1CU6A

T4 lysozyme mutant l91a
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSADAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Methionine and alanine substitutions show that the formation of wild-type-like structure in the carboxy-terminal domain of T4 lysozyme is a rate-limiting step in folding.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1cu6A00
1OVKA 3ODUA 1L26A 3FADA 3HUKA 4ARLA 1L03A 1QT6A 222LA 3SBBC 2ANVA 2B72A 1D2WA 234LA 218LA 250LA 3GUMA 1L46A 2B6XA 1L95A 1L62A 3PBLA 103LA 205LA 3DN6A 4OO9A 2HUKA 1L32A 3HH6A 3L2XA 3DMZA 2Z6BA 191LA 221LA 1PQIA 1LI6A 1P64A 1T8AA 1G0LA 1CU0A 2F2QA 3NY8A 4I7OA 3DMXA 4W54A 1CVKA 1OWYA 4W51A 2RH1A 3HTGA 147LA 1G0QA 4EKSA 1LYEA 4W55A 1CV5A 1SWZA 1L18A 168LA 3PDSA 1QT5A 3HU9A 1B6IA 1L24A 253LA 2RBQA 259LA 1QUGA 1LWGA 1L02A 4ARJA 1DYBA 4EPFA 1L84A 4I7MA 130LA 1ZYTA 2RBPA 3CDQA 166LA 2RBRA 248LA 173LA 111LA 1SX2A 1L41A 1DYCA 1L79A 1P37A 161LA 4W59A 1G0KA 115LA 1CU6A 110LA 260LA 1QS9A 1L06A 201LA 192LA 261LA 1SWYA 223LA 2RAZX 119LA 1L33A 1CU5A 1P3NA 209LA 162LA 1G07A 3DN3A 2HUMA 1L75A 1DYFA 139LA 2LZMA 4I7RA 3OE8A 228LA 2B75A 3SB8A 109LA 225LA 216LA 1L63A 3HTFA 3HH4A 1L40A 1L80A 3CDVA 2OU9A 1D9WA 120LA 1LI2A 150LA 1D2YA 256LA 1KW7A 3C82A 2CUUA 2OU0X 1QS5A 155LA 3GUKA 2HULA 1CV6A 3C8QA 1L94A 4DAJA 214LA 255LA 146LA 3C80A 3HU8A 1LLHA 1P6YA 1DYDA 2OE9X 4DJHA 144LA 1JTMA 1T6HA 174LA 1L36A 2RBOA 1C6QA 1L37A 3HT7A 1L44A 107LA 235LA 243LA 4I7JA 138LA 1L00A 1L50A 4EKQA 182LA 1OWZA 1C6NA 1QTZA 175LA 211LA 187LA 4ARMB 4EKPA 2O79A 185LA 1C62A 1I6SA 1L39A 1L07A 165LA 3V2WA 129LA 220LA 2B73A 1L96A 1DYAA 1XJUA 1L0JA 247LA 1CV0A 1LGWA 1LGUA 4EXMA 1QT4A 4I7SA 236LA 4DKLA 123LA 1L67A 244LA 1C6TA 1L99A 157LA 3C8RA 240LA 4I7PA 1L98A 1L19A 1L60A 1L76A 1L87A 1P46A 6LZMA 198LA 112LA 200LA 1QT8A 1G0GA 1KY1A 1L97A 3GUNA 1QSBA 257LA 1L23A 1D3MA 1L56A 1OVHA 224LA 143LA 1C60A 1L71A 252LA 2B6ZA 1L53A 2ANXA 