1EPQE

Endothia aspartic proteinase (endothiapepsin) complexed with pd-133,450 (sot phe gly+scc gcl)
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title Analyses of ligand binding in five endothiapepsin crystal complexes and their use in the design and evaluation of novel renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 80
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1994-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1epqE02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1epqE01
3QVCA 4J0YA 4J0PA 3VLBA 3D1ZA 2OF0A 3ZKXA 5P2BA 2OHUA 2O4NA 2HPEA 4CKUA 2NR6A 3TPRA 5OYVA 5HTZA 3RTMA 5P6MA 1HVLA 4DQBA 4LAPA 1HPVA 4ZSMA 2WEZA 4I0DA 4Y3ZA 1G0VA 4GYEA 5P8QA 1PPLE 1HPOA 3N4LA 3LZUA 3ZKGA 1QBSA 3MWSA 4JPCA 5P4IA 1FMBA 4LXMA 3NSHA 3ZPTA 4NJTA 5P8DA 3PEPA 2IENA 4MC9A 3OTYA 5P53A 5P8RA 4PYVA 5P23A 2AVVA 3PI0A 4NJVA 3B7VA 5OZMA 3ZL7A 2I1AA 3QBHA 1YG9A 3ECGA 1EPME 3ZKSA 1YTJA 5P7ZA 3T6IA 3LPJA 4EQJA 4S1GA 1ODWA 5OZPA 4XX4A 5P8CA 4Y37A 3L5DA 5P10A 5P78A 3S8IA 3TL9A 2A4FA 1LS5A 2QD8A 4MC2A 5P6EA 1PROA 3SPKA 4F74A 1SDVA 4J17A 3SKFA 1SIPA 2QI3A 5OZQA 4FCOA 5HDUA 4DJOA 1AZ5A 5P44A 4KUPA 4DJQA 1HEGE 5P02A 3IAWA 2HB3A 5AGZA 5P3UA 2Z4OA 3CKPA 3BVAA 4B00A 1ODYA 1FMXA 1GNNA 5P7JA 1EBKC 5P46A 5P2WA 1MTBA 1IZEA 5P0WA 3S43B 2FDEA 5I3VA 3IVHA 1IIQA 2OHSA 5P65A 5P68A 3GI5A 3SA8A 4FE6A 1D4LA 5P1AA 2I4UA 1OEWA 5ER2E 5OZRA 5P4PA 5P6KA 5P8NA 4DJVA 2Q11A 4DUSA 5P6JA 3UQPA 4QJAA 5KOSA 1FQXA 1T6GA 3IXOA 4GJ5A 1B6PA 3LIVA 3OGQA 5P4NA 2XYEA 5P71A 4EXGA 3QPJA 5FIVA 4RCFA 3UFNA 3SA3A 1NPWA 4Y53A 4FRSA 2EWYA 2ZJKA 5P05A 1T6EX 1IZHA 1Z1RA 5P6LA 1HSHA 2F3FA 3EKVA 4RYCA 5P37A 2G1RA 2I0DA 1A8GA 5P4DA 2AZ9A 3VLAA 1HTRB 4HEGA 3O9FA 3LZVA 5DQCA 2BKTA 4PZWA 4Y3LA 3GGVA 4FRIA 1MVPA 3URIA 3UDYA 4RCEA 5P5TA 1ER8E 5HE7A 