1EP8A

Crystal structure of a mutated thioredoxin, d30a, from chlamydomonas reinhardtii
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
112
structure length
112
Chain Sequence
GGSVIVIDSKAAWDAQLAKGKEEHKPIVVAFTATWCGPCKMIAPLFETLSNDYAGKVIFLKVDVDAVAAVAEAAGITAMPTFHVYKDGVKADDLVGASQDKLKALVAKHAAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the wild-type and D30A mutant thioredoxin h of Chlamydomonas reinhardtii and implications for the catalytic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Chlamydomonas reinhardtii
molecule keywords THIOREDOXIN CH1, H-TYPE
total genus 36
structure length 112
sequence length 112
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1ep8A00
1VF1A 4I97A 3UMAA 1GUHA 1S3DA 3TRQA 4GCIA 3HVXA 4TR3A 4N10A 2PWJA 4JZQA 2X8GA 4K7NA 2HRFA 1T4ZA 5DCHA 3F3RA 3ZTLA 5KN0A 2GZPA 1JLVA 4IP6A 1GTBA 3FRCA 4L0WA 1AQWA 3UL3A 2PGTA 4KNDA 3GA4A 3TJKA 5HR3A 5KEJA 1A0FA 2RUEA 2ALBA 3KGKA 3Q19A 1YF1A 1GSUA 3UARA 2PMTA 3W8JA 5CRGA 4TXVA 4HZ2A 1UA5A 3GSTA 4JRRA 2YNXA 2L5OA 3ZITA 3ISOA 5D9VA 3E0UA 3TOUA 4HZ4A 1N2AA 4OO4A 3IDVA 5DJMA 4TKYA 1X9WB 1NW2A 3IR4A 5E4WA 2AV4A 4ZXGA 3RBTA 2A2RA 2YANA 1AQVA 5ECHB 4H86A 5GZZB 3A2XA 1PN9A 2H19A 3SWLA 5GAND 4MZBA 2K9FA 1VGLA 4RUVA 1M9AA 2A2SA 5DAKA 4OFTA 2OACA 4ISDA 3O3TA 5J9BA 2DMMA 2AJQB 2FA4A 3TGZA 2X99A 4JR4A 1SYXA 4MPFA 3TRPA 1A24A 1OC8A 1MEKA 13GSA 1Q4JA 3GUSA 2O7KA 1KEBA 5ENUA 1ERUA 1GWCA 2YPMA 4ZIJA 4Q5RA 1F9MA 1F6MC 2L5LA 4XIHA 5ELGA 3KP9A 16GSA 2CVDA 3I69A 5DCGA 2JZTA 2ZUPA 3KH9A 2WZ9A 1TK0B 1OE7A 2GVPA 1THOA 1M7TA 6GSSA 5A5KA 1G7EA 3KH7A 4XCSA 1USBA 3ZLPA 1J0FA 5DALA 3LGCA 5ECMB 4DSSB 3IC4A 1A0RP 2M72A 3BCKA 3TCOA 3VURA 8GSSA 3VWWA 4EC0A 3H1NA 4EO3A 2J9HA 3DIEA 4IQ1A 1K0BA 1NSWA 3WGXA 4NPBA 2O85A 2NBSA 4ZL7A 2P5QA 3TKSE 3HY2A 1I5GA 4ZB9A 3GH6A 4LMVA 5DBQA 3M3MA 3KIJA 20GSA 5J41A 2HE3A 3W8SA 1XWGA 1UC7A 4L8EA 3TKPA 1B8XA 3TJGA 1XVWA 2XBIA 3RPNA 3RHCA 1GUMA 1X5EA 4AF2A 3LWAA 1ZYEA 5KN3A 1F37A 2P0GA 5JCWA 1KBNA 1Z5YE 3DYRA 4KCEA 4I2UA 2H72A 4WKWA 2IMEA 1JZOA 