1EP7A

Crystal structure of wt thioredoxin h from chlamydomonas reinhardtii
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
112
structure length
112
Chain Sequence
GGSVIVIDSKAAWDAQLAKGKEEHKPIVVDFTATWCGPCKMIAPLFETLSNDYAGKVIFLKVDVDAVAAVAEAAGITAMPTFHVYKDGVKADDLVGASQDKLKALVAKHAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Chlamydomonas reinhardtii
publication title Crystal structure of the wild-type and D30A mutant thioredoxin h of Chlamydomonas reinhardtii and implications for the catalytic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN CH1, H-TYPE
total genus 36
structure length 112
sequence length 112
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1ep7A00
2IMKA 2H01A 3M8NA 2O7KA 1B9YC 4ZXGA 4KA0A 5B6MA 4ECJA 16GSA 1HNBA 3UIWA 4TXVA 1Z9HA 3QAWA 5DALA 2H6YA 1OC3A 2WZ9A 3JCML 2VM2A 1TK8B 3ZVJD 5ELAA 1YEXA 1PKZA 1QXHA 4L5LA 1SL1B 1LBKA 5EY6A 3IRAA 1G6WA 1PGTA 1CQHA 3LJRA 2EIRA 2OBIA 2YWMA 3A2WA 4EE0A 1X9SB 14GSA 4QQ7A 1JFUA 4XCSA 3GA4A 4X0XA 3Q19A 3TJBA 5KN1A 2H1AA 4POMA 1HNCA 2H74A 2V6OA 3TB2A 4HJ2A 1T8EB 4KGIA 1ZZYA 2LEGA 5J41A 2VL2A 1U3AA 5F05A 1ABAA 4MLYA 4MZCA 2LNSA 1TU7A 3GTUB 3HJOA 2JACA 2OBKA 1AIUA 1UC7A 3ZREA 1N8JA 2HXKA 2KP2A 5H5SA 1KTEA 2GTUA 3W8JA 1O73A 2O89A 4BVXA 4XS6A 1O81A 4XRAA 2TRXA 4DVCA 2XBIA 2FWGA 2I81A 1BX9A 2L59A 3E9JB 4F0BA 3UARA 2V1MA 5KN2A 1GUMA 3M0FA 3F8UA 3IOSA 3GV1A 4D73A 4NWYA 3FK8A 3UAPA 5A4WA 4MCUA 4ZB8A 2RIIA 3IBHA 3H79A 1U6TA 3FEUA 3W8SA 3HHVA 2AJQB 2IN3A 3TOTA 2CVBA 19GSA 3DMLA 4D73B 1XWBA 2HZEA 4HZ2A 3UEMA 2AYTA 3TRXA 4TR4A 4IELA 2MYGA 2JADA 1OYJA 1K3LA 5G5FA 4IKHA 1THXA 2B7JA 5D96A 4NHWA 2GZPA 2C0GA 5HFIA 3DGQA 5L71A 1GRXA 5DCGA 1WE0A 5B6NA 5ECHB 1TP9A 5EVOA 1NHYA 3J7Yb 3LYPA 2B7KA 2B5YA 1G7EA 1XWCA 5G5EA 2GSQA 4KDYA 1K0OA 1ILOA 5E59A 1XVWA 4LL4B 5DAKA 5ENUA 1XOAA 4MMMA 2DJJA 2MZCA 1A2MA 1MD4A 3PR8A 1ERUA 2DSAA 3SWLA 3GKMA 2HNLA 1GTBA 5CYYA 4GRFA 1XWAA 2FWFA 2NVLA 4L5OA 5DAKB 1XCCA 1M9BA 5KEJA 2IL3A 1U3IA 4EVMA 1E2YA 4DSQA 20GSA 3U5RE 2XPEA 18GSA 4KH7A 2YCDA 