1CX7A

T4 lysozyme methionine core mutant
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKMKPVYDSMDAVRRAAMINMVFQMGETGVAGFTNSMRMMQQKRWDEAAVNMAKSRWYNQTPNRAKRVITTMRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Use of differentially substituted selenomethionine proteins in X-ray structure determination.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1cx7A00
4LZMA 4YXCA 4I7SA 1LGWA 1OV5A 260LA 225LA 176LA 4W58A 1L98A 3SB8A 2RBOA 4I7OA 4I7JA 1QTDA 118LA 1L66A 2RAYX 197LA 1L99A 1QS9A 257LA 237LA 244LA 1LI6A 3HH3A 115LA 4LDEA 4W59A 4EKQA 1L55A 1L73A 1G0LA 1L00A 3DN4A 4GRVA 2RBQA 1DYFA 1QTCA 1L61A 217LA 1KS3A 1I6SA 139LA 3PBLA 3C81A 1B6IA 222LA 4W54A 1ZWNA 1TLAA 1P36A 1C6GA 4ARQA 210LA 3CDQA 3OE6A 1L45A 1L10A 1LI3A 1QTBA 1QT8A 2RBNA 4ZPUA 4YX7C 1C6EA 1QUHA 261LA 3HDFA 218LA 1QS5A 1L0JA 191LA 1QTHA 3CDVA 195LA 4ARJA 2NTGA 4W56A 3F8VA 1SX7A 3C8RA 145LA 1L27A 1L75A 4I7PA 1OVKA 1C6TA 4EKRA 1C64A 1CUQA 1SX2A 7LZMA 1L96A 1L21A 1LYGA 3DNAA 3UONA 131LA 1L31A 2RBPA 119LA 3QAKA 1DYCA 241LA 1CV5A 213LA 148LE 3C8QA 3C7WA 219LA 3DMZA 2B6ZA 188LA 1G0QA 152LA 3K2RA 4I7RA 147LA 4YXAC 156LA 4AQNA 1L62A 113LA 1L69A 2RB2X 3C80A 1L43A 168LA 1LYFA 160LA 1QTZA 3SN6R 214LA 3PDSA 3HDEA 1DYAA 1L0KA 112LA 1JQUA 2B74A 1L12A 1L18A 3HUQA 2RAZX 4PJZA 4OO9A 4W53A 4I7QA 1CU5A 1L50A 3OE8A 1C62A 1T8GA 4I7TA 1L59A 1OWYA 3NY8A 3HH6A 200LA 138LA 140LA 4DKLA 1PQIA 2OE4X 175LA 1D3MA 2O7AA 1L49A 1DYGA 2Z6BA 1QT7A 3SBBC 3SB6A 1L76A 1C6PA 166LA 1L05A 1L36A 3HH5A 1G06A 1G0GA 1LW9A 4DAJA 1C63A 1L82A 2RB1X 1CV3A 3HTDA 198LA 240LA 1L84A 1XEPA 3NY9A 2NTHA 2B72A 163LA 1C6IA 104LA 102LA 2B70A 1L54A 1ZURA 242LA 2O4WA 189LA 1L85A 3GUMA 1LYHA 3SB9A 1G1WA 1L01A 2B6TA 2OE7X 1LYJA 173LA 1CU6A 3HH4A 3HWLA 123LA 4DJHA 231LA 249LA 2OU8A 1L40A 1QSBA 1L22A 5I14A 1LGXA 223LA 1L72A 216LA 1QT5A 1OVJA 1L25A 1L58A 1CU2A 256LA 2HUMA 171LA 127LA 126LA 162LA 1LI2A 1LYDA 229LA 2HUKA 3VW7A 1P5CA 1L56A 1L48A 220LA 1CX7A 3HUKA 1T6HA 3GUIA 4EJ4A 1SSWA 4W55A 1C6FA 245LA 1D2WA 1D3JA 4GBRB 1L08A 3DN8A 1KW5A 1L97A 2RH1A 180LA 1KNIA 254LA 1L89A 3OE9A 3HT7A 243LA 1L46A 1LPYA 1D3FA 233LA 120LA 1L67A 1CX6A 