1EAGA

Secreted aspartic proteinase (sap2) from candida albicans complexed with a70450
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
342
structure length
339
Chain Sequence
QAVPVTLHNEQVTYAADITVGSNNQKLNVIVDTGSSDLWVPDVNVDCQVTYSDQTADFCKQKGTYDPSGSSASQDLNTPFKIGYGDGSSSQGTLYKDTVGFGGVSIKNQVLADVDSTSIDQGILGVGYKTNEAGGSYDNVPVTLKKQGVIAKNAYSLYLNSPDAATGQIIFGGVDNAKYSGSLIALPVTSDRELRISLGSVEVSGKTINTDNVDVLLDSGTTITYLQQDLADQIIKAFNGKLTQDSNGNSFYEVDCNLSGDVVFNFSKNAKISVPASEFAASLDGQPYDKCQLLFDVNDANILGDNFLRSAYIVYDLDDNEISLAQVKYTSASSISALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ASPARTIC PROTEINASE (SAP2 GENE PRODUCT)
publication title The crystal structure of a major secreted aspartic proteinase from Candida albicans in complexes with two inhibitors.
pubmed doi rcsb
total genus 96
structure length 339
sequence length 342
ec nomenclature ec 3.4.23.24: Candidapepsin.
pdb deposition date 1996-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1eagA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1eagA01
1EC1A 5P5SA 3GGUA 3NXNA 4Y4GA 5P3SA 1DAZC 5OYQA 1CPIA 1HIHA 2Q54A 3D1YA 4LAPA 5P73A 4YA8A 5P7RA 2R8NA 1M43A 1LV1A 2QI7A 1APUE 1UH8A 1AXAA 4FLGA 3LPJA 5P3GA 2SAMA 5P0YA 3VG1A 3CICA 5P0IA 3KYRA 4EQ0A 1LYAB 3OUBA 4H3GA 5P8UA 1AAQA 2B42A 3OQFA 3L5FA 1FF0C 2OHNA 3SQFA 2PSGA 4U8WA 5P51A 8HVPA 2V11C 3N4LA 4RLDA 5SZ9A 1SP5A 2BPXA 5P79A 3URIA 1YTHA 3KFSA 1SH9A 5OZJA 2AVOA 2IQGA 2ZE1A 4B0QA 2PK5A 1T3RA 5HD0A 2F3EA 3EBZA 5OZSA 4LC7A 5KOQA 3BUFA 4L6BA 2QU2A 2V16C 5J25A 1M0BA 5P0RA 3IXKA 2G20A 2HS2A 4I12A 5BS4A 3FIVA 1HPVA 4WTUA 3PB5A 3QROA 5P7CA 3CYXA 2FIVA 4EPJA 4U7QA 4DFGA 5P0AA 2RSPA 2AOGA 3LIVA 1AIDA 3OQ7A 4NJVA 5P12A 1FG8C 2AVVA 4DQCA 3OXWA 5P4BA 5OZNA 1A30A 5P4OA 1TZSA 1FMXA 4S1GA 5OZ3A 4R5NA 5P4SA 5P2RA 3OTYA 3L5CA 5P23A 3UCBA 5P24A 2I4QA 3OU4A 5SY3A 2RENA 3CKRA 5P2KA 5DQCA 5P3BA 3HDKA 1XS7D 4CKUA 2QI3A 3VYEA 1SIVA 