1CNCA

Compensatory plastic effects in the redesign of protein-zinc binding sites
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFCFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structural consequences of redesigning a protein-zinc binding site.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1994-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cncA00
2QOAA 3MYQA 4QIZA 3V3GB 4X5SA 4E3FA 4K0SA 3MNUA 1YDAA 1THKA 3M1QA 1F2WA 3M40A 4CNXA 3JXHC 4YGLA 2FOYA 1CRAA 5SZ7A 3HKQA 3M96A 5FNHA 2X7SA 5AMDA 4FVOA 1H9NA 1CA2A 12CAA 5DRSA 4RUZA 5CACA 4MDGA 1JD0A 1CALA 4Q7SA 3RYYA 4Q06A 2NXTA 4QSJA 1LG6A 2WD2A 4YVYA 3HKTA 3RZ7A 4KUWA 2CBCA 5FNKA 3T85A 3N2PA 3FE4A 4COQA 1TTMA 1TBTX 4Q09A 2VVBX 3KLDB 1CAIA 3KOKA 2FNNA 2AX2A 4QEFA 5FNJA 4LU3A 3RYZA 4MLXA 2NXSA 2NWZA 3OYSA 2WD3A 3MWOA 4UOVA 3OILA 5G0BA 4XIXA 5DOGA 3R17B 2OSFA 3MNAA 5L6KA 4KUYA 1V9IC 4Q6DA 1J9WA 1CCUA 3UYQA 3DV7A 4Q7WA 3S9TA 4CA2A 1CVAA 3BETA 4ZX0A 4YGJA 4Q99A 5FLQA 1BV3A 5FLTA 5SZ6A 4LHIA 5G03A 4FU5A 4YX4A 1CAJA 1JV0A 1BNWA 5E28A 3N4BA 1CNYA 1YO1A 4JSSA 1HCAA 1XEGA 1G54A 3B1BA 5CLUA 2FNKA 5EKMA 2Q1QA 4Q08A 4ETQC 4QK1A 5E2SA 3DCWA 3MHMA 4MTYA 3T84A 5FNIA 1HEAA 1BNTA 2HNCA 4Z0QA 4QIYA 1RAZA 3RYVB 3IBLA 1CNXA 1CAOA 2POVA 3ML2A 3D92A 3FW3A 4L5WA 1G3ZA 1CVHA 2CBEA 4ITPA 4DZ9A 4JSZA 3NI5A 1CVCA 3K2FA 4CQ0A 1IF8A 2W2JA 1ZGEA 1UGCA 5FDIA 4Z1JA 4L5VA 4ZAOA 4QJWA 3CAJA 4GL1X 1FR4A 1DCAA 1KWRA 2HD6A 1V9EA 1ZFQA 4RUXA 5EHEA 5DOHA 1CILA 3OY0A 4QK2A 8CA2A 1Y7WA 5BNLA 5EH8A 1KEQA 3F7BA 5EIJA 5FLPA 1RZEA 4FL7A 5EKJA 1I9MA 5L3OA 5A6HA 3MNIA 5IPZA 4KNMA 1CAZA 5JGTB 1YDBA 5DSMA 4KP5A 1A42A 3P3JA 3DCSA 4CNVA 1IF5A 1CVBA 1DMXA 2POUA 5E2NA 3RZ0B 5JEGB 3S78B 3HFPA 2FNMA 4FIKA 1ZSAA 3MDZA 1FQLA 3NJ9A 1KOQA 3M1JA 3OIMA 4ZWZA 2NNVA 3DC3A 3KONA 4N0XB 4HT2A 5FL6A 4YXIA 1CNJA 3GZ0A 3P44A 3P58A 3RZ5A 5CJFA 1CZMA 1TH9A 1G0EA 4FRCA 1CNIA 1RZCA 4MO8A 3IBUA 4YXOA 4HEZA 4QSAA 4WUPA 3KNEA 4Q8YA 4TWLA 1XEVA 4CNWA 3FFPX 4ZWYA 5JQTA 3V2MA 3S74B 3M98A 1UGEA 1I91A 1Z93A 2OSMA 5EKHA 1CRMA 3IAIA 1EOUA 1TEUX 2FOUA 4Z1EA 4PYYA 1ZSCA 3M2ZA 