1L68A 3C7YA 3DN6A 1LYIA 1T8FA 1L37A 1L32A 209LA 164LA 3EMLA 1C6LA 1D9WA 3RUNA 2Q9DA 1L65A 1L38A 2RBRA 1L14A 3HTBA 130LA 186LA 1CU0A 3CDTA 205LA 3GULA 4W51A 4EPIA 1G0MA 2RB0X 1OYUA 4ARLA 1C65A 167LA 192LA 247LA 1L60A 1L41A 2O79A 114LA 108LA 3DN0A 169LA 1PQJA 1SWYA 1C6KA 2B75A 3CDRA 1G0PA 184LA 3G3VA 3GUOA 3HT8A 1CTWA 1CV6A 1L15A 1ZYTA 2F47A 1P56A 2CUUA 1CU3A 3DMVA 4ARMB 1L19A 3SB7A 1WTHA 1L06A 1JTMA 1L16A 3OE0A 161LA 144LA 103LA 109LA 3FI5A 1CVKA 1C6AA 1LWGA 3L2XA 252LA 1L79A 3HT6A 2OEAX 1PQOA 1L94A 228LA 1L95A 255LA 1QUOA 137LA 230LA 3G3XA 1L53A 141LA 155LA 1L04A 2LZMA 3HTGA 1L35A 1P3NA 3C83A 1L24A 3G3WA 201LA 248LA 3D4SA 246LA 224LA 1G0KA 3NYAA 1L07A 221LA 1L87A 259LA 1L83A 6LZMA 1G1VA 227LA 4ARMA 2LCBA 2B73A 1L34A 3HUAA 4I7NA 1P7SA 1L33A 1K28A 1C61A 1EPYA 1L90A 1T8AA 2OTYX 3DKEX 1L02A 1L29A 1C6JA 250LA 1SWZA 165LA 1C68A 1C6MA 4EKPA 3GUNA 1QT6A 1QT3A 4S0WA 206LA 1CV4A 1L74A 3SBAA 1C67A 4LDLA 3JR6A 1QSQA 1L51A 1LYEA 3V2YA 182LA 1P6YA 1L39A 1C69A 3CDOA 1L52A 3C82A 146LA 1DYBA 1DYEA 4IAPA 170LA 1L42A 3HTFA 3GUPA 151LA 1L86A 4W57A 1L92A 1L28A 1P64A 3HT9A 1OV7A 239LA 1PQKA 1JTNA 157LA 4LDOA 4PK0A 1C6BA 2IGCA 1L03A 2F2QA 1PQDA 1SSYA 3DN1A 1CUPA 1OVHA 1P46A 4EXMA 110LA 159LA 2OE9X 1L57A 2HULA 1D2YA 158LA 150LA 2ANXA 128LA 1C6NA 1P37A 3DMXA 1C60A 1P2RA 1C6CA 1G0JA 238LA 1P2LA 1OWZA 142LA 1G07A 251LA 1D3NA 212LA 2B6YA 2B6WA 3GUKA 1L80A 235LA 181LA 1LWKA 3GUJA 1L30A 1L81A 3F9LA 149LA 234LA 3LZMA 1KY0A 199LA 3L64A 1L71A 2Q9EA 3FADA 172LA 1QT4A 1C6HA 3C8SA 1L20A 3ODUA 1L64A 3SB5A 1L63A 1CV0A 107LA 1L26A 3DN3A 262LA 129LA 2LC9A 2L78A 125LA 177LA 1L17A 1L23A 3C7ZA 4I7KA 226LA 1XJUA 1L70A 178LA 196LA 2OU9A 4EKSA 1L09A 122LA 190LA 1L11A 3HU8A 3FA0A 1L88A 4I7MA 253LA 1T97A 1KW7A 258LA 1QUDA 1XJTA 2OU0X 232LA 2QARC 1C6QA 187LA 4K5YA 2F32A 3DN2A 3RZEA 111LA 174LA 4EPFA 4ARPA 1DYDA 183LA 2ANVA 236LA 4E97A 1CV1A 185LA 2A4TA 2RBSA 1L91A 215LA 1L44A 2QB0B 211LA 2OTZX 1QUGA 1C6DA 1LLHA 4I7LA 1QTVA 1L77A 1NHBA 3V2WA 1L47A 5LZMA 1KY1A 1LGUA 1L13A 2B6XA 4ARQB 4W52A 1PQMA 1C66A 3HU9A 143LA 2B7XA 1L93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LZMA 