3K5GA 3VF3A 5P7CA 5P7FA 1XL5A 2AZCA 5P0YA 5P2ZA 4ZPEA 3L59A 2PC0A 3SQFA 2QMFA 5DGUA 1UH9A 5P4OA 1MRXA 2PH8A 3S43A 1HVIA 2P3CA 5P54A 4Y43A 5P45A 3NUOA 3R0YA 2PK5A 3LHGA 5P07A 2BPXA 4A4QA 5P30A 3JW2A 5P0JA 5P2LA 1W5YA 5OYYA 3O9IA 1VIJA 5P1HA 1K6VA 1MSMA 2VNMA 3L58A 4DV9A 4YOBA 3KFRA 4R5NA 1APTE 5P3KA 3TLHA 5P28A 1PSOE 3O9GA 3SM2A 1MERA 4B0QA 2IDWA 3HAWA 5P2HA 3A2OA 5OZCA 3MSKA 5OZ1A 3UTLA 1NPAA 3S53A 5P4HA 3OUBA 3L5CA 2AODA 4DVFA 4Y4JA 4Y44A 4DQGA 5OZJA 5P5AA 2QHCA 4XKXA 1D4YA 2Q54A 4L7HA 4DH6A 3I2LA 5P2QA 3OADB 2PH6A 3D91A 5SXNA 1EC1A 4Q1NA 1BXQA 3KDCA 5IS4A 5P3XA 5P6YA 5P04A 5OZ8A 5P18A 5SY2A 4R95A 4Y3NA 5DR4A 5P7EA 5P5GA 5P14A 5P74A 3FNTA 2CEJA 2BB9A 5P5YA 3LINA 2R9BA 5KR2A 3ER5E 3WB5A 1PPKE 5P7YA 5P32A 5P1CA 4Y3AA 2ZHSA 3GI0A 2G20A 2R3TA 2ER6E 4ZPFA 2AOFA 2ZDZA 2Q5KA 1JLDA 3S7MA 5IE1A 3ZMGA 2VJ7A 3R1GB 2OHTA 1E5OE 4B1CA 1OEXA 4YHQA 5P27A 4D85A 4OC6B 5P22A 3QS1A 5OYUA 3BUHA 4ZIPA 3VF5A 3PCWA 1HEFE 3QIHA 3RSVA 3SLZA 1EBWA 3SA5A 3RTNA 3APRE 2AOIA 3UHLA 3TH9A 2PK6A 3GGAA 4NJSA 2IS0A 5P7OA 1XE5A 4YD7A 5P5DA 5CLMA 1CZIE 1MRWA 2QCIA 4K4QA 4Y4GA 4GJ7A 3OADA 3LPKA 2ZGAA 2HIZA 1D4SA 4ER2E 2AOJA 5P84A 5P50A 5P1XA 3L5BA 2QMPA 4GJ9A 5P8TA 5P6CA 1PFZA 2HS2A 1BDRA 3EKPA 4Y3PA 5P6PA 2QZWA 4J1FA 3O9AA 4LBTA 4AMTA 3U71A 1KJFA 1EC2A 5P1KA 3OAGA 3UDHA 3DV5A 1SIVA 4A6CA 1QBTA 3EKYA 1HPSA 4EYRA 4YA8A 4PHVA 3UCBA 1HIHA 4RYGA 2FDPA 2IL2A 4I10A 2QI5A 2FMBA 2NPHA 4AZYA 4DPFA 5HD0A 2VKMA 1IBQA 1SH9A 5P5SA 5I3XA 5OZ5A 4XX3A 3DCRA 3VF7A 4OC6A 5P5WA 2G1YA 5P3MA 2QZXA 2ASIA 5P1OA 3H0BA 4JPEA 9HVPA 5P0OA 3NU5A 1UH8A 4EP3A 4OBZA 5P67A 2P4JA 2WF3A 5OYSA 3D1XA 4L7GA 4Y4EA 1DMPA 5P3CA 4QJ8A 4J54A 5OZTA 4LC7A 1AVFA 4Y3WA 3EMYA 5AH9A 3TKWA 5P4JA 1YM2A 2I4DA 5P86A 3KFSA 3OOTA 3NR6A 4CPTA 3TPJA 5P2XA 1LEEA 4ZE6A 5P2GA 3WZ8A 4EJ8A 2P3AA 