1E81E

Endothiapepsin complex with renin inhibitor merck-kgaa-emd61395
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title Refinement of Four Endothiapepsin Inhibitor Complexes. Crystallographic Studies of Cytochrome Ch from Methylobacterium Extorquens and Inhibitor Complexes of Aspartic Proteinases.
rcsb
total genus 86
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2000-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1e81E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1e81E01
5DQ4A 3WB4A 5DR3A 1LYAA 3VYDA 1IVPA 3R0YA 1HPXA 4KUPA 3UDQA 5P7NA 5P70A 5E5KA 3VCMA 1DMPA 3QBFA 3QIHA 4PYVA 5P04A 4CPWA 3O9GA 4AMTA 1ZLFA 2I1AA 3HLOA 4D83A 4HA5A 5P2GA 5P6BA 3KA2A 2WKZA 2G20A 5SY2A 5P01A 5I70A 3CIBA 1T7IA 3NUOA 2ZHVA 5P5CA 5P3AA 2WEAA 3SAAA 3OTSA 4YA8A 5OZGA 3UDKA 1M4HA 2O4NA 1E80E 3OGPA 5FIVA 5OZXA 5OZOA 2WECA 3UDPA 2F3KA 5P0HA 3EKYA 4Y4JA 3DOXA 5P7FA 4D85A 5P76A 2I0DA 3DUYA 2QI5A 3OXWA 5P4EA 4M8XA 3OQAA 3OU4A 4LHHA 5P75A 3OUDA 5P6DA 3SABA 1D4YA 3H5BA 1APVE 1BDLA 2AOFA 3KDCA 5P0NA 5P41A 3APPA 4GJ8A 3ZLQA 5P12A 2IEOA 5P0MA 4EPJA 3JW2A 5P1IA 1HHPA 1K2CA 3UDRA 1YM4A 2OHLA 3PEPA 1MVPA 4NPTA 1EPPE 2AOHA 5P8FA 2FDDA 4GJ6A 4Q5MA 1AZ5A 4Y36A 5P38A 2BKTA 5P85A 1WKRA 3ZKQA 3D20A 5P4UA 4Y3MA 5P0QA 3TPPA 5P1BA 1PSOE 5P4VA 4PZWA 3DK1A 4J0YA 3RVIA 4NJSA 3I25A 2G22A 3ZPSA 2J9KA 2QAKA 5JFPA 3PRSA 1GNMA 4Y5CA 2FXEA 4RCFA 4HDBA 4YHQA 5C9FA 1MT9A 5P06A 5HVPA 1D4SA 5P8PA 1IZDA 2IDWA 2VA7A 2R3TA 5OZWA 2AOGA 1EEDP 3ZKMA 5P5EA 2HS1A 5KR0A 4MC1A 5P6RA 1G6LA 1SP5A 2R9BA 1C70A 4Y3JA 1MIQA 5P0GA 3FSMA 4Y47A 5P63A 5OZHA 3R2FA 2OF0A 2QI7A 5AH9A 5APRE 3MSKA 2F8GA 1HVJA 5P24A 3BUHA 3KM4A 4QGIA 1HXBA 1ME6A 2IGXA 2Q15A 2Q63A 4L7GA 3GW5A 2PYMA 3KDDA 4FIVA 5OZZA 1BDQA 3QP0A 5P0CA 3BVBA 2O4PA 1LEEA 5OYYA 2AZ9A 3DV1A 4H3IA 