1DEJA

Crystal structure of a dictyostelium/tetrahymena chimera actin (mutant 646: q228k/t229a/a230y/a231k/s232e/e360h) in complex with human gelsolin segment 1
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
375
structure length
367
Chain Sequence
DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMKAYKESSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKHEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GELSOLIN
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
total genus 122
structure length 367
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dejA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dejA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1dejA03
2NZTA 4FL9A 3BP8A 4FWLA 2QWNA 4H5NA 2PAVA 4A62A 5AQKA 3FZMA 1Z6RA 4JHDB 4FWKA 4H0OA 4B1VA 1BOTO 4H5WA 4GNIA 4H0VB 1J6ZA 5AQJA 1C0GA 1YUWA 4Y0WA 2P9NA 4BR2A 5BN8A 1V4SA 1U2VA 3G25A 4H0PA 3H45C 1NWKA 1JCFA 3CETA 4XH4A 2ZWHA 4PKGA 3SMPA 3IDHA 3ZEUB 2CGLA 4BG8A 3UE5A 3FZHA 5AR0A 2FSKA 3R9PA 3UKUB 3HZ6A 4FOIA 3EKUA 1GLBG 4H0TB 4I6MA 1ATNA 1E4FT 1KXPA 1WUAA 3MMVA 1YXQA 1IG8A 4NO7A 2P9IB 4E1JA 4JHDA 4EAHD 2V7YA 3R6MA 4FWRA 4EHTA 4Z94A 5BPMA 1NGCA 1GLJO 1IJJA 3JXUA 4CZGA 1T6CA 3ATVA 1HUXA 2FLOA 2CGJA 3GE1A 3IMXA 4MLEA 2A5XA 4B1WB 1LCUA 2YI1A 3MCPA 4B1YB 4WQ5A 2HF3A 2I7PA 5AQPA 2A3ZA 4C23A 4JN4A 1V4TA 2HMPA 3CI5A 3QMLA 3FGUA 3LM2A 5AQWA 1H1VA 2DPNA 2V52B 3QBXA 1GLAG 3W3DA 3ZEUA 1BWFO 5AQIA 3GBTA 4BVOA 2J4RA 2Q0RA 2AA4A 2QWQA 1BDGA 5JLFA 2D4WA 3ENHA 4RCHA 1KAYA 2IVNA 3AAPA 4NB4A 1DKGD 3QB0A 5KQ8A 2QWLA 4K41A 3DXMB 3C0BA 3DJCA 5F2RA 4DHYA 3VEOA 2VWBA 4BRFA 4BRKA 2Q31A 2NRHA 4QS7A 2GELA 5EX5A 5AZIB 2E8AA 1BUPA 3M6GA 3CJBA 3O1WA 3KHYA 2ZF5O 5BRFA 3LDLA 4CZKA 4DQ8A 2V7ZA 2P9SB 3VENA 3J8AA 3VGKA 2YCHA 3B8AX 1JCGA 4WQ4C 5ELZA 1ATSA 3O08A 4BR0A 4BREA 1QZ6A 1GLEG 2ZGYA 3VF2A 3DXMA 3GOIA 3BEXA 4FO0A 4IZ9A 3HI0A 4ISFA 1NM1A 3ENOA 2HOEA 3CQYA 5I9EB 1D4XA 3LDNA 2VYPA 3VGLA 2Q2RA 4XH1A 1K8KB 4M7YA 1XC3A 1WOQA 3I33A 5AZIA 5AQTA 4FWOA 2KHOA 3CJ1A 4BR7A 4QS8A 3H1VX 3BF1A 3ZX2A 3EN9A 4O5FA 