1EPYA

T4 lysozyme mutant, t21h/c54t/c97a/q141h/t142h
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDHEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNHHPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Use of a non-rigid region in T4 lysozyme to design an adaptable metal-binding site.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1epyA00
259LA 2RAYX 2B6XA 187LA 1CV3A 1L26A 1C6IA 192LA 2B74A 1G0GA 3SB8A 1L04A 1L24A 1LWKA 1C6BA 3C7YA 1L50A 238LA 126LA 1L0JA 3D4SA 1L61A 3DMXA 160LA 1EPYA 3C83A 171LA 4GBRB 1C63A 2CUUA 122LA 120LA 1L39A 1D9WA 188LA 3C8SA 1C6DA 1L54A 4I7PA 3SN6R 1L76A 4W52A 1L28A 2HUMA 4ARQA 108LA 4I7JA 1LWGA 1L18A 4I7NA 150LA 174LA 2RBOA 261LA 1KY1A 1L53A 1G0JA 3PBLA 110LA 1C66A 1CV1A 1L99A 152LA 1P2LA 225LA 190LA 2A4TA 1CVKA 1L84A 3HWLA 3GUMA 1LYIA 2B73A 2RBQA 119LA 1P5CA 1PQDA 3DN0A 1C6PA 1L66A 1QTBA 4W57A 211LA 1CU3A 131LA 1G1VA 1L63A 245LA 4I7KA 1C6AA 232LA 2OE7X 127LA 1D3NA 159LA 4AQNA 1L32A 1QS5A 1L35A 1L31A 217LA 2F47A 1L23A 3C8RA 3CDQA 145LA 118LA 123LA 1L64A 1QTHA 4S0WA 1L75A 1LW9A 162LA 2B72A 4DJHA 148LE 1LGWA 1QSBA 4EKQA 4OO9A 256LA 198LA 2Q9EA 2B6YA 169LA 1CV6A 138LA 112LA 226LA 1L80A 1L90A 1DYEA 2RB2X 1L69A 142LA 1T8GA 184LA 1CV5A 1PQJA 1L46A 2OE4X 4I7SA 1L14A 3C7WA 196LA 1CV4A 1DYDA 3GUIA 3HT9A 1P64A 1L41A 1D3FA 3ODUA 1L57A 1C6EA 213LA 4DAJA 1L12A 4W54A 2OU0X 3HTGA 4I7QA 3DN8A 4EKSA 1QTZA 1DYGA 2B6TA 170LA 1L15A 183LA 3G3XA 3C81A 231LA 2HULA 1KNIA 3OE0A 2OTYX 1CX6A 3NYAA 3RUNA 115LA 236LA 255LA 2ANVA 2B7XA 1LI2A 2B70A 114LA 3PDSA 1C67A 1C6JA 3QAKA 156LA 182LA 185LA 1QTCA 1QUOA 257LA 1QTVA 235LA 3V2YA 3SBBC 247LA 1DYAA 5LZMA 1G0KA 2ANXA 214LA 166LA 1P3NA 1LYJA 2RBPA 3HH4A 147LA 3HDEA 1LYDA 3DMVA 1L37A 1P2RA 3UONA 4EJ4A 1CV0A 3NY8A 1LPYA 137LA 1L81A 1L71A 157LA 4LDOA 1L55A 3VW7A 3GUOA 205LA 125LA 1L92A 1L22A 1C68A 2OEAX 1L0KA 2B6ZA 1L72A 1JTMA 1L51A 1QS9A 3GUPA 1PQKA 189LA 3C8QA 1OYUA 234LA 1L65A 2RBSA 1L70A 1LGXA 1OVKA 3HT6A 4DKLA 2O4WA 4EKRA 1L52A 1QT4A 1QUDA 1LYFA 4I7OA 1G1WA 3JR6A 258LA 1DYFA 3HTBA 3NY9A 3HUQA 1L68A 3SB6A 4ARQB 140LA 4LDEA 1G0LA 1KS3A 1CU5A 1CTWA 2RBRA 222LA 3C80A 