5FNMA 4YXUA 3RZ8A 4YGNA 1Z97A 4PYXA 4R5BA 2ZNCA 3BL0A 4PZHA 1Z9YA 4WL4A 4HT0A 1FQMA 1ZFKA 5DSQA 1UGGA 1ZE8A 4Q9YA 4QJMA 3S76A 1HCBA 2F14A 3V2JA 4HU1A 1CNKA 5FNGA 3SBIA 3T5ZA 4E5QA 4DZ7A 4L5UA 4RFDA 3M1KA 1BICA 5G01A 1CAYA 2NN1A 1RAYA 2FMZA 1CINA 3OKUA 1BNVA 4QTLA 2FOSA 3MNJA 4Y0JA 3S75B 3V3JA 2X7TA 5E2RA 3M2XA 1CAKA 1H4NA 3DD0A 3VBDA 2ILIA 1HVAA 3DC9A 2H4NA 5BRWA 4KNIA 4Q8XA 5SZ1A 1HUHA 1I90A 1I8ZA 5DSIA 1HEBA 2HFWA 1YDDA 3D93A 1T9NA 5EHWA 1HECA 3V7XA 4Q7PA 7CA2A 4N16A 4Q78A 4KP8A 4M2UA 3RYXB 3U3AX 5SZ0A 2CABA 3M04A 4HF3A 3TVNX 1URTA 5HPJA 4LP6A 4XZ5A 3C7PA 5DSLA 5FNLA 2HOCA 3M5TA 4K13A 4XE1A 4JSWA 4RN4A 3JXFA 5J8ZA 5EZTX 3KWAA 1AZMA 3F4XA 3PJJA 4R5AA 3KS3A 3N0NA 1FR7A 1FSQA 1G46A 4E9OX 1AM6A 1BN4A 3SAPA 1CVFA 3K34A 4JSAA 5EHVA 2FOQA 1UGBA 3TMJA 5DSPA 3MNHA 3U45X 4E3HA 3P5AA 1BNMA 1TB0X 5DSOA 3P3HA 3HKNA 4BF1A 1UGAA 2NNSA 2NNOA 3R16A 1YO2A 1I9PA 4CACA 3RZ1B 3DD8A 5SZ3A 3BL1A 2NXRA 3MMFA 3T83A 1BNNA 4Q49A 5FL4A 4YWPA 2WEGA 1XPZA 4RIUA 1BNQA 3S71B 4E3DA 5DSNA 2H15A 3DVBA 1TE3X 5A25A 3T5UA 4HBAA 1I9NA 3IEOA 3CZVA 2NWOA 1OKLA 3DAZA 3MHOA 3S73B 1BCDA 3NB5A 1FSNA 4RIVA 1AVNA 2Q1BA 4K0TA 1RJ6A 4FPTA 1OQ5A 5CA2A 1RZDA 3P4VA 4E3GA 2ABEA 2HKKA 3DBUA 4M2VA 4WW6A 5C8IA 3ZNCA 5E5UA 4RFCA 1CIMA 4MDMA 1CVEA 4FVNA 4K0ZA 3F8EA 3EFIA 1LUGA 1CNCA 5AMGA 3MHIA 4YHAA 2QP6A 2GEHA 2EU2A 1BN1A 2NN7A 5JDVB 1CA3A 1RZAA 4Z1NA 3V5GA 3V3FA 3M2YA 1OKMA 1TG3A 3KOIA 4ZWIA 4QJOA 5JG3B 3M67A 5SZ4A 1TEQX 3PO6A 2CA2A 1CNBA 2FMGA 3MNKA 5BRUA 4Z1KA 5JQ0A 1BZMA 4XIWA 3DA2A 5EH7A 3D8WA 2CBBA 3IGPA 5JEHB 3DCCA 1BNUA 2GD8A 3MZCA 1IF4A 4QK3A 1G52A 1G4OA 4XFWA 4QJPA 1I9OA 3QYKA 3W6HA 3OIKA 2IT4A 3IBIA 5E5RA 3HLJA 5EOIA 4QJ0A 3M14A 2VVAX 3DVDA 1FSRA 1I9LA 4PXXA 1CVDA 1G1DA 3EFTA 3L14A 3RLDA 5SZ5A 3V3IB 4M2RA 4Q83A 2NMXA 4QSIA 5E2KA 4RUYA 4Q87A 3IBNA 3Q31A 1H9QA 4ZWXA 1JCZA 4G7AA 4ILXA 1DMYA 4WW8A 2X7UA 5FL5A 1G6VA 2NWPA 4KNJA 4KV0A 3S77B 4ITOA 1CNWA 4QJXA 1CANA 1CAHA 4JS6A 1BN3A 2CBDA 2Q38A 3P55A 3OYQA 4K1QA 3B4FA 1YDCA 1CNHA 2EZ7A 4Q07A 4WR7A 4C3TA 9CA2A 3CA2A 3HS4A 3MHLA 4Q90A 1TG9A 2FW4A 1ZSBA 4HEYA 3M2NA 