1E73M

2-f-glucosylated myrosinase from sinapis alba with bound l-ascorbate
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
499
structure length
499
Chain Sequence
EITCQENLPFTCGNTDALNSSSFSSDFIFGVASSAYQIEGTIGRGLNIWDGFTHRYPNKSGPDHGNGDTTCDSFSYWQKDIDVLDELNATGYRFSIAWSRIIPRGKRSRGVNEKGIDYYHGLISGLIKKGITPFVTLFHWDLPQTLQDEYEGFLDPQIIDDFKDYADLCFEEFGDSVKYWLTINQLYSVPTRGYGSALDAPGRCSPTVDPSCYAGNSSTEPYIVAHHQLLAHAKVVDLYRKNYTHQGGKIGPTMITRWFLPYNDTDRHSIAATERMKEFFLGWFMGPLTNGTYPQIMIDTVGERLPSFSPEESNLVKGSYDFLGLNYYFTQYAQPSPNPVNSTNHTAMMDAGAKLTYINASGHYIGPLFEKDKADSTDNIYYYPKGIYSVMDYFKNKYYNPLIYVTENGISTPGDENRNQSMLDYTRIDYLCSHLCFLNKVIKEKDVNVKGYLAWALGDNYEFNKGFTVRFGLSYIDWNNVTDRDLKKSGQWYQSFISP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords MYROSINASE MA1
publication title High Resolution X-Ray Crystallography Shows that Ascorbate is a Cofactor for Myrosinase and Substitutes for the Function of the Catalytic Base
pubmed doi rcsb
total genus 196
structure length 499
sequence length 499
ec nomenclature ec 3.2.1.147: Thioglucosidase.
pdb deposition date 2000-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
M PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e73M00
2E9MA 1DWJM 1JI1A 2BFGA 2EBNA 3WFZA 3SCPA 3EMZA 1UUQA 2XSBA 2Y2WA 2O9TA 5AYBA 1JYWA 4NRRA 4E8DA 1R87A 4TX6A 3M6DA 1VAHA 4PUEA 5BRQA 1HX0A 4UFHA 3CBWA 2FDMA 3AYSA 1ZBKA 3SCSA 2OWXA 1J0JA 3PTQA 1HJQA 1K9FA 1B1YA 2V3EA 4UFMA 1H11A 5A95A 1BYBA 4WSJA 2DT2A 1V03A 3N9KA 1E6QM 1EOKA 2WHMA 3SUVA 1QHOA 1WZKA 4U33A 2ZUSA 3VPLA 1Q6EA 4CVWA 4ZEPA 3ARXA 2QHAA 2AOSA 4CCDA 3GZAA 5E09A 5EFFA 4IM4A 5CSYA 1CGTA 2JIEA 1FFQA 2VRQA 3CO4A 3AJ7A 4R27A 3PZOA 2FGLA 3I3EA 4TX8A 3NIYA 3QHNA 2CESA 3A3HA 2VQUA 4JFWA 1TCMA 4UFIA 4W88A 1ISVA 1BG4A 1E6PA 1HKJA 5CSUA 5LYRA 1PBGA 4URIA 3WF2A 2VRKA 3N04A 3FAWA 1HJUA 1NOWA 1X1NA 1LWJA 5I23A 2GDUA 4PYSA 3AS0A 1DEDA 3W28A 1BPLB 2DQXA 4M24A 1HL8A 1B30A 3RMEA 1CLXA 2JALA 2A3AA 