1EQYA

Complex between rabbit muscle alpha-actin: human gelsolin domain 1
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
359
Chain Sequence
b'TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords GELSOLIN
publication title Structure of gelsolin segment 1-actin complex and the mechanism of filament severing.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
total genus 114
structure length 359
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1eqyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eqyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eqyA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1eqyA04
5BR9A 3VF2A 4FWLA 5AQIA 1QZ6A 5AQOA 3SLCA 1ZC6A 2P9UB 2P9SB 5B8HA 4CI6A 2YJEA 5AQMA 4BQLA 4FOIA 3O1WA 1XQSC 2H3GX 1C0GA 4B1YB 5F2RA 1WUAA 2PAVA 3EL2A 4M7XA 2QW9A 1BO5O 4AM6A 1D4XA 3HSCA 4FO0A 1RGIA 5ADXH 3ENHA 3QICA 1QQOA 4I6MB 1WOQA 4FWRA 3D2EA 3LDPA 4Y0WA 3O4WA 1GLBG 4IJAA 2P9KB 4BVOA 3DJCA 2QWMA 1NGJA 3EKUA 4CZIA 4B1VA 5KPRA 3CIPA 3MN5A 1BG3A 2Q31A 5AZJB 3GG4A 1DKGD 5FPDA 3H45C 1TYQA 3JXUA 3CJ7A 5EVZA 3MDQA 3VGKA 1NGHA 1NGFA 4BG8A 5AR0A 1HKGA 1Z05A 1HX1A 2D0PA 3R6MA 3WXJA 4RCHA 4H0YB 5EXWA 2P9NA 3JS6A 1K8KB 5AZIB 5E26A 2GUPA 2QWQA 5TKYA 4IXCA 3HM8A 4O5FA 3R8EA 3AY9A 3P4IA 3FZFA 1U2VB 2V52B 3IMXA 5KQDA 3MCPA 2P9LA 1TUYA 2Q36A 4JHDA 1KAXA 2FSNA 3G25A 3A0IX 2GEMA 4BRDA 1HUXA 4HWIA 2EWSA 3L6QA 3H46O 3VEZA 4FWKA 3ATUA 3VENA 3BEXA 1RDWX 1XC3A 1IJJA 4K25A 2Q0RA 4FPBA 2FSKA 4DCHA 3QFPA 3CETA 3O6WA 3CQYA 4FWSA 3DXKA 4LC9B 2A3ZA 2GTDA 4WQ4A 2CH6A 2IIRA 3WXLA 3TU5A 4CZFA 5FPNA 1V4SA 3U8XA 5AQJA 3FGUA 2IVNA 3WQUA 2A42A 2CGKA 3VEVA 1T6DA 4PKIA 1RFQA 3ENOA 4DHYA 3A8YA 2P9IA 3I33A 4PKGA 4HTLA 3D7EO 3A5NC 2FSJA 3WXKA 1GLCG 5BRHA 5AQUA 4MLEA 4FL9A 4H0OA 4BR2A 1NGCA 2V7ZA 4FPAA 2F9TA 4EFHA 1GLEG 1YUWA 4EAHD 1NGAA 2NRHA 1KXPA 4A61A 1HKCA 4EHUA 1YAGA 1TUUA 3ZEUA 5FPEA 4NO7A 4A2AA 2E2OA 4JAXA 1SQKA 3KZBA 4WYBA 3CJBA 4H0TB 3D2EB 4BQZA 4FWPA 1QQMA 2Q0UA 4C23A 3ID8A 1NBWA 4QS7A 3VPZA 4BGBA 1OKJA 3D2FA 3WEEA 2E88A 4DQ8A 3EZWA 