1WTMA 4TTDA 2BQGA 1YAMA 4KT3A 4NGJA 1IR7A 2D4JA 2VB1A 4NGOA 3W6BA 1A2YC 1D9UA 1FLUA 1NMMA 3D3DA 2YDGA 2WARA 1F6SA 1B7MA 1LJHA 2X0AA 4LYCA 3K3TA 5C6IA 1LMNA 1F10A 1BB5A 1BVKC 4PRQA 3EO5A 2HU1A 1C7PA 5LIOA 1JEFA 2A7DA 1YQVY 2W1YA 5K7OA 2DQGY 3AW7A 1IX0A 2GV0A 4G4HA 4DWXA 1JKCA 1H87A 5L3IA 1UC0A 4OWCA 2LYMA 4DC4A 1HFYA 1C45A 4YENA 1KXWA 1JTTL 1FN5A 4H9AA 1LSYA 5DL9A 4BADA 1B5VA 5B1GA 1DI5A 4H91A 1GBSA 5APDA 4ETDA 4GN4A 3WPLA 4ET8A 1H6MA 1IOQA 1LSNA 1ALCA 4KPMA 5KXWA 2DKVA 4ZFPA 2MEBA 1B2KA 2W1MA 3W6DA 1LZTA 4WOAA 3RZ4A 3TXKA 3HFMY 1IO5A 194LA 1UIGA 9LYZA 4H8XA 4EMNA 2HEBA 4QDNA 1JJ0A 4B1AA 5I4XA 4NGIA 3ATOA 4GCFA 5I4WA 4ZEEA 1J1PY 4WO6A 1CJ9A 5EBHA 5LVGA 2F4GA 3TXHA 1VDPA 4RDSA 3CQLA 3AJNA 1IOTA 3TMWA 3TMXA 3LHMA 1GB2A 3WUNA 4BAPA 1JHLA 3AGGG 1DQJC 3A6CY 2LYOA 1IWWA 4GN5C 4U3XB 4J1BA 4B0DA 4UWUA 1JSEA 1G7HC 4H9FA 1LSCA 2DQHY 1XEKA 3BKHA 4GCCA 2BQCA 4CGEA 4PGJB 2MEEA 1DPXA 3A94A 4AXTA 3A96A 2HEAA 2A7FA 3LZ2A 1UIDA 2BQOA 4XJIA 4I8SA 3VWOA 3RT5X 1IP7A 4ET9A 5B1FA 5KY1A 2MEAA 1G7JC 3T36A 4B4IA 4OWAA 1GF7A 2RSCA 5II3A 4IJ4A 4NHSA 5AMYA 4J7VA 1GBXA 1HMKA 5LXWA 2D4IA 5KXSA 4DD0A 3CB7A 1GE2A 1OUCA 1BQLY 1B7PA 2MEHA 2XBRA 4YEMA 1D0MA 2XJWA 4Z41A 1GF8A 1IIZA 1I20A 4QEQA 4BAFA 4H9IA 1ZV5L 1LSGA 3ATNA 132LA 1GFRA 4XJGA 1P2CC 3FE0A 4WM5A 1A4VA 1LSBA 1C43A 1HF4A 2DQJY 2G4QA 1GF4A 1LZEA 1GB3A 1IR8A 1LZ8A 3CT0A 3WW6A 4ETAA 1IOSA 2MEIA 2MEFA 4G4BA 4N0JA 1HC0A 5F14A 1UIBA 1IWUA 1XSFA 1GF5A 3A34A 1LZYA 153LA 2LHMA 1JJ3A 1LAAA 3CSQA 5FEKA 3P65A 3W6AA 4M4OA 1XGTC 1YKZX 4ETCA 4DDCA 5KXNA 2XTHA 135LA 1FLYA 4WG1A 1BB7A 2Y8PA 2ZYPA 2C8OA 4HTQA 4LT3A 3W6EA 1WVVA 4WL7A 1TEWA 1TDYA 3P68A 1GE0A 5HNLA 2HUBA 1JKDA 4HSFA 4H93A 1GF9A 4WM6A 4HP0A 2YSSC 4Z3MA 3A91A 1MLCE 1HEPA 2FBBA 4WM1A 1G7MC 4NSIA 5LVJA 4WL6A 2LZ2A 4LT1A 5FHWA 1UCOA 4IATA 1HSWA 1JUGA 1HSXA 2BQAA 1LJJA 2FYDA 1YAPA 2ZILA 1YILA 2BQFA 4ML7A 3TXEA 4HPEA 1WTNA 3LYTA 1W08A 1J1XY 4KL7A 4DDAA 4DD9A 5LAGA 1LTMA 1IC5Y 