1EEDP

X-ray crystallographic analysis of inhibition of endothiapepsin by cyclohexyl renin inhibitors
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title X-ray crystallographic analysis of inhibition of endothiapepsin by cyclohexyl renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 81
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1992-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
P PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1eedP02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1eedP01
4TRWA 3OXWA 5P05A 1VIKA 3SQFA 5KOQA 1E5OE 5P0PA 2I4VA 3MWSA 3EM4A 5P0YA 3QRMA 5KQZA 2P83A 5P1GA 4QLHA 3RTHA 5KR2A 1D4JA 9HVPA 4PHVA 1NSOA 3O9LA 1MIQA 5OZVA 1PPME 1SP5A 5P6RA 4YDGA 1HVSA 2NR6A 3INFA 4NPUA 1BV7A 1QBRA 3BVBA 2I0DA 3VF3A 3UTLA 1FMXA 4DFGA 4Y37A 2FXEA 3OQDA 5P5OA 4FLGA 3UDKA 1B6JA 5P8JA 1G0VA 1DIFA 3OUDA 1HOSA 3C9XA 4K9HA 3UHLA 2HB4A 5P6BA 4I0DA 5P4KA 3I8WA 3MSLA 2O4LA 4EYRA 1K6TA 5OZ0A 4DJQA 2IEOA 4EJDA 3L5CA 4FM7A 4Y4WA 1FG6C 3NU5A 1AAQA 5P28A 3L3AA 2NXMA 4EQ0A 2FIVA 1J71A 1UPJA 5P2QA 2H6SA 3UDPA 5P4OA 4B00A 1U8GA 5P3IA 1ZAPA 4JPCA 5P5WA 1LYWA 2WECA 5I3VA 3O9LB 4RRSA 2R5PA 2FMBA 4DJUA 2WJOA 2QAKA 1EEDP 4GJ7A 2JJIA 5P5RA 2AZBA 4BFDA 5HDVA 2VIYA 5ENKA 1PSAA 5KAOA 3S56A 1PPLE 3KDCA 1AZ5A 4APRE 3CICA 3NUOA 3QS1A 4J1EA 1HSHA 4OBKA 3O99A 1LF3A 1LF2A 4Q1YA 2G1YA 1UH8A 4R93A 5JODA 5P4EA 1LYWB 4NKKA 3LZUA 2OHSA 5P7QA 5P33A 3T6IA 2VJ6A 5P7UA 5E5KA 3HLOA 4AMTA 4EJKA 1XL2A 4DQEA 1XDHA 5P0XA 3OU3A 3CYXA 5P4SA 3S2OA 2XFKA 3SPKA 4XX4A 2O4NA 3IA9A 3OQKA 4FS4A 5P8GA 3MXDA 2V12C 1B5FA 1C6XA 4TVHA 1IIQA 5P6PA 5P00A 1C6ZA 3UDHA 2O4PA 3ZKSA 1WBKA 3Q6YA 5P59A 1MTBA 3L5FA 1AIDA 3ZKIA 5P5JA 4MC2A 3O9AA 1MEUA 5P6WA 4EQJA 2CEJA 5IVSA 5P83A 3SKFA 3OTYA 3EM6A 1HPSA 5P58A 4DJVA 4I0IA 1Z1HA 3IAWA 3OAGA 5P0HA 4Q1WA 3OY4A 5SY2A 1MRWA 3UF3A 3QP0A 4DJYA 2AZ8A 4CPQA 1B5FB 3EL5A 5OZFA 5P04A 3IN4A 4DQCA 2VA7A 1ZJ7A 5HE4A 3UQXA 1A8GA 3ER5E 3VSXA 2AOHA 1BIMA 3ECGA 4PPHA 1IZIA 4LXKA 2QU2A 4Y3RA 1KJ7A 