1KR1A 1E43A 4D6DA 2XVKA 1BYAA 5LA1A 2X0YA 2XIBA 2O9RA 3WIJA 4CCEA 3N1AA 2ZUTA 3UR8A 3TTQA 1V3IA 1LL6A 1H41A 3POHA 4DWSA 3MMUA 3OLGA 3VGHA 1VF8A 1QBBA 4S3JA 4D6FA 2VOTA 4RL3A 4B3LA 1B3ZA 5I6SA 4JKLA 4CU6A 4AZ7A 4JZ5A 4D1IA 1GVIA 1UHVA 2J74A 1QI4A 3WQVA 3ZSSA 4WF7A 2WC4A 3FXYA 5E0FA 3BGAA 4MDPA 1V08A 2CCRA 4DWSB 5DMYA 1J01A 4UQ9A 3WNNA 1QNRA 1US3A 1XYZA 3RDKA 1CGVA 4IPNB 1M53A 4Q7NA 3VGEA 4D6IA 3VIKA 3ZT7A 1NWSA 1FA2A 2VVNA 5A8QA 4D72A 1MQPA 1BF2A 1PEZA 2W4XA 4F8XA 2GK1A 1UR4A 4NZCA 2A3BA 4DUVA 1W3HA 1C91A 2J47A 3UETA 5A6BD 4W8LA 1CTNA 4AZCA 1HJSA 3GNPA 5FCZA 2GK1B 5BXSA 3A4WA 5HDRA 4AIOA 5M5DA 2G8ZA 2PBOA 2X0HA 2XVPA 2XPKA 4H8UA 2VZUA 1I1WA 4WLCA 4AY1A 1GW1A 2WLZA 4DUXA 4D1JA 5ABFA 3SUWA 3APGA 2WZIA 1IZJA 3NDZA 5E70A 2XG9A 4AZCB 1J0ZA 4PMVA 1JD9A 2HVMA 3WBEA 4H7VA 1J0YA 1KFWA 2HISA 4L4PA 3VMOA 1CGXA 2PWDA 1HP4A 3T2OA 5HXMA 1H09A 2WC7A 3WQ6A 3M07A 1AQ0A 3W4RA 3AZTA 4FLRA 3UCQA 1NARA 5A6SA 2UY4A 1R85A 4NF7A 1WAWA 3KWXA 1H2JA 5ABFB 4HZ7A 3M7SA 1ZJAA 3EDKA 4PMZA 2V5CA 1H5VA 4P7NA 2VR4A 3BAWA 3WMBA 2BHZA 2XYLA 1OT2A 4PTXA 2BY2A 1LG2A 1UG6A 4U2ZA 3VIIA 3IJ7A 1ZBVA 2IXUA 5C70A 4B9YA 3GBEA 1R8LA 1JAKA 1OGBA 1KXTA 1QNOA 3WQ8A 3L4VA 4MAVA 1PPIA 1W2VA 1KR0A 4M80A 3GTNA 5CGTA 1MVYA 1K9DA 1OGGA 3FHQA 1MW0A 3GM8A 1V0MA 1E4NA 3SURA 5IFTA 2BVDA 1OSEA 2YJQA 1BFNA 1C3FA 4EE9A 1FHLA 5IFPA 2BXYA 2F8QA 3NDYA 2ZUUA 1MYRA 1FFRA 1QNSA 4ZXLA 3VUPA 1E4IA 5A6MA 4CGTA 1XH0A 3CUGA 5M3WA 3WH9A 3WY1A 5I3DA 1K6AA 1X6NA 1E9LA 2BNJA 5CGMA 4U31A 4WKFA 1ZBWA 2FHBA 3MKKA 2WHKA 1JDCA 2OLHA 1VEOA 1LLOA 1GJUA 1WZAA 1JFXA 3ARPA 5CLWA 4GZJA 4ACYA 3VGGA 3L4YA 1UH2A 1UD4A 5BROA 5D9NA 2J7GA 3D5HA 4H8VA 3GDBA 4AEFA 1HJWA 1U2YA 1UR2A 3VMPA 3CHDA 4A4AA 2EPKX 1WDSA 1RD6A 4GO8A 5CJ5A 2ZUVA 2XTKA 1UD8A 1DWIM 4QLJA 1KWGA 5E0CA 1D2KA 2XVNA 4PMNA 4W87A 4KGLA 1WB0A 4AIEA 3BSHA 4W8BA 1KGXA 3ZQ9A 5CG0A 5I77A 3WDPP 1Q6CA 2YDRA 1RP9A 1ZB5A 3OGRA 5LA0A 4CU8A 3RJYA 2YKKA 3KEHA 1UA7A 2QMJA 