1EZKA

Crystal structure of recombinant tryparedoxin i
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
149
structure length
149
Chain Sequence
SGLDKYLPGIEKLRRGDGEVEVKSLAGKLVFFYFSASWCPPCRGFTPQLIEFYDKFHESKNFEVVFCTWDEEEDGFAGYFAKMPWLAVPFAQSEAVQKLSKHFNVESIPTLIGVDADSGDVVTTRARATLVKDPEGEQFPWKDAPLEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of tryparedoxins revealing interaction with trypanothione.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Crithidia fasciculata
molecule keywords TRYPAREDOXIN I
total genus 45
structure length 149
sequence length 149
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1ezkA00
4J56E 2MMOA 2VL9A 2GSRA 2OBIA 2RM5A 1BG5A 4ZL7A 3WGDA 4CHSA 1YQ1A 1A8LA 2H0IA 5CO3A 5B6MA 3VK9A 3GL5A 3FR9A 1O85A 2JADA 3LJRA 3WD6A 1TRVA 1GNWA 18GSA 2DJKA 4KA0A 1X9WB 3F6DA 1OC8A 1PGTA 1CQHA 1GNEA 4MJAA 1GL8A 2FGXA 3M8NA 1MTCA 1YEXA 2WZ9A 4OD7A 2K6VA 2DMMA 1Q98A 1YZXA 5JWOB 1F3AA 4TXVA 1Z6NA 2H75A 2FWGA 1ZMAA 2VCZA 4IS0A 3Q19A 4ZB9A 1BX9A 2H70A 3LWAA 3GIXA 4KX4A 5FHIA 2B7KA 4MF5A 5AN1A 1J9BA 3KH7A 2EIRA 5IO2A 3APSA 1GP1A 4K7NA 2VL2C 3DEXA 4V2LA 4EUYA 1GSFA 1TU7A 5KN0A 1ABAA 2M72A 1GRXA 3FKFA 1T4ZA 2L4QA 3LXTA 4IP6A 4GXZA 2AAWA 1X9MB 5FWGA 2DJ1A 4DEJA 5COHA 1MDIA 1SJ6A 3FHKA 4TN8A 3A5WA 5H5QA 3I69A 3UMAA 3CTGA 4BPYA 1J08A 3ZFBA 1A2JA 6GSWA 1HNCA 3DVWA 1EV9A 4DSSA 2ON7A 4MH3A 1EGRA 4JE1A 4ZBBA 3RHBA 2EC4A 1R5PA 1KBNA 3DVXA 4GLTA 3VWUA 2N5FA 2LS5A 3TJBA 1Z7PA 2DMLA 3GSSA 5J9CA 3QPMA 5DCGA 2MMNA 3CRUA 4PQHA 3DYRA 5HFIA 3UJ1A 4TR0A 1WRYA 2H71A 1ILOA 4ECIA 4TR3A 3R2QA 2RLIA 4NPBA 1TRWA 4WBJA 1F2EA 4JR6A 4L0WA 2WGRA 3GSTA 3RAZA 2E2GA 5C04A 4FYBA 1V58A 4TR1B 4KAEA 1X9SB 2NTOA 4I5QA 5F07A 1EEMA 1OVNA 5J9BA 1U3AA 1FVKA 1XW9A 3H93A 3LYKA 2R4VA 3G7JA 3APQA 3M1GA 1J0FA 16GSA 2PBJA 3F0IA 4OO5A 2L6DA 2HI7A 2LTKA 3KEBA 4IP1A 2B7JA 1TK8B 2P5RA 3TOTA 3GFKA 2HSHA 3NOFA 4V2NA 2YWMA 3HD5A 4GQFA 1UN2A 1K0CA 4NHWA 2AB6A 1H4OA 1T8EB 2CVDA 5ECNB 4MDCA 2DJ2A 3TJFA 5GSSA 2B3SA 4FO5A 1R26A 1DUGA 3J7Yb 1TU8A 2PUKC 