1DEJA

Crystal structure of a dictyostelium/tetrahymena chimera actin (mutant 646: q228k/t229a/a230y/a231k/s232e/e360h) in complex with human gelsolin segment 1
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
375
structure length
367
Chain Sequence
DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMKAYKESSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKHEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords GELSOLIN
total genus 122
structure length 367
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dejA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1dejA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1dejA03
2D4WA 3GL1A 3S41A 3ENHA 3IUCA 3QB0A 1U6ZA 3MN9A 5AQMA 4CZJA 3DXKA 2A42A 2A6AA 2GELA 3M6GA 4CZEA 2P9LB 1XUPO 2IVPA 4JD2B 5AQSA 3HM8A 3BEXA 1IG8A 1KXPA 3HBTA 4XH1A 2YJEA 3FZLA 3H45C 3WXJA 3SMPA 3KHYA 2CGKA 3CQXA 3LDLA 5F2RA 1MWMA 3WEEB 4FWOA 1QZ5A 3MMVA 4FWMA 5AFUH 1X9JA 5KPRA 2VCPA 3UKUA 5LJWA 4B1UB 4CD3A 5KPZA 3FZKA 1ATRA 5LY3A 1NGCA 2VYPA 1QHAA 4YDUC 1IJJA 4MO5A 5AQTA 4NB4A 3U8XA 3ZX0A 1ATNA 2D0OA 4BVPA 3QBXA 4BR7A 3BP8A 3CERA 3L6QA 4FWQA 4QS9A 1MWKA 5AQKA 1NWKA 3A5MC 2Q1NA 1KAYA 4ISEA 3AARA 1GLFO 3LDPA 3UKRA 3M1FA 2YHYA 3QDKA 4FL9A 2P9UA 3FE1A 4CZGA 3I33A 3QFUA 3LM2A 1TUYA 2AA4A 2W41A 3D2FB 4MLEA 1RDWX 3HZ6A 1XC3A 4H0PA 2HF3A 4CBXA 4BR0A 4BRKA 3L4IA 2VWBA 1SZ2A 3VEXA 5EVZA 4BR9A 2YCHA 3VERA 4M63C 1NM1A 5ADXA 4BREA 4CZIA 2CGJA 4RCHA 1U2VA 5AQLA 3VGKA 3GOIA 4BRFA 4EHTA 2A3ZA 3RSEB 4CZFA 1HX1A 3U9DA 2GUPA 4B1VA 4BRMA 5BRHA 3DAWA 3DJCA 1BA1A 2P9IB 1Z6RA 4H0TB 4FOIA 1DKGD 3LDOA 3VPZA 3ZEUA 2GWKA 3ATUA 3FLCO 4BRCA 4FWPA 3KZBA 3O4WA 1V4TA 1XQSC 2P9IA 3C7NB 3IDHA 1S22A 2NRHA 2YHWA 3EZWA 5E84A 1T44A 3QBWA 3UE5A 4DCHA 3C0BA 2YJFA 3CJAA 2ZGYA 1NLVA 4H5NA 4B1YB 3J8AA 3QICA 5AQGA 2ZGZA 1JCGA 5BRFA 1BG3A 1ESVA 4ISGA 1ATSA 2I7NA 2IIRA 5JICA 4GNIA 4H5RA 4PL8A 5ELZA 1K8KB 2IVOA 1Z05A 5AQWA 4BR2A 2QWOA 1GLEG 2QWMA 1NGAA 1HJOA 5AQVA 4A2AA 2ZWHA 4BROA 2GWJA 3IMXA 5EX5A 3O80A 2F9TA 4LC9B 3A0IX 3H6EA 4CJ7A 5KPTA 3WQUA 