1EZOA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
b'KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 57
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA01
4DLDA 2I0BA 1N84A 3B7DA 4RPOA 3TTLA 4GOTA 2OK2A 1US5A 2R71A 1POTA 4NEDA 4R9FA 2QPQA 4QFPA 1LB9A 3PPNA 3K0VA 4NE4A 5L9OA 4AB6A 4FAJA 2FA7A 4IO7A 4R74A 4E0WA 4FIMA 4GLIA 1J1NA 5DT6A 3S9LC 1H3DA 5I58A 2DWHA 3PPOA 1FQEA 2LAOA 4M1VA 1NNPA 5AA4A 3HSTA 1OLAA 4ZEIA 1D4NA 5CMBA 3Q25A 5KDTB 3O28A 1P1QA 4ZECA 3MPLA 4Z0IA 4FORA 3IB2A 4QF9A 2F36A 1VSOA 4U4XA 1OLCA 3FJMA 3OSQA 1B52A 1LAXA 3N94A 2Y7PA 1Y9UA 1Y3QA 1N3WA 3RTWB 1B46A 2O6AA 1B3GA 4RJZA 1Y1ZA 3T93B 5DVIA 4OESA 5EHSA 2XX9A 1B3FA 4U1ZA 3MC2A 4I8CA 3T22A 4FEBA 1B9JA 1ATGA 1SI1A 3MZBA 2RC7A 3KSXA 3RY3A 1SQYA 5IAIA 3K1MA 4ZS9A 2THIA 3K1NA 3MP8A 3GBBA 2I4BA 4NF8A 4DIGA 3KSJA 2H9BA 3ZS6A 4ELQA 2PT2A 2DXYA 5CMMA 1LB8A 3O97A 4QSDA 2NVUB 1Y4CA 3M3LA 4YB5A 3IB1A 3VE1B 1Y3NA 1A40A 3T96B 2PX1A 4MFIA 2O51A 4ZEFA 2QS3A 1MXWA 1BIYA 3D4CA 2DQVA 3U1OA 1DOTA 3PUYE 3TMGA 2CZLA 3H6TA 1JW1A 1N7XA 3FASA 4F29A 4R6KA 1MY0A 5EHMA 1BP5A 2AL4A 2HFBA 1QULA 1B5IA 3H3GA 4BDNA 1N04A 3KFMA 4XKQA 1UIUA 1BLFA 3V83A 1IXCA 1R9LA 2PT1A 3G7WA 2ZYNA 3ODBA 2WKYA 3VDFA 5A5XB 3QUJA 3CI8A 1M5DA 4AQ4A 2ZNTA 3T66A 4EQ7A 1JNFA 3E4RA 3TTMA 3N5LA 3I6VA 4OVJA 2F6GA 3SEYA 1IXIA 2H98A 2ZYMA 1M5EA 4OHNA 2VOZA 4ZE9A 1UTBB 4LZ7A 1B7HA 3OMBA 3FJGA 2DE4A 2E1SA 1L5TA 2XXYA 4BLAA 5B7DA 1O63A 5I59A 2Z8FA 1DMBA 1D9YA 4WKMA 1AMFA 3EHTA 2OZZA 2AYSA 1JVYA 1MG1A 4KCDA 4FJPA 3O2AA 3K02A 1H76A 1M5CA 2W7YA 3TEPA 3N26A 3MPKA 4R6YA 5K2YA 3FD3A 2QMWA 3PMVA 3U8QA 1POY1 3T9VA 3CG1A 1ANFA 1MXXA 3LR1A 4IY6A 4OENA 1CE2A 2ZXTA 1GR2A 5KCJB 5I57A 2F5XA 1LCFA 3G3JA 3DM0A 4NMYA 5AA3A 1SYIA 4N6PA 4IY5A 