3SBCA 2IMEA 4EVMA 2F9SA 4IHUA 3FRCA 2FY6A 2JSYA 3IE3A 1OC9A 1PKZA 4D73A 2ZNMA 4GQCA 4MF6A 3IC4A 3LQ7A 1WWJA 2C0DA 1T1VA 1YDKA 4JEDA 5DJLA 5D9TA 2YZHA 4WBRD 2VCXA 5ABRA 1I5GA 2IPAA 3F4TA 4N11A 4FH8A 3GX8A 3F8UA 1A0RP 2VM2A 4JU5A 4ZXGA 5IMZA 2GSTA 3DXBA 1JZOA 2JU5A 4ULXA 1M2DA 3KCMA 3QOUA 3EYTA 4XCSA 1R5AA 3F9UA 1TI1A 4F0BA 2I81A 1AUCA 2HT9A 1B9YC 4CW9A 2VCWA 2WCIA 3SWLA 1JZDA 4ECCA 3VI5A 3US3A 4AF2A 3PH9A 2V2GA 5HR2A 1K0MA 1ZCPA 3OR5A 3VWVA 1ZOFA 22GSA 5D9XA 2XPDA 4E8EA 2CAIA 3P90A 1X0RA 2VLVA 2H1AA 1FAAA 1PMTA 1GWCA 3QR6A 3IOSA 2X64A 5ECIB 2GVPA 3CYNA 3GH9A 2GQKA 3L78A 1GSEA 3D6IA 1EGOA 5ECKB 2P31A 2DJJA 3GV1A 1UA5A 2E0QA 1PL2A 4OO4A 3TDGA 5GZZB 2FUG2 2TRXA 4Q5QA 2YWNA 2REMA 11GSA 4N0VA 3N5OA 4YAVA 4CDOA 3A2VA 5ECLB 1AQWA 4NV2A 2VAFA 3ERGA 2PVQA 1URMA 3QDNA 4MZBA 2OE3A 2I3YA 5EL8A 5D93A 5A4VA 2IJYA 5GAPD 3IAM2 4BWQA 3IDVA 2LRTA 3C73A 3I9V2 3KGKA 2WJUA 1TOFA 2IFQA 4BL7A 2L6CA 1JHBA 4HZ4A 4OCEA 2HZEA 3WT1A 4K7IA 12GSA 4EXJA 5DQSA 2KP1A 2I4AA 4MZCA 4RQXA 1QK8A 5CRWA 3VFIA 3FY7A 4YQVA 1XVWA 2IWTA 1FG4A 1AQXA 4AJ7A 1G7EA 1SD8A 4TRXA 3FR3A 3QAWA 4NHZA 1VF3A 2LKUA 3FZAA 5JWRB 1K0BA 5F06A 1TI3A 3KJYA 4TR1A 5DALA 2H8LA 3DGQA 2HFDA 3ERWA 1XZOA 3O6TA 1RQMA 2XC2A 4LMVA 4GSTA 3KZQA 5B7CA 1MDJA 3C7MA 1YY7A 2DJ0A 2ON5A 1ZGNA 1MDKA 5HFGA 2H0GA 3GTUA 2LRCA 1U87A 5ECQB 3L4NA 1T4YA 2H6ZA 1T3BA 2HNLA 2VIMA 3GMFA 3GUSA 3CSJA 4JBBA 3VI7A 1VRSD 1TDIA 3FYGA 3HJPA 2YNXA 6GSTA 1K3YA 4JR4A 2QC7A 2X8HA 1XCCA 1XIYA 3BD2A 4JZQA 3UL3A 2GSQA 2YWIA 4E8HA 2GLRA 3TCOA 3TB2A 5B8AA 5HR3A 2K8VA 5ECSA 2ZCTA 3HCZA 2CV4A 2X8GA 4K8MA 2PERA 2R2JA 6GSSA 4KCAA 2HXKA 1M9AA 4WKWA 2CA8A 3F3RA 4K9ZA 2VCVA 2CVBA 3DRNA 4QL7A 4RI6A 2H6YA 2NBSA 5AISA 4POBA 2CZ3A 3ZZXA 5LNKe 5JWQB 3UBKA 5B8BA 2AYTA 3VPTA 3IR4A 2JZSA 2OA7A 3ZLPA 1K3OA 1AC1A 2C3TA 3L9SA 4RQRA 5L71A 2QSIA 1V40A 4KGIA 2B1KA 3C1SA 3HHVA 3EURA 4J2FA 3ERFA 2RUFA 3CMIA 3ZIJA 5DVBA 3EU3A 4O5RA 4HS1A 4DSQA 4I2UA 2H1GA 1JFUA 2V6OA 4XIHA 3KM6A 3IHQA 3TOUA 4HDEA 1AQVA 5EY6A 5HR0A 4LA1A 2YPMA 2V32A 2LV3A 