1ERTA

Human thioredoxin (reduced form)
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOREDOXIN
publication title Crystal structures of reduced, oxidized, and mutated human thioredoxins: evidence for a regulatory homodimer.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 34
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-02-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1ertA00
2V41A 2BMXA 4KDYA 4ZBBA 3Q6OA 3KCMA 3HHVA 5DCGA 1PSQA 1MTCA 2DBCA 3F9UA 2V6OA 3KTLA 3EURA 2IMEA 2IN3A 2NDOA 5DALA 5B8BA 2MMNA 2ZCTA 1Y6EA 1PA3A 3L9VA 5COHA 4HUAA 4TOPA 1Z6NA 5CRDA 3FR3A 4IHUA 4N0VA 1ERVA 1XWCA 4IBPA 1AQWA 2OKAA 2E2GA 3H8QA 1ZOFA 2K6VA 1S3DA 3WGXA 2GT6A 3I6AA 4F2IA 1VRSD 3KMNA 4GRFA 3UMAA 3EWLA 1GL8A 5A5KA 2X8CA 5ECMB 6GSTA 3IK7A 3DVXA 2ZNMA 4LL1B 3A2VA 2OE0A 4N10A 1SKRB 5G30A 2GZYA 5J9BA 2NBSA 4PGTA 3DEXA 2X8GA 2C3QA 3QOUA 3WGDA 1VF1A 2PWJA 2L4QA 2IJYA 1A8YA 3ZYWA 2H74A 4JEDA 1XIYA 4ZB9A 2YNXA 4K6XA 1J0FA 1LJRA 2LKUA 3ERFA 2O89A 1JLWA 4HS1A 3GIXA 2FNOA 4EE0A 2J23A 2FY6A 4OFMA 1SYRA 4ID0A 3C1SA 1TI3A 1B4QA 5IO0A 2KOKA 3KTBA 3RAZA 2LRNA 1PL2A 1FB6A 5DJLA 1WWJA 1XZOA 2P5RA 3APOA 1GSDA 1YQ1A 2QSIA 5CYYA 5IOXA 4KDXA 5IMCA 2YCDA 2CZ3A 2YANA 2C0GA 1BG5A 2VCQA 1B9YC 3J7Yk 2X99A 3M1GA 5J4UA 4E8HA 3M0FA 2GT5A 3TDGA 3QFAC 3KD0A 2QGVA 4H86A 3QR6A 3F3RA 4BL7A 4HU9A 5JCGA 1H75A 2F8AA 2ON7A 1GSSA 4EC0A 3LORA 1YEPA 4ZXGA 1GNWA 1VGLA 6GSVA 3UIWA 4AF2A 4G10A 4ILFA 2FUG2 4TXOB 1M0UA 5D8IA 3GA4A 5FT3A 1ST9A 1USBA 2H71A 4DSSB 3WYWA 3ZREA 2PUKC 3BJ5A 4KH7A 2VM1A 4LLRA 4AJ6A 3MWHA 5AGYA 3IPZA 5GZZB 4Z7XA 7GSSA 2AHEA 3IR4A 2A2SA 1BEDA 2R3XA 3FR6A 1FO5A 4ZILA 5J41A 4OFNA 3P8WA 1XOAA 3CRTA 3HKRA 2F8FA 3G9BA 2C0EA 4CW9A 2P31A 3LQ7A 3FRCA 1TK0B 2IFQB 1IYIA 2H76A 3RBTA 2OJLA 3I9V2 3HZ4A 1AAZA 3HJMA 3D4TA 1Y25A 5ECQB 4F03A 2R37A 3P7XA 2M72A 2G2QA 1TRWA 5LCZA 3BCKA 4ZL8A 4X1UA 1GUHA 3ZIJA 4KW6A 4FYCA 1PMTA 2I81A 3WT1A 4EO3A 2FCHA 4MLYA 1GLPA 1MDKA 5HFGA 4BVYA 1M2BA 4OO4A 1QGVA 