1CUQA

T4 lysozyme mutant v103m
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMMFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Methionine and alanine substitutions show that the formation of wild-type-like structure in the carboxy-terminal domain of T4 lysozyme is a rate-limiting step in folding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1cuqA00
4EXMA 4K5YA 4ARLA 1T97A 2RBRA 1C6CA 1T8FA 142LA 2OE9X 1P7SA 256LA 1C6QA 1CUQA 1C6KA 1L16A 1L68A 1QT5A 1CX6A 1PQKA 262LA 2RAYX 224LA 185LA 175LA 143LA 1L92A 3HUKA 3OE6A 220LA 1L12A 1L24A 1L59A 3HDFA 247LA 4I7QA 4W51A 1QUOA 1G0PA 2RB0X 125LA 1P46A 1L11A 182LA 1L25A 1PQJA 252LA 1L62A 1LYJA 3RUNA 2RBQA 217LA 1D3MA 160LA 2OU9A 238LA 1XJTA 1L65A 2HULA 1LI3A 1L76A 3HH4A 259LA 170LA 260LA 4I7OA 1CUPA 1SX7A 1L08A 1C6NA 1LI6A 223LA 2OEAX 168LA 1L43A 1L94A 253LA 2ANVA 1CTWA 1I6SA 1L19A 3C7YA 1CU5A 3CDQA 3GUKA 1C66A 242LA 2NTGA 2Q9EA 3HH3A 199LA 1DYAA 206LA 1L06A 1L95A 1P5CA 214LA 4EKRA 249LA 1L84A 1L39A 3C7ZA 3OE9A 147LA 1L33A 4W52A 1C62A 1G0LA 1PQDA 2F32A 3CDOA 4W58A 1L80A 4I7MA 3PBLA 1L45A 2B73A 4LDOA 129LA 111LA 3G3XA 3ODUA 3HTGA 5I14A 212LA 231LA 2OU0X 1C6PA 254LA 3K2RA 3SBAA 4ARMA 4ARJA 1T8GA 2RAZX 215LA 1G0QA 1QS5A 3GUPA 1OVHA 3FA0A 1G07A 1L60A 2A4TA 1L15A 1L17A 1L75A 3OE8A 137LA 126LA 2F47A 146LA 1QTDA 1P37A 1C67A 1CV1A 1G1WA 1K28A 2ANXA 1L87A 234LA 2B72A 188LA 1L09A 232LA 102LA 1P56A 1G0KA 1QTVA 1C6HA 3RZEA 1L66A 1L49A 210LA 3F9LA 4I7TA 1LYEA 1LYGA 1L03A 3C8QA 3SB8A 1L20A 3HT8A 1C6MA 1D2WA 1C6LA 251LA 186LA 3DN8A 4W53A 3DN0A 1WTHA 1L05A 3HH5A 1L67A 241LA 1L00A 2Q9DA 4GBRB 158LA 3SB6A 150LA 3SB7A 2O7AA 1KY1A 3DMZA 198LA 1L77A 227LA 1L96A 1C63A 1L02A 2O4WA 3C8RA 1L0JA 2OE7X 1PQOA 1L70A 140LA 1JTMA 1L93A 1OWYA 1LWKA 2LC9A 2O79A 4I7JA 3SN6R 221LA 2F2QA 3CDTA 3DKEX 201LA 4EKSA 2B75A 4IAPA 3FADA 4DAJA 4EPFA 1C6DA 2RBOA 3SB9A 211LA 1L64A 1KNIA 1G06A 1T8AA 4I7LA 235LA 1L26A 1L56A 1L83A 3G3VA 4I7RA 216LA 107LA 3HTDA 230LA 3DN3A 1QS9A 1D3JA 1D3NA 1DYDA 218LA 119LA 178LA 3F8VA 2NTHA 1KY0A 181LA 2RBNA 130LA 1L98A 1CV0A 213LA 239LA 2HUMA 1L58A 3D4SA 3GUJA 162LA 3DN4A 2L78A 165LA 120LA 