1EQEA 4NGVA 1YL1X 1D0LA 1JTOL 2B5ZA 4ANRA 1RCMA 1OUDA 2HECA 4GLVA 2BAAA 4NGYA 4YEOA 5L3HA 4B4EA 3AZ5A 1LSZA 2HEFA 1YROA 1NDMC 4NHTA 3TXIA 5FDJA 2Q0MX 3OK0A 4XENA 193LA 4LZTA 3ZEKA 1FKQA 1REZA 2AUBA 5HQ1A 5B05A 1GB7A 1KXXA 1I56A 1NBZC 1B7LA 1W6ZA 1RJCB 2DQAA 1YIKA 5LA8A 1IP4A 4J0LA 1CJ8A 3HBEX 4WO9A 1SQ2L 1HMLA 1LZNA 2Z2FA 3EXDA 5C6JA 3A92A 1QTEA 3CSRA 1HELA 6LYZA 5B07A 5KXOA 1GHLA 1NKHA 2DQIY 5DN5A 4GCBA 3EBAB 1BB3A 3AGHA 3WL2A 5KXXA 1D6QA 8LYZA 2ZIJA 4NFVA 2Z2EA 1GXXA 1AT5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GUPA 2BQIA 3F6ZA 1E8LA 3A8ZA 1G0PA 4H92A 1NHEA 1GEVA 1LCNA 3WVYA 186LA 1EL1A 1LMCA 3GUJA 4C5FA 1C6GA 1BGIA 1GFVA 1C6CA 4H9EA 1L43A 1OWZA 248LA 1LYEA 1YL0X 1PQDA 2RBPA 1DYCA 1GXV2 1QT5A 3HBDA 3AZ4A 1KW5A 5I4YA 4A7DA 3HDEA 1FDLY 3LN2A 2BQBA 1KIPC 206LA 3RU5A 1FKVA 5KXTA 4W52A 257LA 4WM3A 4G49A 2DQCY 1L75A 235LA 1JTNA 1IEEA 1LPIA 1G0GA 2ZWBA 3VW7A 4EKRA 123LA 4OWEA 4PHIA 1QTHA 1QT7A 4HJYA 4TSCA 4R6CA 133LA 1JIYA 147LA 1L96A 1IP1A 4W94A 1JITA 5APFA 1D3JA 4NY5A 3A3QA 4LFPA 3WULA 5D5CA 2BPUA 1L11A 3L2XA 4CJ2A 3WVXA 2H9JA 4LYOA 1P2RA 1L92A 2RB2X 1JKBA 1KIQC 2LCBA 2MEGA 1UUZC 5FSTA 2EKSC 3WU7A 3A95A 1ZWNA 2ZYCA 5L9JA 3GUNA 1L60A 5E9RA 3L64A 1BWJA 227LA 4I7TA 1VFBC 1GF0A 1C6DA 3HTDA 182LA 3AZ6A 2I6ZA 1L16A 4Z98A 3AZ7A 3CDVA 4LYZA 1HEWA 4ZPUA 1LMQA 4HTNA 4GN3A 1LYYA 2Z37A 1OV7A 1JISA 7LZMA 1KS3A 1T97A 4CHXA 3OJPA 5APCA 1L51A 3B0IA 4TWSA 1L59A 4UWVA 1LKRA 4H1PA 4H94A 1QQYA 1WQQA 1JTMA 1YKYX 4ETEA 5JENB 3WXUA 1C63A 3WH1A 2BLYA 3DMVA 2OU9A 1QTBA 3C8SA 5KXKA 1IWZA 3CDQA 4XJBA 1LSPA 1XEPA 5C6LA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1B5W A;  1UBZ A;  1FLW A;  1LYS A;  1NF5 A;  1INU A;  1NWG A;  1C10 A;  1RE2 A;  1BWH A;  2BQI A;  2MEC A;  3F6Z A;  4LGK A;  4B49 A;  4H8Z A;  4RLM A;  1E8L A;  1V7S A;  3A8Z A;  4H92 A;  1NHE A;  1JJ1 A;  5KXL A;  3M3U A;  3LYO A;  1JPO A;  4OW1 A;  1BVX A;  1B5U A;  1GEV A;  1LJ4 A;  1XGP C;  