1DIWA

The hc fragment of tetanus toxin complexed with galactose
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNEESEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
source organism Clostridium tetani
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TETANUS TOXIN HC
total genus 110
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1diwA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1diwA02
1AXZA 2KLLA 1WLDA 4GWMA 3V65A 3WG4A 5GALA 4F83A 2GMMA 1AF9A 1PUUB 2D6OX 4EB2B 1I1EA 5DUWA 2R0HA 2P37A 1W6PA 4DCKC 1WBLA 2NM1A 4C1WA 1SLIA 5T5OA 2FFVA 2UWBA 3NV3A 3WO2A 1URXA 1GANA 1WW4A 4TLPA 4IY9A 3AH4A 1D0HA 3SH3A 3RQ0A 2A7AA 5AVAA 4HJJA 3DUIA 1QU0A 3WLUA 4GP0A 1FN0A 4I7IA 2AH2A 3FBYA 1F5FA 4OW4A 2FDBM 2W39A 2CTVA 1Q8PA 2FO1A 4XTPA 5F5QA 4YZ3A 1GSLA 3WINC 1ENRA 1SR4A 2HWMA 2CL2A 1MS8A 2Z49A 1X50A 3INAA 5T50A 1G82A 1LEDA 3NV1A 3TB0A 9ILBA 4BLIA 3O0VA 1BKZA 1VAMA 4Q9PA 4LBQD 1W0OA 3PG0A 5FZUA 1RZOB 4PCRA 2AGSA 3O12A 3ZYRA 1WD3A 3ILNA 1JYCA 3ILFA 1JLYA 4Q8KA 2JKBA 3CA1A 1N1VA 1CVNA 2VH9A 1W6OA 2NTDA 5EWSA 3VT1A 4P6AA 4YW4A 3SNMA 4XFSA 5KXDA 3I2AA 4QD2C 4YW5A 3C2UA 2C5DA 2I2SA 2V5YA 2ZHKA 4YOLA 3AZZA 2H0BA 1RITA 2D3RA 1C1FA 5BXSA 4YGDA 2ZGQA 4I4SA 3WMUA 4M3CB 3BRDA 3N7LA 3V0AA 1EV2A 1G7YA 1YIFA 2IWTB 4I1EA 1O4YA 1WBAA 1J0SA 1Q8QA 3SLIA 1SLAA 1Z2VA 3AYEA 2GNMA 3VKNA 3LSDA 2E4MA 3AP4A 4C1XA 1A78A 1SBEA 3O4OA 1HWOB 5BOWA 1N47A 2D43A 1OKQA 2OW4A 1DZDA 1ENSA 4XTMA 1CJPA 5D63A 5KXCA 1F9KA 1ONAA 2LALA 3AKHA 4I2SA 1W3FA 2JJ6A 2RG9B 3A0KA 2VSAA 3R4UA 1ITBA 4QALA 1LTEA 4LBKA 2P3KA 1V6KA 4Y22A 1LENA 5H9RA 1DLLA 4WV8A 1QQLA 1ONKB 1AJKA 2K8RA 1CPNA 3UK9A 4BLJA 5H9QA 1MS1A 3ZYPA 3JRRA 2FGFA 1LHNA 3MW4A 4PQ9A 3VV1A 4FQ4A 2VSEA 4FPYA 3D5OA 3AP6A 1VAVA 4AVVA 4LBLA 2YZ4A 4Z8SB 3WINA 1LHVA 5F90A 4XBLA 1LHUA 4ATFA 5SV8A 1CVSA 4J2XA 2SLIA 1HIBA 3B69A 4OUJA 2GNTA 1AVXB 5DG2A 1UZYA 2ET2A 2ZGNA 4OEFA 5HCBA 4MYEA 3BX1C 2AYHA 4XKIA 3FLPA 3SISA 2A70A 5IT6A 3WHUA 1KRIA 3QYDA 4BMEA 4IZEA 