2DJ3A 3FR6A 4EC0A 3ZZXA 4CW9A 5AIXA 5HFKA 4HEA2 2NPBA 4AJ8A 1BQ7A 3ZITA 5JWQB 4ZL7A 1Y6EA 2CV4A 4JR4A 4X1UA 5CRWA 3LQ7A 1GSUA 3FZ9A 1TOFA 3F6DA 1MDJA 5IIZA 2CAIA 4ML6A 4K7OA 3GFKA 3HY2A 4V1Ap 4E8HA 5HQPA 1SJZA 2GSRA 1EZKA 3CRUA 4MH2A 4G9HA 1YKAA 4AF2A 5INYA 3LXTA 1RK4A 3CSIA 4Q5NA 3GURA 1PX6A 1QK8A 2VLVA 2VD0A 3IC4A 4Q5FA 6GSUA 3VWXA 4KUNA 2C0EA 3H93A 3P8WA 4TVEA 2B1KA 2FGXA 2K6VA 1XVQA 3TKSA 3EURA 2LNTA 5H5QA 3L9UA 4H86A 1T1VA 2V2GA 3F0IA 3UBKA 1G0TA 17GSA 1XWGA 3EINA 3IHQA 3EMXA 5G1KA 3HA9A 1U87A 4K8MA 2KP1A 3SBCA 4ECCA 1PL2A 1SJ6A 3O3TA 4O7HA 1XW9A 4IJIA 4YQMA 2LQQA 4YAVA 1K0MA 1OC8A 2QKEA 5D9VA 1KEBA 1ZCPA 1TK5B 7GSSA 5HR2A 5G1LA 4OCEA 1BYEA 2C4JA 1A8YA 3FKFA 4OWYA 5GZZB 2HLSA 4IBPA 4F82A 1EEMA 1AAZA 2R5GA 1H75A 3RBTA 4MJEA 4LL1B 1GSQA 4TW5A 1O7UA 5ELGA 3V1WA 4AJ7A 2BJXA 10GSA 1X0RA 5IOXA 3Q74A 5ECIB 2L4QA 1V2AA 2DJ1A 3KP8A 5IMDA 1MD3A 1ZL9A 2VLUA 5DVBA 3CRTA 3LXZA 3KZQA 2C3NA 1X5CA 1VRSD 1JHBA 1V9WA 3HDCA 3MDKA 4QL9A 2LS5A 1BEDA 1UN2A 4JEDA 4IVFA 3GL3A 1BJXA 4F9ZA 3VI7A 4PUAA 3CTFA 1PSQA 4GSSA 1SK0A 2WDUA 1CQGA 1IYHA 3QAGA 1GUKA 1ERTA 1SYRA 1PX7A 1R4WA 4O92A 2YANA 4ILFA 1O8XA 1U88A 5IMVA 5COHA 1Z6MA 4I8BA 2C80A 6GSVA 3H1NA 1GH2A 4ZBBA 2AUVA 2V32A 3E0UA 2VUPA 5C04A 2LTKA 5CAXA 2PUKC 3L9VA 1A0RP 2VIMA 4WKWA 1FAAA 3ZRDA 2LJKA 4HU9A 5ECLB 1DUGA 1X9MB 4IQAA 3D4TA 3GSSA 5ECQB 1SL2B 1OKDA 1TRVA 3BCIA 4WETA 5AN1A 2DIYA 2M80A 9GSSA 2HRFA 3TDGA 11GSA 2I4AA 4HDEA 1OAZA 5ECMB 1YY7A 4XRDA 4HI7A 3GNJA 5J3RA 1I5GA 1OC9A 3UVTA 1SYXA 2OADA 3L9SA 2GZYA 2XBQA 2CAQA 3VWWA 3ZMKA 3GHAA 3D5JA 3J7Yk 5F8BA 1YZXA 1WOUA 4RQXA 3TJGA 2YJ7A 4PNGA 2LRCA 1OC9B 1SK1A 4PQHA 4K6XA 1MTCA 2BTOT 1X5DA 4G2EA 1FVJA 2KOKA 2VL3A 4ECBA 1TJDA 1SKRB 3CBUA 5A5KA 3F4RA 3HXSA 2V41A 4N30A 1J0FA 2L6DA 1YEPA 2FA8A 2R37A 2L57A 3GKXA 4I2UA 1UVZA 4POLA 2GZZA 1TRUA 4PX1A 1FW1A 5LNKe 5B7CA 5J5NA 1K3OA 3WD6A 2LQOA 3EVIA 2FNOA 2ZNMA 4MJBA 1FHEA 1ZYEA 5IMCA 4IP6A 2NDOA 2JZTA 3PH9A 5HR0A 2GT5A 1THOA 3BBYA 3FR3A 1FB6A 2B3SA 3G7JA 2CZ2A 1PN9A 4HOJA 2OE0A 2J23A 1DE2A 3DXBA 4EDZA 