1CKHA

T70v mutant human lysozyme
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKVPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Contribution of intra- and intermolecular hydrogen bonds to the conformational stability of human lysozyme(,).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 51
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ckhA00
3ATOA 1ALCA 1GDXA 2HTXA 1BQLY 3P4ZA 4N5RA 1I1ZA 5DLAA 4YEMA 2Z37A 4WLDA 5L3IA 4GN3A 1DPXA 2CDSA 3AZ7A 2H9JA 5KKIA 3WYHA 1AZFA 4EMNA 9LYZA 5FCPA 4RW1A 1RJCB 4LFPA 1QSAA 4BADA 3J6KA 4QGZA 1OP9B 1JTPL 5IDDA 1LMNA 1LJGA 3A6BY 2ZYPA 1LZGA 5F16A 2YSSC 1UCOA 5HMJA 1WVUA 3EXDA 3BKHA 1LKRA 1A2YC 135LA 1LZYA 1VFBC 1IR9A 1YROA 2YBJA 3LZTA 4HJZA 2DBTA 1IP4A 1GBYA 1LYSA 2F30A 1QQYA 2YBLA 4NGIA 4NSHA 3TXBA 1FN5A 1UIDA 4XYYA 6LYZA 1JEFA 1JISA 5HNCA 1IWXA 1XGRC 1GBZA 1C43A 1FLQA 2D4IA 2DQDY 4NFVA 1IOQA 1B5YA 4H94A 1GAYA 2C8OA 2PC2A 4HSFA 3AZ4A 1O23A 5KXSA 4C3WA 3CB7A 5LAFA 1LHHA 2BQBA 1ZV5L 3RNXA 4DD0A 3LHMA 4WOAA 4DD1A 3W6AA 4TX7A 1GXV2 3ZVQA 1CKHA 1DQJC 4X3BA 4LYMA 1HF4A 2MEIA 5D5FA 4H9IA 2CJLA 4NG8A 1UIAA 1JIYA 1YANA 1LSGA 1UUZC 5KXWA 5APDA 5C6IA 1BB7A 1LSNA 208LA 1LJKA 3A8ZA 1LZ6A 4G4HA 1NBYC 1KIPC 2HECA 1LZTA 2W1MA 5F9UA 1JKCA 4NGLA 1CJ7A 5B1FA 3N9EA 1IOSA 5KKJA 1C46A 2HEEA 2MEFA 1IC7Y 1H87A 4NEBA 4WM1A 1JSEA 2BQEA 4NWEA 4XJFA 5FDJA 4ETBA 1BWIA 1WQPA 4TWSA 4RW2A 1REYA 1B7OA 3WMKA 4WO9A 1LMTA 5KJ9A 1FLUA 1E8LA 1LSDA 3CSRA 1JHLA 1HSXA 1SQ2L 4NGJA 4ZEEA 2DQAA 4CJ2A 1GF0A 1CNSA 1NBZC 2EIZC 2Z38A 3A93A 1G7JC 3AW7A 3QNGA 1YAPA 4J1AA 4DD7A 3D9AC 4KL7A 3AGHA 4OOOA 3CSZA 4B49A 1YAQA 1LZAA 1HEQA 3HBDA 1LJEA 1TCYA 1LZSA 4OWEA 1G7LC 2Z12A 4OWHA 4LGKA 4L41A 4GCDA 1BB4A 3W6FA 5I4WA 153LA 4E3UA 1IC4Y 4WO6A 3AB6A 1GE3A 4UWUA 4LT3A 1V7TA 3W6EA 3B72A 3ULRA 1LZ4A 3WPJA 4DC4A 1ZMYL 1LKSA 1LZ1A 1NDMC 4NG1A 