The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
142
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structure length |
142
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Chain Sequence |
SLSAAQKDNVTSSWAKASAAWGTAGPEFFMALFDAHDDVFAKFSGLFSGAAKGTVKNTPEMAAQAQSFKGLVSNWVDNLDNAGALEGQCKTFAANHKARGISAGQLEAAFKVLSGFMKSYGGDEGAWTAVAGALMGEIEPNM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
HEMOGLOBIN
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| publication title |
Cyanide binding to Lucina pectinata hemoglobin I and to sperm whale myoglobin: an x-ray crystallographic study.
pubmed rcsb |
| total genus |
58
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| structure length |
142
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| sequence length |
142
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-11-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QRW A; 5SW7 A; 2SPM A; 1XZV B; 2H35 A; 1Y8H A; 1A3N A; 1YMA A; 1DXU B; 1HGA B; 2MGG A; 2D5X A; 2AA1 A; 1IRC A; 4M4B A; 4WJG 1; 1OR4 A; 1BIJ B; 4XS0 A; 3A5G A; 3A59 A; 1LH2 A; 3WFW A; 2DC3 A; 2ZT0 A; 1TES A; 1AJ9 A; 1DXT B; 1O1N A; 5E83 B; 1MNI A; 3QQQ A; 4TWU A; 3DHR A; 3PT7 B; 4NI1 A; 1Y7Z B; 2W6V A; 1V4U B; 2ZLU B; 3GOU B; 2MGI A; 1XZU A; 2V1I A; 1MYG A; 1NEJ B; 1LA6 B; 3GYS A; 2O5T X; 3QJE B; 3G53 A; 1LFZ B; 3CY5 A; 2R4W A; 1NIH B; 1S69 A; 1J7Y A; 3G4R A; 3O7N A; 1Y4B A; 1LUE A; 1J3Z A; 3A2G A; 2QMB B; 3H57 A; 1OJ6 A; 1RQA A; 1NS6 A; 3IC0 A; 1YGF A; 3UH6 A; 3WCP A; 3H58 A; 4N8T A; 1CMY A; 4F4O B; 5D5R A; 1JF3 A; 3K3U A; 3LB4 A; 1MYJ A; 5EE4 C; 1A6M A; 1DLY A; 2GRZ A; 3UGZ A; 4HRR A; 1YIH B; 3PI9 A; 4MQK B; 3GQP A; 1Y0D B; 2HZ1 A; 1BUW B; 5JDO F; 1G0B A; 3QM9 A; 3D17 A; 5CN5 A; 1MTK A; 5B85 A; 3ZJN A; 2LH3 A; 4UZV A; 2FRI X; 4O4Z A; 1GBV A; 4ODC B; 1MLQ A; 5M3S A; 2Z85 A; 2AV0 A; 1Y83 B; 1A00 A; 3S65 B; 1HV4 A; 1K1K A; 2ZS1 D; 3M39 A; 1XQ5 A; 4ROL A; 2G0X A; 1A6G A; 1QPW B; 1T1N B; 1MYZ A; 3UHV A; 2SPN A; 3LR9 A; 4JYQ A; 3SDN A; 1QSI B; 2QSS B; 4FWZ A; 1X9F B; 4F6I A; 3P5Q A; 3EOK B; 3HEO A; 2MB5 A; 2ZS1 A; 3UHQ A; 3S48 C; 1JY7 B; 2D2N B; 2D5Z A; 4NXA A; 5EU2 A; 5HBI A; 1LH1 A; 1S5Y B; 1UFP A; 3BCQ A; 4MXL A; 5CN4 A; 1ABW A; 1HAB A; 4M4A A; 1MBA A; 1DWT A; 5HLX A; 2D2M D; 1RQ4 B; 3V2V A; 1Y8H B; 1LH7 A; 5EQM A; 3NMM