3CJ9A 5EY4A 4CBWA 4DB3A 4JD2A 5AQRA 1TYQB 3MMVA 5AQTA 3UE5A 4BRAA 3QB0A 3MN7A 1DGKN 4O8KA 2A40A 5AQWA 4NB4A 3RSEA 2QM1A 5KQ8A 3HI0A 4K42A 3R9PA 2P9NB 3LDNA 4A62A 3F9MA 4CJ7A 4QS9A 4AM7A 1YXQA 4BRIA 4CBUA 1LCUA 4BC4A 3FZMA 2E8AA 4FWOA 3L0QA 2P9LB 4BR7A 4JHDB 2BTFA 4CZGA 2E2NA 2QWPA 3HBTA 2HF4A 2YCHA 5AQXA 1J6ZA 3VEYA 3AAQA 3CJCA 2HF3A 3TPQA 4M63C 2AP1A 2NZTA 4ISFA 3DXKB 2IVOA 3QFUA 4GNIA 3O8MA 5ELZA 3IFRA 4BR5A 2YHWA 4BR9A 1BUPA 1S3XA 3O80A 3S41A 2P9IB 4IZ9A 2D4WA 3OHRA 4BC2A 2F9WA 1BDGA 1NWKA 5F0XA 4E1JA 3CI5A 5AQQA 2I7PA 3O5BA 5AQVA 2E1ZA 2A5XA 1ESVA 5AQSA 3FLCO 3UKUA 5JICA 1CZAN 3U9DA 3WT0A 1BA1A 4B1ZA 2PBDA 3A5MC 3GBTA 1X3MA 3ULEA 2ZGZA 5F1XA 2UYTA 4H0XB 3ZEUB 3VEOA 5EX5A 1E4GT 1HLUA 3LM9A 4BC5A 5BN9A 1R59O 4GY2B 2FXUA 5I9EB 4H5NA 4FOEA 1GLFO 4MO4A 4B1UB 1MWKA 4BRQA 2V51B 5EOYA 2E1YA 4XH4A 1NGGA 4B1WB 5BRDA 3ZX2A 3D2FB 3WEEB 1QZ5A 4M7YA 3MN6A 5BPLA 2BUPA 4BG9A 4JD2B 1E4FT 3H1VX 3VGLA 2E20A 2FF3B 1GLAG 1BU6O 3H3NO 4BRCA 4PL7A 1ATSA 3RSEB 3KHYA 3SMPA 1BWFO 1HJOA 2E2QA 4XEIA 2V7YA 4BRLA 4CZJA 2I7NA 3HZ6A 1S22A 4K41A 2J4RA 2NLXA 2VCPA 1P8ZA 3M1FA 2HOEA 3BP8A 3CJAA 3VF6A 4WQ5A 1H1VA 4FWNA 4CD3A 1T6CA 4CZLA 5KPZA 2QWLA 3SJHA 5BN8A 2QWOA 3LDLA 1SAZA 2ZGYA 3J8AA 3CJ1A 1XUPO 2Q1NA 2ZF5O 1HPMA 3KVGA 3U9ZA 3QDKA 1BA0A 3ZETA 1G99A 4H5WA 3GE1A 2VYPA 1JCEA 2FF6A 2GELA 3FZKA 4BVPA 4PL8A 1NGBA 1GLJO 3O08A 4WQ5C 2E2PA 4YDUA 4BRMA 3ZX0A 3H3OB 4QS8A 3M6GA 2CH5A 1GLDG 1QHAA 4IO8A 1NM1A 3H6EA 4JN4A 3B8AX 3ZX3A 4EHTA 2FLOA 1Z6RA 5AQGA 2VWBA 3LDOA 1NGIA 4CZMA 2QXLA 3M3ZA 2D0OA 5JLFA 4EIAA 3UKUB 5AFUA 2OANA 2P9PA 3IUCA 4FSVA 3LDQA 3QMLA 4YDUC 3WUHA 3DXMA 4IWVA 3C7NA 1BOTO 1U6ZA 3ULEB 4BGAA 1NGEA 1NMDA 5AQKA 4BRNA 3A5OC 5JLHA 5AQLA 2YHXA 3QBXA 4CZHA 4H03B 3IDHA 4BRGA 1MA9B 4H5RA 1ATNA 5KPTA 3UKRA 3I8BA 3W3DA 3CERA 4Z94A 1ATRA 4XH1A 2W40A 3WXIA 4BRFA 2ITMA 3VERA 5LJVA 1DEJA 4CZEA 3GDQA 1ZBSA 2QWNA 1EQYA 1V4TA 2P9UA 2P9SA 4BC3A 4BR0A 1GLLO 3A5LC 1QQNA 2QWRA 1LOTB 3MK6A 4H0PA 4CZKA 4KBOA 3MN9A 1NLVA 4FWQA 4H5VA 4H5TA 5E84A 3VETA 2YHYA 3EKSA 2GWKA 2A41A 3BF3A 