1CNWA

Secondary interactions significantly removed from the sulfonamide binding pocket of carbonic anhydrase ii influence binding constants
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase (oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Secondary interactions significantly removed from the sulfonamide binding pocket of carbonic anhydrase II influence inhibitor binding constants.
pubmed doi rcsb
total genus 79
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1995-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cnwA00
2HKKA 3DAZA 4YGKA 4MLTA 4BF6A 5BRUA 3MYQA 2GEHA 4ZWXA 5JG3B 4PYXA 5J8ZA 1RZBA 1G4OA 4MTYA 1CAHA 4RIVA 4RN4A 1YDBA 3MHCA 3P55A 1CRMA 3PO6A 2NXRA 1RZDA 2X7UA 1CNKA 1G4JA 3FFPX 3ML5A 4QJPA 1CAOA 4MDMA 1BN3A 6CA2A 3HKNA 3V7XA 2QOAA 3ZNCA 4Q7PA 1ZGFA 1YO2A 3MNIA 5FLQA 4Q78A 3OILA 5EIJA 4KP5A 4RFCA 1CNBA 5FNGA 4X5SA 4Q49A 3IEOA 4ILXA 3KS3A 1CVHA 1I9LA 3CYUA 1CNYA 1TG3A 3M1KA 5EH8A 4WW6A 4YXOA 1I90A 2FW4A 5SZ6A 3M04A 1BZMA 3OKVA 3SBHA 2OSMA 3M1QA 1I91A 1HVAA 3RZ0B 4PQ7A 1G0FA 2NWOA 4QJOA 1FQRA 1OQ5A 1CNJA 1AZMA 2H4NA 4KV0A 2GD8A 3TVOX 3V3HB 3U45X 3DVDA 3DCWA 2Q1BA 3RZ8A 2EU2A 2ZNCA 3NB5A 1CAIA 1I9PA 4BCWA 4LU3A 3UYNA 3RZ7A 1IF7A 5FNJA 3V3JA 2FOUA 3QYKA 1ZFQA 3MMFA 2IT4A 1G54A 1F2WA 4QJXA 1UGFA 1G45A 3BETA 1BN4A 5SZ5A 1UGAA 4Q08A 5BNLA 3MWOA 4XZ5A 4CNRA 1ZSBA 5G01A 4Q8YA 3BL0A 1ZNCA 4QK1A 3HS4A 3DC9A 1CAKA 3T83A 3MNUA 1RZAA 3V2MA 1XPZA 5EOIA 5JEHB 3HKQA 2F14A 3RLDA 4ZAOA 3MHOA 2NN1A 1UGDA 1BNUA 3KOIA 5JQTA 3P4VA 4YXUA 4WL4A 3M1JA 2WEJA 3T5UA 2NWYA 3PJJA 4L5WA 2HFWA 3HKTA 4Z0QA 4HT0A 5E2MA 3V2JA 1CAMA 3R16A 3U3AX 2NNSA 1G6VA 5FNHA 5DSOA 3S72B 2W2JA 1G53A 1XEVA 3DA2A 1FR7A 1BV3A 1G52A 4QK3A 4RUYA 3MNJA 3N0NA 3S73B 2VVBX 5JEPB 1IF9A 1UGEA 4L5UA 1TBTX 3LXEA 1CVEA 5CA2A 3RJ7A 3P5LA 1OKLA 3DCSA 4DZ7A 3K34A 5DSLA 3OKUA 1RJ6A 4E3FA 5E2KA 4E3HA 2NNOA 4KUVA 5DSPA 1YDCA 1CVAA 2AX2A 5EHVA 4CACA 4HEWA 1HEAA 4Z1KA 5IPZA 1OKNA 1CNIA 4IWZA 1KWRA 1YO1A 1G0EA 4FU5A 3N4BA 3CZVA 2FMGA 3IBIA 7CA2A 2WD3A 3NJ9A 3S75B 3NI5A 4Q6DA 2ILIA 3TMJA 3UYQA 5FDCA 5FNLA 1H9QA 1YDDA 3EFIA 3RYJB 5A25A 1BNTA 4Q7SA 4JSAA 4E9OX 