2ER0E 3JVYA 3OTYA 4K4PA 1SIPA 2WF4A 3OU1B 5P6HA 5P1RA 3D91A 3R4BA 2QU2A 4YBIA 3O9HA 1FEJC 2G1OA 1DIFA 3INHA 5P4QA 2QI3A 2QI6A 5P4FA 4FS4A 5COOA 5P8NA 5P7TA 3GGUA 3IAWA 4OBHA 1YX9A 4U8WA 2XFKA 3INDA 2BPWA 4EXGA 2NXLA 4IVSA 4Y48A 1QDMA 2B8LA 5P7DA 5P7UA 3ER5E 1E81E 2HB4A 2IRZA 4Y5LA 3N3IA 3NWQA 3O9AA 4FCOA 5OZUA 1SDTA 1XL2A 5OYRA 1DP5A 3VF3A 1HEGE 4GJ5A 4B72A 5HTZA 3DCRA 4CPQA 5P09A 4OD9B 1BIMA 1LF2A 3QN8A 3ST5A 5SY3A 2CEMA 4Y3SA 4YD3A 4QJ2A 2HIZA 2NR6A 5CLMA 1A8GA 4PHVA 2JJJA 5P02A 1EC3A 2G1SA 3LZSA 1UPJA 4QJ8A 1FQ4A 4I10A 5P67A 4HE9A 4TVHA 5P0OA 5KQYA 1OHRA 3K5CA 3HD8A 4LXAA 3KT5A 5HCTA 4J1KA 2CENA 4LC7A 3T3CA 3Q4BA 2FXDA 5P8QA 5P37A 4GB2A 5P17A 5P79A 3NUJA 2P4JA 5P03A 1IDAA 3QPJA 3DV5A 3UDJA 4GJAA 5P4AA 4Y50A 4B05A 3ZKSA 5AH8A 3OK9A 1FG6C 1MRWA 4YE3A 4JPCA 1XN2A 4EJDA 1XS7D 4Y3RA 3URIA 3EXOA 5P16A 1TZSA 5P89A 5P8MA 2Q3KA 3OXVA 5P5HA 3VLAA 3KFNA 5P8RA 3VEUA 1LYBA 4JECA 4RYGA 5P2JA 2AOIA 1ODYA 3O99A 5OZPA 1K1UA 2G26A 4J1EA 5P2YA 1SMEA 5P4SA 3PWWA 3L38A 1BBSA 5F01A 3VFBA 5P1JA 1MTRA 3OUCA 2Q55A 4I1CA 3HBOA 3LITA 5COKA 2WEBA 5P1SA 3K5GA 3ZKXA 3WZ8A 3SLZA 1PFZA 4APRE 3CYWA 4BFBA 3DCKA 1MESA 3HVPA 5DPZA 1HTEA 4J1HA 5P3OA 2VIZA 5P1NA 4R95A 3D1YA 4Z2ZA 5OYVA 4FRIA 5P4TA 3O9EA 2QZKA 5KAOA 5P7EA 4Y3HA 2BQVA 3BUFA 5OZAA 5P84A 1G2KA 4FRJA 2RMPA 4ZPFA 5P5TA 4Y39A 5P6NA 2FMBA 4NKKA 4OBZB 2I0AA 4Y51A 3RTHA 3T7XA 5IVSA 2HC0A 4NJTA 3D3TA 3ECGA 4ZIPA 5P1XA 1B6MA 4Q1YA 1AJVA 3INEA 1BWAA 5ISJA 3FV3A 3RTNA 4E43A 1EBWA 2OHRA 6UPJA 5OYZA 1IZIA 2AIDA 2PSVA 5DGWA 5P4MA 5P5LA 1IZHA 4Y41A 2IQGA 3CYXA 5P0IA 3EM3A 4QJAA 5P1ZA 5P73A 3RSXA 5P29A 2V10C 5P2ZA 4UPJA 5KOSA 5P5YA 5P0RA 2ZYEA 1HOSA 4YDGA 2HB2A 1K1TA 1SBGA 1DPJA 4Y3QA 2XFIA 4Y5AA 2I4XA 3UFLA 3VF7A 5P6QA 2QNQA 1HVSA 5P2KA 3FNTA 5KQFA 5OZ6A 1MEUA 2R38A 2VIEA 5P4ZA 4R92A 