1EPME

A structural comparison of 21 inhibitor complexes of the aspartic proteinase from endothia parasitica
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title A structural comparison of 21 inhibitor complexes of the aspartic proteinase from Endothia parasitica.
pubmed rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 82
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1994-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1epmE02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1epmE01
1DIFA 2G1OA 3PCWA 3QVCA 4KE0A 5P7DA 3SA3A 3BRAA 4Z22A 1TSQA 3PWWA 4FLGA 3SKGA 2ANLA 5OZ9A 3HD8A 4RRSA 5P72A 4Z2ZA 1HEGE 4R92A 4HZTA 3BUGA 5P7KA 4Y4GA 5KR0A 3QPJA 5IS4A 2FMBA 1ZSFA 4QGIA 5I3WA 2I0DA 3KFRA 4Z50A 1EBYA 2OHUA 5P18A 4RROA 5OYYA 4QLHA 3IXOA 5P5YA 5I70A 4I0ZA 2AQUA 1SDVA 5COPA 4J54A 3K5DA 5P2TA 1HPSA 5P16A 2PK5A 4I0JA 3CYXA 4YOBA 3SABA 2APRA 3LIXA 4XKXA 3I25A 5P50A 1SMRA 5OZUA 5P1ZA 4K4RA 2HB4A 4E43A 4LXMA 5DR8A 4HVPA 2JYSA 1T7KA 4Y3TA 5P6FA 3VYEA 5ER2E 4I8ZA 1APUE 3K5FA 5C9BA 1FQ7A 2ZJKA 5P7OA 2ZHRA 5P46A 1HVIA 3L38A 2JJIA 5P0QA 3WSJA 1F34A 1IBQA 3EL0A 4RYGA 2AVVA 3BC4A 5P07A 4GMIA 3R1GB 5UPJA 1EEDP 4JP9A 4Y38A 2NMZA 4Y35A 5OZTA 5P7BA 5OYXA 4OBKA 4EQJA 5P56A 4CPRA 5P55A 2P8HA 3BVAA 1EPOE 4D8CA 5P8TA 1G35A 5DR7A 3OQKA 5P64A 5COKA 5J25A 3EL9A 2BBBA 7HVPA 4Y3AA 2PSVA 3INEA 4K4PA 4GJ5A 3FSMA 4COEA 3QVIA 4EJLA 3LNKA 1XE6A 1G6LA 1IZEA 5APRE 1FLHA 5P80A 4WTUA 1M43A 2IKOA 2I4UA 4I0GA 4A4QA 1FQ8A 3NXEA 3D20A 4RZ1A 5OZBA 2NTRA 1FB7A 3DJKA 1LEEA 3JVYA 2FDDA 3KFPA 1T6EX 2QZLA 3OQAA 1B6MA 2UPJA 5P2EA 3OADA 2QI3A 4J1FA 4L7GA 5P7TA 5P8AA 4GIDA 1KJGA 2AVMA 5P0YA 5P0MA 3UFLA 2G1YA 1GVWA 3OXXA 4EJKA 4RYCA 5P8SA 4Y3LA 4GJCA 3VSWA 3O9LA 5P25A 4Y5AA 4DJRA 3URIA 3QP0A 4APEA 3KM4A 4RGHA 5P1TA 2FS4A 3A2OA 5P8UA 3O9IA 5P8EA 1B6LA 3OHHA 5P5LA 5P82A 4DFGA 2R5PA 3VFAA 3OADB 5P37A 1AZ5A 1HSGA 2Z54A 5P2IA 1Q9PA 5P77A 4EJDA 5OZ5A 5P2FA 5P34A 1TZSA 2ER7E 2HB3A 1HVJA 3OQDA 3INHA 1B6KA 1UH7A 4Y3JA 5EZXA 5OZ2A 3DM6A 