The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
51
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sequence length |
136
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structure length |
136
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Chain Sequence |
LSADQISTVQASFDKVKGDPVGILYAVFKADPSIMAKFTQFAGKDLESIKGTAPFETHANRIVGFFSKIIGELPNIEADVNTFVASHKPRGVTHDQLNNFRAGFVSYMKAHTDFAGAEAAWGATLDTFFGMIFSKM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
ERYTHROCRUORIN (CYANO MET)
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| publication title |
Structure of erythrocruorin in different ligand states refined at 1.4 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Chironomus thummi thummi
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| total genus |
51
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| structure length |
136
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| sequence length |
136
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1979-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4FC3 A; 1WVP A; 2GRF A; 4FWX A; 2D60 B; 1COH B; 1SPG B; 3WHM A; 2ZSR A; 1G09 B; 1BIJ A; 3SDH A; 3MJU B; 3GQG B; 3OK5 A; 1BZ6 A; 7HBI A; 4KMW A; 1Y09 B; 1K0Y B; 1LHT A; 4NXC A; 2W72 B; 1JZK A; 104M A; 1O1K B; 5KER B; 1V4W B; 2AUP A; 3A59 A; 1YCA A; 1JPB A; 1HAC A; 2IN4 A; 3ZJJ A; 3TLD A; 5MBN A; 1J7W B; 3AQ6 A; 4IRO B; 2V1K A; 4ROM B; 1A0Z B; 2FAL A; 3QM7 A; 2MGB A; 1ABY A; 1Y7Z B; 3GOU B; 4F6F A; 2ZFO D; 3G53 A; 4UUR A; 4F6G A; 2M6Z A; 1A6K A; 3WCP A; 2ZFO B; 3LHB A; 3ODQ A; 5JDO C; 1Y4G B; 1A4F B; 2ZS1 D; 3M39 A; 1V4U A; 2G12 A; 1RSE A; 1MNH A; 2HCO A; 1UVY A; 2ZS1 B; 1RVW A; 3WHM B; 2PGH A; 1MBN A; 1RQA A; 2HZ1 A; 3IC0 B; 2GKN A; 2R50 A; 3GYS B; 1LUE A; 3AT5 A; 3DUT A; 3ZJO A; 2AUR A; 5F2A A; 2VYZ A; 1FDH A; 1Y4P A; 3QJD A; 1YOH A; 1YGD A; 1L2K A; 1IOP A; 1LH5 A; 3UHE A; 1CBL A; 4HSW A; 3OZW A; 2GRH A; 1MOC A; 2VLZ A; 1ECN A; 2HBS A; 5HBI A; 2BWH A; 3O89 A; 1RTX A; 1ABY B; 1H1X A; 3KUO A; 1NIH A; 2VHB A; 2O5L X; 1CBM A; 3QZZ A; 2ZFB A; 1YVT B; 1A6M A; 3WR1 A; 1A6N A; 1VXE A; 3WCP B; 1XY0 A; 1NXF A; 4NK1 A; 4TWU A; 1A9W A; 1V4U B; 3B75 A; 1YEO A; 2HCO B; 4N8T B; 2EVK A; 2R1H A; 3H58 A; 3A5B A; 1UFJ A; 2PGH B; 3UBC A; 1RQA B; 1MNJ A; 3AT5 B; 1G0A A; 3DUT B; 1IRD A; 1C40 B; 1S0H B; 5CNB A; 1GDK A; 