1E6IA

Bromodomain from gcn5 complexed with acetylated h4 peptide
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
RGPHDAAIQNILTELQNHAAAWPFLQPVNKEEVPDYYDFIKEPMDLSTMEIKLESNKYQKMEDFIYDARLVFNNCRMYNGENTSYYKYANRLEKFFNNKVKEIPEYSHLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Gene regulation
molecule keywords TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR GCN5
publication title The Structural Basis for the Recognition of Acetylated Histone H4 by the Bromodomain of Histone Acetyltransferase Gcn5P
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 39
structure length 110
sequence length 110
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2000-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 1e6iA00
4NS5A 4ALHA 5E73A 5D26A 5E3DA 2F6JA 4QB3A 4LDFA 4TU6A 4O78A 2DVQA 5CQ6A 3O33A 4TT4A 5FE0A 5CY9A 4CUPA 3P5OA 4QR3A 5FFYA 5FB0A 2RI7A 5CQ5A 3TLPA 3S92A 5JWMA 5FE4A 5BT5A 5D3JA 5HEMA 5LVRA 5D3SA 4NYXA 3NXBA 2DVRA 4OGIA 5HCLA 5DX4A 5DW1A 4YY4A 4ZQLA 3P1FA 4UITA 2R0VA 3MUKA 5KTXA 4UYFA 4TS8A 4N4IA 5D3TA 5E0RA 3HMFA 5C7NA 5IBNA 4UIVA 5H85A 4O74A 4QYLA 3UV2A 4Y03A 3LQIA 5KHMA 4A9FA 5E9VA 5FH6A 5E74A 4QUTA 4TZ8A 5F61A 5F63A 4YYHA 2D9EA 4QYDA 4NRAA 5FB1A 4QY4A 4O7CA 4UIXA 3U5MA 3O36A 5EPSA 3K2JA 4C67A 4A9LA 2WP1A 4UYGA 5ENJA 4A9NA 2F6NA 3MXFA 2H60A 5EM3A 4QZSA 5CU8A 5HFQA 2DVVA 4QUUA 2YELA 4FLPA 5CQAA 5DKDA 4J0SA 5DLXA 3U5JA 5EPBA 4CURA 5I86A 4BW3A 4CUQA 1JM4B 3UV5A 5E7DA 4YYGA 3LQJA 3UVWA 5F5ZA 2R0YA 2G4AA 2L5EA 3Q2FA 5D7XA 1JSPB 4QSSA 5HFRA 4O70A 5C4QA 3JVJA 5ENIA 4LYIA 4YADA 2YW5A 4IR4A 4O75A 4QSPA 4WHWA 5EPRA 5F62A 4YBMA 5FG6A 4Z93A 4YBSA 4CUSA 5F60A 4BW4A 3Q2EA 5IGMA 4ZW1A 2R0SA 4J0RA 4HXRA 4X2IA 5FE8A 4CUUA 4IOQA 4QBMA 2L85A 5EWVA 5A5RA 2OSSA 4YABA 4YAXA 5ENFA 4PCIA 4MENA 4BW2A 3RCWA 3P1CA 3UV4A 4Z1QA 4A9OA 5CUAA 5A5NA 5BT4A 3MULA 4NUCA 5FH8A 3IU6A 1X0JA 4TU4A 4YYMA 1N72A 2E7OA 5I89A 4MR6A 4O7BA 4KCXA 5HRXA 4IR5A 5CUEA 5I29A 3O35A 3JVMA 4CL9A 5KTUA 5LVQA 4PKLA 4MEPA 3AADA 4NR9A 5LKTA 5FE5A 4CFKA 5DFDA 4O72A 2LSPB 