1CQHA

High resolution solution nmr structure of mixed disulfide intermediate between human thioredoxin (c35a, c62a, c69a, c73a) mutant and a 13 residue peptide comprising its target site in human ref-1 (residues 59-71 of the p50 subunit of nfkb), nmr, minimized average structure
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPAKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDAQDVASEAEVKATPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The solution structure of human thioredoxin complexed with its target from Ref-1 reveals peptide chain reversal.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
source organism Homo sapiens
molecule tags Complex (electron transport/peptide)
total genus 24
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1cqhA00
2X64A 1J0FA 5ECNB 5D73A 4FIWA 2IMIA 3FRCA 2AHEA 3C1RA 2VAFA 5FHIA 2RM6A 1WOUA 1A2MA 3FZ4A 4HQSA 1X9WB 3DRNA 2IMDA 3FW2A 2H01A 1GSDA 2RM5A 4DSSB 4KSOA 2TRCP 1B9YC 3QR6A 4K8MA 2CVKA 4K9ZA 3DGQA 1MDIA 4GQFA 5HQPA 2IMEA 2FNOA 3D4TA 3TJFA 4YQVA 4NAXA 2FGXA 2X99A 5AIXA 2P0GA 3LYPA 1R7HA 1XWAA 1M9BA 3UEMA 4BWSA 4TOPA 5L71A 4HI7A 2ZUPA 2B5EA 2P5RA 3LYKA 1R5AA 3IBHA 5H5SA 3CSJA 3DIEA 3QDNA 5JCUA 1GH2A 1K3LA 5E4WA 2H75A 1XWKA 3EWLA 4IHUA 1AQWA 2HYXA 2R4VA 3GV1A 3TJJA 4POKA 2C0DA 2YP6A 3CRTA 1FG4A 1GTBA 2JZSA 3WT2A 1T00A 4HQZA 2C4JA 4WF4A 3WGEA 3F3RA 1ACVA 4IJ3A 5H5QA 4FH8A 5IQYA 2H8LA 3ED3A 1V58A 3TKSA 2B7KA 2EC4A 2CVDA 4GXZA 3ZYWA 4K0NA 2PU9C 1EEMA 2JADA 1SYXA 3G7IA 4MDCA 2DMMA 3GRXA 3NIVA 3ZZXA 4KB3A 2KOKA 3KIJA 4ECCA 1E6BA 1SU9A 1S3CA 1NW2A 4ML1A 2VL2C 1M7TA 2H0GA 3QOUA 1TRVA 1MTCA 4TVEA 1X5CA 5FT3A 1YF0A 2YANA 3E3EA 1N8JA 1V9WA 5ECSA 2AB6A 3KJYA 3F8UA 2DJKA 4IP1A 2M72A 1PSQA 2KLXA 2K6VA 2GVPA 4XS4B 4DEJA 4MPFA 19GSA 4GTUA 3GX0A 3PINA 1TW9A 1H75A 4YAPA 3ME7A 1TRWA 2QSIA 4POMA 12GSA 1BG5A 2JU5A 2RIIA 4ZBBA 5G2ZA 3HYPA 4IBPA 5IO2A 4J56E 4EC0A 3H79A 2E2MA 3F0IA 4N11A 1OE7A 1GULA 3F6FA 4KDXA 3VWVA 2GSRA 4MCUA 3Q19A 2R3XA 1KBNA 1A2JA 3DMLA 2FA4A 4OMVA 3P90A 2PN8A 1GRXA 2DJJA 4GF0A 