A; 1HBH B; 2DHB A; 2D5X B; 1K0Y A; 1XZ5 B; 1Y8W A; 3UHD A; 1JL7 A; 1DXV A; 3W4U A; 3QM7 A; 1HBA B; 1CBM A; 1A3O A; 1Y0W A; 4NK2 A; 1KD2 A; 3R0G A; 4MQI A; 2D2M A; 5HU6 A; 4F6G A; 1KFR A; 1VXA A; 1MNH A; 3CIU B; 3FS4 A; 1G0A A; 3UHZ A; 3WCT C; 2B7H B; 1HBS A; 3OO4 A; 1RQA B; 2V1K A; 1UX8 A; 1ASH A; 3BJ3 A; 3IC0 B; 5CNC A; 5F2A A; 1Y4R A; 2ZLX A; 1CMY B; 2O5S X; 2MGK A; 1MLR A; 3E4N A; 1M6C A; 3ZHW A; 1XXT A; 1F5P A; 1MGN A; 1C7B A; 1F5O A; 3ONZ B; 2OIF A; 3D7O B; 4G51 B; 1Y4G B; 4N7N A; 5CN6 A; 2V1J A; 3ZJO A; 1QSH A; 1M6M A; 1G0B B; 3D17 B; 1SPE A; 1WMU B; 4XDI A; 1YEO A; 1RQ3 A; 3MVC A; 1HBB A; 2NRL A; 1ABY A; 2HCO B; 2LH1 A; 1IBE B; 4H2L B; 4IT8 A; 5D1V A; 1R1X A; 4NI0 B; 4HRT B; 3A5B A; 4N7P A; 2DN3 B; 1VXF A; 3HEP A; 1K1K B; 3EDB A; 1Y31 B; 1I3D A; 1HGB A; 1A4F B; 4ESA A; 2ZLV B; 1OUU A; 1QI8 A; 2WTH A; 1S0H A; 1YE2 B; 2YRS B; 1GCV A; 3G46 A; 2ZLT B; 2NRM A; 4ROM A; 2MGL A; 5E6E B; 2G3H A; 1LFL A; 3BJ2 A; 2ZS1 B; 4F6F A; 1YGD A; 1Y0T B; 3GQG B; 1YEV B; 1OR6 A; 1MYF A; 3R5I A; 2OLP A; 3WCT D; 1XZ4 B; 1FDH G; 1YEQ B; 1ABS A; 1YDZ A; 1H97 A; 3E5O A; 1A01 B; 1SDK B; 3ZOM A; 1VRF A; 4YU3 A; 1Y8W B; 4QAU A; 3PI3 A; 5JGG B; 2HHE B; 3DHT A; 1J40 B; 3WCT A; 2LH2 A; 1MNJ A; 4PQB A; 2PEG B; 1RVW A; 1JEB A; 1YE0 B; 1G09 B; 1G9V A; 1YEN B; 2ZSX A; 2V1F A; 1NS9 B; 3UHX A; 2HBC A; 3GKV A; 3WCV D; 1YCA A; 2ZS0 C; 3RJN B; 3G4Q A; 1CH2 A; 1GDJ A; 2HHD A; 1DM1 A; 1MLO A; 112M A; 1EWA A; 1MWC A; 2OH9 A; 1XZV A; 4H07 A; 4U8U B; 5CNG A; 3QJD A; 2GRF A; 1Y01 B; 1X9F C; 2ZLX B; 1DXU A; 1HGA A; 1Y5J B; 3ECL A; 3PIA B; 2FAL A; 3SZK B; 1NWN A; 1DXT A; 1MOH A; 4L2M A; 1GDK A; 5AZR A; 5E83 A; 4N7N B; 2ZLW B; 1NQP B; 1Y7Z A; 1V4U A; 2Z6N B; 2ZLU A; 3GOU A; 1BZZ B; 1QSH B; 1Y4P A; 1HDS B; 4O35 A; 1IDR A; 1NEJ A; 1LA6 A; 1Y22 B; 107M A; 3GQR B; 3UHC A; 3QJE A; 4DC7 A; 1LFZ A; 1XYE B; 1NIH A; 5CNF A; 1W92 A; 5C6E B; 3NFE B; 1Y7C B; 1MLU A; 2QU0 B; 4G1V A; 1FAW B; 2QFN A; 2Z6T A; 4DWU A; 1VXD A; 1HGC B; 1Y8K B; 1RPS B; 2ZSP A; 5E29 B; 2MGD A; 4NZI A; 2HHB B; 1YHR B; 2OHB A; 3QZX A; 2QMB A; 104M A; 1PBX A; 1Y4V B; 1A0U A; 3GDJ B; 1MBD A; 3AQ7 A; 1S0H B; 4F4O A; 1N9X A; 1J7S B; 3RGK A; 3DUT B; 1THB B; 2VYY A; 2HBD B; 1LHT A; 1MLS A; 1EMY A; 1YIH A; 1A0Z B; 4MQK A; 3VRF A; 108M A; 1VWT B; 1Y0D A; 2R80 A; 3S1J A; 2BKM A; 4H0B A; 