4PBPA 1JQZA 3KM5A 4Q1RA 1QMJA 1WCSA 1AX0A 2BQPA 5DXDA 4JPZA 1LESA 4HL0A 4L8QA 3V0AB 2HW9A 3Q7YA 3U4XA 2GMEA 5BQUC 3I2XA 2JECA 4I4YA 4LO1C 3D7WB 1HWPB 1CONA 2WQZC 5F8SA 1YI7A 2PELA 2FFUA 1IRAX 3T2TA 3NV2A 4K21A 2D22A 1MS5A 4J2SA 3AXEA 2DUQA 4A7KA 2GN3A 2DTWA 3M3EA 3UJQA 5DSSB 4XMIA 3AJ5A 2VW2A 3RS6A 2EXIA 1IILA 3HMYA 1KNMA 4LO8B 1BFFA 1HWMB 2ZGOA 3SITA 2EAKA 5IK7A 4G9MA 2NMOA 4YLZA 1BASA 3QCWA 2TEPA 2DVFA 1IS3A 2LTNA 5EG6C 5CA6A 3ZXGA 3MW3A 4Y22B 3DGTA 3BB2A 1OQ1A 4LO2C 3OBTA 1BQPA 4GKYA 3M1HA 2R0FA 3C9ZA 3NV4A 1W3GA 2ZAAA 4LO3C 1PWAA 2D23A 1RINA 2GMPA 1W6NA 2DWRA 4NO4A 1ULDA 1UN1A 1E0OA 3FJJA 4EFQA 4U36A 4IONA 1XYFA 2P23A 1HLCA 3KQRA 5FRAA 1HQWA 1YYNA 3LTQA 3CRIA 2BEAA 1DHKB 1H9PA 1TIEA 4I4UA 1BYHA 2WT0A 1ENQA 3GNEA 1S0BA 3NBDA 5E88A 4Q2FA 3B3QE 4XJWA 1SLTA 3WUCA 1LOGA 1DQ4A 1QDOA 4ITCA 3AKGA 3NBEA 2VXTI 1Q8OA 4A7YA 2GALA 3CA3A 4JP0A 1V6LA 2A5ZA 3AH1A 3O4BA 1IS6A 4XBNA 2P3JA 3FLTA 1N3PA 4ZFUB 3H6QA 2WT2A 3HSMA 4U2AA 1WLWA 1JN2P 3ZXKA 1XG6A 1CR7A 4QD2B 1EYLA 2ZGUA 1B09A 4YZ4A 4Q8LA 4P0LA 3O4AA 4F34A 3GALA 1K5VA 2D7FA 1G9CA 1FAYA 1AZDA 4LBQB 5DUVA 4R9CA 1JT4A 3O5WB 1DJSB 4DENA 3N0KA 2XG3A 4R9BA 4OWJA 5BQUA 1ISZA 2DU1A 2E51A 2D3SA 1AXMA 1LEMA 2D3PA 2X2SA 1IRPA 4HR6C 4FPHA 1PC8B 4I8MA 3ZXEA 1QQKA 4FOQA 3WO3A 1QKQA 3CNAA 3WHTA 1VLNA 2A6WA 1DFCA 3IMNA 5IK4A 1WLCA 2ZABA 2ZHLA 1HKDA 3QR5A 4YW2A 3IAGC 3ENRA 2MIBA 2ARBA 4XJZA 4H04A 3N7KA 4IZXA 1IHKA 1FQ9A 1UL9A 2BFHA 2UWCA 2DUPA 2WRYA 4UW3A 4UW4A 4YM2A 3V64A 4GAIA 3VKMA 1DQOA 3WCRA 5DUXA 4L4IA 3FJ8A 1MS4A 4QO3A 3H6RA 4WVWA 4LO2A 5CNAA 1W6NB 1HCEA 1QOOA 2R1DA 3WA1A 1ISWA 4ZXKA 1LCLA 4WVVA 3BIWE 1R8NA 1WBCA 3WV6A 4LO3A 1GZWB 5GM0A 4XYXA 3WDWA 2K4AB 4FPJA 4AVTA 3VUOA 2AREA 3AZXA 3A07A 3ILAA 5G00A 2WBCA 3M3OA 3BAHA 3N36A 1PZ7A 1LHWA 4CJMA 1QOSA 1ULFA 4QC4A 3FUOA 2MLLB 4I4VA 3BAVA 1MS9A 1II4A 3Q9OA 2CY6A 2ESUA 5DUYA 3PJQA 4M01A 1S0FA 1CN1A 5GLTA 4M3CE 1DYPA 2ARXA 4FPLA 1I3HA 3USUA 5H9PA 3IPVA 4GOVA 4YG3A 4FGFA 1RMLA 3OJMA 2R9KB 