2Q1QA 3PYKA 4Z1NA 1DMYA 3FW3A 3D8WA 3RYVB 4Y0JA 3DD0A 4YGFA 5JGTB 3P3JA 4DZ9A 3KIGA 1BNWA 3EFTA 1CNWA 2FOSA 3KKXA 4HF3A 3T84A 4QJWA 5DSKA 1TH9A 1BN1A 1YO0A 1LG5A 3B4FA 1RJ5A 1FQLA 1G1DA 1YDAA 3MNAA 4R5BA 4LP6A 3M96A 1CCSA 1TG9A 4YYTA 1LZVA 8CA2A 1HECA 4QEFA 4K1QA 4FRCA 2WD2A 2NWPA 2AW1A 5C8IA 1HEBA 5E2RA 4CQ0A 3K7KA 2OSFA 4XFWA 3D0NA 1FLJA 1IF6A 4E49A 4M2RA 1G46A 4QTLA 4Q09A 3HLJA 4CA2A 1G48A 3N3JA 4RUXA 5DSRA 5EHEA 4ZX0A 1AM6A 2HOCA 9CA2A 3S76A 1IF4A 1OKMA 2POVA 4WUPA 1CVCA 1CVFA 1V9EA 3S97A 4YGNA 4LHIA 5DOGA 2EZ7A 1JD0A 1H9NA 3M14A 1FR4A 4QJMA 1FQMA 3V3FA 5E5UA 4YVYA 3M2NA 2NMXA 1T9NA 4Q81A 3P5AA 4HEZA 4ZWZA 4QK2A 4Q9YA 1EOUA 5E28A 1CANA 4YGJA 5FNIA 2WEOA 3KONA 3L14A 5EKHA 5JDVB 3ML2A 2FMZA 3F8EA 4ITOA 3GZ0A 3RYZA 3M2YA 4K0TA 5JG5B 5DSJA 3M1WA 3HFPA 1MOOA 3SBIA 2X7SA 4QSIA 2FOQA 4WUQA 1UGGA 3DD8A 5E2NA 5DSQA 3M5TA 3RZ1B 5G0BA 2NNVA 4BF1A 2HNCA 1I9MA 4RFDA 3S8XA 1CAYA 2CBCA 1AVNA 3OYSA 5CJFA 1I9OA 3V3GB 5L6KA 12CAA 1ZH9A 3F4XA 4JS6A 2NXSA 3CAJA 1FQNA 3RYXB 3D92A 4E4AA 5DSIA 3W6IA 4XIWA 3MNHA 4E5QA 3JXHC 1ZGEA 4K0SA 2CA2A 4Q7VA 4TWLA 3FE4A 1TE3X 3MDZA 4HBAA 5SZ4A 3DVCA 1ZFKA 5FNKA 1CNHA 1IF8A 4Q8XA 1ZSCA 1LGDA 3MHIA 5FL4A 4N16A 2VVAX 1Z93A 4RUZA 5EKJA 3DCCA 4Q87A 5JESB 3F7UA 5EH5A 1ZE8A 3V5GA 1HCAA 1CALA 3M5EA 2QO8A 2FNMA 4ETQC 1I9QA 2CBDA 1LG6A 5EHWA 2CABA 3RG4A 4WW8A 4YGLA 3KOKA 3M2ZA 1KOQA 3D93A 4QJ0A 2EU3A 4MDGA 1Z97A 4ITPA 4QY3A 1JV0A 3OIKA 4K13A 1CRAA 1KEQA 4ZWYA 1H4NA 1LUGA 4KP8A 4Q83A 3OIMA 4Q90A 3KNEA 3JXGA 2FOYA 4KAPA 5FLOA 4FL7A 2NWZA 3HKUA 3M67A 1CA3A 1XEGA 5BRVA 3S78B 4Q07A 4MLXA 1BCDA 3IGPA 1DCAA 1A42A 1TEQX 1BICA 4KNIA 4R5AA 3RGEA 3S74B 2WEGA 4HU1A 2FNNA 2QP6A 1V9IC 5EKMA 5DOHA 5JQ0A 3M40A 5BRWA 4PZHA 5FLTA 3IAIA 1ZSAA 3Q31A 1HEDA 3SAPA 1I8ZA 5DSNA 3S77B 3JXFA 4TWMA 4CNXA 5AMDA 5E2SA 1HCBA 2ABEA 3T5ZA 3C7PA 4L5VA 4Q99A 5G03A 2O4ZA 4Q6EA 5AMGA 5JGSB 3RZ5A 4YHAA 1IF5A 5FLSA 5EH7A 5FNMA 2CBEA 1UGCA 4Q06A 4CNWA 1J9WA 1Z9YA 3MHMA 4COQA 3T82A 4XE1A 1DMXA 2HL4A 4HT2A 5FLPA 3DBUA 5FL5A 1KOPA 2CBAA 2NXTA 4ZWIA 3V3IB 4KUWA 1UGBA 5G0CA 4IDRX 3MNKA 4R59A 1RAYA 5AMLA 1CCTA 4GL1X 5FDIA 4ZX1A 3U7CA 1RZCA 3T85A 3SAXA 4M2VA 