1E5JA

Endoglucanase cel5a from bacillus agaradhaerens in the tetragonal crystal form in complex with methyl-4ii-s-alpha-cellobiosyl-4ii-thio-beta-cellobioside
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRESAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mixed-Linkage Cellooligosaccharides: A New Class of Glycoside Hydrolase Inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE 5A
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus agaradhaerens
total genus 121
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2000-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e5jA00
4WK9A 3VGBA 4PMOA 1C90A 4D1JA 1HXJA 4AIOA 4UFLA 3F5LA 3MUZ1 2E40A 1QNSA 3ZJKA 3E1F1 4PUEA 4OBRA 5DEZA 1SMAA 1B3WA 1J18A 4HU8A 1HKJA 1BFNA 3AHXA 4PN2A 5A94A 1QNRA 3T0AA 3KE0A 1NWUA 4FLQA 1AQHA 3BAWA 4C7DA 4JHZA 1JL8A 3VUPA 2YA2A 3CZLA 1J0HA 5D9OA 2GJXA 2PF0A 1PX4A 1LWJA 3FHQA 2YA0A 1JNEA 1E55A 5BCAA 3O6AA 5CLWA 2WHMA 2PWDA 1HL9A 2D23A 1C93A 2WKGA 4RL3A 1BHGA 5E6YA 1H5VA 1NOFA 1X6LA 1WZMA 1FP8A 1OWQA 2XM1A 1V0LA 3IJ8A 3S2CA 1BLIA 4KMQA 4HOXA 2V3EA 4BQ2A 1V0KA 3WNKA 1QI2A 2CBJA 2VRJA 4TVUA 1CZ1A 1OGSA 3CUHA 3SCOA 1TVPA 1W9XA 5I0DA 1PBGA 2EXOA 2DSWA 2XVLA 4CN4A 3IANA 4W86A 2E3ZA 4V27A 1W1TA 2ZUVA 5D8ZA 4IPNB 1V6YA 5I6SA 1UWSA 4J28A 2X0YA 3EMZA 2WZIA 2FH6A 2DIJA 1NH6A 2J7DA 1JZ5A 4JKMA 1TG7A 1VFOA 2VZOA 1UH4A 4DM2A 3NJ3A 3VX1A 5E6ZA 1ZBCA 1G0CA 3GNOA 1H1NA 1DWJM 1JI1A 1B3VA 2BVYA 2F2HA 3GNRA 1E9LA 4ZEPA 3ARZA 1SR0A 1V6WA 3WMCA 2VR4A 5A2AA 1W9PA 1RPKA 2VZVA 4A3HA 5BRQA 3F5KA 5HOSA 1GONA 2X0HA 4MDOA 3BAKA 2PWEA 3AXXA 2YBTA 3IK2A 1UR9A 3EBVA 3K4AA 1J0ZA 1AVAA 3GXFA 5A8NA 4RE3A 5I3DA 3AMDA 1E4LA 3L4ZA 4AMCA 2CCRA 3AIRA 3VIIA 3MUIA 4CU6A 2IUZA 1ISZA 2G4FA 1UQZA 5BYWA 3AIVA 5AYIA 3NSXA 1V3JA 3DHUA 2YKKA 1JZ8A 2C8NA 1DWGM 4OIFA 5DMYA 