1CQHA

High resolution solution nmr structure of mixed disulfide intermediate between human thioredoxin (c35a, c62a, c69a, c73a) mutant and a 13 residue peptide comprising its target site in human ref-1 (residues 59-71 of the p50 subunit of nfkb), nmr, minimized average structure
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPAKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDAQDVASEAEVKATPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The solution structure of human thioredoxin complexed with its target from Ref-1 reveals peptide chain reversal.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Complex (electron transport/peptide)
source organism Homo sapiens
total genus 24
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1cqhA00
5INYA 1O85A 2J23A 2VO4A 2IIYA 4XS4B 5HR3A 2IN3A 1G7OA 2HFDA 1PSQA 3HVXA 1RW1A 4V2LA 4ZBAA 1ERUA 2YJHA 5CREA 2DJ3A 2GQLA 4GSNA 1OE7A 2R2JA 5ID2B 1PX6A 2RM6A 3CTFA 2L5LA 1Z6NA 4IP6A 4KX4A 2E2GA 3F6DA 3W8SA 4WBRD 3N9JA 2AHEA 2L4CA 1YZXA 3TKPA 5D96A 4MCUA 1SJZA 1OE8A 4FH8A 6GSVA 1PL1A 3L9VA 3IV4A 1GL8A 3ZIJA 1YEXA 2OA7A 4ZXGA 1I9DA 3KZQA 1GUHA 3CTGA 4WKWA 3LYPA 2FWFA 2V6OA 2E0QA 3ME7A 4PUAA 3C73A 4FYBA 2IMKA 3HJPA 2H66A 4KDYA 3KMOA 1FW1A 5FWGA 2PVQA 2VUPA 12GSA 5IMDA 5DVBA 2WB9A 5AISA 2CT6A 1M2DA 4XHMA 4HDEA 2C3QA 3WT1A 3DVXA 1OC9A 1MD3A 3D4TA 1AW9A 5KN2A 4NWYA 2X8GA 5AIVA 1ERWA 4ML6A 4PXOA 1MD4A 4K1FA 5D73A 5HQPA 4OO4A 3KGKA 4GCIA 2NBSA 3GTUB 1B4QA 2CQ9A 2YANA 1HNBA 1EOGA 1GNEA 4D73A 2H1DA 4TW5A 1X0RA 2YWOA 1S3CA 4ECIA 4XIHA 2LSTA 1A2LA 2C0FA 2VL2A 1M0UA 2G2QA 4X1UA 2F3MA 2P0GA 1JZDA 1EOHA 5IOXA 1KTEA 2OJLA 20GSA 1URMA 2XBQA 5G1KA 3UOMA 4WF4A 1TU7A 1ML6A 4I2UA 1OC8A 2WJUA 1PQNA 4IJIA 4IKHA 1FAAA 2NVLA 2YWMA 3RPPA 1FOVA 1F3AA 1WE0A 4POKA 2DLXA 3MSZA 1F37A 3EU3A 2WCIA 3E3EA 3FEUA 4GSSA 3QDNA 1XVQA 1OC3A 3H1NA 3IC4A 1A2JA 1CQHA 1B4PA 1MTCA 3CRTA 1IYIA 4LMWA 2GQMA 3NIVA 1GLPA 2H0GA 5B6MA 1YKCA 5HR2A 2LTKA 3UL3A 1TRWA 1K3OA 2MMAA 4LA1A 1RK4A 2DMLA 2YNXA 4KCEA 4K7OA 3EWLA 3CXGA 3UARA 3DVWA 