5P1EA 1TCXA 1K6PA 4Y4WA 5P3PA 4M8YA 3BXRA 1OEXA 1FFFC 5KR1A 1RNEA 4FRSA 3OGPA 1HBVA 4Y36A 2FDPA 3OWNA 3CIDA 2QI0A 3OU3A 1HTFA 1E81E 1SMEA 5P86A 3L5BA 3Q70A 3R4BA 3UCBA 3GGUA 7UPJA 4NJSA 4Y3RA 1GVXA 3D1YA 2ZJMA 3BGBA 4J17A 1DPJA 5P6HA 5DR4A 3DCKA 3TLHA 2G22A 4LXAA 4BFBA 1WBMA 3S7LA 4QJ7A 1EPNE 4NJUA 3QBHA 1AM5A 2PK6A 2ZJHA 2QNNA 4YCTA 5P8JA 2CEMA 1HPOA 2MIPA 4ZLSA 4U8WA 5P0HA 3T7QA 3LINA 4EWOA 3NLSA 5HDXA 1EPQE 3S8IA 2QD7A 2IGYA 1GKTA 3SA5A 5P5SA 5P2OA 5P4FA 1SDUA 1FFIC 5E5JA 2QD8A 1KJ7A 4YA8A 4AMTA 5F01A 3OK9A 5P24A 5AH6A 3T11A 1K1UA 3OY4A 5P0VA 5OZXA 1C6XA 4AA8A 3ECGA 2V16C 4Y9WA 3HAWA 3EKPA 5P2AA 3DCRA 1LYBA 3NU6A 2QI5A 4TRYA 5P4TA 1NH0A 3PLLA 3UTLA 5SY2A 3KDBA 5JFPA 2WHHA 1T7JA 4B05A 1K2BA 4CPTA 1K6VA 3PWRA 3S54A 5HD0A 4FRKA 5P30A 5P27A 3NDXA 4FSEA 4FIVA 5P71A 5P59A 3IN4A 3SM1A 2JE4A 2QHYA 1LF2A 4S1GA 3IXJA 1HVSA 5OZ8A 3UPJA 4K8SA 1A8KA 5P6YA 1LYBB 1PPKE 1BXOA 3HLOA 5KR8A 5P0TA 4Y44A 2ZYEA 1EC2A 2NXDA 4LXKA 1YT9A 2BPYA 2VNNA 4Y57A 3UDPA 3K4VC 4Y3MA 4K9HA 1YG9A 3MSKA 3NU4A 1PROA 1HSIA 4AA9A 4B1EA 1MTBA 4PZWA 5P1BA 3M9FA 5P1IA 5P47A 4YD3A 4F73A 4Y4AA 3UF3A 4OBHA 4FM8A 4R8YA 5P1AA 5P68A 4Y3FA 4I0IA 1OEWA 5P3JA 2F81A 2VKMA 1TSUA 1QBTA 2P3AA 3IVIA 1RQ9A 3PB5A 4H3GA 2WEBA 5P7MA 5P2HA 3K5GA 1MT8A 1EC1A 3EM6A 1YM2A 4GJ8A 3HVGA 3LZVA 3QBFA 5OZ0A 5P8OA 3ZKQA 2IEOA 4Y3SA 2OHRA 3KDCA 2I4WA 1SH9A 5P4BA 4Y3HA 3UHLA 4Y4TA 1BVEA 2OHSA 2WF3A 4PYVA 3T7XA 1ZLFA 5OZQA 2F3EA 4Q1XA 5P5GA 3PJ6A 4OBDA 1AJVA 5P62A 1RV7A 5P39A 2Q64A 1B5FA 2B8VA 3PSGA 3ZPUA 5P5JA 3TNEA 3TTPA 2BB9A 1BIMA 4Q1YA 3PLDA 4YHQA 1J71A 5P2VA 1FIVA 3NWXA 5P1QA 5P38A 2WEDA 3URJA 1ZPKA 3LPIA 1FGCC 1YTIA 5KQFA 5KQZA 2VS2A 5P1WA 1K2CA 3PHVA 1D4YA 5P12A 5KQXA 1EPRE 4J0ZA 5P76A 2PWRA 2P3BA 2H6TA 5P8FA 4LHHA 2FGVA 1EPLE 1B5FB 2HS1A 1ZTZA 2HM1A 3SA6A 1ODYA 4NPTA 3ZKGA 4ZPFA 4RVIA 2OHQA 5OZNA 5P0OA 1HVHA 3UDHA 5P3GA 1ZP8A 5P29A 2Q54A 3PMUA 4QJAA 1GVUA 3MSJA 5C9FA 4Q1NA 4ZPGA 5P4AA 3HDKA 4ACUA 5IVSA 5P0LA 5P15A 1SIPA 2P3BB 3SA7A 1FQ6A 4JECA 2QMDA 1ZBGA 5P2DA 