5DFCA 4TTEA 5HELA 4IORA 1E6IA 4YYKA 5CTLA 5COIA 4E96A 3UVXA 4BW1A 5D0CA 4LR6A 4HXPA 3O34A 5C87A 3UVDA 4RVRA 5EWHA 3LQHA 4LZSA 2I7KA 4UIUA 4NUEA 4YATA 5DYCA 4XY9A 5EWDA 5HQ6A 4LC2A 4QR5A 4IR3A 3U5OA 3G0LA 3SVGA 4IR6A 4HBVA 5FFVA 5CP5A 4N4FA 4HXSA 4OGJA 5CUDA 4IOOA 5L8UA 5CS8A 3U5LA 2RNWA 4LRGA 5C8GA 4AKNA 5CRZA 4QNSA 5H1UA 5A5OA 4NYWA 5DW2A 5EU1A 4QR4A 5KTWA 4YYDA 4O76A 5A7CA 4QEVA 5I7XA 4BJXA 4NXJA 3LJWA 4QSQA 5EWCA 4QSVA 1WUGA 4OUFA 2E3KA 4N4GA 2OUOA 5IG6A 5IGKA 2E7NA 5CRMA 3DAIA 5HM0A 1EQFA 3U5KA 4NR8A 5FE9A 5CQ3A 4NR7A 5E9IA 5E9YA 4HXKA 5BT3A 5I83A 3G0JA 5FG5A 5A5QA 4WIVA 4UIZA 3QZVA 4NRCA 1ZS5A 5I40A 4XY8A 5G4RA 5FE3A 4O77A 4YC9A 5CUBA 5C89A 5F1LA 4XUBA 5J0DA 3P1EA 3I3JA 4TT2A 5JI8A 3U5NA 5DYAA 5ENGA 5TCMA 5ACYA 5D3NA 5I88A 5F2PA 2D82A 5A82A 3UW9A 2FSAA 4CFLA 5DBMA 4YYIA 5H1VA 4QSWA 4LYWA 4MEOA 2I8NA 3HMHA 2RO1A 5EGUA 4PS5A 4WHUA 3AQAA 5A5SA 5D3RA 5DKCA 4UYFB 3JVLA 5ENEA 3SVFA 5I7YA 4DONA 2GRCA 4TZ2A 5CPEA 4C66A 3ONIA 5DY7A 4YK0A 4MR4A 5E9LA 5L96A 2DATA 5IGNA 2N9GA 4YY6A 4O7AA 5L98A 3UVYA 2WP2A 5CQ7A 4Q0OA 3IU5A 5EV9A 3FKMX 2YEKA 4CUTA 4NYVA 4HBXA 4YYJA 2YYNA 3QZSA 3O37A 2YEMA 4LZRA 5ENCA 4QSTA 5HRWA 5CQTA 5L97A 5ENBA 2RS9B 5D24A 4HXNA 4NR5A 4NQNA 4UIWA 3S91A 5F1HA 4ALGA 2RNXA 4YH4A 4J1PA 5FE6A 5EICA 5FE1A 4HXLA 5A83A 5K29A 4HBWA 5CQ4A 5FBXA 3U5PA 5FE7A 4PTBA 4UYHA 4F3IA 5KO4A 5AD3A 4NR4A 5CUCA 4XUAA 4N3WA 4LZ2A 1WUMA 4HXOA 2DKWA 4QSRA 5EQ1A 4BHWA 5LJ0A 4PY6A 4J3IA 5TB6A 5L8TA 4O7FA 5I80A 4KV4A 4QC1A 5F3AA 4ZC9A 3SVHA 5HRVA 2MJVB 2RNYA 5DYUA 5II2A 5E3GA 5F36A 4NR6A 4NRBA 5D25A 5CZGA 2R10A 5E9MA 4QEWA 5A81A 4QEUA 3MB3A 4MEQA 5C85A 4UYEA 5AMEA 4YYNA 4Z6IA 5DLZA 4YH3A 5EP7A 5E9KA 5EI4A 5HLSA 5I1QA 4GPJA 4TQNA 2RFJA 4O71A 4TYLA 4LYSA 5FH7A 5CGPA 5FFWA 5IGLA 2DVSA 3D7CA 2L84A 4XYAA 3QZTA 3ZYUA 5H1TA 5FE2A 2YDWA 4NUDA 4UIYA 5FG4A 4Z1SA 5LKZA 4MR3A 4QC3A 5HQ5A 5ETBA 5CQ8A 5AMFA 2NXBA 4YBTA 5F25A 5DFBA 5HJCA 4A9HA 5G4SA 5CUGA 4HBYA 5LKUA 5A5PA 4O7EA 2YQDA 5KU3A 5CFWA 3LXJA 4Q0NA 5DKHA 4A9EA 3HMEA 5A85A 3MQMA 4CLBA 4Z6HA 4QSXA 5FDZA 5HENA 