1DE2A

Nmr structures of reduced bacteriophage t4 glutaredoxin
Total Genus 16
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
16
sequence length
87
structure length
87
Chain Sequence
b'MFKVYGYDSNIHKCVYCDNAKRLLTVKKQPFEFINIMPEKGVFDDEKIAELLTKLGRDTQIGLTMPQVFAPDGSHIGGFDQLREYFK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structures of reduced and oxidized bacteriophage T4 glutaredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN
molecule tags Electron transport
total genus 16
structure length 87
sequence length 87
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1de2A00
4NPBA 1Z3EA 1THXA 1K0NA 2PBJA 3O76A 2ON5A 4TVEA 1EV9A 2C80A 2VL2C 4EDZA 3L4NA 4MJCA 1PA3A 1GSUA 1GULA 3N5OA 4DSQA 5D9XA 3EINA 4PXOA 2C3NA 1NM3A 3HZ8A 3DD3A 5ECMB 5IQYA 5ECLB 1FOVA 2LQOA 4AJ8A 6GSTA 1TK0B 3VLNA 2HZFA 2X8CA 2I3YA 2R5GA 3D6IA 3VI7A 2QKEA 4EE0A 3QMXA 1JZRA 1ACVA 1LJRA 3IDVA 4ZB8A 2IN3A 1T1VA 1K3LA 2XBIA 4IBPA 2DJ3A 5CRGA 1I9DA 5IPHA 4J2FA 1A8LA 2LKUA 4LL4B 1U88A 4ZB9A 1AAZA 2FA4A 3W8SA 3SWLA 12GSA 5GSSA 1C72A 5J9BA 10GSA 4XS4B 3CSHA 3IK7A 4EO3A 4V2MA 1WRYA 2C4JA 2C0EA 4JE1A 5JWRB 3TCOA 2X99A 1K0CA 1J08A 2ES7A 3D22A 3VI5A 2NBSA 3TJBA 1A2MA 2H0GA 4KCAA 1SKWB 1TU7A 4IVFA 5JCWA 3A2VA 18GSA 1FW1A 4YQVA 3WGDA 2RIIA 3PGTA 22GSA 1BEDA 2D2ZA 2G0FA 3KH7A 2F9SA 5DJLA 5B8AA 3DKSA 4NMUA 3D4TA 1VF3A 5CRDA 4V2LA 2OADA 4WBRD 3VWWA 4TN8A 2L5OA 2B5XA 2VLVA 2PGTA 2Z9SA 5DAKA 4G10A 1PQNA 3ZIVA 4ULXA 5IMDA 5J4UA 2AUVA 2O85A 1F37A 3WT1A 2LNTA 2A2RA 5G5FA 3RHCA 1SYXA 2IMFA 3VWUA 2H75A 5A4WA 4DSSA 3DGQA 4WR4A 1ZCPA 1GTIA 2P5RA 3Q18A 1H4OA 4KA0A 3QOUA 2JZSA 4TXOA 2OE3A 2I1UA 1XW9A 1EOHA 3L9UA 5GAND 4K1FA 2K8VA 4EL1A 4E8EA 3NIVA 1ML6A 2IWTA 3D5JA 2PERA 4PGTA 3QAWA 4HI7A 1A2JA 4MF7A 2M46A 4X0XA 1SJZA 4XRDA 3TJJA 4ECBA 4GXZA 2H72A 3KP8A 1XW5A 1HNCA 4NAXA 1Y25A 1SJIA 3GHAA 3UBKA 3LG6A 2LV3A 4MJBA 1MD3A 3N9JA 1YKCA 3G7IA 4ZBBA 4MPGA 3F3QA 2FHEA 5LCZA 2PN8A 1FHEA 4PUFC 1V98A 4OO5A 4KUNA 1X5DA 3CTGA 2LUSA 2CT6A 2GT6A 2YWMA 3EYTA 5IIZA 