1EQYA

Complex between rabbit muscle alpha-actin: human gelsolin domain 1
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
359
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords GELSOLIN
publication title Structure of gelsolin segment 1-actin complex and the mechanism of filament severing.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
total genus 114
structure length 359
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1eqyA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eqyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1eqyA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1eqyA04
3D2EA 4IO8A 2P9PA 2Q0UA 3VGMA 2FSKA 4BR9A 4C23A 2QWMA 3HSCA 1GLFO 1DEJA 3VGLA 2J4RA 2P9IA 2NRHA 2A42A 3LDPA 1OKJA 1GLEG 5BPLA 5EX5A 5F1XA 5AQZA 2CGKA 4H0PA 3B8AX 3CJ9A 3DXKA 2ASPA 3EKSA 4FSVA 3GOIA 3R6MA 5AQKA 2P9UB 2QWRA 5BREA 3FGUA 3ENOA 1GLAG 5BR9A 1QZ6A 2D0OA 2CH5A 2A5XA 3ZETA 3IUCA 1JCGA 3WT0A 1HJOA 4BR5A 4F9OA 1X9JA 2E2PA 1R59O 1XQSC 4EHTA 3AARA 1S3XA 5KPZA 3VENA 4FOIA 2Q97A 4FWNA 3MN9A 2P9IB 4B1YB 2ZGYA 4KBOA 1BWFO 1SZ2A 3WXIA 1NGHA 1NGGA 5BN9A 4M7XA 4FWSA 1ATNA 3EZWA 2VWBA 2P9NA 3DXKB 4CZHA 1D4XA 4BC5A 3MCPA 2E2QA 1HUXA 1T6CA 4BVPA 3L6QA 5JLFA 3SK3A 3ZETB 4BC2A 1WOQA 1T44A 4BG8A 3R9PA 3GBTA 3KVGA 3HM8A 2YCHA 1SAZA 1KXPA 3GDQA 3HTVA 4H0TB 4B1WB 1HKBA 4H5TA 3W3DA 4FWPA 1V4TA 1MWMA 4HTLA 1SQKA 5EVZA 5BN8A 3WUHA 3H45C 4FWRA 2YJEA 3JXUA 4XH5A 2H3GX 5AQSA 3CJ7A 2GEMA 2P9NB 2V7ZA 3D2FA 1ZXOA 3O1WA 1ESVA 3BF3A 3MN5A 3C0BA 4H0XB 1NMDA 3CQXA 3FZMA 3TPQA 2FF3B 2I7PA 4H0OA 3J8AA 2Q31A 4L3QA 4WQ4A 5AQQA 2Q2RA 2E2OA 4BRHA 4RCHA 5CE3A 4CJ7A 3ULEA 5AQRA 3DXMB 4MLEA 1XC3A 5AZJA 4K25A 4MO4A 2CGJA 3WXKA 1EQYA 1XUPO 2P9SB 2E1YA 3G25A 3OHRA 2ZWHA 2FLOA 3O6WA 1TYQA 1ZC6A 4O5FA 3ZX3A 1YAGA 2FF6A 3IMXA 2Q0RA 4BRIA 1Y64A 1BA1A 3VETA 4BRNA 1T6DA 4BRQA 4CZIA 5ADXA 2IVNA 3FFKB 5F0XA 5AQOA 1BOTO 4QS7A 4K42A 1RDWX 5E26A 3H3OB 4B9QA 2PAVA 1RFQA 5EY4A 1HKGA 4PL8A 2W41A 4XEIA 1K8KB 4B1VA 2ASMA 3DJCA 4WQ4C 5AQYA 1YUWA 2V7YA 3ID8A 3SMPA 4IJNA 