1EP3 | Genus

Total Genus 99

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	99
sequence length	311
structure length	311
Chain Sequence	MTENNRLSVKLPGLDLKNPIIPASGCFGFGEEYAKYYDLNKLGSIMVKATTLHPRFGNPTPRVAETASGMLNAIGLQNPGLEVIMTEKLPWLNENFPELPIIANVAGSEEADYVAVCAKIGDAANVKAIELNISCPNVKHGGQAFGTDPEVAAALVKACKAVSKVPLYVKLSPNVTDIVPIAKAVEAAGADGLTMINTLMGVRFDLKTRQPILANITGGLSGPAIKPVALKLIHQVAQDVDIPIIGMGGVANAQDVLEMYMAGASAVAVGTANFADPFVCPKIIDKLPELMDQYRIESLESLIQEVKEGKK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Lactococcus lactis
publication title	Structure of dihydroorotate dehydrogenase B: electron transfer between two flavin groups bridged by an iron-sulphur cluster. pubmed doi rcsb
molecule keywords	DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE B (PYRD SUBUNIT)
total genus	99
structure length	311
sequence length	311
ec nomenclature	ec 1.3.1.14: Dihydroorotate dehydrogenase (NAD(+)).
pdb deposition date	2000-03-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1ep3A00

3BG3A 4XBKA 3YPIA 4O57A 5LNWA 1R30A 4FXRA 3SGUA 2A7RA 1NAL1 3HGSA 2VFGA 5EBUA 5CSSA 5U7SA 1KTNA 3Q37A 2X1SA 1VYPX 1DKWA 2E6DA 1KFCA 4RCXA 2H90A 1FDZA 3QPZA 1V7YA 1JVNA 4LT9A 4DF0A 4PA8A 3UY8A 3SR7A 1ZENA 3QRHA 4HNNA 4EWND 2DZVA 1ZFJA 3G0XA 5D2XA 1FWNA 1KFEA 2H8ZA 2QDGA 1TJPA 3O06A 3LHZA 5KITA 3S5NA 3OIXA 2RH9A 4PFMA 2ZBTA 1VCVA 2E5DA 3VCRA 3E0IA 3W7LA 1GVQA 4IMEA 2NXGA 2QUUA 4GBUA 3NYZA 3LCXA 4S2BA 5H91A 2Y7GA 1X1ZA 3C0JA 1FCBA 2RDTA 3GDRA 5HUPA 3B8DA 1UUOA 5I3JA 3TMLA 3W1MA 4M7TA 4YMZA 1G67A 2QF7A 1Z41A 4RLIA 1GJPA 1EWDA 4IGHA 3ANYA 3A22A 4TIMA 4UR8A 4BWLA 4NT0A 4O19A 4Y8FA 1OFRA 4LUIA 3TKFA 2QCHA 1H1ZA 1ZAHA 4QAIA 3P8IA 3L5MA 4PC8A 4OWGA 2UV8G 3PBYA 4K6AA 5C6MA 3MO7A 3PF3A 4TMCA 1Z42A 4UNKA 1ME9A 5DBUA 3IGSA 1W5PA 2QCLA 4W9TA 3QW4B 3LCWA 1K7FA 1F5ZA 3NQAA 4WJEA 1F6PA 5D32A 1WOBA 4FX6M 4K38A 4AAJA 3G1FA 4JTKA 3W2LA 4AHPA 1Q6OA 1D9EA 2VELA 3USBA 4BI5A 1M7OA 2JKAA 3NL5A 4JGDA 3L0NA 4D2JA 3W70A 5FF0A 4YCPA 1H7NA 4JTJA 3W83A 3EXRA 2CZFA 3NVTA 1OFOA 4QNEA 3T7VA 4O50A 4O13A 1ICQA 4NZJA 4JNMA 1L9WA 3TNOA 2ISWA 1QO5A 