5P0XA 2WHHA 2ZDZA 2AOJA 3PBDA 2NPHA 1APTE 5P23A 3VFAA 1AM5A 1Z8CA 2WEDA 5KOQA 5P59A 4DPIA 4IVTA 3HW1A 1XN3A 3BUGA 3EL0A 1HTRB 4I0EA 1B5FA 5P45A 3K1WA 4RVJA 2WF3A 3Q6YA 5I3YA 1FB7A 3GI6A 4TVGA 1W5WA 5P1PA 4YD7A 1WBKA 5P2WA 1HWRA 3VV7A 5DQCA 2P83A 4I0HA 3NR6A 2AOCA 3VSWA 1HEFE 4RYCA 3O9LB 1A30A 5P72A 3PCWA 4J17A 5P1LA 3ZKGA 4J5JA 5P20A 3BGCA 2QMGA 4I0IA 4ZSMA 5P0EA 5P5VA 2AOEA 3OQKA 4DH6A 5P43A 4GJ7A 5P2TA 3ZPTA 4F74A 5P50A 1BWBA 3GGVA 3IGBA 4L6BA 4DJOA 2OHPA 1J71A 3WZ6A 3PSUA 2BBBA 3EKVA 3UF3A 3NDTA 5HD0A 4BFDA 5BWYA 1GVTA 4B77A 5P86A 4R5NA 1BXOA 4CPSA 5P74A 5P30A 5I3WA 1FQ6A 1IBQA 4DJUA 3PJ6A 3K4VC 1HTFA 3D1ZA 5OZIA 5HDVA 3EL1A 2B8VA 3BXSA 1WBMA 3O9CA 5P2EA 5P7GA 4I12A 2VA6A 5P1GA 3SQFA 3SM1A 5P3HA 5P1KA 3VSXA 2PYNA 5P00A 3S56A 4J0ZA 5OYXA 5P3RA 5P46A 2UPJA 5OZSA 5P0LA 3OAGB 1HVRA 1MT7A 1VIJA 1FQ7A 5OZ7A 5P7HA 2QP8A 2G1YA 5UPJA 5OZRA 3OU1A 2OHSA 2QD7A 4HDPA 5P8JA 3B7VA 4EYRA 4J54A 1MRXA 3S85A 4LXMA 4Y5MA 5AHCA 2F81A 1TCXA 5P2QA 2AQUA 4Y58A 1D4LA 4Y5NA 4FE6A 4DQHA 5P8OA 5P22A 1JLDA 5P2BA 2WF2A 2FS4A 2QNNA 1W5XA 3PSGA 3S7MA 1GVWA 2V12C 4DV9A 1M43A 5P6UA 3HAWA 1LF4A 1SIVA 4OD9A 5P3TA 1G35A 4Y4UA 5DR1A 5P4GA 5P4XA 1HRNA 5P58A 4RRNA 2Z54A 2CEJA 5P33A 5P34A 5P4RA 4MC2A 3EKTA 2FIVA 3FNSA 1EPRE 1HVKA 2AVQA 3KFSA 4ZSQA 5P49A 1IVQA 4R91A 2NMYA 4Y45A 1EPOE 1HVCA 2PK6A 3UDMA 5HDXA 2AZCA 3PMYA 3R0WA 5P0SA 4B1DA 3EC0A 3NDUA 2FGVA 3I6OA 3KN0A 3BC4A 4YD6A 4Z50A 5P5IA 2WL0A 2ZGAA 4DQGA 2PH8A 5P5XA 3HZCA 2A4FA 1MERA 5P7PA 5P88A 5P1VA 4D8CA 5P2LA 3NXEA 3I8WA 3GI5A 5JODA 1EPLE 2P3CA 5P51A 4S1GA 2VNMA 2IENA 3NDXA 3PSYA 4FRKA 2H6TA 4BELA 2VJ7A 3UFNA 4I8WA 3L3AA 2I4DA 5P6TA 4H3JA 1G0VA 4DFGA 6FIVA 2R5QA 5P3FA 1NPVA 5P8HA 5KR8A 5P5BA 3TKGA 4J0PA 4EJKA 4GJ9A 3PI0A 5P3WA 2OHNA 3OUBA 1HIHA 5P1CA 4Y4WA 1K2BA 5JG1A 1XDHA 4FAFA 