3HKUA 3M3XA 5DSJA 4BF6A 3SBHA 4ZX1A 4MLTA 3U47A 1YO0A 1FLJA 4Q81A 1CNGA 5EH5A 3LXEA 2QO8A 3KIGA 4Q6EA 4M2WA 3S8XA 5AMLA 3RYJB 1LZVA 5FLSA 3PYKA 1ZNCA 1OKNA 3K7KA 1G0FA 5JEPB 6CA2A 4CNRA 1I9QA 4KAPA 3RJ7A 2WEJA 5JESB 1G4JA 4E4AA 2FOVA 1FQNA 2O4ZA 3RG4A 1IF7A 4BCWA 2NWYA 3S72B 4YGFA 1G48A 2AW1A 1LG5A 1HUGA 3U7CA 1HEDA 3KKXA 1IF6A 4RH2A 2WEHA 1CCSA 1IF9A 3F7UA 1RZBA 4TWMA 3DVCA 1CAMA 3ML5A 5DSKA 2EU3A 3JXGA 3UYNA 5SZ2A 1FQRA 4E49A 5FLOA 5FLRA 3SAXA 1G53A 4IWZA 3CYUA 3N3JA 3ZP9A 2CBAA 5JGSB 4G0CA 4QY3A 5BRVA 5JG5B 1CCTA 4QSBA 1ZH9A 2NNGA 3W6IA 4YGKA 5FDCA 2POWA 1MUAA 1RJ5A 5G0CA 3RG3A 3D0NA 1KWQA 3M1WA 3MHCA 4IDRX 1LGDA 4PQ7A 5E2MA 4Q0LA 3M5SA 5LMDA 1ZGFA 1G45A 5DVXA 4WUQA 1MOOA 1UGDA 2HL4A 4R59A 4KUVA 4Q8ZA 1DCBA 2WEOA 3S97A 3V3HB 3M5EA 1KOPA 4KNNA 1UGFA 1XQ0A 4HEWA 5DSRA 3RGEA 4YYTA 3P5LA 3T82A 4MDLA 3TVOX 5BYIA 3OKVA 3D9ZA 4Q7VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2QOA A;  3MYQ A;  4QIZ A;  3V3G B;  4X5S A;  4E3F A;  4K0S A;  3MNU A;  1YDA A;  1THK A;  3M1Q A;  1F2W A;  3M40 A;  4CNX A;  3JXH C;  4YGL A;  2FOY A;  1CRA A;  5SZ7 A;  3HKQ A;  3M96 A;  5FNH A;  2X7S A;  5AMD A;  4FVO A;  1H9N A;  1CA2 A;  12CA A;  5DRS A;  4RUZ A;  5CAC A;  4MDG A;  1JD0 A;  1CAL A;  4Q7S A;  3RYY A;  4Q06 A;  2NXT A;  4QSJ A;  1LG6 A;  2WD2 A;  4YVY A;  3HKT A;  3RZ7 A;  4KUW A;  2CBC A;  5FNK A;  3T85 A;  3N2P A;  3FE4 A;  4COQ A;  1TTM A;  1TBT X;  4Q09 A;  2VVB X;  3KLD B;  1CAI A;  3KOK A;  2FNN A;  2AX2 A;  4QEF A;  5FNJ A;  4LU3 A;  3RYZ A;  4MLX A;  2NXS A;  2NWZ A;  3OYS A;  2WD3 A;  3MWO A;  4UOV A;  3OIL A;  5G0B A;  4XIX A;  5DOG A;  3R17 B;  2OSF A;  3MNA A;  5L6K A;  4KUY A;  1V9I C;  4Q6D A;  1J9W A;  1CCU A;  3UYQ A;  3DV7 A;  4Q7W A;  3S9T A;  4CA2 A;  1CVA A;  3BET A;  4ZX0 A;  4YGJ A;  4Q99 A;  5FLQ A;  1BV3 A;  5FLT A;  5SZ6 A;  4LHI A;  5G03 A;  4FU5 A;  4YX4 A;  1CAJ A;  1JV0 A;  1BNW A;  5E28 A;  3N4B A;  1CNY A;  1YO1 A;  4JSS A;  1HCA A;  1XEG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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