4BRHA 4JNEA 4DB3A 2H3GX 2P9NA 4FWNA 3A5LC 5AQZA 1NMDA 3GE1A 3HSCA 3CETA 2P9SA 3LM9A 4XH5A 5ADXH 3WEEA 1NGGA 2GEMA 5AQIA 3WXIA 2PBDA 3KVGA 4NO7A 3O08A 3FZFA 1QQOA 2ASOA 1SAZA 1YAGA 2P9LA 3F9MA 2E20A 4M7YA 2E2PA 5FPEA 3O1BA 2V51B 4JHDB 2QXLA 1T6DA 4JD2A 5TKYA 3JXUA 4FSVA 4L3QA 3ZX2A 4WQ5C 3A5NC 3O5BA 3AAPA 2QM1A 3MN7A 4IO8A 4K42A 1GLAG 2Q0RA 3CJCA 3P4IA 3VGLA 3H1QA 4DQ8A 1R59O 3M3ZA 3B8AX 4WQ4A 1BA0A 5AQUA 5AQOA 4H5TA 3LDNA 1QQMA 3W0LA 1SQKA 4BG8A 2J4RA 4K25A 1KAZA 3VESA 5AQQA 2E2OA 2BUPA 3ATVA 4I6MB 4H0YB 4QS8A 4BC3A 4E1JA 1DEJA 1GLDG 4JAXA 4CZMA 5KQDA 1RGIA 3ID8A 1BUPA 5AQHA 1E4FT 4AM6A 1RFQA 1JCFA 4A2BA 5BRDA 2YI1A 3ENOA 4RTFD 1GLJO 5BPMA 2P9KB 1GLCG 4PKGA 3CJBA 1MA9B 4IZ9A 2WUSA 2CGLA 2ASPA 3MDQA 4EFHA 2FSNA 4ISFA 2KHOA 2V52B 3D2FA 3O6WA 4M7XA 4BRDA 4BR5A 5KQ8A 4B1XB 2V7YA 3FZMA 3O8MA 1JCEA 2IVNA 4FWLA 3JS6A 4BG9A 3ULEB 2AP1A 4H5VA 1BDGA 2E1ZA 1QQNA 3W3DA 4H0VB 3H3OB 2CH5A 3VOVA 4CZLA 5EY4A 1BU6O 2NZTA 4BRAA 3D2EB 1YVNA 3EL2A 4A61A 4K41A 3RSEA 3EKUA 3OHRA 4Y0WA 2QWNA 3FR0A 2UYTA 3TU5A 4BRLA 3CJ7A 4BC5A 2HF4A 1HUXA 3CJ9A 2Q0UA 2A41A 1HLUA 3MK6A 5BR9A 3EO3A 4K43A 2W40A 4IXCA 3C7NA 5EOYA 4F9OA 1T6CA 1LCUA 3H1VX 1OKJA 1CZAN 4FWSA 1V4SA 2ITMA 4IJNA 3ZETB 4A62A 1C0FA 4YDUA 5AZIB 3EKSA 1BO5O 3SLCA 3TPQA 4B1ZA 2QW9A 3SJHA 4BC4A 1K8KA 1WUAA 5AQXA 3VEOA 3UB5A 3FZHA 4IJAA 4CZKA 2QWPA 4CZHA 4FWRA 4Z94A 1NBWA 3VEVA 3A5OC 3AAQA 4B9QA 2CH6A 4MO4A 3QFPA 3SMSA 1WOQA 1NGHA 4DHYA 2E88A 2Q36A 1ZC6A 3WQTA 4FOEA 5AZJB 4EIAA 1S3XA 3BUZB 2PAVA 3VEWA 2Q2RA 2YHXA 4EAHD 3DXKB 3VF4A 4B1WB 5E26A 3R9PA 1HPMA 3WXKA 5I9EB 5FPMA 5F1XA 3VEZA 1E4GT 1Q18A 1NGIA 4HWIA 1ZXOA 4FPAA 2D0PA 2HOEA 3DXMB 4JHDA 4PKIA 4RWTA 2E8AA 1HKCA 5BREA 4PL7A 3IFRA 2ZF5O 3SK3A 1HKGA 4CI6A 2V7ZA 4BRNA 2Q31A 3DXMA 3GBTA 3H3NO 3FGUA 1ZBSA 3QMLA 3UKUB 3CIPA 3WUHA 4C23A 5FPDA 1TUUA 1Y64A 2Q97A 4HTLA 2FSKA 4H0XB 2FF3B 2FLOA 4H5WA 4I6MA 5CE3A 1G99A 1GLBG 3HTVA 4WYBA 1X3MA 1EQYA 3DWLA 2EWSA 3GDQA 3VEYA 3VF2A 3BF3A 3FFKB 1YXQA 4IWVA 3LL3A 2A40A 3VGMA 5BPNA 3MN6A 2P9PB 1GLLO 1YUWA 1D4XA 4FO0A 3H46O 