2AUVA 4I5QA 3APQA 5DBQA 2LTKA 2EIQA 3ZFLA 2IJYA 1PD21 5J3RA 5DAKB 3N9JA 1SL1B 5JCWA 2KHPA 2GQLA 3TGZA 4I6XA 4OFTA 2VCZA 4JRRA 4V1Ag 3PH9A 3E9JB 2C0FA 2DJ3A 1THOA 1TJDA 1K0BA 1T3BA 4IELA 2WCIA 1ILOA 2RUEA 5DCHA 3TCOA 2FA8A 1XW5A 3L0HA 2AAWA 2LRNA 1UVZA 4KA0A 4YAVA 1EGRA 22GSA 1SYRA 4F0BA 3DVWA 3P2AA 4N10A 2NTOA 3W6GA 4MH3A 3IE3A 2VUPA 4V2LA 4EO3A 2K8VA 2A2RA 3QMXA 1Q98A 1WE0A 4LL1B 3KCMA 4AJ6A 3CBUA 3LXZA 4GSSA 3RHCA 3MNGA 5DALB 2XHFA 3JCML 4BPYA 4V1Ap 2OE0A 3MSZA 3QAVA 2L6DA 1G6WA 1XWCA 2R37A 5CRDA 1T1VA 2LRTA 1GSUA 3APSA 10GSA 5IIZA 2VCWA 1R5PA 4ZXGA 1K0NA 1ZOFA 4FYUA 3KP8A 3QFBC 1XOBA 1R4WA 4OD7A 2K8SA 3FY7A 3WGXA 1ABAA 3BJ5A 1G6YA 2LV3A 4MZBA 1GTUA 2VLTA 5G5EA 3HVXA 5ELAA 4Z7XA 3TJBA 2H30A 2J23A 1CQHA 2I1UA 2H1AA 1J08A 1YEPA 5D9VA 2C3NA 4EVMA 1PA3A 4HJMA 3IOSA 3H93A 3MWHA 3GH9A 2CX4A 2GQMA 2HT9A 2QGVA 2WS2A 1YDKA 2VOCA 4ML6A 4RQXA 1O81A 5IMZA 4E8EA 1PX7A 4WR5A 2M80A 2K9FA 3A3TA 2IN3A 4ZL7A 4YH2A 5G1LA 2WDUA 1UA5A 3H8QA 1AQXA 1GTIA 3RPNA 5D93A 3TOTA 2DBCA 1B8XA 3KP9A 2NBSA 1EOHA 1E2YA 4ZB9A 1OE8A 3GTUA 1WMJA 1U87A 2PMTA 11GSA 3G7JA 2O89A 1XIYA 1AXDA 3A5WA 1X9MB 4AF2A 1GNEA 2YN1A 3BCKA 2YCDA 4E8HA 1WPIA 1I5GA 1OVNA 2F3MA 4N0ZA 3TB2A 2ALBA 4K1FA 2VIMA 5DJMA 3CTGA 2V41A 1HNAA 5DQYA 4NHWA 2LNSA 2PUKC 1ERWA 4JZQA 2E7PA 3V1WA 1FW1A 5F0GA 1VGLA 2HRNA 2JL4A 2L4CA 3J7Yb 1A0FA 1FVKA 2X8GA 20GSA 1F9MA 4IW9A 1ZYQB 2VLVA 2IIYA 2F8FA 1YZXA 1FB0A 1O85A 4YQMA 2HFDA 4NHZA 4DSQA 3RHBA 4O7HA 1H4OA 4HU9A 4CDOA 2EIOA 3IDVA 3VK9A 1F2EA 3FK8A 4QQ7A 3TOUA 4IVFA 3EE2A 4QL7A 4POBA 4EDYA 1YQ1A 1PGTA 5ECQB 3UBKA 1PQNA 4I97A 2DIZA 3EC3A 2GT6A 3ZVJA 5CYYA 4PQIA 1OYJA 1OC8A 2GT5A 3GKXA 2JZRA 4KCEA 4OWYA 2C0GA 4YQUA 4TN8A 4JE1A 2YWIA 3ZITA 2HRFA 4GSTA 1XFLA 2V1MA 2AYTA 1M2DA 2I3YA 4O32A 1UN2A 2PGTA 3L9UA 3MDKA 5C00A 6GSYA 3HJPA 1TKDB 2B5XA 3ZRDA 5A4WA 3IV4A 2VCXA 2H73A 2BMXA 1G7EA 1O8XA 1XXUA 1YY7A 1O7UA 2O7KA 2H71A 4G19A 4XHMA 3F4SA 4ZILA 5JWQB 1OC3A 4ECJA 1S3DA 5IMAA 1JZRA 4LMWA 1YKCA 4GSNA 3HZ8A 1SL2B 1TRUA 2LSTA 4TXOA 3CXGA 5JCGA 4KUNA 4K6XA 1K3YA 4H86A 2FLSA 3GL3A 