3CETA 4ISEA 4O8KA 3D7EO 4EIAA 1CZAN 3HI0A 3WXJA 5LY3A 3ZEUB 3IDHA 4DHYA 3BP8A 4BC3A 5KPTA 3A5OC 5AQXA 3UB5A 2WUSA 1MA9B 4XH4A 5AQFA 4BRPA 3ZX0A 1G99A 2QW9A 3I8BA 5KPRA 1DKGD 4M7YA 1Q18A 4CBWA 4CZGA 3WXLA 3O8MA 4BQLA 1HLUA 3H1QA 4WQ5C 3LDLA 3HZ6A 3QDKA 3U9ZA 4BROA 4BC4A 3C7NB 3VEZA 4CD1A 2CGLA 4WYBA 2YHYA 3LDNA 3U8XA 3JS6A 1ATRA 1WUAA 5B8HA 1NGIA 3VEVA 4BRFA 3QMLA 3A5MC 4GY2B 5AQMA 3LL3A 2GUPA 4CBXA 1DGKN 3LDQA 1HX1A 3FZHA 4HWIA 4YDUA 2FXUA 5LJWA 4PL7A 2ZF5O 1QQNA 3AAPA 3I33A 2W40A 4FPAA 4BRAA 3CJCA 1BO5O 3FR0A 2AA4A 3DXMA 3VEWA 3FZKA 3ATVA 2A41A 2PBDA 1BUPA 2IVPA 1P8ZA 5I9EB 4B1UB 2CH6A 2P9SA 4A61A 4BR2A 1NGDA 4H5VA 3UKUA 3H46O 3DWLA 4M63C 1TUUA 4I6MB 2YI1A 1IJJA 4AM6A 4A2BA 4FWOA 4IJAA 3QFUA 4H5RA 1QQMA 4J8FA 3SJHA 1YXQA 4JHDA 3GL1A 2FSNA 4H5NA 1GLBG 3MDQA 5AR0A 4EFHA 2E2NA 1NBWA 4CZMA 5FPDA 2D1KA 1V4SA 4YDUC 1K8KA 1GLDG 3U9DA 3L0QA 3R8EA 4B1XB 2VCPA 4NO7A 3UKUB 4FOEA 1NLVA 3TU5A 1HPMA 3UE5A 1X3MA 2GELA 2QWPA 3ZEUA 5AFUA 1U2VA 4AM7A 4K41A 3QICA 4FWKA 3GG4A 3AY9A 2E1ZA 1BDGA 3P4IA 2I7NA 3QBXA 4JHDB 4H5WA 2E88A 1MDUB 1HKCA 3CQYA 3M6GA 4WQ5A 4QS8A 4CD3A 2IVOA 3O80A 4BR0A 5AQVA 2GWJA 5AZIB 3HBTA 5BPMA 1ATSA 2QWOA 4H0VB 4CZEA 3BUZB 1NGJA 3MMVA 2QM1A 5ELZA 3UKRB 3FZFA 3KZBA 1X3NA 2ZGZA 3EKUA 3H1VX 4NB4A 4A2AA 3BF1A 3H3NO 5EXWA 2YHXA 3C7NA 3F9MA 1MWKA 1U2VB 4DCHA 4FPBA 1U6ZA 2EWSA 4BREA 5AFUH 2UYTA 5ADXH 2HMPA 3BEXA 2V51B 3CJBA 3KHYA 2A6AA 4BGAA 4CZJA 3VF4A 1BU6O 3ATUA 1BA0A 4XH1A 3CHWA 3CI5A 4BRGA 2HOEA 3O4WA 4DB3A 4EAHD 3CERA 3EN9A 3A0IX 4JD2B 3GE1A 3VERA 3W0LA 4CZLA 3EL2A 4JNEA 4BRKA 2HF4A 3QBWA 3O5BA 3RSEB 2Q36A 2YJFA 3ENHA 1LCUA 4ISFA 1KAYA 5AQPA 2A3ZA 3MN6A 2P9LA 4A62A 2GWKA 3VGKA 5KQDA 1JCFA 2YHWA 3EO3A 1NGEA 3SLCA 5JICA 3VEXA 2A40A 2NZTA 4CI6A 3H6EA 5JMVA 4I6MA 4JN4A 5AQIA 1C0GA 5BRHA 3D2EB 1NGFA 3A5LC 1NM1A 2P9PB 5JLHA 3LM2A 3U4LA 3MK6A 5BPNA 4PKIA 1JCEA 2QWNA 3LM9A 3ZX2A 4GNIA 5AQNA 3S41A 1GLCG 4RWTA 3IFRA 1Z6RA 1H1VA 2AP1A 2IIRA 2P9LB 2D4WA 2NLXA 3AAQA 1GLJO 2BUPA 3WEEA 1TUYA 3VEOA 1NGCA 3VF6A 1QHAA 4FWQA 2FSJA 3CJAA 3O08A 