3FYGA 2WB9A 4F2IA 3VWUA 1Z5YE 2WS2A 1FG4A 1YF0A 5DQSA 2LKUA 4KDXA 1K0NA 1TK0B 1YKCA 3I9V2 3TKRA 4KB3A 4MPFA 1YF1A 5ABRA 1B9XC 2IPAA 3LG6A 1QQ2A 5A4UA 1VF4A 5DALB 4MJAA 1GTAA 3LEFA 2KLXA 3VPQA 3LYKA 3FZAA 3EWLA 1GNWA 1GL8A 3KMNA 1EP8A 5D93A 4OO5A 4HZ4A 1XW5A 1B4QA 2HI7A 1XW6A 2X64A 4FH8A 1WP0A 4TR0A 5FWGA 3LORA 2YWNA 2ALBA 1Z6NA 1Z3EA 4WF5A 2ON7A 3IPZA 4MPGA 4XS4A 2CX3A 3HZ8A 1PMTA 2H70A 1M2DA 1RQMA 3Q6OA 3VK9A 2J9HA 2YZHA 1A0FA 2H75A 1GSDA 4FYUA 3KTLA 1Z7RA 2F51A 2ON5A 2O8VB 3KGKA 1SU9A 4NAXA 1K0BA 3U6VA 3EE2A 2CZ3A 3FZ4A 2E0QA 4OCFA 1FOVA 2GQMA 1ZYQB 4TRXA 2F3MA 3G7IA 4EDYA 1VF1A 4WEYA 2H0GA 4E8EA 3CSJA 3M9KA 2IMDA 2M72A 1QUWA 3BD2A 3HCZA 1GTIA 1GUHA 4MA9A 3RAZA 5IMAA 2CVDA 1PL1A 2WGRA 2DMLA 1K0CA 4OD7A 2YP6A 2YPMA 1K3YA 4J57E 4J2FA 2CVKA 3APSA 3UMAA 3GYKA 2L5LA 5J4UA 3ZVJA 2HZEB 3QOUA 5CREA 1XIYA 5GSTA 4OO4A 3TJKA 5HFGA 5AIVA 2RM6A 4TR3A 3RPNA 4N10A 4RQRA 4G19A 2O85A 3CTGA 4I97A 5LD0A 1JZRA 1GP1A 4MF6A 3DVXA 5J9CA 1TI3A 4ZILA 4IGJA 3NZNA 2VLTA 4EXJA 2GGTA 1USBA 2GT6A 6GSSA 1H4OA 1UA5A 5ECOB 2L5OA 2I1UA 3WGXA 4GQCA 4JRRA 2B6MA 2JSYA 4GQFA 2VCXA 2VOCA 2YZUA 2PWJA 2OJLA 2MBTA 3EU4A 3AY8A 4F0CA 2L6CA 3APOA 4ISDA 2JL4A 4K2DA 3FW2A 1V57A 4PQIA 2EIOA 3F6FA 2R4VA 3WGEA 2GDRA 3P7XA 1FO5A 1DBYA 5HR3A 2YNXA 1V98A 3GKKA 1WPIA 1TXXA 1M2AA 2I3YA 2LUSA 4GWRA 3RDWA 3VFIA 5B8BA 3ZMLA 3KP9A 3KJYA 5IOWA 3P2AA 2HRNA 5IO2A 1F2EA 1GSFA 5IPHA 3GUSA 3ZLPA 3MNGA 3K8NA 2PBJA 1Z7PA 4AJ6A 5D8IA 4TR1A 2DIZA 2R2JA 3TRPA 2HZFA 3DVWA 4K7IA 6GSTA 4TN8A 4POKA 2QGVA 2FLSA 1S3AA 1WMJA 3ZYWA 2FWEA 1OKTA 4IN0A 4PGTA 4L0WA 2VCTA 3F4TA 1G6YA 4CDOA 2WFCA 3W6GA 3MAKA 4TR1B 5IQYA 3ZIVA 4MF7A 2OKAA 3HJMA 2R3XA 2HYXA 4WBRD 1RW1A 5KN3A 3VWVA 3IAS2 1BAYA 2C8UA 2YJHA 4KDUA 4DSSA 5FT3A 2DMMA 3M3MA 2B5EA 4PXOA 3NIVA 4GTUA 1AQXA 3NOFA 3C7MA 2NBSA 3MSZA 3UVHA 3C8EA 1HYUA 1S3DA 5G2ZA 1K0AA 3IR4A 1GSSA 3KXOA 4XHMA 2EIQA 1ON4A 1HNAA 4GSTA 2H1BA 3H8QA 3RPPA 3VURA 3D22A 1PQNA 4YQUA 2REMA 3A2VA 2N5AA 3RHBA 3GX0A 4JBBA 1TKDB 1JZDA 4MDCA 2LRNA 1PRXA 1GLPA 2CT6A 1FVKA 2YWIA 