4E3UA 3EO5A 1QSWA 1C43A 2RBOA 4I7OA 1YKZX 2RAYX 2BQIA 3A91A 237LA 1BHZA 244LA 1F0WA 3HH3A 1L00A 3DN4A 1QTCA 139LA 3C81A 222LA 4W54A 4HPEA 1INUA 4L41A 1LJIA 3CDQA 1UIBA 1L45A 1L10A 2BLYA 1QTBA 2MEBA 1GAZA 3M18B 1L0JA 1C45A 1JKDA 1LZ6A 1EQ5A 3EMSA 1I20A 1DPWA 4J0LA 1L75A 1OVKA 3N9AA 1N4FA 1C64A 1XGTC 1KXYA 5APDA 4ETCA 3QY4A 4H9AA 4ET8A 3DNAA 3UONA 4Z3MA 131LA 3AW6A 1CV5A 3C8QA 5KXRA 4C3WA 4B4IA 4WM3A 3K2RA 4AQNA 1L69A 4TSCA 3LYMA 2YSSC 3WVYA 4D9ZA 1VDTA 1IWXA 1L43A 5FDJA 1DZBX 3TXFA 1GXXA 1QTZA 3A93A 3ZVQA 214LA 2X0AA 112LA 2XJWA 5KXLA 4NSGA 4OO9A 4W53A 3OE8A 2MEIA 1T8GA 4I7TA 1WTMA 3NY8A 138LA 1PQIA 1LJ4A 1DYGA 4J1AA 5KXSA 4ETEA 3SB6A 1L76A 1LZYA 166LA 1L36A 1LYYA 4II8A 3W6AA 1G0GA 4NGJA 3TXKA 1C63A 240LA 1IWVA 2BQMA 1LSCA 3WXTA 1LKRA 1IP3A 104LA 2B70A 1L54A 3GUMA 3SB9A 1YIKA 4CGEA 1IP6A 2B6TA 1P2CC 3WU7A 4I0CA 193LA 4WM1A 249LA 4J7VA 2AUBA 1L22A 1LGXA 216LA 1L58A 4IATA 2C8OA 7LYZA 1OUAA 4PRQA 2BQBA 4NG1A 1GB9A 1P5CA 1YQVY 3GUIA 4EJ4A 1HFXA 4W55A 1C6FA 1O23A 1SLYA 1D3JA 1B5VA 4GBRB 4BADA 4B4EA 1WVUA 8LYZA 3AZ4A 1BWHA 1LSZA 4MR1A 2Z2FA 3HT7A 1TBYA 4G49A 5LVGA 3RZ4A 1L67A 1C08C 3C7YA 5K7OA 4NGWA 3EMLA 3SP3A 1REZA 5L9JA 4R0FA 4YENA 2Q9DA 4GLAA 4NGIA 2ZYCA 3RU5A 1G0MA 1KXWA 1IC4Y 1L60A 1L41A 2O79A 114LA 3DN0A 1B5UA 4YF2A 3AJNA 5FELA 1GFRA 2ZYPA 1GDWA 184LA 1YAQA 1JJ1A 1LHHA 1F10A 1UICA 3G3VA 4J1BA 3GUOA 3HT8A 207LA 1IP7A 1B7QA 4BS7A 1ZYTA 3DMVA 1CU3A 3AZ5A 2F30A 3OE0A 1IEEA 3GXKA 1GB8A 1DPXA 109LA 1IR7A 2Z18A 3L2XA 1L79A 1LJGA 3HT6A 2D4JA 3RT5X 228LA 1L95A 4Z46A 3OJPA 230LA 141LA 4NGKA 1L04A 1HERA 1JUGA 3HBHA 1VAUA 1OUDA 246LA 1CNSA 1QTEA 1L83A 1G1VA 1GBOA 2LZ2A 3B0OA 1L34A 1P7SA 4RLNA 1K28A 4ZFPA 1EPYA 1L90A 1UC0A 1KXXA 2OTYX 2BQHA 250LA 4PJ2C 2Z19A 4NGLA 1SWZA 2G4QA 3WPKA 1QT6A 1GF6A 5F81A 1HEPA 5KXTA 2W1YA 1BWJA 1HELA 1L74A 1LPIA 3SBAA 4TSBA 1AT5A 2MEGA 1L51A 1LYEA 1VEDA 3V2YA 1HSXA 4WLXA 4GN3A 146LA 1IP1A 1L42A 3GUPA 1L86A 3AGGG 1L28A 3HT9A 239LA 157LA 2IGCA 1UIGA 1PQDA 4C5FA 110LA 2H9JA 2YBMA 4ET9A 4NWEA 1HEOA 2B5ZA 1GF4A 5HQ1A 1P37A 1IOCA 3DMXA 1GD6A 4YEOA 1C6CA 4MCKA 1B2KA 2BQDA 2B6YA 5D5CA 1DI3A 1JHLA 1HEMA 1JTTL 194LA 1VDPA 3W6BA 