3P6IA 2E7QA 1V6NA 5T5LA 3NWKA 3O4CA 1N4KA 1YO8A 1CPMA 5E8AA 4JRAA 1MR5A 3FJFA 4LBNA 1GLHA 3MALA 1NZKA 4IHZA 5BVPI 4XFUA 31BIA 2LIEA 4I4QA 3BAQA 1P63A 1FMMS 3BAGA 1QGLA 1SACA 3D4KA 4FQZA 2VY0A 2YY1A 1ZM1A 3WNXA 2IHOA 5GLWA 1AXKA 3O4DA 4J2YA 2GDFA 4XBQA 2KI4A 1FGAA 1Z0HA 1HKNA 1DZQA 4QBVA 4D8HA 4I4PA 3UJOA 1S1AA 2ZMLA 4G6JA 2E7TA 4Y20B 2DVGA 4X37A 1V6OA 4Y24A 3AFKA 3PMEA 1XZZA 4H55A 3HOMA 4AGVA 4I1BA 3MEPA 3CA6A 5D61A 3H6RB 3R05A 3A22A 3NBCA 1KJRA 3O49A 1GICA 3FJKA 4UW6A 1YXWA 1DZCA 1W6MA 3AJYA 4XILA 3E8LC 1IS4A 2UWAA 2A3WA 3PHZA 4YZ2A 2Y9XE 4DS0A 3OJVA 2AENA 1L2HA 1MZ5A 2AR6A 1W6PB 3FJAA 1UX6A 1M2TB 1LECA 5DZFA 3WG1A 1S0DA 5JOYA 3BA5A 3BAUA 1JY0A 2JDZA 3R4SA 3RSJA 1T4QA 4EFPA 1JT5A 4ISQA 3SH4A 5CB7A 2D44A 1DIWA 2W52A 4AN7B 3HALA 4XFTA 1LGBA 4I3NA 5F9TA 5F8WA 3BAOA 2C9AA 4ZA3B 3USUB 1HCDA 1G8WA 4KEIA 3RRDA 3W58A 4FOVA 1WW5A 4DFSA 1J1TA 3AP5A 3MPPG 4XIKA 2GN7A 4QKSA 2DVBA 1GYKA 1C57A 2AAIB 3MW2A 1IS5A 4JC1A 2D20A 3WG3A 3POKA 2I1BA 4P9WA 2KM2A 1FWUA 4P14A 4QKRA 2ZGKA 3HR9A 3W59A 1MS3A 2Q5TA 4LBMA 4OWKA 2ZR1B 3WO4A 2D24A 4ZFWB 1CESA 3CAHA 2R16A 2DURA 2CWSA 1W6OB 2EXKA 3T1LA 1N1TA 1TP0A 2A71A 4J23B 4ZKTB 3BTAA 7I1BA 2F8XC 4Y1ZA 3ZXJA 4YZ1A 2ZGSA 4LBOA 4G9NA 3VSFA 3A23A 2UURA 3OYWA 4YW3A 1V6UA 1JW6A 1TWEA 2ERMA 5I1BA 1V6MA 4GWNA 1BFGA 3OGFA 2Z42A 4BPZA 1JT7A 4FPCA 3IM0A 1LJ7A 5JDBA 3F62B 1SFYA 3ZC8A 1ULEA 1V6IA 4GXLA 1LU2A 1IT0A 4XZPA 2QN4A 1UAIA 3BRGC 2JE9A 2VW0A 4QBCA 1FNZA 4GKXA 1G86A 2L5XA 3WVJA 1MVQA 5DVHA 3V0BA 2ZQOA 2EXHA 3BOPA 1V00A 5JOXA 1DGLA 4Z9WB 5FNXA 4EEEB 3PVNA 1LOFC 4A7ZA 2W68A 2A75A 3HBWA 1RG8A 4JAWA 2E53A 1KDKA 4I4OA 3IN9A 3NBNA 3A4UA 1LU1A 3AZVA 4SLIA 2X2TA 1H30A 3ZSMA 4KEKA 2JD4A 1W6QA 4L4HA 2Y9WC 1UPSA 5GZCA 1LOAA 1SCRA 1SCSA 2GNDA 5F8YA 2P2KA 3A21A 3P53A 2WKKA 3H0OA 3POYA 4GA9A 3V79C 3AK0A 2DREA 2RHPA 3UJ0A 5FZYA 3POSA 4FPGA 3AZYA 1ISYA 2P3IA 1MS0A 1ISXA 3OY8A 4D69A 2KKIA 4DRRA 1DYKA 1U0AA 3LCPA 1GV9A 3JU9A 1JOJA 1APNA 1Z78A 1AX2A 1SBDA 2PHUA 1C4RA 