1AT5A 1NWGA 1B2KA 1TEWA 4H90A 4R0FA 4NSIA 1QIOA 1JUGA 1EQ4A 3CT5A 4PHIA 4XJGA 4WG7A 5LXWA 4YOPA 2ZQ3A 5LIOA 5LYMA 1LJFA 3AZ5A 3P66A 5LINA 2LZ2A 5D5CA 1ZVHL 1QUSA 4ETCA 2I6ZA 2LZTA 3WUNA 4WL6A 2F4AA 4Z98A 4OWCA 4ML7A 1LHMA 5KXYA 4B4JA 1YAOA 3A6CY 4H8XA 3CT1A 2BQFA 4YF2A 2LYZA 2G4PA 3WUAA 1CKDA 4DD2A 1C08C 1RI8B 4IASA 4TSBA 4B1AA 3A94A 2BAAA 1LMPA 1HFXA 4II8A 4YM8A 1UIBA 1HEWA 4WL7A 4NHSA 1V7SA 1NDGC 1HERA 3AW6A 4NWHA 1YIKA 1GFVA 1IP5A 5LVGA 1WVVA 3LYTA 1OUBA 4G4CA 4GCBA 4D9ZA 3WW5A 8LYZA 5L3HA 1OUEA 4PPOA 3ZVQB 1YKYX 4LZTA 1A4VA 4WM6A 4DDBA 5KXTA 1J1PY 4NHTA 4NGZA 5DM9A 1HELA 2A7FA 4O34A 4PJ2C 1EQEA 1JTOL 1UC0A 3HBHA 4TSCA 1QUTA 3EO5A 3WU7A 1JPOA 3WPKA 1CKGA 1YL1X 4HPIA 4XJDA 5LVJA 3AZ6A 1LSBA 1GF8A 3AYQA 1G7HC 1UICA 2MECA 1BB3A 5HNLA 4R6CA 2XBSA 1IWZA 1HFZA 4N1CC 1LHLA 2ZIKA 3A3RX 4FDYA 1BB6A 1OUJA 3IJUA 5JENB 1IC5Y 1BWHA 4HPEA 1LMCA 2GV0A 1FDLY 1J1XY 3RU5A 2XBRA 4GLVA 1DZBX 1RE2A 4WM2A 1INUA 1GFRA 4KPMA 5I4YA 1LMOA 1BWJA 1OUGA 1BVKC 5E4PA 7LYZA 1QTKA 1B5XA 1DI3A 1CJ8A 1WQMA 3IWRA 5APCA 1KXXA 5I5QA 1PZYA 4MCKA 4EOFA 4XJIA 2FBDA 1GF4A 1LJIA 2BQDA 2HEFA 1HENA 1RCMA 2W1XA 2DQGY 1LCNA 4HJYA 5FEKA 5LVKA 4CGEA 1UIGA 1HEPA 1P2CC 1HNLA 2BQJA 3AGGG 1LYOA 5DL9A 3A91A 1FBIX 3A90A 4DDCA 1WTMA 1TAYA 4H1PA 2ZQ4A 5I54A 4H9FA 1B7RA 1IR7A 1FKQA 4WM5A 4XADA 1WQQA 5KXPA 3A67Y 4G9SA 1LSFA 1REXA 4QY9A 2MEEA 1JKDA 1LHJA 3M18B 4HTQA 3EBAB 5KXKA 2BQIA 3LYOA 3ZEKA 4ETEA 1LMAA 2XTHA 3LN2A 1BGIA 3BKVA 1YKZX 3M3UA 4DYGA 2AUBA 1UIFA 1LSAA 5FHWA 2EKSC 1IR8A 3W6BA 4UWNA 5KXOA 2I25L 3CQLA 1B7MA 1YKXX 3A96A 5B05A 2YBNA 4W96A 2Q0MX 3W3EA 1GE0A 2DQHY 5KXNA 3WXUA 3VWOA 4U3XB 5AMYA 3WVYA 1JJ3A 2YDGA 4DT3A 1GF5A 2YBMA 4QDNA 4WG1A 5HMVA 1C45A 2HEAA 1GFKA 1VATA 4BAPA 5K7OA 4I8SA 1IOTA 3OK0A 2BQOA 1B7PA 5B1GA 5DN4A 132LA 2BQMA 1B7SA 207LA 1GFUA 4DWXA 1NHEA 1OUHA 3EMSA 2BQNA 1GXXA 