1EQYA

Complex between rabbit muscle alpha-actin: human gelsolin domain 1
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
359
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of gelsolin segment 1-actin complex and the mechanism of filament severing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GELSOLIN
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
total genus 114
structure length 359
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1eqyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eqyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eqyA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1eqyA04
2ASOA 1NGEA 4BC4A 1HKBA 3FZLA 2CGJA 4IWVA 3U4LA 4XH1A 1NGGA 2A41A 1NGFA 3ZX3A 3SMPA 3VETA 5FPEA 2GTDA 3MN5A 3M1FA 1X9JA 4BC2A 1BWFO 4B1VA 1JCEA 5AQHA 5TKYA 2P9SA 4CBXA 4FO0A 3H3OB 1MDUB 3O1WA 3UKUB 2CGLA 3EKSA 3H45C 2YI1A 3SJHA 5F1XA 4BR2A 3VENA 1K8KA 3VEWA 2V52B 3M3ZA 1X3MA 5LY3A 4JHDA 2E2OA 4K25A 3VGLA 3MN9A 3WXIA 4B1WB 1HKCA 3BUZB 4L3QA 4WQ5C 1SAZA 2P9IB 1GLBG 4BRIA 2A5XA 3OHRA 5JLFA 5AZIB 1C0GA 5E26A 1DEJA 2FF3B 4YDUC 2ZWHA 2D0PA 3D2EA 1V4SA 4LC9B 5EXWA 3RSEA 3O1BA 3HTVA 4CD3A 2V7YA 2ASPA 1ATSA 2DPNA 2QXLA 3ENHA 2P9PB 3FLCO 2ZGZA 2PBDA 3UKRA 5EOYA 4CZIA 1K8KB 3WQTA 5BRHA 4H03B 1TUYA 1Z6RA 2NRHA 1BO5O 3MN6A 3EKUA 3I33A 1T6CA 2FXUA 2YJFA 3CJ9A 3U9ZA 1U2VA 1S3XA 4DB3A 1GLDG 2BUPA 4CZKA 4BQLA 1NMDA 2GUPA 3ATVA 4BR5A 1NLVA 1R59O 3ULEA 5ADXA 3VF2A 5AQWA 2E2QA 3U9DA 1WOQA 5AQJA 3DXMA 3MCPA 4RCHA 1XC3A 3BF1A 1G99A 2QWQA 3AARA 3H1QA 1ZBSA 3H6EA 4O5FA 3VESA 4CZGA 3WXLA 4XEIA 3CJ7A 3CJAA 4ISGA 4CZMA 1U6ZA 2NZTA 4BR7A 4A61A 2P9LB 2IVPA 5AQPA 3D2FB 2BTFA 2VCPA 3H3NO 1HKGA 3GOIA 3A5OC 3GE1A 2J4RA 3GL1A 1BDGA 4BROA 2AA4A 4BRDA 3IMXA 4FPBA 3WEEB 4CI6A 4JD2B 3WT0A 4A2BA 3VPZA 5AZJA 2E8AA 1GLJO 1HLUA 5AQNA 1XUPO 3O4WA 4H0TB 4H5NA 3CERA 3GDQA 4B1YB 4AM7A 4CZFA 3LL3A 1RDWX 2P9NA 3P4IA 4H5WA 2CH5A 5KPRA 4H5VA 2HF3A 3J8AA 5AQQA 4H0XB 1BA1A 1GLFO 2Q0UA 5AQLA 4A2AA 3ENOA 2NLXA 2Q1NA 1ATRA 4H5TA 4FPAA 5AQKA 1NGHA 2D4WA 1ATNA 