3C0BA 3UB5A 4MLHA 5BREA 5AQNA 5AQHA 1C0FA 2DPNA 3SK3A 2AA4A 1KAYA 4I6MA 3VOVA 1X3NA 4B9QA 1HKBA 3AAPA 3CQXA 2P9KA 2WUSA 3GOIA 5BPMA 5FPMA 2ZWHA 4XH5A 4A2BA 5AZJA 3VEWA 4RWTA 3QBWA 2KHOA 3GL1A 1Y64A 3ZETB 3EO3A 3VESA 3BUZB 1KAZA 1JCGA 1MWMA 4JNEA 3SMSA 5ADXA 4BREA 5AFUH 5AQZA 4FWMA 3W0LA 4CD1A 2ASMA 1YVNA 5AQFA 3U4LA 4B1XB 3LL3A 4F9OA 2GWJA 1K8KA 5AZIA 5LJWA 3FZLA 3WQTA 3EN9A 5BRFA 4RTFD 1MDUB 2Q2RA 1U2VA 2HMPA 2CGJA 3LM2A 2A6AA 4K43A 4L3QA 1JCFA 3CHWA 1T44A 4BRKA 4ISEA 4MO5A 2Q97A 5JMVA 3FZHA 1ZXOA 4H0VB 3FR0A 4PKHA 5CE3A 3DAWA 3VGMA 2IVPA 4WQ4C 1SZ2A 3DWLA 3VF4A 3ATVA 3HTVA 4BRPA 2P9PB 4BRHA 1Q18A 3H1QA 5AQYA 2D1KA 2CGLA 3FE1A 2ASPA 3AARA 1X9JA 3DXMB 3C7NB 4CBXA 3L4IA 2W41A 3BF1A 4BROA 2YI1A 2ASOA 4ISGA 2YJFA 3FFKB 5BPNA 4IJNA 3UKRB 3O1BA 3VEXA 1NGDA 5AQPA 5LY3A 4J8FA 1IG8A 4BR4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HRPA 3CCMN 4FWLA 5AQIA 1ZC6A 1DTTA 5B8HA 3O9QA 2WFBA 1QVGM 5CZ1A 1KVCA 3IG1A 1XHZA 2KLAA 4B1YB 4E7IA 1M1KO 1ZBFA 4Z4HA 2OPRA 4DFJA 4M7XA 3OYCA 3SV3A 1BO5O 1ASUA 4FO0A 3HOSA 1TKTA 3ENHA 1QQOA 5K14A 2IDOA 3KK3A 4M3ZA 3P5JA 1L3UA 1GLBG 2QTDA 4W5NA 1C0TA 4PY5A 1ILYA 1TL3A 2QWMA 4B1VA 4DFPA 4FM2A 5FPDA 2HHTA 1RBTA 4GKJK 3CJ7A 4HTUA 4CEOA 3VA3A 3PSFA 3SPYA 4JK9A 3WNFA 5C42A 1NGHA 5GAEP 1NGFA 1HX1A 3R6MA 3WXJA 3L2QA 5EXWA 2P9NA 1Y97A 1K8KB 1VK0A 4K0KK 2QWQA 5TKYA 3HM8A 4OPKA 2HVHA 3R8EA 4CJEA 1RBRA 3AY9A 4E19A 3P4IA 1U2VB 3JYTA 1TUYA 4OX9K 1KAXA 3G25A 1RTDA 3A0IX 3PX4A 4YOUA 1RNHA 4KH6A 3L6QA 3OW2M 3ZSVA 2X78A 3H46O 4FWKA 3PO4A 3BEXA 3U3GA 1XC3A 2FSKA 2VG7A 3CETA 3CQYA 4ID1A 4WQ4A 4CEEA 3TU5A 1WBDA 4CZFA 3M8PA 3U8XA 3SAGA 5AQJA 3SYZA 4JKHA 2VG6A 3L8BA 4ILHA 4B8CA 1N6QA 4Q5VA 4KO0A 3M8QA 3MCAB 4I9QA 3KK7A 2G8KA 2FSJA 4BWMA 1GLCG 1NJZA 2XHBA 1WSHA 3L3VA 3NF7A 4FL9A 4H0OA 2V7ZA 3N4QA 5DK5A 3PUFA 4EAHD 2Z1IA 4A61A 1HKCA 3NFAA 1YAGA 1LWEA 4GV9A 3HT3A 2XY5A 3K59A 1SQKA 4O0JA 1VRTA 4FJ9A 4E1MA 1L3SA 1IKYA 4O4GA 4FWPA 3O4NA 4C23A 1LAVA 3HXMA 1NBWA 3MWPA 4RW4A 4KHWA 3KIOA 1OKJA 3D2FA 4H8KA 3WEEA 5HL7L 4DV3K 3CJ9A 4CBWA 4DB3A 