2MMNA 3IPZA 4MJEA 3F4SA 2FY6A 1OC8A 4JEDA 4IHUA 1TOFA 3UOMA 1Q98A 1HNAA 1JZDA 2LNSA 2H6XA 4F0CA 1ZL9A 3ME7A 3APOA 3H1NA 1BX9A 3GN3A 3TRQA 2NPBA 3QAGA 2C0DA 2JU5A 1B9YC 3IBHA 2AAWA 4KAEA 4KGIA 1PX7A 3F6DA 5H5QA 1MDIA 1GWCA 1TRSA 1Z7RA 3UAPA 4DEJA 5F07A 4HZ4A 5COHA 2GSTA 2H0IA 1M0UA 4LMWA 3ZVJD 1ZYQB 3EWLA 2VCZA 3APSA 2C8UA 2HT9A 4POBA 3ZIJA 1WPIA 4J56E 4IQAA 3UEMA 3GURA 2AYTA 3QCPA 3GKMA 2FLSA 1K3OA 4PQIA 2YWOA 3UMAA 1K0MA 1TK8B 2WS2A 1XOBA 3KD0A 3UVTA 4O5RA 5DDLA 3IV4A 2AB6A 2CAIA 4ZBAA 2YP6A 5B6NA 2MBTA 4L8EA 1M99A 1X5EA 5HR0A 4PUAA 5D9WA 2LEGA 3GKKA 4N11A 2FWHA 3L78A 2RLIA 1GUHA 2VL2A 4K7NA 2HI7A 1J0FA 3H79A 3RPPA 1OC9A 4K0GA 2LJKA 4D73B 2VCQA 4GSNA 2TIRA 1TP9A 2JL4A 2VCXA 3KCMA 2YJHA 3US3A 3TOTA 2PWJA 7GSSA 1R5AA 1MDJA 5ECHB 5IOWA 1XPVA 2HSYA 2MMZA 1GSYA 3C1RA 1B4QA 1GSQA 3HVXA 4GCIA 2H6ZA 2VLUA 5G1LA 1R5PA 2L57A 2FWFA 4NHZA 1ERTA 2DIYA 4WKWA 1GSDA 2XC2A 1F3BA 1U3AA 4NHWA 1K0AA 3FZ5A 2GQKA 4QL7A 3GL3A 5JCGA 2MMAA 1ZYEA 2YV7A 1EP8A 16GSA 3BJ5A 3LXTA 3UIWA 3Q74A 1VF4A 4MA9A 1SL1B 1PKWA 1G6YA 3U6VA 4TR0A 2PMTA 2YZUA 4KDYA 1XVWA 1Z6MA 1GLQA 4WF5A 3WD6A 4ECJA 1B48A 1ZGNA 4FO5A 5IMVA 3HZ4A 2CX3A 4Z7XA 1U6TA 1R4WA 2YZHA 1XWKA 1M7TA 4YQMA 4CW9A 2L6DA 5KEJA 2B7JA 2WJUA 1NHOA 5JWOB 3GSSA 3C73A 3A2XA 2DSAA 3EE2A 3HJMA 1OKTA 1GLPA 17GSA 3BD2A 1T7PB 2LJRA 4L5LA 3U5RE 3KH9A 1OE7A 2HNLA 1XFLA 2B7KA 2MZCA 1X5CA 3ERWA 5HR3A 1MEKA 1SJ6A 4OFTA 1X9SB 1YZXA 2NVLA 1ERUA 3HVSA 1RW1A 5AN1A 2HE3A 3TUEA 2LSTA 5ID2A 2C0GA 2CX4A 4DSRA 3IR4A 1ERWA 1JZWA 2JADA 2IFQB 4XS6A 2YOIA 3EMXA 2AHEA 4WR5A 1G7EA 3O6TA 4LL1B 2GSRA 3HD5A 3ZITA 4AJ6A 1TI3A 4DVCA 2H0HA 5C00A 2J9HA 3LYPA 1DUGA 3F3RA 3LORA 2HZEA 1RQMA 2I9HA 3F4TA 5IMFA 1VF2A 2XHFA 2XBQA 6GSYA 4IKHA 5ABRA 3UJ1A 2BTOT 3I9V2 1XBSA 1PL2A 4HS1A 5J41A 1XW6A 2GGTA 5J3RA 2P0GA 3LJRA 2YWNA 4MCUA 4K6XA 3UL3A 1TW9A 2PVQA 1SL0B 1E6BA 1K0DA 4XHMA 3I69A 2GSSA 1V58A 4JR4A 3TRXA 3TDGA 2KUCA 5DALB 2JACA 1SD8A 4KDUA 3F9UA 2PU9C 4MJAA 3GMFA 5DQYA 5DAKB 1LBKA 1T4ZA 2V41A 3QD9A 4KNDA 3KMNA 2LRTA 