2XIBA 1E6SM 3AHVA 3WUBA 1WNOA 1E0WA 2FGLA 3GTNA 2CERA 1VFMA 4UTFA 3U7VA 3GXIA 2VC9A 1KCLA 4QFUA 1UZ1A 4MJ4A 3A3HA 3AIEA 3WF0A 5A6AA 1ITXA 1V3KA 1ZS2A 3PZUA 4TTGA 1WB0A 2FDMA 4UFHA 1OGGA 2WZEA 4MB3A 4W88A 1KXHA 4OBSA 4E2OA 4F9DA 1RH9A 1UD8A 3UR8A 3WH5A 3AFBA 1VAHA 3B9DA 2WBGA 2J77A 2CITA 2PB1A 3I3EA 1NOUA 3WNPA 1YHTA 1JZ7A 4BQ3A 1C7SA 1H2JA 4U31A 3L4XA 4UFKA 3WNNA 1E15A 4LXFA 4FMVA 3RO8A 4MNJA 3WMBA 2VOTA 3GZAA 3SCNA 4EE9A 2X8RA 3GH4A 3ZR5A 4RE4A 1CXEA 2QF8A 3AYRA 5JBDA 1UR1A 1N82A 4A4AA 4AW7A 4E4PA 2VRQA 1OD8A 2ZX8A 3VKKA 1B3YA 3RM4A 1Q6CA 3MSGA 4W8AA 2EPOA 1PIFA 4D6FA 3DC0A 4LYQA 1UKPA 5HXMA 3BSGA 3DHPA 5IHSA 3PZVA 2VL4A 3ZJ7A 4W89A 1QW9A 1WZLA 2ZWYA 1MXGA 4LX4A 1UH3A 3BSHA 3OZPA 1QW8A 2ZE0A 1WZKA 1GHSA 3BAXA 4P7RA 2X09A 2WW5A 3OLEA 1TA3B 2VCBA 4UQDA 1PZ2A 4NZCA 1G5AA 1XC6A 4MJ2A 3OZOA 1LLOA 4JFTA 2WC7A 4B3LA 2DSZA 3SURA 4U3CA 3VGFA 4JFSA 4J3XA 1B3ZA 3CMJA 2CBUA 2DT2A 4AZ7A 1NQ6A 3BLKA 3PTQA 3N15A 4W87A 4PBGA 4UNIA 1EIBA 4HOWA 2XUCA 2XHYA 5C70A 4UQCA 2D3NA 3LPOA 4C7GA 4BS0A 4F9JA 3VVGA 5E0FA 1ITCA 5ABEA 1JZ4A 3WEZA 2WCAA 1QHPA 2EPLX 1KGWA 3VO0A 1BYAA 3LMYA 4Z2JA 2W63A 2QPSA 4AWEA 3AIBA 4CGTA 4GQQA 5CQ1A 2BXYA 1MW0A 1M04A 1TFVA 3WN6A 3WDQA 3NDZA 2ZX7A 2YOCA 2WVUA 2E9LA 2XM2A 4GPNA 4ZENA 2E9MA 3ZOAA 1VIWA 1EO7A 2D2OA 3IAQA 1OGBA 3AS2A 1HKMA 2QMKA 1UWRA 1G1YA 4WIWA 4P7NA 1RD6A 1OINA 2GVYA 5E09A 1ISYA 2W5FA 1UA7A 5DO8A 3WKZA 4F8XA 3UERA 1D7FA 2WK2A 2YL5A 2JIWA 3K4DA 1MW1A 1UR0A 1XSJA 4CCDA 1JXJA 2CIPA 3ARQA 2OYLA 1PAMA 1QVBA 3L4VA 2ZICA 4ATLA 3AMCA 4J27A 1W3HA 3ECQA 4GXPA 2BS9A 3DYMA 4QLJA 3WQ4A 1R86A 3B9AA 4WLCA 4B15A 5A2BA 5A6LA 4Z2IA 5IXEA 2ZUTA 3CBWA 3VIPA 1DP0A 3QOKA 1H0IA 4FK9A 4JL1A 5GQBA 1LL4A 1NP2A 3W6LA 1KGUA 3VIFA 4S3KA 2WLZA 2UY5A 3ARTA 1DWFM 2EJ1A 3VDCA 3M07A 3WQVA 1X6NA 4KGLA 1EHNA 3GXDA 1BVZA 4TOQA 5I77A 1D3CA 