1C6TA 3CDVA 1QSQA 1QT8A 3HT7A 1QTZA 1L01A 1L29A 1ZURA 164LA 4DJHA 4ARMB 1C69A 2OTYX 1SSWA 229LA 1DYFA 1L54A 3HTFA 139LA 183LA 258LA 2HUKA 3NYAA 3GUNA 112LA 1L18A 1L0KA 222LA 3HH6A 1L47A 3HT9A 191LA 261LA 2B6TA 1LGXA 1L69A 1L99A 1C6AA 3HUQA 1L37A 1G0GA 109LA 1L57A 2RB2X 1KW7A 3EMLA 1D9WA 250LA 1L71A 1SWZA 1L44A 2B6WA 1OYUA 1LYHA 3V2YA 3QAKA 1LGWA 1LYDA 4ZPUA 4EPIA 225LA 1D2YA 244LA 123LA 2B6XA 1L21A 257LA 1CU2A 4W55A 1L14A 3SBBC 1QT7A 103LA 1L85A 1G0JA 240LA 141LA 1L61A 1CU3A 190LA 4W57A 4AQNA 166LA 1LYIA 3C80A 1C65A 118LA 159LA 1XJUA 3C7WA 1C68A 115LA 6LZMA 4EKQA 3L2XA 180LA 157LA 184LA 196LA 1NHBA 1LPYA 1C64A 2B7XA 1L13A 1LW9A 1XEPA 3HWLA 4PK0A 151LA 4W56A 3DN2A 172LA 1C60A 1C6EA 1D3FA 1C6FA 1L97A 2RH1A 3NY8A 3HTBA 2LCBA 3DN1A 3HT6A 3L64A 4I7PA 4YXAC 205LA 1LI2A 1P3NA 127LA 169LA 174LA 4E97A 1L63A 4I7NA 4ARQA 3V2WA 104LA 1C6BA 4LDLA 1L81A 3FI5A 1C61A 4OO9A 255LA 4YXCA 1G1VA 2RBSA 1OV7A 1L46A 4I7SA 1QTHA 167LA 1L91A 1LLHA 1L10A 110LA 122LA 219LA 248LA 1L32A 2RBPA 144LA 1L55A 1L50A 1QTCA 195LA 1CV6A 3GULA 1L22A 4LZMA 2Z6BA 3DMVA 138LA 1L72A 3DNAA 2IGCA 128LA 1L73A 4S0WA 1L23A 148LE 145LA 2QB0B 1LGUA 1C6JA 228LA 1L30A 1P2RA 4I7KA 1L48A 3DN6A 3C8SA 5LZMA 1P6YA 1LWGA 2LZMA 3HU9A 1L35A 3GUMA 197LA 1L51A 163LA 2B70A 3C82A 1G0MA 1L86A 4EJ4A 1OVKA 1L38A 1CV4A 1L40A 237LA 4W54A 1OV5A 152LA 149LA 1L89A 3VW7A 3GUOA 3JR6A 187LA 3OE0A 1DYCA 1SSYA 1QUDA 4EKPA 1DYEA 3C83A 2OTZX 3LZMA 226LA 3UONA 1B6IA 1L41A 3PDSA 1QUGA 3HUAA 3GUIA 3CDRA 1EPYA 3C81A 131LA 1SX2A 1CV3A 1QT4A 1OWZA 2B6ZA 1L34A 1L74A 1P36A 1SWYA 1ZYTA 1L28A 1L07A 200LA 7LZMA 1L90A 1L36A 192LA 1QT6A 1TLAA 1C6IA 233LA 1KS3A 1L27A 1QUHA 2RB1X 4W59A 1CU0A 3DMXA 4ARPA 1CX7A 1L88A 236LA 3G3WA 176LA 1L52A 2CUUA 1JTNA 4ARQB 171LA 1L04A 3HU8A 1L79A 209LA 1PQIA 114LA 156LA 1QT3A 1P2LA 155LA 113LA 243LA 245LA 1P64A 4YX7C 2OU8A 2B6YA 1L31A 108LA 1L42A 1C6GA 177LA 1QSBA 2B74A 1DYGA 3SB5A 1CV5A 161LA 246LA 1OVJA 2QARC 1CVKA 1QTBA 4LDEA 1L53A 1KW5A 173LA 1DYBA 3HDEA 1L82A 4DKLA 1LYFA 1T6HA 4PJZA 1JQUA 1CU6A 3NY9A 1PQMA 4GRVA 1ZWNA 2OE4X 189LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FLUA 4ARLA 