1M0BA 2RMPA 1HTGA 3EC0A 5P13A 4EP3A 4YD6A 4GJAA 5P5BA 3APPA 3EKQA 4D89A 2NPHA 3NUJA 5P6RA 5P4RA 3ER5E 4PZXA 2V11C 2F80A 5P44A 4B00A 2AOCA 1MIQA 5P0KA 2A1EA 4Y3PA 4Y4EA 2BPZA 3SLZA 4Y3EA 5P1KA 5P66A 2WF1A 3HZCA 5OZJA 1K6CA 4EP2A 4TRZA 5JFUA 4FM7A 2AZCA 3G70A 3VV7A 5OZVA 4B72A 2Q5KA 3LIQA 3TOHA 1YTGA 4KB9A 3UQPA 5OZOA 3BVBA 1FKNA 1AAQA 3OAGA 2ZDZA 5P8IA 4K4QA 4TVGA 2R3TA 5P7IA 3Q3TA 2G1NA 5P0PA 1E82E 4I0FA 4EJ8A 5ISKA 1XE5A 1PSAA 5P8VA 1F7AA 1AIDA 2P3DA 4DH6A 5P11A 3KMYA 5P32A 5P7RA 1SIVA 3R0YA 1IZIA 4B70A 4YE3A 1BWAA 1EAGA 1GNMA 4Y4BA 4YD7A 2V00A 1GNOA 4ZEAA 3D1ZA 3T3CA 5P87A 3OAGB 5OYTA 3O9DA 4Y45A 5P22A 1HOSA 1SBGA 4CPQA 1QBSA 3IN3A 3UDQA 1BV7A 2ER6E 2WKZA 3L5FA 4H3FA 5P1DA 5DQ1A 1EC0A 2PWCA 5P3YA 4DQBA 5P6XA 3QS1A 5P63A 1SGZA 3S7MA 1SGUA 4L6BA 4EXGA 3F9QA 3OUDA 1LZQA 3L5CA 4MC6A 4KE1A 5P41A 5P1RA 2WEAA 5P3HA 2VIZA 4Y53A 3PBZA 6FIVA 1FF0C 5P4QA 3TKGA 3EMYA 5P7XA 2O4LA 5P6NA 3OUAA 4Y5MA 5P84A 5JG1A 3K1WA 4Y3ZA 3SFCA 4D88A 3IAWA 5P7ZA 2BPVA 2BPXA 3GGVA 4Y47A 2XFKA 2ZJLA 1LYWA 5P7CA 1FQ5A 5P0NA 4Y5LA 4OBZA 5P69A 3UDRA 5DR0A 5P5CA 1HIIA 1MUIA 3OUDB 5SXNA 4X2LA 4J55A 1XDHA 3AUPA 1MEUA 5ISJA 5P5NA 3LZYA 1ME6A 4LBTA 5P6MA 1ZPAA 3OOZA 2ZJIA 1W6IA 4Y4DA 5P3AA 2CEJA 1B11A 5P1SA 2IL2A 5P04A 3G6ZA 1META 5P4OA 4Q1WA 3SKFA 5HTZA 4HA5A 5P4XA 4I0HA 5P4GA 1LYWB 3LIVA 5P01A 5T4SA 5P3QA 4OBZB 3D91A 1W50A 4RVXA 2XYFA 5P57A 3B7VA 5KQYA 5IVTA 4M8XA 5P5TA 2JXRA 4Y5PA 1PSOE 3EKTA 5AHCA 3INDA 3NR6A 5OZSA 1FMUA 1ZJ7A 5P6OA 5P7LA 4I1CA 3H5BA 4EYRA 5KOQA 5DR3A 5OZIA 1W5XA 1RPIA 4Y3GA 3NXNA 5P8CA 4DJWA 3LHGA 3ZPSA 3CIBA 3ZPTA 5P00A 2F8GA 4J0VA 5P0IA 2AVSA 4R91A 1HXBA 2F3FA 3UQUA 4OC6A 4H3JA 4Y56A 1U8GA 1BILA 2VIJA 3S53A 1FMBA 1LV1A 3SA9A 3NDUA 4Y3XA 3G72A 2B7ZA 5P5KA 4PPHA 2OAHA 1W51A 4Y4JA 4JPEA 2CENA 4Y5GA 2PH6A 5OZFA 4YBFA 3NU5A 5DGWA 1MPPA 3EKWA 3L58A 1B6PA 1EPPE 3VV8A 3O9LB 2QZXA 3TL9A 1IIQA 2VNMA 5OZ7A 4BFDA 2QK5A 3CKTA 5P0AA 4Y37A 4Y5KA 2FNSA 4DJPA 5CONA 5P8RA 3T6IA 5P3RA 4D85A 4DJQA 1D4JA 4HEGA 3SPKA 4BEKA 1NPWA 2PYMA 