4LC9B 1NGBA 1GLLO 1IG8A 4FWLA 3FE1A 4DQ8A 1E4FT 1NGAA 1BG3A 4E1JA 1S22A 3VPZA 4CZKA 2E8AA 3VOVA 5EOYA 4CZFA 1YVNA 4IXCA 4K43A 3CJ1A 1Z05A 1QQOA 5AQGA 2P9KA 3DAWA 5AQTA 3M1FA 3WEEB 1QZ5A 4H03B 3LDOA 5AZIA 4BQZA 2D0PA 5F2RA 2QWQA 2ITMA 2F9WA 2HF3A 3CIPA 2VYPA 2KHOA 3UKRA 3QFPA 4B1ZA 5FPEA 2Q1NA 1E4GT 4ISGA 2QXLA 5KQ8A 4BRMA 1ZBSA 4IZ9A 4MO5A 4BR4A 4CBUA 3O1BA 4IWVA 4EHUA 4Y0WA 4FL9A 4MLHA 5FPMA 4RTFD 1KAZA 4JAXA 2ASOA 2GTDA 2V52B 4BVOA 5LJVA 4BGBA 3VF2A 4PKGA 3FLCO 2P9KB 4FO0A 4FWMA 1KAXA 5AQUA 5AQWA 2OANA 5BRDA 4BRCA 4JD2A 5E84A 5FPNA 3D2FB 4BRLA 1NWKA 3A8YA 1C0FA 5TKYA 2DPNA 4Z94A 1J6ZA 1RGIA 2QWLA 3RSEA 4PKHA 4BG9A 3VEYA 1LOTB 3A5NC 3FZLA 3WQUA 3WQTA 5AQLA 3ULEB 2F9TA 3L4IA 5AQJA 5AZJB 2E20A 3MN7A 3SMSA 4BRDA 2P9UA 4QS9A 3M3ZA 2BTFA 3QB0A 3VESA 5AQHA 5BRFA 4H0YB 1TYQB 4BR7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JKHA 3PV8A 3HP9A 4IO8A 4FXDA 1NK5A 2FSKA 4BR9A 3HSCA 4DF4A 1DEJA 4JYAK 2P9IA 2NRHA 1NOZA 3EE8A 1GLEG 4ELUA 5F1XA 2C1GA 4B3RK 3DLGA 4H0PA 4HVJA 3JSMA 3IG1A 1J9AA 3KD1E 3R6MA 1WSHA 3RVCA 2G8VA 3I0SA 3FGUA 1CLQA 1OH5A 2CH5A 2A5XA 3HOSA 4F9OA 3VQQA 1HJOA 4BR5A 1X9JA 5A2QO 4KAZA 1QQCA 4EHTA 1KC8O 1TK0A 4BDPA 3VENA 4JKDA 2KFNA 2HNZA 3MN9A 3QIPA 4B1YB 2LSNA 1VSEA 2ZGYA 5M1QA 1RBSA 1SZ2A 4FJLA 4B8AB 1W0HA 1YIJN 1T8EA 1KTQA 3KLEA 4AHCA 3NBPA 1ATNA 4AHVA 3EZWA 1XMQK 3DXKB 4JI6K 3G6EN 1JL2A 4BC5A 4DFJA 4DR4K 4NCBA 3MCPA 3SNNA 2YHAA 2E6LA 1KVBA 3OYFA 4DSKA 1EO1A 1GOAA 4JS4A 4W5TA 1WOQA 3EE9A 5C2DA 3GBTA 4OPHA 3HM8A 4H0TB 1KXPA 4B1WB 1D9DA 1XNQK 3B6OA 4ID5A 3VQBA 3W3DA 4FWPA 4DV4K 2ETJA 3CPEA 4KKOA 4O0IA 1UA0A 2GEMA 1Q7YO 2V7ZA 3MXJA 3TTCA 4FM0A 3T69A 4F2RA 1CXQA 4L3QA 5AQQA 1SKSA 1MU2A 5IT9O 3SBTA 2VWJA 3QEWA 4KB0A 5HLFA 5FROA 3OYGA 1WSGA 2D0BA 4MLEA 3VQPA 2G8KA 4K25A 4MO4A 2XY6A 1VRUA 2YNHA 3NMUA 1UAXA 4CEAA 3TAPA 3J81O 3O6WA 1ZC6A 3N4PA 3ZX3A 5J1EA 3KK1A 4W5NA 4OJRA 3C95A 4BRQA 1R0AA 4CZIA 3CQ8A 1QS4A 2IVNA 4Z4HA 3ZCMA 1QHTA 3BY5A 4LFCK 4K42A 4UY8O 1A5VA 5E26A 4CK1A 1VQ5N 4B3TK 3H3OB 4B9QA 3O4QA 1YI2N 1RFQA 1T05A 5EY4A 