1JITA 3B0IA 4B4EA 5EBHA 4HTKA 3CSQA 1GFTA 2MEGA 4GCEA 4ET8A 1VDTA 4HJVA 5KXRA 1GBOA 1T3PA 4XN6A 3W6DA 5M1YA 1IVMA 1W6ZA 1WQNA 1LSYA 2IHLA 3J4GA 3RZ4A 3LZ2A 4TUNA 4I0CA 1EQ5A 1C10A 5ILFA 5ILCA 1WQOA 2Z39A 5APFA 4NSGA 1LHKA 4OOTA 1GB3A 1BVXA 2YBHA 3A92A 3K3TA 4NGYA 3WUMA 1YAMA 1VDSA 3QE8A 1AKIA 2BQCA 2FBBA 4PGJB 4WLYA 3GXRA 1ZVYB 1GFEA 1B5VA 2WARA 4YENA 5FELA 4BS7A 4DD9A 3N9CA 1G7MC 1D6QA 2DQIY 134LA 1TBYA 4CHXA 3WPLA 5T3FA 4IATA 3TMXA 4H91A 5I53A 2FYDA 194LA 4IJ4A 1IY4A 5LA5A 2XJWA 3T6UA 1B5ZA 4XJBA 2DQFC 3LYZA 3P65A 1LJ4A 5IELA 3TXFA 4H9HA 4H9CA 1HSWA 4LYOA 1GEZA 2LHMA 1LSCA 1DXJA 1HMKA 1UIHA 3WU8A 5LYTA 1IY3A 4N8ZA 4LYZA 2CWIA 2X0AA 1AT6A 1FKVA 2VB1A 3G3AB 4J7VA 1GFHA 1IORA 3A3QA 4Z41A 3LYMA 4XENA 1LZBA 1GAZA 1XGQC 3WULA 4B4IA 1B9OA 3W6CA 1Z55A 2Z2FA 5C6LA 4J0LA 5LVHA 4J1BA 1IP1A 4NGVA 1MLCE 4XJHA 4OWAA 1DKJA 1N4FA 4RLMA 1LSPA 3A34A 1QDTA 2IFFY 1B0DA 1QTEA 4GCFA 2CGIA 2LYMA 1BHZA 1OQMA 1LJJA 3ATNA 1LMQA 2ZNXY 1GB9A 1GB7A 1UACY 4NHPA 1IP7A 1LZNA 4BAFA 4GN5C 4Z46A 1IWUA 1T6VL 2W1YA 2BQHA 2RSCA 4HTNA 1I56A 1D6PA 4UWVA 1KIQC 5HQ1A 1GF3A 4NHIA 1IEEA 2BPUA 1H6MA 3QY4A 1HHLA 1OUDA 1FLWA 1JKBA 4NY5A 4LYCA 3TXKA 3WVXA 1IWTA 1YQVY 2F4GA 4M4OA 1IWVA 1DI5A 4ZFPA 1LOZA 2HU1A 2HUBA 4WM3A 1F10A 3KAMA 1RFPA 1D0MA 1SLYA 4WMGA 5C6JA 1GBXA 4LFXA 3TXDA 3AGIA 4H92A 1J1OY 2A7DA 3P68A 1KXWA 4A7DA 4ET9A 5A3ZA 1LJNA 3IJVA 1AM7A 1CJ9A 1HFYA 3TMWA 4H8YA 1HMLA 2MEBA 1LPIA 3FE0A 2H9KA 3TXHA 5LA8A 1GF9A 1IOCA 4PRQA 3CT0A 2Z2EA 1BB5A 5FSTA 2BQKA 5B07A 2DQJY 1JTTL 4NHQA 1F6RA 5LVIA 1OUCA 1JWRA 2DKVA 4FJRA 133LA 1REMA 1XEJA 2BQAA 4HP0A 2Y8PA 1GE1A 2ZNWY 5A3EA 1XEKA 3WL2A 4CFPA 1GHLA 1HEOA 4NGWA 4AGAA 1NQIA 1DI4A 3F6ZA 2H5ZA 2HEBA 1LZRA 1G7IC 2BQLA 1DPWA 2Z18A 4H9EA 1CKFA 3TXEA 1HEMA 1OUAA 1GDWA 1WQRA 2G4NA 4WLXA 5LYZA 3SP3A 2DQEY 1XGTC 1GB5A 4H8ZA 1JJ1A 5II3A 2D6BA 