1TXXA 2NVLA 3EWLA 3C1RA 4K1FA 3HJMA 2VCQA 1K3LA 2VCTA 2R37A 3CSIA 1N8JA 3TKRA 1AIUA 2WDUA 2B5XA 3E0UA 5ID2B 4OFTA 2VD0A 3F4RA 4ECJA 1SK0A 4GSSA 2C8UA 2C1YA 3HZ8A 1PD21 5DJMA 1OKDA 3HXSA 3MNGA 4LL1B 2H73A 5C00A 3U6VA 2FHEA 1TTZA 3U5RE 5EPFA 1XFLA 3GKXA 1SKSB 3IA1A 2GT5A 4PUFC 1OAZA 2PGTA 1PKWA 3LFLA 2GQLA 4EDYA 4FYUA 4GTUA 4H86A 3VWWA 4Q5RA 5ECRB 3ZTLA 2IMKA 1HNBA 1YKCA 3ZYWA 4BWSA 3F6FA 4ML1A 3TKQA 4MJEA 20GSA 2FWFA 2FNOA 3ME8A 1YEPA 3TGZA 5JCWA 5CREA 1M0UA 3LXZA 3RPPA 4XTSA 1ERVA 4ZB8A 2ZUPA 5A4UA 3HYPA 4HU7A 1VF2A 2FWHA 4OMVA 4MJBA 4HJ2A 5ELGA 4F9ZA 4ZBAA 4XS1A 3L0HA 4IBPA 3QFAC 3DD3A 4KSOA 5D9VA 1S3DA 1SD9A 3WT2A 4YH2A 1XWCA 1LJRA 1XOBA 3EMPA 1T00A 3KXOA 1M9BA 5ECPB 1M2BA 6GSYA 2CX4A 3KIJA 3QCPA 2CT6A 2ES7A 3DKSA 1GSDA 4Z7XA 3NIVA 4LMWA 4ML6A 3ME7A 1ML6A 2GQMA 2LSTA 5F05A 2DBCA 1G7OA 3E9JB 2VLTA 3Q18A 5B6NA 2I1UA 4N30A 4EC0A 5JCGA 2H72A 3RPNA 4MLYA 1SYRA 4I8BA 4IQAA 4O7HA 1RW1A 4GF0A 2QKEA 1ZYEA 2LJRA 1B48A 1B4PA 2LEGA 1THOA 5F0GA 4GWRA 4NAXA 1A24A 1WP0A 1CQGA 3PGTA 2MYGA 2H01A 5IOXA 3KD0A 1XWBA 3TKSA 3VWXA 5A4WA 1G0TA 1O8WA 2X99A 3ZRDA 19GSA 4Q5NA 1OE8A 3ZREA 2O87A 3H79A 3M3MA 2L5LA 3P7XA 4ILFA 1A23A 2N5BA 1TRUA 4AJ6A 1BJXA 1ACVA 4XS4B 2OBKA 2FCHA 3Q6OA 2JACA 4WF5A 3G9BA 1XVQA 1Z7RA 1BEDA 3GURA 1Y6EA 3TJGA 3I6AA 1YKAA 2CQ9A 2QGVA 3GHAA 3GL3A 3BCKA 3ZIVA 1SKWB 5DDLA 1HD2A 4XHMA 1K0NA 3C71A 1IYHA 4BA7A 1R7HA 4V1Ag 4XRAA 5CRDA 3UAPA 1GTAA 3EVIA 1K0AA 3CRTA 1AW9A 3ZL5A 2VO4A 4MPFA 1YF1A 1FW1A 2GDRA 3FR6A 5D9WA 3GA4A 1GSQA 5DBQA 2A2SA 4ID0A 4PNFA 4KDYA 8GSSA 3FW2A 5KEJA 5J3RA 4IELA 5E59A 2A4VA 2H66A 5ECOB 5F8BA 3D0ZA 1WMJA 3QMXA 3EMXA 1ERUA 2BMXA 4AGSA 4PXOA 3BOAA 3IAS2 4GCIA 3A2WA 2K18A 3MAKA 2KLXA 2O85A 2DJ3A 4RI7A 3RDWA 3F63A 4KCEA 2AJQB 2EIOA 2BJXA 3TRXA 5G30A 2HE3A 3FZ9A 4WETA 1V9WA 1TKDB 13GSA 3UEMA 1C72A 1Z9HA 1I9DA 4TVEA 10GSA 5J4UA 4JRRA 2GT6A 2GSSA 3QAVA 2JSZA 2WB9A 1EP8A 1HQOA 2P0GA 4MABA 2RUEA 2X8CA 3A3TA 3KMOA 1DE2A 4KDXA 2KUCA 4I6XA 1GTUA 4LLRA 3M9KA 1QMVA 4TR4A 5AIXA 2IN3A 1ZYQB 1AAZA 4HQZA 1X5DA 