3M98A 5BYIA 5A6HA 5JEGB 4Q7WA 1DCBA 4XIXA 3DVBA 1CZMA 2POWA 3M3XA 1HUHA 3IBNA 1BNNA 5SZ1A 4KNMA 3U47A 4CNVA 1FSQA 2HD6A 1BNVA 1FSRA 3OYQA 1RAZA 3F7BA 5FL6A 4YX4A 3KWAA 3S9TA 4KUYA 1CINA 4Z1JA 4G7AA 2H15A 2CBBA 4QSAA 5DSMA 1CAJA 4M2WA 1MUAA 2NNGA 1JCZA 4M2UA 4Q0LA 4Q8ZA 4QSBA 1CNCA 3RYYA 5FLRA 3VBDA 3D9ZA 4JSWA 5SZ2A 5SZ0A 3K2FA 1TEUX 4YWPA 1CIMA 1XQ0A 4Z1EA 1BNQA 2FOVA 1CVBA 3P58A 1URTA 4FVNA 1CA2A 1TTMA 3S71B 4JSSA 5HPJA 4JSZA 2Q38A 4K0ZA 4C3TA 1CVDA 5EZTX 1RZEA 3TVNX 5CACA 2POUA 5LMDA 1Y7WA 4KNNA 3P44A 4E3DA 4WR7A 3MHLA 3CA2A 5DRSA 1G3ZA 2NN7A 3RG3A 4PYYA 4FVOA 2FNKA 3N2PA 4RIUA 4MO8A 3DC3A 4FPTA 3M5SA 4N0XB 1HUGA 3B1BA 4E3GA 3W6HA 2X7TA 3R17B 3M2XA 1I9NA 2WEHA 4MDLA 4KNJA 4QSJA 3DV7A 5CLUA 1CCUA 5L3OA 4QIZA 5SZ7A 3MZCA 4YXIA 1CNXA 1FSNA 1THKA 4HEYA 4UOVA 3IBUA 3KLDB 1KWQA 1TB0X 4RH2A 4G0CA 3BL1A 1CILA 4FIKA 4QIYA 5DVXA 4PXXA 3IBLA 1BNMA 3ZP9A 1CAZA 3OY0A 5SZ3A 3P3HA 5E5RA 1CNGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2HKK A;  3DAZ A;  4YGK A;  4MLT A;  4BF6 A;  5BRU A;  3MYQ A;  2GEH A;  4ZWX A;  5JG3 B;  4PYX A;  5J8Z A;  1RZB A;  1G4O A;  4MTY A;  1CAH A;  4RIV A;  4RN4 A;  1YDB A;  3MHC A;  3P55 A;  1CRM A;  3PO6 A;  2NXR A;  1RZD A;  2X7U A;  1CNK A;  1G4J A;  3FFP X;  3ML5 A;  4QJP A;  1CAO A;  4MDM A;  1BN3 A;  6CA2 A;  3HKN A;  3V7X A;  2QOA A;  3ZNC A;  4Q7P A;  1ZGF A;  1YO2 A;  3MNI A;  5FLQ A;  4Q78 A;  3OIL A;  5EIJ A;  4KP5 A;  4RFC A;  1CNB A;  5FNG A;  4X5S A;  4Q49 A;  3IEO A;  4ILX A;  3KS3 A;  1CVH A;  1I9L A;  3CYU A;  1CNY A;  1TG3 A;  3M1K A;  5EH8 A;  4WW6 A;  4YXO A;  1I90 A;  2FW4 A;  5SZ6 A;  3M04 A;  1BZM A;  3OKV A;  3SBH A;  2OSM A;  3M1Q A;  1I91 A;  1HVA A;  3RZ0 B;  4PQ7 A;  1G0F A;  2NWO A;  4QJO A;  1FQR A;  1OQ5 A;  1CNJ A;  1AZM A;  2H4N A;  4KV0 A;  2GD8 A;  3TVO X;  3V3H B;  3U45 X;  3DVD A;  3DCW A;  2Q1B A;  3RZ8 A;  2EU2 A;  2ZNC A;  3NB5 A;  1CAI A;  1I9P A;  4BCW A;  4LU3 A;  3UYN A;  3RZ7 A;  1IF7 A;  5FNJ A;  3V3J A;  2FOU A;  3QYK A;  1ZFQ A;  3MMF A;  2IT4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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