The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of a New Ligand Binding Intermediate in Wildtype Carbonmonoxy Myoglobin
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen transport
|
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| total genus |
61
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1999-12-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1DXV B; 1Y0A B; 4F68 A; 4FH6 A; 3NFE B; 1SPE A; 1YCB A; 1BUW A; 1XZU A; 2EVK A; 1G0A B; 3A2G A; 1JP8 A; 1G0B A; 1K1K A; 1Y22 A; 3ZJO A; 1MBO A; 1SDL B; 4KMW A; 5EV5 A; 1JF4 A; 3ZHW A; 4FWX A; 1KR7 A; 2ZSS A; 1O1N A; 1CLS A; 2O5B X; 5E83 B; 1DXU A; 104M A; 1HBA B; 3DUT A; 2EB8 A; 4X0L A; 2LH2 A; 3MJU A; 1Y4P B; 1C40 B; 3BJ3 B; 2ZFO C; 1IBE B; 1UVX A; 2ZSQ A; 1XQ5 B; 1C7C B; 1O1O B; 1S5Y A; 2R4X A; 2W6X A; 1OUU A; 1BBB A; 1HJT A; 2H8F A; 1A00 A; 3PEL A; 3MYM A; 1CH1 A; 4HRT A; 4MQJ A; 5CN9 A; 1G09 B; 2G0Z A; 1K0Y A; 3SZK B; 1DUK A; 4ILZ A; 1GDJ A; 1BZZ B; 4N7P A; 1HBB A; 1MLU A; 1MLN A; 2MGB A; 4NI0 B; 3VAU A; 2ZS1 B; 3ZJH A; 1M9P A; 2MGE A; 3P5Q A; 1UFP A; 4U8U D; 1FSL A; 1GBU B; 2ZWJ A; 3ARL A; 4N7N A; 5KER A; 3LB3 A; 2W6V A; 4H07 A; 1DWS A; 2RAO A; 3G53 A; 1MYF A; 1CG5 B; 1MYZ A; 1G9V B; 1GJN A; 1JW8 A; 4WJG 1; 3WTG A; 2BKM A; 4MPM A; 4F69 A; 2ZS1 D; 3BJ2 A; 1HAC A; 1YGF A; 1MNH A; 2DN2 B; 1THB A; 2BNL A; 2PEG A; 1Y2Z B; 4PNJ A; 1IDR A; 1MYM A; 3PI8 A; 1ABS A; 2ZST A; 1JL7 A; 1HGB A; 3UH6 A; 1MYG A; 2HHB B; 1G08 B; 1KFR A; 1CQX A; 1O16 A; 3NMM B; 1HV4 A; 2FAL A; 1OBM A; 2SPN A; 2R4W A; 2FRK X; 3UHD A; 2D5Z B; 3DHT B; 2GTL A; 3MJP B; 2HBS B; 1YEV B; 3A5B A; 2MYD A; 1BZP A; 1DLY A; 1XZ7 B; 1YG5 B; 1GLI B; 1X9F B; 4DWT A; 2VLY A; 1IRD B; 1VXH A; 4F6B A; 1SPG A; 1QXD B; 1LFZ A; 1YZI B; 3GQR A; 1Y85 B; 2MYC A; 3PIA A; 5EYS A; 1XZ5 B; 2MGC A; 1DUO A; 1Y4Q B; 3H57 A; 2DN3 B; 1MOB A; 2IG3 A; 2M6Z A; 1BAB B; 1X9F D; 1UX8 A; 1MLF A; 3WR1 B; 4KN3 A; 3AQ7 A; 2VEB A; 1VXE A; 1YHE A; 1Y8H B; 1YEU A; 3DR9 A; 1YEO A; 1NXF A; 3BCQ B; 2OH8 A; 1MCY A; 1YIH A; 1FDH G; 1DWR A; 2GLN A; 4SDH A; 1RQ4 B; 5HBI A; 2Z6S A; 4L7Y B; 3D17 A; 1Y8K B; 1HGA B; 1XXT A; 1V75 B; 1NIH B; 1NS6 B; 1BIN A; 1JWN A; 1LH6 A; 1Y7C A; 2ZLV