4GRFA 1B8XA 3M9JA 3FK8A 2H76A 3BJ5A 3TKSE 2L5OA 2F51A 3D21A 3GKMA 4KSMA 3TKSC 3CXGA 2DSAA 3F3QA 2C3NA 3CTFA 1EOHA 2YWOA 4I2TA 2PVOC 3GYKA 3D4MA 4X1UA 3TUEA 1O7UA 1SL0B 1F9MA 2HRFA 4TOPA 3KP8A 2O7KA 4YAPA 5ECHB 3IRAA 4TW5A 3D22A 2OJLA 3A2XA 4K0GA 1NSWA 1WJKA 2YOIA 1F37A 2V1MA 3S9FA 3HVVA 3KP9A 1BAYA 2MZCA 2MMAA 3RHCA 1WPIA 4KB3A 1GSUA 3KTBA 3EINA 4XS6A 1EV4A 5H5RA 2F8AA 1EZKA 1E2YA 5IMVA 3ISOA 4NMUA 1FHEA 1YJ6A 2G2QA 1DSBA 5LD0A 5CRHA 4ACSA 1MD4A 1EEJA 2KP2A 1VF4A 5H5SA 4L8EA 4K0NA 4K2DA 2DIYA 2ALBA 4I97A 1XXUA 1O81A 2TRCP 5INYA 2OADA 1WIKA 1ERWA 1OYJA 1SENA 1W4VA 1SL2B 4DVCA 5A5KA 5LCZA 4G10A 3IPZA 1BYEA 1XOAA 2E7PA 4TKYA 5HQPA 4XS4A 1H75A 3NZNA 2XBIA 5D73A 4IQ1A 5D96A 2C3QA 3W6GA 2PPTA 1QXHA 3L9VA 3LSZA 1LBKA 4MJCA 2FD3A 4ZIJA 4NXIA 4QQ7A 3LEFA 4EF0A 4L5OA 2WS2A 3HVSA 3N9JA 2DIZA 1QGVA 5IIZA 2H1DA 5KN2A 2P5QA 2NDOA 2HLSA 4G2EA 1F6MC 2EIQA 3H4KA 1M2AA 1SYXA 4IGJA 2FWEA 1PX7A 4POMA 4O32A 2YV9A 3D4TA 5D8IA 2GGTA 1G6WA 1NHOA 5IO0A 2LQQA 4MA9A 1OC9B 2GZPA 4EKZA 1K0DA 1TW9A 4D73B 1EWXA 1TK5B 4WR4A 1PL1A 4NV5A 5CYYA 4WF4A 3G7IA 2O89A 4DSRA 3JCML 2M80A 2A2RA 1OE7A 1NHYA 4V1Ap 1RK4A 2H19A 1JLWA 3W8JA 4IW9A 4K6XA 2VUPA 2HZFA 2B5YA 3AY8A 1JZWA 1DE1A 2LUSA 4K7OA 3GRXA 2NPBA 3D5JA 2LNSA 1QQ2A 2V41A 3F4SA 3IBHA 2R5GA 3HA9A 5IPHA 1GUKA 4X0XA 3K8NA 1X5CA 3MWHA 3QFBC 2R3XA 2OACA 2XPEA 2VM1A 1GUHA 2R6KA 1DBYA 5IOWA 9GSSA 4J57E 1VGLA 1T7PB 2XHFA 3QD9A 2M46A 2GZZA 2IL3A 2VD1A 4FIWA 2KOKA 4PNGA 4EL1A 1Y25A 5EVOA 1QUWA 1Z6MA 2B5EA 1U3IA 1A8YA 2JZTA 3CSHA 1GLPA 4BVXA 4ISDA 3O76A 2C0EA 2MBSA 2L4CA 2YP6A 3TJKA 4NWYA 4KUNA 2N5AA 2B1LA 5AGYA 1U6TA 1O8XA 2J23A 1ZL9A 4F0CA 1NM3A 2H1BA 3HY2A 1SK1A 1Z3EA 2MMZA 2WULA 2AV4A 1XBSA 4N0ZA 2CZ2A 4HZ2A 5HFKA 3LORA 4POKA 1S3CA 1EOGA 1U88A 4QL9A 4F82A 1PQNA 4HQSA 1QFNA 1WOUA 2IFQB 5IQYA 1ON4A 3KH9A 5G5EA 2BTOT 1V98A 4TXOB 1Q4JA 2CAQA 5AIVA 4XRDA 3W8SA 4MZWA 2HZEB 1GTIA 2LRNA 1MEKA 1O73A 3Q74A 2F3MA 4HUAA 2LJAA 1M99A 1GUMA 2L57A 2HRNA 3LGCA 5CP1A 3ED3A 3H8QA 3GNJA 4KNDA 5DAKB 2FLSA 2OKAA 3FZ4A 