1DCAA

Structure of an engineered metal binding site in human carbonic anhydrase ii reveals the architecture of a regulatory cysteine switch
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLCTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structure of an engineered His3Cys zinc binding site in human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1dcaA00
1HUGA 4QJ0A 2POUA 3T83A 3M2YA 3MHIA 3IEOA 4K1QA 3DV7A 3OIKA 1I9OA 5EIJA 4Q90A 3M96A 1ZFQA 4YGNA 4WW6A 5DSRA 3OY0A 5SZ3A 3V3IB 3N4BA 1FSQA 4QSIA 3HKNA 1BNUA 1UGAA 2AW1A 2POVA 3U3AX 5AMGA 3QYKA 3SBHA 3PO6A 4Q06A 5G0CA 4Q99A 4FRCA 1EOUA 2CABA 4HEZA 1IF8A 4YXIA 1ZSAA 5DRSA 1CIMA 1HCBA 4Z1JA 3U7CA 4Q07A 5EHEA 1ZE8A 3SAPA 5DSNA 5FNMA 3DAZA 5JGTB 2OSMA 1V9EA 3MYQA 4E49A 3IBIA 5CJFA 4YGKA 1CA2A 2NNGA 3T5ZA 1BN1A 1CNIA 1TEUX 3KONA 5FLSA 2OSFA 2WEGA 5FNIA 3BETA 1AZMA 3N0NA 1KWRA 4Q08A 1LG6A 4QJMA 1CNBA 4QY3A 4YXOA 5DOGA 4Q7PA 4Y0JA 2CA2A 3V5GA 3OKUA 1CNKA 3IAIA 4Z1KA 4E4AA 5G01A 3TVNX 5FL5A 1HECA 3M2ZA 4XE1A 2NNSA 1J9WA 3W6HA 3IGPA 1UGGA 3JXHC 1G53A 3CZVA 1TTMA 4BCWA 3S71B 4COQA 3S73B 4MDLA 4PYXA 2X7SA 3MHLA 2NWOA 5AMDA 1UGBA 3HKTA 5A25A 5SZ0A 5BRUA 1I9PA 3MWOA 3Q31A 1LGDA 3MHMA 3DC3A 1MOOA 3LXEA 1IF7A 5FLTA 2NMXA 5DSOA 4Q7WA 4PXXA 1CAMA 3D8WA 3U45X 3MNKA 1CNXA 1OKNA 1RAYA 5EH5A 2GEHA 3NJ9A 3DD8A 3KS3A 3EFTA 2NN7A 4M2UA 4CQ0A 1BNVA 2NXTA 4YHAA 1TBTX 1OKLA 4IDRX 1OKMA 4MDGA 5FNGA 1YO2A 1CZMA 1G4OA 1DCBA 1TE3X 5E2RA 2NXSA 3W6IA 2H4NA 4ZWXA 2QO8A 1BZMA 3M5EA 4M2WA 5FNHA 5DSIA 1CANA 5BNLA 1MUAA 3DCCA 3RJ7A 5E28A 3MNIA 4Q83A 1DCAA 4MLTA 4ILXA 2ZNCA 1CVBA 2ILIA 4BF6A 3HS4A 3V3FA 5SZ6A 3RZ5A 4L5VA 5E2NA 1CAKA 4WW8A 3UYQA 1BNNA 1CCSA 3DCSA 4YYTA 1Z93A 1AM6A 4GL1X 3RZ7A 5DSPA 3OYQA 1JD0A 4KAPA 1I9LA 4CNRA 1FQNA 4XIWA 1T9NA 1BNMA 3IBNA 1FSNA 4YX4A 2AX2A 5A6HA 5EKJA 1KOPA 5JQTA 1I9MA 1IF5A 4FPTA 3MDZA 3SAXA 4QEFA 4JSSA 3M3XA 2CBBA 4ZWIA 1CVAA 2NNVA 4TWMA 4TWLA 3IBLA 3KOKA 1XQ0A 1F2WA 4QIZA 1A42A 3CAJA 4LHIA 1ZSBA 4PQ7A 5HPJA 5EKHA 3HKUA 3P55A 4HT0A 1CNHA 2NXRA 2NWPA 4QK3A 4KNJA 4CACA 1TG3A 1BNWA 4FL7A 4Q49A 1ZSCA 1BNTA 