1DXV A; 1Y4P B; 1UX9 A; 2MGH A; 2W72 C; 3LB3 A; 5CHR A; 1ABW A; 5KKK A; 1FCS A; 3MKB A; 2V1G A; 4HBI A; 2NRL A; 3UHN A; 3WFW A; 1DWS A; 1YEU A; 3ECL A; 1MGN A; 2Z6T A; 1Y83 B; 5E29 B; 1JY7 B; 3G4U A; 1MLF A; 2YRS B; 3ZJN A; 5AZQ A; 1NGK A; 2Z8A A; 1T1N A; 1XYE A; 1YGF B; 5CNC A; 3WR1 B; 3SZK B; 1OUT B; 3E4N A; 4VHB A; 1GZX A; 3EOK A; 3ZJL A; 1BBB B; 2ZT1 A; 1A01 A; 1RQ4 B; 1V5H A; 4MQH A; 5EU2 A; 3HF4 A; 3B75 B; 2HBD B; 5CN8 A; 5EUI A; 2BW9 M; 3NML A; 3AQ5 A; 1BZP A; 1BZ1 B; 5EQM A; 1YMB A; 1Y4B A; 2O5S X; 1O16 A; 1MWC A; 1YMC A; 1CH7 A; 1X46 A; 1V9Q A; 1THB A; 5EV5 A; 1DXV B; 1O1P A; 1O1O A; 1Y5J B; 1HBR A; 2DC3 A; 1N9I A; 2PEG B; 1SPE A; 1HGA A; 5KDQ B; 5CN6 A; 2ZLU B; 3MKB B; 2W6Y A; 1CH9 A; 1I3E A; 1Y8H A; 1MYJ A; 1X3K A; 4NI0 A; 1CP0 A; 1VXC A; 4XDI A; 1URV A; 1MYZ A; 2O5O X; 1VRF A; 4OF9 A; 5EYS A; 3HEP A; 1HJT A; 3WCU A; 1YHU A; 3AQ9 A; 1XYE B; 4AVD A; 1ASH A; 1W92 A; 2Z6S A; 2OIF A; 1GZX B; 3EOK B; 4PNJ A; 1A01 B; 1MWD A; 4N7O B; 2XKI A; 1J7Y B; 1NZ3 A; 4KN3 A; 3M3B A; 1C7D B; 1VXA A; 3ONZ A; 5EUI B; 1CG5 A; 3D7O A; 1KR7 A; 4NI1 B; 2VYY A; 1Y4B B; 1SI4 B; 1HBS B; 1MOB A; 3OO4 A; 3UHR A; 2D5X A; 1RQ3 A; 3LQD B; 4PQ6 A; 1O1P B; 2QLS A; 2BLI A; 1ECO A; 5B84 A; 110M A; 4F4O A; 1G0B B; 2H35 B; 1Y8H B; 4NI0 B; 4O4Z A; 1SDL B; 2NSR A; 1Y4F A; 1O1M A; 5HLU A; 3GK9 A; 1MNO A; 1F63 A; 1YVQ A; 1Y7G A; 3ARK A; 5D5R A; 1J40 A; 2HBC B; 2QSS B; 1XZ5 A; 3V2V A; 3PI3 A; 3QM6 A; 4U8U D; 1I3D A; 3DHT A; 1HGC A; 3UHX A; 3WCV C; 101M A; 5EE4 D; 4U8U B; 2ZSX A; 2QU0 A; 3WCT C; 1YE0 B; 2EVP A; 5HU6 A; 2B7H A; 3UHY A; 3ONZ B; 1GLI A; 1CG5 B; 2GTL C; 5E6E A; 3UH7 A; 1JP9 A; 1GDL A; 2QFK A; 3D1K A; 1Y7D A; 2DHB B; 3HHB B; 1HBG A; 1S5Y B; 2QLS B; 4F6I A; 1NEJ A; 4F4O B; 4YU4 A; 3ZJM A; 1WMU A; 1OFK A; 4HHB A; 1YHR B; 1QPW A; 3SDN A; 1DTM A; 1MYF A; 1GCV A; 2DN2 B; 2R80 B; 3ZOL A; 3EDB A; 1BAB A; 3ZHW A; 1YVQ B; 1Y7G B; 2JHO A; 1J40 B; 1OBM A; 2GKM A; 3DHT B; 2GLN A; 2RI4 A; 3OVU C; 4H2L A; 1M9P A; 1B86 A; 6HBW B; 2VEB A; 1Y8W B; 5JDO D; 3BJ3 A; 1YMA A; 1CH4 A; 3QQR A; 2MYE A; 3HXN A; 3UHG A; 1HRM A; 1NQP B; 1HBH A; 3GLN A; 1XZ7 B; 3D1K B; 3ZH0 A; 3BJ2 A; 5CN7 A; 2XYK A; 1Y7D B; 5CNG A; 1LFV A; 1JP6 A; 1Y4V B; 2D60 A; 1COH A; 1SPG A; 2MGE A; 1G09 A; 1YHE B; 3MJU A; 3GQG A; 1YEN A; 3NFE B; 4B3W A; 1NEJ B; 2D2N C; 1WMU B; 1Y09 A; 3PIA B; 2BLH A; 2CMM A; 4MQC B; 