1CU5A

T4 lysozyme mutant l91m
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSMDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Methionine and alanine substitutions show that the formation of wild-type-like structure in the carboxy-terminal domain of T4 lysozyme is a rate-limiting step in folding.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1cu5A00
1C6GA 1SWZA 1L02A 1QUOA 1CTWA 7LZMA 1CU0A 3FA0A 3HTBA 3CDTA 108LA 1XEPA 3SB7A 157LA 161LA 3LZMA 1L51A 2RH1A 4ZPUA 4E97A 147LA 1L54A 125LA 1EPYA 158LA 1L76A 4YX7C 1L43A 1L90A 2CUUA 1TLAA 3DN8A 1LW9A 1PQOA 1L86A 3HUKA 182LA 1CU5A 2B6XA 1C6DA 3RZEA 3HUAA 1L21A 247LA 1L66A 1CUPA 1QTHA 1L63A 2ANVA 1L47A 139LA 1CV3A 212LA 1L40A 1L30A 252LA 3JR6A 4W56A 1P6YA 3SB5A 1C6JA 4ARQA 1L33A 1G1WA 177LA 3HTDA 1L17A 3NYAA 1P56A 1PQKA 1C6TA 2RBNA 3PDSA 181LA 2Z6BA 1OWYA 197LA 1QT3A 3K2RA 2B75A 2OE9X 3OE6A 1L84A 4I7RA 1C66A 2HULA 1JTNA 3D4SA 1LI3A 1QTBA 138LA 4ARQB 109LA 1L61A 1D2WA 1L58A 226LA 227LA 240LA 1L92A 2F2QA 170LA 3OE9A 1CU6A 1L59A 1LYIA 3C8SA 113LA 1L07A 259LA 3V2YA 2LZMA 3DN4A 2B7XA 1L37A 1L16A 1G0LA 1G07A 1SWYA 148LE 4ARJA 183LA 160LA 2NTHA 258LA 2B70A 1LWGA 1XJUA 4PK0A 5LZMA 3GUIA 1JQUA 4EKRA 169LA 3HT9A 195LA 206LA 6LZMA 1P2LA 3DMVA 3F9LA 1NHBA 4W51A 4EJ4A 1L46A 4I7PA 1KY1A 201LA 2RB2X 1G06A 1P36A 4EPIA 1QT7A 1QT4A 1SSWA 230LA 163LA 1L55A 1JTMA 1CUQA 3HDFA 4GRVA 165LA 1QUHA 4W53A 1L10A 4I7MA 131LA 1PQMA 178LA 1L25A 4EPFA 1L06A 1QUGA 1L98A 1QTCA 1ZURA 164LA 3GUKA 1L09A 1L19A 1QUDA 3RUNA 1DYFA 1G0KA 3CDOA 102LA 1L28A 4DAJA 4YXAC 1L49A 3C7YA 2B74A 118LA 1CV0A 3PBLA 1SX2A 3GUMA 4OO9A 262LA 167LA 3SN6R 210LA 1L20A 1L72A 1QT8A 4YXCA 3DN3A 1L57A 189LA 261LA 198LA 244LA 1CV4A 2RBQA 1LGXA 123LA 151LA 2QB0B 1OV7A 1L68A 1KNIA 1P7SA 4EXMA 1L62A 4ARLA 129LA 1KS3A 137LA 1C68A 3SBAA 1OV5A 1G0GA 130LA 1C6AA 217LA 213LA 224LA 1D3NA 1ZWNA 1T8FA 1T8AA 2B6WA 1C61A 1T8GA 1DYDA 4GBRB 1L27A 1L52A 3HH5A 4EKPA 1QSQA 1G0PA 1CX6A 3FADA 1C60A 1C63A 1C6KA 3GUNA 1L14A 1L83A 2RBSA 1CU3A 1DYCA 2OU0X 3HTFA 1L71A 3NY9A 3HDEA 3G3WA 1CV1A 3HT6A 1D3MA 2OTZX 1CVKA 145LA 3V2WA 1L23A 1LYFA 1LI2A 235LA 1ZYTA 1L08A 