5P2UA 3KDBA 5P6GA 2P3DA 3QRSA 1RQ9A 3B80A 1J71A 3EKQA 5P2IA 2PSGA 4B78A 2ZJHA 4ZSRA 5P0AA 5P0XA 2BQVA 6FIVA 5P8OA 5P4VA 1APWE 4JOOA 3PBDA 2FS4A 4JECA 3ZKIA 2HM1A 3T11A 1PSAA 4U7VA 3O9BA 4GJDA 4GJCA 2WEBA 4YD5A 5P6NA 1HVJA 4DQHA 1DW6C 1K1TA 4Y4XA 5IVSA 2IEOA 4OBGA 1ZPAA 1FGCC 4HE9A 5P1ZA 5P85A 2HPFA 1UPJA 2UXZA 3L5EA 2FLEA 5HCOA 5P55A 4Y50A 4OBJA 3UDKA 5P4TA 3O9HA 3HVGA 2P3BB 4R92A 5P2EA 3QRMA 2HB4A 1KJ4A 5E5KA 4DJUA 5OZWA 5P6ZA 5P41A 3T7XA 5P1SA 1A94A 2QD7A 1XE6A 4PEPA 3O9EA 3ZLQA 4EJKA 1PPME 3CKTA 5KR0A 2G94A 2P83A 4GIDA 4YE3A 5DQ1A 3GI4A 4EXHA 4DI2A 4EHCA 2AIDA 1HBVA 1GNMA 3HBOA 5JG1A 5P5JA 1ZBGA 3ZKMA 2G1NA 4J0VA 5P5BA 3SA9A 1SMEA 5P4SA 1IDBA 5P1RA 2G69A 5P3SA 4Y5CA 2HC0A 3IA9A 1EBYA 3KYRA 3RVIA 5OZ2A 1D4JA 4H1EA 4YD4A 5P80A 5DPZA 3VEUA 5P1GA 2BKSA 3SABA 5P8GA 4QJ9A 5SY3A 5OYRA 5P6UA 4K9HA 3RSXA 3OQKA 2NMZA 5P75A 2AOGA 2WJOA 4M8YA 5P2KA 3OQFA 5OZZA 4I0GA 2QK5A 3QAAA 1BWBA 5P7AA 4Y3DA 4FL8A 5P2VA 5P4BA 2P3BA 1LF4A 5OYXA 1G6LA 5P4UA 3OU3A 4J1EA 2G22A 5DR7A 1AJXA 4A6BA 5P66A 4B1EA 1FQ5A 2FNTA 3IN3A 4J1IA 4YBIA 1B5FB 4FSLA 4Y4UA 5P13A 3O99A 3DV1A 5P2RA 3BVBA 5P1VA 4H3FA 4PPHA 1HOSA 2AZ8A 4Y3JA 5OZ3A 4Y3YA 2P8HA 1D4KA 5P0QA 1FG8C 2NXLA 5P6DA 3NWQA 1E81E 2V13A 3KFNA 2ZHTA 5AHAA 5P72A 4RVJA 5P1DA 2ZE1A 1FQ8A 2VIEA 3BUFA 5P15A 5P01A 5OZVA 4I0JA 1KZKA 4KB9A 4FGXA 4FAFA 3LIYA 1BDQA 1TCXA 5P5FA 3VYEA 1FB7A 3ZOVA 1QBRA 2WEDA 4CPRA 3BXSA 2AOHA 3FIVA 3K5CA 1EEDP 3TNEA 3HLOA 3SFCA 1LYAA 5HU0A 2QI4A 5P4EA 1HTGA 1TSQA 2QU2A 3ER3E 5P4MA 4BFDA 3DOXA 4I0FA 4YCTA 1PSNA 5P5ZA 1FQ4A 1K6TA 4D83A 2O4KA 3L5FA 5F01A 2I4WA 2NXMA 3OTSA 2J9JB 5P36A 3DK1A 1T3RA 5P0CA 4GJ6A 1B5FA 2FDDA 5P52A 5OZLA 4J5JA 2BPWA 5P2OA 2Q3KA 5COPA 3LITA 5OYZA 1FF0C 4AA9A 3CMSA 4QJ6A 1HVSA 3OU1B 5P7GA 2FIVA 5P4XA 5B18A 2ZHVA 5P6SA 4RGHA 1C6YA 4LL3A 3PLDA 