1NK9A 3T7ZA 3MMVA 2HHIA 3P38A 3OTOK 4JI4K 5I3UA 4IO9L 3RSEA 4LFBK 4DR7K 3VQQA 4FLWA 3SQ2A 2O8EA 2GBZA 4CJ5A 1NJWA 5KGWA 3G0ZA 4A62A 3V9ZA 3F9MA 4R5PA 1RT5A 4CF0A 1A5XA 3VA0A 1UOCA 3FZMA 2E8AA 2P9LB 3SUPA 4Y1DA 2YNGA 3DLHA 3HBTA 4DV1K 2C1GA 2YCHA 2GX9A 2RKIA 5AQXA 4FJ5A 4BECA 4JKAA 2WOMA 3DYAA 1KFSA 2HF3A 5KGXA 3TPQA 2G8VA 4LH5A 3ZT0A 3AVKA 3QETA 4GNIA 3OJUA 3O8MA 3NE6A 4JKBA 1CZBA 3THVA 1J54A 3O80A 3EY1A 4DR5K 3NF9A 5LMNK 2P9IB 4JK8A 4FJNA 4M3TA 2F9WA 1BDGA 3CI5A 5AQQA 2I7PA 5KRSA 1ESVA 5CHIA 3VQ6A 3VQEA 1IV0A 3OYEA 3E1YA 1VQ8N 1BA1A 4B1ZA 2PBDA 4Z4GA 1YTAA 1X3MA 5F1XA 4IKFA 1RDAA 2ZJPL 1ZBIA 2EHGA 5GINA 2W6LA 3TTDA 3DRSA 4FK4A 2RE2A 1T03A 4BC5A 4AHUA 1R59O 2FXUA 3CYGA 4BE2A 1JLCA 4DTMA 2IC3A 4JI3K 3THYB 5BR8K 1VSIA 5CYQA 1XMQK 2E1YA 4XH4A 5C12A 5CR4A 5BPLA 1ITGA 3MN6A 4M7YA 4BDZA 4CJQA 2O8DA 1E4FT 3H1VX 3OBYA 4E72A 3ID6A 4O5BA 3VGLA 5GIOA 3ISNC 5T7BA 3AVIA 2F7TA 3D6RA 4XEIA 2V7YA 4E7KA 2P51A 3HZ6A 4OKJA 4DR6K 1S22A 2WTUA 2ZE2A 4JKCA 4OVLA 2FBXA 3D45A 3BDPA 1WAFA 3FFIA 1TK0A 4DUZK 4WQ5A 1T6CA 3TAGA 3ZLJA 3T1HK 3LP3A 4DS5A 1TKDA 4DTJA 2QEXN 2NRWA 3O9RA 2ZGYA 3KVGA 2YNFA 1XNQK 3AVLA 3V4IA 4U7BA 3QEWA 3ZYYX 1CZ9A 2HNDA 2KZZA 4RW7A 4PUOA 4EZ6A 3O3FA 3OYNA 3SNNA 1WSFA 1JLBA 4QS8A 3ZX0A 1NOYA 4CJKA 2CH5A 4BACA 4LFCK 1GLDG 4CGGA 4E7HA 3P1GA 1NM1A 3LPUA 5C15A 4DR3K 3ZX3A 1VSMA 4EHTA 2O8CB 5J2PA 3R1XA 3LDOA 1NGIA 4FJLA 1HRHA 2QXLA 3M3ZA 3QESA 1L3VA 3KD5E 1C1BA 4B9TA 2P9PA 4C8MA 4B9MA 1N33K 4Z4CA 4TSXA 4O44A 1NGEA 2YHAA 2YHXA 5CYMA 3M8RA 3IDHA 3EE9A 4KHPK 1W7AA 4N47A 1DTQA 4IG0A 3I8BA 4W5OA 3CCEN 3KLIA 1ATRA 4H4MA 2W40A 1VQPN 2ITMA 1DEJA 4FCYA 4CJTA 1HNZK 3VQPA 2QWNA 4EP5A 4PA1A 1JL1A 4BR0A 4JKEA 1GLLO 1QQNA 3ZSQA 5M1NA 3MK6A 4X62K 3CM6A 4KBOA 4OPHA 4KREA 2GWKA 3NVMA 2A41A 2PY5A 2NNWA 3UB5A 4MLHA 5BREA 3OYBA 5AQNA 5AQHA 1Q9XA 1C0FA 1HPZA 2DPNA 4G1QA 3HPOA 2OCEA 2HB5A 4NCAA 3SZ2A 4CCHA 1S1XA 1Q86O 1KRPA 1BQNA 2G8WA 2WUSA 3GOIA 5BPMA 3CMEN 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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