3H03A 3KGCA 2XHDA 3PUZE 1H44A 1OQHA 3IR1A 2UYFA 3OENA 1GVCA 3A3CA 3T9XB 1OIBA 1Z7NE 2PYYA 1B05A 2XXTA 1A55A 3C36A 2KLFA 2B65A 3FV1A 1Z7ME 3OO9A 2G29A 1QKBA 5I59B 2QSXA 2F6PA 3MWBA 1PB9A 1OVBA 3E3KA 4OFJA 3CFZA 1IXGA 1JETA 4YB7A 4JWYA 4G4PA 5ICTA 3CIJA 3FUZA 4U23A 3A3UA 3FV2A 5LOMA 3VVDA 3RGYA 1JEVA 1R9QA 1TWYA 3U93A 1FTJA 4IO5A 1H43A 1XS5A 1P1OA 1OMPA 3OOAA 5JTYA 2UVJA 3O6GA 5I57B 1B4HA 1JW5A 3EPEA 3E13X 1D9VA 4KYEA 3O66A 1HSLA 3OO6A 4FECA 4F1VA 5AE4A 2H99A 3MVZA 1ZKBA 3HV1A 1FQBA 4ZEKA 3RUMA 1AIVA 3V5AA 3PPQA 2UVIA 1Q35A 5AA2B 1LAGE 3FVOA 3U94A 2A5TA 2ONSA 3FIRA 3HCQA 1EH3A 3RNNA 1DPPA 3CFXA 1URSA 3F11A 5L8DA 2DSFA 5CBRA 4QFLA 4BDQA 4GRKA 1Y4TA 4OEVA 1IXHA 2GH9A 2ONRA 5H8SA 2VHAA 4DCYA 4OMBA 2YJPA 5FTIA 3MVYA 1N7WA 2XD2A 2UVHA 1URGA 1PB8A 5KDTA 4THIA 1D3KA 2BJJX 3H6UA 1Q1KA 2V25A 4XXUA 3RQTA 4GXAA 1S7YA 1SW2A 5HPQA 4IO3A 5DYHA 1UTHA 1ZMGA 4JWXA 3TKDA 5ISUA 1IUDA 4DDDA 4R2FA 3I5OA 3TPAA 1FCKA 3WAEA 1US4A 2ZNUA 1LBCA 2R9JA 2DWIA 1PBQA 3SESA 2P2AA 1MRPA 4OEUA 4JXIA 2NXOA 3C31A 3IO6A 4GF8A 3LSWA 3K00A 4YKJA 4EF2A 4E0XA 1N0TA 1ZTYA 2A5TB 2QL3A 3KOSA 4NTLA 3DLNA 4PETA 3LSFB 5FHOA 5BUUA 3G3GA 3USDA 3O6IA 2Z23A 5I84A 2O1MA 3PMWA 1FQDA 4QFNA 5FHNA 1B7ZA 1EZ9A 2V3QA 4JDFA 3IK6B 5AA1A 4QSEA 2V93A 4K3FA 4GL0A 3GXAA 2PVUA 1JW4A 3VLUA 2YPNA 2RCAA 3PU5A 2NWJA 1A7LA 4GVOA 1MM6A 4H5FA 2HEUA 3KOTA 3OSRA 1UTHB 5CBSA 2ZMBA 4O3CA 1SI0A 1NKXA 4H0WA 2OWTA 4EUOA 1NNFA 1MDP1 3IOUA 2Y84A 4JWOA 3H7MA 4F22A 3H4ZA 3CSBA 2G93A 4HCYA 3SEXA 4FEDA 3OXNA 5A5XA 4NWCA 1FW0A 4RPNA 3KN3A 2QJEA 3Q28A 4U4SA 2RCBA 5F7VA 2XXQA 2O1LA 1VR5A 3MW0A 2DVCA 2VP1A 3R7XA 4LATA 2I0CA 5H8HA 1UTBA 2OJTA 4ZEDA 2XX7A 5K2XA 1A8EA 5CMCA 3CVGA 4YICA 1SW1A 4OZ9A 2M8CA 3MVWA 4HTGA 2P0SA 5DEXB 3FVNA 2Z8DA 