1DEJA

Crystal structure of a dictyostelium/tetrahymena chimera actin (mutant 646: q228k/t229a/a230y/a231k/s232e/e360h) in complex with human gelsolin segment 1
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
375
structure length
367
Chain Sequence
DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMKAYKESSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKHEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords GELSOLIN
publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
total genus 122
structure length 367
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dejA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dejA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1dejA03
2HF4A 3H3OB 5AQOA 4XEIA 4H0TB 1RFQA 4A2BA 4H5TA 3L0QA 4K42A 1QZ5A 4EFHA 2Q0RA 1BOTO 1C0GA 2ZF5O 3VPZA 3CETA 3C0BA 3HBTA 5AQVA 3ATUA 1IG8A 2F9WA 4H5WA 5BPMA 3D2EA 4FWLA 5AQWA 4CD3A 4IXCA 2E20A 1U6ZA 3MMVA 3GOIA 4BRPA 3M1FA 3LDNA 1QZ6A 1GLJO 1T6DA 2P9LA 4CZGA 3LL3A 4IJAA 3CIPA 3IUCA 4FOIA 5AQSA 2QXLA 4JD2A 4BRIA 3U9ZA 5BREA 4BRCA 3O5BA 4B1XB 1X3NA 1ATSA 3H1QA 3VETA 4MLEA 4KBOA 3M6GA 1YXQA 3CQXA 1ATRA 1NBWA 2A40A 4BC5A 3MN7A 1ATNA 1X9JA 2IVOA 2BUPA 4H0YB 1HJOA 2E2QA 1IJJA 4JAXA 4FOEA 2CH5A 2E8AA 3F9MA 5AQPA 3HSCA 1CZAN 4BR5A 4FWRA 1NGDA 3BUZB 4H5NA 4WYBA 3DWLA 1SQKA 2CGKA 4O8KA 3G25A 5KPRA 1NGFA 3KVGA 3SMSA 1NGIA 3HZ6A 2D4WA 5AQQA 3FZLA 4Z94A 4YDUC 3MN5A 3ULEB 2GWJA 2FF3B 5JICA 2A6AA 3I33A 4H0OA 2W40A 3OHRA 2DPNA 2P9KB 3DXMB 3EO3A 3CHWA 3VEXA 1BA0A 2P9UB 4FWKA 1BU6O 1HX1A 2E1YA 3A8YA 2CGLA 1RDWX 4H5VA 4NO7A 4PKGA 5AZJB 4CZEA 3QICA 3AARA 3U4LA 4PL7A 5FPMA 3VEWA 4B1ZA 4JHDB 3QMLA 3JXUA 3SJHA 4WQ4A 3ZX0A 1HLUA 1XC3A 4FL9A 4WQ5C 5EVZA 3GG4A 4BRHA 4B1WB 3VF4A 4RTFD 3VESA 4ISGA 3IDHA 3W3DA 3WQUA 3CERA 2QWPA 2QWLA 4BR2A 1Z6RA 2H3GX 1QQNA 1HPMA 1NGCA 2FSNA 4A61A 3O4WA 2Q31A 3WT0A 3AAPA 2KHOA 4CBUA 3SMPA 2GWKA 4IJNA 2QWNA 4XH5A 5AQTA 2P9KA 3DXMA 1GLLO 1BDGA 3WXLA 3LM9A 3VGLA 2NZTA 4BGBA 3CJAA 3D2EB 3JS6A 5JLFA 5AZJA 5AQKA 2GEMA 3H1VX 3FE1A 3QB0A 5ADXH 1YVNA 4QS8A 