1DLLA

The hc fragement of tetanus toxin complexed with lactose
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
molecule keywords TETANUS TOXIN
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium tetani
total genus 114
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1dllA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1dllA02
1JN2P 1GANA 5E89A 1W6OA 3ILFA 4LO1C 1QQLA 2LTNA 1BLAA 5F9TA 2NM1A 5T54A 1II4A 1MACA 2KI6B 3A21A 1GNHA 2ERMA 4I1BA 2FO1A 2A71A 1LHUA 1JOJA 5EYYA 2VUAA 3NV2A 1XHBA 2KLLA 1TTUA 3WMVA 3HR9A 1JT4A 2D3PA 1OQLB 4YOLA 3AKFA 3BIWE 3H6RA 4UW4A 41BIA 1BQPA 4K1ZA 1NZKA 2JKBA 3AJZA 1ULDA 4YGDA 1V6MA 5GLWA 2BEAA 4DS0A 1QKQA 3HBWA 3OYWA 1ZM1A 1SACA 4I8MA 5IK5A 4AVTA 1Q04A 4XJ9A 2DUPA 4TZDA 5T52A 1CR7A 4OW4A 4BLIA 1JXNA 1DLLA 1H9PA 2AGSA 4Q8KA 3UJOA 5DSSB 3NBDA 2BFHA 1WD4A 2A3WA 2HWAA 4FPHA 4Q1PA 4EB2B 2R9KB 3D4KA 5GLZA 1HQWA 4XTMA 1ONKB 1W6QB 3T2TA 3QYDA 4I4PA 5GZDA 5F8SA 1BFCA 2ZGLA 2F2FA 2D43A 4BMEA 4GA9A 1DZDA 1BKZA 2AXMA 2ZMNA 3BRFA 3IPVA 3WG4A 1LOFC 1DIWA 3USUB 3O0VA 1EYLA 1LGCA 1SFYA 1T4QA 1MD6A 2VXTI 5EYXA 4LBLA 1DQ1A 2W68A 4IZEA 1HQLA 4BLJA 5FRAA 5JOXA 2ZHNA 3O49A 3BRGC 3BA4A 3RMYA 4FPGA 1BA7A 2GMMA 4XBQA 5GLVA 4Y1VA 4I4XA 1SLLA 4A7YA 5DZEA 1EPWA 3ZSKA 4H55A 4AYUA 1N3OA 1LESA 4OZXA 2GNDA 2ERFA 4J2SA 4I4RA 1TEIA 4FPFA 4Z8BA 3L2YA 4R9BA 1PZ7A 2AH2A 4YGBA 2WNEA 1UZZA 3POYA 3CQAA 3MW4A 4FOYA 2NMNA 3VWCA 1NUNA 1IKPA 1DFCA 4USPA 5DG1A 3RMXA 1BZWA 3V0AB 4AWDA 4FPEA 1JT3A 3WO2A 4K1YA 4I37A 1LEMA 1RMLA 5IK8A 3MEPA 2DVBA 3SNMA 2DURA 3O0WA 3VKLA 1LECA 4XXPA 2Q9XA 3RTJB 3AYEA 4AVSA 1LHOA 1FMMS 4XFSA 1YIFA 4CJMA 1SLIA 3WINA 2AQZA 3P53A 4DPNA 4FQ4A 4CRQA 5BXPA 1Z78A 5CB7A 2H0BA 1CONA 3M1HA 1YXWA 1MS0A 1AX1A 5T5PA 1G9BA 3BX1C 4I30A 2PHTA 4YG6A 2V5YA 3AJ6A 3BAUA 1JLXA 5HCBA 1WUVA 4TLPA 4M01A 3FJ9A 4ASMB 4G9MA 1VIWB 2Y9XE 4I7IA 4GWNA 4MYEA 1WLCA 1BJQA 4BM8A 4U2AA 2Z42A 3WO4A 1S0FA 4M3CF 1S0GA 2MC2A 1Q56A 3AK0A 2V73A 2FDBM 1FWUA 4OEEA 