5P74A 4DJXA 4GMIA 3URIA 4NJUA 1XE6A 4NJSA 2WF0A 4DJRA 3OAGB 3UDNA 2JYSA 5P57A 5OZ2A 1MVPA 5P6XA 5P1ZA 1BBSA 1QDMA 4J5JA 1GVXA 5HE5A 4RVXA 5P0WA 2ER6E 4Y5EA 5P75A 1HSGA 2J9JA 2Z4OA 1D4LA 4I12A 1K6CA 3R0WA 3KFPA 2IRZA 1FFFC 5P4UA 3ZOVA 1IBQA 2PK6A 5I70A 5AGZA 3EMYA 1OD1A 2OHRA 1DPJA 5P2HA 4DUSA 1SH9A 5P8AA 4ZPEA 1M0BA 5F00A 4LL3A 4I0HA 4Y44A 5P2TA 3PWWA 4TRYA 4A6BA 2F80A 2P3DA 5P8HA 4QGIA 3TPRA 5OZGA 1NPAA 4H3JA 4JOOA 4Y3ZA 4CPSA 4DQHA 2XFJA 5P03A 2J9JB 2P8HA 3UPJA 1HRNA 3KDDA 3TPJA 1FQXA 5P5TA 5OZUA 2NMYA 4XX3A 5P72A 5P2GA 4FM6A 3SLZA 5P70A 3B7VA 3OQAA 1T7KA 2QZLA 5AH8A 3PI5A 4GB2A 4HE9A 5FIVA 5P1DA 5P36A 1FQ6A 5P7SA 3UDRA 4Y57A 3OOZA 5P46A 4L7GA 5OZ5A 4I1CA 5P0QA 1RL8A 3CYWA 4QJ6A 4ACXA 1HTRB 3GGAA 5P55A 1EPNE 2CEMA 2NXLA 3M9FA 4I8WA 2RKFA 3BUFA 5OYVA 3LZYA 3KFRA 5P6AA 4K4QA 3FSMA 1CZIE 4J1IA 4CPXA 5P42A 1DP5A 3VFAA 2XYEA 4ACUA 5JG1A 5OZXA 3SACA 5P01A 2I0AA 5P67A 2ZJJA 3S45A 5HE7A 1HIHA 4CKUA 2ZHRA 1PPKE 1UH7A 5DR7A 4LHHA 4FSEA 4OBFA 6APRE 1YT9A 1OEWA 3INHA 3D1YA 5P0SA 4NPTA 2QI6A 1EC3A 3PB5A 1XE5A 5P1QA 3UQWA 5P7MA 3NWXA 5KQYA 4Y6MA 2AVOA 4CPWA 4Z4XA 3NWQA 5P2DA 3PLDA 3UDMA 5P4HA 2G1SA 5P2CA 5P38A 3APPA 1TQFA 3OK9A 2PMAA 2QNQA 1HPOA 2HS2A 3DJKA 4J55A 1ZPKA 5DQ5A 1B6LA 2G94A 5P1UA 1MT7A 4EPJA 1XL5A 2PSGA 2G21A 5DR4A 2QZWA 3HAWA 1YX9A 5OYTA 3R2FA 3PBZA 1D4KA 4PZXA 2QP8A 5P2KA 5P7IA 2QI3A 4MC6A 2ZDZA 4KE0A 5P5IA 2A4FA 7UPJA 5P0ZA 5ER1E 1MT9A 3QI1A 3IXKA 1B6MA 4Y3GA 1LYBA 5P3TA 3TPPA 1VIJA 5P5SA 3BC4A 4H1EA 1IZEA 5P40A 1FB7A 3CKPA 4HZTA 3S54A 1W5YA 1EC1A 1EBKC 3VCMA 4KE1A 3HVGA 2AIDA 3G6ZA 2QI7A 3NXNA 5P6OA 5P37A 1HWRA 1IZHA 3ZPTA 3KYRA 2JJJA 5OYYA 2AOFA 3S7MA 3OXCA 3K5FA 3PRSA 3QRVA 5P7PA 3Q4BA 5P63A 3QBHA 2AOIA 5P0EA 1BWAA 2NPHA 5HD0A 3S85A 2OHNA 1ODYA 4BEKA 3RSXA 2VJ9A 3R1GB 1LYBB 4YD7A 2QMDA 5P5NA 5KR0A 3JVYA 1MT8A 5EZZA 5P1YA 5P6FA 4ZEAA 3I25A 5UPJA 4YA8A 4ZSRA 3VLAA 4I0ZA 4GYEA 5P85A 5P27A 4QJ9A 3T3CA 5P2FA 3GI5A 5OZ6A 2ZHUA 1B6KA 2FS4A 2F3EA 2IS0A 3O9EA 5SY3A 5P3BA 5OZHA 1PFZA 3SFCA 5OYSA 4I0JA 1HIIA 