2L57A 3HD5A 4I6XA 1ACVA 1O81A 2OE0A 3UBKA 4L5OA 4ECIA 5JCUA 1C72A 1K0MA 3L78A 1JHBA 3S9FA 5D93A 2B1KA 4KB3A 1OAZA 2EIRA 4MF7A 3F9UA 3FR3A 4RI6A 4PX1A 2B5EA 3MNGA 1TK5B 3WYWA 1T00A 1O6JA 2GTUA 3GL3A 4XS4A 2JU5A 2WJUA 2DJ2A 4RI7A 4EL1A 2EIQA 2Z9SA 2YV7A 2B5YA 4LL1B 1SJZA 1R4WA 2PVOC 1M99A 1HNAA 3ED3A 5IIZA 4G10A 1YEPA 1R7HA 2GT5A 3VWVA 1A2MA 4F0BA 1X9SB 3UEMA 3FZ5A 3I9V2 1YDKA 1B4PA 4KUNA 3Q6OA 3J7Yb 2H1GA 1V40A 3FZ4A 2YWOA 1FHEA 2KP2A 4YAPA 2RM5A 1F3AA 2LUSA 1RK4A 2WFCA 4MJAA 5EPFA 4EF0A 1U3AA 3C7MA 4XTSA 1MD4A 5ECSA 2I4AA 1S3CA 3VWUA 5JCGA 3IXRA 4HUAA 1SK0A 1GP1A 4GSTA 3SBCA 4POLA 4HQZA 2L6DA 3Q74A 4WR4A 2E2MA 1ERWA 3WGEA 5A4WA 2H6YA 1EEJA 3LSZA 3BCIA 3F6DA 3GKXA 3DD3A 2N5FA 5GAPD 2HSYA 2VIMA 2H70A 4N0VA 11GSA 2C0FA 3FR6A 3GTUA 4JE1A 2C80A 4IVFA 3L0HA 3KZQA 2QKEA 1MTCA 3CBUA 5IPHA 5ECNB 3EU4A 2PN8A 2VO4A 2LRCA 3TJFA 2VM1A 22GSA 4OD7A 3QD9A 3GKMA 2H1DA 2F51A 3U5RE 2LRNA 2H0GA 4I8BA 2R4VA 4POMA 2R2JA 1OVNA 1G6WA 3F6FA 1BJXA 1SL2B 3EMXA 3IK9A 2LNSA 1NHYA 4QQ7A 2I81A 2DIZA 3M1GA 3TOTA 2CQ9A 2JSYA 3DEXA 3WD6A 2YWNA 2I1UA 5HR0A 2PERA 18GSA 2MMOA 2E7PA 2AUVA 5A4UA 2FLSA 4V2LA 4ECBA 3VLNA 1K0CA 2G0FA 3M9KA 4YAVA 3APOA 3ERGA 3C1SA 1EP7A 3ZVJD 2H30A 1TKDB 2B6MA 5G1LA 3OR5A 4LA1A 3LXZA 1YY7A 1HYUA 1M2BA 3ZREA 2GZZA 2LJRA 1WP0A 4XS4B 1XWCA 4ILFA 2WB9A 2CZ2A 2DIYA 4G2EA 1PMTA 4HEA2 1ZOFA 3AY8A 5IOXA 5CAXA 4KCAA 3QOUA 1BEDA 4XRAA 1ERVA 6GSUA 3D0ZA 5IMZA 4EDZA 3A2VA 2FWHA 3EE2A 3LFLA 2DJ1A 1XWBA 2H1AA 2LQOA 5D73A 3IRAA 2H6ZA 4Q5FA 4IGJA 5G5FA 3DWVA 4XS1A 4MF6A 4F9ZA 1W4VA 4IP1A 4L0UA 2B1LA 2R37A 3QMXA 5E59A 1ERTA 5A4VA 3DRNA 3US3A 3PINA 5LD0A 3D22A 2QC7A 3ZZXA 3L9UA 3M0FA 4Q5QA 4MMMA 3C73A 4V1Ag 5B7CA 5IMAA 2HRNA 1FW1A 2P5RA 4O5RA 3KTLA 2FGXA 3IV4A 1Y25A 1OKTA 3HDCA 4FYUA 1M2AA 4IKHA 1RQMA 2CVKA 3GMFA 1XOBA 3P90A 5FT3A 4GQCA 2IMDA 2RM6A 2IWTA 4POKA 5DDLA 1G6YA 1SJ6A 2KUCA 1A23A 3H8QA 2L4CA 1EWXA 4HS1A 2EC4A 5ECLB 4IJIA 2DJKA 3HVSA 1BAYA 5JWOB 5EL8A 4WBJA 3NIVA 2HLSA 1PSQA 4GLTA 5HR1A 1ST9A 1WMJA 4BVXA 1AIUA 3LG6A 2GSSA 5F07A 1K3OA 