1EZKA

Crystal structure of recombinant tryparedoxin i
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
149
structure length
149
Chain Sequence
SGLDKYLPGIEKLRRGDGEVEVKSLAGKLVFFYFSASWCPPCRGFTPQLIEFYDKFHESKNFEVVFCTWDEEEDGFAGYFAKMPWLAVPFAQSEAVQKLSKHFNVESIPTLIGVDADSGDVVTTRARATLVKDPEGEQFPWKDAPLEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Crithidia fasciculata
publication title Structures of tryparedoxins revealing interaction with trypanothione.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPAREDOXIN I
total genus 45
structure length 149
sequence length 149
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1ezkA00
3GN3A 4PX1A 4F9ZA 4JRRA 4MF5A 2KOKA 2HRFA 4Q5NA 3GURA 1PA3A 3KXOA 1W89A 1GLQA 2FWHA 2K9FA 3Q19A 3GNJA 5ECNB 1XCCA 1YY7A 2DJ3A 1FB6A 3PH9A 2IN3A 2DIYA 2CVDA 3WGDA 2YWMA 4TR4A 2GZZA 5ELAA 2O8VB 3Q18A 1Z6MA 12GSA 2QC7A 2XPDA 1FG4A 2AYTA 3DYRA 3CSHA 1T8EB 3GKMA 5CRWA 1QQ2A 1YF1A 1XBSA 2CAQA 3KMNA 4AJ7A 3Q74A 4IVFA 4YQMA 4MK3A 3GX8A 1JZOA 3MSZA 4N30A 1ZOFA 2H75A 5HR3A 2YN1A 1ERWA 2VAFA 2DLXA 4E8HA 2LV3A 4ZILA 3ZLPA 2IMFA 4XS1A 5EVOA 4RQXA 1X9SB 5CRGA 2TRXA 4OWYA 2GTUA 3RAZA 2VUPA 3US3A 5G1LA 2WJUA 1AAZA 3KTLA 1A0FA 4DVCA 3HZ8A 2LRTA 1G6WA 3GTUB 1G6YA 2HLSA 2E0QA 4K7NA 5D93A 2IJYA 1Z3EA 1GSEA 3CMIA 2ZUPA 1PQNA 2CT6A 4O7HA 5C00A 1SK0A 4TR1B 2VOCA 1XWKA 3EURA 5AIVA 3UARA 2FCHA 3QAWA 4JU5A 1LU4A 3KCMA 5ECIB 3EU4A 4F0CA 2JZSA 2MMNA 4GQCA 4ISDA 5AIXA 1T4ZA 1BEDA 4FYUA 3D22A 2DJJA 2JACA 2VL3A 2HE3A 2GGTA 5F8BA 2C0EA 1JZRA 4K2DA 1QFNA 2B5YA 1TRVA 3RBTA 2WCIA 3HY2A 5DALA 1MDJA 2MMOA 4ACSA 20GSA 1GSYA 22GSA 3E0UA 1R5PA 4L8EA 5JCUA 3DEXA 3EMPA 3FZ9A 4LL1B 2G2QA 2RUFA 5ELGA 2FY6A 3EE2A 1GSQA 1SJIA 2ZCTA 1B48A 1J0FA 2WFCA 3IA1A 4WBRD 1ACVA 1S3CA 5JWOB 3IAS2 2EC4A 1EV4A 4DSSA 4RI7A 2FWFA 4IQAA 1EWXA 2ES7A 2IFQA 1K0CA 2CQ9A 14GSA 5IPHA 5IOXA 3DVXA 3L0HA 4LLRA 3FHKA 1G0TA 1TK0B 3ERFA 4MABA 4TXOA 5HR1A 3UOMA 1BAYA 2CV4A 1FVJA 1YEPA 4J57E 3VPTA 2VIMA 5EY6A 4WXTA 3IV4A 3CXGA 5GSSA 2PN8A 4GRFA 