1DXJA

Structure of the chitinase from jack bean
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
DVGSVIDASLFDQLLKHRNDPACEGKGFYSYNAFVTAARSFGGFGTTGDTNTRKREVAAFLAQTSHETTGGAAGSPDGPYAWGYCFVTERDKSNKYCDPGTPCPAGKSYYGRGPIQLTHNYNYAQAGRALGVDLINNPDLVARDAVISFKTAIWFWMTPQGNKPSCHDVITNRWTPSAADVAANRTPGFGVITNIINGGIECGRGPSPASGDRIGFYKRYCDVLHLSYGPNLNCRDQRPFGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title Structure of Jack Bean Chitinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords CLASS II CHITINASE
total genus 89
structure length 242
sequence length 242
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2000-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1dxjA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 1dxjA02
2D91A 1IP4A 3A96A 2F2NA 1GEVA 1B5UA 3B6LA 1HEQA 1OP9B 1AM7A 4H9EA 4WM3A 3A3QA 2D6BA 4N8ZA 1GDWA 4MCKA 4WL7A 3G3AB 153LA 4PRUA 1LJIA 4H9FA 4NWHA 4TTDA 2MEDA 4G49A 4NSJA 5B1FA 3D3DA 5KXWA 2CJLA 2ZYCA 1GF0A 1ZV5L 4GCEA 3BKHA 2BQCA 1D0MA 1LSYA 3W6CA 5LA5A 1GE0A 2YBMA 4Z3MA 1IY4A 1GHLA 1JTOL 2EKSC 1EQ4A 1LZNA 4GN4A 1CKDA 3M3UA 5FSTA 5HNCA 4CFOA 3W6EA 1LJKA 1LZCA 1IOTA 2B5ZA 4AGAA 3AW6A 5LYTA 4B1AA 2FBBA 1BWHA 134LA 1FKVA 4RLNA 4TUNA 1GBWA 4NGYA 4FJRA 132LA 4YENA 4DT3A 5KXTA 1FKQA 1C45A 4ET8A 194LA 4DD0A 1NMMA 5DN5A 4OWBA 1G7LC 1VEDA 135LA 1QTKA 1VDPA 1VDSA 2MEFA 4N0JA 1LJ4A 5B07A 4ZFPA 6LYTA 4KPMA 2HEFA 2EQLA 4DDCA 1XGUC 1OUBA 3CT0A 3KAMA 3EXDA 3B0KA 1DPXA 1D0KA 4HV2A 1JTPL 1B5WA 3WPKA 2LYOA 5F16A 3WXTA 4GCDA 1IWVA 5LYZA 1C7PA 4WLDA 1HSXA 1LKRA 3CSRA 1OUDA 4WG7A 4DWXA 4XJIA 1CKCA 4NG1A 5LVGA 1JSEA 1GBOA 1LHIA 3WMKA 3W3EA 1LZ1A 1H87A 2HUBA 4HV1A 4MSTA 4QDNA 1GBSA 3AJNA 1GF6A 1T6VL 3AGHA 3F6ZA 4OW1A 4XYYA 1GB5A 3WPJA 1IWUA 1B7SA 1G7HC 4LYCA 1LJFA 5J7CA 1B7MA 1HSWA 1OUEA 5L3IA 3WW5A 1C46A 1FBIX 3M18B 1JEFA 4LYTA 1NF5A 4OWAA 1GFKA 3HBDA 1GB2A 1BGIA 1FLWA 1GXXA 4IASA 4CGEA 1YKZX 4KL7A 3W6AA 1RI8B 4TWSA 4H8XA 2DQJY 1IIZA 4DD1A 4G4CA 1NQIA 1BWIA 1B7OA 2F30A 1GF8A 3WUMA 1LZSA 2DQAA 3TXFA 1B5XA 1JJ3A 1LHLA 1OUGA 1UC0A 4G9SA 2EIZC 4W94A 1J1PY 1REZA 4LT3A 2FYDA 1N4FA 1LSZA 1YQVY 