1ELJA

The crystal structure of liganded maltodextrin-binding protein from pyrococcus furiosus
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
380
structure length
379
Chain Sequence
MKIEEGKVVIWHAMQPNELEVFQSLAEEYMALPEVEIVFEQKPNLEDALKAAIPTGQGPDLFIWAHDWIGKFAEAGLLEPIDEYVTEDLLNEFAPMAQDAMQYKGHYYALPFAAETVAIIYNKEMVSEPPKTFDEMKAIMEKYYDPANEKYGIAWPINAYFISAIAQAFGGYYFDDKTEQPGLDKPETIEGFKFFFTEIWPYMAPTGDYNTQQSIFLEGRAPMMVNGPWSINDVKKAGINFGVVPLPPIIKDGKEYWPRPYGGVKLIYFAAGIKNKDAAWKFAKWLTTSEESIKTLALELGYIPVLTKVLDDPEIKNDPVIYGFGQAVQHAYLMPKSPKMSAVWGGVDGAINEILQDPQNADIEGILKKYQQEILNNMQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for oligosaccharide recognition by Pyrococcus furiosus maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Pyrococcus furiosus
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 133
structure length 379
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1eljA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1eljA02
5TP9A 1B5IA 1LLSA 3FV1A 3PD8A 4U23A 1M5FA 2I0BA 1B9JA 2DE4A 3T66A 3OOAA 3K6UA 3O28A 4YKKA 2O68A 3U72A 2QMWA 3MPKA 1Y4TA 3TDJA 3TTNA 5KZTA 3S9EA 4F19A 4U1OA 4BDMA 3LSLA 2VD2A 5L8DA 1I6AA 1MXVA 3RLFE 4PFUA 3RGYA 3M3LA 3KSXA 1B32A 1NNKA 3RN8A 4H5GA 4XKRA 1Y3PA 5JK4A 3FGSA 4I8CA 3S9NC 1QW0A 4POWA 3O6IA 1DMBA 4JXIA 1LCFA 4R9FA 3TTLA 4EXKA 1P99A 4G77A 3IL1B 3N6UA 3O97A 2DOJA 4OFLA 5I2NA 2X7PA 2Q2CA 3A09A 3MJNA 4DXCA 5DVJA 1Q35A 1A99A 3TODA 2HCAA 3UN6A 1WDNA 4F22A 1M5CA 1JW1A 4G2ZA 1MXZA 1B58A 4LZ8A 2Z22A 3MUQA 3H6VA 3TFLA 1EH3A 4UA8A 1OVTA 1OVBA 1MQHA 4DLDA 1Y3QA 2B3FA 3USDA 4PE5B 2DWHA 2D5WA 3WAFA 1N76A 1LSTA 3VFJA 1URSA 1HSLA 1GGGA 4QFKA 3H06B 1Y20A 1NNFA 3EN3A 3O9PA 5FHMA 3FD3A 3EHSA 1B7UA 3TAJA 2QJEA 3O6GA 5H8NA 2I3WA 3LR1A 2FNCA 1GVCA 2VHAA 3IOVA 1MG1A 4EXLA 2PYYA 1B7ZA 3VDFA 4KFQA 3P7IA 2DWAA 4PFTA 2F78A 4HW8A 3KOSA 4KCCA 3SEWA 3GZGA 4P0IA 3SERA 4R6KA 2RF1A 3R26A 4NTLA 2NWJA 3RT8A 3PPPA 4DZ1A 3PMVA 1QJMA 1TFAA 1B1XA 3QSLA 5H8QB 3H3GA 2OWTA 4R73A 2QS2A 3LC8A 5TP9B 4OHNA 1PDAA 3JYRA 3IR1A 3OEKA 