4CPTA 2V16C 4FAEA 2AOGA 1D4HA 5P8LA 5DR0A 3VF7A 3DCKA 4Y4UA 3ZKMA 1XN2A 5P61A 1GVWA 4DV9A 2I4DA 5P3MA 1B11A 5KR1A 5P87A 2B8VA 4ZIPA 4J54A 2IL2A 3INEA 2ZJKA 4DQGA 4MC9A 4PEPA 3TKWA 1TSUA 5P2JA 2FDPA 2PYNA 3UCBA 4YE3A 3OGPA 5P5EA 2VA6A 3QAAA 5P71A 4LAPA 4Y3JA 5P3XA 3S43A 1FQ4A 3AIDA 1T7IA 5P19A 3HW1A 5P3ZA 4Y5NA 4Y4GA 5P29A 2I4WA 5P1JA 2FDDA 2I1AA 2VKMA 3URJA 2B7FA 2IGYA 3T11A 3L5EA 5P0IA 5HDXA 2QI4A 5P2IA 1PROA 5P5VA 1GVTA 3D1XA 3I2LA 2AZ9A 2VNMA 3PMUA 3EC0A 5OZ4A 5KOSA 3GI6A 2IDWA 5P0CA 4WY6A 5OZ9A 5P31A 2G1OA 3KN0A 5P2RA 2FNTA 4OBDA 5P18A 2G26A 2B7ZA 4XKXA 4J0ZA 4DJWA 4ZSQA 2OAHA 2OHUA 5P3AA 1SGUA 4EJ8A 5AHAA 3S43B 5OZZA 5PEPA 1M43A 1UH9A 5IVTA 5COKA 1ZP8A 5OZ3A 2I4XA 5P66A 3EL1A 3WB4A 4AZYA 5P1XA 5P4LA 5ER2E 4RVJA 5P5QA 2WF3A 5P7KA 1HHPA 5P24A 1HTGA 2VIJA 4F76A 1SGZA 1HTFA 5P64A 4I11A 1HBVA 4FL8A 3VLBA 3PSUA 1D4YA 1FKNA 1MTRA 5P4YA 5P7DA 4F75A 6UPJA 5P8BA 4Y3LA 3NUJA 5JFUA 1SIPA 1HVCA 3CKRA 3B80A 5P8FA 4J0PA 1TSQA 4GZFA 1FIVA 2G1RA 3O9DA 5P76A 3PJ6A 4HA5A 4IVTA 5P79A 5P7GA 5KQFA 3VEUA 1MRXA 2AZCA 4F73A 4Y47A 5P1IA 3T7PA 3SA4A 1IVQA 3NLSA 1ENTE 1EPLE 1Q9PA 1SMEA 1FGCC 3NDXA 5OZPA 1CMSA 3DUYA 3VSWA 4YD6A 4Y3TA 5DR8A 1HVJA 4Y3MA 2BPWA 1AJXA 4S1GA 5P1HA 3AUPA 2G24A 1YM4A 5P0VA 4B78A 1TZSA 3HD8A 4J1HA 5HDZA 5P0UA 1SDUA 5P3GA 3DV1A 1KJ4A 2FDEA 4FRKA 2MIPA 5P6NA 5P8IA 4DQFA 2JE4A 4ER2E 5P51A 3SKGA 5P62A 5CONA 4DJPA 4B77A 4ZE6A 2IKOA 3HVPA 5E5JA 4MC1A 5P11A 1T7JA 4Y56A 5P5GA 4OBZA 1W50A 5P1RA 5P15A 1BWBA 3DOXA 4K4PA 3LZVA 2PWRA 4DQBA 5P5YA 4KUPA 4Y4AA 5P1CA 1OEXA 5AHCA 4GJAA 4CPUA 1N49A 5P5UA 2OHLA 2ZHTA 3EL9A 3HZCA 5OYRA 4Y3FA 5P26A 2OHPA 3NU6A 2R43A 3TKGA 1MSMA 1LS5A 2Q54A 3S7LA 1LV1A 5P06A 3ST5A 3LPIA 2OHTA 2AOJA 1APUE 5P3CA 5SZ9A 5COOA 4F74A 2VNNA 1EC2A 3PCWA 4K4RA 1FQ8A 1T3RA 4RCFA 5P1AA 2FGVA 3SM1A 5P7EA 3OXXA 3KA2A 3OQ7A 4OBJA 3ZKGA 4Y41A 3PBDA 4OBZB 5P8TA 2NNPA 2ZJIA 3SA8A 3VV8A 3KFNA 1YTIA 3LIQA 5P65A 5OZSA 4B0QA 4Y43A 1ZSRA 3BUHA 4L1AA 3UQPA 3UDYA 2G1NA 6FIVA 5P0FA 3UDJA 3RU1A 5P41A 5P7BA 3I7EA 