2ENRA 3BTAA 4Q2FA 1QDCA 4D8HA 1HWMB 1W6QA 1DQGA 2D23A 3RG0A 4QALA 5F5QA 1JBCA 3BAOA 3VT1A 2EALA 1WW5A 3VKOA 3O4OA 2NP0A 3FJKA 3USUA 1W3FA 2LIEA 1SBDA 1NXD1 1Q8SA 3ZXDA 2A5ZA 2W52A 5FNXA 3IM6A 1LHVA 4G1RA 1U0AA 4R9DA 5IK7A 1FN0A 3QCWA 3NBCA 1WW4A 2IWTB 5CNAA 3MW3A 4Q9PA 1Q8OA 3INAA 1GZ9A 1AVBA 1G9AA 4J2YA 2YXSA 4P0KA 1KJRA 1L2HA 3AZZA 1Q1UA 4KEKA 4FPOB 3Q7XA 5BQUC 3JRRA 4LO3A 1VALA 2GZBA 2MIBA 3ZSJA 1Q8VA 3FJIA 2D6NA 2FHRA 1A3KA 2GN3A 3Q7WA 3EF2A 2E4MA 3AZYA 3Q9OA 5T55A 1N1YA 1IOBA 3WA1A 1JT7A 3V0AA 1HWNB 5GLTA 4LO7B 3OJ2A 1W6NB 3ZVXA 4DQAA 1ISXA 2GO2A 2DVGA 4P0JA 4G9NA 2W08A 3WHTA 4AGGA 1WD3A 3M3QA 2DU0A 4YW1A 1LHWA 3LSDA 4K20A 2ZGNA 4KEIA 1JYCA 2P39A 1I3HA 4KC3A 3D6EA 3V64A 1ULFA 2J3PA 1Z2VA 3WG1A 4DFSA 1R8NA 2VLCA 5BOWA 5DG2A 3U4XA 1ULGA 3D5OA 3ZXFA 2UURA 3LCPA 1J1TA 2VU9A 1PUMB 5BP5A 4GP3A 4ENDA 1RITA 4Z9WB 3FBYA 4XDQA 2RG9B 1DQ6A 3JU9A 1SLCA 4II0A 2DRZA 4PCRA 4LBMA 2QN4A 3ASIA 2E6VA 2A6WA 2DRYA 4Y1ZA 2D6OX 1UPSA 1KRIA 2Y9GA 1VLNA 1CN1A 1BXHA 2FFVA 2KI4A 3F62B 3CRIA 2D44A 3BAQA 4XFTA 4Y24A 3ZXJA 3AKGA 2ARBA 3ZXEA 2ES3A 3IIRA 2X2TA 1DGLA 3WDVA 1PUUB 2ZGUA 2M49A 4I4VA 1D0HA 3WLUA 4HR6C 4R6UB 4YZ1A 1APNA 2VW2A 2A6VA 4QKRA 5EHAA 1I1EA 3FJBA 1JLYA 1QXMA 1JY0A 1NLSA 3OJMA 4YZ5A 2VY0A 4U36A 2I2SA 1W0OA 4QD2C 5H9RA 2EXIA 3GALA 3B9CA 4G6JA 1MVQA 4FQZA 3AH4A 1QDOA 3BADA 3FJDA 4JPZA 2C5DA 2DVDA 1LENA 2ZGTA 4ZKTB 1P63A 1Z0HA 1F9KA 3AP9A 2ZQNA 5EWSA 4I4QA 3B01A 4I2SA 2OW4A 1JTCA 5BXSA 1IRAX 2ESUA 3H0OA 2F2FC 1RINA 1MS3A 5DZUA 2ZMLA 3B00A 3OJBA 3AP6A 4JQ0A 5DZGA 1EV2A 4AVVA 4Y1UA 1W6NA 1Y7BA 3OBRA 3O12A 4YW5A 2JJ6A 4XJUA 3AJ5A 3AH1A 3VT2A 1S1AA 3WUCA 1HIBA 2D6LX 1AVUA 3T8SA 31BIA 5F8YA 2UWCA 2JD4A 3AYAA 2D20A 1DZCA 2R0HA 4XBLA 1IRPA 1O4YA 4YZ3A 1K5VA 2QYIB 3N7JA 2P34A 3N35A 4FOQA 3IM7A 3AP7A 4XIOA 1LODA 3P6JA 5KXDA 1BFFA 1GZWA 4W65A 1JUIA 4XTPA 2WSUA 4YW3A 2ZGRA 6I1BA 4BMBA 1HCDA 4I4YA 2XG3A 1LOBA 4IQPA 4LBQB 2DWRA 1TWEA 1W6PB 4Q91A 2OUHA 3LSEA 3FJFA 3ZYRA 1K5UA 