1UA6Y 1T97A 4LT0A 1C6CA 256LA 1AM7A 1JKCA 1CX6A 262LA 3GXRA 2YBIA 1TEWA 175LA 143LA 1QSAA 3OE6A 5D5FA 4YEOA 1L12A 1L24A 4NGYA 1OQMA 247LA 1HSWA 5LYTA 1QUOA 2RB0X 125LA 5APDA 1LZ8A 5LVJA 1L25A 1IIZA 2RBQA 4ANRA 4IJ4A 4RW1A 4H90A 160LA 5J7CA 1XJTA 1LOZA 1L65A 1OUJA 1LYZA 1NBZC 1I20A 3OJPA 4DQ7A 3A34A 4LYBA 2OEAX 1WQMA 3WL2A 1CTWA 5KXYA 1IP1A 1QSWA 5FSTA 1CU5A 3GUKA 2Q9EA 199LA 1L95A 1AT5A 1LJKA 5KXWA 1WVVA 3C7ZA 1KIPC 1L33A 4RLNA 194LA 1NMMA 1L80A 4I7MA 1LSMA 111LA 4H9HA 2D4KA 1NHEA 1GHLA 2HEFA 5I14A 2ZYPA 1C6PA 4ARMA 4NHPA 4CJ2A 1GB7A 3A92A 4WG1A 4H9IA 1GE2A 1IC4Y 1OVHA 1G07A 2IHLA 4WL7A 137LA 146LA 3IWRA 1GDXA 5LA5A 2ZNXY 2MEBA 1CV1A 1K28A 1HSXA 1LKRA 2ANXA 234LA 2B72A 102LA 1P56A 3HBDA 1L66A 3LHMA 3ZEKA 3HBHA 1BWHA 4TTDA 2GV0A 3HT8A 251LA 2F2NA 4NHTA 2EPEA 241LA 3P64A 4CFPA 1OUBA 1YANA 3RZ4A 1L77A 227LA 1C63A 4OOOA 2O4WA 1UIHA 2OE7X 1LJEA 140LA 1IOTA 1B7SA 1L93A 1OWYA 4RLMA 1XEJA 1Z55A 2F2QA 4DD1A 1JSEA 201LA 4EKSA 4IAPA 4DAJA 4YENA 1B2KA 1L64A 1LSNA 1CJ9A 4BS7A 4R6CA 1L26A 2DQDY 1L83A 5KXKA 3G3VA 3HTDA 3DN3A 3N9EA 181LA 1JPOA 1LSYA 4IATA 2MEEA 2BQLA 1AT6A 165LA 4H9FA 3RT5X 1UCOA 3CDVA 1QSQA 1QT8A 4DDBA 1ZURA 2OTYX 229LA 1LHLA 1BQLY 3NYAA 5I54A 3GUNA 1L18A 2ZYCA 4OWEA 1L0KA 222LA 3HUQA 5LVKA 1VAUA 3EMLA 4G4CA 5KKIA 1REYA 1SWZA 1FLYA 4PPOA 1RCMA 4H93A 4ML7A 3V2YA 1LGWA 4EPIA 4Z41A 5KJ9A 1JJ1A 1HFXA 257LA 1N4FA 3SBBC 1LYSA 4Z46A 3BKHA 3WUNA 1D0MA 4GLAA 2DQCY 2BLYA 4W57A 4AQNA 2YBHA 3ATOA 1NBYC 2LHMA 4NHQA 180LA 4OWHA 4BAFA 3WW5A 4NWHA 2BQBA 5HMVA 4E3UA 3HWLA 3IJUA 2BQIA 1HMLA 172LA 1B5UA 1D3FA 1ZV5L 4WG7A 1C6FA 3P68A 2MEFA 1LJFA 1CKHA 2DQAA 1OP9B 4B49A 1QUTA 3DN1A 4YXAC 1G7MC 1LI2A 1LZYA 174LA 2HEEA 4WM4A 4E97A 4I7NA 3TMVA 4ARQA 3V2WA 104LA 2G4PA 3FI5A 1C61A 2BAAA 1DKKA 5I53A 4YXCA 132LA 4J1AA 1G7JC 1IX0A 4W94A 1L10A 4ETDA 3W6AA 5DM9A 2BQEA 5IELA 1GXV2 1FKVA 3LZTA 219LA 248LA 1L32A 4M4OA 4B4IA 1L22A 1GB2A 2ZWBA 4LZMA 2Z6BA 1GFJA 128LA 148LE 145LA 228LA 1B5WA 3D9AC 4C3WA 4I7KA 1DPWA 1GE4A 4PJ2C 3DN6A 1WQQA 1IP6A 1L35A 1DI4A 1YILA 1YIKA 4NWEA 197LA 163LA 3SP3A 4EJ4A 4H8ZA 1CV4A 5HQ1A 4ET8A 3AW7A 2Z39A 1JTTL 149LA 1L89A 3JR6A 4DQJA 