3T82A 2FOUA 2FOVA 3P5AA 2ABEA 5DOHA 1G6VA 4RUZA 5EKMA 3RZ8A 2WEJA 1Z9YA 2FMGA 3RLDA 2WD2A 3B1BA 3M1JA 5DSKA 3MMFA 5FLPA 4R5BA 1CAIA 2CBAA 3P5LA 2HNCA 1G0EA 1LUGA 3RG3A 1UGDA 1KWQA 3EFIA 1URTA 5SZ2A 3MNJA 4CNWA 2FNNA 4R59A 1HVAA 3V3JA 2NWYA 1BV3A 4MDMA 2H15A 3N2PA 4FU5A 5FLQA 1H9QA 5C8IA 3ZP9A 1LG5A 3D9ZA 4YGJA 2HFWA 2WEOA 2QOAA 3C7PA 9CA2A 5JG5B 1H9NA 2FW4A 3RYZA 4Q6EA 1XPZA 3MHOA 3KKXA 3MNUA 4N16A 4BF1A 2Q1QA 1CAYA 3F7UA 3S78B 1OQ5A 5EHWA 3NB5A 1TH9A 4CA2A 5BYIA 2NN1A 4YVYA 1CVFA 2HKKA 4KNIA 1CRAA 1I9NA 3SBIA 4RFCA 4QJPA 1XEVA 1FSRA 2GD8A 3RYJB 5CA2A 3M1KA 1FLJA 1TG9A 3K34A 4JSWA 4QSJA 3F7BA 5FDIA 2HL4A 3MNAA 3S77B 3F8EA 5DVXA 2FNKA 4Q7SA 3T85A 4QJXA 4YGLA 4JSAA 4QK1A 5SZ7A 3DA2A 3HFPA 4KUWA 3PYKA 3KIGA 4L5WA 5LMDA 3S75B 4C3TA 1I90A 2EZ7A 1G1DA 1FQRA 5AMLA 4WR7A 3M14A 3V3GB 1IF4A 4CNVA 2VVAX 3DD0A 8CA2A 5EOIA 4Q6DA 1FQMA 1CINA 4XZ5A 1ZGFA 5JESB 1YDAA 4KUVA 5L3OA 2FOQA 5EHVA 1YDCA 3U47A 4Z1EA 7CA2A 4DZ7A 4KP8A 5SZ5A 3MNHA 1YO0A 4L5UA 1CILA 2X7UA 1UGFA 1DMXA 1G52A 5BRWA 3F4XA 1G48A 3HKQA 5BRVA 4UOVA 4QJWA 3V2MA 3RZ1B 2NWZA 3TMJA 4ETQC 4Q78A 4K0ZA 4FVNA 1G4JA 1KOQA 1CCTA 2CBDA 5E2SA 4QSAA 1ZFKA 5JEGB 4RUXA 4R5AA 1ZNCA 2FOYA 1HEDA 2WD3A 3P3HA 4M2VA 1CNYA 1I9QA 2O4ZA 2F14A 4Q0LA 4X5SA 3RYXB 4E3HA 3S9TA 1YDBA 3P58A 4M2RA 1RAZA 3KOIA 5E5UA 1UGEA 3M67A 3V7XA 5DSLA 5G03A 5SZ1A 4Z1NA 3OYSA 2NNOA 4IWZA 3FE4A 1G0FA 1HCAA 5JGSB 4DZ9A 3NI5A 3BL1A 2Q1BA 4WUQA 4FVOA 3D92A 3RG4A 3S74B 4Q87A 3RZ0B 3RGEA 3D93A 4E3FA 3DCWA 4YGFA 1CVEA 3B4FA 4RIVA 3D0NA 3M5TA 5SZ4A 5L6KA 1RZEA 3P3JA 1BN4A 3S72B 4CNXA 2POWA 1CAZA 5DSMA 4ZX1A 1RJ6A 5JEPB 5JEHB 4KV0A 1FR7A 1HEBA 3KLDB 1Z97A 5DSQA 1CVCA 3K2FA 1CNWA 2CBCA 1XEGA 3R16A 4FIKA 1ZGEA 1RZCA 5FLOA 1RZAA 3FW3A 3N3JA 3OKVA 4PZHA 5FNLA 4HT2A 4WL4A 3T5UA 5DSJA 5JDVB 3RYYA 1FQLA 1HUHA 5G0BA 3MHCA 3HLJA 5EH8A 4K0TA 3L14A 4Q9YA 1BICA 4JS6A 3M5SA 5E2MA 1TB0X 1CRMA 4HBAA 3OILA 4E9OX 3M1QA 1V9IC 4HF3A 4Q09A 1CAJA 1JV0A 5FL4A 3BL0A 1I91A 2QP6A 3ML2A 4Q8XA 4RFDA 3CYUA 3JXGA 3DVBA 1G3ZA 4N0XB 4QK2A 4KUYA 3TVOX 4XIXA 1Y7WA 4QJOA 3DBUA 3S97A 1BN3A 3M04A 4ZAOA 