The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
32
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sequence length |
142
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structure length |
140
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Chain Sequence |
MVDVSAKAETVREARAEAFVTMRSETLAMIIDGRHHKGDVFATARIAGIQAAKRTWDLIPLCHPLMLSKVEVNLQAEPEHNRVRIETLCRLTGKTGVEMEALTAASVAALTIYAMCKAVQKDMVIGPVRLLAKSKSGDFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Insights into molybdenum cofactor deficiency provided by the crystal structure of the molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Translation
|
| source organism |
Escherichia coli
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| molecule keywords |
MOLYBDENUM COFACTOR BIOSYNTHESIS PROTEIN C
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| total genus |
32
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| structure length |
140
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| sequence length |
142
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| ec nomenclature |
ec
4.6.1.17: Cyclic pyranopterin monophosphate synthase. |
| pdb deposition date | 2000-03-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01967 | MoaC | MoaC family |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Molybdopterin cofactor biosynthesis C (MoaC) domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3JQJ A; 1EKR A; 2EKN A; 1EKS A; 2OHD A; 3JQK A; 4PYD A; 3JQM A; 2IDE A; 2IIH A; 2EEY A; 4FDF A; 4PYA A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4ED2 A; 3S7R A; 2W2O P; 2PMW A; 4B3R F; 3VR1 A; 1RDR A; 5HAO A; 4HH1 A; 1Y11 A; 2J9D E; 1OY8 A; 2DNK A; 2B4O A; 1A7G E; 2LA4 A; 2CNO B; 3EYZ A; 3M2R A; 1HHT P; 1V5I B; 1R8B A; 1Q8L A; 3JSM B; 5BYS A; 2KVQ E; 4ZPB A; 2BJD A; 2B9X A; 1N32 F; 3B54 A; 3LGH A; 4QW8 A; 1UPM B; 5C25 B; 2HMI A; 4TY8 B; 1ZZF A; 2QSW A; 3PYD A; 1FJG J; 2W7P A; 3M05 A; 3T9N A; 1KFD A; 1CJT B; 2CDQ A; 3V6K A; 3I4P A; 3P3D A; 4Z7C A; 1WOR A; 3GFX A; 3HJV A; 1S0V A; 1AFI A; 2MSS A; 1XNR F; 2C2M B; 2M2B A; 4OJ3 A; 2PI4 A; 2JNJ A; 1EKS A; 1WNE A; 2P9C A; 5D0H A; 4QR1 A; 1RT3 A; 2E5I A; 1NDL A; 4JI4 F; 2N3O A; 4NXN F; 3NP5 A; 2MZJ A; 5B0D A; 4UUX A; 2RH3 A; 2ZOM A; 1FTC A; 3L7U A; 3CJ3 A; 1LV5 A; 2ZZM A; 4G3I A; 4P74 A; 1OSC A; 2HPU A; 4PPZ A; 1HNW J; 2GQQ A; 1SKR A; 1FKP B; 2C3Y A; 4A8Q A; 3VVU A; 4NLW A; 4KIA A; 3AOD A; 