5IHGA 1B7QA 3TMVA 1OUIA 1JKAA 1GFGA 1LSMA 4HV1A 1LZCA 4ETAA 1GEVA 1GB8A 1LYYA 1IX0A 3G3BB 4LT0A 4Z3MA 1VDQA 2YBIA 4OWBA 1VAUA 2ZIJA 4NGOA 1B7NA 1FLYA 2DQCY 5KXZA 2EQLA 5J7CA 1GF7A 2BLYA 4PRUA 5B59A 154LA 1NMMA 1XFPL 3WU9A 4N1EI 4G4BA 2B5ZA 1IWYA 1GPQC 2ZWBA 3WW6A 1YILA 3AJNA 4QEQA 1GB0A 4LT2A 3N9AA 4YEOA 1UA6Y 2BLXA 4WLTA 1GFJA 4GN4A 3WXTA 4ANRA 1NF5A 5L9JA 1B7LA 1D9UA 4LT1A 1DKKA 1GE2A 1XSFA 3HFMY 4RDSA 1LZDA 3TXJA 4N9RA 2D91A 4H93A 2BQGA 4M6DA 2F2NA 1GBWA 5F81A 4C5FA 1LAAA 1LZEA 1IP3A 4W94A 4H9BA 1F0WA 1IWWA 3TMUA 4ETDA 3B0KA 3D3DA 1KIRC 1REZA 1B5UA 1LJHA 1LYZA 1I20A 1LZ5A 4DDAA 5KXLA 1GFAA 2MEHA 1VDPA 3HBEX 1W08A 4NGKA 5F14A 1LHIA 4ZIXA 4KT3A 4P2EA 1C7PA 2MEAA 3OJPA 2Z19A 3RW8A 2YVBA 4MR1A 1LJ3A 5DN5A 6LYTA 2C8PA 1WTNA 2D4KA 3GXKA 2FYCA 4LYTA 4G49A 3A95A 1CKCA 1LZ9A 1HC0A 1GB6A 4N0JA 4RLNA 4WM4A 5KY1A 2LYOA 2ZYCA 5KXXA 2I26L 4TTDA 1VEDA 3B6LA 5HLLA 2HEDA 1QDRA 1XGPC 5LAGA 1GB2A 1D0LA 2W1LA 4GLAA 5KXMA 1IO5A 1F6SA 1UBZA 5F9XA 1TDYA 5B06A 1XEIA 3WH1A 1OUFA 1NKHA 4CFOA 5I4XA 2EPEA 4NIJA 4KXIA 3T36A 1IP2A 1IP6A 1XGUC 3B0OA 1PS5A 4LYBA 1GD6A 1QSWA 2N5ZA 3MGWA 1JSFA 2NWDX 3FI7A 1LTMA 4GCCA 1JJ0A 5E9RA 1B5WA 1CJ6A 5APEA 1KXYA 1LSZA 4DD3A 1GBSA 1LSEA 3RT5X 1GWDA 4AXTA 4H9AA 4NSJA 1GF6A 3E3DA 4OW1A 3TXIA 4HV2A 3P64A 1YL0X 1GE4A 1UIEA 4B0DA 2D4JA 4MSTA 2G4QA 2MEDA 1EL1A 2HU3A 1D0KA 3TXGA 193LA 2ZILA 1MELL 1LZ8A 1IIZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ATOA 3V2WA 1QT3A 2HTXA 1BQLY 1L59A 3DMVA 4WLDA 1NHBA 3AZ7A 4EMNA 5FCPA 4LFPA 3J6KA 2ZYPA 5F16A 1L02A 3K2RA 1WVUA 1QUHA 3EXDA 3BKHA 135LA 2YBJA 3LZTA 1IR9A 2LC9A 1L53A 2YBLA 2F30A 1FN5A 1UIDA 4XYYA 6LYZA 237LA 1P46A 1GBZA 1C43A 1FLQA 1B5YA 4H94A 4LDEA 1G0QA 196LA 1GAYA 4HSFA 3AZ4A 1O23A 5KXSA 6LZMA 4I7LA 1LYDA 5LAFA 1LHHA 2O4WA 1GXV2 4TX7A 1DQJC 1HF4A 5D5FA 4H9IA 4LDLA 1YANA 4PK0A 5APDA 