3VEYA 4BRNA 4B9QA 1EQYA 3D2EB 5JLHA 2P9SA 3HSCA 2A40A 3O80A 5AQSA 4I6MB 1T6DA 3WXKA 2YHXA 4BRLA 5BREA 4BRGA 3FZFA 5BPNA 4K42A 1G99A 2YJFA 5KPZA 1C0FA 5ADXH 1Y64A 2YHWA 5E84A 5AQQA 3VEXA 5LY3A 3ULEB 1K8KA 2CGKA 4CZLA 1Q18A 5LJVA 2FSJA 4CJ7A 4CD3A 1LOTB 4BGBA 4MO4A 4JD2A 4BQLA 1NGHA 3HM8A 4BVPA 4XEIA 1TUUA 3R8EA 3M1FA 1HX1A 3A5NC 4BGAA 4CBWA 3D2EA 4MLHA 3SLCA 1MWKA 1KAXA 3KZBA 3GG4A 3H46O 2ASPA 1HKBA 4AM7A 4BC5A 1P8ZA 4CZIA 1QQMA 3OHRA 5AZJB 2E2QA 2E20A 1YVNA 1BU6O 3FFKB 5AFUA 3IFRA 3ID8A 2A42A 3RSEB 2BTFA 5TKYA 2HF4A 3VETA 2E1ZA 3WEEB 3ULEA 4A2BA 5BRHA 3C7NB 4FPBA 5EXWA 4IWVA 5E26A 4QS9A 3D7EO 3H6EA 3A5MC 3FLCO 3KVGA 3WXIA 5AQUA 5F1XA 3WXJA 4CZMA 3CJCA 1TUYA 3EO3A 1NGDA 2ZGZA 1QZ5A 3BF3A 4M63C 3SJHA 3MK6A 4BC2A 4FPAA 1NBWA 4B1XB 3EZWA 1XQSC 4IO8A 4WQ4A 2Q97A 4DB3A 1QHAA 5BPLA 5JMVA 3JS6A 2Q1NA 3FR0A 4FSVA 4B1ZA 4BRCA 2PBDA 5AZJA 3QDKA 3QFUA 1ZC6A 3CERA 2QWRA 3A8YA 5AQZA 3TU5A 1QQOA 3RSEA 3SMSA 1CZAN 4ISEA 3GL1A 4YDUC 3L0QA 4FWSA 5FPNA 3WEEA 1MWMA 2GWKA 3C7NA 2QWOA 3U8XA 3HTVA 4BRPA 1R59O 3F9MA 1Z05A 1NGEA 5JICA 1SAZA 4H03B 2CH5A 4HWIA 2I7NA 4PL8A 4BRDA 3CHWA 4CBXA 1NGBA 4B1UB 1BO5O 3H1QA 1S22A 5FPDA 2E2OA 2QWPA 5AQHA 4A2AA 2QWMA 1BA0A 4K25A 5AQOA 3D2FB 3VERA 3MN6A 1GLLO 2ASMA 4BR4A 3WUHA 2D0OA 3QFPA 5AQLA 4KBOA 4MO5A 2F9WA 5BRDA 3WQUA 3BUZB 1GLDG 1HKGA 2F9TA 2EWSA 4K43A 3ZETB 3MN5A 5LJWA 3FZLA 3A5LC 1JCEA 3AY9A 4JD2B 4CBUA 3MDQA 4BRMA 4AM6A 3VF6A 3IUCA 2QM1A 2OANA 3O8MA 4BRIA 4XH5A 5AQRA 4BRAA 4H5VA 4CZJA 3O5BA 3CIPA 2VCPA 3D2FA 5AQYA 1RFQA 2W40A 4PL7A 1SQKA 1ZBSA 4H0XB 3UKRB 3FE1A 4J8FA 1MA9B 2E2PA 2FF6A 4PKHA 4F9OA 1X3MA 4CZEA 4GY2B 2V51B 3AAQA 1RDWX 2GUPA 3ZETA 2P9KB 5CE3A 4CI6A 4IJNA 4BG9A 4CD1A 5AQNA 3VGMA 2IVOA 4BC4A 1DEJA 3GDQA 4FOEA 3QBWA 1HLUA 5FPEA 4RWTA 4RTFD 2Q0UA 1BA1A 3VPZA 3P4IA 3U9DA 2YJEA 3LL3A 4BROA 1NGJA 5KPRA 2GEMA 1TYQB 3UKRA 2E88A 3QICA 1S3XA 1XUPO 4YDUA 2E1YA 3U4LA 4EHUA 1RGIA 2P9KA 3EKSA 3M3ZA 1ZXOA 4ISGA 3TPQA 2GTDA 4IXCA 3U9ZA 5EY4A 5AQMA 4H5TA 2YHYA 3ATUA 3ZX3A 2P9PB 4H0YB 3UB5A 1NGFA 5AQVA 5BN9A 4HTLA 3SK3A 2CH6A 3LM9A 