2NPF A; 5HQM A; 2JL9 A; 2YWW A; 1JWW A; 1KWM A; 5K9F A; 4IH5 A; 3VCD A; 1VDH A; 4IUF A; 3OVA A; 3BF4 A; 3G86 A; 4FXV A; 3AOA A; 2IMO A; 1NB7 A; 2VQE J; 1XMO F; 1SQF A; 4DL2 A; 2GVD B; 2FB0 A; 3BQ1 A; 4QWD A; 3K59 A; 3CDE A; 2V2Q A; 4NPO A; 2XGP A; 3ILL A; 2QA1 A; 3FZB A; 3TI0 A; 3R5J B; 4PYA A; 2O1P A; 5E3A A; 2RS8 A; 4HI2 A; 3CXC R; 3OL9 A; 3CW2 C; 2VG7 A; 5GAE I; 1IBK F; 3VAF A; 1YJV A; 1RAB B; 2M4M A; 4MTP A; 1KC8 T; 3E8O A; 4OZ5 A; 3TVY A; 1HA1 A; 5I4M A; 3ENA A; 2CAJ A; 5A8R A; 5DZ6 A; 5IC4 B; 2GMH A; 1XMB A; 1LWE B; 1RHM B; 2BJ1 A; 5CCM A; 1NK7 A; 3BGR A; 3EX7 B; 1QLN A; 4F0K A; 2XQC A; 3GYN A; 1XNQ J; 2LCW A; 3GU0 A; 4QOT A; 1RTD B; 3OTB A; 2W7A A; 5G0R B; 3HVT B; 3CCM S; 3GIR A; 4ZJQ A; 2XNR A; 1FDA A; 1DQ8 A; 5D4N A; 2IHR 1; 4QR0 A; 3JXO A; 1WF2 A; 3UNG C; 2QFJ A; 1ZPW X; 3M6X A; 5HVF A; 2C42 A; 4UOC A; 3N6N A; 1O0P A; 5IZH A; 3GSI A; 1Q8K A; 2ASD A; 5FDL A; 3OL7 A; 4X4R A; 2JZ5 A; 2J0S D; 2ZM6 J; 1WEL A; 1N34 F; 1C1C B; 4QYR A; 2JC0 A; 4ZVQ B; 4OX9 F; 2FJD B; 2XYG B; 4S0M A; 4XK8 C; 1R8H A; 2ATC B; 1HNX J; 1J27 A; 3MMB B; 3PTW A; 1ZTT A; 5KT7 A; 2H4W B; 4KY3 A; 1SJ1 A; 1VC5 A; 2CG4 A; 2J7U A; 2RRB A; 4UOF A; 2QLX A; 4YDX A; 3MR6 A; 3NL0 A; 2HHV A; 2OML A; 1YSJ A; 2OKQ A; 3RB6 A; 4CLP A; 2FZG B; 2LQ9 A; 3SQO P; 2C2Z B; 5DO2 A; 5J1E B; 5IS2 A; 1U6F A; 1JLE A; 4EUV A; 2ZH8 A; 4C8Z A; 2XHC A; 4YOE A; 1QM9 A; 2NSB A; 3SDE B; 1VRU A; 4N47 A; 3UR3 C; 1RSC A; 2YH1 A; 1A0O B; 4M5D A; 4C8O A; 3QJJ A; 1G4C A; 1ZAV A; 4O44 B; 2XSJ A; 2ZFH A; 4IG0 A; 3M8W A; 2V67 A; 2VG5 A; 3HM9 A; 5KFM A; 1HPZ B; 2Y1J A; 5GAG U; 1OO0 B; 2D7S A; 4USI A; 2RKI B; 1KQF B; 3PM9 A; 4OI0 A; 2YBV A; 4KPC A; 1CC8 A; 1KD1 T; 2RHQ B; 3TZW A; 1NBE B; 2AYE A; 3BQ0 A; 1YJU A; 1UWA A; 3V6J A; 2B9W A; 2CUY A; 1JLQ B; 2GIR A; 1NSA A; 2ZJP Q; 1NK6 A; 2KG1 A; 3D6H B; 1S77 D; 5KFO A; 2XB2 D; 4U7U D; 3FQK A; 4ZVF A; 1TKX A; 3K2Y A; 2ZEJ A; 4PXE A; 1VQN S; 4CLU A; 5I42 A; 3QRR A; 1GK8 A; 3CCR S; 1WG5 A; 2XUL A; 4EK2 A; 4YFU A; 2QX0 A; 1UA1 A; 4QWE A; 6AT1 B; 3JB9 k; 1UEU A; 3I0R B; 3BO4 A; 4QYZ J; 2CQI A; 2CQD A; 1M5H A; 1XMQ F; 2ROP A; 3LAL A; 3CD7 A; 1JLC A; 4EYH B; 2DHH A; 3EXY A; 2A3J A; 2V0N A; 2HLT A; 3MPU B; 2DNN A; 2FJE B; 3GB0 A; 3KG4 A; 2DO0 A; 3AXK A; 4HEA 9; 5HP1 B; 2EFO A; 1XC9 A; 5T7L B; 4O4G A; 3W9J A; 4LFC J; 1FES A; 3PW5 A; 2VA3 A; 2QTW A; 1IKW A; 1NK9 A; 4YB5 A; 5K14 B; 2HZV A; 3N4W A; 2XTJ P; 1DQA A; 2W2M P; 1JJ2 R; 4PCQ A; 4Q43 A; 1FK9 B; 2C3P