1CX7A

T4 lysozyme methionine core mutant
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKMKPVYDSMDAVRRAAMINMVFQMGETGVAGFTNSMRMMQQKRWDEAAVNMAKSRWYNQTPNRAKRVITTMRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Use of differentially substituted selenomethionine proteins in X-ray structure determination.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1cx7A00
1DYDA 1L03A 2RH1A 3GUPA 3C82A 1LI3A 262LA 252LA 3OE6A 1LYGA 2CUUA 1T8FA 4I7RA 1QTCA 2F2QA 1C6NA 2OE7X 2F32A 3C8RA 4AQNA 1L88A 1L04A 171LA 1C65A 251LA 108LA 1PQJA 2Q9EA 2B6TA 4PJZA 2ANXA 1L43A 1LWGA 1WTHA 1C66A 2LC9A 1CV0A 255LA 3OE0A 128LA 199LA 1C64A 151LA 1C68A 219LA 1L57A 1OWYA 1CX7A 1L54A 1C6PA 2QB0B 1C6HA 3CDRA 123LA 126LA 4LDEA 3C7WA 3GUIA 1L05A 244LA 180LA 1L34A 1L56A 1L65A 103LA 1L90A 1C60A 1L07A 1G1VA 234LA 1K28A 1L50A 1G0KA 1L48A 241LA 3SBAA 3SB8A 206LA 185LA 1QT4A 131LA 2OU0X 232LA 3NY8A 1I6SA 218LA 1DYGA 1L82A 2HULA 237LA 1D3NA 1L68A 1KNIA 3RUNA 227LA 3HT7A 1L61A 4EKRA 1LYJA 1L53A 1OVHA 3CDQA 1L47A 3FA0A 1PQKA 225LA 7LZMA 115LA 1L74A 1C6QA 3SB9A 2OE4X 2RBNA 191LA 1JTNA 1OV7A 3DN3A 125LA 2QARC 1KW5A 1L12A 2F47A 1SWZA 1L13A 1L96A 2O7AA 1QUDA 4YX7C 149LA 1D3MA 1L85A 205LA 1LLHA 4ZPUA 3HUKA 1L09A 2RB2X 1L21A 248LA 211LA 3SB5A 1L20A 155LA 1L51A 2L78A 1CX6A 1L11A 4EJ4A 1L75A 3RZEA 1OYUA 1P36A 1C6DA 112LA 220LA 189LA 1L01A 2B72A 104LA 1QT3A 1L99A 1P37A 1C69A 169LA 1L33A 253LA 145LA 1L49A 3HTGA 1CU0A 3HU9A 1NHBA 213LA 1L64A 1L55A 1SX2A 1P6YA 1L30A 242LA 150LA 1PQIA 4I7PA 2HUMA 1L24A 1CUQA 148LE 1LYEA 1L89A 4W57A 1OVKA 1LGUA 2OU9A 4ARPA 3HH5A 3F9LA 3HTFA 1EPYA 1L98A 158LA 177LA 1L86A 3HTDA 1G1WA 4I7LA 3HDFA 1L31A 3JR6A 1DYEA 114LA 147LA 231LA 233LA 3K2RA 4ARQB 229LA 164LA 256LA 3DMXA 1G0LA 118LA 239LA 3DN1A 1QT6A 165LA 1KY1A 1CV1A 146LA 1D3FA 1QT5A 3ODUA 1QTDA 130LA 2RBSA 1G0MA 4LDLA 5I14A 1CV4A 3QAKA 163LA 1TLAA 2B73A 1L93A 3HT9A 3OE9A 1CU5A 2O4WA 1L22A 190LA 3HDEA 2RBRA 3DN4A 1DYFA 1P2RA 1L19A 102LA 1LYFA 1ZURA 1CVKA 1L87A 1P56A 1QSBA 1KS3A 1L35A 1L41A 217LA 2A4TA 2IGCA 3SBBC 1L23A 196LA 1L0KA 2HUKA 1DYCA 1QS5A 1LYHA 137LA 1L26A 1QUOA 168LA 4W54A 214LA 1G0PA 1LGXA 