1C6IA 3CDRA 238LA 115LA 1L56A 1T6HA 2RBRA 2RB1X 3EMLA 1QTZA 149LA 3DMZA 1L39A 4W55A 1G0QA 184LA 1C69A 3CDVA 220LA 1OVHA 3HT7A 1CU2A 2B72A 1L26A 1L95A 1L22A 3HH3A 237LA 2A4TA 1QT6A 1L31A 1L96A 3G3VA 1SX7A 2LCBA 3HU9A 2Q9EA 4PJZA 4W58A 2LC9A 1L81A 4LZMA 1OVKA 3DN6A 1LYGA 3HT8A 2B6YA 1P37A 1LYJA 1L50A 215LA 126LA 255LA 3GULA 1C6HA 150LA 1PQIA 1KW7A 1CX7A 1C6MA 4W59A 1LWKA 1DYAA 1KY0A 2O4WA 3ODUA 180LA 3OE8A 3L64A 1LYHA 1C62A 1L12A 2RAZX 3SB9A 162LA 4EKSA 4I7TA 199LA 1L18A 1L42A 127LA 1D2YA 1G0JA 245LA 4LDLA 1C67A 1OYUA 103LA 1L69A 218LA 1DYGA 1L94A 1D9WA 1L97A 250LA 2RBPA 4I7LA 3HU8A 1C6BA 4W52A 233LA 1L15A 1D3FA 223LA 239LA 1QS5A 4I7OA 1QT5A 1C6QA 4EKQA 1L38A 1C6CA 253LA 1L73A 174LA 1L74A 1L65A 2B6ZA 1L13A 2ANXA 1L67A 1LLHA 214LA 256LA 3HH4A 1C65A 3C80A 3DN2A 4I7KA 1L11A 1C6LA 1L53A 1L77A 155LA 2OU8A 225LA 1L87A 2F47A 3QAKA 4I7NA 159LA 3HTGA 1P5CA 242LA 2O7AA 1L03A 1C6EA 1P3NA 3C81A 4DJHA 3C8QA 4W57A 1L75A 3HH6A 1L41A 168LA 188LA 143LA 3NY8A 249LA 2OEAX 1L44A 1L82A 1LGUA 2HUMA 114LA 1PQDA 4W54A 2OTYX 2O79A 1L85A 1L34A 4IAPA 1L64A 1L05A 1OVJA 234LA 111LA 2RB0X 4I7SA 2IGCA 1L70A 173LA 1L36A 1L01A 1L04A 187LA 1L99A 243LA 2OE7X 1L24A 4LDOA 110LA 119LA 142LA 104LA 140LA 185LA 1PQJA 1C6FA 3SB8A 251LA 1L45A 4LDEA 3HWLA 211LA 3SBBC 205LA 1K28A 107LA 1L0JA 1SSYA 2L78A 1I6SA 1KW5A 4S0WA 3SB6A 222LA 1P64A 1B6IA 1L00A 3C7WA 254LA 190LA 1L80A 1LPYA 146LA 3G3XA 4I7JA 1P46A 1L35A 3F8VA 4AQNA 3GUPA 1L93A 3DN1A 1P2RA 246LA 2RAYX 128LA 1L89A 1C64A 219LA 1QTDA 257LA 4K5YA 1DYBA 171LA 241LA 176LA 1C6PA 1LYEA 1T97A 216LA 1CV6A 2NTGA 112LA 1C6NA 1L60A 1LYDA 186LA 3GUJA 231LA 3UONA 1QTVA 209LA 1L32A 2RBOA 3DMXA 1L0KA 1XJTA 120LA 2B6TA 2OE4X 1G0MA 3FI5A 5I14A 192LA 2QARC 3DNAA 141LA 2HUKA 1QS9A 4ARMA 3C8RA 1WTHA 1L79A 228LA 2B73A 3C83A 196LA 3DKEX 2OU9A 236LA 229LA 156LA 3HUQA 1L88A 200LA 122LA 1CV5A 1QSBA 260LA 1DYEA 3GUOA 4ARPA 3L2XA 2F32A 144LA 4I7QA 4ARMB 248LA 191LA 1LGWA 221LA 3CDQA 1L29A 1D3JA 3OE0A 3DN0A 232LA 166LA 2Q9DA 1G1VA 3VW7A 1LI6A 172LA 3C82A 1L48A 1L91A 1OWZA 4DKLA 152LA 3C7ZA 175LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZEKA 1G7MC 7LZMA 1GWDA 3HTBA 1GFAA 4NHQA 5LIOA 3SB7A 1LZRA 3WVYA 2RH1A 4RW1A 1FLYA 1XFPL 5KKIA 1L76A 1YROA 1TLAA 3DN8A 1PQOA 2B6XA 4WM5A 1C6DA 5HNCA 1CUPA 1LHJA 5F81A 1L63A 2ANVA 1L47A 139LA 1LJ4A 3JR6A 4W56A 5DN5A 3SB5A 1DKJA 5LAGA 4LZTA 177LA 1IP6A 1P56A 4BADA 1ZMYL 3PDSA 2Z6BA 1OWYA 1YANA 3K2RA 1QIOA 5KXLA 1IWWA 3HBHA 1ZVYB 4I7RA 1C66A 2HULA 1JTNA 1B2KA 2YBMA 4HJYA 1BWHA 1GF3A 1GF0A 1L07A 5J7CA 259LA 3V2YA 3LYTA 1F0WA 1GB0A 4TWSA 4DYGA 1LYOA 3P68A 1NWGA 2WARA 2B7XA 1G07A 1IO5A 1VDPA 160LA 1FLUA 1XJUA 4PK0A 5LZMA 1XGQC 4H90A 4J7VA 2BQOA 4D9ZA 169LA 1YAPA 3T6UA 1LAAA 1P2LA 3VWOA 1D0MA 1BGIA 201LA 4NSHA 2RB2X 3IJVA 1QT4A 2A7FA 4OWBA 1DI4A 230LA 1C7PA 4WO6A 1UIAA 1WVVA 2LHMA 3HDFA 5B05A 1QQYA 4H1PA 2YBNA 4B4EA 1HMKA 1IP4A 3AZ6A 4DC4A 1L19A 1SQ2L 4TUNA 2Z12A 1L49A 2MEFA 118LA 4GN3A 1CV0A 3PBLA 1SX2A 1RFPA 2MEDA 3IJUA 4OO9A 262LA 210LA 1L72A 4NGVA 4RW2A 4XN6A 5IHGA 5K7OA 3A95A 2C8OA 244LA 1KIRC 2RBQA 1LGXA 2D4JA 2F30A 4EXMA 1ZV5L 1C68A 3SBAA 1C6AA 1GE1A 213LA 3A8ZA 2B6WA 1C61A 1LJGA 3A3QA 4H92A 3GXKA 2F4AA 4BAPA 1IC7Y 1OUAA 4PJ2C 4EKPA 4ZFPA 1CX6A 1C60A 1LYZA 1BWIA 1L14A 1L83A 3RT5X 5FEKA 4HPEA 1IP2A 1B5VA 2OU0X 3B72A 1A4VA 3A34A 1IOQA 1B5UA 3AW6A 1GBOA 1HSXA 1JWRA 1G7JC 1L23A 1NBYC 4WM2A 1RE2A 4HPIA 1L08A 5KXPA 1T6HA 2DBTA 4OWEA 2B5ZA 3HT7A 4WLDA 3HH3A 5HNLA 1LHLA 4DQJA 2D91A 4N8ZA 1HEOA 5FSTA 2LCBA 3HU9A 1JSFA 1IY3A 1NF5A 5I54A 2LC9A 1L81A 4NWHA 2BQBA 2DQEY 1GFKA 1LYGA 5ILFA 1GFTA 1IR9A 1BVKC 1DZBX 1P37A 1C6HA 3EXDA 2G4NA 1EL1A 1KW7A 1CX7A 4C3WA 4W59A 1LWKA 1LZYA 1KY0A 1GAYA 3G3AB 3OE8A 3L64A 1LYHA 1L12A 1FN5A 4ETBA 4I7TA 8LYZA 4WLYA 4LYMA 4WG1A 1D2YA 1C67A 2ZIJA 1IOCA 2I25L 1CKGA 1L97A 4LT3A 250LA 3AZ4A 3HU8A 1IORA 1L15A 1D3FA 2HU1A 3AYQA 4I7OA 3LHMA 3B6LA 1LTMA 253LA 6LYZA 2ANXA 2EIZC 6LYTA 1LZ4A 3C80A 1CJ8A 1L77A 3J6KA 1UICA 3TMWA 1P5CA 1QSAA 1C6EA 1P3NA 3C81A 1LSZA 4W57A 249LA 2OEAX 1JTPL 1L44A 1BB5A 2MEEA 2H5ZA 1WQOA 2BQNA 1REMA 4UWVA 4QY9A 1L36A 1L01A 4NGJA 2OE7X 1GB8A 1GDWA 4LDOA 119LA 1IX0A 1B7PA 142LA 1C46A 3WMKA 3SB8A 3ULRA 1LZ5A 4H94A 1LZDA 4DQ7A 1IWVA 2L78A 4WM4A 4ANRA 3FE0A 1FKQA 1P64A 3TXBA 3C7WA 3RNXA 4W94A 4FJRA 3WW5A 3ZVQB 1L80A 4I7JA 1L35A 3F8VA 1TBYA 1QUSA 4G49A 5LA5A 3A94A 1BB4A 4OWAA 3DN1A 4NHSA 1P2RA 2RAYX 4LYOA 1XEIA 1L89A 219LA 5B1FA 1DYBA 1GDXA 5T3FA 2ZILA 5B06A 1FKVA 1LYEA 3A90A 1T97A 1C10A 216LA 112LA 1L60A 1LYDA 3GUJA 5LVKA 1HEQA 2BQMA 3TXIA 1IIZA 1JIYA 1L32A 2BQFA 2Z38A 4CGEA 1JTOL 1XEJA 1HMLA 1XJTA 1LKRA 1YAQA 2OE4X 1G0MA 2AUBA 1LZBA 4NHTA 5I14A 192LA 2QARC 3B0OA 141LA 1IWTA 4J1BA 3IWRA 4I0CA 3C8RA 3A93A 2OU9A 5I53A 1GD6A 122LA 4NGYA 1CV5A 4A7DA 3WPJA 3A3RX 1D0LA 221LA 1LMPA 1L29A 3AZ7A 1D3JA 154LA 5F9XA 4P2EA 3DN0A 1HEMA 1VFBC 1KXYA 1OWZA 2ZWBA 1UIBA 3WUAA 175LA 2Z2EA 1GFJA 1UCOA 4NGWA 1C6GA 4CFPA 1L02A 4G4CA 1CU0A 1FBIX 4HJZA 1HERA 2IHLA 1IOSA 3LZMA 4H8ZA 4HTKA 5I5QA 4E97A 1ZVHL 4PHIA 125LA 4BS7A 2W1MA 4HJVA 158LA 3WU8A 4YX7C 1L43A 1IC5Y 1LW9A 1AT5A 1CU5A 1LSAA 1WQPA 1L66A 1LYSA 252LA 1C6JA 4ARQA 5B1GA 1PQKA 1C6TA 4ETAA 3WH1A 2Z2FA 1LJNA 4H93A 1OUBA 4YENA 3AJNA 4E3UA 1D6PA 1INUA 2B75A 3OE6A 1L84A 1IEEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ZEK A;  1G7M C;  7LZM A;  1GWD A;  3HTB A;  1GFA A;  4NHQ A;  5LIO A;  3SB7 A;  1LZR A;  3WVY A;  2RH1 A;  4RW1 A;  1FLY A;  1XFP L;  5KKI A;  1L76 A;  1YRO A;  1TLA A;  3DN8 A;  1PQO A;  2B6X A;  4WM5 A;  1C6D A;  5HNC A;  1CUP A;  1LHJ A;  5F81 A;  1L63 A;  2ANV A;  1L47 A;  139L A;  1LJ4 A;  3JR6 A;  4W56 A;  5DN5 A;  3SB5 A;  1DKJ A;  5LAG A;  4LZT A;  177L A;  1IP6 A;  1P56 A;  4BAD A;  1ZMY L;  3PDS A;  2Z6B A;  1OWY A;  1YAN A;  3K2R A;  1QIO A;  5KXL A;  1IWW A;  3HBH A;  1ZVY B;  4I7R A;  1C66 A;  2HUL A;  1JTN A;  1B2K A;  2YBM A;  4HJY A;  1BWH A;  1GF3 A;  1GF0 A;  1L07 A;  5J7C A;  259L A;  3V2Y A;  3LYT A;  1F0W A;  1GB0 A;  4TWS A;  4DYG A;  1LYO A;  3P68 A;  1NWG A;  2WAR A;  2B7X A;  1G07 A;  1IO5 A;  1VDP A;  160L A;  1FLU A;  1XJU A;  4PK0 A;  5LZM A;  1XGQ C;  4H90 A;  4J7V A;  2BQO A;  4D9Z A;  169L A;  1YAP A;  3T6U A;  1LAA A;  1P2L A;  3VWO A;  1D0M A;  1BGI A;  201L A;  4NSH A;  2RB2 X;  3IJV A;  1QT4 A;  2A7F A;  4OWB A;  1DI4 A;  230L A;  1C7P A;  4WO6 A;  1UIA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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