2KP2A 1PD21 1N8JA 3HVSA 3S9FA 3EYTA 4IVFA 1VF3A 4WBRD 2GS3A 2RLIA 3P90A 1K0AA 3FEUA 2R4VA 4PUAA 5IPHA 3F3QA 1AC1A 2GSSA 2WS2A 2LSTA 3DMLA 2V1MA 3IOSA 4K9ZA 5D93A 3LG6A 4NHZA 3IAM2 1HNAA 4NPBA 4OCEA 1MDJA 3FZ5A 2L6DA 2E2MA 2N5BA 4HQZA 3TJBA 3D0ZA 3D6IA 2CVBA 3VWVA 2CV4A 2YWNA 3DIEA 1I5GA 3WT2A 4DSQA 3VWUA 2CAQA 2LNTA 3J7Yb 1AIUA 1NM3A 3DD3A 5CNWA 5LD0A 2TRCP 1ZMAA 2H1DA 4JE1A 2EIOA 4MZBA 1XW6A 5IMZA 5D9VA 3U6VA 1MD4A 2IIYA 3UBKA 4TR1A 5DDLA 2HZEA 4KAEA 1AUCA 3BBYA 5H5RA 2WRTA 2WZ9A 4HI7A 1A2LA 1QXHA 5JWRB 2FHEA 1JHBA 8GSSA 4OMVA 2OACA 1O81A 1F3BA 2VOCA 5CAXA 2C1YA 2YWMA 3O6TA 2MMZA 2JADA 5DAKB 4PNGA 2L6CA 2HSYA 4WKWA 1AW9A 4MJBA 4D73A 2X8HA 1OC9B 3QAVA 4EF0A 2LQOA 2E7PA 4PQIA 4HQSA 1G7OA 1FVJA 4OO5A 5ECSA 3M9KA 2H0IA 1TXXA 1SKWB 3VLNA 3Q18A 2ZUPA 5CRHA 4G9HA 5EVOA 2OADA 2IMFA 4O32A 3VPQA 5DQYA 2WDUA 1XBSA 1B48A 1JZOA 1J08A 2IMIA 4LA1A 2FA8A 1GRXA 4MABA 1X9SB 3UAPA 5E4WA 2R5GA 1NHOA 4NV5A 3CMIA 3VWWA 2K8VA 4DVCA 2FWEA 4TVEA 1KNGA 1YF1A 3ZITA 2MMOA 2GQLA 3IHQA 1TU7A 1THOA 1K3OA 1R26A 3FYGA 1GNEA 2GTUA 1V40A 4TRXA 3UBLA 4J2FA 4IGJA 1DE1A 1HD2A 1TRVA 1M7TA 4RUVA 2EC4A 1K0DA 4POMA 5ID2A 2LJRA 3G7JA 5IOWA 1GSUA 2MMAA 4GSTA 3NOFA 5AN1A 4EVMA 4DSRA 3IK9A 2B7JA 4YH2A 2CZ2A 3VWXA 4POLA 1TOFA 2H0GA 2GLRA 1GTUA 1RK4A 1YKCA 2HZFA 6GSUA 4ML1A 1DUGA 1M99A 2JZSA 2JACA 1V58A 3DYRA 5J5NA 3UL3A 5JWQB 3KGKA 1FB0A 2RUFA 1PX7A 3DVWA 4YQVA 4WR4A 3L0HA 2HYXA 1MD3A 2CAIA 3TKSE 3ED3A 5C00A 1T7PB 4F82A 3GFKA 5HR2A 3TOTA 1TW9A 1PRXA 2DJ0A 4I5QA 1A8LA 5IQYA 3QCPA 2I1UA 4L5LA 1XXUA 4HOJA 1R5PA 1GLQA 4KDUA 6GSYA 1U87A 4J57E 3ZRDA 2AYTA 3GRXA 3UOMA 3QAWA 1AQVA 3IE3A 1JZRA 5CO3A 1XWBA 1T4YA 2GDRA 1QFNA 3GKKA 2D2ZA 3KEBA 1QQ2A 3EVIA 3IC4A 5C04A 1JFUA 1GTAA 3NZNA 5FHIA 4MJEA 4MF5A 1W89A 3PR8A 2H30A 3TJFA 3KIJA 2OA7A 5IMFA 2PN8A 4GTUA 4L8EA 5F05A 3K8NA 1SU9A 3CSHA 5B8AA 1TDIA 1ILOA 2H1BA 3FHKA 1THXA 2VIMA 2HRFA 2FLSA 4QL7A 4WEYA 3TKPA 4CDOA 5ELAA 6GSSA 3HJPA 2WCIA 3GURA 1GTBA 3N9JA 3H1NA 4KE3A 2HE3A 