3JVWA 2PYNA 1APVE 5KR2A 1WBKA 1BXQA 1D4LA 1C6YA 2IQGA 2ER9E 5P6BA 4Y51A 5P7JA 4YD4A 1UH9A 4ZIPA 2P3CA 4ZSRA 2HAHA 5AHBA 2WL0A 3OGQA 3KFSA 2P4JA 3MSLA 5AH8A 1IDAA 3GGXA 4NKKA 1YM4A 4Y50A 3QAAA 5P8DA 5HU1A 5P6LA 5P85A 4I11A 3NSHA 5P35A 3VYDA 4F76A 3OXVA 3IVHA 3GI6A 1D4HA 3EM4A 1LYAA 2I4XA 4OBFA 5P1JA 3N4LA 2WJOA 3RTNA 3FNSA 4LP9A 2QI6A 3RTHA 1HHPA 3EL1A 5P75A 5P3MA 5SZ9A 5P53A 1FG6C 5P4DA 5P51A 1LF3A 1BDQA 5P1FA 4U7QA 3O9EA 3SO9A 1PPME 3DK1A 4RCFA 1A94A 4NJTA 3OOTA 2H6SA 4I12A 5P02A 1LYAB 1BVGA 5P43A 3QRSA 2QCIA 5P4NA 3OU1A 5P49A 5P8LA 5PEPA 4UPJA 3OQFA 3O9CA 5P4UA 4L1AA 1XN2A 2PQZA 2IENA 4EQ0A 5P0XA 5P6IA 3PSYA 5P1XA 2R8NA 1XL2A 1UH8A 5P8KA 5OZPA 1MESA 2OHTA 3WZ8A 4FE6A 1RL8A 5AH9A 1D4SA 1KZKA 1QDMA 5P26A 5AH7A 2O4SA 3BGCA 1QS8A 3OU1B 5P7SA 3UQWA 5P1VA 4WY6A 1TW7A 8HVPA 5P0SA 1PPLE 5P48A 5P6UA 4L1AB 2AODA 3EM3A 5P3TA 5DQ4A 5I3VA 1TQFA 2PSGA 5P4IA 1TCWA 3CKPA 1BDRA 1IVPA 1CMSA 3Q6YA 3RTMA 5OYVA 2RENA 5BRYA 3ST5A 5P2ZA 3L5EA 4YBIA 2FLEA 3KFNA 1LS5A 4DJOA 5B18A 2BJUA 2G26A 5P20A 4QJ8A 5P83A 2VJ9A 5OZ4A 3WB4A 3O9BA 1T3RA 2AOFA 3ZOVA 5P0GA 4DQGA 3PGIA 3VLBA 1A8GA 5HDUA 5HDZA 1Z8CA 2R3WA 3QN8A 2R43A 2V12C 3SACA 3QI1A 5P3OA 2AOJA 3OUBA 4AUCA 4DI2A 3UDKA 4Y39A 5P4LA 1GVTA 4H1EA 2G24A 1EBWA 3L59A 2PC0A 4XX3A 1MVPA 5P7QA 4YDFA 5OYRA 2FGUA 3OU4A 3UDMA 5P33A 5P52A 3WZ7A 4I8WA 3OUCA 4TRWA 5FIVA 4GJDA 4J1HA 4Y3WA 2ZE1A 4FM6A 3VCMA 1FEJC 3TPJA 1C70A 4PHVA 5P4YA 5P5VA 2WF0A 5P2WA 1MSMA 3K4VA 2G1SA 4FRJA 4B77A 1VIKA 4GB2A 4J5JA 3OTYA 5P3WA 5P1PA 3KYRA 3RVIA 4JOOA 3OU4B 4B1CA 3N3IA 5P89A 1IZHA 1HIVA 4N00A 3VF5A 5P6ZA 5P8PA 1QBRA 5OZWA 5P3IA 4PEPA 3IA9A 4DQEA 5P3DA 3VUCA 3NDWA 1C6ZA 5TOLA 1ODWA 4GJ6A 4H3IA 5P61A 3LPJA 2HPEA 3SA4A 3KDDA 2O40A 2VIEA 2VA6A 3EKYA 5OZYA 3GI0A 4EHCA 3QRVA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1DIF A;  2G1O A;  3PCW A;  3QVC A;  4KE0 A;  5P7D A;  3SA3 A;  3BRA A;  4Z22 A;  1TSQ A;  3PWW A;  4FLG A;  3SKG A;  2ANL A;  5OZ9 A;  3HD8 A;  4RRS A;  5P72 A;  4Z2Z A;  1HEG E;  4R92 