3Q7XA 3TC2A 2ZHNA 1AXYA 1KITA 5EXOA 1M16A 3ZC9A 3VWCA 3M2MA 2EIGA 2RQ9A 1D2SA 3OGGA 3O0XA 3P6JA 3ZXFA 4BOWA 1AVBA 4CTEA 4GOYA 4GP3A 3AP9A 4X39A 2DUOA 3BODA 4RL7A 1IOBA 1AVAC 1Q8SA 2ZGRA 2DRYA 1DQ0A 3CA0A 2YUGA 3IKWA 1N1YA 3POWA 3CA5A 3OYWB 1NXD1 3FJDA 5GLUA 5IK5A 4X38A 2AUYA 1LOBA 4FOWA 2PHWA 4Q26A 1MZ6A 1FMZA 3IM6A 2VUAA 2ZGTA 1EVTA 4OEGA 3AKIA 8I1BA 2J3PA 1UZZA 5H9SA 2NVHA 2W08A 2UU8A 1Q8VA 3AJZA 2WT1A 5GZGA 4TZDA 4Y26A 1W3AA 4ATEA 2D6MA 3V0BB 4DPNA 3CU1B 4K1ZA 3Q7WA 4PC4A 3FFZA 5FNWA 2D6LX 3O3QA 4FOYA 5T55A 3AYCA 1MC9A 5CAZA 4WBCA 2ZKNA 3ZSLA 2D6NA 4ISRA 4KEJA 4I4XA 1OFSA 5JMCA 1LOFA 4LO7C 1W6QB 1VIWB 4CZSA 3VT2A 2ZHMA 1N3OA 3IM5A 3AYAA 1SBFA 1MACA 5GJ6A 5CBLA 3WDUA 1PZZA 5DZUA 4Z8BA 3I29B 4XJUA 5GZDA 1AJOA 3S8KA 2FMDA 4PF5A 1R8OA 3IM7A 3AH2A 1TOOA 4M3CA 3D6EA 3RTIB 2RSTA 2ZBJA 3AP7A 2B7YA 4AVSA 5FREA 1CQ9A 1GKBA 1Z4SA 4YG6A 1QDCA 4KBBA 1V6WA 4DQAA 4FP2A 3VT0A 1DQGA 1QNWA 1S0GA 4R6UB 3W9TA 3UD7A 1BJQA 1N1SA 5HPZA 1HWNB 2A3XA 4YW1A 3ILRA 3FJEA 2CNAA 3WZ1A 1QNYA 1SLLA 3B9CA 5D62A 4GAFA 2AQZA 3BA4A 5BXPA 1QOTA 2D6KA 4JCKA 2ES3A 2KH2A 4XE9A 1A3KA 2WLQA 4KC3A 1PZ8A 1AX1A 5FZZA 2OUJA 5KXBA 2D7IA 2PHXA 1EPWA 2VLCA 2ZGLA 4OWLA 4Y1UA 3ZVXA 2QYIB 1AVWB 2UUSA 3IIRA 2A6XA 4FPOB 2MC2A 1TTUA 3QLQA 3CA4A 1S0EA 1S0JA 4Y1VA 1JUIA 2A6ZA 4G1RA 5BYNA 2GZBA 3I8TA 2V73A 1OQLB 5B2HA 5EHAA 3AKFA 3BADA 1SZ6B 1FATA 3N7MA 3NJ5A 3TAYA 4XXAA 2YROA 4LBJA 5L73A 3VKOA 1V6VA 5T54A 4JKQA 4UW5A 5IK8A 1BLDA 41BIA 2K43A 2DU0A 1ABRB 4OEEA 5LK5A 1LGCA 2PHRA 3L2YA 3PUBA 3B00A 1SLBA 1IKPA 3UDAA 4ZGRB 1TWMA 2R1BA 2ZZJA 5E89A 1TFMB 3AZWA 4YM1A 5JOZA 3B9UA 3F1RA 1DQ6A 4BQ1A 1LGNA 3ZPYA 3S8JA 3VEQA 4XHXA 2KI6B 1G9AA 1QXMA 5DZGA 1JT3A 2OVUA 1AFCA 2Z48A 2ZQNA 2YMZA 4USPA 2A6VA 2WSVA 4BM8A 1JBCA 3VKFC 1S0LA 4IYBA 4ZFYB 5KXEA 5EC5A 1JTCA 2NN8A 5DZEA 3WDYA 2D6PA 4XHBA 1A8DA 2XOAA 4EKXB 2NYYA 1VALA 1UMZA 1S0IA 1Q56A 4RA0A 1BLAA 3B01A 2YV8A 2DRZA 3FUQA 1H9WA 21BIA 4DRVA 4XXPA 2P39A 3WUDA 3SNVA 1N3QA 4YM3A 5BXTA 