2A4VA 2X8GA 2ALBA 1N8JA 2H70A 4K9ZA 5G2ZA 3C71A 4BWSA 4TR1B 3FEUA 1LU4A 5H5SA 2IIYA 4O32A 2DJ0A 1GSFA 4IS0A 5GSTA 4POMA 1NHYA 4BL7A 2HRNA 3GRXA 4KW6A 1JLVA 4GF0A 4V2NA 4L0WA 1O8XA 4MF6A 2L4CA 4ZILA 1NW2A 4OCFA 3TKQA 3UVHA 3D4MA 2JSZA 2ON7A 1IYIA 3LQ7A 1GL8A 4OFNA 3GSTA 3M0FA 1H75A 1V2AA 3PR8A 4RQRA 4KB3A 3HJOA 4OO4A 3UARA 2O87A 2DJJA 4HEA2 4O92A 3DWVA 1YQ1A 2F8FA 3VPTA 3L9SA 1ON4A 1S3DA 2DMMA 4HOJA 3GUSA 1KEBA 4P3YB 8GSSA 2HFDA 4I8BA 5DCHA 2N5FA 5AISA 3ISOA 2IJYA 4JBBA 1USBA 3FHKA 2E2GA 3ZL5A 1JZOA 2VCWA 2HXKA 2CZ3A 3TJFA 3GX0A 1JHBA 1TTZA 1FO5A 3KTBA 5D8IA 2VCTA 3FK8A 4EF0A 2ZCTA 4WETA 4NV2A 3R2QA 3ERFA 4RI7A 1MTCA 5INYA 4E8HA 4F82A 4XRAA 4HZ2A 4H86A 3MAKA 5HFIA 1A0FA 2V6OA 3F4RA 2PPTA 3BOAA 3GFKA 3ZMLA 4MPFA 3LEFA 4PX1A 3I43A 5DQSA 1M2BA 2YCDA 5ELGA 2CAQA 3WYWA 4XS4A 3KTLA 3GKXA 2H01A 2B1KA 5IO2A 2RUFA 5D9VA 1K3YA 2OBKA 3TB2A 4HJMA 1PN9A 2X8HA 2DMLA 2HSHA 4NV5A 5AIVA 1T4YA 2IL3A 3IAS2 5AIXA 2AV4A 4JZQA 1GNEA 4POLA 3K8NA 2WCIA 1T8EB 4EC0A 5IMCA 20GSA 2IPAA 3IK9A 4IJIA 1GP1A 1IYHA 1RK4A 3H4KA 1PL1A 1FB0A 2CZ2A 1MDKA 1BAYA 1AXDA 3HYPA 5C04A 3TKRA 2ZNMA 1GNWA 1O81A 3E3EA 4HUAA 5F0GA 3VURA 4MZBA 4I6XA 3GIXA 1Z5YE 1F6MC 2L59A 4LMVA 5IM9A 3BCIA 2OACA 1OAZA 4LA1A 2V2GA 1HD2A 1EEJA 3DMLA 1URMA 3HCZA 4GSSA 4TR4A 3ZREA 4HQZA 2BMXA 1AUCA 5IOXA 4RI6A 3FZ9A 4F2IA 2DBCA 1M2AA 2O8VB 2XPEA 5DVBA 4NXIA 4MLYA 1GRXA 3HXSA 1R26A 2OE0A 2QGVA 4FYCA 2H73A 3NZNA 4X1UA 5ECKB 4HDEA 2VOCA 3APQA 2B6MA 4TR3A 2G2QA 6GSUA 2ZUPA 5HFGA 2VIMA 1PMTA 1SD9A 2MYGA 3EMPA 5D73A 1HQOA 1AIUA 3VPQA 4Q5QA 3DXBA 5HR2A 2GDRA 2WULA 3ED3A 3ZMKA 5IMZA 1EV4A 1OVNA 3SBCA 5HR1A 4MZCA 1V9WA 4ILFA 1FVJA 2F3MA 3IRAA 1ST9A 3GTUB 5G1KA 1AC1A 3QDNA 4FYBA 5A4UA 4MMMA 1EP7A 2N5BA 4ZB6A 2VM1A 1EWXA 3HHVA 2CVDA 3MDKA 3RAZA 2LTKA 1EOGA 1KBNA 5ECNB 4K7IA 1XWGA 4CHSA 1XOAA 2JZTA 1A8YA 4GRFA 1VGLA 5ECPB 1DSBA 2RUEA 2H71A 1A24A 2OE1A 2QC7A 4MH3A 4F9ZA 4K7OA 4L5OA 2B5YA 2LJAA 5FWGA 1W89A 2K8SA 2WFCA 5D9TA 3HVVA 1M2DA 4V1Ap 2DIZA 1A2LA 6GSWA 3CRTA 3ZVJA 3CRUA 3H93A 