4AZ6A 1MFUA 2O92A 3OG2A 1KBBA 6A3HA 3WD1A 1V02E 5HBFA 4U2ZA 1JZ6A 3VNYA 1ZBKA 5A1AA 2O9OA 3GXMA 4TTUA 3S6TA 1JF6A 2WYSA 3AISA 4H04A 1ZBWA 2DSKA 3ARSA 1GOQA 3GDBA 4ZXLA 2ESCA 1US2A 4CD4A 1W1YA 4H8HA 5JBFA 4PMUA 2Y8VA 3EMQA 2VI0A 4WKHA 1KGXA 2WCGA 1UKOA 3VD7A 1D2KA 2VZUA 3VMNA 2VQUA 2ZOXA 1JGIA 2F61A 4JHOA 3SCPA 3N18A 3W81A 3I3DA 2XGBA 4CD6A 4AEEA 1V6UA 2PC8A 5ABFA 2WHLA 3AXIA 1W9BM 1OIFA 2XVNA 2RGLA 3BCFA 1UH2A 2QLYA 3EYPA 1BTCA 2NT1A 2VQTA 1V6VA 4PMZA 5ABHA 2BY2A 1B31A 1GJWA 2XWDA 3RMEA 2J8GA 3K8KA 1E56A 5GNZA 5CJ5A 1KXTA 4FF5A 4M80A 4GZIA 4D6GA 2CHOA 4DWSC 3VNZA 2FHBA 3WH7A 2CPUA 3N9KA 5D4YA 3BAIA 1KQZA 4AD3A 1G94A 3OB8A 4QDMA 4KRTA 2VNCA 1PX3A 4PSPA 5A8PA 5LA1A 4J3SA 4NI3A 2W67A 1H09A 4HMCA 2BFGA 2DSVA 4D6HA 1CWYA 2NW0A 4BZYA 3VGEA 1H41A 2J25A 4FLRA 2OWCA 4F79A 5A69A 2BHUA 2PBGA 3CGTA 3A4WA 1KR1A 2IXVA 4AZCA 3AIWA 2O9TA 3U57A 1V0NA 2Y4SA 1R7AA 3PZOA 4PMDA 5F7UA 1ZBVA 3ZSTA 1UD4A 4CN6A 1B0IA 4W85A 1JYXA 4PMRA 2J79A 2XYLA 1G01A 1ZU8A 5HDRA 3WF4A 4UQAA 3VD4A 3SCUA 2JEPA 5LA2A 1W32A 3BLPX 3K1DA 2J78A 1IT0A 4HA4A 1WZAA 3OGRA 3OLGA 1V3LA 3OLDA 1UUQA 3VOCA 4CCCA 1BVNP 1UKQA 3AQUA 3WDPP 4B16A 4PMQA 1LJYA 2V3FA 2PWFA 3W27A 1HJUA 2J7FA 3QHOA 3KWXA 3U5YA 3F4VA 2XWEA 1W2VA 4ACZA 3AHTA 4HOZA 1CECA 3BAJA 1MWOA 1HJSA 1E72M 1WCGA 4H8UA 4P7QA 4DWSA 1TUXA 3POCA 5D9MA 3G6LA 3L2LA 3RJYA 1FH7A 4RE2A 2GJRA 3EDKA 3N11A 5IHRA 1H11A 1E1FA 4PSRA 1IZJA 5FIPA 4N0RA 4NSBA 2V5CA 4GKLA 1HT6A 1M03A 2VO5A 2Q8XA 4YHGA 3RCNA 2VMFA 3VTRA 3BMWA 3BGAA 1QI5A 3J7HA 3VILA 1I1WA 1L0PA 4WJXA 4CD7A 1KCKA 1BG4A 2DPEA 2W91A 4P8VA 4IM4A 4W93A 1ISVA 3GH7A 1WKYA 4LPCA 2WKLA 3T08A 1PIGA 2WVVA 3PZMA 1OB0A 2YLLA 4AIEA 1O6IA 1MXDA 1W3KA 5KZ6A 5ECUA 3SUUA 3MMDA 4JL2A 3GNPA 2GJXB 1FHDA 3AICA 1C3FA 2G3JA 2OWXA 1CGVA 5A2CA 4R5EA 5I5RA 1UD2A 2OSYA 3KEHA 4Y7EA 1XD1A 3TTQA 