1EPOE

Endothia aspartic proteinase (endothiapepsin) complexed with cp-81,282 (mor phe nle chf nme)
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title Direct observation by X-ray analysis of the tetrahedral intermediate of aspartic proteinases.
pubmed rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 77
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1994-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1epoE02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1epoE01
5P3JA 4GIDA 3NXEA 5OZHA 3UCBA 1F34A 2VS2A 1D4IA 1FQXA 5P2DA 4ER4E 4I10A 1Z8CA 3OUCA 4J17A 5P1JA 5P7AA 5P75A 4Q1YA 3RSVA 5BS4A 2HS2A 5I70A 4EJKA 1SMRA 4DQCA 3URIA 3TPPA 5P4BA 1FLHA 3URJA 5P2UA 4CPRA 4RYCA 5P1YA 1ODXA 5OZRA 4X7IA 2ZDZA 5P8GA 3OQ7A 1ZTZA 1ZSRA 1E80E 1GVTA 5P5BA 5P0CA 5KQFA 1T6GA 5P3RA 1W50A 1LYWA 2G1YA 5P86A 5P0AA 5P3MA 5PEPA 5P45A 3H0BA 4Y3XA 4J5JA 3PCZA 5P29A 2QI4A 3IVHA 3SAAA 2WF2A 1ZPKA 3WSJA 5T4SA 3TNEA 2QMDA 4FM6A 1W5VA 2VNMA 5P1VA 1M43A 3LZYA 9HVPA 5P7FA 2G24A 1XE6A 4D85A 5F01A 2QI6A 5P3NA 1QBRA 3S45A 1META 5P3QA 4FM8A 4MC9A 1AJXA 3K4VC 5P73A 3GGVA 4IVSA 4IVTA 3K5CA 5P27A 3S56A 4B78A 1NPVA 4Y4XA 4ER2E 1AAQA 3TPRA 3EKQA 5C9BA 3O9BA 2NPHA 5P3FA 4ZPGA 3UDNA 1D4KA 5P3WA 5P1AA 2J9KA 1HSHA 1KJHA 2JJJA 1ZLFA 3TTPA 4Y39A 1B6MA 3SA9A 5KR2A 2AOIA 3VG1A 2OAHA 5P08A 1GNNA 5P15A 3NXNA 2RENA 5P37A 3D20A 3UDRA 1KZKA 3PI5A 4L7HA 3VSXA 3JW2A 5P87A 5P34A 1KJ7A 4OD9B 1A94A 1MTRA 3UDYA 5I3XA 4TRWA 5P0PA 2AVMA 1SDUA 5OZ7A 4F74A 1FQ5A 1EBZA 1YTHA 2QHCA 3NU6A 3VSWA 3WB5A 4TRYA 2ZJIA 3SO9A 3OHFA 4GJ9A 5P20A 4J0PA 3EKXA 3CKRA 4Y45A 1FMXA 2QHYA 2BBBA 2PK5A 5P52A 3VYEA 3VV6A 4HA5A 4LXMA 4DV9A 2HM1A 1WKRA 5HVPA 5P5TA 3INFA 5DPZA 1T7KA 3PSUA 3T7QA 5P43A 5P5CA 5DR7A 1HPOA 5COKA 5P0ZA 4EQJA 5P8SA 5P76A 3S53A 4Z2ZA 4GYEA 1W5WA 5COOA 4GZFA 5P6HA 1IBQA 4Y53A 1AM5A 5P4WA 2XFKA 5P0FA 5P4JA 2FXDA 2QI0A 2VJ7A 1FG6C 3EL1A 5P7KA 5P11A 4QJ2A 4FSLA 4Y4WA 4EWOA 4I8ZA 2QHZA 1E81E 2R3TA 5P8FA 4Y3QA 3OXCA 4DJUA 2IL2A 4Y4TA 1TZSA 