2ITMA 2IIRA 4BR5A 2FF3B 3CJ7A 5AFUH 3CQXA 1T44A 4H5RA 2D0PA 1X9JA 2E2NA 2BUPA 1X3NA 2QXLA 1TYQA 3CJ9A 1NGAA 4EFHA 4BRHA 3A5OC 3VF4A 3LDQA 1E4GT 1HKCA 3W0LA 3WXLA 2FSNA 3H3NO 3DXKB 3O6WA 4L3QA 3UKUA 4EIAA 4BQZA 2AP1A 4DCHA 4LC9B 1GLCG 4BC3A 2P9IA 2P9PA 4FWNA 5KPTA 3EL2A 3MN9A 5EVZA 3MN7A 4PKIA 5AQFA 3VEZA 3DAWA 3HBTA 3L4IA 1DGKN 2QW9A 1OKJA 5B8HA 2P9LB 2P9UB 2WUSA 3VOVA 1YAGA 3CJAA 3VEWA 3LDOA 4A61A 3A0IX 3H3OB 1BG3A 3AARA 5AQGA 4WQ5C 3WQTA 3L6QA 2NLXA 1NGGA 1NMDA 4FWPA 3DXKA 2UYTA 5FPMA 5F0XA 4BRQA 1QQNA 3DWLA 2A41A 4JAXA 4IJAA 4M7XA 3S41A 3VEVA 1ATRA 4CZHA 2FXUA 1NLVA 2ASOA 1GLFO 5EOYA 2D1KA 3O1BA 5AQXA 4JNEA 1MDUB 3LDPA 3ZX0A 1SZ2A 2P9UA 2P9LA 5KQDA 2H3GX 2A6AA 3VESA 2P9NB 1NGIA 4FWQA 1HJOA 3WT0A 5BR9A 1U2VB 4O8KA 2GWJA 5ADXA 1HPMA 1KAZA 1ESVA 4FWMA 2IVPA 2W41A 3FZKA 3O4WA 3I8BA 4BR9A 4WYBA 2Q36A 1U6ZA 4CZFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DLGA 2NRWA 4YORA 4DFKA 4DSJA 1GOAA 5AQKA 1A5XA 1TKXA 4JHDB 4N5SA 3ENBA 4KI4A 4DV3K 3EYZA 1BOTO 4NCAA 4LH4A 1I39A 3IKMA 3L8BA 3VMFB 1NJWA 1W7AA 5C12A 1U2VA 3G25A 4N56A 2BDPA 3CETA 4XH4A 2ZWHA 3VQPA 1VQ7N 2HBKA 1WBBA 2IS3A 3NE6A 1WSEA 2FSKA 5I42A 1HRHA 3R9PA 3UKUB 4FOIA 3ID6A 1X9WA 1NJIO 1ATNA 2OTLN 1RDDA 3DLKA 4I7FA 3R6MA 4EHTA 4Z94A 3AO3A 4CJUA 3PSIA 4Z4CA 1HUXA 5HRNA 2CGJA 1QS4A 2RN2A 3IMXA 4MQ3A 3OTOK 3L2WA 1B9FA 3MCPA 5DM6L 4B1YB 2I7PA 2W00A 1NK8A 4CIGA 2A3ZA 2C1GA 2HMPA 1Q8IA 1UA0A 3TWHA 3QMLA 2DPNA 2V52B 2QEXN 3ZEUA 4JKFA 4X66K 4CEQA 2QWQA 4ICLA 4DS4A 3THWA 2GX9A 1C0UA 1RDCA 4RCHA 1S1UA 3AAPA 1DKGD 5JVGL 2X6NA 5C10A 2QWLA 3DLGA 4M3TA 2RPIA 3C0BA 3DJCA 3LP2A 2HNZA 3S3NA 1NOZA 5JVHL 1D9DA 4BRFA 2Q31A 4QS7A 5EX5A 1XMQK 3AVFA 3AA3A 3KHYA 5M1FA 3CYMA 4JKGB 3LDLA 4CZKA 1VQ8N 4FJ8A 1HJRA 3WNGA 2V7ZA 5GAGP 3DM2A 3SYZA 4W5NA 3QNOA 4WQ4C 1ATSA 1SV5A 4ELTA 2ZGYA 3PIOL 3DOLA 1OH5A 3GOIA 1JXBA 3BEXA 3RWUA 3VTHA 4CESA 3DLRA 2O8CB 3CQYA 2JWLA 3LDNA 1FW6A 2VYPA 2Q2RA 3SPYA 3S3MA 1XC3A 4I9LA 4KHUA 4JRQA 4CGDA 4CE9A 2KHOA 2HHQA 3CJ1A 3EE8A 5CHIA 1IKVA 3ZX2A 3OYKA 1ZBLA 5JLHA 2P9SA 4N76A 3WXKA 2YHXA 3C6TA 