5DYXA 5EWWA 4QSUA 4A9MA 5D3PA 5D3LA 4KV1A 2KTBB 5EK9A 2OO1A 5LUUA 4N4HA 4A9IA 5LKXA 5L99A 4PCEA 4A9JA 1F68A 3JVKA 3DWYA 5EA1A 5IIDA 2DWWA 5LJ2A 5D3HA 4MR5A 5EVAA 4HXMA 5LJ1A 5AD2A 3GG3A 4NQMA 5ETDA 5II1A 3P1DA 5EISA 5ENHA 4A9KA 4TT6A 4UYDA 5HQ7A 3MB4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NS5A 4ALHA 5E73A 5D26A 5E3DA 2F6JA 4QB3A 4LDFA 4TU6A 4O78A 2DVQA 5CQ6A 3O33A 4TT4A 5FE0A 5CY9A 4CUPA 3P5OA 4QR3A 5FFYA 5FB0A 2RI7A 5CQ5A 3TLPA 3S92A 5JWMA 5FE4A 5BT5A 5D3JA 5HEMA 5LVRA 5D3SA 1PUOA 4NYXA 3NXBA 2DVRA 4OGIA 5HCLA 5DX4A 5DW1A 4YY4A 4ZQLA 3P1FA 4UITA 2R0VA 3MUKA 5KTXA 4UYFA 4TS8A 4N4IA 5D3TA 5E0RA 3HMFA 5C7NA 5IBNA 4UIVA 3ERRA 5H85A 4O74A 4QYLA 3UV2A 4Y03A 3LQIA 5KHMA 4A9FA 5E9VA 5FH6A 5E74A 4AKIA 4QUTA 4TZ8A 5F61A 5F63A 4YYHA 2D9EA 4QYDA 4NRAA 5FB1A 4QY4A 4O7CA 4UIXA 3U5MA 3O36A 5EPSA 3K2JA 4C67A 4A9LA 2WP1A 4UYGA 5ENJA 4A9NA 2F6NA 3MXFA 2H60A 5EM3A 4QZSA 5CU8A 5HFQA 2DVVA 4QUUA 2YELA 4FLPA 5CQAA 5DKDA 4J0SA 5DLXA 3U5JA 5EPBA 4CURA 5I86A 4BW3A 4CUQA 1JM4B 3UV5A 5E7DA 4YYGA 3LQJA 3UVWA 5F5ZA 2R0YA 2G4AA 2L5EA 3Q2FA 5D7XA 1JSPB 4QSSA 5HFRA 4O70A 5C4QA 3JVJA 5ENIA 3VKGA 4LYIA 4YADA 2YW5A 4IR4A 4O75A 4QSPA 4WHWA 5EPRA 5F62A 4YBMA 5FG6A 4Z93A 4YBSA 4CUSA 5F60A 4BW4A 3Q2EA 5IGMA 4ZW1A 2R0SA 4J0RA 4HXRA 4X2IA 5FE8A 4CUUA 4IOQA 4QBMA 2L85A 5EWVA 5A5RA 2OSSA 4YABA 4YAXA 5ENFA 2EJNA 4PCIA 4MENA 4BW2A 3RCWA 3P1CA 3UV4A 4Z1QA 4A9OA 5CUAA 5A5NA 5BT4A 3MULA 4NUCA 5FH8A 3IU6A 1X0JA 4TU4A 4YYMA 1N72A 2E7OA 5I89A 4MR6A 4O7BA 4KCXA 3D1DA 4IR5A 5CUEA 5HRXA 5I29A 3O35A 3JVMA 4CL9A 5KTUA 5LVQA 4PKLA 4MEPA 3AADA 4NR9A 5LKTA 5FE5A 4CFKA 5DFDA 4O72A 2LSPB 5DFCA 4TTEA 5HELA 4IORA 1E6IA 4YYKA 5CTLA 5COIA 4E96A 3UVXA 4BW1A 5D0CA 4LR6A 4HXPA 3O34A 5C87A 3UVDA 4RVRA 5EWHA 3LQHA 4LZSA 2I7KA 4UIUA 4NUEA 4YATA 5DYCA 4XY9A 5EWDA 5HQ6A 4LC2A 4QR5A 4IR3A 3U5OA 3G0LA 3SVGA 4IR6A 4HBVA 5FFVA 5CP5A 4N4FA 4AKHA 4HXSA 4OGJA 5CUDA 4IOOA 5L8UA 5CS8A 3U5LA 2RNWA 4LRGA 5C8GA 4AKNA 5CRZA 4QNSA 5H1UA 5A5OA 4NYWA 5DW2A 5EU1A 4QR4A 5KTWA 4YYDA 4O76A 5A7CA 4QEVA 5I7XA 