5ECLB 4K2DA 2GZZA 4ECIA 4ISDA 3VPQA 1PX6A 5EPFA 4JEDA 2V2GA 2C3TA 5GAPD 4OFMA 1AUCA 4QL9A 2HSHA 2H1DA 1GNWA 1SKWB 3O6TA 1EP7A 1ZZYA 2GSQA 2N5AA 4EKZA 2MYGA 1ZCPA 1U6TA 1Z9HA 2WZ9A 4KDYA 4PQ1A 2LJRA 1GWCA 5ECHB 2H76A 1B9XC 1MDKA 2FWHA 2DSAA 3ZFBA 1XOAA 1B4PA 2B7JA 5J5NA 2XBIA 5DDLA 4NV5A 1M0UA 4NMUA 1BJXA 2VL2A 1FO5A 3L4NA 5CRWA 2B1LA 2XPEA 4L5OA 1EV9A 3GTUB 4ACSA 7GSSA 4GLTA 1BAYA 1VF3A 4HU7A 5DALA 2F8AA 1K0CA 3KXOA 2FY6A 3APOA 1GP1A 3EURA 4WR4A 3FR6A 5DQSA 2H1BA 2BTOT 4XCSA 1XWGA 1M99A 1BX9A 3D0ZA 3GKMA 1KNGA 2GS3A 1DE2A 5F07A 3ERGA 4ZB8A 1T4ZA 2H66A 3F6DA 2LRCA 2GGTA 2O87A 2LS5A 5B8BA 2I81A 4DVCA 1QUWA 4PUAA 5CRHA 3IK9A 3L9VA 2YWMA 1X9SB 3KH9A 2LKUA 1X0RA 3VFIA 1SK0A 3MAKA 2L5OA 2GSSA 3UAPA 5G5FA 1KTEA 2LNTA 1MD3A 1VF4A 3IXRA 14GSA 2CVBA 2CZ3A 5AN1A 1T7PB 2X8HA 6GSWA 4L8EA 4KGIA 2REMA 2HE3A 3UIWA 5HR3A 1PKZA 3ZREA 3ZIJA 2ZCTA 1J9BA 5KEJA 1U3IA 3QAWA 2MMNA 3UJ1A 2YZUA 2NDOA 3VWXA 4MPGA 1EV4A 4ZB6A 4HZ2A 5GSTA 3KMNA 1XVWA 3WGDA 1QK8A 1A8LA 4L5LA 2WB9A 1Z6NA 2NVLA 4X0XA 2TIRA 3FR3A 2E2GA 2IMKA 3A2VA 1PL2A 3OR5A 1USBA 3UBLA 3I9V2 3J7Yk 4F82A 1Y25A 3GKKA 2A2SA 3D21A 2A4VA 2ES7A 3HVVA 1F37A 4ZL8A 3WT1A 1RQMA 4KH7A 2C8UA 5DCGA 1TXXA 4HEA2 4L0UA 2TRXA 1Z3EA 3VWUA 2OA7A 4POLA 3H4KA 1VF2A 4TXOB 5EY6A 5ABRA 3PGTA 3BOAA 1O6JA 4XRDA 3DYRA 2C1YA 2L59A 3CRUA 1SK1A 1WJKA 4WXTA 2AV4A 2BJXA 5LCZA 2CZ2A 3QAGA 1Z7RA 2H72A 1JFUA 5H5RA 1TK5B 3TKSC 1M2BA 1RK4A 6GSVA 1F3BA 2YWOA 1ZYEA 2VCQA 3BCIA 1GSEA 1HYUA 1NHOA 1K0AA 1XW6A 1SJ6A 1GSFA 4TW5A 3HKRA 3D22A 1TK8B 3P8WA 2IFQA 4EF0A 1A0RP 1EOGA 4TR3A 2H74A 4I2TA 3S9FA 2AJQB 4LLRA 3UARA 3HXSA 2FWGA 1M9AA 3GSTA 1V40A 5ID2B 5IOWA 2DIYA 3D6IA 1A23A 6GSTA 1ERVA 2C3QA 4ILFA 2O8VB 5D9TA 4PQHA 4O5RA 4DSRA 5F05A 2I4AA 1W89A 2K18A 3H1NA 4WEYA 4MF5A 2XPDA 3NZNA 1SJZA 5LD0A 5B8AA 4EL1A 16GSA 4N0VA 4Q5QA 3US3A 3TJKA 2QKEA 3LG6A 4IQ1A 2WGRA 3CYNA 2GZYA 3HDCA 4NXIA 3Q6OA 5ECPB 1YEXA 3IC4A 2JSYA 4TR1A 1LJRA 1TK0B 2LJAA 5HFGA 3TKRA 2CQ9A 5ECIB 1AIUA 1GL8A 1OAZA 2OJLA 4XRAA 2G0FA 5G1KA 5IOXA 2VM2A 3VURA 2GQKA 2R5GA 1GUMA 3O3TA 