1KM0A 3Q2DA 3UQNA 1WV2A 3L5AA 3N19B 4S1FA 1XDLA 1XFBA 3ATZA 3WK3A 3DAQA 2GQ8A 2QKFA 1V5XA 2EHHA 4FNTA 2P1FA 1ONRA 1ZHAA 2PRLA 3GX9A 2GQAA 3SECA 1DJQA 1J2WA 3B04A 1JCMP 7TIMA 3MJYA 4NX5A 4TU1A 1P1XA 1QO2A 5CZTA 1FWSA 3QH2A 4HNVA 3P67A 5AHFA 5LHFA 1WA3A 4EF9A 4MOZA 2GUUA 5EKYA 4EOUA 5HQEA 2CLIA 1L6SA 1Q6RA 1TPB1 2DORA 3G3DA 2W6RA 5G1YA 3N14A 2ISVA 1LLWA 2ZZ1A 2WNNA 1LOLA 2CZ5A 2YW3A 4JTHA 2JKEA 1I2NA 3IIZA 4IQLA 4EVZA 3P74A 5KTLA 3GVGA 1VCGA 5I3IA 5AHIA 5CPOA 1Y0EA 1LYXA 4PL1A 2DZXA 1I2QA 3ZFHA 1OF6A 1XDMA 4NJKA 3LM7A 2YFOA 4B5NA 2DP3A 2ZZ2A 3SSJA 3S1VA 3LV5A 3TIMA 2NUXA 1PS9A 5GVJA 3C2RA 2ZRZA 1HG3A 2Q3RA 4K7YA 1MEIA 3QW3A 3DU0A 4LVGA 5E0KA 4JYDA 3NXFA 3QJAA 3NOEA 5D37A 1QPRA 3SIZA 5D38A 1SQ7A 3UWZA 3W71A 1B57A 3EXTA 1TO3A 3R2GA 4MPQA 3W7DA 4ORIA 3NQ7A 3W9ZA 3HO8A 3HG3A 3NPXA 2YXGA 3W7RA 2WNQA 1ML1A 2WO5A 1JCJA 3NQDA 1BKSA 2BX7A 4OQVA 3BG5A 3PAJA 4GFSA 1EP2A 2E1DA 3P60A 2OZ0A 4A29A 4DQWA 3C2OA 3UWVA 4GUHA 2FPTA 2ZDRA 4UNLA 1DOSA 1HO4A 1RV8A 2Y7FA 1TPDA 1EEPA 4LUJA 1FCUA 3G1YA 3MYOA 4LOCA 3G1HA 4FO4A 4WY0B 1F7BA 1LDCA 1DORA 4NXKA 2LLEA 2TMDA 4RR4A 4GRSA 4K36A 4O0KA 1HUVA 1KW1A 3R8RA 3LTSA 1WYIA 3NR0A 3DFTA 1H60A 5D2WA 3EWZA 2GQ9A 2VXNA 2QCNA 5HR7A 4KWVA 5FF4A 2QCCA 1SZNA 1P5BA 2J9XA 4KFPA 4UR7A 4JY8A 4L4LA 2H3BA 1ME7A 1T8XA 1X7FA 2ZA3A 5J5DA 4QIUA 4ZMGA 1M7PA 4K37A 3W23A 3QMTA 2VFHA 2QCMA 2G95A 2RDUA 3GKAA 2CU0A 1TRDA 3FYOA 4HIBA 2C13A 3VE9A 1QCWA 3FA5A 5F2GA 1JUBA 2CLLA 3L0KA 4MYAA 3KFTA 3M7WA 3W88A 2E77A 3DXIA 1AG1O 4UC5A 4I7UA 4NX0A 1GTHA 3G8EA 3MP5A 1F76A 5G2HA 5IBXA 5FEWA 1QNVA 1GWJA 1RVGA 3U6WA 1MSSA 3C2EA 5I3FA 2JGYA 1IXPA 2Y7DA 2YGYA 4XTDA 4JIPA 2AGKA 3LCFA 3PBUA 5DCEA 1SU5A 2V2CA 3ZR4A 3FFSA 1EWEA 3W86A 2QR6A 3NNTA 1XM3A 4KWWA 3G22A 2C3ZA 1QOPA 2Q8LA 1FWRA 3P80A 4JTEA 3BG9A 1G4PA 3C56A 3INPA 5AN7A 4O10A 3UPWA 3LBCA 1VQTA 3UD6A 1KFLA 2WV8A 3IGXA 3P61A 1QFEA 1N8FA 3V75A 4IPIA 1JULA 2B7PA 4CNNA 3L66A 4MY9A 4QISA 5AB3A 4ZQPA 5TQLA 3QPYA 5CKSA 2ZFAA 1K8XA 2OMAA 2VFDA 3STFA 1SO5A 2J88A 1A5CA 4GUIA 2OT0A 1O60A 4YLWA 4CCEA 1S5TA 4UFIA 2JK2A 3PUOA 2ZCGA 4E2DA 3FEMA 1VCFA 2BSLA 5K9XA 1TTIA 