1DQ2A 4P0JA 4OZXA 4BMBA 1Y7BA 1KJLA 4ZBVB 3ZSJA 4I0YA 2DS0A 2LIQA 3VSZA 1C1LA 3RMXA 2A3YA 1IOAA 2D7RA 3ASIA 3K1XA 3N3HA 3O0WA 1BFCA 1LODA 1MVEA 3I4IA 1Q04A 1LOCA 5GZFA 1QF3A 5JVVA 1Q03A 2DTYA 3IPVB 1WW7A 5GAQA 2YXSA 5E24E 2E6VA 1XHBA 3N35A 2VU9A 1I1BA 4I96A 4XJAA 3CRGA 3SH5A 1YF8B 2GNBA 1CE7B 5GZEA 2ZA9A 1NLSA 4ZLBB 4P9YA 3WOGA 2F2FC 4FPKA 3H6SE 3FJCA 4M00A 1BA7A 3FJHA 3BA7A 1KQRA 3LLPA 2EXJA 2AXMA 2Q9XA 3APBA 1DQ1A 3CQAA 1CIWA 1G9DA 4YFWA 2PHFA 3AJ6A 4XIOA 1TEIA 3LSEA 5JLVA 2P34A 4CRQA 4XJ9A 1F31A 1ZA4A 4IY8A 1IKQA 3JUUA 3OPZA 1JYIA 2HWAA 4AYUA 2CWMA 2NP0A 1RY7A 2AFGA 4AWDA 1KDMA 2Q3NB 1GBGA 1FYUA 4LO7B 5BP5C 1G9BA 2WSUA 4D0TA 4I37A 4X3AA 3WDTA 1JHNA 4LO0C 4GALA 4YGBA 3VKLA 2HZ9A 2NMNA 5T52A 4TYSA 3WDVA 4DEPA 4J2KA 4LBQA 1T9FA 4Q27A 1FWVA 1DFQA 1W6MB 1HQLA 1VCLA 4Q91A 5DG1A 2HYKA 3OJBA 5T5JA 3N7JA 1IJTA 1PUMB 3FJBA 4K1YA 4W65A 2Y9GA 3UJ4A 2JE7A 2R49A 4Q9GA 1WUVA 1FNYA 1WBFA 4ENDA 1O4ZA 3BRFA 5HCAA 2EALA 3ZX7A 5HCFA 4JKXB 3M3QA 3KMVA 4R9AA 2DVAA 4YZ5A 4AN6A 1JLXA 3FJIA 3A0NA 4YM0A 4IQPA 4ASMB 4I4RA 3OBRA 2ZMNA 4XMAA 2GO2A 2CYFA 2NZ9A 4YGEA 1YBIA 4ZOTA 1AVUA 4USOA 3UD8A 2A6YA 4FPFA 3EF2A 3O5SA 1GZ9A 1Q1UA 5EYYA 3AXDA 4XJ8A 3ZXLA 3RTJB 2FHRA 3WG2A 1FV2A 1LHOA 3O44A 1FV3A 3UD9A 2ENRA 4Y1YA 3FLRA 4YGCA 2M49A 2PHTA 3RMYA 1GZWA 4II0A 1S0CA 3HN1A 2F2FA 4G6MA 2DVDA 4P9XA 3PVEA 2BEBA 2EF6A 2ZGMA 4YFZA 1WD4A 1GNHA 2XB6C 1ISVA 1XQNA 2DV9A 1BARA 4AGRA 3PVOA 1MD6A 3ZXDA 1PZ9A 2WNEA 2ZGPA 4XDQA 1V6JA 5GLVA 2WJSA 4YG0A 3WDXA 5JOWA 3T1MA 1SR4C 1RIRA 4WZFA 4NOTA 2OUHA 3M3CA 4FP3A 1BZWA 5DUUA 2ERFA 4D0ZA 4H9WA 4EFRA 6I1BA 4K20A 3UL2A 4P0KA 2VW1A 1JXNA 3CRHA 4I30A 4FVVA 4JQ0A 4PBOA 1ILR1 2Y9FA 4Y1XA 3FJ9A 5BXRA 1UKGA 1WW6A 1G9FA 3JUTA 1GZCA 5BP5A 4I6IA 3AYDA 2G4IA 3RG0A 4XOGA 4LO0A 3ATGA 5IUQA 1DBNA 4Q1PA 1GGPB 1FX5A 2VXRA 4LO1A 1ULCA 1ULGA 3T8SA 3WMVA 4R9DA 3WCSA 4HA2A 4M3CF 3ZSKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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