1SJIA 4WBJA 4ECJA 2MMOA 2K9FA 3BCIA 2DIZA 3C1SA 3TJKA 1R26A 4KSMA 5IMZA 5LNKe 5FHIA 5AGYA 3MNGA 4J56E 3GX0A 4CW9A 4V2MA 3TJFA 1KBNA 2A2RA 3I6AA 3E0UA 5HR1A 1ERTA 2YV7A 4IS0A 3AY8A 3ZIVA 2LQQA 1TU8A 5ENUA 2CX3A 3UJ1A 1QUWA 2A2SA 3HDCA 4IN0A 3QCPA 3TCOA 3GN3A 1PGTA 4K7IA 4RI6A 1WOUA 1EP8A 2YV9A 4ACSA 1DE2A 2VCQA 5CP1A 1R5AA 3P2AA 4F9ZA 4WR4A 1J08A 2JACA 2C3TA 1M99A 5IPGA 1TTZA 2A4VA 4EF0A 4EVMA 1XOBA 2VL9A 1FO5A 2LQOA 1I5GA 3J7Yk 3ZREA 3TB2A 4WF5A 3LWAA 2VLUA 1B9YC 3BOAA 3ZVJD 2ON5A 4IHUA 5HFKA 4IGJA 3APOA 1Z7PA 3IK7A 2H1AA 2LEGA 2IWTA 2G0FA 1TW9A 2H19A 2B5EA 4EO3A 4WR5A 1OKTA 1ZZYA 1ZMAA 2WZ9A 19GSA 1GLQA 2AV4A 1ILOA 2GSQA 4EDZA 1O8XA 3L0HA 4E8HA 2KOKA 4KW6A 3R2QA 1EZKA 1Y25A 4MF6A 2FA4A 5EY6A 1OYJA 2KLXA 3QPMA 4PX1A 2O87A 1A8YA 1PRXA 1TRVA 1SD9A 4BPYA 1SL0B 2F9SA 1W89A 1SKRB 2IFQB 1WMJA 2M72A 4G19A 2X8HA 4PNGA 4GWRA 3GH6A 3H93A 4TR3A 1GSEA 2E2MA 2J9HA 3ZMKA 5IMFA 3IXRA 5ELAA 4MF7A 4Q5NA 5JWQB 4F0CA 2AB6A 3ZFLA 1PL2A 1BX9A 2HSYA 1K0OA 1N8JA 1XIYA 2IL3A 1V9WA 3FZAA 3VI5A 1H75A 4X43A 3W8JA 5ELGA 1GSDA 1JHBA 2KP1A 1FB0A 2WFCA 2IMEA 1M7TA 17GSA 4MZWA 1U87A 3G7YA 3FYGA 5KN1A 2XHFA 5IOWA 8GSSA 3TKQA 3A2VA 1E2YA 3PINA 4FYUA 3S9FA 3ZLPA 1T00A 4DSSB 2YZUA 4ML1A 3SBCA 3I43A 2H6YA 3GKMA 1GUKA 6GSXA 1LJRA 1XWAA 2TRXA 1Q4JA 4DSRA 1HYUA 1EEMA 1WJKA 2C0DA 3CBUA 2HZEB 1K0NA 1EGOA 3O76A 3GH9A 1C72A 3IK9A 5EPFA 4IVFA 1NHOA 1SL2B 5IIZA 4HS1A 2RM5A 3VWUA 2GLRA 2QSIA 1G7EA 1FVKA 2FHEA 3ZZXA 4JU5A 4KDXA 4DVCA 4Q5QA 6GSUA 1EWXA 1SL1B 3L9SA 5C04A 1A0RP 4AF2A 2V6KA 4KUNA 4XS6A 5DALA 1G0TA 1T1VA 2K6VA 2P5QA 2VL3A 2D2ZA 1SK1A 4OCEA 1Z6MA 16GSA 1ACVA 3CYNA 3TJBA 2FGXA 2LRCA 4ECBA 4OMVA 2GDRA 1NM3A 5EVOA 2O8VB 2WRTA 3DRNA 4RQRA 1CQGA 1ZYQB 1TJDA 3FR6A 2YN1A 2ZCTA 4NV5A 3F63A 3GHAA 4K0GA 1AC1A 5IMVA 1YQ1A 3UMAA 2LJKA 5H5SA 1GUMA 1R5PA 1OKDA 2FWHA 4KAEA 4MH3A 1QXHA 5JWOB 3NZNA 5D9XA 2JZRA 3IE3A 5IMCA 1A0FA 1U3AA 4KGIA 2YWNA 3F4SA 1XZOA 1JLWA 2HI7A 3DXBA 14GSA 1GTBA 3HVVA 2HE3A 2JSYA 1TK5B 3QAWA 2LRNA 4XRAA 4ZL8A 4ISDA 1HNCA 2GZYA 3KTLA 2V41A 2QKEA 1NSWA 2TRCP 2H71A 