2X2GA 3EWXA 3C61A 3H54A 2HTMA 3PBVA 4ADTA 1G6CA 3S5YA 1TIMA 2FDSA 3P5YA 6TIMA 1PIIA 1TQXA 4O14A 1W54A 1PCWA 3UNDA 1EPXA 1SUXA 4FB7A 5LNRA 3AO0A 2CFFA 1SZEA 4ZQMA 3W1AA 3HGOA 1I8JA 1VR6A 4A3UA 2X1UA 3TFXA 1ME8A 4WD0A 5CZ0A 5D2TA 3W7QA 4GUGA 1O5XA 3H53A 3BGJA 3BLFA 3UPBA 1LCOA 1QWGA 4IJBA 5F2LA 5BMWA 3FIGA 3OEXA 3LLDA 3A23A 5LNVA 1LBMA 2Y61A 4OE7A 4MZ8A 2GVJA 1ZAJA 2F84A 1B4KA 5CPLA 3PWAA 1UUMA 1TV8A 3TAKA 3E12A 3W2JA 2J24A 5LZLA 1XI3A 4LTSA 4CQ9A 3IV3A 5MHBA 4JTSA 1H7RA 4HT3A 5F2IA 4BI7A 4ALDA 2TRSA 4XQ6A 5AFDA 2B0MA 5DELA 3T44A 5LSMA 1ICPA 1GG0A 3ZWSA 5A8GA 4A21A 4GXMA 2WOQA 5HNRA 4FNUA 1TPC1 2FTPA 3TUUA 3IVUA 3TA6A 3QEZA 3M5ZA 1W5QA 2B4GA 5FF2A 3LBMA 4UTHA 2V0TA 3CB8A 3S1XA 3GNNA 4GJ1A 3W7OA 3LCGA 2IQTA 1H51A 1M5WA 1G4SA 4LS0A 3MMTA 3TH6A 5AC7A 2I9EA 1JUEA 1QMLA 5DY3A 1H63A 3HG4A 1RR2A 4S2CA 1FCVA 3LOTA 3QQ0A 4BWLC 4ZQOA 2YW4A 2A6NA 4JTUA 3EWBX 4PH6A 3GAYA 2E6AA 2NV2A 2ZZ3A 2CZDA 2NZLA 3I68A 3HB9A 3M43A 1JRCA 3W1NA 3OG3A 1PHWA 3KX6A 1WAUA 1PE1A 1PV8A 2A2IA 3GIYA 3C2FA 3W73A 1MO0A 3CIWA 3L68A 1AK5A 2ZZ5A 2G96A 1U83A 3JRKA 1LTDA 3G1XA 3EWYA 1G7UA 3HGRA 4RZ6A 3M5VA 1GPWA 2TSYA 1BWLA 1LOQA 2C18A 1IF2A 4AWTA 2PE4A 4GUJA 3W3OA 1ZALA 3L5LA 2CLHA 5D2VA 3H55A 1KM5A 3E9AA 1ICSA 4GWEA 5D04C 3I7QA 3UZJA 1QR7A 2X30A 5DCDA 4IXHA 3MUXA 2P10A 4ORMA 2WSYA 3BGGA 1OX5A 4WOQA 1QPNA 1K7EA 3RFAA 2ZRYA 3P8JA 5C55A 3G1VA 3HPSA 2CLOA 2W0UA 1VHCA 4IX0A 3HQ1A 3NQMA 3PUEA 3QM3A 3KVKA 1FCQA 4NUWA 3GR8A 3LB0A 1ZNNA 3M41A 3B0PA 4UFLA 1FXQA 4UFJA 3CWNA 2B7OA 3L21A 4ZQCA 1T96A 1W56A 4O1CA 3SI9A 3TSBA 3MYPA 5K9CA 3S0CA 5BW6A 2ZRWA 2BXVA 1OABA 2A0NA 4JIQA 3W22A 1YTKA 1R46A 1TPH1 1JJKA 2R14A 1VZWA 1M6JA 2OX1A 1LOSA 3HF3A 5C54A 1UBSA 2FLIA 4GUFA 3LCHA 6ALDA 3B0VC 4JYEA 1XBXA 2VEIA 4KFNA 1JQVA 3TQKA 4DELA 3KVMA 2FQIA 5KMYA 1LRTA 4CNPA 1N55A 3NQ6A 4R33A 2RFGA 3THQA 4AWSA 3CEUA 3BW3A 3HOJA 3MHFA 5CGQA 3O05A 1I4NA 2J9ZA 2VC6A 3M5YA 3NQVA 5F4WA 3DKLA 3TV8A 3BLEA 2QJGA 2NV1A 2YCEA 1WDWA 3R5EA 3N3MA 1J4EA 2A1YA 3A5FA 3M47A 2EF9A 2ALDA 2H8XA 1L2UA 1EX5A 2OT1A 3LX9A 2QDHA 3TROA 3G1SA 1SZFA 1ALDA 3CTLA 3UYCA 3NPWA 4UFKA 4YWIA 