1EZ9A

Structure of maltotetraitol bound to open-form maltodextrin binding protein in p1 crystal form
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural evidence for a dominant role of nonpolar interactions in the binding of a transport/chemosensory receptor to its highly polar ligands.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
total genus 123
structure length 370
sequence length 370
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ez9A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ez9A01
1ZMGA 1H43A 1O7TA 4GFRA 1IZ1A 4L17A 2M8CA 3E13X 4UA8A 1B5IA 2O7IA 4HCWA 3KN7A 2GRVA 1ATGA 4BDLA 3TEPA 2Y7IA 2XXPA 4R2BA 4DE8A 2XXQA 1ZU0A 3VLUA 4F31B 1WDNA 4ZECA 1MY4A 3K6XA 3B6QA 1M5DA 1FQFA 4F2OA 4G8NA 1H76A 5IAIA 3IO4A 3WAFA 2V3UA 1RYOA 1ZLQA 3G7WA 2PBWA 3ONMA 4JSDA 3M8UA 1YTVA 1M5FA 1DPEA 2QS4A 2CZLA 3VFJA 1B3FA 3W9WA 2Y7WA 4IY5A 2Y7KA 3QAXA 3CVGA 4LA9A 1FQBA 4LZ8A 4KFQA 1MXZA 4JWYA 5L9MA 3N94A 3OO6A 4GWOA 4EF1A 1OQGA 1LBCA 4U4XA 3IB1A 3HHGA 3PV0E 4LVQA 2B3BA 2F7BA 2XHDA 2OJTA 1LAHE 1MS7A 4H67A 4R73A 3EHSA 4N6PA 3ECRA 4O3BA 3KBRA 3MP6A 1JW1A 1VR5A 2HAVA 1R9QA 3QYTA 3RUMA 1J1NA 2XX9A 3PMWA 3MZ9A 4PFWA 4Q30B 4JDFA 3V83A 2H99A 4DXBA 4DIGA 3O28A 2ALUA 3T9UA 3K4UA 1MY1A 4FECA 1O64A 3L6GA 3LBSA 4KYEA 4GD5A 5DVIA 3T9XB 1DOTA 4LZ5A 1R6ZA 5BUUA 2RC9A 2XXWA 1SYIA 4QSDA 1N3XA 2F8DA 1IXCA 4OEVA 1MY2A 1NH7A 5FHMA 3JV9A 1Y1ZA 3KN3A 4GL0A 4OFJA 4YB5A 1O63A 2FA7A 2YLNA 4Z0IA 1SDXA 3OEKA 3S9LC 3PPQA 3VLVA 4OERA 2X7QA 4DLDA 4I62A 2QS3A 2I4BA 3M3LA 3TKDA 3G3JA 5FTIA 3MVZA 2W7YA 4JWXA 2ANJA 4HCYA 4JXIA 4FEBA 4FIMA 1S9TA 4H1XA 4F39A 1UTBA 4OTEA 2I3VA 1TWYA 2P0SA 2DYXA 3C9HA 4NEDA 3EPEA 1EZPA 1LAXA 2XD2A 4ECFA 3RY3A 5KDTB 4C0RA 1B4HA 1B5HA 4ZDMA 3ODBA 4OFOA 3K1NA 3TCHA 4G4PA 5KZTA 4QRZA 1ANFA 2I4CA 2ABHA 3RTFB 2GHAA 4KCCA 4E0XA 2H4IA 2RCBA 4F1UA 3U92A 3TYHA 1DMBA 4LZ7A 3FXUA 3IJXB 4DXCA 4IO2A 3CIJA 5H8QB 3QIMA 5F7VA 3TAJA 5I2NA 4IO6A 2UVGA 5F1QA 