1FNZA 3UD7A 3N7KA 2ZHLA 3C9ZA 3MPPG 3WDXA 3WINC 3HSMA 1F5FA 1IS4A 2D6PA 2NYYA 1G7YA 3TC2A 2ZACA 1BASA 1SLBA 3B9UA 1PZZA 2DS0A 3SH4A 4CTEA 1AX2A 2PHWA 2ARXA 3WZ1A 4XFUA 1SBFA 4GALA 5GZCA 2ZMKA 3KM5A 3A07A 3FLTA 2A75A 4HANA 2OUJA 5JLVA 3R4SA 4XZPA 1S0JA 3AZXA 3ZSMA 3ZC8A 1CIWA 2CWMA 2VW0A 1SCSA 3UD9A 2A6ZA 3R05A 1KDMA 1T9FA 3SH5A 4QBVA 3I29B 3ILNA 2ZGOA 4I1EA 5E8AA 2P2KA 4I4UA 1PZ9A 4HL0A 1UZYA 4YM3A 1FV3A 3BRDA 1S0LA 4XKIA 3W59A 4EFRA 4LBQD 4FOWA 4YLZA 1AXKA 4UW5A 3KMVA 1S0BA 1QNYA 3H6QA 1PC8B 5HCAA 5CA6A 3POWA 1WBAA 1YTOA 3A4UA 1WBLA 1MS4A 1IKQA 1GLHA 3AXDA 4F34A 1CPMA 2KM2A 4OWLA 1VAVA 5DUVA 2X2SA 1DHKB 1DFQA 2D6KA 4ISRA 4PBPA 2ZGQA 4FPJA 3RRDA 1Z4SA 1N3PA 1LOCA 2GALA 1A8DA 3ZXGA 3AZWA 2A3YA 3KQRA 4I0YA 2EXKA 2FGFA 2PHFA 4LO3C 1FATA 3UJ0A 3GNEA 2WLQA 1HKNA 1IHKA 1WBCA 1ZA4A 3WUDA 3SISA 3JUTA 4YG0A 3AYDA 4YFZA 2D7RA 5BYNA 3OY8B 1E0OA 4AGRA 5JMCA 2A6XA 1Q8PA 5GLUA 2AENA 1QQKA 1G8WA 4XMIA 4XILA 4LBQA 2ET2A 2ZGSA 4I6IA 1VAMA 1W6PA 1DQ4A 4AN6A 4LBOA 4XBNA 3N0KA 3RSJA 4ZFYB 3ZPYA 3D7WB 1C57A 4YM0A 5SV8A 1HLCA 1V6JA 3FFZA 2GMEA 3LLPA 2KKIA 1MS9A 2MLLB 1IS3A 2WBCA 4XE9A 4J2KA 4AN7B 4GKYA 3WCRA 1UAIA 2D7FA 21BIA 1UX6A 3O4DA 3VSZA 2P3IA 3VT0A 1OQ1A 2FFUA 1W3GA 2WRYA 3NBEA 1N1TA 4XXAA 3O0XA 1GZCA 1A78A 1TIEA 3IM5A 3VKNA 2P3KA 3UDAA 3O3QA 5L73A 3POSA 3N36A 2K43A 2NN8A 1LU1A 5DZFA 1LCLA 5FNWA 1QNWA 3WO3A 1MS5A 4ZGRB 4YG3A 1AXMA 3UL2A 4ZBVB 1D2SA 4DRVA 2RSTA 2DUQA 5T5JA 3AX4A 4XHXA 2P3JA 5GJ6A 4I4OA 3AKHA 1DYPA 4Z8SB 1G9DA 4JKQA 3DUIA 3QR5A 4R9CA 2HZ9A 4LO0A 1RY7A 4GWMA 1BFBA 1V6NA 5T50A 4LBKA 3WDWA 3LTQA 1ISVA 2E7TA 2LIQA 1W6OB 3SH3A 1QOTA 2FMDA 1G82A 2NTDA 2GMPA 3BODA 3NJ5A 2AUYA 4FP2A 4ISQA 2WSVA 4GXLA 3B69A 4ATFA 2YV8A 2YZ4A 3CA0A 4ZFUB 3IMNA 4LBNA 4FGFA 2PELA 1WLDA 3FLPA 5B2HA 4WVVA 4WBCA 1GKBA 1TOOA 1S0DA 5E88A 2Z49A 2AREA 3WDUA 2TEPA 1IS5A 1G9CA 3AP4A 1KQRA 4LO7C 5HCFA 3OY8A 2CNAA 4X38A 2CL2A 1FQ9A 1B09A 5GM0A 4EFQA 2ZKNA 3A0NA 3MW2A 4IONA 4IYBA 1G86A 4YFWA 