2PX1A 1BTJA 4FATA 4O3AA 4YU0A 3TCFA 1IEJA 3PU5A 4KQPA 3U94A 4XKQA 1B51A 3VVEA 5I57A 4IO3A 5CMKA 4F1UA 1FTMA 4P11A 2DVZA 3O2AA 2HAUA 3PPQA 4OQOA 1MPDA 4ESWA 3FVKA 1QKBA 3OEMA 2QS4A 3JV9A 3U1OA 3OENA 1FTLA 2R6GE 5TPAA 4QSDA 4MFIA 1L5TA 3HPIA 1A54A 5HBCA 3VV5A 3H03A 3V89B 1XVXA 4TQUQ 1LAGE 4BDNA 5ICQA 5KCJA 1TT1A 3S9MC 1TXFA 4BDRA 4QSCA 3TQLA 5I2NB 2M8CA 1IXCA 1MM7A 4EF1A 1PBQA 1GTKA 1OLCA 2A5TA 2I6EA 3FJGA 4PFYA 4F1VA 4Q30B 2XD2A 4U21A 1QUIA 2ALUA 3FATA 3MAMA 1WVJA 2RKMA 4OERA 3MZ9A 4IGRA 3CG1A 4YB5A 4YKPA 1SW2A 2G29A 1NFTA 3Q26A 2DWIA 1FQAA 2Y84A 3PUYE 1LAFE 3K1NA 5J1DA 3GBBA 1FQCA 1BIYA 2UYEA 4POXA 1FQEA 2QSXA 4H5FA 5DYHA 1H43A 2F97A 3Q27A 4YAHX 2Q8JA 1URDA 3RPWA 3AXFA 3PMXA 3FJ7A 3G3GA 2G93A 1JW4A 3CI8A 5AA1A 4M4GA 4ZZEA 1NL5A 4R2BA 4I62A 4E0XA 5H8NB 4F2OA 3L6HA 4ONYA 3K6XA 2RCBA 1QUJA 4LUBA 3K1MA 4JSDA 4MH5A 1B05A 3ZKLA 4GOTA 4FJPA 1URGA 4ZEIA 1I69A 4ECFA 2QMXA 4WEPA 4WEDA 3UORA 2GH9A 4NF8B 1BKAA 5AA4A 3E4RA 3HSTA 1MRPA 3OO6A 3TMGA 2I49A 1O64A 4AB5A 3C31A 5CC2A 4IO5A 1OIBA 2HAVA 2Y7PA 4IO7A 1MS7A 3LSXA 4ZEKA 4HS7A 2NVUB 2UYFA 2ZXTA 2UVJA 1B4HA 3KZGA 5I57B 4U4XA 4KI0E 2O69A 2HEUA 2AL4A 4FIMA 3OO7A 4R6HA 3ILTB 5F1QA 1DTGA 4JDFA 3RUMA 4WKMA 3T9XB 1CB6A 5TPAB 2AL5A 2XXHA 1H3DA 4F3GA 5CI5A 4N07A 1LBCA 1B6HA 4X9TA 5KCJB 4EUOA 4THIA 1SI0A 2H4IA 4OESA 4OFJA 1FCKA 4MBPA 5CMBA 3SEYA 3OO8A 1PEBA 1XC1A 5I2KA 4IO2A 5F7VA 4WXJA 2DE2A 1MQDA 1JETA 4ELQA 3FUZA 3OELA 2OK2A 4EQBA 3OO9A 2GHBA 1LAXA 1S9TA 3IAZA 4G68A 4RPNA 1P1WA 4YB6A 1LAHE 2DWJA 1GV8A 1MH3A 2DYXA 3EHTA 1XHYA 2QL3A 4H1XA 1N04A 1PBPA 4OVJA 5AA3A 3VLUA 2ONKE 5LOMA 4UACA 2YLNA 3TQWA 3G3KA 3PMWA 1SW1A 4OXVA 1WODA 1UTHA 3TKDA 4RK2A 2YPNA 1B3LA 1MDP1 4PP0A 5IAIA 2HFBA 4ZS9A 4JWYA 4Q0CA 4FORA 1MQIA 1AH5A 1QUKA 4GWOA 2O6AA 2H5YA 1SDXA 1AIVA 1ELJA 2VOZA 4DE8A 3MPLA 2OLBA 5AA4B 1FTKA 2UVGA 3CFXA 4G8HA 5DEXA 3W15C 4OZ9A 1AL3A 1B5HA 4F31B 4N6PA 3D4CA 3PUZE 1MPCA 4YICA 2F34A 4KPTA 1B7HA 2X26A 1OQHA 3IOUA 1JNFA 3T93B 1D9YA 3Q29A 3KJTA 1SW4A 4EDPA 2XD3A 2OJTA 2DS9A 4NMYA 5ELVA 4H6DA 1US4A 5B7DA 