2C8PA 2LHMA 5I54A 1NDMC 1JTTL 1AT5A 2BQMA 2C8OA 2Z12A 4DDAA 5C6LA 2BQIA 1YAQA 1GF7A 1GE1A 4GN3A 1IWZA 4H9HA 1FDLY 4WLXA 1QDRA 3AZ4A 3HBHA 1KIQC 4ETAA 3EBAB 4H9AA 1HHLA 4R6CA 4WMGA 3TMXA 5KXXA 1GXV2 2I6ZA 1UACY 1JKAA 3K3TA 1LSGA 4U3XB 3TXBA 2ZIJA 3A34A 4N1CC 1B7NA 4L41A 1DXJA 5LVKA 1XEJA 1G7IC 1QTEA 1WQNA 2GV0A 4NFVA 5KXNA 4OWCA 2W1YA 1YAMA 2MEAA 4HJZA 1GB8A 4LYMA 4B49A 1LZDA 5FHWA 3G3BB 1OUJA 3IJVA 3MGWA 1BB7A 5HNLA 4XADA 3IJUA 2XBRA 4PPOA 5KY1A 1LHKA 4P2EA 4WO9A 2YBNA 1UCOA 4NG8A 1LSCA 1YANA 1BB4A 1REYA 1WQRA 1YROA 2ZNWY 1LJHA 3AW7A 1YIKA 4GCBA 2HU1A 2BLYA 1HMKA 4H8YA 5I4WA 1HEOA 5LINA 1QDTA 207LA 1GFRA 3AZ7A 2BQEA 1IWYA 1B2KA 1WQMA 4ZEEA 3RZ4A 4YF2A 5ILFA 3OK0A 1C10A 1GE2A 5ILCA 1GAZA 2DQGY 3W6DA 1IEEA 5E4PA 4ETBA 1KIRC 1GDXA 1GF9A 1TCYA 4CJ2A 4WOAA 4E3UA 1JSFA 3LYMA 5K7OA 4WLYA 2D4KA 5DN4A 1EQEA 4B4IA 4BS7A 1LSNA 1LHHA 1QUSA 1WQPA 3B0IA 4NY5A 1YKXX 2H5ZA 1IX0A 4BADA 1WQOA 4C5FA 4NEBA 1OUHA 2YVBA 4MR1A 5B05A 1BHZA 2HEEA 3TMUA 1XSFA 5I53A 4QY9A 2ZQ3A 4OOTA 4QEQA 3A6BY 4H9BA 5KXSA 1IOCA 4G4HA 4KXIA 4ETEA 1BVXA 1VAUA 4LFXA 133LA 4X3BA 5LXWA 2DKVA 1TEWA 2LZTA 4NHIA 1WVVA 1LZ8A 1IC4Y 1D0LA 1UBZA 3HBEX 3IWRA 1LYYA 5KKIA 1JIYA 1HELA 1WTMA 2BQAA 2YBJA 3J4GA 2Z18A 1CKFA 2ZWBA 3CB7A 193LA 3A3RX 1XGPC 1IP1A 1T3PA 4GN5C 3CSQA 1JHLA 1FLUA 3LN2A 4XJGA 4AXTA 1V7SA 4DD3A 3N9EA 1AZFA 1CJ8A 1VATA 1GPQC 1W08A 1LYZA 4NHTA 5DLAA 4DC4A 3TXJA 1LHJA 1IO5A 2DQEY 4J7VA 5LVJA 1UICA 4YEOA 5T3FA 4WG1A 4I0CA 4EMNA 3RU5A 5EBHA 1DI4A 3HFMY 1LZ5A 4NGIA 5LYMA 1VDQA 2Z38A 1B5VA 2MEGA 5C6JA 1HFYA 1CKGA 4II8A 4KT3A 4DD9A 4YEMA 4HJYA 1D9UA 2XBSA 2F4GA 4WM5A 1ALCA 4YOPA 5HQ1A 1D6QA 1F10A 1QSAA 3TXIA 2BQBA 4LYOA 3P66A 2ZYPA 4XENA 5KXRA 1OUAA 1REXA 4GLVA 5JENB 1C43A 1RJCB 2W1MA 1LOZA 2AUBA 5APFA 154LA 2RSCA 2LYMA 3WL2A 4NGZA 4H93A 3A90A 5B1GA 1D6PA 2BAAA 4TSCA 1GE3A 5HLLA 5KJ9A 4DD7A 2YSSC 1HERA 1XFPL 1IC5Y 1IWTA 1GAYA 2DBTA 5LVIA 4NIJA 1LKSA 6LYZA 1LYOA 4NGJA 5I4YA 5DL9A 2BQDA 1G7JC 2H9JA 1GD6A 3FI7A 2HEBA 4RLMA 1GF4A 5F14A 1BWJA 4CHXA 4J1AA 1JJ0A 3TXGA 1KXWA 1G7MC 1XGRC 2XJWA 2DQHY 1HEWA 3TXEA 3WH1A 1UIEA 2Z19A 1NBYC 3ZVQA 2YBIA 