A; 4XDI A; 1FAW A; 2XYK A; 1BVD A; 3AQ8 A; 1MBD A; 3VHB A; 1COH A; 1Y4V A; 3ASE A; 2HBF B; 2DHB B; 4UIQ A; 1V5H A; 1S0H B; 3HEO A; 1MTK A; 1ASH A; 1VRE A; 3M38 A; 1CG8 A; 1FDH A; 3UHB A; 3EU1 A; 1UC3 A; 2O5O X; 1V4X B; 2R1H A; 3B75 B; 2LHB A; 1A0Z B; 1Y09 A; 2V1E A; 3PI3 A; 2ZSP A; 2HHD B; 3W4U A; 1HAB B; 1Y5K A; 4U8U C; 2ZSZ A; 1V9Q A; 2D2N B; 4IT8 A; 1R1Y A; 1FSX B; 2G0R A; 111M A; 3OVU C; 1M6M A; 2V1F A; 1LFT A; 3WCW B; 4FWZ A; 1MYH A; 1VWT B; 4NXA A; 2ZS1 C; 3OGB A; 5D5R A; 1FN3 B; 1QI8 B; 4MBN A; 3OZU A; 1FCS A; 2QFK A; 3BJ1 A; 2VLZ A; 4PQC A; 1UIW A; 1N9H A; 2QLS A; 2D2N D; 3HC9 A; 1MBA A; 1F5P A; 1S5X A; 106M A; 1N9I A; 3UHX A; 1GCW B; 1F65 A; 3PI4 A; 1MOA A; 4WJG A; 3ECZ A; 1Y83 B; 1LJW A; 3GQG A; 2DN1 B; 1YE0 A; 1DKE B; 3VRE B; 4NXC A; 1CBM A; 1URY A; 2LH7 A; 2W72 C; 3DHR A; 3HF4 A; 1GBV A; 1QSH A; 2BWH A; 2AA1 A; 2ZLU B; 4YU4 B; 4OF9 A; 2R50 A; 3U3E A; 4KMV A; 1YOH A; 5EUI A; 2ZFO B; 1RPS A; 1SHR A; 3S66 A; 3SDN A; 1Z8U B; 3ZJN A; 5CN8 A; 2BK9 A; 1TES A; 2ZT3 A; 3ZJR A; 1GCV B; 1X9F C; 1YE2 B; 1HDS A; 1LH7 A; 2QMB A; 4ODC A; 2E2Y A; 1MYT A; 2QSS A; 2SPM A; 1J7W B; 2ZLW A; 3VRF A; 3UHG A; 1O1L A; 1AJ9 A; 3PT7 A; 1QXE B; 2QU0 A; 3LB2 A; 2D6C A; 1IT3 A; 3ED9 A; 3ZOL A; 1MTI A; 5CND A; 4MU5 A; 3FS4 B; 3HHB A; 1DXD A; 2ZLT B; 1YVQ B; 3WCV B; 4G1V A; 2HBD A; 1Y46 A; 1I3E A; 4TYX A; 3IC0 B; 2D2M D; 1YHR B; 3FH9 A; 3QZZ A; 4O4Z A; 2MGA A; 3RJ6 A; 3GQP B; 1QPW A; 3GDJ B; 3MKB B; 1L2K A; 1DTI A; 3A0G A; 3MYN A; 3QMA A; 1U7S A; 2Z8A A; 1VHB A; 5C6Y A; 1YGD A; 3IC2 B; 1IT2 A; 1Y0C B; 2O5T X; 1V4W B; 2VM0 A; 3WFX A; 1O1K B; 3HRW A; 1CMY B; 1A3N B; 2HBC A; 3WCV D; 1YH9 B; 3E5O A; 1LH5 A; 1Y7Z A; 3LB4 A; 1EMY A; 4N7O B; 3WFT A; 1Y35 B; 3MOU A; 1Y7G A; 1Y7D B; 5HY8 A; 1JEB B; 1GDI A; 1S61 A; 3M3B A; 1OUT B; 3HXN B; 4ROL A; 1LFL B; 1O1M A; 3MN0 A; 112M A; 4BJA A; 1XZV B; 2YRS A; 1YEQ B; 5AZR A; 1MLG A; 6HBW B; 4F6F A; 4UZV A; 4H2L A; 4AVE A; 1NZ2 A; 2BLH A; 2QFN A; 3WHM B; 1UFJ A; 1C7B A; 4M4B A; 3WCU B; 1Q1F A; 3R5I B; 1Y4F A; 3O7N A; 4O4T A; 2NX0 A; 2R80 A; 1MOD A; 2ZFB A; 3K8B A; 3D1A B; 1J7Y A; 5E6E A; 5KDQ A; 1HDA A; 3GYS B; 2O5M X; 1DXV A; 1WMU B; 1X46 A; 1URV A; 3K3U A; 