5EC5A 5FZUA 2VSAA 3M3EA 2AAIB 3CA6A 1FNYA 3F1RA 2ZHKA 4USOA 1SR4A 3PMEA 7I1BA 5IK4A 5DUYA 3I8TA 3AP5A 1LJ7A 3A23A 3WCSA 1JQZA 4FPLA 1KITA 1MS1A 3ZC9A 1XG6A 4ITCA 1AZDA 3I2AA 3WNXA 2DTYA 5G00A 1SCRA 3Q7YA 4M3CB 1YF8B 3SNVA 1DQOA 1MVEA 4EFPA 4Q26A 1GSLA 3HOMA 2AYHA 3K1XA 3N7MA 3NV3A 2HYKA 2XB6C 2ZGMA 3W9TA 2EIGA 3ZX7A 3CRGA 3IN9A 3PVOA 2UUSA 4OWJA 3BB2A 3BAHA 1KDKA 1WW7A 1KJLA 3OBTA 3RQ0A 5CAZA 1ISZA 1LHNA 3IPVB 4BPZA 2ZGPA 1G9FA 3S8KA 1V6XA 1XZZA 3ZSLA 2K4AB 3CNAA 1AXYA 5GALA 3UJQA 1LGBA 4LBJA 2OVUA 4DEPA 4ZLBB 3A0KA 1YI7A 4HA2A 3POKA 1ONAA 3AKIA 1HCEA 1IS6A 4QO3A 1RG8A 1AVXB 2ZQOA 1V6KA 1C4RA 1URXA 5H9QA 3SITA 3ZXKA 2R1BA 2K8RA 4LO2A 1TP0A 2CWSA 2Q3NB 3OGGA 2D7IA 1OKQA 5JOYA 1IT0A 2UWBA 5T5LA 1DQ0A 5JVVA 3TB0A 4G6MA 4XJWA 1V00A 2EF6A 1W6MB 3APBA 3FLRA 1JYIA 9ILBA 1FYUA 4IHZA 2BEBA 3WOGA 1SBEA 3FJAA 2GDFA 4P0LA 1ABRB 3T1LA 1WBFA 2D24A 2SBAA 3NV4A 4P6AA 1HDKA 1MZ5A 1AXZA 1ENRA 2XOAA 3FUQA 1YRZA 2WQZC 3WVJA 1WW6A 2A7AA 3BA5A 3WDYA 4JAWA 4NO4A 4ZXKA 3CAHA 2ZR1B 4F83A 4Q1RA 1ENSA 5AVAA 2G4IA 1ULEA 4FPKA 1AJKA 4Q27A 1JHNA 1F31A 1GBGA 2DVAA 4BOWA 3FJ8A 1ISWA 3ILAA 2JE7A 2R0FA 3CA3A 3N7LA 5JDBA 3PG0A 5KXBA 3E8LC 1DQ5A 2Y9WC 4PC4A 1QU0A 3HALA 1H30A 2AR6A 4SLIA 4OUJA 2RQ9A 4M3CE 4M3CA 5H9SA 4J2XA 1TWMA 2DUOA 2YUGA 3BA7A 1IILA 1S0EA 4DRRA 5D61A 1LOGA 4ZFWB 2ZA9A 4GP0A 1N4KA 1LEDA 4YZ2A 4ATEA 3W58A 1FAYA 4PQ9A 3NWKA 3WV6A 4OEFA 1SZ6B 4A7KA 1V6IA 4Y20B 2YROA 4JC1A 4NOTA 4KBBA 4H04A 4LO1A 1ISYA 4D0TA 2KH2A 1H9WA 3P6IA 1CQ9A 5IUQA 1CE7B 4RA0A 3AYCA 4R9AA 1GNZA 4XIKA 5HPZA 4L4IA 3VSFA 2ZHMA 2DV9A 3CA4A 4EKXB 3ATGA 1LTEA 3WHUA 1FWVA 2IHOA 1R8OA 2HWMA 4PBOA 5BXRA 1RZOB 4Q8LA 4WZFA 4AGVA 2HW9A 3FJJA 2NVHA 3V65A 5DUUA 5GZEA 4XHBA 5H9PA 1CESA 4Q9GA 1CJPA 4P9WA 2JDZA 2DREA 1QMJA 4Y26A 5D62A 3O5SA 4X37A 4IY9A 2C9AA 3AZVA 1BFGA 4GOYA 3AH2A 1W6MA 3OGFA 4JP0A 4UW6A 1AVWB 3ENRA 2GNTA 4DCKC 1VCLA 5D63A 3AFKA 3O4BA 8I1BA 5FZZA 1SLAA 1JT5A 4H9WA 4TYSA 1PZ8A 2UWAA 2WJSA 1M2TB 