3H1NA 1V2AA 2B6MA 5IPGA 3UVTA 3BCIA 1GH2A 1KEBA 1THXA 2OE0A 3V1WA 1HYUA 3KTLA 1G6YA 1XWKA 5DALB 4ZL8A 1O6JA 2YANA 3HKRA 1A2MA 5G2ZA 4ZILA 1VF1A 4Q5FA 4ZBDA 3QAGA 1E6BA 2PN8A 2HYXA 4WR5A 4IKHA 4KE3A 4AJ8A 3GN3A 4BVYA 6GSXA 2AHEA 4OFMA 3GTUB 2H74A 1N2AA 1SL1B 4ZB6A 7GSSA 1BQ7A 4FYCA 3DIEA 3VURA 1W89A 2VLUA 2DLXA 3ZVJA 2YJ7A 1OKTA 2YZUA 1EP7A 3HVXA 3FEUA 5J41A 1ERTA 2KHPA 3PR8A 1KTEA 3M0FA 5IM9A 4GSNA 3BBYA 3PINA 5IMFA 3ZFLA 2WRTA 4IVFA 3C8EA 4O92A 3KMNA 1R4WA 4EDZA 2C80A 3TRPA 3UARA 2JL4A 2K9FA 5JCUA 2D2ZA 1S3AA 4PGTA 1TRSA 4EO3A 5J5NA 1TK0B 3CBUA 4LL4B 2H0HA 3APOA 3UIWA 4YQMA 3E3EA 4G9HA 5CRGA 2XBQA 4RUVA 3HDCA 1JZRA 2I9HA 3MSZA 3GX0A 3RBTA 3HZ4A 4MH2A 2WFCA 4KH7A 5ID2A 1YF0A 1A0FA 3TJJA 3TKPA 4IJIA 4L0UA 2O8VB 1ST9A 3DMLA 2YN1A 1A2LA 2GZYA 1FB6A 1AXDA 1SU9A 3HJOA 1SJIA 2FA4A 4X43A 1FO5A 2IIYA 4MK3A 3ZMLA 1JLVA 3L9UA 1TP9A 3IK9A 3IV4A 14GSA 3EC3A 2E2MA 2LJKA 3LYPA 3EU4A 2FA8A 1IYIA 4IJ3A 4MMMA 17GSA 4PX1A 3WGXA 1SKRB 4KDUA 5HR1A 1GTBA 2OE1A 2RM6A 1B4QA 3IK7A 4PURA 3GKKA 4HI7A 4WEYA 5CNWA 1UVZA 5FT3A 1GULA 3DWVA 2PMTA 2Z9SA 3ZITA 3UOMA 2C0FA 4L5LA 2HSYA 1UC7A 4OWYA 3J7Yk 1PX6A 1Z5YE 1XW6A 2IMFA 1GSYA 4F03A 2YJHA 3ZVJD 1V57A 2G0FA 1F3BA 2H30A 1XPVA 5ELAA 4OCFA 2YCDA 2GTUA 3P8WA 2VL3A 6GSUA 1GLQA 1SJZA 1XW5A 6GSVA 3ZMKA 1XWGA 3IXRA 4TXOA 2IMDA 4MPGA 3GKNA 2JZRA 2J9HA 2L59A 5IMDA 2CVKA 4F2IA 2K8SA 3GH6A 3WYWA 1PSQA 4DSSB 4PUAA 4G19A 4HOJA 4ZL9A 1FOVA 4HJMA 5DAKA 4KW6A 5GSTA 5DCHA 2F8FA 4IN0A 3MDKA 4YQUA 4WXTA 2H6XA 4OFNA 5IMAA 1NW2A 2VL2A 1K0OA 1PRXA 5G31A 1WE0A 2DC5A 1HNAA 4ECBA 2AUVA 4HEA2 5IMCA 4V2MA 3O3TA 4MF7A 3EE2A 5G1LA 4POLA 1KNGA 2YV7A 3P2AA 2C4JA 4HU9A 5GAND 2VOCA 3VLNA 2PU9C 5KN3A 4MCUA 5DQYA 4MP4A 3TRQA 3G7YA 4P3YB 1USBA 1FB0A 3LG6A 2V6KA 2CX3A 3UBLA 2IMIA 2TIRA 1LU4A 1SK2A 3WGEA 4PQ1A 1OC3A 1ZZYA 5G5FA 5E4WA 5ENUA 2RIIA 2PWJA 1PN9A 2C0GA 3VPQA 1FVJA 4N10A 2GS3A 5KN1A 3UVHA 5CAXA 1TJDA 1XWAA 2LNTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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