5IPZA 4JSZA 1FR4A 2HD6A 2EU3A 4ZX0A 5EH7A 1CNJA 12CAA 5E5RA 3R17B 3UYNA 4HEWA 1BNQA 1JCZA 4PYYA 3M2XA 5FL6A 3FFPX 1YO1A 5FNJA 1H4NA 2X7TA 4HU1A 1CAOA 4K13A 2FNMA 4G7AA 4LP6A 4QTLA 2IT4A 4K0SA 4QSBA 4E3DA 1LZVA 4Q81A 4E3GA 4KNNA 1RZBA 3V3HB 1RZDA 3GZ0A 2VVBX 3P4VA 3M98A 4WUPA 1IF9A 1KEQA 4MO8A 4HEYA 4Q8ZA 3KWAA 4QIYA 1AVNA 3P44A 6CA2A 4LU3A 3S76A 4G0CA 4Z0QA 4RN4A 1CVHA 4YWPA 2WEHA 2Q38A 3M2NA 3T84A 3V2JA 1CAHA 5JG3B 1THKA 5CLUA 4XFWA 3KNEA 1CNCA 3JXFA 4ITPA 4E5QA 2FMZA 5J8ZA 3IBUA 4RUYA 1RJ5A 4RH2A 1CVDA 4Q7VA 1CCUA 4ZWYA 3ZNCA 4MTYA 3K7KA 3M40A 1G45A 4ZWZA 1CALA 3DVDA 5JQ0A 1ZH9A 3VBDA 4KP5A 1IF6A 2FOSA 1CNGA 3DC9A 1UGCA 3ML5A 1TEQX 1DMYA 3DVCA 4ITOA 5EZTX 2W2JA 4MLXA 5FLRA 5CACA 4KNMA 3M1WA 3S8XA 3PJJA 2HOCA 1CA3A 1G54A 1YDDA 2CBEA 3RYVB 1HEAA 4YXUA 2EU2A 3OIMA 5FNKA 4Q8YA 1G46A 1I8ZA 5E2KA 4RIUA 3MZCA 5FDCA 1BCDA 3CA2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HUG A;  4QJ0 A;  2POU A;  3T83 A;  3M2Y A;  3MHI A;  3IEO A;  4K1Q A;  3DV7 A;  3OIK A;  1I9O A;  5EIJ A;  4Q90 A;  3M96 A;  1ZFQ A;  4YGN A;  4WW6 A;  5DSR A;  3OY0 A;  5SZ3 A;  3V3I B;  3N4B A;  1FSQ A;  4QSI A;  3HKN A;  1BNU A;  1UGA A;  2AW1 A;  2POV A;  3U3A X;  5AMG A;  3QYK A;  3SBH A;  3PO6 A;  4Q06 A;  5G0C A;  4Q99 A;  4FRC A;  1EOU A;  2CAB A;  4HEZ A;  1IF8 A;  4YXI A;  1ZSA A;  5DRS A;  1CIM A;  1HCB A;  4Z1J A;  3U7C A;  4Q07 A;  5EHE A;  1ZE8 A;  3SAP A;  5DSN A;  5FNM A;  3DAZ A;  5JGT B;  2OSM A;  1V9E A;  3MYQ A;  4E49 A;  3IBI A;  5CJF A;  4YGK A;  1CA2 A;  2NNG A;  3T5Z A;  1BN1 A;  1CNI A;  1TEU X;  3KON A;  5FLS A;  2OSF A;  2WEG A;  5FNI A;  3BET A;  1AZM A;  3N0N A;  1KWR A;  4Q08 A;  1LG6 A;  4QJM A;  1CNB A;  4QY3 A;  4YXO A;  5DOG A;  4Q7P A;  4Y0J A;  2CA2 A;  3V5G A;  3OKU A;  1CNK A;  3IAI A;  4Z1K A;  4E4A A;  5G01 A;  3TVN X;  5FL5 A;  1HEC A;  3M2Z A;  4XE1 A;  2NNS A;  1J9W A;  3W6H A;  3IGP A;  1UGG A;  3JXH C;  1G53 A;  3CZV A;  1TTM A;  4BCW A;  3S71 B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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