1B1HA 2I49A 2IEEA 3FJ7A 1LCTA 3W9VA 2GHAA 1LFGA 2Y7KA 4PFTA 4G2ZA 3LSXA 1DPEA 2RKMA 3R6UA 1A54A 3FXQA 4Q5TA 2D21A 1MQIA 4PFYA 2ZYOA 4OFOA 3TODA 3QIMA 4RA1A 2D5WA 1LAHE 3T9UA 5EYFA 1RYXA 3CRBA 2NOOA 4ELOA 2DE2A 3O6HA 1PDAA 1A99A 2FNCA 4F2OA 1XVXA 3UGWA 2X7QA 4WEPA 3B6QA 2XD3A 4GQOA 3SDFA 1NNKA 2F35A 1M5FA 5KCJA 3FVGA 5ITPA 2DE3A 1M5BA 3C9HA 1ZLQA 2DS9A 3H6VA 1GGGA 3VLWA 3RT8A 3ONMA 3K2DA 3U92A 1NH7A 1TFAA 2ABHA 4H6DA 4KYSA 1EZPA 5CC2A 5H8HB 4DE8A 2V3TA 2F97A 3EHUA 5CRYA 3D4GA 4YAHX 2V84A 4KYDA 1XC1A 2IA4A 3V89B 4KD5A 1N76A 3FATA 4KR5A 3HHGA 3JZJA 3C34A 4U2RA 4L17A 3RPWA 2AIXA 4H67A 1XHYA 1A8FA 3RN8A 2PMSA 3S9NC 4G8NA 3LSLA 1FQAA 2Q9TA 5TPAB 4N07A 3K6WA 4HW8A 5ELVA 1UIVA 3OO8A 1QUKA 2Z22A 3LBSA 2D3IA 4OFLA 2H5YA 2UXAA 4ECFA 1B7UA 4ESWA 4RY1A 4ELRA 1MDQA 4IGRA 4BDOA 3ZKKA 1NL5A 4I9DA 1I6BA 4POXA 4NF5B 3UORA 2RC9A 4AB5A 3PD8A 4OQOA 4R6HA 4DZ1A 1GTKA 3P7IA 4IB2A 1YAEA 5JK4A 1IZ1A 2RF1A 4EQ9A 3L6GA 3IOTA 3ILTB 3PGFA 1B1XA 4P11A 4ZZEA 3BFTA 5L9SA 2XXVA 3MJNA 5AA2A 3FXRA 5DTBA 3M3FA 3JV9A 3MP1A 3KJTA 4F19A 2HZKA 2A5SA 4F2QA 3KEIA 1MQGA 1YTVA 2O84X 4X48A 5HBCA 2F7BA 2F7CA 3UK4A 1UQWA 1PBPA 1FTKA 2OWSA 4XKNA 4DXUA 1SBPA 4ESXA 4G68C 5KZTA 2F8DA 5I56B 4PP0A 1FTLA 5TP9A 3HHFA 5I2KB 1LAFE 4UA8A 3QXMA 3B6TA 1USYE 3UP9A 5H8QB 1QJMA 5I2NA 2R6GE 2DVZA 4PE5B 3FXUA 4KHZE 2QS2A 1PB7A 1NMUA 4EQBA 3TAJA 1NNTA 1WDNA 4U21A 3VXBA 2Q2CA 4MLVA 3O29A 4ONYA 1R1NA 2NUVA 1QKAA 1KWHA 1ELJA 1URDA 4XKRA 3TTKA 3PMXA 3EN3A 3BBRA 4BDMA 1Y20A 4LZ5A 1TXFA 1BKAA 1SW4A 1USYH 3G3HA 3TQWA 3DP6A 3IORA 1B2HA 4RK2A 1LFHA 1MQHA 4R72A 1TFDA 1SYHA 3ZKLA 1H45A 2H25A 4JB7A 4ZE8A 3S9MC 2O7IA 5J1DA 3K1PA 4OXVA 2DYXA 4X1BA 4LONB 4OYVA 4ZEBA 4BDLA 3IAZA 4TLMB 2UYEA 4EXKA 4G68A 3KN8A 4ZDMA 4RYAA 4F3GA 