1OWZA 1P64A 3C7YA 138LA 1D2YA 119LA 1L00A 1L08A 3F8VA 4EPFA 159LA 3G3VA 4W53A 4YXCA 2ANVA 1QT8A 2OEAX 4EXMA 1C6IA 224LA 258LA 4I7NA 144LA 1ZWNA 1L59A 1CU6A 1L18A 1LGWA 3GUNA 4OO9A 141LA 160LA 3DN0A 4DAJA 240LA 3GUMA 1SSWA 3DKEX 4I7JA 3GUKA 139LA 1C63A 200LA 4W55A 3C8SA 142LA 113LA 1L70A 1C67A 184LA 1L46A 1L94A 173LA 4I7TA 1XJUA 6LZMA 2B6YA 178LA 3HT8A 1QTZA 1QTHA 254LA 3CDTA 2LCBA 1T8GA 4ARMB 3PBLA 1L84A 197LA 156LA 1P3NA 1L16A 1CU3A 1L60A 157LA 1C6LA 176LA 3C80A 250LA 3VW7A 187LA 1T97A 5LZMA 188LA 2RAYX 1QS9A 3GULA 1D3JA 1P7SA 3HH6A 4YXAC 1C6JA 2B6WA 107LA 3HWLA 3C81A 2B7XA 1L44A 1LW9A 1QUGA 1L39A 1L52A 1CTWA 1CU2A 4ARJA 1KW7A 110LA 1LYIA 2B70A 4GRVA 1LI2A 172LA 1G0GA 215LA 4DJHA 1D9WA 1L15A 3DNAA 3NYAA 2Q9DA 3DN8A 2B74A 1L42A 3EMLA 4EPIA 3V2WA 1L32A 246LA 129LA 3CDOA 3UONA 1PQDA 1L37A 245LA 260LA 4EKSA 1L95A 201LA 122LA 1XEPA 1G07A 1L83A 127LA 174LA 1CV3A 1C6MA 1CUPA 1LWKA 1C61A 3D4SA 175LA 3HT6A 4S0WA 1L81A 1P5CA 1L40A 4GBRB 247LA 216LA 1B6IA 3OE8A 1CV6A 162LA 1L14A 1L67A 1C6EA 109LA 1ZYTA 4W51A 2OTZX 238LA 195LA 1L29A 3DMZA 2RBOA 1L63A 4LDOA 4LZMA 1L06A 3FADA 4I7SA 3C8QA 1D2WA 4I7OA 120LA 1T8AA 249LA 3HU8A 167LA 3PDSA 1L38A 161LA 4I7QA 1C6GA 1PQOA 1L69A 3C83A 4I7MA 181LA 1CV5A 1SSYA 1PQMA 1QSQA 3G3WA 3SB6A 1L58A 4ARQA 1DYAA 1T6HA 1G0QA 1L76A 209LA 3DN6A 1P46A 140LA 1L0JA 2O79A 1L02A 221LA 170LA 3HUAA 212LA 1L66A 1L77A 1L79A 4PK0A 2LZMA 3L64A 226LA 1L71A 2OE9X 198LA 1L91A 2B6ZA 3FI5A 4EKQA 1L62A 1C6CA 2OTYX 261LA 1L97A 3NY9A 1OV5A 1C62A 1L25A 2B6XA 1L73A 2NTHA 1L80A 222LA 2OU8A 1L92A 3L2XA 182LA 1L27A 1SX7A 4W59A 4I7KA 223LA 1QUHA 1L72A 3GUOA 2RAZX 192LA 1L28A 3SN6R 1G0JA 1QTVA 3DN2A 1LI6A 259LA 2RBPA 186LA 166LA 3DMVA 4W56A 1QT7A 2RB0X 1C6BA 1L17A 1OVJA 4DKLA 1C6KA 1P2LA 2RBQA 152LA 1JQUA 1C6AA 1LYDA 143LA 1L10A 235LA 183LA 236LA 1JTMA 3GUJA 4K5YA 3HH4A 1G06A 2NTGA 4E97A 111LA 4EKPA 2B75A 230LA 1L36A 1C6TA 1C6FA 1L45A 1LPYA 2Z6BA 3LZMA 1XJTA 257LA 1SWYA 210LA 4IAPA 3SB7A 1DYBA 3G3XA 3V2YA 228LA 243LA 3HH3A 4W58A 1QTBA 2RB1X 4ARLA 3CDVA 3C7ZA 3HUQA 4ARMA 3HTBA 4W52A 1KY0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AYQA 