1CV5A 1LJKA 4G4HA 250LA 2Q9EA 5F9UA 5LZMA 144LA 252LA 3N9EA 4I7TA 2HEEA 3C83A 4WM1A 1IC7Y 1EPYA 4GRVA 2BQEA 4TWSA 4RW2A 1REYA 4WO9A 5KJ9A 1FLUA 1E8LA 170LA 1L24A 1SQ2L 119LA 1CNSA 1T8GA 1G7JC 2F47A 1G07A 1L10A 4ARQB 1YAQA 2Z12A 198LA 3HTGA 1BB4A 3W6FA 205LA 4WO6A 3AB6A 1GE3A 2HULA 3W6EA 1V7TA 3ULRA 1L66A 4DC4A 1NDMC 1AT5A 4H90A 1L87A 251LA 1QTCA 234LA 2ZQ3A 5LIOA 1LJFA 1OVKA 3AZ5A 3P66A 1XEPA 1ZVHL 1T97A 2I6ZA 3WUNA 4Z98A 4H8XA 2BQFA 1C6AA 1CUPA 2LYZA 4IASA 190LA 3A94A 1LI2A 4II8A 1UIBA 1HEWA 1P37A 3SB7A 1YIKA 3SB6A 3WW5A 5L3HA 1LYJA 1XJTA 3ZVQB 1XJUA 4LZTA 1L09A 1HELA 3OE8A 2A4TA 1UC0A 3HBHA 3WPKA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3ATO A;  1ALC A;  1GDX A;  2HTX A;  1BQL Y;  3P4Z A;  4N5R A;  1I1Z A;  5DLA A;  4YEM A;  2Z37 A;  4WLD A;  5L3I A;  4GN3 A;  1DPX A;  2CDS A;  3AZ7 A;  2H9J A;  5KKI A;  3WYH A;  1AZF A;  4EMN A;  9LYZ A;  5FCP A;  4RW1 A;  1RJC B;  4LFP A;  1QSA A;  4BAD A;  3J6K A;  4QGZ A;  1OP9 B;  1JTP L;  5IDD A;  1LMN A;  1LJG A;  3A6B Y;  2ZYP A;  1LZG A;  5F16 A;  2YSS C;  1UCO A;  5HMJ A;  1WVU A;  3EXD A;  3BKH A;  1LKR A;  1A2Y C;  135L A;  1LZY A;  1VFB C;  1IR9 A;  1YRO A;  2YBJ A;  3LZT A;  4HJZ A;  2DBT A;  1IP4 A;  1GBY A;  1LYS A;  2F30 A;  1QQY A;  2YBL A;  4NGI A;  4NSH A;  3TXB A;  1FN5 A;  1UID A;  4XYY A;  6LYZ A;  1JEF A;  1JIS A;  5HNC A;  1IWX A;  1XGR C;  1GBZ A;  1C43 A;  1FLQ A;  2D4I A;  2DQD Y;  4NFV A;  1IOQ A;  1B5Y A;  4H94 A;  1GAY A;  2C8O A;  2PC2 A;  4HSF A;  3AZ4 A;  1O23 A;  5KXS A;  4C3W A;  3CB7 A;  5LAF A;  1LHH A;  2BQB A;  1ZV5 L;  3RNX A;  4DD0 A;  3LHM A;  4WOA A;  4DD1 A;  3W6A A;  4TX7 A;  1GXV 2;  3ZVQ A;  1CKH A;  1DQJ C;  4X3B A;  4LYM A;  1HF4 A;  2MEI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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