2BQKA 1DYEA 2OTZX 4HTQA 3TXDA 1BB7A 3HUAA 1UUZC 5FHWA 4G4BA 131LA 1QT4A 3A67Y 1L34A 1L74A 1SWYA 1LHKA 5KXOA 2MECA 133LA 4WO6A 5L3HA 1B5ZA 1QT6A 4I8SA 1QQYA 3ZVQB 4YOPA 4NSHA 1GEVA 1JHLA 1JIYA 1YAQA 1UBZA 1CU0A 3DMXA 4BAPA 1L88A 1FLWA 4RDSA 1L52A 1JTNA 1L79A 4J0LA 1J1XY 3W6FA 156LA 243LA 4RW2A 4NGIA 1QSBA 1AZFA 2B74A 1LMQA 3SB5A 1CV5A 1CNSA 1GFKA 246LA 4TUNA 2FYDA 1GD6A 2QARC 3HFMY 1IVMA 4LDEA 4ZEEA 2Z37A 1L53A 1I1ZA 1DYBA 3A6CY 4DKLA 5C6IA 4PJZA 3NY9A 2BQFA 1YL0X 189LA 1LSDA 1LJHA 3A8ZA 4NGVA 4R0FA 1XGRC 2OE9X 1T8FA 1A2YC 2ZNWY 1CUQA 1C6KA 2BPUA 4M6DA 1LJJA 3WULA 1IP4A 220LA 1QDTA 4LT3A 3A95A 1IORA 1T3PA 1GF3A 1GB0A 1PQJA 1LCNA 1LYJA 217LA 2EIZC 1JISA 2OU9A 5FEKA 4I7OA 259LA 1V7SA 5KXNA 4W96A 1XGTC 1GFHA 1UC0A 1L94A 1I6SA 5LA8A 4GCDA 4LGKA 3C7YA 3CDQA 2MEAA 1IEEA 242LA 2NTGA 1CKFA 1L06A 5AMYA 1LZAA 1JSFA 1L84A 2BQJA 3WU9A 5KXZA 3B0KA 4W52A 1G0LA 1PQDA 2F32A 3CDOA 4W58A 4GCBA 1L45A 1GBSA 2B73A 2FBBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1FLU A;  4ARL A;  1UA6 Y;  1T97 A;  4LT0 A;  1C6C A;  256L A;  1AM7 A;  1JKC A;  1CX6 A;  262L A;  3GXR A;  2YBI A;  1TEW A;  175L A;  143L A;  1QSA A;  3OE6 A;  5D5F A;  4YEO A;  1L12 A;  1L24 A;  4NGY A;  1OQM A;  247L A;  1HSW A;  5LYT A;  1QUO A;  2RB0 X;  125L A;  5APD A;  1LZ8 A;  5LVJ A;  1L25 A;  1IIZ A;  2RBQ A;  4ANR A;  4IJ4 A;  4RW1 A;  4H90 A;  160L A;  5J7C A;  1XJT A;  1LOZ A;  1L65 A;  1OUJ A;  1LYZ A;  1NBZ C;  1I20 A;  3OJP A;  4DQ7 A;  3A34 A;  4LYB A;  2OEA X;  1WQM A;  3WL2 A;  1CTW A;  5KXY A;  1IP1 A;  1QSW A;  5FST A;  1CU5 A;  3GUK A;  2Q9E A;  199L A;  1L95 A;  1AT5 A;  1LJK A;  5KXW A;  1WVV A;  3C7Z A;  1KIP C;  1L33 A;  4RLN A;  194L A;  1NMM A;  1L80 A;  4I7M A;  1LSM A;  111L A;  4H9H A;  2D4K A;  1NHE A;  1GHL A;  2HEF A;  5I14 A;  2ZYP A;  1C6P A;  4ARM A;  4NHP A;  4CJ2 A;  1GB7 A;  3A92 A;  4WG1 A;  4H9I A;  1GE2 A;  1IC4 Y;  1OVH A;  1G07 A;  2IHL A;  4WL7 A;  137L A;  146L A;  3IWR A;  1GDX A;  5LA5 A;  2ZNX Y;  2MEB A;  1CV1 A;  1K28 A;  1HSX A;  1LKR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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