2P5QA 3A3TA 1R5PA 2F8FA 4WF4A 1B8XA 4N0ZA 1YDKA 4OFTA 1MEKA 2AAWA 3QAVA 4POBA 5JCWA 2VL2C 1XBSA 1JZWA 2MMNA 2GSTA 3DEXA 3KM6A 2HSYA 2C0DA 3QFBC 1F9MA 4HU7A 2DBCA 3ME7A 2LJAA 3UL3A 3ED3A 8GSSA 1PKWA 4BA7A 1R7HA 2K8SA 4XS1A 4Z7XA 3WT1A 1V40A 1EOGA 2H30A 1A24A 3HVSA 2F9SA 1TRWA 1A2JA 2C3TA 4ZB9A 13GSA 1GLQA 4IW9A 3N9JA 1N2AA 4YAPA 3L78A 2QC7A 4KW6A 3GL5A 3FZ5A 4BWQA 3MWHA 5DDLA 3BOAA 2AB6A 4NV5A 4NHZA 1KBNA 2FWHA 3O6TA 1AUCA 3TRQA 3EYTA 2ZUPA 2B1LA 3IV4A 1G7OA 2MMOA 3IXRA 3D4MA 2WRTA 3TGZA 1OVNA 4HS1A 3C73A 3WYWA 2H1DA 2G2QA 4V1Ag 4KCAA 1AC1A 2XPDA 4KE3A 3C71A 2K8VA 2H71A 3TKSE 2WULA 3TJFA 1YQ1A 2H0IA 5AISA 1JZOA 1EWXA 4TXOA 3KD0A 1F3BA 2IMFA 1C72A 4NPBA 1XWKA 2PN8A 5CNWA 4I6XA 5E4WA 6GSXA 4BWSA 2FCHA 3D6IA 3QD9A 3HVXA 2VO4A 3ME8A 3ZIJA 2TIRA 3ZTLA 4TXOB 4V2NA 1MDKA 1EV4A 4J56E 1EGOA 4MK3A 1O85A 2CX4A 1T7PB 1XXUA 2PU9C 4OMVA 5DQYA 1I9DA 1M9AA 5B8AA 1F37A 5EPFA 2IMIA 2O87A 2GLRA 1T4YA 5H5RA 2R6KA 2C3QA 1F6MC 4PNFA 1AXDA 4RUVA 2OE3A 2H19A 4FYBA 5C00A 4BL7A 5GAND 5IMFA 1TU8A 2N5FA 1T00A 2PGTA 1KNGA 3L4NA 4Q5RA 2XHFA 4RI7A 1T3BA 3LWAA 1TRSA 1VF3A 3UOMA 2V6KA 4ZL9A 4MF5A 3FHKA 1ST9A 4WBJA 4MH3A 2JU5A 1WWJA 3CMIA 4GF0A 5D9XA 2GQLA 5DJLA 3S9FA 1B4PA 3H4KA 4FO5A 2G0FA 2FUG2 4WR5A 3I6AA 2QSIA 4KNDA 2VCQA 2OA7A 2K18A 3FR9A 2RM5A 2H6XA 1ZGNA 1J08A 3KEBA 1Q4JA 4KCEA 2FD3A 3PINA 5GSSA 2YWOA 2H72A 2MBSA 3GX8A 1IYIA 3TKSC 4XTSA 1OE7A 4EO3A 5F0GA 2H76A 5IPGA 3ISOA 5IM9A 2A4VA 1E6BA 4TKYA 3KMOA 2OE1A 1QMVA 1T4ZA 2A2RA 1GSEA 3GTUA 2CA8A 3EC3A 2DLXA 1R5AA 1GNEA 3HYPA 3I69A 2RUEA 1LU4A 4PQ1A 1EGRA 3UJ1A 2X8GA 1K0DA 2E2GA 1F3AA 2RLIA 1HQOA 4ZB6A 2MMAA 5CRDA 1X9WB 1EP7A 4IQ1A 1NSWA 2GVPA 3DKSA 4XS4B 5ECNB 2N5BA 2X8CA 2VL9A 1GULA 1XPVA 5HR1A 4NXIA 2FHEA 2OACA 2WCIA 4HQSA 4X43A 5IMZA 1W4VA 2X99A 1XFLA 2VM1A 4NMUA 3EU3A 5A4VA 4DEJA 1S3CA 3DWVA 2YV9A 3QCPA 4NV2A 1M0UA 4O32A 3TUEA 1ERWA 4P3YB 2ZCTA 1M7TA 4QL7A 4HQZA 3FRCA 4JU5A 1GWCA 2LJRA 3IE3A 2DJ0A 3BCKA 5ID2A 4K1FA 2A2SA 2RUFA 5D9TA 4K7NA 4I5QA 2EC4A 1AQWA 4WXTA 2HT9A 3ERWA 4EUYA 5ID2B 2KHPA 