5P6PA 5P59A 1EC2A 2G27A 5P06A 5P3EA 2VIZA 1PROA 2CEJA 4YBFA 4UPJA 3Q3TA 2QP8A 5OYQA 1XL2A 3BUHA 2FDEA 4Y5LA 3BRAA 2OF0A 4R93A 2O4PA 4K4QA 1FF0C 3VUCA 2I4WA 2J9JB 3QVCA 1GVWA 5P3BA 1PSNA 2ZHUA 5P5YA 5P5XA 3BVBA 1MPPA 1BWAA 2QU3A 5P28A 5P4AA 5P2IA 1HPVA 3T6IA 5P7MA 3UDQA 5P7YA 1C6YA 3KMXA 3VLBA 1APVE 5AH7A 4AZYA 5P12A 3GI0A 4ZIPA 2NNKA 4ZLSA 5P8BA 5P3LA 1UH9A 4KB9A 3CKTA 5AHCA 5P3ZA 2VA6A 5P3UA 4NPTA 4Y57A 4ZSPA 5P6VA 5P16A 4BFBA 1LF3A 4NPUA 1IVQA 2V13A 3K5FA 3LIVA 2PSGA 4PPHA 1MRWA 2V12C 2OHRA 5KQYA 2IGXA 4GJBA 2AZ9A 3OAGA 5P5GA 5P5LA 1B5FB 2QU2A 3TKGA 2G1SA 4Y3FA 2AOHA 2AOCA 2UPJA 2AIDA 5P5WA 3RTNA 4PZXA 3FV3A 1K2CA 1IDAA 5P51A 2WF4A 2HB3A 5P61A 1HIVA 3QI1A 1K2BA 4Y3MA 1FFFC 5P44A 2IDWA 1EPQE 1K6TA 4Y5CA 4DI2A 5ISJA 3TH9A 4B1EA 2NTRA 4Y4UA 5P3XA 2ER6E 2ER9E 4RRNA 5CLMA 4YOBA 5P25A 4B72A 5P4UA 1YG9A 2PH6A 4LHHA 3HAWA 3OQKA 5OZZA 3VFAA 1ZSFA 1EPNE 4Y3TA 2F3EA 1DPJA 1WBMA 5OZQA 3ZMGA 1W6IA 4Y3ZA 1G2KA 3PMUA 2G1RA 4OBFA 4GJ8A 2CEMA 5JFPA 4QLHA 4DH6A 2HC0A 4Y5BA 4D83A 4YDFA 5P22A 3SA3A 1RNEA 4CP7A 1ENTE 4RVXA 2BPYA 5JFUA 2V11C 4Y4GA 4L7JA 5P85A 2WL0A 2OHUA 3EKVA 3K5GA 3WB4A 1NH0A 5P10A 1FQ6A 1TSQA 1Q9PA 4LAPA 3T7PA 3VF7A 2OHQA 4H3JA 3VYDA 2WECA 5P2SA 4NJSA 4EQ0A 5OZLA 5OYSA 1HXBA 5P6RA 4I0DA 1QS8A 2G69A 4FRSA 1FG8C 5OZOA 5P4LA 4LC7A 1N49A 5KAOA 4JPCA 4Y3SA 5P3AA 1BDLA 5P0RA 3NDTA 3VLAA 4J55A 3GGUA 3BHEA 3K1WA 5P2AA 4ZPEA 5P7DA 2PYMA 3LPJA 1SDTA 5DR4A 1B6PA 5P3VA 3BGBA 5P69A 3OU3A 4L1AA 2F3KA 1K1TA 1BV7A 5P4FA 3HBOA 4RRSA 1YTIA 4EPJA 2NR6A 1ZBGA 3PCWA 4KE1A 2IEOA 5AGZA 3PJ6A 3ST5A 2VJ6A 4Z4XA 5FIVA 1MRXA 3KA2A 1T7IA 2I4DA 3LZSA 3GGAA 4B0QA 5I3WA 4DUSA 1PSOE 3LZUA 5P6UA 4A6CA 2QD7A 3O9EA 3NLSA 3SA5A 1HPXA 2PQZA 3G6ZA 2A4FA 4TVHA 4L7GA 5OYYA 5P1NA 5OZYA 5P1MA 4FGXA 3OXXA 5P6JA 5P00A 4CKUA 3LNKA 1HSGA 1ZJ7A 3DM6A 5P6XA 3VV7A 5IE1A 5P0GA 4I12A 1YX9A 3D91A 3KF0A 5P0BA 1EBWA 5P55A 5P47A 4Y3AA 5P3PA 2NMZA 1BXQA 3TLHA 3O99A 5P6TA 2ER7E 1SIVA 2B60A 2BB9A 3FSMA 4R95A 3S2OA 1VIJA 4EJ8A 5P35A 1SGUA 5P7GA 1LYBA 4DQBA 