3ZFBA 1K0OA 3C8EA 4YQMA 3G7JA 4XHMA 2ON7A 2DMLA 2GT6A 3CRUA 3H79A 1OE8A 5IOWA 4BA7A 2NTOA 1PL2A 3IAS2 4AJ7A 5CP1A 5ECPB 1VF4A 1A8LA 2G2QA 2WDUA 3DKSA 3BJ5A 2OBIA 5IO2A 1X5DA 1O85A 1GULA 4GWRA 1WWJA 3QAGA 2WCIA 2KP1A 4XS6A 3ME8A 3L9SA 1FO5A 2HSHA 3HYPA 5DQYA 3TUEA 2M46A 5J4UA 5D9XA 3A3TA 1TI1A 1V2AA 5IMDA 4LL4B 3LEFA 3IOSA 5FWGA 5CNWA 5CO3A 1SL0B 5F06A 4WF5A 2VM2A 4IHUA 2LV3A 3LORA 1U6TA 5B8BA 3MSZA 4I2TA 2H0HA 3E3EA 1QGVA 2AYTA 1MD3A 4IJ3A 3P7XA 1N8JA 1I9DA 2KHPA 1YF0A 3N9JA 4MPGA 1DBYA 1U87A 4FYCA 1FB0A 3FZ9A 4ZILA 1S3AA 2QGVA 2CX4A 4YQUA 2VCVA 4K2DA 3C71A 2K8VA 4YH2A 3HXSA 4NV5A 1YKCA 1K0DA 3RHBA 1SD9A 3IHQA 3ZL5A 1Z6NA 2L59A 3CMIA 2C0EA 4DVCA 4ZL9A 2IMFA 4PXOA 4TR4A 3QPMA 4N0ZA 4X0XA 1V9WA 1XW9A 2N5AA 3VI7A 1H75A 5DQSA 3GFKA 4MLYA 3HVVA 4BPYA 4JEDA 3F4RA 3KXOA 3WT2A 3D5JA 2OA7A 2YCDA 1SJIA 3EINA 2X64A 2BJXA 3QFBC 1PX6A 1B4QA 5GSSA 4HJ2A 4EDYA 2LS5A 2H6XA 3GNJA 5IMCA 4WR5A 5F8BA 2O89A 2YN1A 3J7Yk 2LEGA 4KDUA 1GSSA 5FHIA 2GLRA 3EMPA 1EGOA 1JZDA 1MDKA 2OKAA 1YJ6A 3EVIA 5HFKA 3FEUA 3ME7A 3TKRA 1URMA 1GRXA 1EV4A 2KLXA 2OJLA 3VK9A 4PUFC 4KGIA 3UVHA 1WIKA 5H5SA 3CRTA 3I6AA 1LJRA 3P8WA 1QK8A 4ZBDA 1Z7RA 2IL3A 3W6GA 3GYKA 2PVQA 4KW6A 5H5RA 2HI7A 3A5WA 2C0GA 5D8IA 3HA9A 1NHOA 4NAXA 3HJMA 4D73B 1QQ2A 3ZFLA 1IYIA 1VF2A 3CSHA 6GSYA 4X1UA 1F2EA 3UOMA 1JFUA 3ZMKA 4BVYA 4K7IA 4CHSA 2H66A 3KJYA 4FIWA 4IQAA 1O8WA 2GQLA 10GSA 4WETA 2MMNA 2R5GA 4WEYA 2A4VA 4ML1A 4CW9A 2V2GA 3KMNA 1ABAA 1WOUA 2CAQA 1GUKA 1QXHA 3EU3A 5ECKB 4PNGA 1FOVA 5JWRB 1A8YA 1T1VA 1PKWA 1ZL9A 4HQSA 3UJ1A 2FD3A 3CTGA 3LQ7A 1UVZA 4V2NA 4LMWA 3H4KA 4Z7XA 4MCUA 1XIYA 2C1YA 2L4QA 2BTOT 2B5XA 3M9JA 4FH8A 1GTIA 5H5QA 2RIIA 1GSEA 1XZOA 2L6CA 2WGRA 1EV9A 2H75A 2WRTA 4JU5A 2VCQA 3LXTA 4BWSA 2MZCA 3LJRA 3CYNA 5COHA 1O73A 2CVBA 3GKKA 1FVJA 2FHEA 2FY6A 4ULXA 3GURA 1B9XC 2GSQA 1SKSB 1R5AA 2B3SA 2DJ0A 6GSTA 3KCMA 3EWLA 2VL9A 5EY6A 5ID2A 2PBJA 1OYJA 1XXUA 1XWKA 3TKSC 3ZRDA 4EUYA 4N30A 2AHEA 3ZYWA 1J08A 3CSJA 4IW9A 1OKDA 4F82A 2YZUA 4X43A 1U88A 3KEBA 4J2FA 1BYEA 1SKRB 3FYGA 2PU9C 2MBSA 