1OUIA 1BVKC 4PHIA 1GB9A 1H6MA 1LMOA 4ETCA 4N9RA 1B7PA 1LZ6A 4W96A 1YL0X 1XGQC 1Z55A 3WPLA 4Z46A 4UWVA 4H90A 2Q0MX 3LYOA 1LTMA 1W6ZA 2N5ZA 4LT0A 3WYHA 1O23A 1LMQA 1MELL 4XJFA 3T36A 4M6DA 5L9JA 4QGZA 4RDSA 4HTQA 1B5YA 1IY3A 1YAOA 1B0DA 4Z98A 5KXMA 1GEZA 1GFEA 5IELA 1GFUA 1B7LA 1EQ5A 3AGGG 2MEIA 3TXDA 1IR7A 3A93A 4LT2A 2G4NA 3QY4A 3CQLA 4LYBA 3CSZA 2MEBA 5F81A 5FDJA 3CT1A 1I56A 2HEDA 2DQDY 2HECA 4TX7A 1RE2A 1LZ4A 1JKCA 5KXZA 4HPIA 1V7TA 4DD2A 1LSBA 1OQMA 2G4QA 4HJVA 4YM8A 3EMSA 1LJJA 3QE8A 1LAAA 2BQFA 2BQOA 2IFFY 1FLYA 3AYQA 3E3DA 1LCNA 2BLXA 4LGKA 1LZAA 4NGWA 4B0DA 8LYZA 1HFZA 3P65A 3TMWA 1LHMA 5KXOA 1GWDA 5DM9A 2BQGA 1B5ZA 1OUCA 2CWIA 5F9XA 1LMTA 9LYZA 2WARA 3T6UA 2YBLA 1IP6A 3GXKA 3ZVQB 3TMVA 1KIPC 1WQQA 2LYZA 4GCFA 5KXKA 1KXYA 3ATOA 3B72A 5M1YA 2MEHA 4R0FA 1LZ9A 2Z2FA 1INUA 2HTXA 4J1BA 4ZIXA 3ULRA 1IWWA 1J1OY 1GF5A 1I1ZA 2YBHA 4WM6A 2DQCY 2HEAA 4H8ZA 3CT5A 3OJPA 1UIHA 5FELA 5LAFA 1ZVHL 4OOOA 1BB3A 5LAGA 4N5RA 4PGJB 1NWGA 1KXXA 4ML7A 1GB7A 1LYSA 1IR8A 1LPIA 1RCMA 4HP0A 4HPEA 1CJ7A 1ZVYB 4UWNA 4ANRA 1LSAA 1GE4A 4IATA 1GBZA 1VFBC 3A95A 1JWRA 5IDDA 1VDTA 3QNGA 1JKBA 1HENA 1DQJC 4NWEA 3GXRA 2HU3A 1HF4A 1OUFA 1HC0A 2FYCA 1CJ9A 1GBYA 1UIFA 3ATNA 5KXPA 1YKYX 3WXUA 1REMA 4ETDA 1QSWA 2FBDA 1XGTC 3AGIA 4ET9A 4UWUA 1AT6A 3WULA 3AB6A 3D9AC 1CJ6A 2DQIY 5F9UA 3WVYA 4RW2A 1IVMA 3B0OA 4LFPA 4NSGA 3LHMA 1CKHA 1F6SA 3J6KA 1JJ1A 1NBZC 3P4ZA 2H9KA 2Y8PA 4WO6A 1LMPA 1GFVA 1IP3A 2Z39A 4DDBA 1GFHA 3LZ2A 4G4BA 5AMYA 4H9CA 4CFPA 1JISA 1HFXA 4GCCA 3W6BA 1GB6A 5LVHA 1QIOA 3SP3A 1SQ2L 4LYZA 1LJGA 1P2CC 4PRQA 4WM1A 1GFGA 3WU7A 4NHSA 3WUAA 4NHQA 3WU9A 5HMJA 1LZYA 1LZTA 4XJDA 1GB0A 1HNLA 1LMAA 2I26L 2PC2A 1IP7A 2BQKA 5I4XA 1BQLY 1QQYA 3FE0A 3P68A 5FEKA 1YL1X 1IOSA 1GFAA 4PJ2C 1FN5A 1B7QA 3RW8A 1JPOA 1LZBA 1WTNA 2VB1A 1LSMA 2ZQ4A 4NGKA 1UIAA 1LZRA 1IP2A 1F0WA 1LJ3A 4B4JA 4EOFA 2X0AA 4J0LA 1TDYA 1IR9A 4H1PA 1TAYA 4M4OA 2XTHA 3A91A 4RW1A 4GLAA 1A4VA 2CGIA 4HTNA 1LSFA 1SLYA 2ZIKA 4BAPA 2BQLA 4WM4A 1J1XY 1GB3A 1WVUA 3VWOA 1JITA 3RNXA 1AKIA 3P64A 1XEIA 1LSDA 1LSEA 1JUGA 1EL1A 5LA8A 4A7DA 2EPEA 3BKVA 4NGOA 3LZTA 1LSPA 1GBXA 1IWXA 2BQJA 