4YB6A 4NF4B 2OZZA 3BFUA 3C32A 3VXCA 4IGTA 3QK6A 3DELB 5FHNA 3H7MA 2NXOA 2DWJA 5I57B 4G68A 2AL4A 1MRPA 4ESXA 4N13A 2O7UA 2VD2A 3K00A 2O69A 4GOTA 2XXUA 1B7ZA 2XXTA 1MPBA 3SETA 1MPDA 2V25A 3ZKLA 1Z7NE 1N84A 3UP9A 2O6AA 4NE4A 2Z8DA 2R6GE 4ZEIA 3K0VA 2XD3A 1SI1A 4F3SA 1OQHA 1B05A 3CSGA 4OZ9A 4GVOA 3I5OA 1AL3A 1LLSA 4OFLA 5CMMA 2I49A 5EHSA 3FVGA 4R9FA 5JTYA 4U1ZA 1RKMA 1P1NA 5B7DA 1LFHA 1II5A 3TELA 3KZGA 1MXUA 3K02A 4YKPA 5EYFA 3EN3A 3TMGA 5AA1A 4XXUA 2PVUA 2H9BA 3LSFB 3HHFA 1SW2A 1QUJA 4K3FA 1MM6A 2ZNSA 4KHZE 2Q2AA 2RINA 1LAFE 3ZSFA 4DXUA 3RT8A 1DTGA 1SW1A 3IOUA 2ZNTA 2GHBA 2UVHA 2D21A 2DP8A 3DP8A 3S9EA 2UXAA 3IAZA 1USYH 2I0CA 3MUQA 1Y1MA 1N76A 5AA3A 1FW0A 1MXYA 2H25A 4OXVA 1M5CA 4NWDA 3TZAA 2QS1A 1H44A 5DEXB 3D4CA 3MC2A 1ZJLA 4XKPA 5I56A 2F78A 3F11A 3M3KA 3N6TA 4OENA 3Q28A 3OO7A 1B51A 2V3TA 4NF8B 2F97A 3FD3A 3H06B 1GTKA 4XKNA 4WEPA 2XXRA 4EF2A 2H5YA 1DPPA 2HQ0A 2VD3A 1FTLA 3RPWA 4F3BA 4ZEBA 1BIYA 1FCKA 2E0SA 4R6YA 1RYXA 1B3LA 3O6IA 3RNNA 5CRYA 3MP1A 2REGA 4FATA 3FIRA 1UQWA 3OMBA 3TFLA 4H0WA 1B40A 2ONRA 1MY3A 1UTHA 3IB2A 3EF7A 5I59A 3TPAA 4ONYA 1LGBC 4IO3A 5ITOA 2OCUA 4FORA 3M3FA 2Y84A 2V84A 1EU8A 3K1PA 4HTGA 2V93A 1IXGA 1B1HA 4JWOA 1I6BA 4UACA 3N5LA 1B1XA 3TUSA 1JEVA 2QMXA 5I58A 3Q27A 2XX7A 1QKAA 3PPNA 3S9NC 5I56B 1SW4A 3OSRA 3VXBA 5TU0A 1PB9A 4DCXA 3R7XA 4OYVA 3O6HA 3SESA 2ESNA 2Z22A 1Y4CA 3T9HB 4NMYA 4QFOA 2HXWA 4OWDA 4H8IA 1MDQA 4P0IA 5AA4B 3O2AA 2I0BA 5M2VA 3B7DA 3PUXE 4C1UA 4RY1A 4OVJA 1M5EA 1P1WA 1EZ9A 4EXKA 2X26A 1LB9A 3KG2A 3H6WA 5TP9B 3PD9A 3HPIA 5I59B 3WAEA 5DVFA 3FJGA 4WEDA 4ZEDA 5H8HA 4YMBA 5L9OA 3PUVE 1FTJA 4LQ5A 4RK9A 3HO7A 3TDJA 3MJNA 5I58B 1LSTA 3LUYA 1PBQA 4QSEA 1M5BA 2X7PA 1NFTA 3H6VA 4BDMA 1H3DA 3EHTA 2UVJA 5B70A 1VSOA 1B5JA 2B3FA 2OLBA 1HSEA 2I3WA 3MAMA 4RK2A 4KCDA 4POXA 3I6VA 3HN0A 2QMWA 4EQ7A 3BKIB 3T9VA 5ITPA 1Y20A 3U1OA 4NF5A 2HZKA 1WVJA 3PUYE 3TQWA 1MPCA 1UIVA 4YU0A 1LFIA 1NL5A 4G77A 4F2QA 3FVOA 3B6WA 1A40A 4X1DA 3T93B 