1TYQB 2P9KA 3AY9A 3UKRB 3G25A 4BVOA 3CHWA 3VETA 1X3NA 2P9UB 2BTFA 2P9PA 5AQPA 4XEIA 4J8FA 4O5FA 1TYQA 1BOTO 4PKHA 4CD1A 3LDQA 4O8KA 3L0QA 3BF1A 3VF6A 3MN5A 4BQZA 2OANA 2E1YA 4MLHA 5BPLA 5FPNA 3ULEA 4BQLA 3CJ1A 1U2VB 1H1VA 2ASMA 1BWFO 2D1KA 4BGBA 3R6MA 3U4LA 3WXLA 2FSJA 5AQFA 3CI5A 5AQJA 3D2EA 1NGBA 4WQ5A 2QWRA 5JLHA 4WQ4C 1NGFA 1KAXA 2QWQA 4AM7A 3GG4A 2E2NA 3ZEUB 1DGKN 4H03B 2I7PA 2QWLA 5AR0A 3U9ZA 5LJVA 2FF6A 5AQNA 4GY2B 3O1WA 3WT0A 2GTDA 5AFUA 4BR4A 3R8EA 4FWKA 4H0OA 4BRPA 4QS7A 4FPBA 2DPNA 2HMPA 3HI0A 3ZETA 3D7EO 3CQYA 5AZIA 1C0GA 1LOTB 4CBWA 4BRGA 5JLFA 4BC2A 5AQYA 5AQRA 2A5XA 4XH4A 1MDUB 2F9WA 3EN9A 3I8BA 4KBOA 1QZ6A 5B8HA 5F0XA 4EHUA 1HKBA 4BGAA 4BRIA 5EXWA 3A8YA 3MCPA 5BN8A 1J6ZA 1NGDA 1NGEA 2NLXA 3ZX3A 4BRQA 2P9NB 4JN4A 1P8ZA 2P9SB 5JMVA 1NGJA 4CBUA 5AZJA 2E2QA 5BN9A 2FXUA 3VENA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D4WA 3PX6A 3S41A 3J7YP 1BI4B 3QB0A 2GX9A 5JS1A 1SKSA 3DXKA 3NAEA 4G9ZA 2A6AA 3M6GA 4CZEA 4CECA 4I9QA 5AQSA 2ITGA 5HP1A 3HBTA 1WBDA 2YJEA 4Z4GA 3WXJA 4GV3A 3LALA 3LDLA 3OS1A 1X9JA 3UKUA 4FK0A 1OVQA 1WSEA 1GOBA 4CD3A 5E41A 1C1CA 1NGCA 1RDCA 4MO5A 4NB4A 3ZX0A 3J81O 4DS5A 4V19S 4DQQA 4GV9A 3HO1A 4C8LA 3G10A 2YX6A 1NWKA 2Z1HA 5CZ2A 2DFHA 2YHYA 1YIJN 2O8CB 1SKRA 4F2RA 1TUYA 3PV8A 2W41A 1NMNA 5JVGL 5CHIA 4CJFA 3SV3A 3C6TA 1W2BM 2JGUA 4CBXA 2G8VA 4BRKA 3L4IA 1S6PA 4DMNA 1TK0A 5EVZA 1RDAA 3D0PA 3AA3A 4B9UA 3V1OA 4BREA 1L3VA 4CEQA 3O9QA 1TL3A 4B08A 1LWFA 1VSIA 2YKNA 5EU7A 4CIGA 1U04A 1WSHA 2O8EB 3U9DA 4DV2K 3O9UA 1B92A 2GUPA 4HUFA 4FJXA 2B5JA 4FOIA 1DKGD 5C24A 4Q0BA 2GWKA 1XC9A 1NJIO 3ATUA 3FLCO 4FWPA 3T7ZA 1BQNA 3HOTA 4AHSA 2NRHA 1VSMA 5M1NA 3EY1A 4DTXA 1U45A 2ZGYA 3C0BA 2G8WA 4FZXC 1TVRA 2ZGZA 4JKGB 4ISGA 1VQ6N 4GNIA 3VA3A 3QESA 1J5OA 4BR2A 1HJOA 3SAFA 4C8NA 3ZSQA 3ALYA 2OZSA 4XJXA 1LV5A 5EX5A 4KAZA 4KH4A 4B3MK 2P51A 3LZIA 3MEEA 3SV4A 2P9NA 3GE1A 3MWTA 1NK9A 3V1RA 1IKYA 1NJXA 2G8UA 2IGIA 4JLHA 4O4GA 2QEXN 2OPQA 1BI4A 1RTHA 4DTNA 4NO7A 5LMUK 1VQ9N 2ASOA 4WFAL 1SAZA 2YKMA 3IKMA 3QIPA 4M7YA 2HHUA 4JI3K 4ILJA 3PO5A 