2IKOA 5P4DA 5P0JA 5P0XA 1HVIA 5OYWA 4Y35A 4Y4AA 5OZDA 1MT9A 4HVPA 1F7AA 4FSEA 3O9GA 4KE0A 3NWQA 5DQ5A 3UDPA 4J1IA 2PSUA 1AIDA 3HD8A 5P1PA 5P2CA 1YTGA 3UHLA 3EL5A 1XDHA 4APEA 3KDBA 5OYXA 3ZL7A 4DJYA 2Q63A 1CPIA 5P7OA 1CZIE 4Y58A 3LIZA 1MT8A 3INEA 2Q15A 5P7ZA 5DQ1A 3SABA 3APRE 5P09A 5P60A 2R5QA 2Q5KA 5P0EA 4RVJA 2AOGA 3INHA 3QIHA 5P56A 1EBYA 3ZKQA 4R91A 4DPFA 3TOFA 2XFJA 2ZJLA 3EM4A 5P0OA 1U8GA 5KQXA 5DQCA 3MXDA 5P7LA 5P78A 1PSAA 1MESA 5ENMA 5P7UA 2ZJHA 3OU4B 4DQHA 3EL4A 3T3CA 2HPEA 4Q1WA 1QDMA 3NUJA 4GMIA 1IZIA 1NPWA 4AA8A 4EYRA 5P0IA 3ZLQA 5P8NA 2FGUA 5P49A 3IXOA 3QRSA 4FCOA 5OZIA 2RKGA 1TQFA 3S85A 5P8CA 5P2LA 2G26A 1FMBA 2B7ZA 2Q55A 3O9LA 1K6PA 5HDZA 6UPJA 2QD8A 2JE4A 1FEJC 2QNNA 3OU1A 5P7BA 1HTRB 1SIPA 4WY6A 2BQVA 1APTE 3IN3A 3DJKA 3KFNA 4Y3GA 2A1EA 1ODWA 3K5DA 4PEPA 1PPLE 4J1FA 5P5QA 4CPTA 2UXZA 4B05A 4JPEA 1UH7A 4Y5AA 5KR0A 2QMFA 3HVGA 5P6FA 1EPRE 2OHSA 1A8GA 4Y3PA 1ODYA 2P4JA 2FGVA 2P8HA 1Z1HA 2QI1A 3O9FA 3OQAA 4Y3YA 5SY2A 5P1IA 3KDCA 4YBIA 1EEDP 1HHPA 3S8IA 5P0MA 4LP9A 3FNTA 1ME6A 1HVHA 5P2KA 5OYUA 5P71A 2QNPA 5P23A 3WZ8A 4FLGA 1RV7A 1HXWA 3FX5A 5DGWA 2OHPA 3CIBA 3UTLA 1OD1A 4JOOA 5P4YA 3SLZA 3QRVA 1BVEA 3I7EA 4OBGA 2XYEA 3C9XA 2ZJNA 4R5NA 2IGYA 4Y56A 5P7EA 4ACXA 2AOEA 5F00A 4GJ5A 1DIFA 3D3TA 5P3CA 1GKTA 3OGPA 1W6HA 3L58A 5P8EA 5P6LA 2ZE1A 4Y5KA 3RVIA 3ZPUA 1APWE 3Q6YA 4Y3JA 1EPPE 4A6BA 4XX3A 5OZAA 1WBKA 1NSOA 2I4UA 5P4ZA 4Y48A 3UFLA 2BKTA 5P30A 3L5CA 3PRSA 5P6DA 4M8YA 4H3GA 2UY0A 3TPLA 5P5KA 5P3HA 1MT7A 4BEKA 3SM1A 3ZPSA 1XN3A 1AVFA 1ZPAA 1RL8A 3HVPA 3UPJA 1EPME 2RMPA 2G1OA 5JG1A 2P3DA 3IGBA 3OOZA 5P38A 1OHRA 4GJ6A 3QBHA 1LF2A 5ENKA 3L5DA 1MUIA 4D88A 2Q54A 5P3OA 3OY4A 3QS1A 5TOLA 2O4LA 4B1DA 5P8VA 4J54A 2BPWA 3UDJA 1W51A 2VIEA 2QCIA 4Y54A 3HAUA 2CENA 5P1RA 4N00A 3KN0A 4B1CA 2I4QA 3I6OA 4H3IA 3VYFA 1D4JA 4OD9A 2P83A 3T11A 5P79A 3R0YA 2OHTA 4QJ8A 5DR3A 5P1BA 3VV8A 3KM4A 2HB4A 5OZFA 5KQZA 5P7QA 1MSMA 4ZSQA 3B7VA 4OBJA 4Y3LA 4DQEA 2AZCA 5HE4A 3CMSA 4S1GA 5P8QA 1SH9A 1PFZA 3MXEA 2B8LA 5P8LA 