3O3TA 1ZGNA 1EV9A 4HOJA 3HJOA 3VI7A 2DIYA 4MMMA 5ECMB 2LJRA 4O92A 1FVJA 3F4RA 2CVKA 5D9WA 3QMXA 3G7JA 1FG4A 2DMMA 4QL7A 3JCML 5G30A 2N5BA 3TRQA 2LKUA 1TRUA 1X5DA 3F3QA 1MDJA 3GX8A 1GTIA 3ZL5A 3UBKA 2MYGA 2JSZA 2GZPA 1A2MA 1TDIA 2C3NA 4YQMA 4EKZA 2YP6A 2O89A 6GSTA 1T3BA 1XBSA 3BCKA 4QL9A 4ECCA 1SK0A 2GGTA 1PMTA 2B7KA 1BAYA 3DKSA 2I9HA 2PWJA 3U5RE 2RUFA 1BJXA 2BMXA 1JZWA 1X9MB 2H8LA 4TKYA 3DMLA 2C0EA 2LV3A 1YY7A 3M3MA 3WT2A 4AGSA 1QQ2A 4PQIA 5DQYA 1YKAA 1Z7RA 1DE1A 3APQA 3GMFA 4EXJA 5C00A 4HI7A 1XFLA 3ZITA 1YF1A 5H5RA 3A2XA 3D6IA 4AJ6A 5LCZA 2H74A 3KP8A 2B1KA 5F07A 3GURA 4NMUA 1FHEA 4JEDA 1YF0A 3EC3A 4IP1A 1X5CA 4K2DA 1QGVA 3UBLA 4WETA 1AQVA 3Q74A 2HLSA 3F4TA 3HJMA 1V98A 1F2EA 4LL1B 1B9XC 2R5GA 9GSSA 4PNFA 1LU4A 4NHWA 2FWEA 3BJ5A 2FA8A 1TK0B 2VD1A 2IMFA 1J9BA 2H75A 4HQSA 2C80A 3GA4A 2VL2C 2JZTA 2CAIA 2PVOC 2VD0A 3EYTA 4POBA 3P8WA 1VRSD 1ZCPA 5ECOB 3TRXA 1N2AA 3IPZA 4OD7A 1NHYA 2FCHA 3TRPA 4XTSA 1BG5A 2CX4A 2GSRA 4KCAA 3GL3A 4ZL7A 3G9BA 4L0WA 4TR1B 4ZBBA 1V2AA 5J5NA 4L5LA 2HRNA 2O7KA 4G10A 4PURA 2QC7A 3KMNA 2KHPA 2OE0A 3QFBC 1QMVA 1SJ6A 3NOFA 4TVEA 3US3A 3HVSA 2CZ2A 2KP2A 2GQKA 5A4UA 3IBHA 3GKKA 3ZMLA 5CRHA 3EMXA 3GKNA 2YOIA 1G6WA 5DAKB 3M9JA 2K8SA 1GRXA 4XS4A 4JRRA 1ERVA 4KB3A 4N0VA 3VWWA 3OR5A 3ZVJA 3FK8A 1IYHA 5ECLB 3F3RA 2AJQB 2V2GA 5ID2A 1UA5A 2GZZA 5J9CA 2V1MA 2EC4A 1B8XA 1YDKA 3A2WA 1Z3EA 3HKRA 2IPAA 3D21A 2HNLA 3LYKA 1XW6A 1MDKA 4MP4A 5IM9A 4FYCA 1Y6EA 4PQHA 4V1Ap 4XRDA 4MABA 5ECIB 1R4WA 4HJMA 3MDKA 6GSSA 1GTUA 1K0BA 2RLIA 4O5RA 5D93A 2PERA 3WD6A 5HFGA 5G5EA 1U88A 3M0FA 4ZILA 2H1BA 5HR0A 5L71A 1S3DA 3P90A 4V1Ag 4TXOB 4L0UA 4EDYA 2JL4A 11GSA 1OVNA 2VM1A 2NPBA 2C8UA 3DEXA 3IAM2 2P31A 2EIRA 3GNJA 2MBTA 3EURA 4YQVA 4ZL9A 1QK8A 1X9WB 1PKWA 1XXUA 3KH7A 2DJ2A 3F0IA 5B6NA 2L59A 4POLA 3UIWA 3BD2A 4PUFC 3HZ4A 3EVIA 1PX7A 3H79A 1XW5A 5H5QA 5CNWA 1M2BA 4P3YB 4FO5A 1PD21 3DYRA 3C7MA 3L9UA 2OBKA 2LNTA 2H72A 4G9HA 3HCZA 3KD0A 1X9SB 4HUAA 5JWRB 2GT5A 4HQZA 2DJKA 3HYPA 2ZNMA 5COHA 1A8LA 3LFLA 1V40A 4JZQA 4DSQA 1R7HA 1JFUA 4WXTA 2CV4A 3LXZA 3D22A 