2PAVA 4EIAA 2YHYA 3WXJA 1YUWA 1SAZA 4XH4A 3O80A 5ADXA 3FR0A 3HI0A 3L4IA 4BRQA 4A62A 3WEEB 4CZMA 3WUHA 1ZC6A 5FPEA 4GY2B 4HTLA 4EAHD 5LJWA 4Y0WA 3LDLA 3VGMA 1BG3A 3D7EO 2GELA 4JNEA 4PL8A 3VEZA 3ZEUA 4CD1A 3O1BA 1GLAG 4CI6A 3QDKA 4MO5A 1NWKA 2QW9A 2IVNA 5I9EB 1ESVA 2A42A 3FGUA 3FLCO 4RWTA 2E1ZA 3L6QA 2FF6A 4K25A 3A5MC 4H0XB 2Q0UA 1GLDG 3I8BA 3UB5A 4BRFA 2BTFA 2P9NB 4BREA 2V51B 1U2VB 5F1XA 1KAYA 1NGEA 4DB3A 2YI1A 1ZBSA 3MK6A 4E1JA 3S41A 2HMPA 3WEEA 2F9TA 4CJ7A 3EZWA 3W0LA 4C23A 3DXKA 1KXPA 2A41A 1KAXA 1G99A 2OANA 2Q97A 3BP8A 5EY4A 3GBTA 4BVOA 4I6MB 3ZX3A 2AP1A 3QBWA 2ZGYA 4H5RA 4L3QA 3KZBA 2E2NA 3R9PA 4WQ5A 3EN9A 3CI5A 3BEXA 2I7PA 4BRNA 2QWOA 4BRDA 3HTVA 3LDOA 1MWKA 1NLVA 4LC9B 3FZKA 1ZXOA 4BR4A 3DAWA 2P9NA 5AQLA 2E2OA 4M63C 5F2RA 4M7XA 1J6ZA 3BF3A 5KQDA 1U2VA 1E4GT 5EOYA 2A5XA 3VEVA 3CJ9A 4QS9A 3D2FB 1NGGA 3TU5A 4IO8A 1NMDA 2FSKA 2E88A 3M3ZA 5AQJA 4I6MA 3U9DA 4XH1A 3VF2A 3ZX2A 3CJ7A 4BR0A 2YCHA 4HWIA 4BROA 5AZIB 2FLOA 4H03B 2UYTA 3J8AA 3ENHA 4H0PA 1BO5O 4JN4A 3O08A 3EL2A 5AQIA 4MLHA 3ZEUB 1LCUA 2FSJA 4BRLA 2EWSA 4CZFA 5F0XA 3MDQA 3R8EA 4K43A 2AA4A 2E2PA 3VERA 2CGJA 2GUPA 1OKJA 3EKUA 3IFRA 2QWMA 3LM2A 1LOTB 3U8XA 3WXKA 3UKRB 1Z05A 1WOQA 3VEYA 3H3NO 1HKCA 3A5LC 5FPNA 4FSVA 1V4SA 2D0OA 3D2FA 3C7NA 3CJ1A 2ASOA 3SK3A 3GDQA 4AM7A 3LDPA 4MO4A 3A5OC 1GLBG 1KAZA 1QQMA 1P8ZA 2CH6A 4BC4A 3RSEB 1QQOA 4FWSA 1DGKN 5FPDA 2HF3A 1MA9B 2WUSA 3H45C 5AZIA 4BR9A 4H0VB 1GLCG 3VGKA 4BRMA 3DXKB 3IMXA 5AR0A 1X3MA 5AQXA 2HOEA 4A2AA 5B8HA 5BN9A 2P9SB 3VEOA 5JMVA 1GLEG 3MN9A 1BWFO 2Q36A 5AQHA 1TYQB 4NB4A 2IIRA 4WQ4C 1QHAA 2W41A 1NGAA 1GLFO 4RCHA 2D0PA 3UKRA 4BGAA 1C0FA 5EX5A 2ZGZA 2V7YA 3CQYA 2QWRA 4YDUA 5LJVA 1Q18A 2ITMA 4O5FA 1V4TA 5BPNA 4BRGA 3MCPA 4GNIA 2ASPA 2QM1A 3CJCA 1HKBA 1Y64A 2YJEA 1K8KA 3GL1A 2V7ZA 1RGIA 3FFKB 3RSEA 1NM1A 2YJFA 1MWMA 4FWPA 1TUYA 4B1YB 4CZHA 3B8AX 2QWQA 2VCPA 2P9SA 2YHXA 4BG9A 1SZ2A 4EHUA 4FWNA 5BRDA 1JCFA 1YAGA 4ISFA 1TYQA 2ZWHA 3A0IX 1JCGA 3LDQA 2P9PA 3AAQA 4FWQA 3SLCA 4DHYA 3ZETB 1D4XA 3ENOA 3FZHA 5KQ8A 4FPBA 2I7NA 2Q2RA 1TUUA 5AQUA 4BVPA 4PKIA 4IWVA 