A; 2W9B B; 4RNO A; 2KYX A; 4EYI B; 3TA1 A; 4KB7 A; 4I64 A; 2CQ4 A; 3G87 A; 4JV5 F; 1J5E F; 2UU9 J; 4E98 A; 4G65 A; 4ZVT B; 3PJW A; 1DTQ B; 4ERD A; 4DR1 J; 2L48 A; 1LFP A; 2CZV C; 3BV8 A; 5CYQ B; 1U4B A; 2GJF A; 3A8J A; 4N8O A; 1WC4 A; 3WBZ A; 3T5K A; 4PWW A; 5J2M B; 2PD1 A; 4ZPA A; 3GCX P; 2IPO B; 1AYE A; 1UFK A; 4ECU A; 2JFK A; 4JI3 J; 2B0G A; 3BN7 A; 2K7J A; 3MR7 A; 3UR0 A; 4ALZ A; 4DU8 A; 3SV3 A; 1B4S A; 1RT1 A; 3NWR A; 4ZVP B; 4DV5 F; 3N79 A; 2M70 A; 1IM4 A; 1V3Z A; 3BSN A; 3BPD A; 4N5S A; 2J9D A; 5KFA A; 2ZH9 A; 1X9W A; 1ZM9 A; 3IGV A; 4Q8F A; 3V81 B; 2FHJ A; 3EZO A; 4F04 B; 1EET B; 5A8W A; 3ICL A; 4UQT A; 3CT9 A; 3M4X A; 2FVS A; 2QA4 S; 3HFZ B; 1DRZ A; 1A9N B; 2VFU A; 3GR1 A; 1HR0 J; 4KO0 B; 1GXT A; 3HLU A; 1RBA A; 1RZM A; 4OV1 A; 2HHH J; 3DLK B; 4MK8 A; 2MQP A; 5DQI A; 2CQB A; 3DRS B; 4WTO B; 4X4P A; 2Z2L A; 5IFM A; 2UUA F; 3HHL D; 3CJ2 A; 2K1R B; 3RJM B; 1CJK A; 2EFP A; 1U2R A; 3AT1 B; 3RAX A; 3TUJ C; 3BR8 A; 3T1Y F; 3AY0 A; 2FLL A; 3WHI A; 4YQW A; 3FEX B; 2CJ9 A; 2HNZ A; 4AL5 A; 1ACM B; 3O44 A; 2G2Z A; 4LT6 A; 5DG7 A; 3GON A; 3M6W A; 3R7N B; 2MKI A; 3NS5 A; 1PJ7 A; 3MM9 B; 3CDW A; 1BMQ B; 2MZR A; 1TVR B; 3O3L A; 2W4P A; 1RUS A; 2DGO A; 2PII A; 4HHU A; 3KHH A; 4F3Q A; 5ETT A; 3QYY A; 3TUI C; 1QAJ A; 3C16 A; 3JTN A; 3FSY A; 1U8S A; 2D3U A; 1SV5 B; 4I2P B; 2AQ4 A; 2YQ1 A; 3QIP B; 2IMW P; 2ZH2 A; 4DX6 A; 3SXL A; 1YX2 A; 3ETM A; 4LF5 J; 1URR A; 3UD4 P; 1JQG A; 1UEK A; 4EMD A; 2UXD J; 2GHV C; 3MR3 A; 3K89 A; 1UJ5 A; 4KKO B; 1EQ0 A; 1VBX A; 4J9S A; 4DSK A; 2ZOG A; 1XEZ A; 4M5I A; 3NAI A; 1XTZ A; 4OZ1 A; 4KC5 A; 2QO3 A; 1HWJ A; 4M5M A; 4U8V A; 5CAB A; 3P45 B; 1GMV A; 2ZH7 A; 2A0F B; 2LU1 A; 4LF8 J; 1EAY C; 3V4I A; 3MEG B; 3DLE A; 2FD2 A; 2XI2 A; 1VCT A; 1WI6 A; 1IBM F; 2CQG A; 4X4S A; 1W2I A; 2Z2Y B; 2HQC A; 4RX6 A; 2HG4 A; 2XMJ A; 4F3M A; 4L72 B; 2B56 A; 1U8W A; 3EZ5 A; 2CFX A; 4I69 A; 3J7A 1; 2HQ3 A; 4OJH A; 1FJ7 A; 4EFA C; 1UL3 A; 4HH0 A; 2Y1L B; 5D15 A; 5EX3 A; 4DL6 A; 1ZOT A; 1DLO A; 4NX9 A; 4ELV A; 5KFI A; 1IKV B; 7AT1 B; 1PYT A; 1Y5I B; 3IR7 B; 4CLS A; 5KFT A; 3OFG A; 1SH3 A; 3RYL A; 4ILM A; 5C2G A; 1R7I A; 1TMJ A; 7FD1 A; 2XBP A; 4UY8 T; 2GAG C; 2MKC A; 1S1V B; 1HNV B; 4FF3 A; 1TV6 A; 1B7Y B; 3T1H J; 1PC4 A; 5ETK A; 2EC2 A; 4DV1 J; 4KJI A; 4C4W A; 2LU2 A; 3MEC B; 5E5N A; 1HBM B; 2KJV A; 1IVZ A; 4A8W A; 3LGN A; 3LP0 B; 2W4C A; 5K8P A; 5HBM B; 4NL5 A; 4F0M A; 2EKN A; 4U9R A; 2APO A; 5KFK A; 3R2D J; 4IG3 B; 1PBA A; 3N01 