1ABAA 2NTOA 2FWGA 12GSA 3DKSA 2GZPA 3LSZA 4V2LA 2O7KA 5L71A 3GKNA 3TJJA 3HCZA 1LBKA 4GCIA 3M3MA 1BJXA 22GSA 5DQSA 2CT6A 5F8BA 2VLVA 4V2MA 1EV4A 3TRPA 17GSA 1GSFA 3LXZA 1EP8A 3LFLA 1UA5A 4BA7A 3D22A 4ECJA 3GH6A 4ZBAA 2PVQA 3F4SA 5H5SA 2FD3A 1E2YA 1BAYA 1TK8B 4KB3A 2NVLA 3ERWA 1BX9A 2PMTA 1B4PA 3IV4A 4MH3A 1GUMA 3VI7A 3CRUA 1XW9A 1SJIA 2YPMA 4LMWA 1S3AA 3W8SA 2X64A 4KSOA 1OE7A 4I97A 3HXSA 2K8SA 5D73A 4ZB8A 4E8EA 2IL3A 3DXBA 4L5OA 2KP1A 2FA4A 4KX4A 2KLXA 2VLTA 4ZL9A 4I8BA 4FYUA 2LUSA 1HQOA 5DVBA 4KUNA 4GWRA 1A0FA 3DGQA 1TRUA 1PGTA 3Q74A 1K0NA 3GL3A 4PQHA 3F4RA 1FG4A 1K0MA 3WGEA 3IRAA 4BWSA 2LTKA 3CSJA 1XPVA 3HVVA 3ZFLA 1GP1A 3GYKA 2F9SA 2V32A 3ISOA 2N5FA 1SL0B 2E0QA 1O85A 1NHYA 2R6KA 4I2TA 1ZGNA 3GNJA 3I69A 3IXRA 1EEJA 3N5OA 3US3A 3D4MA 3GV1A 4J56E 1WRYA 4HJMA 5HQPA 1PL1A 1YKAA 1XFLA 2L5OA 1T8EB 1I9DA 4IW9A 1K0OA 3GSSA 4EDYA 4NV2A 1CQGA 1LU4A 1M2AA 1OVNA 1XOBA 2WGRA 1HNBA 4MMMA 4MA9A 4K0GA 1YJ6A 4GSNA 1X5DA 1KBNA 2DLXA 3ZL5A 5G1LA 5JCUA 5H5QA 3MAKA 3HVXA 3BCIA 2B5XA 3L9SA 2VM2A 1Z3EA 1SL1B 4BVXA 1FHEA 3ZZXA 4K7OA 4ECBA 2M46A 3ZMLA 1M9AA 3D21A 4I2UA 4XTSA 1F2EA 5DBQA 1GUKA 2YJHA 2JZTA 1X9WB 4MH2A 1T00A 3QMXA 2G0FA 4FH8A 1WPIA 1URMA 2C4JA 16GSA 1WE0A 1IYHA 1NSWA 4TR1B 4MPFA 2LNSA 2CQ9A 2HZEB 2FWHA 3RPPA 5G5EA 3ZFBA 4P3YB 1EP7A 1SJ6A 5A4WA 4WR5A 4K8MA 2L5LA 2VCWA 2IFQA 5AIXA 1G6YA 2YZUA 1OKTA 3ZIVA 11GSA 1GSYA 1WP0A 1SYXA 4KGIA 4X43A 2PU9C 1V9WA 2XPEA 3GTUA 2GSTA 2Z9SA 4D73B 2O87A 4MJAA 3DWVA 4NWYA 3W8JA 1GSEA 5IM9A 3GHAA 2VL3A 1R5AA 3FY7A 1V2AA 4F0BA 3CYNA 1PKWA 3CTGA 4HDEA 3F63A 4N30A 2LRCA 3HD5A 4FYBA 2H1AA 5G2ZA 2AJQB 3UEMA 2IMKA 3H93A 1F37A 4QQ7A 2PERA 4XHMA 2YV7A 3LYPA 3KH7A 1KTEA 5G1KA 2H70A 2C0DA 2ALBA 3LJRA 4KNDA 4AGSA 3IDVA 3RPNA 5EPFA 2P0GA 4ZBDA 2QKEA 4POBA 1K3LA 4OCFA 3GKMA 1OE8A 4IQAA 5HFIA 3QPMA 2AV4A 3HDCA 4HU7A 2H19A 6GSWA 4AJ7A 3OR5A 10GSA 3UJ1A 1M9BA 3PINA 1TKDB 3LYKA 4MF6A 1RW1A 4RQXA 1ZL9A 3VFIA 4WF5A 2VL9A 3C7MA 5E59A 3F4TA 5FWGA 1X5EA 5CRWA 5GAPD 