1E4FT 3AAQA 5ADXH 4J8FA 4BRMA 4FWSA 1ZC6A 2V7ZA 3EL2A 4E1JA 1KAZA 3JXUA 2CGKA 2F9WA 5AFUA 3R6MA 3LDLA 3TU5A 2ASMA 2GWKA 3CJCA 3FZMA 3CJ1A 4IJAA 4FWLA 3CI5A 3KZBA 4BRQA 4BRLA 3ATUA 5I9EB 2VYPA 2P9UB 2GWJA 5FPDA 5B8HA 4FWKA 1T6DA 2QWMA 3LDNA 3D7EO 3DJCA 3LDQA 4FWOA 1Y64A 3CIPA 4ISEA 3QDKA 3AY9A 5JMVA 3HI0A 5AQVA 4BRCA 3MMVA 4K42A 3DXKA 3ID8A 1QQOA 4FWMA 3KVGA 5BPNA 4C23A 2E2NA 2P9SB 2QWRA 3G25A 1DGKN 3HM8A 3QMLA 4BR0A 1HJOA 4H0PA 5F0XA 5CE3A 5KQDA 1MWMA 4H0YB 4XH5A 1EQYA 2W41A 1GLEG 1YXQA 4F9OA 5KPZA 5AQXA 3FZFA 1NGCA 3VEYA 4JHDB 3SMSA 1JCGA 3ZETA 2GEMA 1NGBA 4ISFA 1SZ2A 2Q2RA 4MLEA 3FE1A 1C0FA 1QQMA 3HZ6A 5AQZA 2YHWA 1QZ5A 4I6MA 3EN9A 1NWKA 5AQFA 5F2RA 3A5NC 2YHYA 2IVNA 3BF3A 2QWNA 4FSVA 4WQ4C 4EIAA 1T44A 4DHYA 3FR0A 4EFHA 4JAXA 4AM6A 2E20A 3D2EB 4CZJA 3CQYA 3SK3A 3C7NA 2H3GX 4NO7A 3RSEB 2OANA 1KAYA 3R8EA 2FLOA 5BR9A 3W0LA 4BVPA 3WUHA 2A6AA 4PKIA 5AR0A 3UKRB 3ZX0A 4CJ7A 4FOEA 3O80A 4M7XA 2Q0RA 4FWNA 2QWLA 2FSKA 4CD1A 1S22A 2QWOA 1X3NA 3QFUA 1U2VB 1RGIA 3O8MA 2ITMA 1NGAA 1BOTO 4JN4A 1GLLO 5EVZA 1BG3A 2P9KA 4BRAA 4BRKA 3A5MC 3LM2A 2HF4A 4H0OA 4BG9A 4CZLA 3ULEB 2ZF5O 3WXJA 2QM1A 3C0BA 3O5BA 3DXMB 3VGKA 1NGJA 3A5LC 3QBWA 1GLAG 1ZXOA 4BRGA 3EZWA 1RFQA 2FSJA 2A3ZA 4B1UB 4IJNA 4NB4A 5FPNA 3L6QA 1BA0A 1Q18A 1IJJA 4BGAA 1OKJA 4EHUA 2VWBA 4FWPA 2D0OA 3R9PA 3VF6A 3UKUA 5AQSA 3SLCA 5AQYA 2AP1A 4BRNA 4PKGA 1HUXA 4XH4A 1JCFA 3TPQA 5AQTA 5BREA 5LJWA 3HBTA 2A42A 3BEXA 3CQXA 1BUPA 4MO4A 3VF4A 3U8XA 4RTFD 4JNEA 3VERA 1CZAN 3AAPA 5BPLA 2D1KA 3QB0A 2Q36A 4QS7A 1TUUA 2P9IA 5BN9A 5KQ8A 3UE5A 4FWRA 4HTLA 5AZJB 5ELZA 5AQGA 2KHOA 5BRFA 3BP8A 5AZIA 4GY2B 4K43A 4DCHA 3I8BA 2I7NA 5EX5A 4HWIA 2PAVA 3M6GA 2P9NB 3H46O 4MO5A 3QICA 2QWPA 3O08A 2F9TA 3L0QA 5JLHA 4RWTA 2YJEA 2FSNA 4BGBA 2I7PA 3LM9A 4PL7A 2E1YA 2P9PA 2GELA 3FFKB 1IG8A 3GG4A 1D4XA 1BU6O 1QQNA 1MA9B 2Q97A 3CETA 4Z94A 4H0VB 2YCHA 3QFPA 4GNIA 2FF6A 1QZ6A 4IXCA 3FZHA 4O8KA 4IZ9A 5JICA 4KBOA 3VGMA 4BRPA 3L4IA 3W3DA 2IVOA 4WYBA 1NGIA 4BC5A 3EO3A 2IIRA 3ZEUA 3IUCA 4PL8A 2HMPA 4CBWA 2YHXA 1P8ZA 4A62A 4BRFA 4BQZA 