1AQVA 1NSWA 2GS3A 1V58A 4HS1A 3IHQA 1TDIA 2H0GA 5HFGA 3EC3A 4NPBA 4PQIA 3CTGA 4HJMA 3UVHA 3I6AA 2HFDA 5B8BA 1ST9A 2LJKA 2YJ7A 2RIIA 4L5LA 2L57A 5DAKA 1KNGA 3KH7A 2PPTA 3M8NA 2V32A 1DE2A 3VI5A 2VCTA 1YJ6A 1SK2A 2LJRA 4GXZA 5ID2B 5H5QA 5D9TA 3VWVA 1AQXA 1X5EA 2NTOA 3TJGA 3ZIJA 4MPFA 1V2AA 1XPVA 2AV4A 4I8BA 4K8MA 2CZ2A 4IP6A 4OCEA 4EF0A 4CHSA 4F82A 3O76A 1QXHA 4ECIA 2YZUA 3DKSA 1K3YA 3QCPA 6GSYA 6GSSA 3TJKA 3ZVJA 1U88A 5ABRA 2DMMA 3C1SA 3TJBA 3IR4A 1I5GA 2H0IA 3CTFA 5J4UA 4V2NA 3WYWA 1URMA 5IIZA 3I69A 3G9BA 1A2JA 4IS0A 4BWQA 2YWNA 3HA9A 3OR5A 1HNCA 2LQOA 2KLXA 3BCIA 2PBJA 3F3QA 2GQMA 4TKYA 1ZL9A 1F6MC 2H70A 4F0BA 2WDUA 1MDIA 5FT3A 1ERTA 4BA7A 3E9JB 1GWCA 2VD0A 5DBQA 3DGQA 4IW9A 3KD0A 2V2GA 3WGXA 1YF0A 4V2LA 3LSZA 1GTIA 4EDYA 4POKA 1Y25A 4G10A 1TU7A 2C3NA 4BWSA 4NAXA 4HU7A 4EVMA 2VCXA 1FW1A 2H71A 2VD1A 4MZCA 3F4RA 1AIUA 4PNGA 1THXA 1IYIA 5IMAA 3R2QA 3CBUA 5A4VA 4ZBDA 4X1UA 2G0FA 4ZBBA 9GSSA 3ZIVA 1OVNA 2OE0A 2V6KA 3I9V2 4WR4A 3APQA 5CYYA 4XS6A 1LJRA 4MP4A 2KP1A 3F4TA 2NDOA 2BJXA 2LNSA 1X9WB 3LYKA 4NXIA 1M0UA 1SJZA 4ECBA 4KSMA 1GH2A 3EYTA 2EIRA 3M0FA 1ML6A 3NOFA 1WOUA 5ECKB 1HQOA 2WS2A 5CREA 7GSSA 4EC0A 3KIJA 2F51A 3ZTLA 3HJOA 2GSQA 3IDVA 4NV2A 3DRNA 3IK9A 2GVPA 4ID0A 5GAND 1YZXA 2N5BA 2JL4A 3PR8A 4TRXA 4AJ6A 4HEA2 1SYXA 5IMDA 1F9MA 1H4OA 4QQ7A 2QKEA 4WF5A 1T7PB 2K8SA 2O87A 3EU3A 2ZNMA 1USBA 3VURA 1SKRB 5D96A 5ECSA 2N5FA 3KP8A 3TOUA 4MZWA 3P7XA 2TRCP 2Z9SA 5HR2A 2H1DA 3HHVA 5KN3A 2C3TA 5IO2A 1RW1A 1VF2A 1OKTA 3M3MA 1H75A 1ILOA 1Z6NA 2LRCA 4NHZA 1T4YA 5AN1A 4ECCA 4KH7A 2YV7A 2LKUA 1NW2A 2HT9A 4FIWA 4GSNA 4MCUA 1AXDA 5IQYA 4NWYA 1F2EA 2VO4A 1OC9B 4XHMA 3DVWA 1CQHA 3VFIA 5CAXA 1IYHA 4G19A 1R7HA 1PKZA 4RQRA 1Z5YE 1OC3A 5ECOB 5G1KA 3DWVA 2OE1A 5CP1A 3GIXA 3FR6A 4HJ2A 3KJYA 1JLVA 4EO3A 2OBIA 2L5LA 5ECQB 4MJAA 3TOTA 3FR9A 3TB2A 2VCVA 3VWUA 5KN0A 1Z7PA 2P5QA 2LJAA 2FUG2 1WJKA 1WWJA 1Z7RA 4IJ3A 2XPEA 4D73B 3L4NA 2FNOA 3GKKA 1FOVA 3D5JA 2JU5A 4KAEA 1SKWB 1GUKA 2IMKA 5J9BA 5DJMA 1VF1A 4EE0A 1FB0A 1K0AA 1XZOA 2CZ3A 