3VOVA 1S22A 5AFUH 5ELZA 4FO0A 5AQZA 4CZIA 1R59O 5LY3A 5AFUA 1JCEA 3QFPA 1NGBA 5TKYA 3C7NB 3O1WA 1S3XA 4EHTA 3AY9A 3BF1A 4FWMA 4M7YA 3ATVA 3WQTA 1XQSC 1MDUB 4CZKA 4DQ8A 1E4FT 1WUAA 3GE1A 4B1UB 5CE3A 3DJCA 3WXIA 3VENA 4FPAA 5AQFA 4B9QA 4QS7A 2V52B 5AQRA 5BRFA 1H1VA 2A3ZA 4CBWA 5KPZA 2D1KA 3QFUA 4F9OA 1DEJA 4CZJA 3ZETA 3VF6A 4BRKA 2P9IB 1EQYA 5E84A 5BPLA 5AQMA 4BR7A 5BRHA 2Q1NA 3UKUB 1HUXA 3UE5A 4BG8A 5BN8A 2J4RA 4K41A 1NGHA 3TPQA 5E26A 1NGJA 2VYPA 3O6WA 3CJBA 4CZLA 3QBXA 4ISEA 1BA1A 1XUPO 3H46O 4BQLA 3O8MA 4B1VA 3ULEA 1K8KB 5AQGA 5AQNA 5JLHA 1HKGA 4DCHA 3P4IA 5BR9A 3H6EA 2P9UA 3R6MA 3FZFA 2IVPA 4J8FA 4PKHA 3A5NC 4CBXA 2FXUA 2ASMA 2GTDA 2NLXA 1T6CA 4IZ9A 3MN6A 1DKGD 4BQZA 2P9IA 4FWOA 2P9LB 4JHDA 4AM6A 3KHYA 5KPTA 5EXWA 3HM8A 1T44A 3FZMA 3ID8A 4JD2B 1BUPA 3UKUA 2YHWA 2P9PB 4BRAA 2NRHA 4BC3A 5AQYA 4BC2A 2PBDA 3EKSA 2VWBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HF4A 4XEIA 1RFQA 2O8DB 4E7KA 4FJKA 3OYDA 1HNIA 4EFHA 4X66K 4CFCA 5KI6A 1C0GA 2ZF5O 3M8PA 3C0BA 2YHAA 1ZBFA 3T7ZA 3NDKA 4H5WA 3CCMN 3D2EA 2Q3SA 3MMVA 4BRPA 5GINA 4LF9K 1QZ6A 4DTJA 1T6DA 2P5OA 3MAQA 1Q9XA 2QA4N 1XHXA 1ATSA 3VETA 2KFZA 4IG3A 4E3SA 3DLEA 1NBWA 2HSTA 4H0YB 3VTHA 2VGNA 4LF6K 1DT9A 3AVNA 5AJ3K 4FJNA 1IJJA 3TAQA 3NGZA 1KVAA 1JXEA 3VQDA 3DLHA 4BR5A 1QTMA 1NGDA 4FLUA 1NK4A 2CGKA 4JRQA 4BE0A 4FZZA 1NGIA 3HZ6A 5AQQA 4DQRA 5GAGP 1CXQA 3ULEB 5JICA 1RBRA 2W40A 1GOCA 3NF6A 5I3UA 4FJHA 2P9KB 3DLBA 4Z4GA 3EO3A 3WXMB 4CE9A 3ZLJA 2P9UB 1HX1A 1YJNN 1RDWX 3AVJA 4NO7A 1ASVA 3CM6A 4AHCA 4DLEA 1S6PA 1QVFM 4DTSA 4B1ZA 2OYQA 4I9QA 1N34K 1CZBA 1IKYA 1D5AA 3C6HA 3J7YP 1XC3A 2KQ2A 4FL9A 1RBTA 1C0MA 5H1SQ 2YKMA 1DTQA 1EO1A 1RDCA 3VF4A 3KKSA 4R79A 2Z1HA 3VESA 3IDHA 5M1FA 4W5RA 1ZBLA 1HQUA 3WQUA 3CERA 3KK2A 1NGCA 3ZT0A 4V19S 3E9LA 3ZSZA 4IJNA 1GLLO 5M1QA 3NF8A 2W42A 4FLVA 4JK9A 4NXNK 3P1GA 2FBXA 4YFUA 5AZJA 4DV3K 3AA2A 1WSGA 1YVNA 3LP2A 3SQ0A 1TKTA 4KTWA 4XH4A 3OW2M 1VQNN 3L4IA 3ENBA 4BRQA 1U47A 3I0SA 3KD1E 5FPEA 4GY2B 4EAHD 3QETA 4GKKK 3LDLA 1BG3A 2GELA 3BDPA 4CF2A 3TABA 4Q5VA 1VQ6N 3OYMA 4MDAA 2HBMA 1ESVA 