3ZX2A 4NYNA 5KRSA 3AVHA 2QM1A 3MN7A 4JI1K 2XO7A 4IO8A 1RTDA 4JI5K 2UXCK 3H1QA 4Z4HA 4BDZA 3ULDA 1T05A 4N56A 4A57A 3W0LA 2NRRA 1KRPA 4EZ9A 4WE1A 4B8CA 2J4RA 3AVKA 4K25A 1KAZA 4CFAA 4FYDA 1F21A 4H0YB 1MU2A 4E1JA 3KK3A 5KQDA 4LSLA 4AHUA 3OY9A 3CYMA 2VGNA 2IOCA 4AM6A 1KFSA 2C1IA 3ZSXA 3HYFA 5BRDA 2ZD1A 1T03A 3T1AA 1KLNA 4NLBA 3V1QA 4PKGA 3H08A 3DRSA 2B6AA 3LDSA 4F8RA 4EFHA 2O8CA 2KHOA 3O6WA 4M7XA 4DR4K 2EX3A 1TGOA 4M41A 3F2KA 3JS6A 2AP1A 3RMCA 4CEBA 3NVMA 1TKXA 5EY4A 3G0ZA 2E6LA 1WN7A 4K41A 5M1PA 1FW6A 2O8EA 5GINA 3OJUA 1LAVA 2P5GA 2QWNA 4KTZA 1NK8A 4C8OA 3CJ7A 4BC5A 1UOCA 2UXBK 3MK6A 1RT5A 3EO3A 4JI8K 3K9JA 3H1VX 3MEGA 1P90A 2ITMA 4JKGA 4F3TA 4M42A 4DF8A 2IDOA 3DLEA 5HOOA 2BE2A 3AVJA 4J2DA 4JI2K 2OPPA 2G8HA 4CZKA 3KD5E 4FWRA 4W5OA 2QK9A 3VEVA 3C95A 3QLHA 4MO4A 3QFPA 1WOQA 1HNVA 3VTHA 4ICLA 3LP3A 2E88A 2Q36A 1YVUA 1ZC6A 4NCBA 1KLMA 1WSIA 4IG3A 1YI2N 2W00A 4GKKK 4C1NI 3C6HA 2YNHA 3VF4A 3MAQA 3M8PA 4JRQA 2NUBA 4ELVA 3E01A 5M1QA 1E4GT 1Q18A 2NRXA 4BACA 4HWIA 4LFAK 1ZXOA 4X64K 2D0PA 3DXMB 4RWTA 1IKXA 2OCEA 3THXB 5BREA 4PL7A 1JLEA 3IFRA 3F5TA 5D3GA 2ZF5O 1HKGA 4AHVA 4PA1A 2V7ZA 2Q31A 3GBTA 1ZBSA 5TKWA 3HOSA 4DLGA 4O44A 1CXUA 2Q97A 3TAPA 3LANA 4FLWA 4H0XB 3SPZA 4K0KK 3QEPA 3HTVA 1GLBG 3K5OA 4WYBA 1C0TA 3KLFA 3KLHA 1QTMA 4DSKA 4U67L 1BGXT 4M3XA 3VEYA 4CJ3A 1S9EA 3RMDA 3KLGA 2E5LK 4LF6K 4B3OA 1U4BA 4E7IA 3NBPA 4FO0A 3H46O 2F8SA 3UKRB 3CHWA 3S9HA 4WFBL 4J8FA 4O5FA 4W5RA 2Q3SA 4DTUA 4PKHA 4I2QA 3LDQA 3M8SA 5DM7L 1WLJA 3SUQA 4MLHA 1TV6A 4IDKA 4WFNL 2GUIA 3AVAA 3CJ1A 1K8AO 3R3LA 4FJ7A 1H1VA 2D1KA 4BGBA 1S72N 3DLHA 3DRRA 1VSHA 4DTSA 1W9HA 3E9LA 4KHQA 3O3FA 5AJ3K 1NGBA 1Z26A 5HLFA 1K6YA 2FBXA 1NGFA 4AM7A 2VWKA 4IFEA 4O8UA 4KTQA 4FW1A 2OA8A 5AQNA 4CJWA 3B6OA 3CFOA 4RW9A 3OYDA 4H0OA 4BRPA 1DLOA 4CIEA 2LSNA 3HI0A 1LW2A 3KD1E 3PLAA 2HBLA 4JYAK 1KCFA 4LF8K 4BC2A 5AQYA 5AQRA 2A5XA 2W6KA 3RMBA 3EN9A 3QEVA 3SZ2A 2QKBA 3MCAB 2HBJA 1QZ6A 4EHUA 2HBKA 1HKBA 3SJJA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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