4M6D A;  3RW8 A;  1LCN A;  3KAM A;  1LZG A;  3WVY A;  4DD1 A;  1TBY A;  3AB6 A;  1EL1 A;  3N9A A;  4HV1 A;  4DD2 A;  4J1A A;  1LMC A;  4BS7 A;  3QE8 A;  4N1E I;  5T3F A;  3T6U A;  5A3Z A;  1AZF A;  207L A;  1B7R A;  3BKV A;  4C5F A;  1AM7 A;  1CKH A;  1BGI A;  1GFV A;  1DXJ A;  2N5Z A;  2BLX A;  5KJ9 A;  1LSD A;  1UIF A;  1DKJ A;  1VED A;  4H9E A;  2LZT A;  1IC4 Y;  1GE3 A;  3TXF A;  4HV2 A;  1LMT A;  4KXI A;  3P4Z A;  2YBI A;  4LFX A;  1GFJ A;  4PPO A;  1YL0 X;  3MGW A;  1CJ7 A;  1CKD A;  1GXV 2;  2F2N A;  4HPI A;  1QSW A;  3HBD A;  1WQR A;  4NG8 A;  1LZ4 A;  5I54 A;  1DI4 A;  1B5Z A;  2W1X A;  3AZ4 A;  1VAT A;  5LVH A;  2BQN A;  1LHK A;  4OOO A;  1B7S A;  4W96 A;  1CKC A;  1SLY A;  3LYZ A;  3TMV A; 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 1YKZ X;  4ETC A;  4DDC A;  5KXN A;  2XTH A;  135L A;  1FLY A;  4WG1 A;  1BB7 A;  2Y8P A;  2ZYP A;  2C8O A;  4HTQ A;  4LT3 A;  3W6E A;  1WVV A;  4WL7 A;  1TEW A;  1TDY A;  3P68 A;  1GE0 A;  5HNL A;  2HUB A;  1JKD A;  4HSF A;  4H93 A;  1GF9 A;  4WM6 A;  4HP0 A;  2YSS C;  4Z3M A;  3A91 A;  1MLC E;  1HEP A;  2FBB A;  4WM1 A;  1G7M C;  4NSI A;  5LVJ A;  4WL6 A;  2LZ2 A;  4LT1 A;  5FHW A;  1UCO A;  4IAT A;  1HSW A;  1JUG A;  1HSX A;  2BQA A;  1LJJ A;  2FYD A;  1YAP A;  2ZIL A;  1YIL A;  2BQF A;  4ML7 A;  3TXE A;  4HPE A;  1WTN A;  3LYT A;  1W08 A;  1J1X Y;  4KL7 A;  4DDA A;  4DD9 A;  5LAG A;  1LTM A;  1IC5 Y;  1EQE A;  4NGV A;  1YL1 X;  1D0L A;  1JTO L;  2B5Z A;  4ANR A;  1RCM A;  1OUD A;  2HEC A;  4GLV A;  2BAA A;  4NGY A;  4YEO A;  5L3H A;  4B4E A;  3AZ5 A;  1LSZ A;  2HEF A;  1YRO A;  1NDM C;  4NHT A;  3TXI A;  5FDJ A;  2Q0M X;  3OK0 A;  4XEN A;  193L A;  4LZT A;  3ZEK A;  1FKQ A;  1REZ A;  2AUB A;  5HQ1 A;  5B05 A;  1GB7 A;  1KXX A;  1I56 A;  1NBZ C;  1B7L A;  1W6Z A;  1RJC B;  2DQA A;  1YIK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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