1R5PA 1PKZA 1ZZYA 4PQHA 1IYHA 5J3RA 1K3YA 1GNWA 5G5EA 1YQ1A 1XW5A 3ERWA 5CRWA 2LKUA 5J9CA 1T8EB 3BOAA 2N5BA 2MYGA 5GSTA 2IIYA 2KOKA 3M8NA 4K0NA 1DE1A 5JWQB 3PH9A 1MDIA 1FG4A 3K8NA 2HT9A 4KSOA 1EOGA 4HJMA 2CZ3A 5HFIA 4KE3A 1A2LA 2VAFA 3FKFA 1TRSA 1T3BA 1U3IA 1WE0A 4MZWA 4BWQA 1WPIA 4AJ8A 2VL3A 1TOFA 2VOCA 3BBYA 4K6XA 1GL8A 5LCZA 1KTEA 1G7OA 1A2JA 2IJYA 3GRXA 1DUGA 3QCPA 2DC5A 2QSIA 2VCTA 3KM6A 4GSNA 4OCEA 4EKZA 4FYBA 4K0GA 5HR2A 5G1KA 4DSRA 5IPGA 3D6IA 1V58A 3D4TA 1QFNA 1GH2A 4MJCA 4K9ZA 1TU7A 2DJJA 2F3MA 3C1RA 4LLRA 1XW6A 5G30A 4QL9A 2GQKA 5CREA 1OC9B 2H01A 3QFAC 2CT6A 3HCZA 1DE2A 3GX8A 2NVLA 1BG5A 2PPTA 1R26A 3FK8A 4HOJA 1AW9A 4K8MA 1PQNA 4E8EA 4G19A 4IELA 4OO5A 2YWIA 4KH7A 2V6OA 5ECOB 3F4TA 4IS0A 3KP8A 4OMVA 1ML6A 4NWYA 3VFIA 1SU9A 4E8HA 5IM9A 2I9HA 5B6MA 1DSBA 3IPZA 3NOFA 4TW5A 1F3BA 2C3NA 3DMLA 5AN1A 5LNKe 1UN2A 4NMUA 3UBLA 1GLQA 2MMAA 5AIXA 5F05A 5KN2A 2B7KA 5ID2B 1JZRA 4TVEA 4GRFA 2VL2C 4MABA 2C4JA 3LYPA 4KA0A 2F8AA 2FWFA 4ZB8A 4MF5A 2GS3A 2DJ3A 4PNFA 2VLVA 2BMXA 2LJAA 2PUKC 2AB6A 2V32A 2B7JA 2YJHA 4TR1B 2OBKA 1TRWA 3F0IA 4K1FA 1XFLA 2FWGA 2OADA 5ECRB 5AISA 4GTUA 1QUWA 4O7HA 2IN3A 4V2MA 4EE0A 1CQHA 3HZ4A 3HHVA 1T7PB 1LBKA 2M80A 2C3TA 4D73A 2XPDA 1ILOA 2IFQB 3FY7A 1M9BA 2O8VB 2OE1A 3A2WA 5CYYA 4P3YB 1SK1A 3V1WA 3APQA 2IPAA 2X8HA 3GSSA 1TW9A 2JACA 4ZL8A 1AAZA 2H8LA 3GL5A 4TXOA 4XRDA 4PQ1A 3GN3A 4O92A 2FWEA 4EVMA 1XVQA 2F8FA 5ECIB 4MH3A 3P2AA 2JL4A 1Z6MA 2H76A 4I5QA 4G9HA 4RQRA 1AC1A 1CQGA 1VRSD 4MZCA 3D4MA 6GSWA 1VF3A 1OC3A 3RPPA 3BD2A 4KDXA 1TRVA 2YOIA 4JR6A 3H93A 4IBPA 5INYA 4HDEA 2VLTA 3FZAA 1WJKA 4GSSA 1K0NA 1SKWB 2GSTA 4HI7A 4PUAA 1H4OA 2C8UA 1GSFA 4NHWA 3ZVJA 1ON4A 3R2QA 2R6KA 3WT1A 2V6KA 3TKQA 2H73A 1AQXA 3QAVA 4ZB6A 5IO0A 1GTAA 1SK2A 2V1MA 3O76A 4NV2A 1EEMA 3WGDA 2XPEA 5D9TA 1PD21 2E0QA 2XHFA 4MP4A 5IMFA 4NXIA 3KD0A 4F2IA 1X0RA 5ECQB 5DJLA 4KX4A 1G0TA 4ML6A 4OFNA 5EVOA 4ZBAA 2NDOA 1O7UA 3HJOA 2GGTA 2XC2A 3CTFA 4TR0A 4ECJA 1T4YA 3F63A 4HU9A 1FB6A 1X5CA 5ELAA 2JSZA 2LTKA 2GDRA 4MH2A 3HZ8A 2REMA 4ZBBA 1SL1B 