2G4PA 1BB5A 2ZNXY 1GFJA 3LYZA 3N9AA 4Z41A 1MLCE 1LMNA 5D5CA 1IP5A 1LZGA 3WUNA 3A8ZA 2D4IA 4XJBA 4LZTA 4H94A 4WLTA 1IC7Y 4XJHA 1PZYA 5APDA 1RFPA 5APEA 7LYZA 1DKJA 1YAPA 2W1LA 4NHPA 3TXKA 2MECA 3N9CA 5APCA 4XN6A 5II3A 1LMCA 1HEPA 2BQNA 2Z37A 4I8SA 4WL6A 5FCPA 1GF3A 5KXLA 1LJNA 2YDGA 3AZ5A 5A3ZA 1JKDA 2NWDX 1UA6Y 2IHLA 2W1XA 4BAFA 4NSHA 3A6CY 1E8LA 1ZMYL 1LJEA 4WM2A 1GFTA 3EO5A 1YILA 2A7FA 3WVXA 1LZEA 1DZBX 3TXHA 3A94A 5KXYA 1BB6A 2A7DA 5HMVA 1XEKA 1F6RA 4TSBA 1DKKA 4DYGA 4B4EA 4HTKA 1NDGC 5B59A 1I20A 5D5FA 3W6FA 2BQHA 3RT5X 1UUZC 2BPUA 1NKHA 4NSIA 3LYTA 1HMLA 3AZ6A 4H91A 4OWHA 3A67Y 4IJ4A 4NGLA 3WW6A 2F4AA 2LZ2A 3ZEKA 5I5QA 1IORA 1B7RA 1UIBA 5E9RA 1DPWA 2Z2EA 4D9ZA 1CNSA 3A92A 4FDYA 4NGVA 3WU8A 5A3EA 4C3WA 1FLQA 1UIDA 2D4JA 2ZILA 5B06A 1UIGA 5C6IA 1C08C 2MEEA 1NHEA 208LA 2I25L 5LIOA 4LT1A 5L3HA 5IHGA 1PS5A 1A2YC 1B9OA 4HSFA 4OWEA 1TBYA 1IOQA 4O34A 4N1EI 1HEMA 2DQFC 1DI3A 4H92A 1QUTA 4H9IA 1DI5A 2CDSA 5KKJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IP4A 4WM3A 1L99A 4H9FA 4NWHA 4G49A 5KXWA 3C7ZA 1ZV5L 3BKHA 1L02A 156LA 1P36A 107LA 1GHLA 1JTOL 1LZNA 5HNCA 126LA 3C7YA 4B1AA 3HUKA 182LA 4RLNA 4TUNA 4NGYA 132LA 5KXTA 4DD0A 1KW7A 1C6DA 2HEFA 2EQLA 1XGUC 1OUBA 3CT0A 3KAMA 1DPXA 1B5WA 2LYOA 4GCDA 4WLDA 4DWXA 3CSRA 2RB1X 1CKCA 3C8RA 3W3EA 155LA 211LA 3DN8A 4I7OA 4XYYA 1LJFA 1L38A 1HSWA 1FBIX 1GFKA 3W6AA 1C6IA 4ZPUA 1CVKA 1L47A 4DD1A 1BWIA 2F30A 1C69A 1CV6A 3WUMA 3TXFA 4I7JA 1B5XA 4W94A 1J1PY 4LT3A 2FYDA 2LHMA 1L71A 3GUNA 5I54A 2Z12A 5C6LA 2BQIA 1YAQA 1GF7A 218LA 3EBAB 4H9AA 1HHLA 4R6CA 1L81A 1L01A 3F9LA 1JKAA 231LA 3A34A 1QT7A 1G7IC 4NFVA 3SN6R 2W1YA 1YAMA 2LZMA 3MGWA 4LDEA 170LA 2HUKA 2XBRA 4WO9A 2YBNA 4ARJA 1YANA 1YROA 1L85A 1HEOA 1QDTA 1IWYA 1L16A 2RAZX 3DN1A 1C10A 1GE2A 1SX7A 3D4SA 1L19A 1GDXA 4WOAA 4E3UA 1QTVA 1LLHA 4BS7A 131LA 180LA 1EQEA 1QUSA 3B0IA 4NY5A 1YKXX 5B05A 1L45A 1OUHA 1QUDA 5I53A 3A6BY 4H9BA 1G1WA 1DYDA 4KXIA 1VAUA 5LXWA 4NHIA 3IWRA 1T8AA 1PQJA 5KKIA 1WTMA 2Q9DA 3HUQA 193LA 1QTDA 1G1VA 1T3PA 1FLUA 1C6GA 4DD3A 1AZFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2D91 A;  1IP4 