2VL3A 2DMLA 2H1GA 1F3AA 3GA4A 5IO0A 4TR0A 2KUCA 3A2WA 3Q74A 2B1KA 1GSSA 3TKPA 2VO4A 4L0WA 4KCAA 2HZFA 4LL4B 4WBJA 4J2FA 2VL9A 1KEBA 3O76A 8GSSA 4PNGA 4GCIA 4NWYA 3VI7A 3DEXA 2JZTA 3M1GA 1EEJA 2H19A 2MMZA 2KP2A 4KW6A 3E0UA 5IMFA 4HZ4A 4WETA 2H0IA 3FZ5A 2G2QA 3BD2A 2N5BA 3D4MA 3KTBA 1GTAA 1PN9A 1NM3A 4G2EA 5KN3A 3ZLPA 4NV2A 1U88A 2YJHA 3KZQA 4F9ZA 5HR2A 2P5QA 4GRFA 4PX1A 2QC7A 1I9DA 4IKHA 4MZWA 4ZL9A 3FYGA 2R2JA 3GURA 5D8IA 2H0HA 2B6MA 5IMDA 4V2NA 4X1UA 3TRQA 3WD6A 1DUGA 2DJ2A 4MABA 1K0OA 1ST9A 2LEGA 4K0GA 4TRXA 5INYA 5B6NA 3FZAA 3QD9A 2WRTA 3IR4A 2CV4A 2V6OA 1EGOA 2GSTA 4HJ2A 5G30A 2XBQA 4AJ7A 4D73B 4XTSA 4XS1A 4EDZA 1EWXA 3QPMA 4MK3A 4OO4A 5CP1A 4RQRA 2VCTA 1TOFA 2GLRA 1ZMAA 2IFQB 5F06A 5HR1A 2L6CA 3LSZA 3L78A 1SD8A 3ISOA 1Z7PA 1GLPA 2P31A 4X43A 2E0QA 1X5DA 2WULA 2YV9A 3KMOA 2YNXA 4HS1A 1T8EB 3M9KA 3TUEA 2DC5A 4IJIA 2LQQA 3HD5A 1IYIA 3FEUA 3L9SA 1TP9A 4RI7A 3FKFA 3RAZA 5GSSA 1DBYA 1S3AA 1MD4A 3KGKA 4TKYA 5IPGA 5IMVA 3DWVA 3AY8A 3VPTA 4WF5A 4MA9A 3TDGA 1QFNA 3LWAA 1ON4A 3CSHA 2V32A 1QGVA 3EMXA 4AGSA 5AISA 3M8NA 1XWBA 1K0DA 2L57A 1DE1A 5JWOB 3GMFA 2CAQA 3M0FA 4TR1B 3K8NA 2CT6A 1FB6A 5LNKe 1TDIA 1OKTA 2X8CA 2HNLA 4KSMA 5ECOB 2ZNMA 4BWQA 3EU4A 2WFCA 1WP0A 5D9WA 4AJ8A 2FD3A 1IYHA 5ECKB 2B3SA 4GQCA 2YJ7A 3I6AA 3HZ4A 5ID2A 3QCPA 5DJLA 3BBYA 2YWNA 3GYKA 2VLUA 5CNWA 4GWRA 1AQVA 1VRSD 3F3QA 1FAAA 4BVXA 3UMAA 1BEDA 5CREA 3GHAA 6GSSA 2DJ0A 1TU7A 2HZEA 2V6KA 3CMIA 3C71A 1DSBA 1RW1A 1PRXA 4IGJA 5E59A 2IWTA 4JR4A 3IK7A 1AW9A 3G7YA 4ID0A 3IA1A 4PUFC 3KM6A 1BYEA 4FYBA 2DLXA 3HY2A 4HUAA 4MZCA 3KEBA 3SBCA 1B48A 1F6MC 1ZGNA 2HLSA 1SL0B 5CAXA 3TJGA 3C8EA 2N5FA 2OE3A 3ZMLA 3G9BA 4KE3A 3SWLA 5IMCA 4F03A 2VD1A 4ZBDA 3IAM2 3DVXA 1TRSA 5GZZB 5F8BA 4K7NA 4ULXA 5FWGA 2GZPA 2OE1A 3LQ7A 4BL7A 5B6MA 1JZWA 1K0MA 3GX8A 5COHA 4IQAA 2R6KA 3VWWA 4O92A 2H70A 2YOIA 1O73A 2WJUA 4IP6A 3LFLA 4XIHA 4IS0A 4K7OA 3WYWA 3GN3A 3RBTA 1TI1A 2B5YA 2JSZA 1A24A 3UOMA 5HR0A 1X5EA 3W8SA 4PURA 2OBKA 1LBKA 1WRYA 3EYTA 5D96A 4F2IA 1JZDA 1PL1A 3DXBA 4MF7A 4MH2A 2VCVA 1A2LA 3KH7A 3F4TA 3GFKA 