4YAPA 2FWFA 2YWOA 5ID2B 3EINA 1YY7A 3TJKA 1O8WA 3A2WA 2YJ7A 2K18A 4MP4A 5DCHA 1O7UA 2H6XA 2DJKA 1WMJA 4WBJA 4ZB6A 1SK0A 4K7NA 3GH9A 2H75A 2DJ1A 1XVQA 4JRRA 2DJ2A 4TXVA 4IKHA 4XS4A 2H73A 1EOGA 2V6KA 3APSA 1EGOA 3EE2A 3LXTA 3PGTA 3ZVJA 1ERTA 4HZ4A 3L9UA 2MBSA 4KCAA 3G7IA 1Z6MA 4XRDA 1SJZA 3TJGA 1GH2A 1ERWA 3VPTA 4JR6A 2OE1A 2CA8A 3KH9A 2NPBA 1TK5B 1C72A 4XS1A 3GSTA 1Z9HA 2A4VA 3GL5A 2VL2C 5IMDA 3RHBA 2JL4A 2XC2A 5ECRB 4NAXA 4Q5NA 2HRNA 5LNKe 5A4VA 3EU3A 4ML6A 2H6YA 3O76A 2MYGA 2VD0A 4OD7A 3CTFA 5KN2A 3FZAA 1EEMA 4HJ2A 2GGTA 4GSSA 3U5RE 2AAWA 2ES7A 2DC5A 2VL2A 5DALB 4IP1A 2P5QA 1QMVA 3KZQA 1G7EA 4G2EA 4FO5A 3HA9A 3LGCA 4NMUA 3H79A 4F0CA 5D9WA 1OAZA 1YDKA 2DMLA 4BWQA 4PX1A 3O3TA 5GAND 2DJJA 3V1WA 4GLTA 4WETA 3CBUA 2CVDA 5IMAA 4RQRA 3M9JA 4AJ8A 3TGZA 3TKSC 5GSSA 4WF4A 4GXZA 1OC3A 2YOIA 1A24A 3NIVA 4TR3A 4KCEA 4EXJA 2RUEA 2H66A 3R2QA 1N2AA 1F3AA 1G0TA 2M80A 2VUPA 3KXOA 3FKFA 2HFDA 5ENUA 2AB6A 2R2JA 4YQUA 3ZTLA 3E9JB 3TKSA 2GZZA 2B5EA 3UARA 2VLUA 1H4OA 1Z7PA 1B9XC 3HYPA 2LEGA 3CXGA 1YEXA 3BOAA 5D9XA 1BYEA 2WFCA 1O8XA 5ECOB 4MF7A 4PXOA 3LWAA 1DE2A 4Q5QA 1YZXA 1TTZA 1TRSA 2C80A 2L57A 2N5AA 3FZ9A 2LQQA 2EIQA 2PPTA 5CP1A 2RIIA 3F8UA 4L0UA 1WIKA 2KHPA 5B6NA 2H01A 4TW5A 2PVOC 4L0WA 2BTOT 2CX3A 1JZWA 5IO2A 3ERGA 4IJIA 2XPDA 5EL8A 1Z5YE 3GN3A 5ECLB 4PUFC 4IJ3A 2IPAA 2B6MA 5A4UA 1FW1A 1SD8A 1NW2A 3TCOA 3UVHA 2VCVA 3I43A 2H72A 1MEKA 4KSMA 1ZYEA 1PN9A 3E3EA 2LRTA 2TRXA 1S3CA 1SKSB 2C8UA 3KP8A 3RHCA 5DJMA 2GSRA 2F51A 4Q5FA 4NXIA 3MDKA 3LEFA 1A2JA 2B1LA 3CSIA 4GQFA 3A3TA 4NHWA 2A2RA 5AISA 5F07A 4TKYA 1OC8A 4K1FA 2C3TA 2B5YA 3ME7A 2IMDA 5G31A 1K0BA 3FW2A 3F0IA 3TUEA 3Q19A 1ERUA 1B8XA 4JR4A 2OE3A 1QUWA 5ECIB 5HFKA 1Z7RA 1TJDA 2WJUA 5ECNB 5J9CA 3G7YA 3SBCA 5IMVA 3UVTA 4K2DA 3EMPA 4IN0A 2DMMA 1UN2A 4MZWA 2LJKA 1HNCA 2YZHA 2REMA 4KA0A 1ZYQB 5KN3A 4PURA 3APQA 1O73A 4N11A 3TOUA 1WOUA 1FOVA 4Q5RA 4TN8A 2LS5A 3E0UA 3ZLPA 5J3RA 2TIRA 2VO4A 4O92A 3EMXA 3FZ4A 1ACVA 3TB2A 4XCSA 3KP9A 2PBJA 5B6MA 4MJCA 1TI1A 3KMOA 4POKA 4EL1A 20GSA 5HR3A 1FAAA 3C73A 4I6XA 2RM5A 4EKZA 2B7KA 3A2XA 4LMVA 2MZCA 1XWGA 1PX6A 2VCTA 3HZ8A 1GULA 3GUSA 1SENA 1GSQA 4ACSA 2YN1A 4XRAA 1E6BA 3L4NA 1TU8A 5IPGA 4TXOA 3A5WA 3VI5A 3M8NA 1UVZA 1QK8A 5ABRA 1OYJA 4DSSA 3WD6A 1WJKA 2YP6A 3GTUB 3KJYA 4XS6A 2QC7A 4TR4A 9GSSA 2H0HA 1AQXA 3EU4A 3C1RA 2XBQA 2XBIA 4GF0A 2O85A 2AUVA 2B1KA 1VF4A 4O7HA 5G5FA 5ELGA 5AIVA 5ECKB 2OBIA 3HY2A 3GMFA 2J9HA 5ECPB 2H8LA 3GX8A 4TR0A 2RM6A 4MK3A 2LV3A 5CRGA 2GSQA 1ML6A 2C0FA 2WB9A 5GSTA 1BQ7A 3HJOA 3C8EA 2MBTA 4QL9A 1T4ZA 3IA1A 5B7CA 4MDCA 4V1Ap 3L78A 4RI6A 5ECHB 5D96A 2LJAA 1V98A 5KEJA 4EUYA 1T3BA 1DBYA 4K7IA 1X9MB 2ON5A 4WXTA 19GSA 1SK2A 4PNFA 2VAFA 4MCUA 3TKRA 3QAGA 3MNGA 2GQKA 2C3NA 1TP9A 1SL2B 2HI7A 3GKXA 1M2DA 1K3YA 1OKDA 1F6MC 2DJ3A 1EOHA 3JCML 4N0ZA 1EZKA 1DSBA 1EGRA 4IP6A 4ECIA 4YQMA 4DEJA 2YV9A 3C71A 2OBKA 2IWTA 3RDWA 3P2AA 1U6TA 1ZZYA 1X0RA 3QD9A 2B3SA 2JSYA 4XS4B 1V57A 2GVPA 2VCZA 4IS0A 4F9ZA 1R7HA 4ISDA 4RI7A 4XIHA 5EY6A 4X0XA 5CREA 3H4KA 5HR0A 1UC7A 3F6DA 3IBHA 1U88A 3BD2A 2H1GA 5F0GA 3VURA 1VF2A 3D5JA 1MDIA 3AY8A 1XVWA 3TRQA 2WULA 3VK9A 2YWIA 1A23A 3TRXA 2VCXA 4PQ1A 4FIWA 2CX4A 5F06A 4OWYA 1JZDA 4OFTA 2KUCA 2O8VB 2K9FA 4ECCA 2PGTA 3GX0A 2EIRA 1U3IA 3IAS2 5DAKA 2BJXA 2HSHA 4BPYA 4EDZA 1F9MA 1J9BA 5KN1A 1KEBA 4GQCA 2VD1A 1OC9A 4MZCA 1SK1A 2HNLA 18GSA 4JZQA 4YAVA 2L4CA 2GQMA 1PQNA 1X5CA 2I9HA 4ZL7A 3ME8A 14GSA 3ZMKA 1HYUA 3QFBC 4G19A 1XWAA 4HZ2A 4O5RA 3FR9A 5HR1A 2CVKA 1T1VA 1A0RP 1EWXA 3MSZA 5JWOB 2L59A 2JU5A 3EC3A 5IIZA 5INYA 3F6FA 2I4AA 2DIYA 4JBBA 3TKQA 5D9TA 1K0CA 4JU5A 4LL4B 1A2MA 4HEA2 1ZCPA 1EV9A 1YF0A 4K0NA 1AXDA 2HLSA 1ON4A 1O6JA 2V2GA 2JSZA 2HT9A 1R4WA 4ZIJA 3DRNA 2H6ZA 2DIZA 2F3MA 4IQ1A 1SD9A 1U3AA 1GWCA 4V2NA 3KM6A 4ULXA 2FGXA 2DSAA 1GTIA 3W6GA 2JZRA 3SWLA 4MPGA 5JCWA 4V1Ag 1W4VA 13GSA 1PKZA 3QDNA 4IELA 5KN0A 3ZVJD 2HXKA 1CQHA 1RQMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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