1XQSC 3MK6A 3A8YA 3O6WA 1H1VA 2WUSA 4EAHD 1ESVA 3B8AX 3IFRA 4B1XB 3KHYA 3LDOA 1DKGD 4BR4A 1GLCG 2V51B 1NBWA 4BREA 5BN8A 5AFUH 2EWSA 3DXKB 4BVOA 1LOTB 3CJBA 3VEZA 4FL9A 2ZGYA 1NM1A 4IO8A 5LJVA 2P9LA 5AQRA 3H1VX 4K41A 4CZHA 5BPMA 2A40A 4WQ5A 3WQUA 2E88A 3ZX2A 3D2FA 4M63C 4B1ZA 4BR9A 1MWKA 1J6ZA 3MDQA 4QS9A 3F9MA 2Q31A 4BRHA 3LDPA 1KXPA 3S41A 2W40A 4YDUA 1Z05A 4BC3A 4QS8A 1E4GT 3QBXA 4B9QA 3WEEA 3ZEUB 3ZETB 1YVNA 4JD2A 2E1ZA 4FWQA 4M7YA 3UB5A 1TYQA 1SQKA 1NGDA 3IDHA 1YAGA 2HOEA 4I6MB 5AQUA 5AQOA 5FPMA 4MLHA 2CH6A 3VEVA 2QW9A 4DQ8A 3JS6A 3HSCA 4EHTA 3DAWA 4PKHA 4H5RA 4CZEA 1LCUA 4CBUA 3MN7A 1HPMA 3FGUA 3C7NB 3VEXA 5KPTA 2UYTA 4Y0WA 5EY4A 4FOIA 1QHAA 3A0IX 5E84A 1YUWA 1V4TA 4WQ4A 5BRDA 3CHWA 3DWLA 2E2PA 1HX1A 1TYQB 1KAXA 4BG8A 3VEOA 1WUAA 3WXKA 3GBTA 5AQMA 3VOVA 2P9KB 2P9UA 3FZKA 5AQIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ASOA 1NGEA 1OVQA 4RW7A 3HYFA 1HKBA 4IWVA 4O0JA 5JENA 1NGFA 1FK9A 3VETA 5FPEA 3EEQA 3MN5A 1A5WA 4BC2A 1VQKN 3WXMB 1L3TA 2YKNA 4JK8A 1W97L 5TKYA 3J80O 2XY5A 2O8FA 4M3UA 1MDUB 1TV6A 3H45C 4JEPA 4F4KA 1QTMA 2YI1A 1QSLA 4BR2A 4Z4FA 5LY3A 4E3SA 4E0DA 2HHHK 4WQ5C 1S1VA 2QK9A 4IOAL 4CJ5A 4M3WA 1BL3A 3WNFA 4FJ9A 1X9SA 3OHRA 5JLFA 4IEEA 4IBNA 2P5OA 4DUYK 3O9UA 4KB1A 1S9GA 3CC4N 2G8VA 1RDBA 4OPAA 3TARA 3HTVA 1R0AA 4CD3A 4OGEA 4CJ3A 3EE9A 1ATSA 2QXLA 5C0YA 1HYVA 4W5RA 2PBDA 1UAXA 5EOYA 4CZIA 3CXCM 1U4BA 5BRHA 3O4QA 4JI3K 1S1UA 4NCAA 2QEXN 2QKBA 1U2VA 1HQUA 1W0HA 4DB3A 2JWKA 1T3VA 2OPSA 4BR5A 4Z4EA 1T8EA 1R59O 2HBMA 5ADXA 3OYEA 1WOQA 1WAFA 2D0BA 2NRVA 1RT2A 4DU3A 4B9LA 5KGXA 3BF1A 1G99A 2RKIA 3H6EA 4O5FA 3VESA 3JSMA 1D8YA 3CJ7A 3OYCA 1VQ8N 3OA9A 4CVNE 1RT1A 3TR8A 5AQPA 4IO9L 1T03A 5M1OA 3D2FB 4X66K 2WTUA 1FJGK 1HKGA 3J7YP 3GOIA 3GE1A 4IG0A 3THWB 4BROA 3LAKA 1WSIA 2O8CB 1X9MA 3C94A 5IWAK 4CW7B 3OYAA 4CI6A 4W5QA 4JD2B 3N4QA 4LF5K 4IOCL 3TAEA 5CZ1A 1GLJO 3SQ2A 1TL1A 1VSFA 4H0TB 3P38A 4H5NA 1VSIA 4FLVA 4CZFA 3QIPA 1RDWX 2P9NA 3P4IA 4H5WA 2O8BA 5KRTA 5KPRA 4CGJA 1BA1A 2KZZA 3SUQA 4CGHA 4CHPA 1ATRA 4M41A 3SUNA 1VSHA 4FPAA 