2W72 A; 2Z6N B; 2DXM B; 1MBC A; 1NWN A; 1V4W A; 1CH2 A; 2EKT A; 1JF4 A; 3UHT A; 1CIO A; 1HHO B; 1A00 A; 1J7W A; 4IRO A; 1FN3 B; 1MYT A; 4ROM A; 1A0Z A; 1HBB B; 2RI4 B; 1QSH B; 2EB8 A; 1XZV A; 3GOU A; 1N9X A; 3AQ8 A; 3K9Z A; 3UBV A; 1X9F C; 3QJB A; 3BOM B; 1JDO A; 2ZFO A; 3HXN B; 3ZJI A; 1S5X A; 1MBI A; 1Y4G A; 1A4F A; 3ARJ A; 3H57 A; 1HBH B; 1VXG A; 3UHZ A; 3OO5 A; 3BJ2 B; 1IBE B; 3LB1 A; 1LFV B; 2ZS1 A; 2MGD A; 3WCW C; 4ROL A; 1YEN B; 3IC0 A; 3GYS A; 3ZJR A; 2O5Q X; 3QZX A; 3GQR A; 2QFN A; 1FSX A; 1HBA B; 1MTK A; 1CH5 A; 5AB8 A; 5CNF A; 2MGA A; 3E55 A; 1A00 B; 1CLS B; 4MQJ A; 1IDR A; 2GDM A; 5C6E B; 3W4U A; 5EET A; 1XZV B; 1DLW A; 1MYM A; 3EU1 B; 4WCH D; 2MGI A; 1YVT A; 3QJB B; 1CG8 B; 4JYQ A; 1BZZ A; 1S5X B; 3D4X B; 1GDJ A; 1OFJ A; 1YH9 B; 4ESA A; 3OO5 B; 5CN4 A; 1YFF B; 4XS0 B; 1Y5K A; 4N7P B; 1HGB A; 1KFR A; 4N8T A; 1Z8U B; 4ROL B; 3S1I A; 1LH6 A; 1YIH A; 1Y7C B; 4F6J A; 1NWI A; 1GCW B; 2V1H A; 1Y0D B; 3MN0 A; 3PI1 A; 3GQR B; 3HEO A; 3PEL B; 1C40 A; 1S0H A; 3UHW A; 3OGB A; 1FSX B; 4C0N A; 1M6C A; 2AUO A; 5CNE A; 1N9H A; 1Y8K B; 2D5Z A; 5M3S A; 2DN1 B; 4MQJ B; 1A3O B; 1Y83 A; 3W4U B; 5E29 A; 1JY7 A; 2YRS A; 4MU5 A; 2WTH A; 2AA1 B; 3OZV A; 3WCV A; 3GDJ B; 1IT2 A; 1YGF A; 3SZK A; 1OUT A; 2ZSY A; 1BZZ B; 1BBB A; 3WCT A; 1RQ4 A; 2HHD B; 4B4Y A; 1ITH A; 3LR9 A; 1MNI A; 1YEV B; 3RJN B; 4ESA B; 3TM9 A; 1DKE B; 1Y5K B; 3K3U A; 1HGB B; 2HBD A; 1BZ0 A; 5AZR A; 2LH5 A; 3QM5 A; 5EOH A; 1YIH B; 3DHR B; 1BZ1 A; 4GZG A; 1FHJ A; 2W6X A; 1MLU A; 3NL7 A; 5ILM A; 2ZLV A; 1Y8I B; 1Y5J A; 3S48 C; 102M A; 1MKO A; 2PEG A; 5KDQ A; 1OR6 A; 2ZLU A; 3G52 A; 2D2M C; 4MPM A; 2D5Z B; 2GRZ A; 1LFQ B; 1AZI A; 3UGY A; 3WTG A; 1MLH A; 1DO7 A; 2EKU A; 4MXL A; 3WCV D; 1XZ4 A; 1A6G A; 3WCT D; 1O1I A; 3WCV B; 1BJE A; 5CN5 A; 2OH8 A; 106M A; 1URY A; 3MOU A; 2XKG A; 4HRR A; 1DXD A; 1HSY A; 2QRW A; 2VLX A; 3ED9 A; 1MOH A; 5EYJ A; 3WCT B; 4M4A B; 3QJC B; 2GTL D; 1UFP A; 4N7O A; 2ZSN A; 1J7Y A; 1J3Y B; 1Y0W A; 3MYN A; 1C7D A; 1R1X A; 2GTL B; 4O35 A; 3KMF C; 1BZ0 B; 2SPM A; 1N9F A; 4NI1 A; 4UZV A; 1CMY B; 1NAZ A; 1JZL A; 2HBE A; 2HBF B; 1SI4 A; 3GQP A; 1HBS A; 1FHJ B; 1S61 A; 2ZLX A; 2ZSP A; 3NL7 B; 4MQK B; 1G9V B; 3LQD A; 2ZLV B; 1MKO B; 1R1Y B; 1LHS A; 2D2N A; 4NK2 A; 2BNL A; 1PMB A; 1G0B A; 1V4X B; 1MBA A; 1S69 A; 2H35 A; 2BMM A; 1OUU B; 3A5A A; 1IRC A; 1HBI A; 1DM1 A; 1QI8 