3JZJA 3IO6A 4BDQA 2ZYNA 4E0WA 4F29A 4JB7A 2D3IA 3F11A 3CRBA 1IXGA 3SDFA 3CSBA 5FTIA 1FQFA 2A5SA 1VSOA 2ZYOA 1IXIA 1PB7A 2IEEA 1KWHA 3CIJA 2I3VA 2Z8DA 1N3WA 3B6WA 4QFPA 5DVIA 3V8XB 1IXHA 1SVXB 3R7XA 3S2VA 4NF4A 2HQ0A 4ZZAA 2UVHA 4RYAA 3LSWA 1VE4A 5I58A 4Z7EA 5I2KB 3H6UA 4KYEA 3FXUA 3H6TA 1DPPA 1IQ7A 3FVOA 1MQJA 3IJOB 2GRVA 3K2DA 3MP8A 1LFGA 1SQYA 1UQWA 4NF8A 3K02A 1N84A 1NNTA 4AQ4A 4QHQA 4ZEBA 4F3SA 4G68B 1B0LA 1VR5A 1JQFA 4Q5TA 2Z23A 1QULA 1M5DA 2V84A 4QF9A 3TCGA 4ZE8A 5AA2A 3CR9A 2XXRA 2ESNA 4DIGA 2I4BA 4KD5A 3KGCA 1QVSA 1MH4A 1NMUA 3Q25A 1ZJLA 5EHSA 4JBZA 2H99A 1UTHB 5H8FA 1H76A 3VXBA 3BFTA 1QKAA 4F2QA 1P1UA 2DXRA 3O6HA 1XVYA 1ZMGA 1N0TA 5ICTA 2CZLA 4GFRA 4LONB 4IO4A 4KHZE 4HCYA 3T9UA 5CMMA 4N13A 1BLFA 4GXAA 5DT6A 3GBAA 3EF7A 2AYSA 1ZBMA 5DEXB 2Q2AA 1A7LA 5ITPA 5BUUA 2F36A 3SEUA 4R6YA 5K2XA 4ELPA 2F7BA 5CM6A 5EYFA 3IOTA 3OD7A 4BDLA 1MXUA 2BJJX 5JTYB 1FTJA 4OMBA 1I6BA 1N7XA 3MZ1A 3DLNA 3M3KA 1FTOA 4XKPA 3KG2A 2ZYMA 2XX9A 2E0SA 1SW5A 3U92A 3PV0E 1N7WA 3K4UA 1MDQA 3KSJA 1ZLQA 3K6WA 3U93A 3FVGA 1EU8A 2DP8A 3QAXA 3MC2A 2XXTA 2H25A 3B6TA 3VE1B 3V83A 1UTBA 1R6ZA 2D21A 3TPAA 4NF4B 4NE4A 2W7YA 1Y4CA 4NF6B 1LFIA 3K0VA 1R9QA 4MLQA 3MP1A 2H9BA 3I6VA 5I58B 1AOVA 3PUVE 4X48A 1A55A 3VVFA 1B2HA 3K00A 3LSFB 3T9VA 1FQDA 4PFWA 4KCDA 5H8HA 1UIVA 4F3PA 4ND9A 1B3FA 1PB9A 1II5A 4I1DA 4LQ2A 4FAJA 1B1HA 2VGQA 3B7DA 4LZ7A 4OYVA 3S4UA 3BBRA 2PT1A 4H0WA 4GXSB 2PT2A 1D9VA 2QS1A 3KOTA 3HV1A 1NKXA 2B3BA 5AA2B 1DOTA 2ZNUA 3DP4A 3MVZA 4R9GA 1LGBC 3A3UA 4ISUA 4EF2A 3QUJA 1IITA 1XT8A 5H8FB 5FTHA 4K3FA 1B4ZA 1JVYA 5DVFA 1LCTA 3LUYA 1GR2A 4DCYA 5I56A 4ELRA 4H8JA 3W9VA 1B52A 3BFUA 2P2AA 2I4CA 3EHUA 4LVQA 2E1SA 4M1VA 1T0KA 1CE2A 2NOOA 2Z8EA 2R9JA 1RYXA 4ESXA 5M2VA 1MXWA 5I59A 3PUWE 3TTMA 4C1UA 1ANFA 3I5OA 4U1ZA 4R75A 2QPQA 3OXNA 3EQ1A 3MP6A 4GL0A 1XOCA 4ZDMA 4LZ5A 4F3BA 3ZSFA 1B40A 4I9DA 3RT6B 3C4MA 3SETA 4RXLA 4IO6A 5K2YA 3D4GA 5BWJA 4OETA 3G3JA 2ZYKA 3MWBA 1B3GA 3PGFA 4AB6A 3SEXA 2YJPA 3TUSA 3RY3A 4O3CA 2CMOA 5FHNA 1H44A 5A5XB 3M8UA 3TCHA 3SKPA 1OQGA 3DP8A 