3IAYA 4K25A 4B3SK 4NLCA 1Q9YA 2BTFA 2HHWA 4BE7B 2D0AA 4DG1A 2V51B 4Z4HA 1U2VB 4DSFA 4NCAA 1NGEA 3QERA 3RWUA 2UUCK 2PFUA 4JI6K 2NRTA 3AO1A 3MK6A 2RN2A 4IEIA 4ID1A 5T7BA 3EZWA 3PIOL 1CXUA 4JRPA 1MU2A 3VQCA 3BP8A 1W97L 4BVOA 3AO3A 2AP1A 3NH2A 2ZGYA 4H5RA 4X65K 3CCQN 2OCEA 4QCLA 1YF5L 3EN9A 3BEXA 2GBZA 3O3FA 4BRNA 2QWOA 3AVBA 1MWKA 1NLVA 2X6SA 4LC9B 1C6VA 2E5LK 1NK5A 4JYAK 4BR4A 4H4OA 4C8OA 2P9NA 3K58A 4DU4A 4M63C 5F2RA 1J6ZA 4DTOA 3L2VA 3SV3A 3NAEA 4FK4A 2HNYA 3D2FB 4EP5A 2UXBK 4KB0A 3ASMA 4WFAL 3J81O 3OYLA 1HYVA 4I6MA 4O44A 3U9DA 3ZX2A 1TVRA 1HPZA 1OH6A 3CJ7A 5JVGL 2OPRA 4LFAK 1TKXA 1TK5A 1KFDA 4H03B 1FKPA 3K5MA 4JN4A 3O08A 4OVLA 4O0JA 1RCHA 3ZEUB 1NMNA 4PA1A 5F0XA 3I55N 4H8KA 3R8EA 5CHIA 3EZ5A 2E2PA 3HT3A 1J9AA 1FKOA 2CGJA 1OKJA 3IFRA 2QWMA 1RT7A 2G8VA 4FK0A 3CC4N 1S1XA 3THXA 2NRWA 4UY8O 2KTQA 2HHQA 3SQ2A 3IG1A 1QHTA 1JLCA 3RRGA 3PV8A 3U3GA 3LDPA 1GLBG 3RR8A 3VQ8A 1P8ZA 4U7BA 2CH6A 3DLRA 4BC4A 4IOAL 4IEEA 3RSEB 3B6OA 4CJSA 1HYSA 4B3TK 1HNXK 4BRMA 5AR0A 3IRXA 4GVMA 1NK6A 2P9SB 2WFBA 3VEOA 1OH5A 1GLEG 4AF1A 4CJUA 1TYQB 2LSNA 4FJGA 3L4QA 3HPHA 4CECA 2F7TA 4BGAA 4CEBA 2O8BA 4KFBA 4RG8A 1Q18A 1V4TA 4X64K 4UQGA 4J2BA 3VTIA 4C8KA 4IDKA 5LMNK 4FJLA 3CFRA 4CJQA 4K8ZA 1W9HA 1JJ2M 4CJ4A 4KHYA 3IS9A 4CZHA 4FJMA 3B6PA 3VQEA 4CGIA 5SWMA 4EHUA 3MEDA 1S72N 2GV9A 4FWQA 4JI8K 4DHYA 4JS5A 1JLGA 3LWMA 4CEZA 4FJ8A 3J80O 4PKIA 5GAEP 1S22A 4DSEA 4C8NA 1CZ9A 4FO0A 3O9SA 3KLHA 1VQON 3T19A 5AQZA 3THYB 3RR7A 4GVEA 5LY3A 1JCEA 4CJKA 3O1WA 3WNHA 4B3MK 5GADP 3CC2N 3JYTA 4JI3K 5DMRA 4AHTA 1XQSC 4DQ8A 1E4FT 1P90A 4ID5A 1D8YA 1BCOA 3BGRA 5AQRA 5BRFA 1H1VA 2A3ZA 1NK9A 3M8QA 3QFUA 4F9OA 4QOZB 1EETA 3MX2A 4LF8K 3ZETA 2NNWA 4BACA 4E7LA 2P9IB 4K0KK 2VQEK 5BRHA 1QS4A 3UKUB 1BHLA 1X9SA 4OGEA 1SV5A 4YORA 4RW7A 2HHIA 1NGHA 1C1AA 4GKJK 1RTIA 2VYPA 3O6WA 4CZLA 4OLAA 4M45A 3CCVN 3O8MA 4B9UA 1K9MO 3C6UA 4FLYA 4PWDA 3HP6A 4CF8A 1Z25A 1JLAA 3AA4A 3ZT4A 4DCHA 1Q7YO 5BR9A 5A2QO 2PY5A 1S1WA 3FZFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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