3P90A 4ZIJA 2VD1A 4TXVA 3W6GA 2EC4A 2H6YA 1YDKA 5A4VA 3DVXA 3MSZA 4Q5FA 3RDWA 3LXZA 3MNGA 1YJ6A 2FUG2 2R4VA 2GTUA 2YPMA 1QMVA 4YAVA 4L0UA 3FW2A 19GSA 2KHPA 4JRRA 3TRPA 1XZOA 1SENA 2BJXA 3DRNA 2O7KA 1UN2A 3QPMA 2FWEA 1WIKA 3ZYWA 4N0ZA 2EIOA 3C1SA 4IN0A 3IC4A 5EPFA 3G7YA 5LNKe 4AGSA 1Y6EA 1KTEA 1UVZA 2LRNA 4O7HA 2FCHA 3P7XA 2VL9A 3IAM2 1ZMAA 3KM6A 4D73A 3L9VA 5F8BA 3DEXA 4BVXA 1O7UA 4V1Ag 3HJPA 1GTUA 1B4PA 3M1GA 5G5EA 2VM2A 1I5GA 1VF1A 4N10A 4GQCA 5DCGA 1XWBA 4HU9A 1U87A 4KSOA 2V1MA 4LLRA 1GSEA 1WMJA 2FGXA 5ECOB 2OBIA 3WGXA 1TU8A 1NSWA 3IE3A 5GAPD 4YH2A 1A23A 4KX4A 1VRSD 1GUMA 2C3TA 2MMOA 2HRFA 3F0IA 5H5RA 3KGKA 5LD0A 1GH2A 2GZZA 4RQXA 4YAPA 5L71A 2N5AA 1S3CA 3HKRA 4ACSA 4PNGA 1YEPA 3GV1A 1K0OA 2WZ9A 2I4AA 4FH8A 2FD3A 4G2EA 5ECIB 2L6CA 4TKYA 4KCEA 2EIQA 1GSSA 2HLSA 3A3TA 2QSIA 4F03A 4POKA 1YEXA 2C0FA 4I2UA 4OD7A 3J7Yb 1XWAA 2E0QA 4YQUA 3GKNA 4IP6A 2YANA 4WF4A 1ZZYA 14GSA 2GT5A 3TJGA 2IMEA 3IHQA 5J5NA 1AQXA 3JCML 4GQFA 1TRWA 4N30A 1WWJA 3KP9A 1WP0A 2XPDA 3MWHA 1QQ2A 4ML6A 4DSSB 2DJ2A 4QQ7A 1QFNA 1TRUA 1GTBA 3E9JB 4TXOB 1R7HA 3HA9A 1CQGA 2H1DA 1PD21 4RUVA 2JZRA 2IFQA 4J57E 4ID0A 2TRXA 5E4WA 1TRVA 5IMAA 2VUPA 5F06A 3CTFA 4GWRA 3VWVA 1TI1A 3Q6OA 2PUKC 2IMIA 2B5EA 5HQPA 3PINA 3KEBA 1ABAA 4PQHA 1FG4A 1K0BA 11GSA 2E2MA 4ZL8A 1B8XA 2KOKA 4KDXA 3KXOA 2CV4A 2DJ1A 4XCSA 2DJKA 3F63A 1XIYA 4NWYA 2KLXA 3CSIA 4FYUA 2C3QA 6GSXA 3RPNA 1X9MB 1THOA 1HYUA 1Z7PA 4EVMA 2K18A 3L0HA 3G9BA 1AW9A 3LWAA 3TKSA 1N2AA 2J23A 5EVOA 2H66A 2OA7A 5KN2A 5GZZB 4BA7A 1BJXA 3WT2A 4PQ1A 3TJKA 1TK5B 2H8LA 4KE3A 3FZAA 5CRWA 4WEYA 1Z9HA 2RM5A 3GYKA 5DALA 2VO4A 3OR5A 1PGTA 5KN0A 4XS1A 3GX8A 4GSTA 1QGVA 1Q4JA 3FY7A 2DC5A 4Q5RA 3LFLA 1J9BA 3V1WA 4TW5A 2YNXA 1B9XC 3EU4A 3O3TA 6GSSA 1JFUA 5DBQA 4TR1A 1DBYA 1BYEA 13GSA 3LYKA 4G9HA 4IP1A 2TRCP 1FAAA 4EXJA 1EEMA 1SYRA 3M3MA 2H74A 4AF2A 4HJ2A 4ZL9A 3CYNA 3ERGA 1QUWA 2WGRA 2F8AA 3GH6A 4ZBDA 9GSSA 2I81A 1UC7A 2CA8A 3GH9A 4HQSA 1SL2B 3C7MA 2CVBA 3CBUA 4IGJA 4MP4A 5CNWA 4OCEA 3CSJA 3KIJA 5JCUA 4ZXGA 3EC3A 