4JECA 4HEGA 5HTZA 3OTYA 1HVKA 1BIMA 2I4VA 2NMYA 1ZAPA 5P24A 2P3BB 3U71A 3KFPA 5P7WA 3ZKIA 5P8MA 1C6ZA 2G20A 4DQFA 2FIVA 2V0ZC 5P5RA 5P5MA 1B6LA 5P8UA 4D8CA 5ER2E 3QP0A 3OUDB 1APUE 1HEFE 5P36A 3PLLA 3Q5HA 3SKGA 1MVPA 3OXWA 4AA9A 3SKFA 5P6QA 3APPA 4I0ZA 3EXOA 4QJ7A 4RCFA 1SP5A 3UDKA 4DJPA 1MIQA 5DR1A 5P8AA 4WY1A 1BV9A 5P8IA 3PWRA 3IN4A 4Q1NA 4GJAA 1FQ7A 1K6CA 3KT2A 4Y4BA 4OC6B 5P6CA 5IVQA 3OQDA 4OBKA 4FIVA 3DK1A 2AVVA 1DMPA 5P83A 3G72A 5P66A 3M9FA 5P77A 2PWRA 4Y5MA 7UPJA 1EC3A 4FL8A 1KJ4A 4F75A 4RYGA 2PH8A 3S7MA 2I4XA 4J0YA 2J9JA 5P5NA 2AVSA 1DAZC 5BRYA 3PGIA 5P4PA 5OYVA 5DR8A 4PHVA 5P0NA 4EHCA 5B18A 1C70A 3LITA 2OHNA 2QAKA 5C9DA 1HPSA 5KOSA 2IQGA 5P4VA 5P2RA 5P5HA 5P5AA 3PSGA 1HWRA 3S43B 3OK9A 3PBDA 3LIXA 5P8DA 3ZKSA 1HTEA 5COPA 2P3AA 5P5OA 3R2FA 5P3YA 1LYAB 3O9HA 3VCMA 3MSJA 5APRE 1B5FA 3L5EA 2ANLA 4Y3HA 1SDVA 2PK6A 3MWSA 5P1GA 4H1EA 4RCEA 1Z1RA 1GNOA 1SBGA 5P63A 4K4PA 5OZMA 3TOHA 5P0QA 5P0VA 1LZQA 2XYFA 3SFCA 5P2MA 2ZHVA 5SXNA 3PM4A 5P70A 2IS0A 5OZ4A 3UQXA 3EKPA 3EKWA 4RROA 1QBTA 3A2OA 4DPIA 3CYXA 4HDPA 3NU3A 4Y43A 3TKWA 1KJGA 1QBSA 4U8WA 4K8SA 5E5KA 5P6GA 4I0HA 1SMEA 2Q64A 2VKMA 4Y41A 5P7VA 4XX4A 2V00A 3VF5A 3BUFA 5P0UA 4ZE6A 3BUGA 3QRMA 3DUYA 4Y3EA 1LV1A 3QPJA 2QK5A 5P6ZA 5P89A 4Y9WA 2IENA 2VJ9A 1OEWA 2OHKA 5OZWA 1PPME 1RPIA 2I1AA 4I0JA 1B6JA 5IVRA 2HIZA 1BXOA 4ZSMA 4B00A 1K6VA 4NKKA 5AHAA 2V10C 1FB7A 3LPKA 1TCXA 3B80A 4I0FA 4OBZB 1XN2A 3EMYA 2WF1A 2JYSA 5P3GA 4Y5GA 1IZEA 2R3WA 4YD4A 5P03A 4APRE 1C6XA 2HB2A 3SM2A 5OZTA 5DR0A 3VEUA 1KJFA 4J0VA 2QZKA 4PZWA 3FKTA 5DGUA 1W5XA 4QJ6A 3IVIA 1MSNA 4YCTA 3R0WA 5P1DA 4RZ1A 5P3TA 5P39A 3LPIA 4ZSRA 3QBFA 2NXLA 5OZKA 5P3SA 1GVVA 3ZKMA 3EL0A 5P2EA 4DFGA 5P6BA 3VF3A 4YA8A 2ZJJA 4JP9A 3UFNA 4HDBA 2PSVA 1AXAA 2OHLA 1UPJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P3J A;  4GID A;  3NXE A;  5OZH A;  3UCB A;  1F34 A;  2VS2 A;  1D4I A;  1FQX A;  5P2D A;  4ER4 E;  4I10 A;  1Z8C A;  3OUC A;  4J17 A;  5P1J A;  5P7A A;  5P75 A;  4Q1Y A;  3RSV A;  5BS4 A;  