3OXWA 4R8YA 4Y3QA 1KJGA 3BHEA 4FM8A 4NPTA 3BGCA 4M8XA 5P8VA 1M43A 2B60A 3NU4A 4APEA 2BBBA 3IXKA 5P7BA 5P5CA 5P6OA 3R0WA 2F3EA 2V0ZC 1Q9PA 2QHZA 5P0NA 1AIDA 3NUJA 1LZQA 4Y3SA 2SAMA 3S85A 2HAHA 4Y56A 5EZZA 3HVPA 1ZP8A 3NXNA 2BPYA 3N3IA 3T7QA 3F9QA 1MESA 3BUGA 2ZJMA 3ZPSA 2H6TA 3CKRA 5DQ4A 2OHPA 1HVHA 4DJXA 2J9JA 3VCMA 5AH8A 2Q64A 3S7LA 3DCKA 4CPWA 2AVQA 4J55A 3DM6A 3PVKA 1E82E 5P17A 5P2AA 4GMIA 5P2NA 5P62A 3OU1A 5P7DA 3NYGA 1EPLE 4ZSQA 8HVPA 5COOA 5P1LA 1APVE 5P0FA 5P7IA 5P1PA 3C9XA 1RNEA 1MT7A 1BXOA 1OD1A 3QBFA 4OBHA 3T7PA 1WBKA 3EL0A 4ZPGA 4CPSA 2XYFA 5AHCA 3OU4B 4GZFA 5OZFA 1M4HA 5OZ0A 2V11C 4RVXA 2ER9E 2PWRA 5P1MA 2ZJNA 4HDBA 5P69A 5I3WA 3I25A 4Y4ZA 3I6OA 4FM7A 5P1BA 3CYWA 4GJ8A 3L3AA 3LIZA 3LPIA 3PSGA 3NXEA 5P39A 1YTIA 5P6BA 2F3KA 3UDPA 3S54A 5P29A 4QGIA 1MPPA 3LIXA 1SGZA 4L7JA 2PYMA 4Y4TA 3NDTA 3OQ7A 2JXRA 4HA5A 4Y6MA 5P00A 1FFFC 3IVIA 1LF2A 2FXEA 5P48A 2UPJA 2WF4A 5P2JA 5KQZA 5KOQA 5P0IA 3WZ7A 5P24A 1Z8CA 5P47A 3D20A 4Y5NA 3PRSA 2XFJA 1SBGA 3TPLA 2ER7E 5P7VA 4Y5EA 1SMRA 5P6TA 3PWMA 1GNOA 2XFKA 3PCZA 2G21A 3JVWA 5DR8A 1MIQA 3CYXA 2XFIA 3ST5A 4HLAA 5OZIA 5P7MA 3OAGB 5P8AA 1LV1A 2VA6A 5P6RA 3KM4A 3OU4A 5P7RA 1SDUA 3FNUA 2QP8A 4Q1XA 4I8ZA 4Y5AA 1EPRE 4LP9A 5P43A 3RU1A 4Y5GA 4OBDA 5APRE 3Q5HA 1U8GA 5OYQA 4LXKA 5DQ2A 2PYNA 3SA7A 5P4GA 3EL9A 3IN4A 3H5BA 4Y41A 5HDVA 1HSIA 4F76A 3D1YA 4OBZB 4B1DA 4LXAA 4Y3XA 2VIYA 5P3WA 5P8KA 3S45A 5P20A 4YCYA 4X7IA 1RV7A 1YX9A 5P7XA 1FFIC 2I4XA 4RLDA 1HIIA 5P03A 1FMUA 1W50A 1XDHA 4ZSPA 4OD9B 3OUDB 1G2KA 3NDWA 4KE1A 3PMYA 1ZSFA 5ENKA 1GVXA 3TOFA 4RRNA 1FQ6A 5HVPA 5OZAA 5OZ7A 4JP9A 2NXDA 5KAOA 4Z50A 3K1WA 4Y3EA 4B77A 5IVQA 4I12A 3BGBA 5P0HA 4ER1E 5P3PA 5P4YA 5P5OA 4ZLSA 3GGUA 5P76A 3PSYA 5EZXA 5P4AA 3PGIA 5AHBA 2QHYA 1E80E 2F80A 4J0TA 5J25A 3SO9A 4OBKA 1HWRA 5P1UA 3ZPUA 