3GXFA 3WH8A 2PWHA 1W9PA 2XIIA 4OOZA 1OWQA 2CKSA 1U33A 1M7XA 4CD6A 3WDIA 3W82A 2D23A 2WVTA 4Y7EA 5EB8A 3DYPA 1G01A 4WKAA 3ARTA 1MXGA 4WSKA 2JF6A 2ZOXA 4OOUA 3M46A 4P7LA 1LWHA 2FHFA 5DF0A 1JYVA 1V6YA 4W7WA 3W38A 4ATLA 3RPMA 1B2YA 1GUVA 3K4DA 1UWIA 2B31A 4OZOA 1B3YA 4H41A 1HT6A 3VGFA 1HKMA 4W86A 4BA0A 2XWDA 5ABEA 1CPUA 2D0GA 4PMUA 7TAAA 2O9OA 1KGWA 4FLQA 1VJSA 4B15A 3OIHA 3GXIA 3WD4A 1O7AA 3QHMA 3IJ8A 4WIWA 2GJPA 1FHDA 4H8HA 3VKKA 1JZ8A 1CXKA 4JFSA 1CXHA 1OD8A 4UZUA 3WDJA 3VGDA 1V0KA 4E4PA 1JNDA 4M81A 3IAQA 2DGAA 1KXVA 2WCAA 4EAMA 2WK2A 1MXDA 1NOFA 3AFBA 4D6HA 2JEPA 4AD4A 2CEQA 1OGSA 2WVVA 3WSUA 3F5JA 3VIGA 7A3HA 1OD0A 3UG5A 3II1A 1J0HA 2QF8A 2PBGA 4X0NA 3AS3A 2X05A 3ZJ8A 4ZE4A 1VIWA 1TVNA 3MSGA 1PAMA 2XVGA 1KXQA 3AHYA 1E0VA 3OG2A 2WVVB 4Z2IA 1HIZA 1OIMA 4JL1A 4QCFA 2WHLA 2XGIA 4QLKA 1PX4A 2BY1A 2D0FA 1E6SM 3CZJA 3KL3A 2VO5A 3LPGA 2A3HA 4FMVA 1CGWA 2VI0A 3CZGA 3OLDA 1ISWA 1E55A 4M56A 5AC5A 3ZSTA 3W37A 1E6RA 2WW5A 2NSXA 2E3ZA 1F4HA 2OSXA 3VOCA 1UKQA 4HPGA 2V3DA 1MW2A 2W63A 2OYKA 3N13A 1JIBA 1V3HA 2BXZA 3T09A 4MB3A 4QDMA 2X1IA 3VINA 2QMKA 3W24A 5JBDA 1GQIA 4CCCA 3BAIA 1UWTA 4P8XA 3BLKA 4Z2LA 4J3WA 1JDAA 4MNJA 4PMDA 2V3FA 2WMHA 3NSMA 3VM7A 4P7OA 5BCAA 3T2QA 1EHNA 1CIUA 1IT0A 1M03A 5HBFA 1NWTA 1JAEA 1BGGA 2D3LA 5CPTA 1XC6A 1VRXA 1KB3A 3UERA 1B3XA 3CUJA 2VZTA 1OCQA 1SFSA 3E1F1 4PTWA 1BQCA 3VDAA 2BY0A 4JHZA 2DH3A 1EXPA 3ARQA 4Z2KA 3ZM8A 2EO7A 5IHRA 4GIAA 5A94A 2WMKA 3AXIA 1FP9A 3MV01 3WD2A 1NWUA 4CD4A 3PZMA 2QPUA 1UA3A 2DSUA 4GXPA 2WMJA 4GQQA 2FHCA 4U5KA 3CZKA 3G6LA 3PZTA 1WDQA 3EDFA 1GNXA 3AMCA 4CUCA 3GYCA 3WQWA 3NUKA 1UYQA 3WD1A 2XVLA 2Z1SA 3U57A 1DHKA 2GUYA 1FP8A 1WKYA 3GXMA 3S2CA 2VR5A 5CPSA 1UR9A 1XSKA 3OA5A 3T08A 3KL5A 1W9XA 2JF7A 2O9PA 2QPSA 3JUGA 3TTSA 3WUFA 4GZEA 2G3MA 5BXPA 1ZU8A 5A1AA 1NP0A 1HN1A 2JIWA 4W85A 3W27A 3VIJA 4W84A 2PF0A 4J7RA 3WELA 1CENA 3VDBA 5C8BB 2XJ7A 1BGAA 5TD4A 1EDQA 1Y7VA 5FL1A 3WUGA 5A69A 1E0XA 1Q4NX 1V02A 