2HS2 A;  5I70 A;  4EJK A;  1SMR A;  4DQC A;  3URI A;  3TPP A;  5P4B A;  1FLH A;  3URJ A;  5P2U A;  4CPR A;  4RYC A;  5P1Y A;  1ODX A;  5OZR A;  4X7I A;  2ZDZ A;  5P8G A;  3OQ7 A;  1ZTZ A;  1ZSR A;  1E80 E;  1GVT A;  5P5B A;  5P0C A;  5KQF A;  1T6G A;  5P3R A;  1W50 A;  1LYW A;  2G1Y A;  5P86 A;  5P0A A;  5P3M A;  5PEP A;  5P45 A;  3H0B A;  4Y3X A;  4J5J A;  3PCZ A;  5P29 A;  2QI4 A;  3IVH A;  3SAA A;  2WF2 A;  1ZPK A;  3WSJ A;  5T4S A;  3TNE A;  2QMD A;  4FM6 A;  1W5V A;  2VNM A;  5P1V A;  1M43 A;  3LZY A;  9HVP A;  5P7F A;  2G24 A;  1XE6 A;  4D85 A;  5F01 A;  2QI6 A;  5P3N A;  1QBR A;  3S45 A;  1MET A;  5P3Q A;  4FM8 A;  4MC9 A;  1AJX A;  3K4V C;  5P73 A;  3GGV A;  4IVS A;  4IVT A;  3K5C A;  5P27 A;  3S56 A;  4B78 A;  1NPV A;  4Y4X A;  4ER2 E;  1AAQ A;  3TPR A;  3EKQ A;  5C9B A;  3O9B A;  2NPH A;  5P3F A;  4ZPG A;  3UDN A;  1D4K A;  5P3W A;  5P1A A;  2J9K A;  1HSH A;  1KJH A;  2JJJ A;  1ZLF A;  3TTP A;  4Y39 A;  1B6M A;  3SA9 A;  5KR2 A;  2AOI A;  3VG1 A;  2OAH A;  5P08 A;  1GNN A;  5P15 A;  3NXN A;  2REN A;  5P37 A;  3D20 A;  3UDR A;  1KZK A;  3PI5 A;  4L7H A;  3VSX A;  3JW2 A;  5P87 A;  5P34 A;  1KJ7 A;  4OD9 B;  1A94 A;  1MTR A;  3UDY A;  5I3X A;  4TRW A;  5P0P A;  2AVM A;  1SDU A;  5OZ7 A;  4F74 A;  1FQ5 A;  1EBZ A;  1YTH A;  2QHC A;  3NU6 A;  3VSW A;  3WB5 A;  4TRY A;  2ZJI A;  3SO9 A;  3OHF A;  4GJ9 A;  5P20 A;  4J0P A;  3EKX A;  3CKR A;  4Y45 A;  1FMX A;  2QHY A;  2BBB A;  2PK5 A;  5P52 A;  3VYE A;  3VV6 A;  4HA5 A;  4LXM A;  4DV9 A;  2HM1 A;  1WKR A;  5HVP A;  5P5T A;  3INF A;  5DPZ A;  1T7K A;  3PSU A;  3T7Q A;  5P43 A;  5P5C A;  5DR7 A;  1HPO A;  5COK A;  5P0Z A;  4EQJ A;  5P8S A;  5P76 A;  3S53 A;  4Z2Z A;  4GYE A;  1W5W A;  5COO A;  4GZF A;  5P6H A;  1IBQ A;  4Y53 A;  1AM5 A;  5P4W A;  2XFK A;  5P0F A;  5P4J A;  2FXD A;  2QI0 A;  2VJ7 A;  1FG6 C;  3EL1 A;  5P7K A;  5P11 A;  4QJ2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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