1MUIA 4UPJA 4D89A 1DAZC 2BKSA 5DR1A 5P6CA 4QJ8A 3RSVA 4D83A 3OOTA 3DCRA 1QBTA 5AH9A 4Y53A 4M8XA 2ZGAA 5P2LA 3PGIA 4I0FA 3GI4A 2AVSA 2Q3KA 2V13A 3KT5A 5P6LA 5P22A 4YOAA 1T6GA 5P6IA 3D20A 1A8KA 1FQ7A 3K5CA 3PM4A 5P1PA 3O9CA 2WF1A 5P23A 1W6IA 3DM6A 2Q64A 5P3EA 4Y5MA 3OU1A 4LC7A 3ZL7A 2ZJNA 4L1AB 5P8CA 5HCTA 2ZHVA 1T6EX 3RTNA 5P0RA 3BUGA 4LBTA 5P2UA 4DVFA 3GI0A 3LINA 1PSNA 5P02A 5P3KA 3NSHA 5P2YA 4EHCA 3WZ8A 2IGXA 4L7HA 2OHMA 3CIBA 3OUAA 1BILA 5P1BA 5P7HA 5I3YA 4D8CA 5P2BA 3G70A 3EKWA 5DGWA 5P0OA 1OHRA 3IGBA 3F9QA 5P7XA 4OC6A 1ZLFA 5P1NA 5P5PA 3LPJA 5P8RA 5P73A 2VIZA 4HVPA 3D3TA 5P25A 2QI5A 3QPJA 4U8WA 1DW6C 1HPXA 4Y54A 5P6HA 1D4SA 3D91A 3R4BA 2ZJLA 5P1KA 3EBZA 8HVPA 5P2EA 1QS8A 3OU1B 4J0VA 3TH9A 4Y36A 3LIVA 3K4VA 1HTEA 3O9IA 5AHBA 5P1TA 5P5KA 5P6ZA 5P5FA 3NXEA 2BPXA 5P0AA 3O9HA 4FSLA 4Y5CA 1SDVA 4AUCA 1IVPA 4QJ2A 4HDPA 4Y5PA 4U7QA 4U7VA 5HDUA 3FKTA 5IVRA 5HU1A 4YHQA 2P3AA 4OC6B 4BFBA 5OZ8A 3U6AA 4GJ9A 3L5DA 1HIVA 5P4JA 5P1OA 3VYDA 4HDBA 1KJGA 4ZSPA 1W6HA 3O9GA 3WZ6A 1KJFA 2Q11A 5P5AA 5P4PA 5KQXA 4YCTA 2Z54A 4H3GA 1EPME 4KB9A 2QMFA 3O9FA 1EBZA 4L7JA 3OHHA 1SDTA 2QK5A 3APRE 5P80A 5P4ZA 2QI1A 2ZJMA 1LEEA 5P3DA 4N00A 5P7ZA 5P5LA 2QHYA 4Y3SA 1TCWA 1G35A 3KT2A 5P0BA 1FQ5A 1META 4D85A 2HAHA 1ME6A 4Y3EA 3MSJA 5P0GA 2VJ7A 1W5WA 5OZCA 1A94A 1FEJC 4TRZA 1TW7A 3FNUA 4YOBA 3IXOA 3OADB 5P0TA 4M8YA 3NU4A 3TTPA 1GNNA 5P8NA 4GJBA 1KJHA 5P6DA 4FE6A 5P1WA 4R95A 4K8SA 3D1ZA 3MSKA 4GIDA 2JXRA 5P44A 3N4LA 5P4XA 1K2BA 3IXJA 4Y3PA 1K1TA 5P6YA 2F3KA 1HSIA 1HVIA 1Z8CA 5P4QA 2RKGA 5P4GA 4CP7A 4YBFA 4Y38A 2FXDA 1FF0C 5P4BA 2ZJHA 3BHEA 4GJDA 1IDBA 2BJUA 3L59A 2F3FA 1RV7A 3K5DA 4EWOA 5P84A 5P88A 3VV6A 5DQCA 2WKZA 5OYQA 5P53A 2QD7A 1XN3A 4Q5MA 4HEGA 1K1UA 5P8OA 3CKTA 4RRNA 5EZXA 5P47A 3PCZA 5CLMA 2AVVA 4OBGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4TRW A;  3OXW A;  5P05 A;  1VIK A;  3SQF A;  5KOQ A;  1E5O E;  5P0P A;  2I4V A;  3MWS A;  3EM4 A;  5P0Y A;  3QRM A;  5KQZ A;  2P83 A;  5P1G A;  4QLH A;  3RTH A;  5KR2 A;  1D4J A;  