1VAUA 4LYCA 1LI3A 262LA 1IEEA 252LA 4I7RA 2F2QA 1KXWA 3A90A 3G3AB 3FE0A 5I4WA 1TEWA 1LSGA 1L88A 1YAQA 1UIBA 108LA 5LVHA 1QSWA 2B6TA 3A96A 1B5UA 1LWGA 5KXZA 4GN3A 4M4OA 1L57A 4J0LA 2QB0B 3CDRA 3GUIA 1WQPA 1KXYA 4HJZA 5B1FA 180LA 3B72A 2D91A 1BVKC 4J7VA 4BAFA 1IOCA 3SB8A 3WW6A 2LHMA 4WM6A 4X3BA 2BQFA 1XGPC 237LA 1JSEA 1D3NA 1L68A 3AGIA 4CFOA 1WQMA 1L53A 1VFBC 1IP7A 5E4PA 3FA0A 1YILA 7LZMA 5IDDA 115LA 1ZV5L 4QEQA 1WTNA 1GB3A 5I54A 1YKYX 3AZ7A 2F47A 1GBYA 2YDGA 4AXTA 4CHXA 5I5QA 2DQHY 2O7AA 1LMNA 4N5RA 2HEBA 1XEIA 1GAZA 4NGLA 1LCNA 1DPXA 4Z41A 4WO9A 1LLHA 3LYTA 211LA 1GBWA 3SB5A 1L20A 4ML7A 5K7OA 3RZEA 2H9KA 4OOOA 1P36A 220LA 1UIHA 5LA8A 4PRQA 4GCCA 5APFA 5I53A 2MEGA 169LA 1JJ1A 2N5ZA 1QUSA 4WL6A 3CT5A 1NDMC 4NHSA 2F2NA 4XJBA 1L24A 3WPKA 1CUQA 1LYEA 1OUHA 1FLWA 1LGUA 2Z2FA 2BQGA 1GB9A 5F9UA 2HEEA 4IJ4A 1G1WA 1IP5A 3JR6A 1LZAA 114LA 147LA 231LA 2Z38A 2YBNA 1LZ8A 4ARQB 1DI3A 1CV1A 1OUAA 1EQ5A 1YL0X 5KXYA 3ODUA 5JENB 5KXKA 2RBSA 3KAMA 5I14A 1TLAA 1C10A 3OE9A 1CU5A 1FLYA 4XJIA 102LA 1LYFA 4NGYA 1CVKA 1LZ1A 2BQJA 4YM8A 2NWDX 1KS3A 217LA 2IGCA 3P68A 3SBBC 196LA 5E9RA 1DYCA 4WL7A 2BAAA 1LSAA 214LA 3BKHA 3OJPA 1LSDA 159LA 1LMTA 4C5FA 2OEAX 224LA 4HV1A 3N9AA 4XJFA 4MCKA 4I7NA 1LYSA 3VWOA 3GUNA 141LA 1SSWA 3DKEX 4I7JA 5KXMA 3GUKA 1C63A 2RSCA 4RLMA 3C8SA 5APEA 5LAFA 4EOFA 5KXPA 3F6ZA 184LA 5LVGA 1J1OY 1L46A 4LYOA 4LT3A 173LA 2B6YA 1LJJA 3HT8A 1QTZA 3CDTA 4Z98A 3PBLA 197LA 1HFYA 1CU3A 1LZ9A 4Z46A 250LA 2EQLA 5LZMA 188LA 1C6JA 4NHPA 133LA 107LA 4PJ2C 1L44A 5KXNA 1QUGA 2IFFY 1L39A 2EIZC 3A8ZA 3WXTA 3CT1A 3BKVA 2B70A 4TUNA 1LI2A 2BQAA 172LA 1IWVA 4N8ZA 1D9WA 3DNAA 4TX7A 1AZFA 1XEKA 1OUCA 1XEJA 4II8A 2B74A 3AZ4A 3V2WA 2LYOA 1YL1X 3TXKA 4NGVA 4XYYA 4BS7A 1CKFA 1G07A 1IOTA 127LA 174LA 1TDYA 4HJVA 1NF5A 4G9SA 3W6FA 1GBOA 4GBRB 3TMUA 135LA 5B59A 1UCOA 4EMNA 1L14A 5HMJA 4H90A 109LA 2OTZX 4H9HA 4LT2A 3FADA 1HFXA 1D2WA 1LZ6A 4NSGA 4QDNA 2IHLA 1T8AA 4DQ5A 2W1YA 3WYHA 5J7CA 3W6DA 1HF4A 2CWIA 1JEFA 1B7QA 5IHGA 4I7MA 4ET8A 1SLYA 1NWGA 1UIEA 1JKCA 1DYAA 1CJ6A 1YQVY 4GN5C 4NGIA 1L76A 1CKDA 5FCPA 5LA5A 3HUAA 1RE2A 1LSCA 1LOZA 1GFEA 2BQBA 3LHMA 3L64A 1L91A 1LSMA 1GBSA 3FI5A 