3SV3A 2JLEA 1RT3A 4CEZA 3IAYA 4BRMA 3F9KA 3WNEA 3AA5X 5C2DA 3ZSRA 1ITGA 3TAPA 2CGKA 1Q82O 3K9KA 4DKWA 4PY5A 4CK3A 3TSUA 3FZMA 3VQCA 1VQ4N 3RTVA 2QTDA 4BRQA 4CJEA 1D9DA 5FPDA 3MAQA 4FWKA 2YX6A 3AO1A 3LDQA 4ISEA 2BANA 4DTRA 5JMVA 2VQEK 1S72N 4BRCA 4ILHA 4YOWA 5D3GA 3THXB 4DQSA 5JS1A 2DFHA 3VQQA 4X64K 4I7FA 4B3RK 1HJOA 3AVKA 3KLIA 4E7LA 3RRGA 4FM2A 1S5JA 3SAHA 4CJ4A 1IV0A 3RMCA 2G8IA 1VK0A 5KPZA 4DR5K 4CJVA 5AQXA 3VTHA 5GIPA 2KKZA 3FZFA 3VEYA 3VQ4A 2GEMA 5KRSA 1NGBA 2Q2RA 3CG7A 1QQMA 1ZBFA 4IDHA 4XJXA 4KHWA 4KHPK 1N6QA 5F2RA 4BECA 3PSFA 4DHYA 2JWLA 2IDOA 3RSEB 2OANA 4I2PA 4ILJA 3R8EA 3OYLA 4AQYK 1WN7A 4KHUA 2FLOA 4JKGA 5J2PA 1S6QA 3W0LA 1ZBIA 3NH0A 4PKIA 1SKSA 4C8LA 3K2PA 4CD1A 2E4LA 2QWLA 4CF8A 1KCFA 4FXDA 3PO4A 4DLGA 2OTJN 4CEDA 4KTQA 4DSLA 2ZJPL 2ZJQL 2ITMA 3CYMA 4JN4A 3AVGA 1GLLO 2ITGA 4O8UA 4B08A 1BG3A 4BRAA 3I0RA 4H0OA 4CZLA 2UUCK 4Z4IA 1IG9A 4Y1DA 3WXJA 3M8QA 4KHSA 4AF1A 3C0BA 3QEXA 3CM5A 3VGKA 1NGJA 3IG1A 1RTHA 3L8BA 3EZWA 3KTQA 1RFQA 1HMVA 1UWBA 3AGRA 1VSJA 4NB4A 3L6QA 1JXBA 4FLZA 2D0OA 3VF6A 3TTFA 1LWEA 5AQSA 3AA4A 2O8EB 5AQYA 2B4JA 3CC7N 4XH4A 4E1NA 4C8MA 2HBKA 3VF4A 4DV1K 4JNEA 4TSXA 5BPLA 3TTCA 2IAJA 2Q36A 4QS7A 2P9IA 4LD0A 4HTLA 5AZJB 4BWMA 4OX9K 3NF9A 4K43A 3I8BA 4JLHA 3M6GA 5CYQA 4IFEA 4MO5A 3QICA 4DLEA 3N4PA 2IC3A 1W7AA 1LW0A 1Q81O 4CJSA 1QQCA 4O4GA 1ZBHA 4MDBA 3QINA 2P9PA 2GELA 3FFKB 1JLGA 4FJKA 1BU6O 3VQ5A 5A2QO 3K59A 1SL0A 4CJRA 3HXMA 3CETA 3R1XA 1RBSA 2YCHA 2GUIA 2KQ2A 1VQ5N 1QZ6A 4IOXA 4IXCA 3FZHA 4O8KA 4R79A 5JICA 4KBOA 3HPOA 1OH7A 1UA1A 4BC5A 4CFAA 3CCJN 4K8ZA 3ZEUA 3IUCA 1GOBA 3I8DA 3CMAN 3K0SA 1SL2A 2NRXA 3O6WA 4FZZA 4EAHD 4LF8K 4QOZB 3B8AX 2DFFA 1C0TA 4CHYA 3KHYA 1IO2A 1DKGD 4JI4K 1KQSM 4L8RB 4B9MA 2X6NA 1GLCG 1NBWA 5BN8A 2EWSA 4BVOA 4C1NI 1YJNN 2P9LA 4EP5A 1T7PA 2F8SA 3H1VX 4WQ5A 3WQUA 4BR9A 4CIGA 4DSJA 2E5LK 1D9FA 1HNIA 3U3YA 3KLGA 3KK3A 3E01A 4KREA 3PLAA 3TSQA 4NXMK 4DV3K 4JRPA 4Q0BA 1IKXA 1E4GT 4B9QA 4ILGB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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