1IGSA 4O1AA 3W2KA 3G24A 5I3GA 1W31A 1LZOA 2NX9A 3JS3A 4AVFA 4MKNA 5DN1A 1VLIA 5F4XA 5E93A 3STGA 4AB4A 2ZZ6A 2YZRA 1K8YA 3W7GA 4LVAA 1YXCA 2NUWA 3WFAA 5AHLA 1W3TA 1S5WA 1RD5A 1TRIA 2ZTKA 4QM1A 3TQVA 4E0CA 4Q4KA 3IIXA 4CLMA 3HMJG 4UUIA 3U8GA 2B7NA 1GYNA 4RZ4A 5CZJA 3HBLA 2BTMA 2Y62A 5K9DA 1EUAA 2X1RA 5K3VA 4Y9AA 3DKJA 3R89A 3I65A 1B4EA 1YDOA 1G69A 1DHPA 2XN0A 3GNDA 1XKYA 5FEPA 4FF7A 4Z0JA 1SW0A 3WK0A 5DXXA 3LXAA 3MP4A 3S42A 3W2MA 5AHEA 3SY5A 5AYXA 4P61A 1C9DA 1NFBA 1TPUA 3UWUA 2DJLA 4MJMA 3PSWA 3P82A 5HUOA 3I7RA 8TIMA 3THAA 1X6UA 2PRHA 1F6KA 3RNDA 5LKYA 2H3DA 2PRMA 1I2PA 4LRTA 3L9CA 1OJXA 1OK6A 1VLWA 4TR9A 2WSQA 1I45A 1L6YA 3KRUA 3QZEA 3PR2A 2G5WA 3L67A 4UMBA 4NNCA 2J6XA 2JBMA 3O6CA 3LRLA 4I9AA 3KRSA 5LNUA 2JGQA 1TCDA 4ADUA 4ZQRA 1WBJA 4DO4A 5IBXC 1KFBA 2GJNA 1T0OA 1QPOA 3OHIA 5EA9A 3W6YA 2ZTJA 2A21A 4LVBA 3QMRA 1TTPA 4Z1CA 4JS3A 3GYEA 2R91A 3BW2A 3KAOA 3DFSA 1PHQA 2NXIA 4HHPA 5FI8A 4UTKA 3UWYA 1H1YA 5KZMA 2Y6ZA 2VOMA 1KA9F 3LDVA 4NJJA 2DZSA 4G1KA 1GVRA 1FBAA 5G1TA 2VFIA 3QFEA 3VE7A 3R13A 1YPFA 1LM1A 3BK0A 1W5NA 3EWUA 4MJZA 3VFLA 2P0OA 5AC6A 3W7KA 5D33A 4HPXA 3QC3A 3ATYA 1OFEA 3NPUA 3L2IA 2ABBA 3NQGA 5L9FA 1OX4A 3DFOA 1Z44A 4A2RA 3PBWA 4FNSA 2HMCA 3C6CA 2PC4A 5SWUA 3QYQA 2HS6A 5FF3A 2YYUA 3LCIA 2Z0IA 3L0GA 1EP3A 1IIGA 1W37A 1R2TA 3CQ0A 1EB3A 4M7SA 5FESA 3ZWTA 4NVTA 4O4VA 3NG3A 2ZZ7A 3SJ3A 1H7PA 3L65A 1OX4B 3LHTA 1GG1A 3PM6A 4C1LA 2Y7EA 2WSRA 3LI1A 4BI6A 4WUIA 3LRKA 3DFNA 3BARA 4M5PA 1YDVA 4BR1A 4JR5A 1TTQA 1FY6A 4R34A 4K8EA 1VPXA 1I2RA 2H6RA 3P5ZA 2ZZ4A 1AW1A 2NWRA 4O1BA 1FDJA 1XL9A 1AL7A 1TPFA 4FX8A 4WZHA 4JDYA 4JX4A 5CPMA 2V2DA 4LVFA 3HG5A 1JR1A 1KV8A 2NX1A 4GE8A 2XN2A 3E02A 2E68A 2GVGA 3M44A 4NNAA 4O28A 1E51A 3IRDA 3PB0A 1YXDA 4UTWC 3ELFA 3BV4A 3O63A 4RZ5A 1OFAA 1OG0A 2O7SA 4YXGA 3TJXA 1KM1A 4UTJA 3FJ6A 3KXQA 3QQ1A 1AW5A 1WXJA 5D02A 2V9DA 3TC6A 3NQCA 3TMQA 3UXAA 3LHWA 1ZJIA 4JX5A 4JDBA 2R8WA 2EKCA 4AMAA 1RPXA 4JTGA 1EA0A 5EPDA 3G1DA 3GDMA 4C1KA 1OYCA 1OFPA 2WJZA 2QCEA 3B03A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1EP3A

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