3APSA 3CSJA 2FD3A 4OWYA 1O8WA 2YPMA 4MPGA 2ES7A 2H70A 4AJ8A 3ME8A 1M9AA 2N5FA 1GWCA 5DDLA 2DC5A 3CMIA 2Z9SA 2CZ3A 1EEJA 4N30A 2MMNA 2YCDA 4NXIA 5D9VA 1V58A 1K3LA 2LS5A 3GUSA 4HEA2 1OC9B 3GFKA 4I2TA 2H0IA 4V2NA 4MZBA 5ECNB 5B7CA 5GSSA 1DSBA 1O7UA 3VURA 1V57A 3LXTA 3UVTA 4TN8A 1K3YA 4XCSA 1K0CA 2P5RA 4D73B 3MWHA 4BWQA 2C1YA 1K0DA 1XWCA 1JZOA 2VCTA 3MAKA 4GQCA 3ZRDA 4TRXA 3KIJA 3ERGA 5ABRA 6GSYA 4IJ3A 3D4MA 1JLVA 1X5EA 3QOUA 1SYXA 2I4AA 4G2EA 5KEJA 1THOA 2MBSA 1GTAA 3TJGA 3RDWA 4MPFA 4DEJA 4ID0A 2QGVA 3E9JB 1AIUA 4RI7A 2VAFA 4MA9A 2IJYA 4AJ7A 1PN9A 3QAVA 1THXA 4IQAA 5A4VA 3FZ5A 4MJBA 3FRCA 2JU5A 4EC0A 1XVWA 4IBPA 1SYRA 4HZ2A 1BQ7A 3EINA 3HXSA 3GIXA 2OBIA 5CYYA 3A5WA 2K18A 5IO0A 4KSOA 2DJ0A 3BBYA 1UC7A 2X99A 4O32A 4L5OA 4POMA 4I5QA 2AYTA 4MH2A 1Z5YE 2BTOT 4RUVA 4MJEA 3ZYWA 5B8BA 3HD5A 1HQOA 4F0BA 1EV4A 5F8BA 1ON4A 4IW9A 5LD0A 3HY2A 1ZYEA 5F06A 2REMA 3QR6A 2I3YA 3GL5A 1QFNA 5JCWA 4N0ZA 4HZ4A 1U6TA 3LQ7A 2I81A 4WEYA 1U3IA 2JADA 4OCFA 3QAGA 5KN3A 1VF3A 5G5FA 2IFQA 3M1GA 2IMIA 3D5JA 3EE2A 1S3AA 1SKWB 3C1RA 4GSTA 5G31A 3Q18A 2X8CA 4K0NA 1F3BA 3GSTA 4EUYA 2RIIA 4K9ZA 3TOUA 4YQUA 1TKDB 3V1WA 1XWKA 5J4UA 4F03A 2WULA 3FR3A 2L4QA 4GF0A 4KDUA 4NPBA 3ERWA 2O85A 3PH9A 3H4KA 3ZFBA 2XPDA 1HNAA 3HA9A 1VF4A 5D9TA 2L6CA 22GSA 2PBJA 3IHQA 4Q5FA 4I97A 5FT3A 5IQYA 2VCWA 5DBQA 1M2AA 2FY6A 2LRTA 2PN8A 4KH7A 2E7PA 4E8EA 3C71A 4XS1A 2H1GA 2FLSA 2B1LA 4TOPA 2OKAA 3GSSA 1OAZA 4DSSA 5CAXA 1F6MC 2JZSA 3KP9A 2H30A 3ISOA 3IA1A 1MDIA 1SU9A 1AQWA 1WWJA 4F2IA 3RBTA 2MZCA 4YH2A 2FWGA 4Q5RA 3H8QA 1K0AA 3IRAA 3IOSA 2C0GA 5A5KA 2HZEA 3G7IA 2OE1A 1BEDA 1ZOFA 2C4JA 1O6JA 2KUCA 1WP0A 3KXOA 2OACA 3IR4A 5D8IA 3LJRA 2B6MA 1W4VA 2LUSA 1UVZA 1XCCA 4NAXA 3LORA 1TXXA 5J41A 1GP1A 4HJ2A 1O73A 2ZUPA 1TK8B 5F05A 3LGCA 3HZ8A 1AUCA 4KE3A 2GSTA 2PMTA 4NHZA 3L78A 5CRWA 2LNSA 5ECPB 2WS2A 2HYXA 1TRSA 2I1UA 1GSYA 1T4YA 2VCVA 1GSQA 3TJJA 2AAWA 5E59A 5CRGA 3ERFA 4OFMA 1YJ6A 3VPQA 4ILFA 5GSTA 2L57A 2F8FA 3A3TA 2PPTA 2VLTA 2NDOA 5A4WA 4BA7A 5ECRB 1USBA 4TR4A 4L8EA 4K8MA 3KM6A 5JCGA 2HSHA 3RHBA 4YAPA 