3DLEA 1K8KB 1WSEA 1ZBUA 4FCYA 3VQDA 3TR8A 4Z4IA 3P1GA 1RDBA 3L2VA 3NAEA 4O8KA 3E9OA 3TAGA 2BDPA 4DV2K 3RR7A 4O8UA 2YNIA 3L4QA 2XY5A 3HI0A 4R5PA 3AVCA 1ZBHA 3M8PA 1B9FA 4BDYA 2QXFA 3D6RA 1L3TA 4HUEA 4CK3A 3A5OC 1IG9A 2WUSA 2VWKA 4KHNA 2NUBA 3TTFA 1SKRA 4CHQA 4CF1A 1VK0A 4FW2A 5CZ1A 3J7AP 3WXLA 3OYDA 1W9HA 1VQ4N 4WQ5C 3LDLA 3QDKA 3WNHA 1OH6A 3VEZA 5CZ2A 3MEDA 2YHYA 3LDNA 1BQMA 4OX9K 2HHQA 1N5YA 1NGIA 3VEVA 4CF0A 4N5SA 3A5MC 3HOTA 2GUPA 3T1HK 2OPRA 1HX1A 3ITHA 3CFRA 1VQPN 1KQSM 4CHNA 3LWLA 5LJWA 3E1YA 1NOYA 3ZSVA 3AAPA 4FJMA 4BY9C 1C6VA 1KRPA 3FR0A 1HNXK 2VG6A 3ATVA 2A41A 2PBDA 1BUPA 2IVPA 2QEXN 4O4GA 1I39A 5I9EB 3AO2A 4A61A 4RW8A 4JI7K 4M41A 3M8RA 4M63C 1HJRA 1RT5A 4A2BA 3G71N 5JS2A 3QFUA 1VQNN 3L8BA 5AR0A 1NK4A 4EFHA 4CZMA 2KZMA 2Y1IA 4FJHA 3V1QA 1YTUA 1K8KA 3U9DA 2A1RA 1RT1A 4BACA 2VCPA 1C0MA 1XHZA 1DTTA 3UKUB 1WN7A 3KWIA 4HCCA 1S1TA 2OCEA 1X3MA 3V4IA 4XIUA 1Y97A 4FWKA 2E1ZA 1BDGA 1C1BA 1JLAA 5LL6Z 4CJ3A 3U3GA 1MDUB 3VQEA 4QS8A 4CD3A 4CFBA 2IVOA 4FJ9A 4DR7K 1K9MO 1SL0A 4I9LA 1ATSA 1JXEA 2QWOA 4H0VB 2GBZA 4FJNA 2WFBA 5C25A 3OA9A 2O8DB 1WAJA 4PY5A 4DS5A 1WB9A 1CZBA 3EKUA 3H1VX 4A2AA 3BZCA 4DSJA 4F2SA 3H3NO 5EXWA 4V19S 5C2FA 3F9MA 4A5BA 4E7IA 2EWSA 4ILGB 3CJBA 3VF4A 3QERA 3CXCM 3I8DA 4CEOA 3AA3A 2WOMA 4GV6A 2PYJA 4DQRA 1RT7A 4YY3K 3CCLN 4BRKA 4OGEA 3O5BA 3RSEB 1LCUA 1KAYA 4LF4K 4A62A 3AO4A 5KQDA 1RBUA 2QI2A 4J2BA 4KRFA 1NGEA 3F73A 4OPJA 2A40A 4CI6A 3VQ6A 1RDUA 3THXB 5AJ3K 3D2EB 1NGFA 3NF7A 5KGXA 3RR8A 2JLEA 1BISA 3LM9A 3L2WA 3AVMA 1W7AA 4DFPA 4J2EA 2O8BA 4A59A 4RWTA 2YHBA 4YOTA 3CCSN 1Z6RA 4E3SA 3LP1A 1H1VA 4DSIA 3AVBA 1X9WA 2P9LB 2HBJA 3AAQA 4FM2A 3WEEA 1U47A 4R79A 4IEIA 2UU9K 4Z4EA 3CCEN 3O08A 4JI8K 4OKJA 2IGIA 3O9SA 4KHQA 1JLGA 1ZBIA 4CGGA 4CZKA 1YVNA 1VHXA 3KLGA 4K43A 3DRSA 2GX9A 3C6UA 1KCFA 2P9KA 4M3WA 5AQTA 3NH2A 4BQZA 4LF5K 1KLNA 3OBWA 1NK6A 2O8DA 1ITGA 2F7TA 2HF3A 3CIPA 5FPEA 2XO7A 4ISGA 3KK2A 4BDZA 2ZQBA 3U3YA 4MQ3A 3O1BA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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