241LA 3V2WA 1PQOA 128LA 146LA 1L49A 1P6YA 1LLHA 177LA 1OWYA 3OE9A 3DN3A 168LA 4I7RA 1L98A 3CDTA 195LA 1L21A 4EXMA 3OE8A 4W53A 3HH5A 1G0QA 3DN2A 3HUKA 1T97A 1SSWA 246LA 1L02A 3CDRA 1L87A 1P37A 2LZMA 1L82A 1G06A 1DYCA 1C62A 2B6WA 3OE6A 2O7AA 216LA 4ARPA 4EPIA 1L77A 212LA 2RH1A 1ZWNA 1QSQA 144LA 1L44A 1L16A 1L74A 1LYEA 1DYBA 102LA 1C61A 2RB0X 178LA 1C64A 3CDOA 1L85A 2LCBA 3C82A 229LA 1LYHA 3CDVA 4LZMA 1L00A 1L25A 1QT7A 240LA 1L43A 224LA 1B6IA 1P46A 167LA 3GULA 3SBAA 1L27A 165LA 1QT8A 249LA 2IGCA 180LA 2OE9X 1CUQA 4YXCA 1WTHA 1L47A 3RZEA 3SB9A 197LA 1T8AA 1G0PA 1C60A 1L45A 2QB0B 1L33A 1OVHA 1G0MA 3HT8A 2HUKA 1KW7A 130LA 1L42A 230LA 4W55A 1L05A 1C6GA 3HUAA 4I7LA 1XEPA 1L95A 1K28A 1LI3A 210LA 3G3VA 4ARLA 1T8FA 3DNAA 1L36A 1L38A 155LA 4ARMB 2L78A 2RBNA 1SX2A 1I6SA 254LA 1QT3A 4W58A 1C6FA 1CX7A 2OTZX 4W59A 158LA 251LA 221LA 103LA 1T6HA 3LZMA 1L89A 233LA 3DN1A 1P56A 4YXAC 4EPFA 2O79A 1D2YA 200LA 1XJTA 4ARJA 111LA 243LA 1L97A 250LA 1C6TA 141LA 1L17A 223LA 1L60A 218LA 1SX7A 3FI5A 3HU9A 3F9LA 3C7ZA 1D3JA 219LA 1OV7A 1L88A 3L2XA 1L01A 3GUNA 1SWYA 4I7MA 237LA 161LA 3G3WA 1XJUA 1L40A 1JQUA 3HTDA 3HU8A 173LA 3GUKA 1D3MA 1NHBA 242LA 1PQIA 1C6NA 1ZURA 3HH6A 248LA 4PJZA 215LA 209LA 149LA 175LA 3SB5A 1C65A 1QT5A 4GRVA 2QARC 1C6QA 4IAPA 151LA 1L62A 2RAZX 4K5YA 1L20A 1PQMA 1L03A 1L19A 2OU8A 220LA 206LA 1LYGA 3L64A 109LA 191LA 1L11A 1ZYTA 2NTGA 163LA 1L79A 199LA 1L07A 253LA 1CU2A 1TLAA 3EMLA 4ZPUA 1C6MA 1P7SA 262LA 1CU6A 1C6KA 1QUGA 201LA 3DN4A 4PK0A 3K2RA 4W51A 4EKPA 260LA 4W56A 1L09A 3HTFA 3DKEX 244LA 129LA 1L96A 2Z6BA 1L67A 176LA 1L91A 1OV5A 7LZMA 2B75A 252LA 172LA 1L86A 6LZMA 2F32A 2OU9A 1SWZA 2NTHA 1C6CA 1L13A 1L08A 5I14A 1L06A 1CUPA 1L94A 2Q9DA 186LA 1C6HA 1G07A 3FADA 1QT6A 1SSYA 1JTNA 1L34A 4YX7C 143LA 1KW5A 1C6LA 1P36A 3FA0A 1LI6A 1L59A 113LA 1L30A 1OVJA 1QUHA 3HT7A 139LA 4LDLA 3SB7A 1L48A 1C69A 3DMZA 1LGUA 227LA 1L93A 107LA 1L29A 1KY0A 104LA 181LA 1L73A 3GUJA 1OWZA 3DN6A 239LA 3HDFA 2F2QA 1L58A 164LA 1D2WA 4ARMA 1CU0A 3F8VA 4I7TA 1QTDA 1L56A 4E97A 3HH3A 228LA 2LC9A 1L10A 2RB1X 1L83A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HBEX 1VATA 