3C34A 3KN3A 3IX1A 1B3EA 3ECRA 3R6UA 4RY1A 2O7UA 1UTBB 4LATA 4KR5A 2O84X 4KYDA 4RJZA 2DVCA 3UIFA 3PUXE 3KBRA 1POTA 4FECA 4YB7A 1P1NA 2RINA 1A40A 5CRYA 3OSQA 3V5AA 1B5JA 3UGWA 4YMBA 3E13X 5H8HB 1EZ9A 1DSNA 4F39A 3CSGA 3MBPA 2Q89A 3OSRA 3C33A 4C0RA 2F6PA 2QRYA 4GQOA 5L9MA 2AIXA 4F1YA 3C32A 4XTCQ 1YAEA 3T9HB 5I84A 4MLVA 5L9OA 4PQJA 4OEUA 1HSJA 2F8DA 4U22A 3HHGA 2GHAA 1MQGA 1PB8A 5B70A 2I58A 4LP2B 3FJMA 3TELA 1JEUA 2FYIA 1TFDA 1Y3NA 5JTYA 4G68C 4NEDA 2GFEA 3FVNA 5H8SA 4GD5A 3ILUB 1MM6A 1US5A 2X7QA 3IK6B 2H98A 4BLAA 3OMBA 3PPNA 4OTEA 2P1SA 3KN8A 3KN7A 4H65A 4NF5A 5I56B 4G8MA 5KDTA 1JW5A 3HO7A 3A3CA 2DSFA 1NH8A 2XX8A 1YPNA 5EHMA 1XS5A 4MF3A 4JSOA 4QFOA 4NF6A 3T96B 5I59B 2Q88A 3H6WA 4NWCA 2Y7KA 3G7WA 4ZE9A 3SEVA 5AA2D 3C36A 1MXYA 2IA4A 2VP1A 2F6GA 3HCQA 2XXVA 4IGTA 1F9BA 2PBWA 1YTVA 2LAOA 3N6TA 4OWDA 3H7MA 4YMAA 3N94A 4DXUA 2Q9TA 2R71A 4LA9A 4RA1A 2XXQA 5JEIA 5ISUA 4X1BA 3FXQA 1AMFA 4U2RA 1Y1ZA 2WKYA 2V93A 3UK4A 1I6QA 4IY5A 1N3XA 3QK6A 4NWDA 1ZTYA 3IB2A 1J1NA 3MVWA 4R74A 4PETA 2ONSA 4GIZA 3IB0A 1ATGA 1FW0A 2OZZA 3BKIB 5TU0A 2Y7WA 2REJA 3QYTA 3VVDA 4R72A 3FXRA 2XX7A 3U8QA 3ZS6A 1VFDA 4G8NA 4YZZA 2NUVA 2F5XA 3E3KA 3O66A 3TEPA 1D4NA 1YCJA 3MQ9A 1OLAA 1DTZA 2XXXA 1LB8A 3Q28A 3SESA 1EZPA 1A8EA 1Q1KA 3DP6A 3B6QA 1LFHA 3RNNA 4XIGQ 2UXAA 1RKMA 4QRZA 2ZMBA 3FZVA 3RTFB 3HHFA 1ZU0A 2I0CA 4ZECA 4O3BA 2HZLA 2XXUA 1MXXA 1B0HA 1M5BA 3E9XA 3CFLA 1MPBA 2HXWA 5FHOA 3G3HA 1B3HA 5IKBA 4BDOA 1S50A 3M3FA 3PPRA 4RPOA 4HTGA 2PMSA 1USYH 5CBRA 2RC8A 4EQ9A 5HM4B 1P1OA 3VXCA 1SYHA 3MW0A 2XXIA 4U4SA 3IJXB 1MY4A 3LBSA 1R9LA 4TLMB 1DPEA 3MZBA 2ZNSA 1PC3A 4L17A 5CBSA 3G3IA 4RK9A 3L6GA 1P1QA 4Q8RA 3IOWA 4DXBA 2OBGA 1Z7NE 1BP5A 3N26A 3H4ZA 2UVIA 2V25A 4FE8A 5A5XA 3K01A 3CG3A 1S7YA 4NF5B 3I3VA 3RQTA 2PVUA 1D3KA 2O1MA 5KDTB 1M5EA 1MY2A 2Y7RA 4ZEFA 1SBPA 1UIUA 1H45A 1MY1A 2O1LA 5L9SA 4TOZA 1JVXA 3GLBA 3C9HA 1EZOA 1B46A 2V3TA 2THIA 3IORA 4OENA 3S9LC 3O29A 4KYSA 4OEVA 3UA8A 5AE4A 2XXWA 3TTKA 1LB9A 2DE3A 3KJ7A 4H8IA 2KLFA 4Z0IA 4C1TA 3GXAA 4IY6A 5CMCA 3CVGA 4XXUA 3KFMA 