2FGUA 5P5RA 4DJWA 5OZVA 2AVSA 5ER1E 5P65A 2ER6E 4DQBA 1ZP8A 2ZJKA 1M0BA 3PLLA 1FQ5A 5P7MA 2RENA 5P2IA 4EQJA 2IGYA 1LYWB 5P31A 3KT2A 1W6HA 5P2MA 1ZTZA 2I4QA 3F9QA 4WTUA 2PWCA 1ODXA 4ZSPA 3UDNA 2VNNA 4Y3NA 5P60A 4Q1XA 4Y3AA 5F00A 1GNOA 5P4OA 2QMDA 2Q64A 4YDFA 2J9JB 5P7WA 1KJFA 5P0PA 5IS4A 3OUAA 3IN4A 5P1DA 2PSUA 2ZHTA 1D4KA 5OYTA 3TPRA 4Y3TA 5P8EA 1QBTA 4B70A 4JPEA 3UCBA 3EKWA 3VV6A 1C6YA 5HE7A 3Q3TA 4OBGA 1GKTA 4F73A 2P3DA 2FNSA 1ZBGA 4LL3A 3OU4B 1ER8E 1BVGA 3UQXA 5P2NA 3AIDA 5P6ZA 7UPJA 1AJXA 3QS1A 1ENTE 5P5FA 2WEZA 5P2SA 1CMSA 1FMUA 3OOTA 3R1GB 5P7AA 1GNNA 5P08A 4Y35A 4M8YA 5BS4A 3SACA 2O4KA 1BDRA 4Y4AA 3G72A 2O40A 3QAAA 3TKWA 5P27A 1BXQA 1EC0A 4AA9A 1RPIA 1RQ9A 3PWRA 5OZ4A 1Q9PA 3TOFA 4DJQA 1SDUA 5P18A 1PPKE 1HSIA 4JOOA 4TRYA 5P47A 2F3EA 3SA5A 1LF3A 5P1FA 3S7LA 4LXKA 2G94A 2QZWA 4Y6MA 3I2LA 5AGZA 5OZJA 5ER2E 5AH7A 3GI4A 5P8SA 4CP7A 5P8IA 2HPFA 3QROA 5P7ZA 3WB5A 3HDKA 5AHAA 4GZFA 3ZMGA 4CPRA 4Y4BA 5P6PA 2IKUA 3OQDA 4Y3EA 5P42A 1K6TA 3U7SA 4KE1A 3BHEA 3QVIA 1W6IA 1HIVA 4HDFA 4Y9WA 3LIZA 5P69A 4YBFA 3O9LA 1HXWA 3C9XA 5OZ2A 3EMYA 4Y56A 5P66A 1EBYA 4Y54A 4B1EA 5P7QA 5JFUA 5P77A 5P2VA 4EWOA 4PZXA 1APWE 1HSHA 2R8NA 5P64A 2QI1A 5P6AA 5P1MA 5P4HA 3NU5A 5P0ZA 5P3YA 4FM8A 3LZVA 3U6AA 3OHHA 1D4HA 1ZPKA 4RROA 5I3XA 2AZBA 2QHZA 5P54A 4FGXA 5P32A 5HCOA 1BAIA 1AVFA 3O9DA 1FKNA 4YCTA 2OHTA 3CKTA 5P5DA 3ZL7A 1F7AA 5P1AA 4DJVA 2P3BB 1GVXA 2BPZA 5OZTA 4Z22A 5TOLA 1QBRA 4YOAA 5P1EA 4L7HA 1OEWA 5P6YA 5P3DA 1GVUA 4TRZA 5P3CA 1FF0C 3G70A 1UH7A 3TPJA 4K4QA 1SDVA 3RU1A 5P3LA 3B80A 2AVMA 4Y4EA 3PB5A 2B7FA 1EBKC 5ENKA 5P7VA 5OZEA 5P8UA 5P6OA 4FL8A 2ER7E 5P52A 3QRSA 3L5BA 3OAGA 3MXEA 2V13A 1HSGA 5P6IA 2PSGA 4GMIA 4EJ8A 2XYFA 5DQ5A 5P07A 1T7KA 5P3KA 1T6EX 3WSJA 1TQFA 2NNPA 1BV7A 2VJ6A 2ZHRA 3LINA 1APUE 2OAHA 4RVIA 4AUCA 3CMSA 