4BJXA 4NXJA 3LJWA 4QSQA 5EWCA 4QSVA 1WUGA 4OUFA 2E3KA 4N4GA 2OUOA 5IG6A 5IGKA 2E7NA 5CRMA 3DAIA 5HM0A 1EQFA 3U5KA 4NR8A 5FE9A 5CQ3A 4NR7A 5E9IA 5E9YA 4HXKA 5BT3A 5I83A 3G0JA 5FG5A 5A5QA 4WIVA 4UIZA 3QZVA 4NRCA 1ZS5A 5I40A 4XY8A 5G4RA 5FE3A 4O77A 4YC9A 5CUBA 5C89A 5F1LA 4XUBA 5J0DA 3P1EA 3I3JA 4TT2A 5JI8A 3U5NA 5DYAA 5ENGA 5TCMA 5ACYA 5D3NA 5I88A 5F2PA 2D82A 5A82A 3UW9A 2FSAA 4CFLA 5DBMA 4YYIA 5H1VA 4QSWA 4LYWA 4MEOA 2I8NA 3HMHA 2RO1A 5EGUA 4PS5A 4WHUA 3AQAA 5A5SA 5D3RA 5DKCA 4UYFB 3JVLA 5ENEA 3SVFA 5I7YA 4DONA 2GRCA 4TZ2A 5CPEA 4C66A 3ONIA 5DY7A 4YK0A 4MR4A 5E9LA 5L96A 2DATA 5IGNA 2N9GA 4YY6A 4O7AA 5L98A 3UVYA 2WP2A 5CQ7A 4Q0OA 3IU5A 5EV9A 3FKMX 2YEKA 4CUTA 4NYVA 4HBXA 4YYJA 2YYNA 3QZSA 3O37A 2YEMA 4LZRA 5ENCA 4QSTA 5HRWA 5CQTA 5L97A 5ENBA 2RS9B 5D24A 4HXNA 4NR5A 4NQNA 4UIWA 3S91A 5F1HA 4ALGA 2RNXA 3VKHA 4YH4A 4J1PA 5FE6A 5EICA 5FE1A 4HXLA 5A83A 5K29A 4HBWA 5CQ4A 5FBXA 3U5PA 5FE7A 4PTBA 4UYHA 4F3IA 5KO4A 5AD3A 4NR4A 5CUCA 4XUAA 4N3WA 4LZ2A 1WUMA 4HXOA 2DKWA 4QSRA 5EQ1A 4BHWA 5LJ0A 4PY6A 4J3IA 5TB6A 5L8TA 4O7FA 5I80A 4KV4A 4QC1A 5F3AA 4ZC9A 3SVHA 1ZKRA 5HRVA 2MJVB 2RNYA 5DYUA 5II2A 5E3GA 5F36A 4NR6A 4NRBA 5D25A 5CZGA 2R10A 5E9MA 4QEWA 5A81A 4QEUA 3MB3A 4MEQA 5C85A 4UYEA 5AMEA 4YYNA 4Z6IA 5DLZA 4YH3A 5EP7A 5E9KA 5EI4A 5HLSA 5I1QA 4GPJA 4TQNA 2RFJA 4O71A 4TYLA 4LYSA 3D1BA 5FH7A 5CGPA 5FFWA 5IGLA 2DVSA 3D7CA 2L84A 4XYAA 3QZTA 3ZYUA 5H1TA 5FE2A 2YDWA 4NUDA 4UIYA 5FG4A 4Z1SA 5LKZA 4AI6A 4MR3A 4QC3A 5HQ5A 5ETBA 5CQ8A 5AMFA 2NXBA 4YBTA 5F25A 5DFBA 5HJCA 4A9HA 5G4SA 5CUGA 4HBYA 5LKUA 5A5PA 4O7EA 2YQDA 5KU3A 5CFWA 3LXJA 4Q0NA 5DKHA 4A9EA 3HMEA 5A85A 3MQMA 4CLBA 4Z6HA 4QSXA 5FDZA 5HENA 5DYXA 5EWWA 4QSUA 4A9MA 5D3PA 5D3LA 4KV1A 4AKGA 2KTBB 5EK9A 2OO1A 5LUUA 4N4HA 4A9IA 5LKXA 5L99A 4PCEA 4A9JA 1F68A 3DWYA 3JVKA 5EA1A 5IIDA 2DWWA 5LJ2A 5D3HA 4MR5A 5EVAA 4HXMA 5LJ1A 5AD2A 3GG3A 4NQMA 5ETDA 5II1A 3P1DA 5EISA 5ENHA 4A9KA 4TT6A 4UYDA 5HQ7A 3MB4A
chains in the Genus database with same CATH topology
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