4Y4AA 5JODA 5P5HA 5P73A 4Y3TA 3WZ6A 2AOEA 5P0VA 4OBFA 2V00A 1TCWA 5P16A 3R2FA 4Y39A 5OYWA 1CPIA 3T3CA 1MSNA 1T7IA 3HZCA 1AXAA 2VA5A 3PJ6A 2G27A 5P3OA 4Y38A 5ISKA 5P5IA 2ANLA 4YDGA 4YOAA 5P4RA 2APRA 2NTRA 5P3RA 3UDJA 5UPJA 6APRE 1XL2A 1LYBB 4OD9A 3OUDA 1B6KA 4EQ0A 3U6AA 3OUAA 3VV6A 5P61A 4J0ZA 3EL4A 4H3GA 4GJBA 5P4ZA 4ACUA 3SM1A 5COKA 5P5PA 1GVTA 1MEUA 5P49A 5P0UA 2IGXA 1AM5A 2QNQA 3I8WA 5OZXA 3G70A 4NKKA 5P3TA 4GJAA 5KQXA 2OHLA 3UF3A 3Q4BA 2VJ6A 5P0EA 4TVGA 5P2SA 4Y5MA 4Y3HA 5P12A 3MSLA 1ZTZA 3PM4A 4FS4A 4HDFA 5P70A 4RRSA 2WF1A 2G24A 3G72A 5P0GA 3URLA 5P2FA 4H3IA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3QVC A;  4J0Y A;  4J0P A;  3VLB A;  3D1Z A;  2OF0 A;  3ZKX A;  5P2B A;  2OHU A;  2O4N A;  2HPE A;  4CKU A;  2NR6 A;  3TPR A;  5OYV A;  5HTZ A;  3RTM A;  5P6M A;  1HVL A;  4DQB A;  4LAP A;  1HPV A;  4ZSM A;  2WEZ A;  4I0D A;  4Y3Z A;  1G0V A;  4GYE A;  5P8Q A;  1PPL E;  1HPO A;  3N4L A;  3LZU A;  3ZKG A;  1QBS A;  3MWS A;  4JPC A;  5P4I A;  1FMB A;  4LXM A;  3NSH A;  3ZPT A;  4NJT A;  5P8D A;  3PEP A;  2IEN A;  4MC9 A;  3OTY A;  5P53 A;  5P8R A;  4PYV A;  5P23 A;  2AVV A;  3PI0 A;  4NJV A;  3B7V A;  5OZM A;  3ZL7 A;  2I1A A;  3QBH A;  1YG9 A;  3ECG A;  1EPM E;  3ZKS A;  1YTJ A;  5P7Z A;  3T6I A;  3LPJ A;  4EQJ A;  4S1G A;  1ODW A;  5OZP A;  4XX4 A;  5P8C A;  4Y37 A;  3L5D A;  5P10 A;  5P78 A;  3S8I A;  3TL9 A;  2A4F A;  1LS5 A;  2QD8 A;  4MC2 A;  5P6E A;  1PRO A;  3SPK A;  4F74 A;  1SDV A;  4J17 A;  3SKF A;  1SIP A;  2QI3 A;  5OZQ A;  4FCO A;  5HDU A;  4DJO A;  1AZ5 A;  5P44 A;  4KUP A;  4DJQ A;  1HEG E;  5P02 A;  3IAW A;  2HB3 A;  5AGZ A;  5P3U A;  2Z4O A;  3CKP A;  3BVA A;  4B00 A;  1ODY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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