1POY1 1RYOA 4GVOA 1Z7ME 2V3UA 3FV2A 2O7IA 4RNSA 3T22A 4ELOA 4JWXA 2RC9A 4ZEDA 4YKIA 4GL8A 1SYIA 2DXYA 3TTRA 3ZKKA 1MY0A 4DCXA 2V3QA 1NH7A 2HZKA 3VLVA 1OMPA 3KEIA 3FASA 4P0GA 1SI1A 1Y9UA 4GF8A 1O63A 2ANJA 4YKJA 2Y7IA 1USYE 4QFLA 1R1NA 3W9WA 2F7CA 3IB1A 2B65A 3C35A 1FQBA 3THIA 2O51A 2F7AA 3EPEA 2DQVA 2XXPA 3DELB 3G3FA 3WAEA 1ZKBA 2QS3A 3ONMA 3IO4A 3TYHA 4G4PA 3PD9A 2RC7A 1SD3A 4GLIA 4QSEA 2Z8FA 3HN0A 2ZNTA 3CFZA 3QXMA 4LQ5A 1LBBA 3MVYA 4IB2A 3ODBA 4F18A 5DTBA 1O7TA 4H67A 2FA7A 4JWOA 2I48A 4TLLB 2REGA 2P0SA 1VFEA 2RCAA 4FEBA 5ITOA 1HSEA 5HPQA 1NNPA 3DM0A 3QUFA 1MY3A 2A5TB 3RTWB 4XKNA 1ZIUA 4X1DA 2ONRA 4R2FA 4QFNA 4GRKA 2XHDA 3K1PA 3UP9A 3TZAA 4HCWA 3PPOA 3K6VA 3FIRA 3MVXA 2XXYA 1Y1MA 3VLWA 2VD3A 4EQ7A 1TWYA 1A8FA 2ABHA 4OFOA 4FEDA 1IZ1A 3N5LA 3QIMA 1IUDA 2OCUA 1IIWA 1JEVA 2NXOA 2OWSA 5H8QA 4DDDA 2F35A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5TP9A 1B5IA 1LLSA 4O7MA 3FV1A 3PD8A 4U23A 1M5FA 2I0BA 1B9JA 2DE4A 3T66A 3OOAA 3K6UA 3O28A 4PE3A 4YKKA 2O68A 3U72A 2QMWA 3MPKA 4N6DA 1Y4TA 4PTKA 3TDJA 3TTNA 4PF6A 5KZTA 3S9EA 1FBCA 4F19A 1G0HA 4U1OA 4BDMA 4HE1A 3LSLA 2VD2A 5L8DA 1I6AA 1MXVA 3RLFE 4PFUA 3RGYA 3M3LA 3KSXA 1B32A 1FBGA 1NNKA 3RN8A 4H5GA 4XKRA 1Y3PA 5JK4A 3FGSA 4I8CA 3S9NC 1QW0A 4GX3A 4MMPA 4POWA 3RPLB 3O6IA 1DMBA 4JXIA 1LCFA 4R9FA 3TTLA 4EXKA 1P99A 4G77A 3IL1B 3N6UA 2CEXA 3O97A 5T3JA 2DOJA 4OFLA 5I2NA 2X7PA 4NGUA 2Q2CA 3A09A 3MJNA 4DXCA 5DVJA 1Q35A 1A99A 4GWXA 3TODA 3CHGA 2HCAA 1IMCA 3UN6A 1WDNA 4F22A 1M5CA 1JW1A 4G2ZA 1MXZA 1B58A 4LZ8A 5LDZA 2Z22A 3MUQA 3H6VA 3TFLA 1LBZA 1EH3A 4UA8A 1OVTA 1OVBA 1MQHA 4GBWA 4DLDA 1Y3QA 2B3FA 4JVIA 4PE5B 3USDA 2DWHA 2D5WA 3WAFA 1N76A 1LSTA 3VFJA 4MEVA 1URSA 4N4UA 5EYHA 1HSLA 1GGGA 4QFKA 1RDZA 1NV3A 3H06B 5A5LA 1Y20A 1NNFA 3EN3A 3O9PA 5FHMA 1YZ0A 4MAGA 3FD3A 3EHSA 1B7UA 3TAJA 3KC1A 2QJEA 1FBDA 3O6GA 5H8NA 2I3WA 3LR1A 2FNCA 4FBPA 1GVCA 2VHAA 4MNCA 3IOVA 1MG1A 4EXLA 4X04A 2PYYA 1NV2A 1B7ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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