5P11A 5P5QA 4Z4XA 5P2OA 4I0GA 2QD8A 3ZOVA 4A4QA 3SPKA 3NU4A 4Y53A 4MC6A 4GJBA 4HLAA 5P5AA 3NXNA 1RV7A 4RCDA 3LIQA 4Y5GA 1BVEA 5P1UA 5P3JA 5P5ZA 3DM6A 4COEA 3QRMA 4Y4TA 3LPJA 4RGHA 4J55A 3UQPA 3NDWA 5P8AA 5OZ3A 5DQ2A 1NPWA 4GYEA 3L5CA 1K6PA 5P6LA 3URLA 3BGBA 3VV8A 4ZE6A 4DJPA 5P83A 3KFRA 2P3AA 2QD6A 3EKPA 4JP9A 3OXXA 3NSHA 2XYEA 5P0YA 3CIDA 4ACUA 3QRVA 4MC9A 2I4WA 4KE0A 3JVWA 5P2XA 5P0JA 3RTMA 2A1EA 3SA7A 5P36A 5P6SA 5P3XA 5T4SA 2NMZA 3NU3A 4HZTA 4U7QA 4EP3A 3EL5A 4PEPA 4DQEA 1YTHA 5P3UA 2NTRA 4LAPA 4DJYA 1T3RA 1W5VA 1VIKA 4EXHA 4RRSA 5P25A 4Y4XA 3MSLA 3IXKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5DQ4 A;  3WB4 A;  5DR3 A;  1LYA A;  3VYD A;  1IVP A;  3R0Y A;  1HPX A;  4KUP A;  3UDQ A;  5P7N A;  5P70 A;  5E5K A;  3VCM A;  1DMP A;  3QBF A;  3QIH A;  4PYV A;  5P04 A;  4CPW A;  3O9G A;  4AMT A;  1ZLF A;  2I1A A;  3HLO A;  4D83 A;  4HA5 A;  5P2G A;  5P6B A;  3KA2 A;  2WKZ A;  2G20 A;  5SY2 A;  5P01 A;  5I70 A;  3CIB A;  1T7I A;  3NUO A;  2ZHV A;  5P5C A;  5P3A A;  2WEA A;  3SAA A;  3OTS A;  4YA8 A;  5OZG A;  3UDK A;  1M4H A;  2O4N A;  1E80 E;  3OGP A;  5FIV A;  5OZX A;  5OZO A;  2WEC A;  3UDP A;  2F3K A;  5P0H A;  3EKY A;  4Y4J A;  3DOX A;  5P7F A;  4D85 A;  5P76 A;  2I0D A;  3DUY A;  2QI5 A;  3OXW A;  5P4E A;  4M8X A;  3OQA A;  3OU4 A;  4LHH A;  5P75 A;  3OUD A;  5P6D A;  3SAB A;  1D4Y A;  3H5B A;  1APV E;  1BDL A;  2AOF A;  3KDC A;  5P0N A;  5P41 A;  3APP A;  4GJ8 A;  3ZLQ A;  5P12 A;  2IEO A;  5P0M A;  4EPJ A;  3JW2 A;  5P1I A;  1HHP A;  1K2C A;  3UDR A;  1YM4 A;  2OHL A;  3PEP A;  1MVP A;  4NPT A;  1EPP E;  2AOH A;  5P8F A;  2FDD A;  4GJ6 A;  4Q5M A;  1AZ5 A;  4Y36 A;  5P38 A;  2BKT A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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