1QSI A; 3NFE A; 1GDK A; 1Y4G B; 1HBS B; 2MYE A; 1G0A A; 2D2N C; 2QSP B; 3WCU D; 2XKI A; 1VRF A; 3D4X B; 4G51 B; 4XS0 B; 5CN5 A; 5B84 A; 3S65 B; 2OH9 A; 1SDL A; 1YDZ A; 3ODQ A; 1HLB A; 1NS9 B; 2W6W A; 1MLJ A; 1VXC A; 1YEN B; 4MQC B; 1YHU D; 1CBL A; 1MWD A; 1DM1 A; 1RVW B; 5E83 A; 2SPL A; 1HBA A; 5ILP A; 3BOM B; 2DXM A; 2LH6 A; 4NS2 A; 3UHI A; 1Y4P A; 1C40 A; 3BJ3 A; 1CO9 A; 1IBE A; 2VYZ A; 2AUP A; 1HBR B; 1HDB B; 2RI4 B; 3PT8 B; 2ZLX B; 1MNJ A; 3TM9 A; 1XQ5 A; 1LFY B; 1C7C A; 2LH3 A; 2V1I A; 1O1O A; 3OK5 A; 5HU6 A; 4VHB A; 2ZS0 B; 1G09 A; 2HBE B; 3VRG B; 2PGH A; 5EQM A; 1MZ0 A; 103M A; 1HCO A; 1JZM A; 1O1I B; 1Y4R B; 5EET A; 1OFK A; 1CPW A; 2VRY A; 3QJE B; 1GBU A; 2D2M C; 1NQP A; 2ZS0 D; 5CHR A; 2G10 A; 3WCT B; 3CIU B; 4F6D A; 3K9Z A; 1BUW B; 4ESA A; 1CG5 A; 3ORD A; 4U8U B; 1G9V A; 1HSY A; 4HSX A; 1G0B B; 3WCP B; 1VXA A; 1WVP A; 1XYE B; 2DN2 A; 2EB9 A; 1UMO A; 3WCV C; 1Y2Z A; 2D5X B; 5D1V A; 2FRI X; 3WCT D; 4MQH A; 1CLS B; 2GL3 A; 2HHB A; 1G08 A; 3NMM A; 4X0L B; 1MTJ A; 1A6K A; 3DHT A; 5CN4 A; 1YEV A; 1Y0T A; 1S69 A; 3UHH A; 1J40 B; 5EYJ A; 102M A; 1Y5F B; 1XZ7 A; 1YG5 A; 1S5Y B; 1GLI A; 1OUU B; 1BBB B; 1BZR A; 1IRD A; 3PI9 A; 1DLW A; 2MB5 A; 4HRT B; 1YZI A; 1PMB A; 2C0K A; 2IN4 A; 1MLM A; 2W72 B; 1Y85 A; 3NL7 B; 1LH2 A; 1MOH A; 2WTH A; 1MLH A; 4MQK B; 3GKV B; 1MYJ A; 1Y4Q A; 2DN3 A; 2AUO A; 1CH4 A; 3ARK A; 1BAB A; 2BLJ M; 3AQ9 A; 3WR1 A; 1Y4B B; 105M A; 3KUN A; 3P5Q B; 1V07 A; 5KER B; 3AT5 B; 3WCU C; 4HHB B; 3BCQ A; 1YMB A; 1B86 B; 4GZG A; 1RQ4 A; 3WTG B; 7HBI A; 2H35 B; 2EKT A; 5M3S A; 1YHU C; 3BJ2 B; 3D7O B; 1A9W E; 2HCO B; 2PEG B; 1Y8K A; 4MXL A; 3O89 A; 1SWM A; 5SW7 B; 1GZX A; 1YIE B; 1HGA A; 3OO4 B; 1JY7 B; 1HGB B; 1V75 A; 1HGC B; 1JZK A; 5EE4 D; 1NS6 A; 3BA2 A; 1IWH B; 4IRO B; 5JOM A; 1BZ6 A; 1MKO B; 2OIF A; 2GTL B; 3A5A A; 4O35 A; 1LHS A; 3UHE A; 1J3Y B; 2AUR A; 1BZ0 B; 5EU2 A; 1PBX B; 1LA6 B; 1LH1 A; 1T1N B; 2DHB A; 2O58 X; 2O5Q X; 1BZ1 B; 3QZX A; 1GDL A; 3UH3 A; 1SPG B; 1Y01 B; 2MHB B; 1SDK A; 2MBW A; 2BLI A; 1A0Z A; 3EOK B; 2GTL D; 101M A; 1N9X A; 1EW6 A; 3NML A; 5CN6 A; 2ZSN A; 1XZ4 B; 1VXD A; 2HHD A; 109M A; 2XKH A; 1DXT B; 1HAB A; 2M6Z B; 1NGK A; 2H8D B; 4MQI