3WUAA 1L62A 1IY3A 2OTYX 3NY9A 3TXEA 2ZIJA 1BB3A 2OU8A 1A4VA 1SX7A 1LZNA 1LZ4A 134LA 4WM1A 4H8ZA 1C43A 259LA 186LA 1QT7A 1L17A 4HSFA 5D5FA 1JQUA 4G4CA 4ETEA 2X0AA 236LA 1JTMA 1IO5A 4RW2A 2G4NA 4NSIA 3HH4A 2NTGA 2Z39A 4EKPA 1VDPA 1L36A 4LYZA 1DPWA 2Z6BA 3LZMA 257LA 1XJTA 1EQ4A 1VDTA 210LA 4IAPA 2CJLA 3V2YA 1HHLA 4ARLA 5ILFA 4ARMA 4W52A 3GUPA 4NGOA 5FHWA 3C82A 3OE6A 2CUUA 1QTCA 2F32A 5HMVA 2W1XA 1HERA 3CB7A 1C65A 5D5CA 3T6UA 3CSZA 1LYZA 1CJ8A 4GCFA 2YBHA 4H9IA 1C66A 2LC9A 255LA 1C64A 151LA 4GN4A 1IIZA 1G7IC 1LJFA 4H9AA 3TXIA 1D9UA 4KL7A 3AGHA 4R0FA 5HNCA 244LA 2I26L 2BQHA 4WO6A 1HEPA 1L56A 1IP1A 1G1VA 1L50A 1HEOA 4LT1A 1GF5A 185LA 1XGTC 2FYCA 232LA 2HEAA 2HULA 1NMMA 3LYMA 3RUNA 1KNIA 5FEKA 1UIAA 4EKRA 5KKIA 1BGIA 225LA 1L74A 4NGWA 4H91A 1C6QA 3TMVA 4IASA 125LA 2QARC 3EXDA 1HSXA 1GFGA 4H9BA 1RI8B 149LA 4AGAA 4DD3A 1LHMA 205LA 1YKZX 2EKSC 3HUKA 2YBLA 1L21A 248LA 1GE2A 1WVUA 1L51A 1CX6A 1L11A 5LVIA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3AYQ A;  1VAU A;  4LYC A;  1LI3 A;  262L A;  1IEE A;  252L A;  4I7R A;  2F2Q A;  1KXW A;  3A90 A;  3G3A B;  3FE0 A;  5I4W A;  1TEW A;  1LSG A;  1L88 A;  1YAQ A;  1UIB A;  108L A;  5LVH A;  1QSW A;  2B6T A;  3A96 A;  1B5U A;  1LWG A;  5KXZ A;  4GN3 A;  4M4O A;  1L57 A;  4J0L A;  2QB0 B;  3CDR A;  3GUI A;  1WQP A;  1KXY A;  4HJZ A;  5B1F A;  180L A;  3B72 A;  2D91 A;  1BVK C;  4J7V A;  4BAF A;  1IOC A;  3SB8 A;  3WW6 A;  2LHM A;  4WM6 A;  4X3B A;  2BQF A;  1XGP C;  237L A;  1JSE A;  1D3N A;  1L68 A;  3AGI A;  4CFO A;  1WQM A;  1L53 A;  1VFB C;  1IP7 A;  5E4P A;  3FA0 A;  1YIL A;  7LZM A;  5IDD A;  115L A;  1ZV5 L;  4QEQ A;  1WTN A;  1GB3 A;  5I54 A;  1YKY X;  3AZ7 A;  2F47 A;  1GBY A;  2YDG A;  4AXT A;  4CHX A;  5I5Q A;  2DQH Y;  2O7A A;  1LMN A;  4N5R A;  2HEB A;  1XEI A;  1GAZ A;  4NGL A;  1LCN A;  1DPX A;  4Z41 A;  4WO9 A;  1LLH A;  3LYT A;  211L A;  1GBW A;  3SB5 A;  1L20 A;  4ML7 A;  5K7O A;  3RZE A;  2H9K A;  4OOO A;  1P36 A;  220L A;  1UIH A;  5LA8 A;  4PRQ A;  4GCC A;  5APF A;  5I53 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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