1OBM A; 1QXD B; 3LB1 A; 3D4X B; 106M A; 3WFT A; 1NZ2 A; 4ODC A; 3AQ9 A; 4F68 A; 1Y46 B; 1YEU B; 1Y0C B; 1JZM A; 1Y83 A; 111M A; 3S65 A; 2W72 B; 3ECX A; 1X9F D; 3MOU A; 5CND A; 5F0B A; 5EV5 A; 2D2N D; 1CH7 A; 2DXM B; 3D1A B; 1QPW A; 4KN3 A; 1Q1F A; 5IKS A; 1VXE A; 2HZ2 A; 2ZSY A; 1T1N A; 3IXF A; 4NK1 A; 3WR1 B; 2H8F B; 3ZOL A; 4YU4 B; 1AJH A; 3GLN A; 3O89 A; 1ECA A; 1O1O B; 1QSI A; 2QSS A; 3UHR A; 3FH9 B; 5HAV A; 2O5L X; 1MKO B; 1X9F A; 1HLB A; 1DTI A; 2AUO A; 3EOK A; 1CG5 A; 3PEL B; 1YVQ B; 1JY7 A; 2D2N A; 3VHB A; 3UHN A; 1S5Y A; 3UHH A; 3WFU A; 2IG3 A; 5CMV A; 3QJD B; 1RQ4 A; 5JOM A; 1LTW A; 1HBH A; 2ZS1 C; 5C6Y A; 3WCV B; 1XZ5 A; 5HY8 A; 4DWT A; 1HBA A; 3UH3 A; 4N7O B; 2ZT2 A; 1G08 A; 2LH5 A; 4MQG B; 3MJU B; 1Y4P B; 1MLK A; 2AUQ A; 1BZ1 B; 1UIW A; 1Y8I B; 1GVH A; 1DWS A; 2ZT4 A; 3UHT A; 1V5H A; 1B86 B; 3QM5 A; 3CIU A; 3QJB B; 1N9F A; 1CG8 B; 2EB8 A; 1OUT B; 2B7H A; 2D2M C; 1YOG A; 5KDQ B; 3RJ6 A; 1IRD B; 4OOD A; 1PBX B; 3LB3 A; 3QMA A; 1A0U B; 3UHE A; 4HSX A; 1LFY B; 1RSE A; 5ILP A; 3AT6 A; 2D60 A; 1BZP A; 2EVK A; 1EW6 A; 3ONZ A; 3D7O A; 2XKI A; 1Y4G A; 4G51 A; 3VRF B; 3AQ5 A; 2O5O X; 1MYI A; 2R80 B; 3G52 A; 2BNL A; 1WMU A; 3MYN A; 2FAM A; 2W6W A; 2BLJ M; 4ZVA A; 2HCO A; 2RI4 B; 2BK9 A; 5CNE A; 1IBE A; 4H2L A; 2QFK A; 1YOH A; 3HXN B; 4NI0 A; 1CH4 A; 4HRT A; 2VM0 A; 4FWX A; 2NX0 A; 2DN3 A; 2ZFO D; 2MGH A; 2R4Y A; 1NXF A; 1UMO A; 1Y31 A; 3UHW A; 1JWN A; 1FSL A; 2G0R A; 1A4F A; 2DN1 B; 1R1Y B; 2GL3 A; 1WLA A; 1HCO B; 2ZLV A; 1VXB A; 4WCH D; 1SI4 B; 1YE2 A; 5CN7 A; 2W6Y A; 2YRS A; 3UH7 A; 3M3A A; 2ZLT A; 1HBG A; 1NZ3 A; 1DWR A; 2HZ3 A; 4TYX A; 5E6E A; 3WFX A; 5KER B; 1CG5 B; 1U7S A; 1Y0T A; 3GQG A; 2GDM A; 1O1K B; 2QLS B; 1YEV A; 2VRY A; 1MWB A; 3EDA A; 1XZ4 A; 4ZVB A; 2ZSQ A; 2XKH A; 1YEQ A; 1L2K A; 1YFF B; 1A01 A; 1Y2Z B; 1SDK A; 1YMB A; 3PI4 A; 2MGB A; 3ODQ B; 1GLI B; 2EKU A; 3V2Z A; 5HY8 B; 1GBU B; 3HYU B; 1C40 B; 4AVE A; 1J41 A; 4F6B A; 3A5A A; 5JGG A; 1SDL B; 2HHE A; 1G08 B; 2NSS A; 1J40 A; 1ECN A; 3MBA A; 1CO8 A; 2QSP B; 1UIW B; 1XY0 B; 2PEG A; 4U8U D; 1Z8U B; 1YE0 A; 5AZQ A; 2W72 C; 1BJE A; 3GKT A; 1G09 A; 1AZI A; 1YEN A; 1DUK A; 2SPL A; 3UBC A; 1NS9 A; 4OF9 A; 3OGB A; 1UVX A; 1J3F A; 2BMM A; 3QQR A; 3ASE A; 4MQJ B; 4U8U A; 1LJW B; 1UFJ A; 1JZK A; 1MBS A; 1Y5J A; 1FHJ B; 3QZZ A; 4IRO B; 3PIA