B; 2HZ3 A; 2GDM A; 2MGM A; 4ROM B; 2ZS0 C; 5JDO F; 1CH2 A; 1OJ6 A; 4F6J A; 3A9M A; 1EBT A; 1F63 A; 2W6Y A; 3UI0 A; 1Y8W B; 1YMA A; 1B0B A; 1C7D A; 1MYI A; 1NPF A; 3WCW A; 2HBG A; 1VWT A; 3E55 A; 1KD2 B; 2AV3 A; 1FN3 A; 2G3H A; 2Z6T A; 1QI8 A; 3MBA A; 3WCT C; 1UT0 A; 3OZV A; 5CNE A; 3LR7 A; 3GLN A; 5C6E A; 4FC3 B; 1J3Z A; 2Z85 A; 4MXK A; 4C44 A; 1Y83 A; 4YU3 B; 4M4A A; 1NZ5 A; 4B3W A; 1DXC A; 3NG6 B; 3VRE A; 1COH B; 1O1J B; 1XY0 B; 1ITH A; 3G46 A; 1Y4V B; 2ZT0 A; 4HRR B; 2HZ2 A; 2CMM A; 1RQA B; 1Y45 B; 2ZLU A; 4YU4 A; 1O1P A; 1NAZ A; 5KKK A; 1CG8 B; 3ZJJ A; 2ZFO A; 2R1H B; 1HBI A; 2DC3 A; 1ABY B; 4NK1 A; 3ZJS A; 1GCV A; 2V1J A; 1Y8I B; 2VYY A; 4NZI A; 1CO8 A; 4O2G A; 1BIJ B; 1AZI A; 3UHT A; 4F6G A; 1R1Y B; 1NEJ B; 2ZSY A; 1QXE A; 5MBN A; 5CNB A; 2FRF A; 2R4Z A; 1MLQ A; 3FS4 A; 3ARJ A; 2MGD A; 2ZLT A; 1YVQ A; 4WCH D; 2FRJ X; 3MVC A; 3QM6 A; 1OFJ A; 4ZVA A; 3AT6 B; 3GQP A; 1JL6 A; 1CIO A; 2AV0 A; 3GDJ A; 3MKB A; 5JGG A; 1RQ3 A; 3BJ1 B; 1UIW B; 2QLS B; 1ABW A; 2D2M B; 1V4U A; 3IC2 A; 5EOH A; 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2V1G A; 3D1K B; 2R4Y A; 3UHV A; 5E29 B; 1OR4 A; 4H2L B; 3QQQ A; 2HBE A; 2NSR A; 1Y5J B; 4M4B B; 1A6N A; 3LHB A; 1XCH A; 2D60 B; 1CH3 A; 2MGJ A; 1O1I A; 3QJD B; 2GRZ A; 3UHW A; 1BVC A; 1MNK A; 1J7Y B; 1DO7 A; 5B85 A; 5KDQ B; 1HDA B; 1MNI A; 3QJE A; 3M39 A; 1YOI A; 1QSI B; 3WCT A; 3CIU A; 2AUQ A; 3UHQ A; 4DC7 A; 4U8U A; 2ZT4 A; 3WCP A; 1Y31 B; 3SZK A; 1FHJ B; 2HHE B; 1SI4 B; 2MGH A; 1YDZ B; 3ODQ B; 3OO5 B; 1XYE A; 2ZSX A; 1BZZ A; 3GOU B; 2D5X A; 1YVT B; 4NI0 A; 3QJC B; 2ZS1 A; 1HBH B; 3A59 B; 3OZW A; 2EF2 A; 2G14 A; 2VHB A; 2DXM B; 1IRC A; 1XZU B; 2V1K A; 3ZJI A; 2O5S X; 5F0B A; 1J40 A; 1RTE A; 1K1K B; 1Y5F A; 1Y22 B; 3UHK A; 1NWN A; 3PI2 A; 4NK2 A; 3ZJL A; 2LH1 A; 108M A; 1ECA A; 5HU6 B; 1O1N B; 3UBV A; 3UGY A; 2W72 A; 3NL7 A; 1DXU B; 1FLP A; 3IA3 B; 2PGH B; 3DUT B; 4MQK A; 1ECO A; 3GKV A; 5HAV A; 3MJU B; 1HCO B; 1NZ4 A; 2D5Z A; 3MJP A; 3G4R A; 2HBS A; 3UHZ A; 1Y4B A; 2G0V A; 3OJ1 A; 1NQP B; 1X9F A; 3AT5 A; 2H8F B; 2MGI A; 1A00 B; 4HHB A; 4ESA B; 4B4Y A; 3PEL B; 1B86 A; 1QXD A; 4MQJ B; 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