3G3KA 2OBGA 1LB8A 3HV1A 4GIZA 5CM6A 3FGSA 3TODA 4Z7EA 3S4UA 3USDA 3RT6B 4H6DA 5AE4A 4I9DA 1NH8A 3Q29A 1JETA 2WKYA 1T0KA 3IOWA 1US5A 2RC8A 3G3GA 1DTZA 4FE8A 1R9LA 2A5SA 4BDOA 4THIA 5H8HB 2QPQA 5EHMA 3HSTA 2NWJA 1PB7A 4U22A 1B46A 5ICTA 1SVXB 4OETA 3VV5A 3PUWE 1TFAA 3FJ7A 2B65A 2XXYA 4OESA 1HSJA 4O3AA 2F7AA 4P11A 3MZ1A 1N7WA 3TCGA 2HEUA 5ELVA 4EUOA 1SI0A 1PEBA 3KN8A 3PPPA 5DVJA 4PFYA 1D3KA 5TPAA 4NF5B 2AIXA 1IEJA 4GF8A 3TTNA 3KJTA 4PFUA 4R9GA 1EZOA 4F3PA 4LP2B 1DSNA 1N04A 4TLMB 3CI8A 2Y7RA 2ZNUA 4N07A 3E9XA 2I58A 3FXQA 5AA2A 1FTMA 2REJA 2Z8EA 1B3HA 3SEUA 3TTRA 4RXLA 2DSFA 1XT8A 3PU5A 2QJEA 5FTHA 2PT1A 1P1QA 4F3GA 2UVIA 1P1OA 3GZGA 1MH3A 4NF6A 4KQPA 2ZMBA 2O1LA 4U21A 2XXHA 4YKKA 1BLFA 3UA8A 1IIWA 1POTA 1B4ZA 3S2VA 2F7CA 1UTBB 4EQBA 2NUVA 2OWSA 2RCAA 4IY6A 1F9BA 3RGYA 3O9PA 4RYAA 1R1NA 1KWHA 4KR5A 3MZBA 4KYSA 4ZS9A 1XS5A 1IXIA 3LC8A 3MVYA 1NMUA 5HM4B 3MW0A 4X1BA 3CRBA 4MBPA 4P0GA 1MXVA 2YJPA 4NTLA 4GLIA 3E3KA 1LCFA 4TOZA 3RLFE 1BP5A 2I6EA 5AA2B 4FJPA 5I84A 1Y3NA 3IR1A 2F36A 4MLQA 4X9TA 5BWJA 1JVXA 2AL5A 2F6GA 1VE4A 5I2NB 2A5TA 3C34A 3G3IA 4ZEKA 4ELRA 1PBPA 5K2YA 4LUBA 1I69A 4NF6B 3ZS6A 4G2ZA 4RPOA 3SEYA 1AOVA 3C4MA 3FATA 4ZZEA 3UORA 4ELQA 1ZIUA 4OQOA 2Q2CA 3MVXA 1B52A 2O51A 3UIFA 3DP6A 2F5XA 1MY0A 4G68B 4POWA 4KD5A 4OMBA 2Z8FA 1CE2A 1B0HA 3MP8A 3OO8A 3VVEA 4Q0CA 4F18A 3EHUA 5FHOA 1N7XA 3RTWB 3K6UA 2QSXA 5A5XA 2ONKE 2F6PA 4YKIA 1MDP1 2VOZA 1NKXA 1JQFA 1FTKA 4O3CA 3MPLA 4HS7A 3CFLA 4I8CA 3C36A 3W9VA 3LR1A 3UK4A 1Y9UA 3K6WA 4BDQA 3U94A 2PYYA 3SKPA 1B6HA 5JTYB 5HBCA 3TTMA 3TCFA 1TFDA 1MG1A 3U72A 4R6KA 3QSLA 1SQYA 2FYIA 3H4ZA 3D4GA 3T96B 4BDRA 3FUZA 3TTKA 3T22A 4I1DA 3UN6A 4F19A 4JBZA 2F34A 3MVWA 1QJMA 2DVZA 2HAUA 3DLNA 3MBPA 1BTJA 3JYRA 5CBRA 2QL3A 3DP4A 4G8MA 3L6HA 1LBBA 1A8FA 2BJJX 2NVUB 2AYSA 2XXXA 5ICQA 3E4RA 1MQGA 2G93A 4YMAA 4RNSA 2OK2A 4QF9A 3OD7A 1P99A 1JVYA 3Q26A 3H03A 3UGWA 1MXXA 3P7IA 1B58A 2UYEA 2HCAA 3N26A 5DTBA 5DT6A 1NNTA 4PQJA 3O29A 