4HDEA 2H0HA 3EMXA 4WR5A 1XW9A 3HZ4A 5LCZA 2PUKC 1TK5B 4G2EA 2B6MA 1UVZA 2L5OA 3N5OA 1JHBA 2C0FA 3TJFA 5JWQB 2FA4A 1GULA 4GQFA 1EGOA 3WT1A 3GKXA 3M9KA 1R4WA 2GQKA 1ZYEA 4ZBAA 4L0UA 2I3YA 2E2GA 3PGTA 4ZL7A 4WKWA 1PL2A 4I2UA 3P2AA 4TN8A 3VI7A 2P31A 3F8UA 4K0GA 2VLUA 4TVEA 2H6ZA 2XHFA 2VCZA 2YV9A 2K8VA 3L9VA 1I9DA 1KTEA 4Q5RA 4H86A 2DSAA 1ZCPA 3GMFA 2NBSA 2V6OA 4I5QA 3CRTA 1AC1A 3C1RA 2AJQB 2X99A 1BJXA 3KZQA 1QMVA 1U3IA 2GZYA 1TRWA 2FGXA 1U3AA 1JFUA 1VF4A 4WETA 3VPQA 3CSIA 2DJKA 1FVKA 1A23A 3M9JA 2FWGA 2H01A 3ZITA 3ZFBA 2K6VA 4IP1A 4ECJA 2AB6A 1HD2A 4N0VA 3KTBA 3SWLA 4K7OA 1X5CA 1XWCA 3L78A 3IBHA 3GHAA 3RHCA 3Q6OA 2GT5A 3BJ5A 5INYA 3ZREA 1O8XA 5G5EA 1E2YA 3E3EA 5DDLA 1WP0A 3KP9A 4RI6A 3C71A 4I6XA 4YQUA 2GLRA 1M99A 2QGVA 1U87A 4K7IA 1QK8A 4XRAA 2LSTA 3O6TA 1UN2A 1B8XA 2NPBA 2B5XA 2JADA 3LGCA 3HCZA 1B9YC 5IMZA 1MTCA 4OO4A 4EDZA 1V98A 1O6JA 2B5EA 1OC8A 6GSWA 5HFIA 11GSA 3LORA 2X8HA 1A0RP 1PKWA 2H76A 4XTSA 3FEUA 1MDKA 4KW6A 1B9XC 3HJMA 2VLTA 4IQ1A 1EZKA 1EP7A 2N5AA 1Q98A 2VLVA 3K8NA 2R5GA 3J7Yk 1CQGA 1AQWA 2BTOT 3MNGA 3VLNA 1Y6EA 2OACA 4XRDA 3F4SA 3UEMA 2FA8A 3TRXA 1S3DA 4K0NA 4CDOA 2B3SA 4IHUA 5J41A 2I1UA 2VL9A 4FYBA 18GSA 1GTBA 16GSA 4HQZA 4MLYA 4PURA 1DE1A 2OA7A 5L71A 2KUCA 3HVVA 3A2XA 4G9HA 3QR6A 3G7YA 1GRXA 2R2JA 3D4TA 5A5KA 3J7Yb 2E2MA 3UL3A 1G7EA 2V41A 3U5RE 1EEMA 4Q5QA 1SENA 4L0WA 2LRNA 2I9HA 2DJ1A 5JWRB 5F0GA 3FZ5A 3V1WA 4HOJA 4JR6A 1XFLA 2YANA 4KE3A 3TGZA 1G7OA 2MZCA 4TXVA 4HZ4A 4ZL8A 3HKRA 3TJJA 3LYPA 1GL8A 4LL4B 5EL8A 2JZRA 1BYEA 8GSSA 2HZEA 5KN2A 4HZ2A 2O89A 4OMVA 1T1VA 5FWGA 3FRCA 4O32A 5HR0A 3D4MA 3KMOA 3WD6A 2X64A 4EKZA 3EVIA 2D2ZA 3GSSA 4L5OA 2J9HA 2K18A 4XS4A 1NM3A 4N10A 2AUVA 2C4JA 3FR3A 1AUCA 1K0MA 5H5SA 1O7UA 1KBNA 1NHYA 3KM6A 3GL3A 3TKQA 3BD2A 4O5RA 1MEKA 4POLA 2IMEA 4AGSA 3JCML 3WGEA 1TOFA 1GNWA 1SD9A 1ZGNA 3FK8A 3HD5A 4K1FA 4YH2A 4ULXA 3L9SA 4TR3A 5IO0A 1U6TA 5DJLA 2YP6A 1X0RA 3TKSA 2E7PA 1E6BA 2CAIA 4DSRA 2NVLA 5KEJA 2C0DA 4MF6A 3ZYWA 3UBLA 4ZIJA 5D8IA 3ERGA 3GKNA 5E4WA 1C72A 5DALB 