A;  3A96 A;  2F2N A;  1GEV A;  1B5U A;  3B6L A;  1HEQ A;  1OP9 B;  1AM7 A;  4H9E A;  4WM3 A;  3A3Q A;  2D6B A;  4N8Z A;  1GDW A;  4MCK A;  4WL7 A;  3G3A B;  153L A;  4PRU A;  1LJI A;  4H9F A;  4NWH A;  4TTD A;  2MED A;  4G49 A;  4NSJ A;  5B1F A;  3D3D A;  5KXW A;  2CJL A;  2ZYC A;  1GF0 A;  1ZV5 L;  4GCE A;  3BKH A;  2BQC A;  1D0M A;  1LSY A;  3W6C A;  5LA5 A;  1GE0 A;  2YBM A;  4Z3M A;  1IY4 A;  1GHL A;  1JTO L;  2EKS C;  1EQ4 A;  1LZN A;  4GN4 A;  1CKD A;  3M3U A;  5FST A;  5HNC A;  4CFO A;  3W6E A;  1LJK A;  1LZC A;  1IOT A;  2B5Z A;  4AGA A;  3AW6 A;  5LYT A;  4B1A A;  2FBB A;  1BWH A;  134L A;  1FKV A;  4RLN A;  4TUN A;  1GBW A;  4NGY A;  4FJR A;  132L A;  4YEN A;  4DT3 A;  5KXT A;  1FKQ A;  1C45 A;  4ET8 A;  194L A;  4DD0 A;  1NMM A;  5DN5 A;  4OWB A;  1G7L C;  1VED A;  135L A;  1QTK A;  1VDP A;  1VDS A;  2MEF A;  4N0J A;  1LJ4 A;  5B07 A;  4ZFP A;  6LYT A;  4KPM A;  2HEF A;  2EQL A;  4DDC A;  1XGU C;  1OUB A;  3CT0 A;  3KAM A;  3EXD A;  3B0K A;  1DPX A;  1D0K A;  4HV2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1L90 A;  1IP7 A;  2BQK A;  5I4X A;  1QQY A;  1GFA A;  4PJ2 C;  1FN5 A;  1B7Q A;  1JPO A;  1L60 A;  1UIA A;  1LZR A;  1IP2 A;  4B4J A;  4EOF A;  1IR9 A;  3HUA A;  4RW1 A;  4HTN A;  4W52 A;  4BAP A;  1I6S A;  1GB3 A;  3P64 A;  1XEI A;  1LSD A;  1QTZ A;  167L A;  1QTB A;  1JUG A;  1EL1 A;  1L98 A;  3LZT A;  2BQJ A;  1GBX A;  2G4P A;  1BB5 A;  1MLC E;  2Q9E A;  1IP5 A;  3WUN A;  3A8Z A;  1L65 A;  4XJB A;  4H94 A;  4XJH A;  1P64 A;  1SWZ A;  178L A;  4NHP A;  3N9C A;  1L84 A;  4I8S A;  150L A;  123L A;  3DMV A;  3NY9 A;  4NSH A;  145L A;  122L A;  3DMZ A;  3EO5 A;  2A7F A;  4GRV A;  1DZB X;  3TXH A;  3A94 A;  1C6M A;  1BB6 A;  1L55 A;  1F6R A;  4HTK A;  3RT5 X;  4NSI A;  1HML A;  3AZ6 A;  4H91 A;  4OWH A;  3WW6 A;  2LZ2 A;  3ZEK A;  4EXM A;  1B7R A;  4FDY A;  2D4J A;  2ZIL A;  1L91 A;  1LPY A;  5LIO A;  5IHG A;  128L A;  4OWE A;  4N1E I;  4H92 A;  4LYM A;  4W53 A;  5KKJ A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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