1L30A 1LYOA 149LA 1B7OA 3TMUA 199LA 2ZIJA 4N0JA 1C6HA 2IFFY 5I4XA 2D4IA 3ULRA 3SB5A 4NHIA 3LZTA 1CV0A 1UA6Y 1IWTA 2LYZA 125LA 1GB7A 1F6RA 1L17A 4NWHA 226LA 178LA 132LA 4H1PA 1L09A 3A8ZA 4NHPA 1L11A 3HU8A 4NHQA 1L88A 253LA 4O34A 258LA 1XJTA 4K5YA 2I25L 111LA 174LA 1H87A 2FYCA 1CKGA 236LA 2A4TA 1L44A 1GBZA 211LA 1C6DA 2HEEA 1L47A 3A96A 2FYDA 3W6DA 1GFTA 1LGUA 2B6XA 4ARQB 1PQMA 3HU9A 1YAOA 2N5ZA 4LYMA 4H9IA 1L93A 4AGAA 4YXCA 4I7SA 2BQJA 260LA 5JENB 4W58A 2HTXA 5B06A 1L98A 4LYBA 1QTDA 1FDLY 3F6ZA 4N8ZA 1J1OY 115LA 4WLDA 5LYZA 1LZGA 4W59A 4EKQA 1L55A 1G0LA 2RBQA 1DYFA 1G7JC 1WVVA 2ZILA 5LA5A 3PBLA 1B6IA 4LT2A 2HUBA 1HEWA 210LA 4PRUA 1LSGA 2DQIY 3OE6A 1REMA 4XJBA 2RBNA 1QUHA 261LA 218LA 5LIOA 3CQLA 2HEFA 1QTHA 3CDVA 195LA 1B7PA 4ARJA 2DQFC 4W56A 3C8RA 145LA 1B7LA 2VB1A 4EKRA 4H9HA 1HHLA 7LZMA 1L96A 1L21A 1BQLY 2HEAA 5KXMA 3TXBA 4G4BA 1IVMA 4M4OA 1RCMA 3QAKA 1YKXX 2C8PA 213LA 2XTHA 148LE 1A4VA 3DMZA 188LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4LZM A;  4E3U A;  3EO5 A;  1QSW A;  1C43 A;  2RBO A;  4I7O A;  1YKZ X;  2RAY X;  2BQI A;  3A91 A;  237L A;  1BHZ A;  244L A;  1F0W A;  3HH3 A;  1L00 A;  3DN4 A;  1QTC A;  139L A;  3C81 A;  222L A;  4W54 A;  4HPE A;  1INU A;  4L41 A;  1LJI A;  3CDQ A;  1UIB A;  1L45 A;  1L10 A;  2BLY A;  1QTB A;  2MEB A;  1GAZ A;  3M18 B;  1L0J A;  1C45 A;  1JKD A;  1LZ6 A;  1EQ5 A;  3EMS A;  1I20 A;  1DPW A;  4J0L A;  1L75 A;  1OVK A;  3N9A A;  1N4F A;  1C64 A;  1XGT C;  1KXY A;  5APD A;  4ETC A;  3QY4 A;  4H9A A;  4ET8 A;  3DNA A;  3UON A;  4Z3M A;  131L A;  3AW6 A;  1CV5 A;  3C8Q A;  5KXR A;  4C3W A;  4B4I A;  4WM3 A;  3K2R A;  4AQN A;  1L69 A;  4TSC A;  3LYM A;  2YSS C;  3WVY A;  4D9Z A;  1VDT A;  1IWX A;  1L43 A;  5FDJ A;  1DZB X;  3TXF A;  1GXX A;  1QTZ A;  3A93 A;  3ZVQ A;  214L A;  2X0A A;  112L A;  2XJW A;  5KXL A;  4NSG A;  4OO9 A;  4W53 A;  3OE8 A;  2MEI A;  1T8G A;  4I7T A;  1WTM A;  3NY8 A;  138L A;  1PQI A;  1LJ4 A;  1DYG A;  4J1A A;  5KXS A;  4ETE A;  3SB6 A;  1L76 A;  1LZY A;  166L A;  1L36 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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