5IPGA 3APSA 3HVXA 4F03A 4TR0A 3GA4A 5IM9A 2TIRA 1F37A 1JLWA 2QSIA 2ON5A 2C80A 2OJLA 4GF0A 3LFLA 4LMWA 3QFBC 4MH2A 2B1KA 2A2SA 2B7KA 5F07A 4DSSB 1OE8A 4WF4A 2A2RA 5B7CA 2IFQB 1PSQA 4ZXGA 5CO3A 4IGJA 1WE0A 1N2AA 1ABAA 2GSRA 2HSHA 5D9VA 3FW2A 3GTUA 4XIHA 2F8AA 5B8AA 2WGRA 2WB9A 2L4QA 4N0ZA 1EGRA 4OFMA 4TXOB 1VRSD 5EPFA 2LNTA 4POMA 4TR1A 1S3AA 4Z7XA 4EXJA 1VF3A 2REMA 4MH3A 4WBJA 2IWTA 2LS5A 5D9WA 1O81A 1XOAA 5HQPA 4RUVA 3IAM2 2HZFA 2GT6A 3IC4A 2VM1A 3ED3A 5ECLB 2FHEA 3ME7A 4IELA 4J2FA 3TUEA 2WZ9A 1XWAA 1TKDB 1K0OA 3TRQA 2GDRA 10GSA 5DAKB 3I43A 4KA0A 2LEGA 4LMVA 5B6NA 4HU9A 2JSZA 3H8QA 3O3TA 5G31A 4NV5A 3QPMA 1PMTA 2EIQA 6GSUA 3LXTA 1Q4JA 1YEXA 3ME8A 3RPPA 1WIKA 2PERA 2IMIA 2X8GA 3N9JA 5GSTA 1TRUA 3FKFA 3ZVJD 3MAKA 2C1YA 1M9BA 1EOHA 3FY7A 2I81A 4AJ8A 3ZMKA 2CX3A 3A2VA 1EOGA 4PUAA 1ERUA 3W6GA 4ZB6A 2PVQA 2FWEA 3VWWA 5F05A 1GUHA 3GSTA 4YAVA 1GSDA 1ZZYA 4TOPA 2H74A 3QAGA 1TU8A 3ERWA 1XW6A 5IMVA 17GSA 19GSA 2FLSA 1GTAA 1K0NA 2KP2A 2YWOA 4HQSA 4NHWA 4J56E 4BVYA 3F6DA 3DXBA 3VK9A 1EP8A 1TI3A 1TK8B 2GZPA 1BX9A 2VL2C 1V40A 3A5WA 4JBBA 3VWXA 2F3MA 4BVXA 2R37A 3C73A 2RLIA 1XW5A 3FZ4A 6GSVA 5DQSA 5IOWA 2YWIA 1RK4A 1TXXA 1TTZA 5ID2A 3H1NA 2AAWA 1OYJA 4MPGA 3HYPA 1YKCA 3KEBA 3MWHA 3F63A 1AW9A 1HNBA 4KUNA 3QFAC 3GH9A 4XCSA 5ECMB 5GZZB 2O7KA 3DIEA 1QUWA 3RHBA 2MBSA 3HVSA 4MMMA 1B4PA 1XVWA 2R4VA 3MDKA 1EEJA 1TI1A 4F2IA 4CW9A 1HNAA 1TW9A 2YJHA 1N8JA 1XWGA 3LEFA 5JCWA 1MD4A 3ISOA 3G7JA 1XXUA 2MYGA 2PU9C 5LD0A 1GSUA 5DQYA 3W8JA 2KHPA 3GL5A 5ECRB 4KNDA 1A24A 5J9CA 1M2BA 1T00A 4MZBA 2LQQA 2HRNA 2L59A 1SJ6A 2EIOA 2JSYA 3IK7A 1K0DA 3A3TA 3C8EA 5JCGA 1GNEA 4N11A 1F3AA 3QOUA 4GSSA 1O73A 2MMAA 1M7TA 4FH8A 4FO5A 3FYGA 2HXKA 2MMZA 5AGYA 1THOA 5ECHB 1SL0B 4IJIA 1SL1B 2RUEA 4DSQA 1JZWA 1TJDA 2HI7A 5DCHA 3HXSA 2YNXA 4MDCA 4KB3A 4X0XA 4MJBA 3GFKA 4I97A 3F9UA 1R5AA 2DMLA 3RDWA 2VL2A 2V1MA 2F9SA 1M9AA 5DVBA 2OE3A 2B7JA 4QL7A 3G7IA 1SK1A 5J3RA 4V1Ag 4X43A 1DUGA 1FAAA 4ZB9A 1SKSB 1XWBA 3IE3A 4MJEA 2M72A 4BPYA 3EINA 4MA9A 3EWLA 3BOAA 2L6DA 