9HVP A;  4PHV A;  1NSO A;  3O9L A;  1MIQ A;  5OZV A;  1PPM E;  1SP5 A;  5P6R A;  4YDG A;  1HVS A;  2NR6 A;  3INF A;  4NPU A;  1BV7 A;  1QBR A;  3BVB A;  2I0D A;  3VF3 A;  3UTL A;  1FMX A;  4DFG A;  4Y37 A;  2FXE A;  3OQD A;  5P5O A;  4FLG A;  3UDK A;  1B6J A;  5P8J A;  1G0V A;  1DIF A;  3OUD A;  1HOS A;  3C9X A;  4K9H A;  3UHL A;  2HB4 A;  5P6B A;  4I0D A;  5P4K A;  3I8W A;  3MSL A;  2O4L A;  4EYR A;  1K6T A;  5OZ0 A;  4DJQ A;  2IEO A;  4EJD A;  3L5C A;  4FM7 A;  4Y4W A;  1FG6 C;  3NU5 A;  1AAQ A;  5P28 A;  3L3A A;  2NXM A;  4EQ0 A;  2FIV A;  1J71 A;  1UPJ A;  5P2Q A;  2H6S A;  3UDP A;  5P4O A;  4B00 A;  1U8G A;  5P3I A;  1ZAP A;  4JPC A;  5P5W A;  1LYW A;  2WEC A;  5I3V A;  3O9L B;  4RRS A;  2R5P A;  2FMB A;  4DJU A;  2WJO A;  2QAK A;  1EED P;  4GJ7 A;  2JJI A;  5P5R A;  2AZB A;  4BFD A;  5HDV A;  2VIY A;  5ENK A;  1PSA A;  5KAO A;  3S56 A;  1PPL E;  3KDC A;  1AZ5 A;  4APR E;  3CIC A;  3NUO A;  3QS1 A;  4J1E A;  1HSH A;  4OBK A;  3O99 A;  1LF3 A;  1LF2 A;  4Q1Y A;  2G1Y A;  1UH8 A;  4R93 A;  5JOD A;  5P4E A;  1LYW B;  4NKK A;  3LZU A;  2OHS A;  5P7Q A;  5P33 A;  3T6I A;  2VJ6 A;  5P7U A;  5E5K A;  3HLO A;  4AMT A;  4EJK A;  1XL2 A;  4DQE A;  1XDH A;  5P0X A;  3OU3 A;  3CYX A;  5P4S A;  3S2O A;  2XFK A;  3SPK A;  4XX4 A;  2O4N A;  3IA9 A;  3OQK A;  4FS4 A;  5P8G A;  3MXD A;  2V12 C;  1B5F A;  1C6X A;  4TVH A;  1IIQ A;  5P6P A;  5P00 A;  1C6Z A;  3UDH A;  2O4P A;  3ZKS A;  1WBK A;  3Q6Y A;  5P59 A;  1MTB A;  3L5F A;  1AID A;  3ZKI A;  5P5J A;  4MC2 A;  3O9A A;  1MEU A;  5P6W A;  4EQJ A;  2CEJ A;  5IVS A;  5P83 A;  3SKF A;  3OTY A;  3EM6 A;  1HPS A;  5P58 A;  4DJV A;  4I0I A;  1Z1H A;  3IAW A;  3OAG A;  5P0H A;  4Q1W A;  3OY4 A;  5SY2 A;  1MRW A;  3UF3 A;  3QP0 A;  4DJY A;  2AZ8 A;  4CPQ A;  1B5F B;  3EL5 A;  5OZF A;  5P04 A;  3IN4 A;  4DQC A;  2VA7 A;  1ZJ7 A;  5HE4 A;  3UQX A;  1A8G A;  3ER5 E;  3VSX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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