2CGIA 4RW2A 1CV3A 3W6FA 4WG7A 1C6IA 1FLQA 1GF8A 192LA 4CFOA 1JKBA 3WW6A 2Y8PA 1LWKA 1C6BA 238LA 2CWIA 1WQQA 4TUNA 4RLMA 1L61A 1IWYA 3B0IA 4H94A 2BQBA 1C63A 2CUUA 1LPIA 120LA 1L39A 1C6DA 1LHLA 3SN6R 1L76A 1YILA 1JPOA 2HEDA 4ARQA 1LWGA 4M4OA 1L18A 3WUAA 4H8YA 1XGQC 1IOSA 1G0JA 4HSFA 3EXDA 1CV1A 1P2LA 3EBAB 1UIHA 1LSBA 4B4JA 1B2KA 4W94A 190LA 2A4TA 4HTKA 2B73A 3CB7A 3DN0A 4G4HA 1D0MA 4GN3A 1OQMA 4WG1A 1B7PA 245LA 1B7OA 127LA 5KXTA 4XJIA 4AQNA 4EOFA 2W1YA 5FDJA 5HNCA 1L23A 3C8RA 4XJHA 3B6LA 118LA 5LIOA 4HP0A 1VDSA 4ETBA 1LGWA 1QSBA 3P66A 5B1FA 4EKQA 256LA 4WLXA 3A90A 2B6YA 1LTMA 1YAMA 1L90A 132LA 1UC0A 3A95A 184LA 4I7SA 1L46A 4NGJA 196LA 1CV4A 4XN6A 4LFPA 4ET9A 1IP2A 4HJZA 3J6KA 2RSCA 4H9EA 3ODUA 1L57A 1C6EA 4PJ2C 1LSFA 1CKCA 4H9BA 2OU0X 4Z41A 3DN8A 4B4EA 4UWNA 4EKSA 1XGTC 3WPKA 4H9CA 183LA 5FEKA 3G3XA 3BKVA 1CX6A 3NYAA 5I4XA 2ANVA 2YBLA 1LI2A 1UIAA 4UWUA 1GFUA 1YKXX 1QTCA 1QUOA 1OP9B 257LA 3V2YA 2IFFY 3N9CA 4NGLA 147LA 2MEBA 3NY8A 1BGIA 1L81A 4MCKA 1GE3A 207LA 1IP6A 1WTNA 3VW7A 3GUOA 205LA 1J1XY 4MSTA 125LA 2MEIA 1L92A 1I1ZA 1I20A 1C68A 134LA 1LSZA 1GB0A 1BB7A 3CT1A 3LYMA 1L72A 1JTMA 1LZDA 1L51A 4WM2A 5B59A 5I53A 1D0KA 1XFPL 3WMKA 3N9EA 4WM6A 2RBSA 2BQOA 2FYCA 1JISA 6LYZA 2I26L 1L52A 1QUDA 4TX7A 1B7LA 4GLVA 1BVKC 4I7OA 1JJ1A 4GCBA 3P4ZA 258LA 4LYMA 1DYFA 1GBYA 3HUQA 1BB5A 1G0LA 2BQMA 2RBRA 4H9FA 5C6JA 241LA 146LA 1P6YA 1B7NA 2LYOA 4TSCA 177LA 1OWYA 3TMXA 1BQLY 1GE4A 168LA 1KXYA 1L98A 1LYZA 4LYCA 195LA 2W1LA 1IC4Y 4KT3A 1YAQA 5DL9A 5APEA 4DWXA 4HTQA 1LJ4A 3W6CA 1SSWA 5LINA 4J7VA 1L82A 1GAZA 3OE6A 2ZIKA 4ARPA 212LA 135LA 144LA 4DQ7A 1L16A 1LYEA 3B0OA 1YANA 1KXWA 4GLAA 1JEFA 1H6MA 2ZILA 4U3XB 1C64A 1C10A 3CDOA 3LZTA 1GFRA 1LYHA 1YAPA 1NBZC 240LA 1YROA 224LA 4NGYA 167LA 1QDRA 1QT8A 4RDSA 1JTOL 5KXMA 1LHHA 2OE9X 4YXCA 3AW7A 4L41A 1FLWA 5APDA 3SB9A 4NWEA 1UUZC 1NDMC 1OVHA 5I5QA 1LJ3A 5HLLA 2H9KA 4I7LA 1OUDA 1LZRA 1LI3A 3DNAA 5KXLA 1WQMA 3AZ5A 155LA 1UICA 2HEFA 1HHLA 2L78A 1IORA 3CSRA 1QT3A 4W58A 1MLCE 1ZVHL 4ZIXA 1T3PA 1HEQA 251LA 1GF9A 103LA 1T6HA 1LOZA 3A91A 5C6IA 3AGHA 3DN1A 1KIPC 1TEWA 200LA 2BQGA 4ARJA 4GCEA 3EO5A 1DZBX 4DC4A 1FN5A 223LA 