B; 1SDL A; 3WTG B; 5CND A; 3LR7 A; 1LFZ A; 1XZ4 B; 1MBO A; 3UI0 A; 2QSS A; 2HBC A; 1JW8 A; 2OLP A; 4N7N A; 3AG0 A; 2O5M X; 3FS4 B; 1O1I B; 2WY4 A; 2W6W A; 4HRR B; 4U8U A; 1BIN A; 1U7R A; 1YG5 B; 3CY5 B; 4MQG B; 1JP8 A; 2MGL A; 3MBA A; 3M3A A; 1YE0 A; 1Y0W B; 1R1X B; 1AJH A; 1UT0 A; 1YIE B; 1PBX A; 2HBE B; 4ODC A; 2HZ3 A; 1HDB B; 3GQP B; 2NSS A; 2ZLX B; 2DHB A; 3HHB A; 1DXU B; 1S5Y A; 2D2N D; 2VRY A; 1IWH B; 3ZOM A; 1JEB B; 4UIQ A; 3DR9 A; 1VXB A; 1FLP A; 4X0L B; 1MLQ A; 1J3Z B; 2W6V A; 2D2N B; 1OJ6 A; 1MYH A; 2MYA A; 1VHB A; 1YHR A; 2DN2 A; 4JAC A; 1Y46 A; 2R80 A; 1MLK A; 4ZVB A; 1LFZ B; 1HAB B; 4YU3 B; 3D17 B; 2V1F A; 1MZ0 A; 1MOD A; 4N7N B; 5JGG A; 1MTJ A; 3KUN A; 1EW6 A; 2W31 A; 1X9F D; 2G0S A; 1M6M A; 3PI9 A; 2AUQ A; 6HBW A; 1Y8W A; 1D8U A; 2O58 X; 1X9F B; 1FSL A; 2KSC A; 1Y4Q B; 1SDK B; 3QQQ A; 3P5Q A; 3PT8 A; 1LFT A; 1NQP A; 1PBX B; 3WCW D; 4ODC B; 1MLG A; 1BVD A; 1XZ7 A; 4SDH A; 3IXF A; 1QXD A; 3K8B A; 1DO3 A; 2G0Z A; 2VEE A; 2MYC A; 3WCW B; 1Y4V A; 1YHE A; 1LFY B; 2O5B X; 1Y0C B; 2W6V B; 3NFE A; 2ZT4 A; 3R0G A; 3PIA A; 5ILP A; 3PI8 B; 2OH9 A; 4C44 A; 4MQC A; 2Z6N A; 1Y22 B; 1Y46 B; 2DXM A; 2LH7 A; 1Q1F A; 1VWT B; 1HHO A; 4HRT B; 4G1V A; 3ECX A; 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3PEL A; 1MWB A; 2D6C A; 1BUW A; 2D2M D; 2LH6 A; 2EB9 A; 2HHB B; 1VXF A; 1Y5F B; 2BKM A; 5C6Y A; 1YZI A; 4NS2 A; 1O1J A; 1CO8 A; 4O2G A; 1YOG A; 2D2M B; 1Y8K A; 1BVC A; 3IC2 B; 3R5I B; 1GBU B; 2GNV A; 3WFX A; 2DN1 A; 2MYD A; 2WTG A; 1A3O A; 1FDH G; 4WJG 1; 103M A; 3ZJQ A; 1F5P A; 2AA1 A; 1HV4 B; 3GDJ A; 2ZT2 A; 1HDS A; 2QMB B; 1V75 B; 5E83 A; 4L7Y A; 1Y85 B; 2HHD A; 3LB4 A; 2V1E A; 2AV0 A; 5D1V A; 1YEV A; 2R4Z A; 1LFL A; 1CQX A; 3OJ1 A; 1DKE A; 2MGK A; 1NZ5 A; 2GL3 A; 3E5O A; 1A3N B; 1VXH A; 2GNW A; 3VRF B; 1S6A A; 4FH7 A; 2AV3 A; 1DO1 A; 3S66 B; 3DHR A; 4FWY A; 1S56 A; 1QSI B; 1YE2 A; 3UGZ A; 2HHE A; 3NG6 A; 4FC3 B; 5HLQ A; 1LH3 A; 1Y8I A; 1BUW B; 1BIJ B; 1YZI B; 1O1J B; 3VHB A; 4F69 A; 4QAU A; 4FWZ A; 1Y4R A; 1LFQ A; 1EBT A; 4ILZ A; 4H07 A; 108M A; 4DC7 A; 3A59 B; 1DTI A; 4M4B A; 5JDO F; 1HAC B; 3G4V A; 2ZSS A; 1ABS A; 4OOD A; 1O1N A; 1HDS B; 4M4A A; 2E2Y A; 3UH5 A; 5E83 B; 4L7Y B; 3QJC A; 3G4W A; 3QM8 A; 1LFL B; 1J3Y A; 1C7B A; 5CHQ A; 1WLA A; 3PI4 A; 1Y01 B; 3BA2 A; 2IG3 A; 2GTL A; 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