1QPKA 1C92A 1RP8A 3PZTA 4EANA 1GQIA 5A6KA 3CHEA 1JDAA 5ABGA 3CZJA 1U30A 1J11A 2OSWA 2E8YA 2FGZA 4GZJA 3T2PA 3ALGA 1UHVA 4HMDA 4D1IA 1QNPA 2PWHA 2WXDM 1UG6A 3W37A 4Z2GA 5CGMA 2BVTA 3BMVA 3WMSA 1IZKA 1JYVA 1M53A 2GJPA 3O9NA 2VT0A 1KWGA 1CGTA 4UR9A 4QCFA 3VX0A 1Y7VA 3AROA 2CYGA 2WPGA 2UY3A 3ARXA 1GUVA 3EDJA 2VRKA 4XZBA 5HNNA 5CG0A 3A4AA 4GI9A 3QHNA 1CENA 2PWGA 1SFSA 2VVSA 3POHA 5D9NA 3WF3A 4Z2KA 4UCFA 4YPJA 3AHYA 4JFUA 2C0HA 3VIKA 1KQYA 1U33A 8A3HA 1KR0A 3CO4A 3CTTA 1JD9A 2D0FA 1CTNA 4AC1X 4F66A 1R85A 1JI2A 4GO9A 4UOJA 2WMHA 1Q4NX 2G41A 1FA2A 4S3JA 3GH5A 1WAWA 2EEXA 3EMCA 3RDKA 4UOQA 3GBDA 4HMEA 1GVIA 1NWRA 1XH1A 2E8ZA 1AQ0A 3FAWA 3CZGA 1E0XA 2PI6A 1CEOA 4CVUA 3ZMRA 2X2YA 1MQRA 4OJYA 2A3HA 2DH2A 5GNYA 1EDTA 3MSDA 4CU7A 1DEDA 3CHDA 4MNMA 2ZUNA 5I78A 3N13A 3GYCA 4P7LA 1MW3A 4W5UA 1X1NA 4AZBA 2XJ7A 4AD5A 3N1AA 4KH2A 1NOWA 1XH0A 5BRPA 1UD3A 1OD0A 2D0GA 4M81A 1UR2A 3OGVA 4HA1A 1BYCA 4U5IA 1VFFA 1NP0A 1EDGA 4W7VA 3GM8A 1R8LA 3DECA 5M3WA 4UFJA 2A3EA 4YHEA 3UG4A 1B2YA 3CMGA 2DIEA 4P7OA 5E9AA 3NUKA 2E0PA 1QI3A 5HPCA 5CPSA 4WSJA 1HIZA 2J75A 1MFVA 1S46A 5DT5A 3PZNA 1EQCA 2C7FA 3CHFA 4U5KA 4EKJA 5CPTA 4J7RA 2XSAA 2WWCA 3ARWA 1BYBA 2JF6A 2YL9A 4XV0A 3JUGA 1E43A 3WFLA 1W9UA 1V08A 1C7TA 3AOFA 5LA0A 2ZX9A 4EAMA 4B3KA 1CGUA 2WMIB 3PBGA 3AS3A 6CGTA 1J12A 1GOIA 4QAWA 3AMGA 1LWHA 3ZR6A 4LQ1A 4JKLA 3SUSA 3GBEA 3MMWA 1K6AA 3TTSA 4AZHA 1E6NA 1KXVA 3B9EA 2OYMA 1HJVA 2E9BA 5M5DA 1W9DM 2MANA 4P8WA 1JF5A 4MB4A 5I2UA 3CHCA 3VIJA 2VZSA 3WELA 1XYFA 2G3IA 1LF1A 3VIGA 4MTVA 4M8UA 3M6DA 3WD3A 2UY2A 3RM8A 3SCQA 3TONA 4WF7A 3KZSA 2G3NA 7CGTA 3FXYA 4AISA 1C8QA 4CN1A 5JIWA 1VFUA 3WQ8A 4D6CA 3QOMA 2EO7A 2ZXDA 1QOXA 2J7BA 1QI4A 4M29A 2D20A 1UYQA 4H8VA 3MANA 3WH6A 4M56A 4QLKA 3MUAA 5BXRA 4UZSA 3WFZA 1HN1A 3OA5A 1AQMA 1MYRA 4JIEA 1EDQA 3SEPA 5AY7A 1HKKA 1VJSA 