1DXJA

Structure of the chitinase from jack bean
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
DVGSVIDASLFDQLLKHRNDPACEGKGFYSYNAFVTAARSFGGFGTTGDTNTRKREVAAFLAQTSHETTGGAAGSPDGPYAWGYCFVTERDKSNKYCDPGTPCPAGKSYYGRGPIQLTHNYNYAQAGRALGVDLINNPDLVARDAVISFKTAIWFWMTPQGNKPSCHDVITNRWTPSAADVAANRTPGFGVITNIINGGIECGRGPSPASGDRIGFYKRYCDVLHLSYGPNLNCRDQRPFGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords CLASS II CHITINASE
publication title Structure of Jack Bean Chitinase
pubmed doi rcsb
total genus 89
structure length 242
sequence length 242
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2000-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1dxjA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 1dxjA02
5HNCA 1G7LC 5L9JA 1GFEA 1B7OA 1HMKA 4ETAA 2RSCA 1GAZA 5FDJA 3WVXA 2HU1A 1LHKA 4H91A 3WVYA 5F9UA 3M3UA 3A93A 4XJGA 1XEKA 2A7DA 3N9EA 1TAYA 2DQAA 1LSYA 2FBBA 9LYZA 2MEGA 4YEMA 1LSGA 3W6EA 1NBYC 4YEOA 1IX0A 2LZ2A 2EQLA 5C6JA 2Z37A 3G3BB 1YAQA 1GFTA 4NHQA 2BLXA 5DN4A 3LYTA 5LAGA 4WL7A 1BQLY 1LJGA 4NGKA 1OUHA 4M6DA 5F16A 5KY1A 4CJ2A 2BQFA 5F9XA 1DKKA 1WQMA 4OOOA 5APCA 1G7MC 4H1PA 1GFGA 3AGHA 3HBDA 4TSBA 4QDNA 5C6IA 1BB5A 4NGJA 4NFVA 5APFA 1D9UA 1HMLA 4H9CA 5D5CA 4TUNA 5B59A 3B6LA 1ZMYL 4BAFA 5IDDA 1OUCA 3A95A 2Q0MX 1HELA 2WARA 4LYTA 3WXUA 1GDWA 3P66A 1GXXA 4WO9A 5KXSA 1P2CC 3A8ZA 1IO5A 1OUAA 5I4WA 3T36A 1DPWA 4GN5C 5C6LA 1BB7A 4O34A 1NKHA 1C08C 4G4BA 4N9RA 2BAAA 1LSEA 1LMNA 5APDA 1HF4A 1AT6A 1LJ3A 1VDSA 4H9IA 4XJFA 3TXKA 1I20A 2NWDX 4RW1A 1LMAA 3AW6A 1J1PY 2F2NA 5A3ZA 1GBZA 5DN5A 4H8YA 1IORA 2HEDA 2Z12A 4MR1A 4NG8A 1REYA 1UICA 3BKVA 4LYCA 1JSFA 1GFHA 4W94A 1C10A 1LMCA 3AZ6A 1OUEA 4WO6A 1LPIA 4B4JA 4DD1A 1UIHA 2ZIKA 4HPEA 4LYMA 4NWHA 1IP4A 4WM4A 1VDQA 1YL0X 1UIBA 4KPMA 1NQIA 1OQMA 5KJ9A 2BQNA 1AKIA 3WULA 1HEOA 1GEZA 3P64A 2DQEY 5L3IA 2ZIJA 2ZYPA 3AZ7A 5KXZA 1PZYA 5LYTA 4PHIA 1QUTA 4DDBA 1LZGA 1JTOL 1TDYA 4WG1A 4M4OA 4N1EI 1GF3A 4UWVA 3P65A 4H9HA 1TBYA 3TXIA 1LJFA 1MLCE 5K7OA 5KXTA 1GBYA 1W08A 1B7MA 2W1XA 3LHMA 1UIGA 1JKBA 1RI8B 8LYZA 1WQRA 4NHPA 1V7TA 3AZ4A 2BQMA 4Z46A 5A3EA 1CKFA 4WM1A 4H94A 3W6DA 1GB5A 3TXFA 1IOSA 4GCFA 1B5ZA 1HC0A 2BQBA 1WQPA 1GBWA 3A6BY 5B1GA 3ATOA 4DDCA 2EKSC 4N8ZA 4G9SA 4PRUA 1Z55A 3EBAB 1IWVA 1BWHA 4UWUA 4QGZA 3A92A 4OWEA 5KXKA 5AMYA 2LYOA 3A67Y 1CKCA 5LA8A 5KKIA 3FE0A 1GE3A 1QIOA 2CDSA 5ILFA 1KIQC 3AB6A 1IWYA 4WM2A 4WM5A 2Z39A 4PPOA 2BQHA 1B5WA 1GBOA 3CSRA 133LA 2H9KA 2MEDA 2MEEA 2HEAA 1OUGA 4YENA 1QQYA 5EBHA 1CKHA 1IP2A 2D4IA 1VATA 1QTEA 2XBRA 1GB0A 1NF5A 4XJIA 1LMPA 1UIEA 1D0LA 4GCCA 1QDRA 2G4QA 2MEBA 5B06A 5IELA 4EOFA 4PRQA 4X3BA 2MEHA 2XTHA 1GF7A 5KXYA 1GF9A 1LSMA 1C7PA 2PC2A 4PJ2C 1LJIA 2GV0A 1IY4A 4Z98A 2X0AA 2BQAA 5LAFA 1IOQA 5D5FA 1OUBA 1RJCB 3G3AB 7LYZA 1IWZA 5E9RA 4EMNA 2G4NA 2MECA 1HNLA 1HEMA 1YQVY 4LT2A 2F4GA 3B72A 1GWDA 1LJNA 2I26L 1CJ7A 1CJ8A 1IR8A 1LSPA 1GE2A 1UIFA 1YKXX 2ZQ4A 4NGOA 4G49A 1XGPC 4I8SA 1W6ZA 5KXMA 1IIZA 1YILA 1LKSA 1REZA 1VFBC 4OW1A 2XJWA 2EIZC 5F14A 4XJHA 3AGGG 1B7NA 3EO5A 4DD2A 4HP0A 4NEBA 1TEWA 4WLDA 5DL9A 3W6BA 1BGIA 2BPUA 1LZ9A 4YOPA 4DT3A 5E4PA 1YAMA 1LSBA 4I0CA 4XN6A 1SLYA 1OUJA 6LYZA 1F0WA 5LA5A 1IWTA 1RE2A 3W3EA 3WU9A 3F6ZA 5M1YA 2BQEA 4HSFA 3VWOA 1D0MA 1LCNA 3EMSA 4OOTA 1JJ0A 2BQOA 1WQQA 1YAOA 1HFYA 3LYOA 4BADA 3ZEKA 1DXJA 1LMTA 1TCYA 4E3UA 3WPKA 2ZQ3A 2F4AA 4GCDA 4C5FA 2YSSC 5DLAA 3TXHA 1JJ3A 1ZVHL 2I6ZA 1GF4A 3OJPA 5APEA 5F81A 5LIOA 1HENA 1CKGA 1IC5Y 1NBZC 2BQLA 2N5ZA 1BB4A 1LOZA 1KIRC 2D4JA 4H90A 3IJVA 4DD7A 4WG7A 2AUBA 4CGEA 2FYCA 3AZ5A 1G7HC 3KAMA 1LHMA 1GDXA 1GBXA 1LHLA 3WPJA 1GB7A 4ETCA 3D3DA 1LSNA 2DQGY 1LZRA 3LZTA 3WU7A 1LKRA 4YM8A 4NSJA 4WLXA 3TXJA 4N5RA 4WM3A 208LA 1GFKA 4IATA 1H6MA 1IC7Y 3TXBA 1BB6A 2LZTA 1JWRA 1LZ8A 4TSCA 1T6VL 4IASA 4KT3A 2ZILA 1BHZA 2H9JA 2W1LA 2MEIA 3SP3A 3ZVQA 4CFOA 132LA 1NHEA 3A34A 4LYBA 4ET8A 4H93A 3QNGA 4NWEA 5B07A 1XGQC 1HERA 1IY3A 2MEFA 1LZ5A 4UWNA 4B1AA 3P68A 1JPOA 3IWRA 4II8A 4WLTA 3WUMA 4TX7A 5KXOA 2HECA 5B1FA 1GPQC 1GE4A 1FN5A 1UA6Y 4ZEEA 1GF8A 3WUNA 1LMOA 4ETDA 4H9FA 1FBIX 1B0DA 1LHJA 1VAUA 1HFXA 1EQ5A 1KIPC 1LMQA 1MELL 2LYZA 1IP1A 2HTXA 1JISA 1NDGC 1JKDA 4HTNA 4RLMA 3RT5X 4DD0A 2LHMA 1A2YC 1BVXA 4NGIA 4OWBA 1FLYA 3TMWA 1KXYA 4B4EA 1CKDA 4AXTA 4DC4A 1IP6A 4A7DA 1T3PA 1UACY 1AT5A 1BVKC 1FKVA 2HEEA 5J7CA 3CT1A 4IJ4A 1OUDA 2DKVA 193LA 3MGWA 4HJZA 4HPIA 1LAAA 3D9AC 5FEKA 2DBTA 3WXTA 1GFRA 1IEEA 1CNSA 1D6PA 3AW7A 3RW8A 4LYOA 4W96A 1B2KA 5KXWA 4XJBA 5B05A 4GN3A 1C45A 2IFFY 1DI4A 1LHHA 3M18B 4XENA 5FELA 1LHIA 1JUGA 1GFUA 2HU3A 2Z2EA 1WTMA 1XFPL 3B0IA 5FSTA 4B0DA 4B4IA 5IHGA 1EQEA 3LN2A 4ETBA 3HBHA 1QUSA 3HBEX 4H9AA 4KL7A 1LSZA 3WH1A 3N9AA 2C8PA 4H9EA 4HTQA 1V7SA 4MCKA 1JSEA 5KXLA 4GCEA 1B7LA 4C3WA 4GCBA 194LA 4ZFPA 4H8ZA 4LT3A 1DI3A 1DPXA 3T6UA 2ZWBA 2HUBA 2ZNXY 3A90A 2IHLA 4J1AA 3N9CA 1FLUA 1REMA 1GXV2 3GXKA 5HNLA 1B5VA 2YBIA 3QE8A 4KXIA 3CT5A 1OUFA 5ILCA 1YAPA 4NIJA 3FI7A 4CFPA 1UUZC 4XADA 1B5YA 3WW6A 4HJVA 1B7RA 3WU8A 3B0KA 4TWSA 1GF6A 5KXXA 2CWIA 1YIKA 4NGVA 5LVHA 1IOCA 4MSTA 1VDPA 3AGIA 4NY5A 1XSFA 1ZVYB 1JEFA 4ML7A 5FCPA 1IR7A 1LZ4A 1LSDA 5L3HA 1JTTL 3CQLA 4WM6A 3A91A 4HJYA 1IR9A 4NHSA 2YVBA 1JITA 1GF5A 1LZDA 2FBDA 2ZYCA 3TXEA 4ET9A 5II3A 4G4CA 1JJ1A 1GFVA 1LJHA 1WTNA 4QY9A 1C43A 1AZFA 1NWGA 153LA 4P2EA 1PS5A 4XJDA 1GB6A 4J7VA 3AJNA 4NGWA 2Z2FA 4B49A 1WVVA 3GXRA 4U3XB 1LSFA 1J1OY 1KXWA 5KXPA 1NDMC 3ULRA 3W6CA 4Z3MA 4DWXA 2F30A 4PGJB 3J6KA 1GFJA 1LSCA 1JHLA 1FLQA 1VEDA 135LA 1IWWA 2G4PA 1IP3A 4HV1A 4DDAA 2ZNWY 1GE0A 1GD6A 1UBZA 1UIDA 3WUAA 3LYZA 1HHLA 4NG1A 4NSGA 1GAYA 1QTKA 4YF2A 1LZCA 1FKQA 1GHLA 1B5UA 4NHIA 1E8LA 1GB2A 1BWIA 3CSZA 1GF0A 1YKZX 3A3RX 1AM7A 2DQHY 1O23A 2DQIY 4ZIXA 4J0LA 3ZVQB 3HFMY 4R6CA 1H87A 4H8XA 4DD3A 1UC0A 1HEWA 1JTPL 2YBLA 1B5XA 5I4YA 2D91A 1A4VA 4RDSA 5HLLA 1IVMA 4HTKA 4NGYA 1XEIA 1I56A 1N4FA 1G7JC 1LJ4A 1GBSA 4LYZA 2XBSA 3LYMA 3WW5A 1DKJA 4BAPA 4H9BA 1HEQA 2EPEA 1FLWA 5HQ1A 4RLNA 2W1YA 1YKYX 1B7QA 4N0JA 1QSWA 3BKHA 4R0FA 1KXXA 1OP9B 4OWCA 2BQGA 1GB8A 1GEVA 3J4GA 5I5QA 5DM9A 1LYYA 2YBJA 4WOAA 3A3QA 4GLVA 2H5ZA 5I54A 5I53A 1YL1X 3WPLA 1INUA 1D0KA 1LJJA 1IOTA 1IP7A 1WQNA 4DD9A 1D6QA 2HEBA 4XYYA 2FYDA 4OWAA 2B5ZA 1GFAA 2DQDY 3IJUA 2YBMA 1JKCA 2Z18A 2Z38A 4LGKA 1CJ9A 1LZYA 1LYSA 1B7SA 3WL2A 1EQ4A 4NSHA 1DZBX 1HEPA 3CSQA 4LT0A 1QDTA 3TMXA 1CJ6A 1F6RA 1JKAA 2VB1A 2DQJY 5KXRA 154LA 2YBHA 1B7PA 1RCMA 1UIAA 3A96A 3RNXA 4Z41A 2W1MA 1F10A 1XGRC 4WL6A 1LZEA 1LTMA 4LFXA 3E3DA 5I4XA 1J1XY 2BQJA 2A7FA 1DQJC 2YDGA 3WMKA 3TMVA 4HV2A 5HMJA 1BWJA 1YROA 1LZBA 1F6SA 1LZAA 2D4KA 1ALCA 4LZTA 5HMVA 5KKJA 1JIYA 1SQ2L 1GB3A 4WMGA 4DYGA 6LYTA 1WVUA 1IP5A 5LXWA 1OUIA 2C8OA 4NGLA 1EL1A 3RZ4A 5LVGA 1LSAA 1DI5A 2Z19A 1QSAA 1LZ1A 1GE1A 1LZTA 4NGZA 2D6BA 1XGUC 4GN4A 3TMUA 4NSIA 4TTDA 3AYQA 1LYOA 1XEJA 5LYZA 1LZ6A 1REXA 1ZV5L 2I25L 3EXDA 3W6FA 2CJLA 4NHTA 4BS7A 4D9ZA 1RFPA 134LA 207LA 5LINA 1LZNA 1LZSA 1VDTA 5JENB 2DQFC 1LJKA 1UCOA 2YBNA 1HSXA 3K3TA 3OK0A 4L41A 2LYMA 1NMMA 5T3FA 4N1CC 5KXNA 3TXDA 4OWHA 2MEAA 4J1BA 4LT1A 2CGIA 1HSWA 2DQCY 4CHXA 2BQDA 4ETEA 3LZ2A 1G7IC 4RW2A 1HFZA 1GB9A 2BLYA 3CT0A 1IWXA 2BQKA 2BQIA 1I1ZA 3P4ZA 1C46A 2HEFA 4FJRA 3WYHA 5LYMA 1YANA 3QY4A 4H92A 5LVJA 4FDYA 5FHWA 4AGAA 4LFPA 2BQCA 4G4HA 2Y8PA 3A6CY 3RU5A 3B0OA 3CB7A 1FDLY 1IC4Y 5LVIA 3ATNA 3W6AA 1XGTC 1LJEA 1WQOA 3A94A 4GLAA 4WLYA 3TXGA 1LYZA 4ANRA 5LVKA 1B9OA 1BB3A 1IWUA 4QEQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YXAC 1G7LC 1HMKA 3HU9A 1GAZA 4ARMA 1L66A 118LA 4YX7C 3A93A 1XEKA 3N9EA 1L48A 1TAYA 1C6DA 2FBBA 1L49A 1IX0A 2LZ2A 2EQLA 206LA 5DN4A 1CX7A 1GFTA 5LAGA 1KS3A 5F9XA 1QTCA 1WQMA 1GFGA 3HBDA 1L00A 1L73A 5APFA 4H9CA 1OUCA 2WARA 4LYTA 3P66A 5I4WA 5C6LA 1BB7A 1C08C 4N9RA 2BAAA 1LSEA 5APDA 115LA 3HH5A 1AT6A 159LA 1G0QA 4I7PA 2NWDX 3AW6A 1J1PY 1GBZA 5DN5A 1QUHA 4H8YA 2Z12A 4W94A 4NG8A 3BKVA 1UICA 3DMVA 1QT5A 1JSFA 3GUOA 4WO6A 4LYMA 1IP4A 3NYAA 1L72A 4KPMA 5KJ9A 1AKIA 4S0WA 1GEZA 3P64A 131LA 2ZIJA 5KXZA 1L44A 3P65A 6LZMA 2W1XA 1L91A 1UIGA 8LYZA 4NHPA 4DAJA 1CKFA 4WM1A 3TXFA 1B5ZA 1C6HA 186LA 1KY0A 4DDCA 2EKSC 4UWUA 1IWVA 4OWEA 5KXKA 4W56A 3A67Y 1CKCA 1GE3A 5ILFA 3AB6A 158LA 2BQHA 1GBOA 1L13A 133LA 1L74A 2OE4X 1QQYA 2B6YA 229LA 1QTEA 1D0LA 4GCCA 2G4QA 3G3WA 228LA 1QTVA 1C7PA 2PC2A 1LJIA 4Z98A 2BQAA 3GUNA 1IOQA 3G3AB 3HTDA 1NHBA 1GWDA 2B6XA 3CDQA 4NGOA 1UIFA 2ZQ4A 248LA 2NTGA 4I8SA 5KXMA 128LA 2XJWA 4ARJA 4XJHA 3EO5A 1TEWA 1LZ9A 4YOPA 5E4PA 4XN6A 1SLYA 1OUJA 3SB5A 3WU9A 4HSFA 1D0MA 1JJ0A 2BQOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5HNC A;  1G7L C;  5L9J A;  1GFE A;  1B7O A;  1HMK A;  4ETA A;  2RSC A;  1GAZ A;  5FDJ A;  3WVX A;  2HU1 A;  1LHK A;  4H91 A;  3WVY A;  5F9U A;  3M3U A;  3A93 A;  4XJG A;  1XEK A;  2A7D A;  3N9E A;  1TAY A;  2DQA A;  1LSY A;  2FBB A;  9LYZ A;  2MEG A;  4YEM A;  1LSG A;  3W6E A;  1NBY C;  4YEO A;  1IX0 A;  2LZ2 A;  2EQL A;  5C6J A;  2Z37 A;  3G3B B;  1YAQ A;  1GFT A;  4NHQ A;  2BLX A;  5DN4 A;  3LYT A;  5LAG A;  4WL7 A;  1BQL Y;  1LJG A;  4NGK A;  1OUH A;  4M6D A;  5F16 A;  5KY1 A;  4CJ2 A;  2BQF A;  5F9X A;  1DKK A;  1WQM A;  4OOO A;  5APC A;  1G7M C;  4H1P A;  1GFG A;  3AGH A;  3HBD A;  4TSB A;  4QDN A;  5C6I A;  1BB5 A;  4NGJ A;  4NFV A;  5APF A;  1D9U A;  1HML A;  4H9C A;  5D5C A;  4TUN A;  5B59 A;  3B6L A;  1ZMY L;  4BAF A;  5IDD A;  1OUC A;  3A95 A;  2Q0M X;  1HEL A;  2WAR A;  4LYT A;  3WXU A;  1GDW A;  3P66 A;  1GXX A;  4WO9 A;  5KXS A;  1P2C C;  3A8Z A;  1IO5 A;  1OUA A;  5I4W A;  3T36 A;  1DPW A;  4GN5 C;  5C6L A;  1BB7 A;  4O34 A;  1NKH A;  1C08 C;  4G4B A;  4N9R A;  2BAA A;  1LSE A; 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 4LFX A;  3E3D A;  5I4X A;  1J1X Y;  2BQJ A;  2A7F A;  1DQJ C;  2YDG A;  3WMK A;  3TMV A;  4HV2 A;  5HMJ A;  1BWJ A;  1YRO A;  1LZB A;  1F6S A;  1LZA A;  2D4K A;  1ALC A;  4LZT A;  5HMV A;  5KKJ A;  1JIY A;  1SQ2 L;  1GB3 A;  4WMG A;  4DYG A;  6LYT A;  1WVU A;  1IP5 A;  5LXW A;  1OUI A;  2C8O A;  4NGL A;  1EL1 A;  3RZ4 A;  5LVG A;  1LSA A;  1DI5 A;  2Z19 A;  1QSA A;  1LZ1 A;  1GE1 A;  1LZT A;  4NGZ A;  2D6B A;  1XGU C;  4GN4 A;  3TMU A;  4NSI A;  4TTD A;  3AYQ A;  1LYO A;  1XEJ A;  5LYZ A;  1LZ6 A;  1REX A;  1ZV5 L;  2I25 L;  3EXD A;  3W6F A;  2CJL A;  4NHT A;  4BS7 A;  4D9Z A;  1RFP A;  134L A;  207L A;  5LIN A;  1LZN A;  1LZS A;  1VDT A;  5JEN B;  2DQF C;  1LJK A;  1UCO A;  2YBN A;  1HSX A;  3K3T A;  3OK0 A;  4L41 A;  2LYM A;  1NMM A;  5T3F A;  4N1C C;  5KXN A;  3TXD A;  4OWH A;  2MEA A;  4J1B A;  4LT1 A;  2CGI A;  1HSW A;  2DQC Y;  4CHX A;  2BQD A;  4ETE A;  3LZ2 A;  1G7I C;  4RW2 A;  1HFZ A;  1GB9 A;  2BLY A;  3CT0 A;  1IWX A;  2BQK A;  2BQI A;  1I1Z A;  3P4Z A;  1C46 A;  2HEF A;  4FJR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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