5CR4A 3FZFA 3SUQA 4FW2A 2HHXA 3DMJA 3K5NA 4CGGA 3EEQA 5HLFA 4IOXA 1NK6A 1Y64A 5AQQA 3TR8A 5LY3A 4JI4K 4FM2A 3OYCA 1VQ5N 1K8KA 3ZCMA 3VQ6A 1ITGA 1LAVA 4E19A 1W2BM 3M8SA 4BGBA 3I0RA 2EHGA 3KLHA 1NGHA 3LAKA 3AA5X 4BVPA 1RT4A 3R8EA 3D2EA 4MLHA 3KZBA 3MEEA 4DUZK 3LZJA 3TSUA 4AM7A 3SQ4A 3PY8A 1ZBIA 4C1NK 1ILYA 1TAUA 2E20A 2F96A 3FFKB 5AFUA 3TSQA 3HPGA 3SI6A 1B92A 4Z4EA 4KAZA 1WB9A 4A2BA 3ULEA 5KI6A 5BRHA 2ZJRL 5EXWA 4HUEA 4NYFA 1WSJA 4CHZA 1U47A 1S6QA 3T1YK 3CCQN 3A5MC 5K14A 3OS1A 5AQUA 3SPZA 1VQKN 4PA1A 1VSLA 1RILA 4WFBL 3SJHA 4M45A 4CEOA 3MK6A 2G8IA 4WCEL 3C95A 4WQ4A 2Q97A 3C94A 3FR0A 3VQAA 4C8MA 5AZJA 1BIUA 3CERA 2QWRA 4PHTX 1K9MO 3I8DA 3QEVA 3KLGA 3RSEA 1JLGA 5C25A 3GL1A 4LSNA 2P1JA 2VQFK 2GWKA 4CK3A 2QWOA 3NVKA 3HTVA 1R59O 5FRMA 1Z05A 4O4GA 3P1GA 4B9VA 5JICA 4W5OA 2HHSA 3K9KA 3KLEA 4KB1A 2CH5A 3HOSA 3CHWA 2Z1HA 1NMNA 2E2OA 3S9HA 4KTQA 2D0CA 1BA0A 3ASMA 4K25A 3MN6A 4FZYA 3TAGA 4BR4A 1SKWA 1NK4A 3MXJA 2IC3A 4KBOA 3K2PA 3RMDA 5BRDA 4E7LA 3PIPL 3MX2A 4FVUA 4K0KK 2F9TA 2EWSA 4K43A 4B9UA 3MN5A 5LJWA 3FZLA 1JCEA 3ZT2A 4E0DA 3OS0A 4B3OA 1SKRA 1EKEA 4J2EA 4AM6A 3VF6A 4U7BA 1SL1A 4OGEA 3V9UA 4DMNA 4BRAA 4CZJA 3AVKA 4B8CA 5AQYA 2W40A 3TANA 3RMAA 2KFZA 3FE1A 4PKHA 1NKCA 4CZEA 3NAEA 4CEDA 1VRUA 1WSHA 1Z26A 3CCVN 1WAJA 5HRPA 2P9KB 4M3YA 4FM0A 3AVCA 1BCOA 4YOVA 3P39A 2Q0UA 4JKDA 4FXDA 3TAQA 1QSYA 3LL3A 5DM7L 4AHCA 4BROA 2KZMA 1SL0A 1NGJA 2ZQBA 5JS1A 4HHTA 3QICA 5M1PA 1XUPO 4OPJA 3NGZA 3CC4N 2NUBA 4JI8K 5AJ3K 1C0TA 3NGYA 1SKSA 4AQYK 4ISGA 5HBMA 3TPQA 3THXB 4F2SA 3HYFA 5C0YA 4H5TA 2YHYA 3ATUA 1NGFA 3O9SA 4KRFA 5BN9A 4HTLA 4OKKA 2CH6A 3J81O 1ZYQA 3CQXA 1T44A 4EZ9A 4H5RA 2HBJA 2QTDA 4F3TA 4B9LA 2XY6A 3AVGA 3LPUA 1VHXA 4KHQA 3A5OC 2BGGA 5GAHP 4YOYA 2YX6A 4MDAA 1CZ9A 2DFFA 4MFBA 1BI4A 2FSNA 1QVFM 3O6WA 3UKUA 4B3RK 4LFAK 4M3UA 4BQZA 1L3UA 1JLQA 3N4PA 2QK9A 3LP0A 3BZCA 4CEEA 4BC3A 4KPYA 2YV0X 3EL2A 2QI2A 3MN9A 4CGFA 5AQFA 3K9JA 2R7YA 3L4IA 3RMCA 1DGKN 3AVLA 4R79A 3PV8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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