2J4GA 1MQQA 1E73M 3ZM8A 1UOKA 1V0MA 2DDXA 4UFIA 6TAAA 1OCQA 3WIJA 2YL6A 3TTOA 3T2OA 1TZ7A 2W4XA 1CLXA 1JZ2A 1VENA 1K9FA 4QCEA 2WAGA 1KFWA 5I23A 5EMYA 2GFTA 1FH9A 1R7OA 5CLTA 4HZ8A 4PMVA 3AI0A 2OWWA 3BXWA 5E70A 5EFFA 1BAGA 3RIKA 1J0KA 1J10A 1W2PA 4W7WA 4XZWA 3QHMA 3KL0A 4HZ7A 4UOZA 3AYSA 4W7UA 3MO4A 4AXNA 2ZX5A 2Z1KA 4PMXA 1K9EA 4M1RA 2BHYA 1GOWA 1FP9A 2DH3A 9CGTA 3THDA 3AHZA 2WNWA 3VGGA 3A4XA 1JFXA 4D72A 1JYWA 1HNYA 2ZIDA 1SYTA 1E4MM 4PUDA 1M01A 3WDHA 5C71A 3N12A 1HL8A 3T2QA 3ZT5A 4UQBA 4TVCA 4DUXA 1U2YA 1UZ4A 4W8BA 1JXKA 1GHRA 4GO8A 1TR1A 2CBVA 1AMYA 2D3LA 5BXPA 1BYDA 1DWHM 1QHZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4WK9 A;  3VGB A;  4PMO A;  1C90 A;  4D1J A;  1HXJ A;  4AIO A;  4UFL A;  3F5L A;  3MUZ 1;  2E40 A;  1QNS A;  3ZJK A;  3E1F 1;  4PUE A;  4OBR A;  5DEZ A;  1SMA A;  1B3W A;  1J18 A;  4HU8 A;  1HKJ A;  1BFN A;  3AHX A;  4PN2 A;  5A94 A;  1QNR A;  3T0A A;  3KE0 A;  1NWU A;  4FLQ A;  1AQH A;  3BAW A;  4C7D A;  4JHZ A;  1JL8 A;  3VUP A;  2YA2 A;  3CZL A;  1J0H A;  5D9O A;  2GJX A;  2PF0 A;  1PX4 A;  1LWJ A;  3FHQ A;  2YA0 A;  1JNE A;  1E55 A;  5BCA A;  3O6A A;  5CLW A;  2WHM A;  2PWD A;  1HL9 A;  2D23 A;  1C93 A;  2WKG A;  4RL3 A;  1BHG A;  5E6Y A;  1H5V A;  1NOF A;  1X6L A;  1WZM A;  1FP8 A;  1OWQ A;  2XM1 A;  1V0L A;  3IJ8 A;  3S2C A;  1BLI A;  4KMQ A;  4HOX A;  2V3E A;  4BQ2 A;  1V0K A;  3WNK A;  1QI2 A;  2CBJ A;  2VRJ A;  4TVU A;  1CZ1 A;  1OGS A;  3CUH A;  3SCO A;  1TVP A;  1W9X A;  5I0D A;  1PBG A;  2EXO A;  2DSW A;  2XVL A;  4CN4 A;  3IAN A;  4W86 A;  2E3Z A;  4V27 A;  1W1T A;  2ZUV A;  5D8Z A;  4IPN B;  1V6Y A;  5I6S A;  1UWS A;  4J28 A;  2X0Y A;  3EMZ A;  2WZI A;  2FH6 A;  2DIJ A;  1NH6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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