5CREA 5HFKA 2A2SA 3DIEA 2F51A 3FYGA 2KP2A 2H1GA 4QL9A 1TJDA 2FNOA 3ZLPA 5FT3A 2P5QA 3P2AA 1QK8A 1UA5A 1MD4A 2X64A 3RHBA 6GSVA 2E7PA 1OE8A 2YN1A 4K2DA 4EUYA 2CQ9A 2O89A 3VFIA 5EL8A 1M9BA 2PVOC 3M9JA 4I97A 2GLRA 1V40A 3D21A 1OC9B 4MK3A 4FIWA 1PSQA 3QR6A 3BCKA 2YJ7A 1WE0A 3FKFA 2GSQA 2LS5A 1BQ7A 3GA4A 3HY2A 1T00A 2OJLA 2R3XA 2H1AA 3D0ZA 1AQWA 4MABA 2FA8A 5JWQB 3ME8A 2AJQB 2IMDA 1U3IA 4MZWA 3ZFLA 3LSZA 3QAVA 1O6JA 2VD0A 4X43A 3FRCA 4ECCA 4EDYA 3QFBC 1QXHA 3CXGA 2REMA 5ENUA 3F6FA 2YWIA 5B7CA 3DVWA 4IQ1A 4ISDA 3RBTA 1TDIA 1YY7A 3G7JA 1FB6A 1F9MA 3I6AA 1M9AA 1OKDA 1G7OA 3TKSE 4ZL7A 1ERVA 4F0BA 3GNJA 2VCVA 3TKSC 2GZPA 1WOUA 5ECRB 1G6WA 4K0NA 3A5WA 3PH9A 2CVKA 4JU5A 3FR6A 2B3SA 3KMOA 5ECSA 5A5KA 1EGOA 5KN3A 2L5LA 2NDOA 1O73A 1AQVA 4GLTA 2L4QA 1T3BA 1V57A 4CDOA 2MBSA 2GVPA 1XVQA 3W8JA 4G19A 1FVKA 3NOFA 3TGZA 2M72A 1YKAA 3BBYA 4WBJA 2HYXA 4BPYA 3FR3A 2M80A 2VLTA 2P31A 2GZYA 4IELA 2H30A 4ECIA 5D93A 2WDUA 4KSMA 5J9CA 1XCCA 1W4VA 2K9FA 3VK9A 4XTSA 3LGCA 1PKZA 2R6KA 2IMKA 2B1LA 5ID2B 4BWQA 2C1YA 5ECQB 4HU7A 4I2TA 5D96A 1ILOA 2VAFA 1SK1A 2K6VA 4KH7A 2GQLA 5CRHA 3P8WA 5KN1A 1G0TA 1GUKA 1GTAA 2V32A 5CP1A 1WJKA 1SU9A 1OYJA 2YV9A 1X9WB 2HZEB 4IW9A 3F8UA 4K8MA 5CYYA 2FWGA 3DYRA 3ZFBA 1X0RA 5EY6A 2GQMA 1SKSB 3WGEA 3ZTLA 2R37A 2LQQA 3CMIA 3VWXA 2V6KA 5DJMA 5F05A 1TXXA 3UBLA 2VL3A 1O8WA 2H19A 5E59A 2H76A 4BVYA 3IA1A 4ML1A 1E2YA 3EVIA 3M9KA 1F3AA 3KZQA 3E0UA 3ZZXA 4PNFA 1ZOFA 2H1BA 4OMVA 3EURA 1S3AA 1YF1A 1EGRA 3HDCA 3GTUA 3ZRDA 3KJYA 3TOUA 4N0VA 1A0RP 5CO3A 4AJ7A 1Z6NA 4OFMA 3S9FA 2LRCA 3J7Yk 2NTOA 1JLWA 4TRXA 4XIHA 2RM6A 2EIRA 3TKPA 4MH2A 3C8EA 4MDCA 5FHIA 1SK2A 1SKRB 3M8NA 1HNBA 1OC3A 4JR6A 5AGYA 5B8BA 3Q19A 3FZ4A 5G31A 1PRXA 4PURA 5G30A 2KP1A 1O85A 4WXTA 3A2WA 2JSYA 4I5QA 4EKZA 5B6MA 1CQHA 3GL5A 3QFAC 2WB9A 5CAXA 5ELAA 3IOSA 2DLXA 1SK0A 3AY8A 4Q5NA 3FR9A 1TKDB 1KNGA 1YF0A 4GTUA 1XWCA 5IO0A 3EU3A 4IJ3A 4OWYA 2WRTA 2OKAA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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