2J23A 5KN1A 1PX6A 1PRXA 1UC7A 4HI7A 4IBPA 4P3YB 4PQ1A 4PNFA 2H8LA 5CNWA 3SBCA 3TKSC 4FYCA 2I4AA 3UMAA 3F3RA 4OD7A 5E59A 1XOBA 3IXRA 1B4QA 6GSTA 2DC5A 2P0GA 3UJ1A 3TKSE 3F0IA 1SD8A 4JZQA 3RPNA 2C3QA 3U6VA 1YQ1A 2FD3A 1WRYA 4GCIA 5ENUA 1SL2B 4HUAA 4V1Ap 3ZMLA 3TKPA 2R3XA 4JEDA 2HYXA 1F3BA 2PGTA 2CVKA 5A4UA 1A2MA 3GRXA 2OKAA 4ILFA 3NZNA 2AHEA 3W8SA 3TCOA 2OADA 2YOIA 2MBTA 1KEBA 1BG5A 3UBKA 3GYKA 4YAPA 2CVBA 1ON4A 2HNLA 1OC9A 2CX4A 1XVQA 3CSJA 4WEYA 3TRPA 4ZL9A 5HFKA 5G2ZA 2HSYA 1XIYA 2F8FA 4JE1A 2VCQA 4MF7A 2WULA 2DJ2A 2OBKA 1J9BA 1OKDA 4YQVA 3H93A 5D73A 5B6MA 1A8LA 1K3LA 3AY8A 1UA5A 2GSSA 3APOA 4TW5A 1GSSA 1GTUA 2A4VA 2XC2A 3TDGA 2PVOC 2YPMA 1TP9A 5J5NA 4KDXA 3TKRA 5IMCA 1MD3A 4OFNA 2IL3A 3DMLA 4EUYA 3P90A 1X9MB 2H1AA 4D73A 4KDYA 2H30A 1M2DA 1O8WA 2IMDA 3C7MA 2R6KA 3LQ7A 5ECPB 2VM2A 2YZHA 3QAVA 4ML1A 5CRHA 1K0BA 1GUMA 2CA8A 3L9UA 1V57A 3CYNA 4Q5FA 1SU9A 1NHOA 4NMUA 2DIZA 2M46A 4E8EA 3KGKA 1HYUA 3M1GA 4K9ZA 2DBCA 3ZL5A 4POBA 1GSFA 1OAZA 5DCGA 1ZMAA 1PGTA 2L4CA 2P5RA 2H1BA 3H4KA 4KX4A 4MJCA 2XBIA 1O85A 5D9XA 2DJ0A 2H66A 4KCEA 2BMXA 3D21A 3QMXA 1YKAA 5LNKe 3F6FA 2GSTA 1M2AA 3LWAA 2RM6A 3D6IA 1TRSA 2LTKA 2X8CA 3UAPA 4OCFA 4KSOA 2H72A 5GAPD 6GSXA 2YCDA 4K6XA 1PX7A 2WRTA 4PXOA 2C0GA 3QD9A 3ZZXA 2O85A 1Z9HA 3P8WA 1QGVA 3FZAA 3DD3A 4LA1A 1PL1A 3HDCA 4PQHA 5FHIA 2VCWA 1BQ7A 3ZFLA 3GX0A 3GV1A 2IIYA 1OE7A 3ZRDA 2H6YA 3BCKA 3KH9A 1J08A 4BL7A 3UIWA 4DEJA 3D0ZA 13GSA 4GWRA 1PN9A 1GLPA 3A2WA 3QDNA 5AISA 1RQMA 1FHEA 4OO5A 2GQLA 4PGTA 1ERVA 2H73A 1R26A 5G5FA 3CRUA 4OFTA 4EL1A 2ALBA 1JZDA 3WT2A 3HJPA 1EV9A 4GSTA 3H79A 2H19A 2H1GA 2XBQA 2L6CA 5C04A 5H5RA 2IPAA 1W4VA 2ON7A 1A2LA 2PWJA 1LBKA 3PINA 4AF2A 3LG6A 2H6XA 3GUSA 1GP1A 1T3BA 4KGIA 2M80A 4GLTA 1FO5A 4KCAA 1K3OA 2B1LA 1A8YA 1WMJA 3BBYA 4ML6A 1DSBA 3IRAA 3S9FA 2C8UA 5IMFA 3LJRA 3GH6A 1YDKA 4KDUA 4QL9A 4I2TA 1PD21 5CRDA 3LXZA 5COHA 4JR4A 1DBYA 2HZEB 4ZB8A 5A4WA 4O92A 2RM5A 3IPZA 4IKHA 2LUSA 2PMTA 1X5DA 1ZYQB 3IOSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite