1E51A

Crystal structure of native human erythrocyte 5-aminolaevulinic acid dehydratase
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
328
structure length
326
Chain Sequence
MQPQSVLHSGYFHPLLRAWQTATTTLNASNLIYPIFVTDVPDDIQPITSLPGVARYGVKRLEEMLRPLVEEGLRCVLIFGVPSRVPKDERGSAADSEESPAIEAIHLLRKTFPNLLVACDVCLCPYTSHGHCGLLSGAFRAEESRQRLAEVALAYAKAGCQVVAPSDMMDGRVEAIKEALMAHGLGNRVSVMSYSAKFASCFYGPFRDAAKSSPAFGDRRCYQLPPGARGLALRAVDRDVREGADMLMVKPGMPYLDIVREVKDKHPDLPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLKAAVLEAMTAFRRAGADIIITYYTPQLLQWLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Crystal Structure of Human Ala-Dehydratase
rcsb
molecule keywords DELTA-AMINOLEVULINIC ACID DEHYDRATASE
molecule tags Lyase
total genus 96
structure length 326
sequence length 328
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.24: Porphobilinogen synthase.
pdb deposition date 2000-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00490 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1e51A00
1P0NA 3LXCA 1OJXA 2Z2UA 1DL3A 4JYFA 2YFOA 4FNPA 2ABAA 1RD5A 1H63A 3W7LA 5D2XA 2A85A 4NVTA 2VEIA 1VCVA 3FYOA 4TMBA 2OCZA 3KRZA 4EOUA 3CB8A 3FS2A 4NZFA 5EMUA 2GVJA 2X2GA 4N02A 4WY0A 1VCGA 2Y7EA 1TTIA 2Q3OA 3BLEA 1H1ZA 5G1TA 1UUOA 1Y0EA 3C2FA 4O19A 5KINA 3INPA 2V81A 2NUXA 1KM5A 1W0MA 2O7SA 4EVZA 4RV8A 3NQGA 2X1UA 3CWNA 3UWVA 2AQWA 2H8XA 3IVUA 1TPFA 3IV3A 2A7PA 3G1AA 3H54A 2OT0A 1TYGA 4PEKA 3I7QA 3NGJA 2TMDA 1PCWA 4QNWA 1HUVA 3M6YA 4BI7A 3C0JA 3VE9A 1SUXA 3N3MA 2DORA 1OFPA 1IIHA 1ICPA 5AB3A 2GQ8A 3M16A 2J9YA 3EKLA 5FEWA 2V2CA 1YXYA 1YTKA 3W2KA 3G0XA 3BARA 2QAFA 4TO8A 7TIMA 3HJZA 4QITA 5BNKA 3QMSA 4HNTA 1XBYA 5TQLA 4FNSA 5TIMA 1GEQA 3OG3A 1W56A 4NX5A 5DXYA 2ZDRA 1JCXA 1VLWA 3O6DA 4CQAA 3SI9A 3CPRA 3LHYA 4O16A 3NOEA 3HPXA 1M5WA 2A7NA 1X1OA 3LCLA 4HPJA 2BZNA 4E2DA 4OE7A 1P4CA 2O7QA 1OX6A 3MBFA 5EPDA 4RKAA 3P81A 4YLWA 1J4EA 1FWWA 2GVGA 5K4XA 3TJLA 4A21A 1IF2A 4JX5A 5F2MA 4AWSA 3W7QA 2VFFA 3MP3A 1GYLA 1JVNA 3R12A 3S1VA 3PF3A 4UTHA 2C6QA 2ATSA 1H7WA 1L6YA 1QPNA 3FEMA 3NQ6A 4OU1A 6TIMA 3FYPA 1NEYA 5AN7A 4PFMA 3EWZA 4RZ6A 1YDNA 3W76A 4UFLA 1JR1A 4JX6A 1JRBA 4DQWA 1JUKA 3LTPA 5AC6A 1GVQA 2GPTA 1VHNA 3N9SA 2PRHA 3T44A 1LRQA 1LRNA 1B4KA 4S2BA 4BF9A 4ALDA 3PG8A 3MP4A 4LRTA 4ZVJA 2VOMA 2ZQ0A 2E6AA 3AJXA 5D33A 5BRBA 5I3HA 1VH7A 1IGSA 4BWLA 5KZMA 4PTNA 1MEWA 3R5EA 1A50A 1F6PA 4BWLC 1TV5A 4Z08A 1VCFA 4DXVA 4MYXA 4K7VA 1F05A 3TNOA 4NJJA 2C1HA 1R2SA 4QNEA 5AHMA 2CZEA 3Q37A 4ADUA 2P0OA 3IGSA 4XZ9A 1QMLA 5KMYA 1SZEA 1FQ0A 3O07A 1YPIA 5EA9A 3MP5A 3LTSA 4NXSA 3BW4A 3QPZA 1YTDA 1UBSA 3O05A 1WQ5A 3GXNA 4WUIA 5GVJA 3F03K 5KZEA 2NV2A 2CZ5A 2NZLA 1KLZA 1VRDA 2YX0A 4RXGA 3ABQA 3W84A 5HWNA 3MHUA 2GQ9A 2R14A 4GE8A 1ICQA 2NUYA 4UTIA 5L6UA 3WK0A 2HS6A 5D05A 1W5QA 3NQ2A 5DELA 3TE9A 3TH6A 3W1NA 4CCEA 4S2CA 1L9WA 1OK6A 4FF7A 3Q58A 1VC4A 1I2OA 2ZZ2A 1TJRA 4H6KA 3ZFHA 3PWAA 4UFKA 4TX9A 2H90A 1HO4A 3W1PA 4DO6A 2TSYA 5F4WA 2V30A 3PBWA 4TMCA 2E5DA 3A5FA 1R2RA 1AL7A 1WA3A 5D38A 3E96A 3LCXA 1ZAIA 4UMAA 3TAOA 3UXDA 5LHFA 2H6RA 2Z6IA 4UTUA 1K03A 5E1QA 4LV4A 5CPLA 4MJMA 3ABSA 3G1XA 4Z1CA 1R46A 4K6AA 1JQXA 2Y89A 1W5OA 2BWGA 5LKYA 3P8JA 1VYPX 3MWAA 3WJYA 1EX5A 1SO6A 1RQEA 1XUZA 1PHWA 5HUPA 3SR7A 4DF1A 1KBJA 5FEZA 2A4AA 3NNTA 3IRDA 3CM4A 1VJIA 2E68A 3L21A 4PL1A 3W85A 3LOTA 5HINA 3GNDA 4P61A 3PB0A 3NM3A 3ANYA 4JTEA 3IGUA 3CT7A 2DP3A 4JY8A 2WJZA 3DGRA 2AAMA 5CKSA 3D0CA 2CZFA 4NNCA 1S5VA 3GIYA 5DBUA 3O63A 1H60A 1DORA 2QR6A 1PL9A 1HFBA 4QAIA 4GUIA 1WBJA 3FIGA 1NSJA 3S9YA 2VFGA 4JYEA 4UC5A 4I7VA 4JR5A 5AC8A 1EWDA 2ZRZA 3B4UA 2A6NA 2E6FA 5EL1A 3ABOA 3HG5A 4O18A 1GZGA 3EX3A 4IWWA 4WOQA 3GDKA 1Q45A 2WOQA 3EXRA 5F2GA 4WD0A 4O10A 3DI1A 1P5BA 1C29A 2ZRYA 4AAJA 1TSIA 1JJKA 1MZHA 3PULA 5CZTA 3NR0A 3S5ZA 1I2RA 2OMAA 3A21A 3P60A 1OFAA 3LRKA 4IMGA 5D2YA 1XCFA 4IXHA 3HG3A 3H55A 2VELA 3SECA 3ZS4A 3QJAA 4FIRA 2YPIA 1C9DA 1EP2A 3S1WA 1AMKA 5LNVA 4N9BA 1OX4A 4WZHA 1H7XA 3SGUA 3KVKA 3SFKA 3NQDA 2QCDB 1W3IA 3KOFA 3LRLA 5CZJA 5D04C 1ZY9A 3L65A 1EP1A 3GDRA 4JTGA 4JNMA 3TIMA 5I3KA 3PUEA 1H7NA 3P5YA 3TQKA 4NJGA 5FEPA 3YPIA 3MI2A 3QSTA 3U6WA 3UWWA 2NX9A 5CG7A 4UTJA 3PBYA 3OEXA 1OFQA 5DXXA 3DAQA 5I3IA 3QPYA 3O8AA 1YPFA 4CNNA 1KFLA 4DBDA 3M0ZA 1ME8A 5F4XA 1HG3A 1GVSA 4UTLA 1G4TA 4LS1A 2ZA2A 3KFTA 3IIXA 1ME7A 5E93A 2GVLA 3ATYA 1KM1A 3SZ8A 5FF4A 1M7PA 1KLYA 3G1SA 5G4EA 2B7NA 5G4WA 5CPNA 3I6RA 4O4WA 4X9SA 5I3FA 1SW0A 1Z44A 3MJYA 1XXXA 2XFWA 4JXCA 4IXXA 4JTKA 1AK5A 1XFBA 2QCNA 3M5VA 5AOUA 3S5OA 4FX8A 3KAOA 1I45A 4RJEA 2C16A 4GUJA 3Q94A 3IIOA 3NO5A 4UTTA 5I3GA 4GUHA 4UTTC 3S6DA 2QCEA 3KXQA 5HULA 4ADSA 1GTHA 4O12A 3EXSA 4P2VA 1I2QA 3G8EA 4D2JA 3LV5A 1KV5A 3GAKA 3W7KA 1WBHA 1A5BA 3QC3A 1Z42A 1I8JA 1TPVA 2BX7A 1BKSA 1KM2A 3NQVA 2Q8LA 4AEOA 1VGAA 1JCYA 4JIQA 4O11A 3NVTA 1TRIA 4LC6A 1PV8A 4OBTA 3L0GA 2QAPA 4LVGA 3NL6A 3CU2A 4K36A 4JEQA 1XKYA 3TAKA 4O57A 1FWSA 3E12A 2CZDA 4JTUA 3E02A 4LUIA 2CU0A 3EB2A 3PY2A 1HTIA 5G5IA 1XBXA 1S3HA 1SW3A 4OV9A 1G4PA 3P82A 2ZZ7A 4UUIA 5KTLA 3W1AA 3P7YA 2P1FA 4KKXA 4NT0A 3W7RA 2V9DA 3NG3A 3VI2A 4FNRA 4UNLA 1JUBA 1QOPA 5A8GA 3RFAA 2OJPA 5LNRA 1JUEA 3FJ6A 1LOSA 4JY9A 3EWUA 5KITA 1XC4A 3P67A 4MLRA 4FNTA 5HR7A 1PIIA 4FX7A 3MW7A 4DF2A 5D2WA 2YZRA 2B7PA 3DH7A 2A1YA 5H2ZA 2ZRXA 1LBLA 4M6PA 1MSSA 2YFNA 5K9XA 5F4SA 3LX9A 3HGRA 3O1NA 4O53A 3T55A 4WQ6A 4O8RA 4J9JA 4MY9A 1KFJA 4AVFA 5EKYA 1PCKA 4CCCA 1NAL1 1IIGA 4RX0A 3W2MA 1EPXA 3IIPA 1F6KA 4MLJA 2BTMA 1EEPA 1Z41A 5FF3A 1W5MA 4NNAA 1TTPA 4YXGA 2ZZ3A 3C4UA 3MYOA 1O4UA 3OVQA 2HSAA 3SW6A 1DJQA 1LLZA 1GJPA 3W71A 2Y7GA 1J5TA 3ABRA 4JS3A 4A2SA 5AYYA 3NAVA 1OHLA 2CLFA 3GKAA 1QR7A 3TW7A 2J88A 3TC7A 4NZJA 3LLFA 3LDVA 4IMEA 4O1CA 2B0MA 4UFJA 1DQWA 5IBXA 3DFNA 1AW5A 3IVSA 5IBXC 1OF6A 3PUOA 3W7DA 1LOLA 5LSMA 4POCA 3UZ5A 2VEPA 2DZVA 2YDAA 2WNQA 1LOQA 1FCBA 5SWUA 2QDHA 3MMTA 3RU6A 1VQTA 3LM7A 2RKXA 1GG1A 2VFDA 2ZZ5A 5AHEA 4BI6A 1S5TA 1MEIA 2DZWA 3TX9A 1W3NA 3LBCA 3I68A 3QRHA 2RDUA 3WJXA 1K8ZA 4E0CA 2EF9A 2QKFA 3KRUA 2JKAA 3A5VA 1TV8A 4IX0A 5K4ZA 4R34A 2G97A 1Q6RA 5D2TA 5FI8A 2JGQA 4HNNA 4N4PA 1QPRA 3THQA 1LLWA 2GJNA 3P74A 1DHPA 5F2LA 3S5YA 4LY8A 2EKCA 4ZZ9A 3S1XA 2R8WA 4K37A 4K38A 1TJPA 1FY6A 3QFEA 3W1LA 2JGYA 5H91A 2ZRWA 3GLCA 2P10A 3F4NA 3RK8A 3O6CA 2TYSA 3M5YA 3TMQA 4R53A 3C61A 3HGOA 5A5WA 3P8IA 1UCWA 2C19A 4FNUA 2ZRUA 1KFKA 5D2VA 3W7HA 2W79A 3GXPA 3TW6A 3UPBA 3BW2A 4MZYA 2CLKA 4FEZA 3S42A 4FNQA 4GUFA 5D37A 1SO3A 3CQ0A 2CLHA 4ZQRA 1MXSA 3MHGA 4TIMA 3UY7A 3PC0A 3LCFA 2YYUA 3TROA 4LNYA 3FFSA 3NZ1A 4UMCA 2VEKA 3A22A 3N73A 3W74A 5C6MA 2H3DA 3S1UA 2V5LA 3IEBA 5HMSA 3G0SA 4UIOA 1QCWA 4ICNA 2E5CA 2EAWA 4YCOA 3BGJA 3DKJA 2J6XA 5CGQA 1L2UA 5G2HA 3L5LA 5K9DA 1O60A 3F1QA 3UWQA 5CPMA 4K8HA 2ZBTA 3JS3A 3LHVA 4LWWA 3ZWTA 5J5DA 2FIQA 3PVFA 3GYEA 1NFBA 3WK3A 4AWUA 1ONRA 2X1SA 3BK0A 3WK1A 4DEFA 1I2PA 4AHOA 3TA6A 1JCNA 4JYDA 1OFEA 3NEVA 2LLEA 3GNNA 1A5AA 1FXPA 3AO0A 3LRMA 4ZQNA 3LB0A 1YDOA 4BFAA 1NF7A 4HN4A 1BEUA 4OGZA 4O4VA 1TTQA 4K39A 3BLIA 1YLVA 4KFOA 4N6FA 2ZZ4A 3DFTA 4U28A 4GJ1A 2DZTA 2GJLA 2KZHA 5U4NA 4OV4A 1VYRA 2A21A 2YCEA 5D03A 3KVLA 3RLUA 3CC1A 2DZUA 2ZTJA 4O54A 8TIMA 2YGYA 4NX0A 5DY2A 3TSMA 3R13A 4UR8A 2FPTA 1SFLA 1QAPA 2D73A 5DCDA 3HQ1A 5AC7A 3TQ0A 1SZNA 3C56A 1LZOA 1W5PA 2YYTA 2IQTA 1AL8A 1DBTA 5FF0A 1UB3A 1JCJA 2Y85A 4IMDA 5F2IA 3T40A 3QQ1A 3PR2A 4IGHA 5TBOA 5I3JA 3W2LA 2X1TA 3N9RA 5LGXA 3G1HA 2QCMA 4WX2A 4M5PA 2E5BA 2Y70A 1FCVA 3UY8A 1OYCA 2QDGA 3M9YA 5C5YA 3C3NA 4IMFA 3L5AA 1H7PA 4AMAA 1LORA 2Y6ZA 5C55A 3RLVA 3BV4A 4MIMA 2ZA1A 3G1VA 2BSLA 2V8ZA 2I14A 2WPBA 3HGJA 1EP3A 4JTIA 4JTFA 4TR9A 1B9BA 2Y7FA 2NWRA 4NU7A 3LHUA 1XDMA 2ALDA 4M19A 2CLOA 2JBMA 3S0CA 3USBA 1SO4A 1P1XA 3LXAA 2Z1BA 4Z0JA 2W6RA 2V5BA 3TXVA 1SZFA 4BI5A 1VHCA 4HSOA 1F76A 1TPB1 3L68A 5IM51 1IXNA 1UUMA 4UFIA 1RR2A 3M41A 1KV8A 3P80A 2RDTA 1WOBA 3GX9A 1JCMP 4L4LA 1VR6A 2F84A 1W3TA 1FWNA 1WV2A 4QIUA 2FDSA 1TPC1 4I7WA 1WYIA 4HNVA 3W3OA 1N8FA 4FIQA 3O16A 2VKZG 1KM4A 1XDLA 1YTEA 1GWJA 2QJGA 4XBKA 1UJPA 2ABBA 1F7BA 4RR4A 3NQ7A 3TCEA 3EWYA 1OX4B 5FEXA 2TPSA 3W1XA 3W7NA 1Q6OA 2OZ0A 4JTHA 3ZWSA 5AHLA 5AFDA 1O5KA 3NQCA 1PVNA 1B3OA 3DHDA 3PB2A 3SGZA 2EGZA 1R47A 4ZL1A 3W70A 1TPUA 3LCGA 4WY0F 1OFRA 1YXDA 3L0KA 3NQAA 1QNVA 1XUUA 1LBFA 1ME9A 4JTTA 2XN0A 1D3GA 2VENA 3IIZA 4EWND 5DBTA 3NPUA 4LUJA 1Z48A 4WJEA 3DXIA 1DQXA 1ADOA 1LRTA 2Y88A 1IXPA 4GBUA 5EBUA 5C2XA 2PCQA 3C2EA 1TMHA 1GG0A 5AHFA 1G67A 1W54A 5CZ0A 3VE7A 1K7XA 4R7JA 3W72A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3NCO A;  1P0N A;  2Z2U A;  1W17 A;  5CPS A;  4YVV A;  3VZX A;  1YHT A;  3KCJ A;  2ABA A;  1UA3 A;  1H63 A;  2VRQ A;  1FH9 A;  2ZX7 A;  3QTP A;  2VEI A;  3PNU A;  4B2D A;  1VCV A;  4JKL A;  3LY0 A;  4QJ4 B;  3CB8 A;  1E4L A;  1GOR A;  4N02 A;  1NP0 A;  1TTI A;  1ISZ A;  3BLE A;  1MRA A;  1V3M A;  3C2F A;  4O19 A;  3INP A;  3CUJ A;  2WZI A;  3POH A;  4EVZ A;  4TOQ A;  4AD1 A;  4GZE A;  4GFI A;  4BKN A;  3CWN A;  2H8X A;  3IVU A;  4HPN A;  2A7P A;  4MAV A;  3VDB A;  5LA2 A;  1TYG A;  4LUT A;  1AVA A;  5ABG A;  2PDY A;  1HKK A;  3IJD A;  3M6Y A;  3N6H A;  4BI7 A;  3C0J A;  1ICP A;  1FRB A;  3B8T A;  3EKL A;  1YXY A;  1YTK A;  3U5U A;  1DWI M;  5REQ B;  3PZQ A;  7TIM A;  3HJZ A;  4G9P A;  1IQ8 A;  5TQL A;  2XTK A;  2ADA A;  3M0Y A;  1US2 A;  3EEZ A;  5DMN A;  5DXY A;  2ZDR A;  3O6D A;  3DOP A;  3KUM A;  1M5W A;  2A7N A;  1QW8 A;  3LCL A;  1EF2 A;  1P4C A;  2O7Q A;  2HEJ A;  3U9I A;  3CZL A;  4RKA A;  4NZC A;  5K4X A;  3MV0 1;  4DWS D;  4JX5 A;  2HRW A;  1RAK A;  2QDE A;  4KRZ A;  5JXQ A;  3W7Q A; 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