3AOFA 3WH5A 1ZS2A 2GSJA 3RCNA 4AD5A 4AW7A 3MO4A 4X9YA 2VUYA 3ARWA 4UZSA 2CIPA 3KE0A 4J3TA 3KZSA 4BF7A 1J18A 3OZPA 3ARYA 4AZBA 1E71M 4HP5A 4Q22A 5D9MA 1C8QA 2J62A 1W1VA 2DT3A 1JGIA 2D1ZA 2VCCA 2ZUNA 4PMXA 1HVXA 5A2AA 1V6UA 2D24A 2BS9A 3L4ZA 5A8OA 1B90A 1L8NA 5JIPA 4U2YA 1PZ3A 3GNRA 4AZ5A 4E2OA 4ML4A 1E6NA 2Z1KA 2AAAA 4MB4A 4QP0A 4UQDA 1XCXA 3SCUA 1V3JA 3CHEA 1PJ9A 2J75A 1HXJA 4OUEA 1TR1A 5C71A 1HKKA 3ECQA 3WEMA 3MU7A 1XD0A 1V3KA 2RGLA 1W9BM 3MMDA 2VZSA 4MAZA 1CEOA 3ZJ6A 3CZLA 2WB5A 5I79A 4FLOA 4MDOA 5IHSA 1NWRA 1FOBA 2ZX5A 2ZUMA 5A6LA 4IPLA 3TTYA 3N11A 2Y8KA 3NSNA 2OYMA 5CXPA 3IANA 4BQ5A 1S46A 4GI8A 1OB0A 1UH4A 2J79A 1E15A 4GPNA 1GOKA 1J11A 4AZGA 3N12A 2EPLX 1GPFA 5E6ZA 1C8YA 1BHGA 2VX7A 2WSPA 4YPJA 5IDIA 5KZ6A 3WBAA 4CN6A 2GFTA 4NRSA 2WKGA 4QCEA 1CXIA 5D8WA 2UY3A 1GHRA 5GNZA 4W7UA 1W3JA 3HJEA 3L2MA 5D9PA 1WPCA 2ZX9A 1TZ7A 5JUVA 4LGXA 5GQBA 3AHTA 2YDSA 1C90A 4D71A 5GNXA 4XZBA 3WNLA 1CGUA 4M1RA 2DIEA 1QHZA 1D3CA 2VQTA 4U5IA 1UOKA 1BYCA 3UESA 3OLEA 3BSGA 1B3WA 3DHPA 3EDEA 1OM0A 2E8ZA 1WO2A 2G4FA 1UKOA 2RGMA 3VMNA 3N17A 4UOZA 2VNCA 4OBRA 2WM0A 4GKLA 3ARSA 4P7QA 2WVUA 4HMDA 4YHGA 1W3KA 3N18A 2WCGA 1VFFA 3F4VA 3L4WA 1GQKA 2G41A 1LJYA 2WBGA 1NH6A 1RPKA 1G5AA 4F79A 1YQ2A 3S6TA 4AD2A 1C8XA 3ZO9A 3BAJA 3BLPX 4CKQA 3O2LA 3B9AA 4PMRA 3VIFA 5DO8A 4H2CA 3LPOA 5FOOA 2DSVA 4UNIA 1EQPA 4BS0A 3AIEA 1CZ1A 3VVGA 4C7FA 1DTUA 1CYGA 5BXTA 2UY5A 1MW1A 3U7BA 1QHPA 3KL0A 2J8FA 3QHOA 3WF0A 2J4GA 3RJXA 1E1EA 3PHAA 1UR0A 3AHZA 3A47A 1EGZA 3QR3A 3QOMA 2D20A 1ZL1A 4DWSD 1V0NA 4UQEA 4DWSC 2XFYA 4OBSA 1XYFA 5CQ1A 2EEXA 4N42A 1WP6A 3RM4A 4R5EA 4D6CA 4BZYA 3F5LA 2QV4A 1KQZA 3PZQA 1Z32X 4JCLA 4J3SA 4OJYA 3IK2A 4Z2HA 2E9BA 2YLAA 4FK9A 2VC9A 1PIGA 5EMYA 5KEZA 2VZOA 1X6LA 2X2YA 3VM5A 1C7TA 1AQHA 1ZBCA 3T0BA 1CWYA 5M17A 7CGTA 3CHCA 1QPKA 4TTUA 4UR9A 2J8GA 2DIJA 1V3MA 1NQ6A 4MJ4A 3WUEA 5CLTA 2VRJA 5BYWA 2EPOA 1JG9A 2YL9A 1FH7A 1QBAA 4V27A 4HPHA 2YIHA 5I0DA 3W6MA 1GOOA 