2CVDA 1T7PB 2OADA 3PR8A 5IMAA 1SKSB 3KCMA 3VWVA 3TKSA 1EGRA 2H73A 3TGZA 4EL1A 2RUEA 3LG6A 2GTUA 2H6ZA 1BYEA 3IAS2 4CHSA 3RAZA 3KEBA 1DUGA 2LJAA 2VOCA 5CRDA 1A24A 2H76A 4ZB9A 5ECHB 3O6TA 4HU7A 4GQFA 3WGEA 3TKSC 5J9BA 5E4WA 3HHVA 3ZTLA 4BWSA 4J57E 5GAPD 4KNDA 1GULA 2M46A 4H86A 1SENA 3VLNA 3VPTA 2H01A 3LEFA 5JCUA 4BL7A 7GSSA 2R37A 3TDGA 4J2FA 4I8BA 2B3SA 3DIEA 10GSA 1O81A 1RQMA 2TIRA 2DBCA 3I9V2 1J0FA 4OO5A 4EE0A 3FZ4A 3CRUA 2B5XA 2CAQA 2CVBA 4ZB6A 3CSIA 2V32A 1KNGA 2HRFA 1FB6A 2VIMA 2HZFA 5DALB 5G2ZA 4IELA 4MLYA 4Z7XA 5ECSA 4OFTA 3QFAC 1B48A 1PKZA 4GXZA 5GAND 2YZHA 3ED3A 4JR4A 1GNWA 2IMDA 1JZRA 2FUG2 3N5OA 1WPIA 5IPHA 2DJ1A 3D0ZA 1ABAA 2ON7A 3WGDA 4ZB8A 1XWBA 4ULXA 2M80A 3GTUA 1XWGA 2B7JA 4MK3A 4QQ7A 4ZBDA 5ECQB 2XPEA 5HFIA 3U6VA 2FNOA 2L6DA 1TI3A 4LLRA 1XW9A 1WIKA 4JE1A 2EIOA 1MEKA 2HT9A 5DQSA 1Z9HA 1GSSA 4ZIJA 2CA8A 4MJCA 1TOFA 4FIWA 1T8EB 5F0GA 2VCZA 4MDCA 2BJXA 3K8NA 1DBYA 2HXKA 4GTUA 3CSHA 2YJ7A 4X0XA 3FY7A 1AQXA 5EL8A 1SK2A 2PUKC 5DJMA 2VLVA 13GSA 3TOTA 2DSAA 1E6BA 3VFIA 4I6XA 3FW2A 2L5OA 3GRXA 4PGTA 5J3RA 3FHKA 1SD8A 1HD2A 1AXDA 1ZL9A 3RPNA 3TUEA 4LMVA 1G6YA 1TP9A 5DJLA 2GT6A 3GYKA 1NW2A 2H6XA 4TR1A 3LSZA 1YEPA 3VK9A 3DGQA 1PA3A 2H0HA 5G1LA 2N5AA 2R6KA 1AAZA 1XPVA 3WGXA 3P7XA 3GKXA 2XC2A 6GSWA 5KN0A 4IQ1A 2VM2A 1H4OA 18GSA 3KH9A 3PGTA 1K0MA 4N11A 4K6XA 4TR0A 3C8EA 3UAPA 4CDOA 3I69A 4NV2A 2WDUA 2B5YA 4KA0A 5DAKA 2XBIA 1GSFA 4TXVA 3EMPA 4BVXA 1VGLA 2K8VA 1LBKA 2F8AA 2GSSA 1VF2A 2AUVA 3UEMA 2R3XA 1GSUA 4N10A 1A23A 2WGRA 1UN2A 4MF5A 3F9UA 3TKSE 4OFNA 3DWVA 4GRFA 5B8AA 4JBBA 3TKRA 1ST9A 3J7Yb 2GS3A 4YAVA 4GLTA 3RHCA 2R4VA 2MMZA 2GVPA 4LL4B 5CO3A 5DCHA 4O7HA 1T4ZA 2YWIA 5ECKB 3SWLA 2X64A 4BVYA 1EP7A 3Q19A 5AN1A 3L4NA 2NTOA 1WRYA 3QD9A 1Q98A 3FKFA 4TXOA 4RQXA 3KJYA 3GV1A 3Q6OA 4HU9A 2PGTA 3WYWA 4F82A 1KEBA 5DCGA 1VF1A 2DJJA 3DD3A 4PQ1A 3VWXA 1TI1A 2F51A 2EIQA 3KTBA 2OE3A 3IDVA 2VCXA 1XOAA 1M9BA 3EU4A 4K7NA 1GH2A 3FZ9A 1F9MA 3UVHA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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