218LA 1XSFA 1IP5A 1D3JA 219LA 4IJ4A 5DLAA 1L01A 3GUNA 2YBNA 161LA 3LYZA 194LA 3GUKA 4HPIA 4GCDA 1NHBA 1UCOA 1PQIA 1C6NA 242LA 3A8ZA 4YEMA 248LA 4PJZA 1XGUC 215LA 2MEHA 1QT5A 1LYSA 1NBYC 2RAZX 1GFAA 1L03A 1L19A 220LA 4ETDA 3L64A 4NGWA 1IOQA 109LA 191LA 5F16A 163LA 1G7JC 2BQDA 5B05A 253LA 3WULA 1TLAA 1P7SA 1YKZX 3K2RA 4EKPA 260LA 1L09A 1LMOA 2BQJA 1L96A 2Z6BA 1L67A 7LZMA 2B75A 4RLNA 4LZTA 1GBOA 2Z39A 5LVHA 7LYZA 2NTHA 1IO5A 4AXTA 1L08A 1LJNA 1L06A 1L94A 1GFJA 2Q9DA 2D6BA 1G07A 1GAYA 1LSMA 8LYZA 2HUBA 1WQOA 3EMSA 113LA 139LA 4LDLA 2DQDY 1OUCA 1L93A 4WLDA 4B0DA 5HMVA 3OJPA 2ZNXY 3DN6A 1J1PY 2F2QA 1L58A 164LA 4H9IA 1CU0A 3WXTA 4I7TA 4CHXA 1DI5A 1HENA 1REZA 1L10A 1L83A 259LA 1YAOA 1J1OY 1OUJA 2Z2FA 4XJBA 4DDAA 1W08A 1L04A 4YF2A 1L24A 3QNGA 2HTXA 1IOCA 2YSSC 1IVMA 3DMXA 3VWOA 3C83A 4ANRA 5LYZA 3C8SA 5II3A 4MR1A 4ET8A 1GE2A 4I7JA 208LA 3D3DA 4DDCA 1AM7A 2XJWA 3RU5A 174LA 3WYHA 2RBOA 4W96A 1KY1A 1L53A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HBE X;  1VAT A;  2CGI A;  4RW2 A;  1CV3 A;  3W6F A;  4WG7 A;  1C6I A;  1FLQ A;  1GF8 A;  192L A;  4CFO A;  1JKB A;  3WW6 A;  2Y8P A;  1LWK A;  1C6B A;  238L A;  2CWI A;  1WQQ A;  4TUN A;  4RLM A;  1L61 A;  1IWY A;  3B0I A;  4H94 A;  2BQB A;  1C63 A;  2CUU A;  1LPI A;  120L A;  1L39 A;  1C6D A;  1LHL A;  3SN6 R;  1L76 A;  1YIL A;  1JPO A;  2HED A;  4ARQ A;  1LWG A;  4M4O A;  1L18 A;  3WUA A;  4H8Y A;  1XGQ C;  1IOS A;  1G0J A;  4HSF A;  3EXD A;  1CV1 A;  1P2L A;  3EBA B;  1UIH A;  1LSB A;  4B4J A;  1B2K A;  4W94 A;  190L A;  2A4T A;  4HTK A;  2B73 A;  3CB7 A;  3DN0 A;  4G4H A;  1D0M A;  4GN3 A;  1OQM A;  4WG1 A;  1B7P A;  245L A;  1B7O A;  127L A;  5KXT A;  4XJI A;  4AQN A;  4EOF A;  2W1Y A;  5FDJ A;  5HNC A;  1L23 A;  3C8R A;  4XJH A;  3B6L A;  118L A;  5LIO A;  4HP0 A;  1VDS A;  4ETB A;  1LGW A;  1QSB A;  3P66 A;  5B1F A;  4EKQ A;  256L A;  4WLX A;  3A90 A;  2B6Y A;  1LTM A;  1YAM A;  1L90 A;  132L A;  1UC0 A;  3A95 A;  184L A;  4I7S A;  1L46 A;  4NGJ A;  196L A;  1CV4 A;  4XN6 A;  4LFP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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