4AZIA 1V02E 3MUAA 1J0IA 2G3JA 4WKHA 2XFRA 4HA4A 4PSRA 4XUYA 2DT1A 2FH6A 1MFUA 3BAYA 3RM9A 4LYRA 3WD0A 5IXEA 3W26A 3AZSA 3OBAA 4Z2JA 1EIBA 3ARVA 3SCTA 2WZHA 1E70M 2J7BA 5CZKA 1CXEA 4UTFA 4MNMA 4HA3A 1XV8A 4NSBA 1DWAM 3VGBA 3NYDA 1GOMA 4K68A 1GORA 1H0IA 1HVQA 3VD7A 2CHOA 1KXHA 2EPNA 3G6MA 3FY1A 1E73M 1HF6A 1C92A 5HOSA 3WD3A 3SCQA 3OLIA 1H3GA 2J7DA 2W66A 3K8LA 1KCKA 3AMKA 4X0VA 5BRPA 1FH8A 5EBAA 3DYMA 1JXJA 1U30A 1VBRA 5A2BA 2NW0A 2F2HA 1G94A 1B31A 1TG7A 4W5ZA 2VZVA 1W32A 1J12A 4GQRA 3K8MA 2FGZA 1W1TA 3THDA 1OBAA 4KH2A 2CNCA 4LYPA 3EDJA 4W5UA 1UWSA 2YOCA 2VL4A 2WVSA 3EMQA 3PBGA 1WNOA 3ZR6A 1TE1A 1E4MM 1I1XA 4JCMA 1SR0A 4AISA 3AMDA 2XUCA 3AIBA 3CPUA 4TVCA 3AQUA 1JZ5A 4KGJA 5DT5A 1UR1A 3MS8A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2E9M A;  1DWJ M;  1JI1 A;  2BFG A;  2EBN A;  3WFZ A;  3SCP A;  3EMZ A;  1UUQ A;  2XSB A;  2Y2W A;  2O9T A;  5AYB A;  1JYW A;  4NRR A;  4E8D A;  1R87 A;  4TX6 A;  3M6D A;  1VAH A;  4PUE A;  5BRQ A;  1HX0 A;  4UFH A;  3CBW A;  2FDM A;  3AYS A;  1ZBK A;  3SCS A;  2OWX A;  1J0J A;  3PTQ A;  1HJQ A;  1K9F A;  1B1Y A;  2V3E A;  4UFM A;  1H11 A;  5A95 A;  1BYB A;  4WSJ A;  2DT2 A;  1V03 A;  3N9K A;  1E6Q M;  1EOK A;  2WHM A;  3SUV A;  1QHO A;  1WZK A;  4U33 A;  2ZUS A;  3VPL A;  1Q6E A;  4CVW A;  4ZEP A;  3ARX A;  2QHA A;  2AOS A;  4CCD A;  3GZA A;  5E09 A;  5EFF A;  4IM4 A;  5CSY A;  1CGT A;  2JIE A;  1FFQ A;  2VRQ A;  3CO4 A;  3AJ7 A;  4R27 A;  3PZO A;  2FGL A;  3I3E A;  4TX8 A;  3NIY A;  3QHN A;  2CES A;  3A3H A;  2VQU A;  4JFW A;  1TCM A;  4UFI A;  4W88 A;  1ISV A;  1BG4 A;  1E6P A;  1HKJ A;  5CSU A;  5LYR A;  1PBG A;  4URI A;  3WF2 A;  2VRK A;  3N04 A;  3FAW A;  1HJU A;  1NOW A;  1X1N A;  1LWJ A;  5I23 A;  2GDU A;  4PYS A;  3AS0 A;  1DED A;  3W28 A;  1BPL B;  2DQX A;  4M24 A;  1HL8 A;  1B30 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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