3WG3A 3BAGA 2E4MC 3I2XA 4XYXA 1S0CA 5EG6C 2F8XC 1HKDA 2WT1A 3A22A 1O4ZA 2EXJA 2L5XA 1AFCA 2BQPA 1ILR1 4LO0C 3ZYPA 1LOAA 4OWKA 4X39A 2Z48A 1DQ2A 1HWPB 1AX0A 1N47A 1LOFA 1GGPB 4HJJA 3WMUA 5GAQA 2CTVA 5GZFA 2GNMA 5DXDA 1R1ZA 1FX5A 3FJEA 4QKSA 1N3QA 2ZABA 1EVTA 3O5WB 3I4IA 3C2UA 2E7QA 1UKGA 2PHXA 1C1FA 1N1SA 4XMAA 1X50A 4OEGA 1WLWA 1RIRA 5CBLA 4Y22B 2WKKA 1AF9A 1UL9A 4KEJA 4BQ1A 2VSEA 2DVFA 4QBCA 4I3NA 4L8QA 4GAFA 5BP5C 1CVNA 2R49A 5JOWA 3O44A 2W39A 3N3HA 1DBNA 3WDTA 3B3QE 4YW2A 4ZOTA 1GYKA 2D6MA 4Y20A 1OFSA 1QOSA 4JCKA 2I1BA 2YMZA 1V6VA 2GN7A 2ZGKA 4UW3A 3M3CA 1LGNA 3FJCA 5T5OA 2GNBA 5FZYA 4GKXA 3MALA 3M3OA 4EEEB 1CPNA 1AJOA 1SR4C 3AXEA 3BOPA 1CVSA 5KXEA 3V0BB 4I4SA 5KXCA 4IZXA 4ZA3B 5BVPI 2ZZJA 4K21A 2WT0A 4YW4A 3OJVA 1SLTA 1MC9A 4FPCA 3VV1A 2D3SA 4JRAA 1LOEA 1N1VA 4Y1XA 3VKMA 5JOZA 3M2MA 1MZ6A 1YO8A 2RHPA 4XJZA 5BXTA 3VKFC 1QF3A 4M00A 3FUOA 5DUWA 1IJTA 3FJHA 2NZ9A 3VUOA 4PF5A 3PVNA 2NMOA 1LU2A 2P37A 1W0PA 1MR5A 4WVWA 2DU1A 3UD8A 4FOVA 2D3RA 1BYHA 5E24E 3ZXLA 1ITBA 2A70A 2E51A 3HN1A 5F8WA 1GICA 4A7ZA 1BLDA 3QLQA 2EAKA 3ILRA 4Y1YA 3T1MA 1V6WA 3CU1B 5IT6A 4C1WA 3PVEA 4XJAA 3O4CA 2EXHA 3CA5A 2ZAAA 3VEQA 1KNMA 4YM1A 3TAYA 2Y9FA 4C1XA 2B7YA 4JKXB 4I96A 2A6YA 1GV9A 4QC4A 2LALA 4CZSA 1C1LA 3NBNA 1ULCA 3RS6A 4IY8A 1DJSB 3HMYA 4WV8A 2AFGA 1V6OA 2JE9A 1J0SA 3UJ4A 3JUUA 3H6RB 1I1BA 3OPZA 4LO2C 4L4HA 2WT2A 2P23A 4XOGA 3V79C 1XYFA 1JW6A 1GZWB 1PWAA 3OYWB 4D69A 1TFMB 1WCSA 4X3AA 3SLIA 2PHRA 4D0ZA 1DYKA 4Y22A 3CRHA 1LULA 2VW1A 2A3XA 4QD2B 3O4AA 2ZBJA 1ENQA 3R4UA 1AVAC 2Q5TA 2R1DA 3DGTA 5DVHA 4P9YA 4GOVA 3H6SE 5DUXA 5LK5A 1FGAA 4YZ4A 3IM0A 5BQUA 2UU8A 1QOOA 1S0IA 5EXOA 1M16A 1HWOB 3IAGC 4FPYA 4P9XA 2D22A 1FMZA 2CYFA 2CY6A 1YYNA 1W3AA 1QGLA 4FVVA 4FP3A 4P14A 4XJ8A 4YGEA 3PUBA 1Q8QA 5I1BA 3BAVA 1YBIA 2D1ZA 4YM2A 3WG2A 3V0BA 3CA1A 5FREA 5F90A 1Q03A 1BARA 2YY1A 4GAIA 5GZGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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