A; 2YKM A; 3I55 S; 2R7R A; 1KKH A; 2VBX A; 5A8K B; 3ISN C; 1MMN A; 5EN1 A; 4UOH A; 2FHJ D; 1T03 A; 2EFG A; 3H5S A; 5I3U A; 2RU3 A; 1HWU A; 1AXQ A; 3RBX A; 3J7A N; 4P9S A; 1N36 J; 4V19 X; 4LRE A; 2F40 A; 5GAE U; 5HVH A; 4TLR A; 2UUB J; 1O5J A; 5KFQ A; 4LF4 F; 4B9L A; 2G9O A; 4LF1 A; 2Z56 B; 1D09 B; 2YWF A; 3SFU A; 5D3G B; 3SIP B; 5KFC A; 1MN7 A; 5KT6 A; 3SI8 A; 1FT8 A; 1QSS A; 4WTY A; 4OIX A; 1C0U B; 3UE2 A; 3RTV A; 2CNN B; 2XG8 A; 1F5C A; 1PIE A; 2MHN A; 1ZET A; 1FRJ A; 5CYJ A; 1UEV A; 2K2P A; 1IQT A; 1LWX A; 1QUP A; 1KTQ A; 3M6U A; 2H51 B; 4UT4 A; 5JVH Q; 3OTE A; 5BYR A; 5KFU A; 2FYX A; 3IFE A; 3DDI A; 5B0B A; 1RJJ A; 1FXD A; 5AT1 B; 1FFS B; 1V3R A; 2B51 A; 3BJY A; 4Y2I A; 2XWY A; 1M5S A; 4RUB A; 1MMD A; 2D3O R; 4A8O A; 3OFF A; 3CO0 P; 2J5A A; 1XR6 A; 2DK2 A; 2BE2 A; 3L7O A; 2KM8 C; 1Q8B A; 1FDN A; 3BM7 A; 4WFA Q; 1JKH B; 3KK3 B; 1N4L A; 1TL1 B; 2IM0 A; 2MGZ A; 1UA0 A; 4IR1 A; 2QL9 B; 1IBL J; 4ZIW A; 4R0E A; 4M95 A; 2IRX A; 1UW4 A; 3TW0 A; 2X1F A; 5B08 A; 2V6A A; 2GCF A; 3I5A A; 4TU8 A; 1JJH A; 3C19 A; 1TUV A; 2QV6 A; 4Q44 A; 3PJ9 A; 4NWB A; 2Z2M A; 1VLO A; 3DXB A; 4HDG A; 3JSM A; 2QMX A; 1IWA A; 3POT B; 2B4V A; 4IFY B; 2XMM A; 2IRY A; 4TY8 A; 2RAQ A; 3H2U B; 4K5R A; 2AEF A; 3R7S B; 3MHY A; 4K4S A; 1HWK A; 1Y9O A; 1WOS A; 1CJT A; 1RYR A; 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3AQP A; 1K1S A; 1YJR A; 2OFH X; 4Z37 A; 5J2N A; 1RBL A; 5EWE A; 1RTD A; 1NH7 A; 1VQP S; 2CVE A; 3HVT A; 3V2U C; 3R5C A; 2GQ2 A; 4F02 A; 5L1J A; 4DQS A; 3D0I E; 1DAR A; 3R5B A; 2JJ4 D; 2E7W A; 3JYT B; 4NCG A; 2P2C B; 1WF1 A; 4X64 J; 4YP3 A; 1YRT A; 1JLF B; 2R8J A; 4LF2 A; 3L9Z A; 2WSF C; 2I5J B; 3GG0 A; 1U0H B; 1NSK L; 2B8Q A; 2RF2 B; 2KHC A; 3CIM A; 3PAC A; 2PDA A; 4J9R A; 3D54 A; 3IRX A; 1C1C A; 3QT5 A; 2V4Q A; 2N7Y A; 4LF7 J; 2UVW A; 4IOC Q; 4NRU A; 2B7C B; 3UDV A; 1WC6 A; 1SH2 A; 1XR5 A; 1UVN A; 3DOM A; 3M8R A; 2CVI A; 2HUR A; 1J2V A; 2J0X A; 2ZNZ A; 1OY9 A; 2IJN A; 1QUV A; 3HK2 A; 4JI2 F; 3OVB A; 5J2Q B; 4PZV A; 1X60 A; 4DR7 J; 4TYB A; 5D4P A; 4DR5 J; 3LP2 A; 3BBB A; 2UUW A; 4YME A; 3KXD A; 4P2S A; 2WW8 A; 1HQU B; 5D77 A; 4DZ6 A; 5J1E A; 2PI5 A; 2VFS A; 4A4J A; 4KR0 B; 3EWG A; 1VJQ A; 2MZT A; 1FE4 A; 1FWK A; 4JOU A; 3UCU P; 2I9S A; 4NZ7 A; 2ZJQ Q; 3AAW B; 2DNL A; 2VDH A; 1M5K C; 2N4C A; 2QIF A; 3RAM A; 3CJK B; 4O44 A; 3C66 A; 2DD8 S; 1YKW A; 1M1K T; 4K4U A; 1X5O A; 3Q22 A; 4XAK A; 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