1TXFA 3TTLA 4KPTA 5HPQA 1NNPA 1QKBA 2RC7A 1GGGA 3OENA 4ELOA 4ZEFA 3K1MA 3DM0A 3FXRA 3V5AA 1URSA 1QVSA 3FZVA 3PUZE 1BKAA 3FV1A 2Z23A 4R75A 4LATA 3K01A 2Q8JA 4KYDA 2PMSA 4XTCQ 2I48A 2O1MA 1B9JA 1MQDA 1UTHB 4ELPA 4RA1A 1JEUA 2Q9TA 4TLLB 1OVBA 1AH5A 4R2FA 2DQVA 3Q25A 5I2KA 2RKMA 3LSWA 1PB8A 5H8NA 3QUFA 1GVCA 3ILTB 4QSCA 4DDDA 2R71A 1A99A 3OO9A 1A8EA 3KGCA 4GXAA 4M1VA 1ZTYA 3RN8A 3OEMA 1JW5A 4AB5A 1XHYA 1B3EA 3C33A 1LCTA 3VVFA 2Y7PA 1PDAA 3KSJA 3G3HA 1P1UA 3FV2A 3PGFA 3GBBA 4Q5TA 2YPNA 2E1SA 3C31A 4YB7A 1Y3QA 1OVTA 4ZE9A 1QULA 3CG3A 1GV8A 3O6GA 5CC2A 4YICA 1L5TA 5L8DA 4WKMA 1GR2A 2ONSA 4FEDA 1B0LA 5KDTA 3CFZA 3T66A 4IGRA 4GQOA 4C1TA 1IXHA 2GFEA 3I3VA 3SERA 3FJMA 5CBSA 4QFPA 4GL8A 3MPKA 4QFNA 1MM7A 1MQJA 5ISUA 5I2KB 2RF1A 5H8NB 3B6TA 3PMVA 2D5WA 2R9JA 4U23A 3IK6B 4FAJA 1S50A 1PC3A 4F22A 1OMPA 1B2HA 1FQEA 4XKRA 4XKQA 3H6UA 5IKBA 5H8QA 2VGQA 3KOSA 5JK4A 1Y4TA 4H5FA 4RPNA 4GRKA 3RQTA 2DWIA 2F35A 1UIUA 1POY1 4ZE8A 4LONB 5KCJA 4MH5A 4DCYA 4NF4A 4ND9A 3R6UA 3O97A 4MFIA 3O66A 4OHNA 3IX1A 3THIA 4DZ1A 4H65A 1B32A 2ZXTA 1D9VA 5K2XA 1SD3A 3IB0A 1XC1A 3KEIA 4R6HA 5I57A 2P2AA 3C35A 3KFMA 4PETA 1NNFA 3LSLA 2XX8A 1SYHA 2PT2A 3CG1A 1ZKBA 3QUJA 1ZBMA 4QFKA 3QXMA 3U93A 1FQAA 1H45A 1D9YA 5H8SA 2ZYMA 2OWTA 4MF3A 4TQUQ 5CMCA 1IQ7A 4IO7A 1QW0A 1B3GA 1FQDA 1MQHA 3VLWA 1YCJA 3BFTA 1ELJA 4YKJA 4IB2A 4GXSB 4KI0E 3K6VA 3PD8A 3V8XB 3AXFA 3H3GA 3OSQA 5KCJB 2V3QA 5TPAB 2HFBA 5CMKA 4PFTA 3ZKKA 3OOAA 5DYHA 1A7LA 3CR9A 3TQLA 1HSLA 4U1OA 3A09A 3GXAA 3IL1B 2NOOA 1N3WA 4AQ4A 1CB6A 2QS2A 3V89B 4YAHX 1OIBA 2G29A 1I6QA 3PMXA 1B7HA 1SBPA 4PE5B 3MQ9A 1XVYA 3U8QA 3JZJA 3SEXA 2GH9A 2DOJA 4ISUA 2VHAA 1MXWA 3KJ7A 1SW5A 2DXRA 2UYFA 4F29A 2ZYOA 3SEVA 1A55A 3KSXA 4WXJA 5DEXA 2DS9A 1N0TA 3PPRA 1VFEA 5L9SA 1URDA 1S7YA 2IA4A 4QHQA 2P1SA 5JEIA 1XVXA 4NF8A 5AA2D 2D3IA 2DVCA 1OLCA 3IORA 1IUDA 4QFLA 1EH3A 3G3FA 1QUIA 1I6AA 1VFDA 3OELA 5H8FA 3N6UA 3FVKA 4LQ2A 1A54A 3BBRA 1AIVA 1FQCA 3IO6A 2PX1A 2ZYNA 2LAOA 1FTOA 5CMBA 4IO4A 3IJOB 3OXNA 3H6TA 5LOMA 1XOCA 4U2RA 1LAGE 2CMOA 2DE3A 2DWAA 2ZYKA 1YAEA 2A5TB 3VE1B 3CFXA 2DE2A 2DXYA 3LSXA 4JB7A 5CI5A 2Q88A 3KOTA 3SDFA 4NWCA 3VDFA 2THIA 4G68C 4BLAA 2O84X 4OEUA 4M4GA 2H98A 3EQ1A 3FASA 1USYE 2FNCA 3W15C 1NNKA 1URGA 1IITA 1Q1KA 3PPOA 4G8HA 4PP0A 2KLFA 4H5GA 1US4A 2Q89A 4IO5A 1AMFA 4EXLA 3A3UA 4R74A 5J1DA 1MH4A 2IEEA 2XXVA 1OLAA 1Y3PA 1MQIA 1QUKA 1YPNA 4X48A 3VVDA 5H8FB 5A5XB 5AA4A 1B7UA 2HZLA 4JSOA 4HW8A 3GLBA 1D4NA 4RJZA 1TT1A 1Z7ME 1Q35A 3ILUB 3K2DA 2O68A 2QRYA 4YZZA 3SEWA 4MLVA 3HCQA 1WODA 1LFGA 5TP9A 2XXIA 3MWBA 4R72A 4H8JA 3IOVA 2DE4A 4EQ9A 1JNFA 4U4SA 4E0WA 3IOTA 2DWHA 3S9MC 4AB6A 4Q8RA 4ZZAA 4F1YA 4ESWA 3A3CA 1JW4A 3GBAA 4XIGQ 2VP1A 3CSBA 4EDPA 4F1VA 3R26A 3FVNA 4BDNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N8YA 1ZMGA 1H43A 4PTKA 1O7TA 4GFRA 1IZ1A 4L17A 2M8CA 2B4LA 3E13X 4UA8A 1B5IA 4OVQA 2O7IA 4HCWA 3KN7A 2GRVA 1ATGA 4BDLA 3TEPA 2Y7IA 2XXPA 4R2BA 4DE8A 2XXQA 1ZU0A 3KC1A 3VLUA 4F31B 1FPJA 1WDNA 4ZECA 1MY4A 1NUZA 3K6XA 4PFRA 3B6QA 1M5DA 1FQFA 4F2OA 3SZPA 4G8NA 3B50A 1H76A 5IAIA 4MNIA 3IO4A 2WYPA 3WAFA 2V3UA 1RYOA 1ZLQA 1KZ8A 3G7WA 2PBWA 3ONMA 4JSDA 3M8UA 1YTVA 1M5FA 1DPEA 2QS4A 5I7IA 2CZLA 2FIXA 2P3NA 3VFJA 4N4UA 1B3FA 2F3DA 3W9WA 2Y7WA 4IY5A 2Y7KA 3QAXA 3CVGA 4O8MA 4LA9A 1FQBA 4LZ8A 3EKIA 4KFQA 1MXZA 4JWYA 4PCDA 5L9MA 3N94A 3OO6A 4GWOA 4EF1A 1OQGA 1LBCA 4U4XA 3IB1A 2JJKA 3HHGA 3PV0E 4LVQA 4JVCA 2B3BA 2F7BA 2XHDA 2OJTA 1XI6A 4MX6A 1LAHE 1MS7A 4H67A 4R73A 3EHSA 4N6PA 5IZ1A 3ECRA 4O3BA 3KBRA 3MP6A 1JW1A 1VR5A 2HAVA 1EYIA 1R9QA 3QYTA 3RUMA 1J1NA 2XX9A 3PMWA 3BIHA 3MZ9A 4PFWA 4Q30B 4JDFA 3V83A 4QBAA 2H99A 4DXBA 1NV0A 4DIGA 3O28A 1IMFA 4NX1A 4XFEA 2ALUA 1NV1A 2XWIA 1LEVA 3T9UA 3K4UA 1MY1A 1FPIA 4FECA 5J16A 1O64A 3L6GA 3LBSA 5EQ7A 4KYEA 4GD5A 5DVIA 3T9XB 1DOTA 4LZ5A 1R6ZA 5BUUA 2RC9A 2XXWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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