1TI1A 2H1GA 2TRCP 4O5RA 3DYRA 2VCVA 4OFNA 2H8LA 1DE1A 4JE1A 4CHSA 2C0FA 5ECKB 3KH7A 3ZFLA 5F06A 1EEJA 3C1SA 2BMXA 1DSBA 3DRNA 1TDIA 2ES7A 2IWTA 5G30A 1GTUA 2E7PA 3IDVA 3CYNA 3CXGA 1X5EA 3IK9A 1SD9A 3G9BA 1YJ6A 1LJRA 4YH2A 2I9HA 1SENA 1JLVA 3F3QA 3WT2A 4K9ZA 2AV4A 3A2XA 1R26A 5D9WA 1Y25A 5IO0A 4KSMA 1URMA 2HE3A 3L0HA 4KAEA 4EF0A 3GRXA 3LGCA 3F63A 2HSHA 5FHIA 3KCMA 2CQ9A 2LV3A 5F07A 1TTZA 3OR5A 2DC5A 4IP1A 2NTOA 3DD3A 1ZMAA 1AW9A 3D0ZA 12GSA 5JCGA 3C1RA 3F4SA 6GSYA 2P5RA 3GIXA 3QFAC 2PVQA 1BG5A 3TOUA 1SD8A 4LMVA 1EV9A 2YV7A 4YQVA 4IJ3A 4OFMA 3ZL5A 4KSOA 1JLWA 4RI6A 1W89A 1PD21 2WJUA 2IIYA 3LSZA 1EOHA 3F3RA 1ML6A 4FYCA 2PMTA 3GKNA 2LSTA 3VI5A 3P90A 1NW2A 5JWOB 4BVYA 1WIKA 3IK7A 1GSYA 1XOBA 2FA4A 3GH6A 2FY6A 2H73A 2IFQA 2H0HA 2H6ZA 4EL1A 4DSSB 1OE8A 3QPMA 4MP4A 2XC2A 4EKZA 4GLTA 2K9FA 2LRTA 3EMPA 4F03A 1SL0B 4K0GA 5CRHA 3TJJA 3HD5A 1J9BA 3TKQA 5DJMA 3VLNA 4N11A 4G10A 1V58A 1QGVA 2E2MA 2IFQB 4AGSA 2JZRA 4IS0A 2X8HA 2DJKA 3KH9A 3ERGA 3Q18A 4PUFC 3BJ5A 4Q5QA 5CO3A 5CRGA 22GSA 3QR6A 2IJYA 3E3EA 3G7YA 1SK2A 3IA1A 1WRYA 5ECSA 5LCZA 5D73A 3N5OA 1NM3A 3HVVA 1O8WA 1SJIA 3GH9A 4MZWA 1B48A 5JWRB 1TW9A 1NHOA 4XIHA 3IAM2 4ECIA 4HUAA 4BPYA 4MZBA 4JZQA 2GSSA 1M99A 4LLRA 1O6JA 1VGLA 3D21A 2GQKA 3F9UA 3LFLA 4MJCA 4ML1A 2AHEA 4ZIJA 3M9JA 3FY7A 2YN1A 3R2QA 3GSTA 5DBQA 2P0GA 1VF2A 1HD2A 2PPTA 4GSNA 3I43A 1A8LA 4ZBAA 3GMFA 4WR4A 3HKRA 3CSHA 4ACSA 2L4CA 4DSRA 4ULXA 2HFDA 4ZL8A 3ZFBA 2PERA 2PVOC 4FIWA 1XZOA 4PURA 3DIEA 3KIJA 3VPTA 6GSWA 2IMEA 5J9BA 4L8EA 3UBLA 1AQVA 4TOPA 2F8AA 3PGTA 4N0VA 4ZBDA 1Q98A 5JCUA 2P31A 4GXZA 4V2LA 1MDIA 5G31A 1SKSB 5CP1A 3RHCA 1ACVA 1FB0A 2VD1A 2C1YA 3HJPA 3QDNA 5AGYA 2Z9SA 4LMWA 2MMZA 3KTBA 2M46A 1M2BA 3ERFA 5ECPB 5EL8A 1A2LA 5GAPD 3US3A 3M1GA 2KUCA 4KX4A 4HJMA 4K0NA 5ECRB 2VAFA 2VCWA 4JR6A 1ZOFA 3HZ4A 3WGDA 4L0UA 2GS3A 5DCHA 1A23A 3APQA 4I2TA 3GN3A 4MABA 3O76A 2YOIA 2DJ2A 3A5WA 1WJKA 2D2ZA 2JSZA 4IHUA 1QFNA 2JZSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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