1HXBA 4Y5EA 4L7HA 3OUAA 5P0FA 3L5EA 2ZHVA 1MT8A 2G94A 6FIVA 1YTIA 1PPKE 3UQUA 3D3TA 5P29A 2IL2A 4Y4BA 1B6PA 5P7FA 3LZUA 4DJXA 4PPHA 3MSLA 2BPYA 2QK5A 4Y56A 3BXRA 1D4IA 2G1NA 1ZTZA 5P6UA 3NWQA 3VF7A 1META 4KUPA 4PEPA 3O9IA 2QMFA 4CPWA 2I1AA 5AH6A 5P49A 3SA9A 4OBHA 5P5EA 1HVLA 2ZHRA 3NR6A 3FX5A 4I11A 3KDDA 2BBBA 1LYBA 5P0BA 3EL9A 3KN0A 4YE3A 4Y57A 4AZYA 2JXRA 2XFJA 1PPME 1B5FA 5DR0A 3ZOVA 2O4PA 2ZJIA 5AGZA 5P6LA 5KR2A 4FAEA 2VIEA 5DQ4A 5P48A 5P78A 3A2OA 3BVBA 3H0BA 5P2OA 2JJJA 4OBDA 2BB9A 3D20A 3TPPA 4DQHA 1EBWA 5COKA 5OYXA 1HSIA 4N00A 5P6PA 4Y4TA 1LYWA 1HTGA 2B7ZA 3K5GA 2QD7A 5OZ9A 3INFA 1W5VA 5P3FA 3I8WA 4JPEA 3T3CA 5P8PA 4GZFA 4LHHA 3INDA 5P8KA 4Q5MA 5P43A 5P2SA 3ZKGA 5P4JA 4GJDA 2AOEA 4PZXA 5OZGA 5P5XA 5P2NA 3ZKQA 1HTRB 5DR3A 3I7EA 1ODWA 4PHVA 4Y3HA 1W6HA 5P3ZA 2O40A 3L58A 2G1OA 5P53A 1G35A 3RTMA 1SBGA 3TPJA 2CENA 4RVJA 2F3FA 3L3AA 1KJ4A 3EC0A 2P3BB 3GW5A 3O9CA 2OHSA 5P06A 1QBUA 3ZKXA 4XXSA 5IVRA 3OU1B 3VV7A 5P1DA 4K4QA 5P5VA 4YD3A 5P5ZA 2VA7A 1WKRA 4Y45A 1ODYA 5OZIA 5P3OA 4HDPA 4Y9WA 4CPUA 1DMPA 4MC6A 1MT7A 2ZHSA 4MC1A 5P4UA 5P7AA 1GVTA 5P0VA 1SDVA 5HU0A 5P4CA 3PWMA 4YOAA 5P5YA 1N49A 4Y41A 1K1UA 5P5WA 1F34A 4Y5KA 5P4QA 4ZSPA 3UFNA 3UQRA 2BKTA 5P88A 5BRYA 4F73A 1YT9A 5P07A 2ER7E 1K6CA 3RSXA 1Z8CA 5DR7A 5P5GA 5E5JA 1NPVA 2QNQA 1MTRA 3INHA 5KR1A 5KQFA 5P4RA 3R2FA 5P1MA 5P1CA 2OHUA 4NPUA 2V0ZC 3LINA 3EKPA 5P0TA 3GI6A 2QP8A 2RKFA 3KF0A 3NLSA 4RZ1A 4YDFA 5P3KA 5P08A 3PMYA 5P4EA 2IGXA 5P5QA 3CKPA 1MUIA 3OOZA 3VUCA 1MTBA 1D4JA 5C9BA 5P7GA 3S54A 1BXOA 3G72A 4Y3JA 1W5XA 2CEMA 3OGPA 4D89A 4M8YA 2BPVA 3QRSA 5P5HA 3GGXA 1EPME 5KOSA 2VKMA 5I70A 4Y4AA 2IKOA 3U6AA 5HU1A 2JE4A 2P4JA 5P1OA 3VF3A 5OYSA 5EZZA 1FIVA 4JP9A 1MVPA 5OZ5A 1HIVA 3L5BA 5P7MA 2WEZA 2O4LA 4L1AA 5P8FA 4Z50A 5P04A 1XN3A 5P7VA 5P4MA 4ACXA 3PSYA 3EM3A 5ENMA 5B18A 1BWAA 3MXDA 2ZJHA 3GI4A 5P3XA 5P2HA 1MEUA 5P70A 4CP7A 5P46A 5P61A 6APRE 3FV3A 5P5CA 5P2JA 4AA9A 3VFBA 5P8NA 5P6TA 2Q11A 4Y39A 4HA5A 5P85A 4ZPGA 3QRVA 3QVIA 3OADA 3VEUA 2PWCA 4QJAA 5P5PA 5SY2A 2HB3A 4J54A 3QI1A 4Y3YA 7HVPA 3TPLA 3UDYA 2RKGA 3SAAA 3HZCA 2QNPA 4GJCA 5P16A 3EKWA 3DCRA 5P4WA 1D4HA 1D4KA 4Y3XA 3OXVA 1EPOE 1FG6C 4FSEA 2Z4OA 3RTNA 1EC3A 2WKZA 5OYZA 2QD6A 2QZKA 3OWNA 4GJ5A 4ZLSA 5P3AA 1B11A 3UF3A 5P1IA 4B77A 4AA8A 3BVAA 2VJ7A 3BGCA 5P1TA 1NPAA 5KQZA 4RRNA 5P7WA 1MRWA 2PSUA 4ACUA 2VNMA 4Y3DA 3R1GB 3OU4B 1IDAA 5P1EA 5P7YA 5P8RA 3OY4A 3G6ZA 1SDTA 4RROA 1GNOA 1HPSA 2PH8A 3PJ6A 4EWOA 4FL8A 4RYGA 2CEJA 5EZXA 4OBKA 4J1EA 3FNTA 5P1WA 5P47A 3VFAA 2PYMA 3MXEA 2QD8A 3ZKSA 5P14A 2ER9E 5UPJA 4EYRA 4FE6A 3PSUA 3LZVA 5OZ4A 3QBHA 4Y4DA 3TL9A 4HDBA 4X7IA 5P10A 2OAHA 1DPJA 4Z4XA 2PSVA 3CMSA 1LYBB 3I25A 4ER1E 4I0DA 5P8HA 2WECA 4Q1YA 5P0SA 5HTZA 4EJDA 3KMXA 4CPXA 3OTSA 4Y36A 3EKYA 3APPA 1AM5A 3B80A 2EWYA 4Y3MA 5OZOA 3NU5A 4I10A 3O9BA 5P1SA 4WY1A 4A4QA 4FM7A 4Y3WA 3TNEA 1BDQA 1HWRA 5P69A 1ZLFA 1XE6A 1W50A 3AIDA 4ZPFA 1LYWB 4Y4JA 5OYVA 2I0AA 5P8DA 3S56A 1B6KA 4EJLA 1IBQA 5P4GA 1YM2A 1ODXA 3ZMGA 3K5DA 5P26A 5DPZA 1E81E 2A4FA 3Q4BA 3UDMA 5P3TA 3OUCA 4F76A 4I0EA 1PROA 3EL1A 1F7AA 3L38A 3PMUA 3U7SA 2HM1A 2QMPA 1FFFC 4RCEA 2HC0A 5DR8A 3TLHA 2QCIA 5AH7A 5P1GA 5P2BA 3BRAA 3NXEA 5HDXA 1TCXA 1WBMA 2AOFA 4L7JA 2UY0A 2NMZA 3LPIA 3DV1A 3EKTA 1HHPA 4DJRA 4EJKA 2OHRA 1EC0A 2V10C 3NDWA 3RTHA 1OEWA 4J17A 3TPRA 2G21A 3CKTA 5P4NA 1FGCC 3QS1A 2FXEA 5P2DA 5P8BA 2P83A 5AH9A 3DJKA 2Q5KA 1DW6C 4PZWA 1K6PA 4R95A 5OZMA 3PWRA 4Y3FA 3SA6A 5P75A 4Y47A 1LZQA 4Y3AA 5P8CA 5OZPA 4YD6A 2PK6A 5P15A 3GGAA 5P58A 4GJAA 5P50A 5P6EA 1EBZA 1G2KA 3PLLA 4Y3ZA 5P60A 5AHAA 1D4SA 1W6IA 5OZUA 4I0IA 5P8MA 1IZIA 2AOHA 1QBRA 3LIYA 1J71A 5P2WA 3ER3E 5OZTA 4EHCA 1T6GA 1GVWA 4ZEAA 1EBKC 4D85A 4ZSMA 4HLAA 1FFIC 3BXSA 3HVGA 5P3IA 1GKTA 4DH6A 5OZFA 3NWXA 2OHMA 5P3QA 3IGBA 5P77A 5P7SA 3ECGA 2Q55A 1HIIA 4Q1NA 4RGHA 4NKKA 4QJ8A 1B6LA 3MSJA 5P7EA 5P7HA 4APEA 3IVIA 2QNNA 2IENA 4RRSA 5P80A 4FRIA 2WEBA 5P45A 3O9EA 3LIXA 3TTPA 2JYSA 1IVQA 1OHRA 4XX3A 4ER4E 5HCTA 2OHPA 5P3DA 2BJUA 4DJYA 1A8GA 4DJUA 2QAKA 1PSOE 5HDUA 4J1KA 3O99A 1DP5A 4J0PA 5P33A 3IXOA 5P1LA 1SGZA 5P8IA 2BPWA 3RVIA 1HPXA 4JPCA 4R93A 1YM4A 4GIDA 3JVYA 5OYWA 5C9FA 2AVMA 2FDPA 2QI4A 1G6LA 2HS1A 4L1AB 3CIBA 3ZPTA 3FNSA 5P6CA 5P4DA 4EQJA 5P6ZA 1HBVA 4B1DA 3G70A 2G22A 1HSHA 2XYFA 5P09A 4Z22A 1K2CA 5P7ZA 2PWRA 3DUYA 5P3JA 5P5FA 5DR4A 4Y3SA 2ZJNA 4YDGA 1TSQA 1D4YA 1T7KA 5P0KA 3OQDA 3OADB 1Z1RA 1RPIA 1Z1HA 3WSJA 4J0ZA 1ME6A 5P27A 5HDZA 1VIJA 3IXJA 2ZYEA 2V13A 3OK9A 4Y5LA 1LEEA 1AJXA 3K5FA 3VSXA 5OZKA 1KJHA 5F00A 4Y38A 4DQBA 4D83A 2WL0A 3INEA 2WEDA 5P7QA 3HAUA 2ZJKA 5OZAA 4H3FA 3UFLA 2PYNA 2FMBA 1C6XA 3ZPSA 3NDUA 3K5CA 3UPJA 3IA9A 4ZSRA 3ZKNA 4JOOA 5P8VA 3KT5A 5OZZA 2Q64A 5OZ2A 1A9MA 3IN4A 1T6EX 4K9HA 1C6YA 1SMRA 5P87A 3DCKA 3S8IA 1ZAPA 4Y58A 4EP2A 4YCYA 1HRNA 3BUHA 5P2GA 1MT9A 5P2IA 5P8EA 5DQ5A 5IVQA 5C9DA 5P22A 5P5NA 2R9BA 3D91A 3SA5A 1QBTA 3GGVA 5OZEA 3S7LA 4IVSA 2QZXA 2OF0A 5P35A 5P4YA 3EL5A 4TVHA 4B1EA 1MSMA 5P1ZA 4IVTA 2J9JB 2WF1A 4Y5GA 4A6CA 3HLOA 5P7BA 5P5DA 4E43A 2VIZA 3UDPA 3UTLA 5P00A 4I0HA 4LXAA 1BV9A 3VCMA 1RV7A 4J5JA 1HVIA 5P0HA 2HPEA 2AIDA 3O9GA 5P4PA 5P4XA 3URJA 2VA5A 3MSKA 5P3MA 3WB5A 2ANLA 5P7JA 3T6IA 3SA4A 5P7PA 2O4SA 4Y44A 3RSVA 1MESA 4YD7A 4HEGA 5P30A 4OBFA 3VSWA 4ZPEA 5P6DA 1K1TA 1BBSA 5P2UA 3BHEA 4M8XA 5P1NA 5P18A 1HEFE 5I3VA 2I4XA 4GJ6A 5P0JA 2XFKA 2FNSA 2G1RA 2FGVA 1UH7A 3K1WA 5BWYA 2I4VA 2B8VA 1IIQA 3PCZA 4GYEA 2OHKA 5P84A 3IN3A 2G27A 4OD9B 2VJ9A 3OQKA 5IVTA 3KDCA 3FNUA 2ZHUA 3QIHA 2WF4A 5KQYA 5DGUA 2ER6E 5P0UA 2HAHA 1GNNA 2AZBA 5P0CA 2IS0A 5P1QA 4ZSQA 5P36A 1YX9A 2ZJLA 1DIFA 3EXOA 1GVXA 5COPA 4B70A 5P1KA 5P3UA 5P6YA 5P6RA 5P4AA 4GMIA 5OZ8A 2V12C 5P8OA 5P02A 1ZBGA 1HVSA 1HXWA 4Y3TA 4I1CA 4J0YA 5P2YA 5P1XA 4D8CA 1IDBA 4OC6B 3QVCA 4YHQA 6UPJA 4YBIA 5OZCA 5P59A 3ZPUA 4Q1XA 4QLHA 5P64A 4PYVA 1SGUA 4CPSA 1IVPA 4R92A 5P3VA 3UHLA 4CPTA 1A8KA 3NU9A 3NU4A 4F74A 2ASIA 1IZEA 3LIQA 3SABA 5P28A 2Q63A 4RVXA 2Q3KA 5P6FA 3T7XA 5P89A 4OBZB 5P5LA 3PM4A 4TRYA 3K4VC 4HZTA 5P6XA 1RNEA 5P0XA 2WEAA 3OHHA 1LS5A 3N3IA 4UPJA 3WB4A 3EM6A 5OZYA 3VYFA 4YD5A 1HSGA 3GI5A 4Y3QA 1FQ6A 2ZGAA 1MIQA 5F01A 4FRKA 3QAAA 5JG1A 3UDKA 4GJ7A 1LF4A 4RVIA 5P1VA 5P0GA 2P3CA 3EL4A 1EPLE 5DQ2A 2B7FA 2AOIA 5P17A 4BEKA 1XL2A 1OEXA 3PWWA 3PI0A 1PSNA 4I0JA 2R3TA 4MC2A 4Y4XA 2O4NA 4XKXA 5P3RA 5OZBA 3WZ8A 5P6GA 3S45A 3M9FA 1YTGA 5P37A 1BILA 1HVRA 4J1HA 3Q6YA 3FKTA 3QRMA 2J9JA 3OAGA 1IZHA 2P3DA 5P3LA 1BIMA 2F81A 4Y37A 5P4IA 3QBFA 5P7LA 3I6OA 3PLDA 2UPJA 2J9KA 5OZ6A 4J0TA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1EC1 A;  5P5S A;  3GGU A;  3NXN A;  4Y4G A;  5P3S A;  1DAZ C;  5OYQ A;  1CPI A;  1HIH A;  2Q54 A;  3D1Y A;  4LAP A;  5P73 A;  4YA8 A;  5P7R A;  2R8N A;  1M43 A;  1LV1 A;  2QI7 A;  1APU E;  1UH8 A;  1AXA A;  4FLG A;  3LPJ A;  5P3G A;  2SAM A;  5P0Y A;  3VG1 A;  3CIC A;  5P0I A;  3KYR A;  4EQ0 A;  1LYA B;  3OUB A;  4H3G A;  5P8U A;  1AAQ A;  2B42 A;  3OQF A;  3L5F A;  1FF0 C;  2OHN A;  3SQF A;  2PSG A;  4U8W A;  5P51 A;  8HVP A;  2V11 C;  3N4L A;  4RLD A;  5SZ9 A;  1SP5 A;  2BPX A;  5P79 A;  3URI A;  1YTH A;  3KFS A;  1SH9 A;  5OZJ A;  2AVO A;  2IQG A;  2ZE1 A;  4B0Q A;  2PK5 A;  1T3R A;  5HD0 A;  2F3E A;  3EBZ A;  5OZS A;  4LC7 A;  5KOQ A;  3BUF A;  4L6B A;  2QU2 A;  2V16 C;  5J25 A;  1M0B A;  5P0R A;  3IXK A;  2G20 A;  2HS2 A;  4I12 A;  5BS4 A;  3FIV A;  1HPV A;  4WTU A;  3PB5 A;  3QRO A;  5P7C A;  3CYX A;  2FIV A;  4EPJ A;  4U7Q A;  4DFG A;  5P0A A;  2RSP A;  2AOG A;  3LIV A;  1AID A;  3OQ7 A;  4NJV A;  5P12 A;  1FG8 C;  2AVV A;  4DQC A;  3OXW A;  5P4B A;  5OZN A;  1A30 A;  5P4O A;  1TZS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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