148LE 1JQUA 1C6DA 1L54A 1PQMA 1C6EA 1L05A 1C68A 3RZEA 1QTDA 3NYAA 171LA 4ARQB 1K28A 2Q9EA 1P56A 226LA 3C8SA 4W58A 1C6PA 1L59A 5I14A 3JR6A 2OE7X 233LA 1L12A 1L81A 3GUOA 199LA 149LA 3DN2A 167LA 4K5YA 128LA 1PQJA 241LA 3QAKA 1L04A 1OVJA 169LA 1L82A 1XJTA 102LA 140LA 4I7LA 245LA 1L25A 1L88A 1L83A 1C6GA 1ZWNA 186LA 249LA 2A4TA 2IGCA 4LZMA 3C7WA 1L09A 1L22A 1P5CA 197LA 1L35A 3V2YA 127LA 3DKEX 217LA 1L34A 1PQOA 206LA 4EJ4A 188LA 1CX7A 1L43A 1QUDA 3DN8A 189LA 246LA 1C6MA 1P2LA 229LA 3HH3A 1DYGA 1L85A 1G0PA 3G3VA 3HUQA 3C81A 3OE9A 1PQDA 2F47A 3SB5A 1L66A 1L93A 3GUPA 1C66A 2B6TA 1LYFA 1LYHA 215LA 3G3XA 251LA 1CUPA 232LA 3OE6A 1P7SA 4E97A 3SB9A 1C63A 227LA 1JTNA 163LA 2L78A 2OTZX 2B6YA 1L11A 1EPYA 3CDTA 3HTDA 1LGXA 242LA 1QUOA 177LA 1L0KA 104LA 1G06A 1L15A 1L45A 1G1VA 3UONA 3C83A 3HT9A 1C6KA 7LZMA 1LYGA 1L57A 1L55A 4LDOA 3SB6A 1L77A 1C6AA 1L73A 2OTYX 3HDFA 3GULA 142LA 1OYUA 2NTHA 3F8VA 4IAPA 1L17A 1L27A 238LA 2B7XA 1QUHA 1C6LA 3SBAA 113LA 1L65A 122LA 2QARC 1L28A 5LZMA 180LA 195LA 1L51A 3SN6R 1L64A 1T8GA 1L13A 1L48A 1D3JA 3DN4A 4EPIA 1CV3A 4GRVA 1DYEA 1L49A 3K2RA 1L42A 3EMLA 1KY0A 239LA 1L89A 4YXAC 4EKRA 2O4WA 2NTGA 258LA 1QTBA 3DNAA 2Q9DA 4I7QA 1C6HA 3F9LA 145LA 3HH5A 1SX7A 1L01A 1CV4A 2LCBA 114LA 3HDEA 137LA 1L86A 3D4SA 3FI5A 141LA 1L72A 4W53A 230LA 2OE4X 4LDLA 158LA 184LA 1CU3A 1WTHA 1LYDA 1KNIA 254LA 4ZPUA 1G0JA 176LA 1CUQA 1ZURA 4PK0A 1L10A 1L14A 1SSWA 1L16A 1C6FA 1P2RA 2LC9A 1L90A 4ARMA 172LA 1C6BA 1G1WA 2B70A 1L69A 1L31A 2B6WA 1D3NA 152LA 1T8FA 3LZMA 1L08A 4YXCA 164LA 3OE0A 1L92A 1T97A 3FA0A 1L68A 1PQKA 156LA 2RB0X 1L74A 1LI3A 3HT8A 2F32A 1L29A 213LA 131LA 190LA 1KS3A 1C61A 1OV5A 2B74A 1CTWA 1LYJA 1D3FA 170LA 262LA 2RBNA 4I7KA 1QT7A 2QB0B 3HUAA 3DN1A 1QTHA 159LA 2OEAX 219LA 1CX6A 2RBSA 4AQNA 1G0MA 4ARPA 1CU2A 1L61A 1L20A 183LA 210LA 3GUIA 2RB2X 3HT6A 4PJZA 125LA 1C64A 1P36A 160LA 1L21A 1KW5A 1LW9A 4GBRB 4ARQA 4W56A 1LYIA 237LA 1L38A 1L52A 151LA 3CDRA 1LWKA 126LA 1L30A 4W57A 4I7NA 4LDEA 4YX7C 1QSQA 3CDOA 108LA 118LA 2O7AA 3DMVA 3L64A 231LA 3C7YA 2RAYX 1L58A 1C6JA 1QT3A 1C65A 3HWLA 3RUNA 2RB1X 196LA 3GUJA 1QTVA 1L91A 1L47A 1XEPA 2OU8A 1LPYA 1C6CA 1L70A 4I7TA 3DN0A 1C6IA 1C69A 3C7ZA 1NHBA 212LA 3G3WA 3SB7A 4S0WA 178LA 1TLAA 181LA 1CV1A 4W52A 1SSYA 3NY9A 1QTCA 3VW7A 1OV7A 1C67A 3HTBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RW1A 4H9AA 1TDYA 1FKVA 1CJ8A 1QT6A 1QSWA 3TMVA 222LA 2B72A 1D2WA 4DD9A 3WVXA 4H8XA 1RJCB 3GUMA 1L46A 5HQ1A 1L62A 3PBLA 3RZ4A 3P68A 4EOFA 5EBHA 1XFPL 1LKSA 3DMZA 2Z6BA 221LA 4GN3A 1NQIA 4N1EI 2FYCA 3RNXA 1B7MA 1OWYA 4DQ5A 3GXRA 1G0QA 1CV5A 1L18A 3WU9A 1QT5A 5LYMA 1B6IA 3CSRA 1L24A 253LA 4Z3MA 1LWGA 1L02A 1HEMA 3W6AA 4I7MA 1LYOA 1VDSA 1ZYTA 5L3IA 4LYZA 1LHKA 1UIFA 4GCEA 4CHXA 3LZ2A 1HEWA 4W59A 1LZBA 2Z18A 115LA 1IP6A 192LA 4XJDA 1D6QA 223LA 4HJVA 2RAZX 1CU5A 1P3NA 1GE1A 1BVKC 1G07A 4H9EA 1AT5A 2Z12A 1L75A 1EQ4A 1UIHA 2MEDA 1W6ZA 3EBAB 1KIQC 3SB8A 1IY4A 5LVIA 4J7VA 5I4YA 1L63A 3HTFA 4DD3A 1L80A 3CDVA 5I5QA 120LA 1INUA 3C82A 2CUUA 2OU0X 1IWXA 2Z37A 1G7IC 8LYZA 3LYMA 3TXKA 2W1LA 3WU8A 1WQOA 2Z2FA 3HU8A 4DJHA 4H93A 174LA 4YENA 3HT7A 107LA 1LSNA 138LA 4EKQA 1RE2A 5DM9A 4L41A 1OWZA 1VFBC 2YBHA 187LA 2O79A 185LA 165LA 3V2WA 1L96A 1DYAA 1XJUA 1B7OA 1GFEA 1CV0A 1DI4A 1L67A 2H9JA 4AXTA 1LZRA 4TWSA 4I7PA 1IOCA 1D6PA 1BHZA 2ZQ3A 1JIYA 1WQQA 135LA 4HTKA 2Y8PA 1KXYA 1D3MA 1JWRA 4NWEA 143LA 1LZ6A 1C60A 1IP1A 2B6ZA 1C6DA 5LA5A 3CB7A 1LZDA 3CSZA 4ETCA 2MECA 4NSJA 4W58A 1HSWA 4H9BA 1L12A 1L81A 4G4HA 5KXSA 1JSFA 169LA 1C43A 1L82A 1XJTA 1IY3A 1L88A 4ANRA 1YAOA 2G4QA 1GBWA 1JJ3A 197LA 4Z41A 4EJ4A 1NBYC 1CX7A 4WLYA 3DN8A 246LA 1P2LA 229LA 3AB6A 3FE0A 1L85A 1G0PA 3G3VA 1JKDA 3OE9A 1LZ8A 1WVUA 4WLXA 3GUPA 1LSBA 2HEBA 1F6SA 3EMSA 1IP4A 1CUPA 1CJ9A 1B5YA 4NHPA 3P66A 2H9KA 177LA 2DQJY 1IP5A 5LVKA 1L45A 3AZ7A 2HEDA 1LZ4A 1LZNA 1LSYA 1C6KA 2F4AA 3W6EA 4LDOA 4XJHA 1L77A 4LYBA 1C6AA 4LGKA 1LMAA 4MCKA 1GEVA 3GULA 4RW2A 3A91A 238LA 4DD1A 1QUHA 1GB5A 1C6LA 1GB3A 1XGTC 4E3UA 1L65A 3BKHA 1HMKA 1T8GA 1NMMA 4BADA 1UBZA 1C7PA 4EPIA 3K2RA 1FLUA 3WW5A 4EKRA 5LVGA 132LA 2NTGA 258LA 3DNAA 4I7QA 4XYYA 3SP3A 1LSPA 3AZ6A 1CV4A 2BQEA 137LA 1L86A 3D4SA 141LA 4W53A 5KXZA 2EQLA 4LDLA 158LA 1FLYA 2IHLA 1DQJC 3VWOA 1ZURA 1LSAA 1L90A 4NSHA 172LA 1G1WA 1L31A 4HPIA 3HFMY 1WVVA 1D3NA 3LZMA 208LA 3AYQA 4W94A 1LJ4A 3FA0A 156LA 2Q0MX 1E8LA 1LSDA 1LI3A 1YL0X 2F32A 1YQVY 2HEEA 1C45A 1KIRC 131LA 4RLNA 5I54A 2BQGA 1PS5A 1IWUA 1LYJA 1A4VA 1GB2A 3WUNA 262LA 1IIZA 1N4FA 1QT7A 1IR8A 3M3UA 4NGZA 2BLXA 2MEIA 193LA 5KXNA 4ARPA 1L61A 3GUIA 3HT6A 1OUHA 5D5CA 1I56A 4HSFA 1P36A 3WW6A 1D0KA 160LA 1KW5A 1LW9A 1LYIA 5FSTA 2EIZC 4NG1A 4ZFPA 4W57A 4YX7C 1QSQA 4GCDA 4DD0A 108LA 118LA 2O7AA 2ZNWY 1D9UA 231LA 2VB1A 3AZ5A 3C7YA 3FI7A 2BQDA 2RAYX 5LVJA 134LA 1LZAA 1HC0A 3HWLA 1G7LC 2RB1X 3GUJA 5JENB 1L47A 2OU8A 5D5FA 1L70A 1LMPA 1C6IA 1CKGA 1LSMA 3WMKA 1TLAA 2HEFA 4J1AA 2HU3A 3NY9A 1C67A 4RLMA 1OVKA 2DQEY 4ARLA 1DI5A 3LZTA 4QEQA 2ANVA 2D4KA 5DLAA 4XENA 5KXYA 1B7QA 218LA 250LA 3W6FA 1MELL 103LA 1LSFA 3DN6A 5A3EA 1SQ2L 1B5VA 3A6CY 3L2XA 3W6CA 1PQIA 3WH1A 1CU0A 2HEAA 1IC5Y 4I7OA 2Z19A 4W54A 1CVKA 4DD7A 1IVMA 4W51A 147LA 4M6DA 4H90A 4EKSA 4W55A 1SWZA 207LA 1GEZA 5B05A 4HTQA 1QUGA 1GF5A 4YF2A 1IOSA 1LMCA 248LA 1LJIA 4WM5A 1L41A 4UWNA 1L79A 1P37A 1YILA 2H5ZA 4ETEA 3QE8A 3G3BB 4DWXA 1QS9A 1OUCA 1SWYA 2Z38A 3W6BA 119LA 4GN4A 1QIOA 3DN3A 3LYTA 1UIBA 1J1PY 139LA 2LZMA 5C6JA 3OE8A 1LJ3A 3A6BY 109LA 2DQAA 1GFRA 4NG8A 4WM4A 3HH4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2HUM A;  1L75 A;  1DYF A;  139L A;  2LZM A;  4I7R A;  3OE8 A;  228L A;  2B75 A;  3SB8 A;  109L A;  225L A;  216L A;  1L63 A;  3HTF A;  3HH4 A;  1L40 A;  1L80 A;  3CDV A;  2OU9 A;  1D9W A;  120L A;  1LI2 A;  150L A;  1D2Y A;  256L A;  1KW7 A;  3C82 A;  2CUU A;  2OU0 X;  1QS5 A;  155L A;  3GUK A;  2HUL A;  1CV6 A;  3C8Q A;  1L94 A;  4DAJ A;  214L A;  255L A;  146L A;  3C80 A;  3HU8 A;  1LLH A;  1P6Y A;  1DYD A;  2OE9 X;  4DJH A;  144L A;  1JTM A;  1T6H A;  174L A;  1L36 A;  2RBO A;  1C6Q A;  1L37 A;  3HT7 A;  1L44 A;  107L A;  235L A;  243L A;  4I7J A;  138L A;  1L00 A;  1L50 A;  4EKQ A;  182L A;  1OWZ A;  1C6N A;  1QTZ A;  175L A;  211L A;  187L A;  4ARM B;  4EKP A;  2O79 A;  185L A;  1C62 A;  1I6S A;  1L39 A;  1L07 A;  165L A;  3V2W A;  129L A;  220L A;  2B73 A;  1L96 A;  1DYA A;  1XJU A;  1L0J A;  247L A;  1CV0 A;  1LGW A;  1LGU A;  4EXM A;  1QT4 A;  4I7S A;  236L A;  4DKL A;  123L A;  1L67 A;  244L A;  1C6T A;  1L99 A;  157L A;  3C8R A;  240L A;  4I7P A;  1L98 A;  1L19 A;  1L60 A;  1L76 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4RW1 A;  4H9A A;  1TDY A;  1FKV A;  1CJ8 A;  1QT6 A;  1QSW A;  3TMV A;  222L A;  2B72 A;  1D2W A;  4DD9 A;  3WVX A;  4H8X A;  1RJC B;  3GUM A;  1L46 A;  5HQ1 A;  1L62 A;  3PBL A;  3RZ4 A;  3P68 A;  4EOF A;  5EBH A;  1XFP L;  1LKS A;  3DMZ A;  2Z6B A;  221L A;  4GN3 A;  1NQI A;  4N1E I;  2FYC A;  3RNX A;  1B7M A;  1OWY A;  4DQ5 A;  3GXR A;  1G0Q A;  1CV5 A;  1L18 A;  3WU9 A;  1QT5 A;  5LYM A;  1B6I A;  3CSR A;  1L24 A;  253L A;  4Z3M A;  1LWG A;  1L02 A;  1HEM A;  3W6A A;  4I7M A;  1LYO A;  1VDS A;  1ZYT A;  5L3I A;  4LYZ A;  1LHK A;  1UIF A;  4GCE A;  4CHX A;  3LZ2 A;  1HEW A;  4W59 A;  1LZB A;  2Z18 A;  115L A;  1IP6 A;  192L A;  4XJD A;  1D6Q A;  223L A;  4HJV A;  2RAZ X;  1CU5 A;  1P3N A;  1GE1 A;  1BVK C;  1G07 A;  4H9E A;  1AT5 A;  2Z12 A;  1L75 A;  1EQ4 A;  1UIH A;  2MED A;  1W6Z A;  3EBA B;  1KIQ C;  3SB8 A;  1IY4 A;  5LVI A;  4J7V A;  5I4Y A;  1L63 A;  3HTF A;  4DD3 A;  1L80 A;  3CDV A;  5I5Q A;  120L A;  1INU A;  3C82 A;  2CUU A;  2OU0 X;  1IWX A;  2Z37 A;  1G7I C;  8LYZ A;  3LYM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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