A;  4HZT A;  3BUG A;  5P7K A;  4Y4G A;  5KR0 A;  3QPJ A;  5IS4 A;  2FMB A;  1ZSF A;  4QGI A;  5I3W A;  2I0D A;  3KFR A;  4Z50 A;  1EBY A;  2OHU A;  5P18 A;  4RRO A;  5OYY A;  4QLH A;  3IXO A;  5P5Y A;  5I70 A;  4I0Z A;  2AQU A;  1SDV A;  5COP A;  4J54 A;  3K5D A;  5P2T A;  1HPS A;  5P16 A;  2PK5 A;  4I0J A;  3CYX A;  4YOB A;  3SAB A;  2APR A;  3LIX A;  4XKX A;  3I25 A;  5P50 A;  1SMR A;  5OZU A;  5P1Z A;  4K4R A;  2HB4 A;  4E43 A;  4LXM A;  5DR8 A;  4HVP A;  2JYS A;  1T7K A;  4Y3T A;  5P6F A;  3VYE A;  5ER2 E;  4I8Z A;  1APU E;  3K5F A;  5C9B A;  1FQ7 A;  2ZJK A;  5P7O A;  2ZHR A;  5P46 A;  1HVI A;  3L38 A;  2JJI A;  5P0Q A;  3WSJ A;  1F34 A;  1IBQ A;  3EL0 A;  4RYG A;  2AVV A;  3BC4 A;  5P07 A;  4GMI A;  3R1G B;  5UPJ A;  1EED P;  4JP9 A;  4Y38 A;  2NMZ A;  4Y35 A;  5OZT A;  5P7B A;  5OYX A;  4OBK A;  4EQJ A;  5P56 A;  4CPR A;  5P55 A;  2P8H A;  3BVA A;  1EPO E;  4D8C A;  5P8T A;  1G35 A;  5DR7 A;  3OQK A;  5P64 A;  5COK A;  5J25 A;  3EL9 A;  2BBB A;  7HVP A;  4Y3A A;  2PSV A;  3INE A;  4K4P A;  4GJ5 A;  3FSM A;  4COE A;  3QVI A;  4EJL A;  3LNK A;  1XE6 A;  1G6L A;  1IZE A;  5APR E;  1FLH A;  5P80 A;  4WTU A;  1M43 A;  2IKO A;  2I4U A;  4I0G A;  4A4Q A;  1FQ8 A;  3NXE A;  3D20 A;  4RZ1 A;  5OZB A;  2NTR A;  1FB7 A;  3DJK A;  1LEE A;  3JVY A;  2FDD A;  3KFP A;  1T6E X;  2QZL A;  3OQA A;  1B6M A;  2UPJ A;  5P2E A;  3OAD A;  2QI3 A;  4J1F A;  4L7G A;  5P7T A;  5P8A A;  4GID A;  1KJG A;  2AVM A;  5P0Y A;  5P0M A;  3UFL A;  2G1Y A;  1GVW A;  3OXX A;  4EJK A;  4RYC A;  5P8S A;  4Y3L A;  4GJC A;  3VSW A;  3O9L A;  5P25 A;  4Y5A A;  4DJR A;  3URI A;  3QP0 A;  4APE A;  3KM4 A;  4RGH A;  5P1T A;  2FS4 A;  3A2O A;  5P8U A;  3O9I A;  5P8E A;  1B6L A;  3OHH A;  5P5L A;  5P82 A;  4DFG A;  2R5P A;  3VFA A;  3OAD B;  5P37 A;  1AZ5 A;  1HSG A;  2Z54 A;  5P2I A;  1Q9P A;  5P77 A;  4EJD A;  5OZ5 A;  5P2F A;  5P34 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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