3VPTA 3MWHA 2LNTA 2H74A 3I43A 3TJJA 4CDOA 4GF0A 4OWYA 4K7OA 2MBTA 4POBA 3O6TA 2FCHA 4L5LA 5HQPA 3TRXA 1EGRA 2NPBA 3QR6A 3G7IA 3APSA 1GLPA 2GQMA 5IQYA 3QAWA 1XWAA 3MDKA 3RDWA 1NM3A 3KMOA 3Q18A 3DVXA 4DSQA 4DEJA 2VCWA 1B9YC 3VWXA 3VPQA 1ZMAA 1LU4A 1KNGA 2XBQA 2D2ZA 2ON5A 4QL7A 4TXOB 2IMIA 2YV9A 3D21A 2LJKA 5B6NA 2WS2A 2TIRA 2YZHA 5HFGA 5C00A 1E6BA 3G7YA 4N11A 4RQXA 3F8UA 3TJBA 3FHKA 4NHZA 2HFDA 2YP6A 5D9WA 5DAKB 1BQ7A 2X8CA 1Y6EA 3IK7A 2CAIA 5KN1A 4EXJA 3PGTA 3TKSA 5B8AA 2CA8A 1TRUA 1THXA 2GZYA 2YWMA 3GKNA 3GHAA 1OC9A 2LRTA 4J56E 5F0GA 4PQIA 2FUG2 1AUCA 1XBSA 7GSSA 3FW2A 5D96A 19GSA 3JCML 2GSRA 2HZEA 1ZGNA 1EP8A 4MJEA 2IMKA 5DALB 2I3YA 2MMZA 12GSA 3GH9A 4FO5A 3N5OA 2WULA 4J57E 1GTUA 5AIVA 1GNEA 1JLWA 5G31A 4MDCA 5DVBA 1TK8B 4F03A 2K6VA 2VCXA 4HU7A 2C3QA 2OE3A 1QMVA 1YKAA 4ID0A 1PGTA 3FR9A 2H0IA 1SENA 4TR1A 2EIOA 2H1BA 1XPVA 6GSXA 3MAKA 4GXZA 1TDIA 2CX3A 4IN0A 4ECCA 4BL7A 2ES7A 4JBBA 1V57A 2H71A 1PL1A 1ZYQB 1PRXA 2YJ7A 3ZMLA 2RLIA 4GQFA 9GSSA 3L4NA 1MDJA 3IAM2 1PX7A 1E2YA 2O87A 1M0UA 2HNLA 1HQOA 1SD8A 3G9BA 1TTZA 5IMVA 4ACSA 3IBHA 1BX9A 1GSYA 2IFQA 4KDYA 4MK3A 1V98A 1Q98A 3NZNA 5ABRA 4O32A 2ZNMA 3L9VA 2TRXA 1FAAA 2JZRA 3IA1A 3HJPA 5J5NA 1EOHA 1TJDA 1M2DA 2FA8A 3KTBA 1PA3A 5C04A 4AJ6A 3UAPA 4Q5NA 1YZXA 3UIWA 3VI5A 1EZKA 3ERFA 2DSAA 3F4SA 3EC3A 14GSA 1TU8A 2HXKA 1GSQA 2P31A 4PGTA 1YEXA 1K0AA 2C0DA 4WF4A 1HNCA 1Z7PA 2DLXA 1SYRA 2J23A 2LSTA 2E2GA 4OCFA 3HKRA 1GSDA 3TDGA 3TB2A 4KAEA 3DXBA 2HZFA 2V41A 1J9BA 2VD1A 1O8XA 1Z9HA 1FVKA 5G2ZA 1X9MB 5AGYA 2VL2A 2RUFA 2K8SA 1WRYA 4YQVA 1JZWA 2R3XA 3ZIJA 4MA9A 17GSA 3UVTA 2TRCP 2VUPA 3IE3A 1Z3EA 2LQQA 5CRDA 4KSMA 5L71A 1XCCA 2HYXA 5CRHA 3E9JB 3RAZA 1B48A 3GV1A 2JZSA 4TOPA 3QDNA 3ZIVA 2K18A 1TI3A 2JADA 4TRXA 4DSSA 2VCZA 2DBCA 2VD0A 3CSIA 3EYTA 1ZCPA 2HZEB 4PURA 1HNBA 1W89A 4OFMA 2FNOA 3EURA 3DVWA 4WXTA 1TXXA 1HD2A 1TP9A 3PR8A 3DGQA 4V1Ap 2ZCTA 3GIXA 4F0CA 1K3LA 4TN8A 3GX0A 3CXGA 3U6VA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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