3HVSA 5J4UA 3ERFA 5HFKA 2IMFA 3FR9A 3QFAC 3GUSA 1A8YA 3HHVA 1FOVA 3HJOA 2H6ZA 1QQ2A 1XW9A 3GKNA 4FYCA 4MJAA 2J9HA 4KX4A 1GSYA 5A5KA 2OKAA 3A2XA 5KN1A 1ZL9A 5AIVA 1NHYA 2PERA 3GNJA 1XBSA 2FHEA 1YF1A 1XVQA 3PR8A 2PVQA 5KN2A 4Q5RA 5A4VA 2GDRA 2FWFA 1AC1A 1PMTA 18GSA 3HCZA 3UVHA 1AAZA 1HNBA 2H6XA 3C1SA 4CHSA 3DD3A 4D73A 1SENA 4FO5A 1EP8A 4OO5A 4TR4A 2YPMA 4ECBA 1FVJA 4XS6A 2FUG2 1QXHA 4HDEA 3M9JA 5IM9A 1T4YA 2LUSA 5AGYA 2I9HA 2XC2A 3TRXA 3U6VA 1SKRB 1URMA 2PPTA 1Z6MA 2LJKA 4F0CA 3TRPA 3ZMKA 1WIKA 1V57A 2CAIA 4MP4A 3EINA 17GSA 1SD9A 5HFIA 3TKSE 1MDJA 1TTZA 4J57E 2HZEB 3NOFA 3UL3A 1OC9A 3HA9A 4RI6A 4ZIJA 4IN0A 3EU3A 2GTUA 2CA8A 5J9BA 2HSYA 3KTLA 4MLYA 3C73A 4K7IA 1GUHA 3ZVJD 3UVTA 4KDUA 2HI7A 5ECMB 4WBRD 1M2AA 3R2QA 2MBTA 2MZCA 1YKAA 5C04A 3ZL5A 4OFNA 2MMAA 1O8WA 1VF1A 3F4RA 1Z5YE 3LORA 1U3AA 4TXVA 5J9CA 2L5LA 4EE0A 1HQOA 5ELGA 1K3OA 4OCFA 3ME8A 1SK2A 3Q18A 2DJ1A 2IPAA 2D2ZA 3W8JA 3ZTLA 5EVOA 4OCEA 2FWEA 4V2MA 1G7OA 3F9UA 5CO3A 4ZBAA 5GAND 2RLIA 2PBJA 3IAS2 1JHBA 4PXOA 1QMVA 4CW9A 6GSUA 1JLWA 1MEKA 1GLQA 4N30A 3GH6A 1GSQA 5EL8A 1WWJA 3IPZA 4DSSA 3FHKA 1LU4A 4I8BA 2FCHA 1GUKA 4BVYA 1Q4JA 4G10A 3I43A 1TU8A 3LGCA 1SJIA 2PVOC 1V98A 3GSSA 2Z9SA 3FZ9A 2ON5A 2YZHA 5DVBA 5JWRB 2OADA 4PNFA 6GSXA 1EZKA 4PGTA 2MMOA 1JZOA 1UC7A 4G9HA 4HOJA 2EIRA 3DKSA 1R26A 1TI3A 3N5OA 4MJCA 5IPHA 3D5JA 5CRGA 5ECRB 1PKWA 2OACA 13GSA 1ERTA 1CQGA 2IL3A 4P3YB 3GIXA 5J41A 4MJBA 5ENUA 3VLNA 1C72A 3IHQA 4EUYA 3HJMA 4MJEA 4RUVA 1Y6EA 4I2UA 1OKDA 3P7XA 2M46A 1SKSB 3CSIA 1HD2A 4JU5A 2MBSA 3VI5A 4KAEA 4MF6A 2VM1A 3I69A 4LMVA 3RDWA 5D9XA 1BQ7A 2L4QA 2ON7A 1XZOA 3M3MA 2PWJA 3LEFA 4LA1A 2H6YA 2O85A 5A4UA 1XPVA 3ERWA 1JLVA 3EVIA 1YJ6A 5B7CA 2C0EA 2KP1A 4BA7A 3GL5A 4XS4A 1N2AA 2RUFA 1V2AA 5G31A 2JACA 1OC9B 4Q5NA 3U5RE 1ERUA 1ML6A 3ZIVA 1G0TA 4MMMA 9GSSA 3C7MA 4EXJA 3EMPA 3F63A 1W4VA 5KN0A 1HNCA 2LQOA 2VD0A 1THXA 2NPBA 1NSWA 4Q5FA 2YV7A 3LJRA 3LXTA 4KNDA 1XCCA 3RPPA 5DAKA 1B4QA 3CTFA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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