A; 1BAB A; 2MGA A; 3SZK A; 2W6X A; 3AT6 B; 2D60 B; 4F69 A; 3DR9 A; 1Y5F B; 3MN0 A; 1URY A; 2ZLW A; 1Y35 B; 1NQP A; 1ITH A; 2Z6N A; 1BZZ A; 3WI8 A; 2AUR A; 3NML A; 2R4X A; 1HDS A; 1S5X B; 3ORD A; 1YHU D; 1Y22 A; 2PGH B; 3GQR A; 3WCV C; 2XKG A; 1XYE A; 2EB9 A; 1IWH B; 1F63 A; 2GTL D; 5C6E A; 3NFE A; 1Y7C A; 1CH9 A; 2QU0 A; 3HEN A; 1FAW A; 1A6N A; 1HGC A; 1Y8K A; 5CN9 A; 4PQ6 A; 2WY4 A; 1RPS A; 4MQC B; 3MKB B; 5E29 A; 3G4U A; 2HHB A; 1YHR A; 1VRE A; 1RTX A; 2CMM A; 1LFQ B; 1Y4V A; 1Y7D B; 3GDJ A; 3MJP B; 3WHM B; 3U3E A; 1MZ0 A; 1WVP A; 1AJG A; 1LH3 A; 1J7S A; 1MLF A; 3ZJI A; 3DUT A; 2G10 A; 3PT8 B; 1THB A; 2HBD A; 2ZFO B; 4VHB A; 1SPG B; 1LFT B; 1A0Z A; 2MGM A; 1VWT A; 2FRK X; 1HHO A; 4KMW A; 5CN8 A; 1DXC A; 1XZ7 B; 1QXD A; 4F6D A; 3D4X A; 1NPG A; 1Y46 A; 4JAC A; 1YEU A; 1FSX B; 1Y0C A; 3D1K B; 5EYJ A; 4FWY A; 4HHB A; 1V4X B; 4FC3 B; 3A0G B; 2W72 A; 1DO7 A; 1J41 B; 3QM8 A; 1RTE A; 2Z8A A; 2DXM A; 1MOD A; 3D1A A; 1YG5 B; 1BBB B; 3OVU C; 4KJT A; 3TM3 A; 1VXH A; 3WR1 A; 5JDO D; 2H8F A; 2MGC A; 4YU4 A; 1O1O A; 2ZWJ A; 2MBW A; 2O5B X; 3FH9 A; 2H8D B; 2GKN A; 1NZ4 A; 1MKO A; 3OO5 B; 3AG0 A; 3PEL A; 1YVQ A; 2OHA A; 1JL6 A; 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5KER A; 2BWH A; 4KMV A; 1CO9 A; 1J7W B; 1HAC B; 2MYD A; 1C7D B; 1F65 A; 2VHB A; 4C44 A; 1CIO A; 3VRE B; 4BJA A; 2G0S A; 2GKM A; 1MNO A; 1O1K A; 2QLS A; 2R1H B; 3S66 B; 3TM9 A; 1NGK A; 1M9P B; 4HSW A; 2GLN A; 5CHQ A; 1LFV B; 2EKT A; 1GZX B; 3NL7 B; 3LR7 A; 4B3W A; 2ZFO C; 4X0L B; 1YFF A; 1Y2Z A; 3ZJS A; 3S1I A; 3ODQ A; 1GLI A; 3BOM B; 1Y4F B; 1GBU A; 4ILZ A; 3HYU A; 1C40 A; 1GCW B; 1LH6 A; 3OK5 A; 3WCU B; 1O1L B; 1YH9 B; 4TWV A; 1SDL A; 1V4W B; 2MHB A; 4MXK A; 2QSP A; 1XY0 A; 3HRW B; 5ILE A; 2ZST A; 2MYA A; 2ZSO A; 2HBE B; 3GK9 A; 2VLX A; 110M A; 1NPF A; 2LHB A; 3UH5 A; 2Z6S A; 1URV A; 1Y09 B; 1YZI B; 4NXC A; 1BZ0 B; 2GNW A; 3KMF A; 4MQJ A; 1LJW A; 2VEB A; 3WTG A; 1VXG A; 1FHJ A; 4IRO A; 3WCW B; 4G1B A; 1JPB A; 1X46 A; 1KR7 A; 1MOA A; 2ZFB B; 3K8B A; 5HLU A; 1COH B; 1Y5F A; 1HBI A; 1Y35 A; 2HBG A; 4U8U C; 4O4T A; 1S5X A; 4AVD A; 2PGH A; 3B75 A; 1JP9 A; 5EUI B; 1Y4Q B; 3ZH0 A; 1IWH A; 3VRG B; 4MBN A; 2MYE A; 3NG6 B; 1UVY A; 4GZG A; 1XZ2 B; 4MQC A; 2E2Y A; 3MKB A; 3PI8 B; 3LHB A; 1LFQ A; 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