1TT1A 4TLLB 3C32A 2O7UA 1PEBA 3N6TA 4F3BA 4YKPA 2DWAA 3G3KA 1MM7A 5TP9B 1B6HA 3G3FA 4YKKA 2PBWA 3OD7A 2QMXA 1MH4A 2V3UA 3TCFA 3FGSA 4OETA 1MXZA 5I2NB 4JSDA 2QS1A 3CG3A 1SVXB 4POWA 1QUJA 1DTZA 3TFLA 4ND9A 4ISUA 1P1WA 3RTFB 3H6WA 1JVXA 2Q8JA 3CR9A 5DVJA 1IITA 4NWDA 4R75A 3MAMA 2ESNA 3PD9A 3JYRA 2HAVA 1SW5A 4YMAA 2RINA 4GIZA 3PUVE 1FTOA 4WXJA 4IO6A 1HSJA 1XT8A 3H06B 2XXUA 5FTHA 3ZSFA 4I62A 4XTCQ 4MF3A 4MBPA 3IO4A 3T9HB 3MQ9A 4G68B 2HXWA 2H4IA 3VXCA 4Q8RA 2GHBA 5B70A 3BKIB 3LUYA 1I69A 3N6UA 3OO7A 5H8FA 5DEXA 4JBZA 3VVEA 4PFWA 3M8UA 1FQFA 1LGBC 4EDPA 1QW0A 3MBPA 4KI0E 1MPBA 2I6EA 4BDRA 5AA2D 3G3IA 4R2BA 1MS7A 2UVGA 1SDXA 2OLBA 1VFEA 3DP8A 3TQLA 4F3SA 3W9WA 3UN6A 3U72A 1Y3PA 3Q29A 4KFQA 4X1DA 4F1UA 2XXPA 1VE4A 1P1NA 1MH3A 1QUIA 1LLSA 3IJXB 4YZZA 4GWOA 4OERA 3M3KA 3SEWA 4YB6A 4HS7A 2QS4A 3TUSA 4NF6A 3Q27A 3GLBA 2ZNSA 3K4UA 4ELPA 4U1OA 4UACA 2RC8A 1DTGA 1SD3A 5F1QA 2B3BA 3MUQA 3DELB 3SKPA 4I1DA 2I48A 1MXYA 1B51A 3QUFA 3L6HA 1MXVA 4RXLA 4QFOA 1AH5A 1MY3A 4C1UA 3OEMA 3K6VA 3MZ9A 5H8FB 3MP6A 3O9PA 3GBAA 2XX8A 3PPRA 1Y1MA 2Q89A 5I58B 1NH8A 3B6WA 3DP4A 2Z8EA 2Q2AA 3KBRA 4LVQA 5AA4B 3S4UA 2O69A 5ITOA 4O3AA 5TPAA 2ALUA 1II5A 3OEKA 3LC8A 2DOJA 1RKMA 3IX1A 1S50A 2HZLA 2DXRA 3K6UA 1ZJLA 2I4CA 4GD5A 4DXBA 1IQ7A 1XVYA 5M2VA 2Y7IA 1OVTA 4QSCA 3THIA 2B3FA 4NF5A 4YKIA 3FZVA 1I6AA 4NF6B 2OBGA 2CMOA 5DVFA 1MPCA 2VGQA 2XXWA 4KCCA 5H8NA 2I3WA 1YCJA 3PPPA 2HAUA 2I58A 1DSNA 2AL5A 4P0IA 4C1TA 3E9XA 1MY2A 4H8JA 3A09A 3IL1B 3KN7A 3RT6B 4NF8B 3TDJA 4F1YA 1CB6A 5CM6A 4LA9A 3S9EA 5BWJA 4F18A 1B0LA 3AXFA 3I3VA 4LQ2A 2XXIA 1B58A 4FE8A 1B4ZA 3BFUA 3C4MA 2F34A 1FQCA 4RK9A 4M4GA 4KPTA 1ZIUA 1B0HA 5I56A 5IKBA 2F7AA 3QSLA 3PV0E 5JEIA 3VVFA 1B3LA 4QFKA 2FYIA 3EF7A 5I2KA 3TCGA 3Q26A 5L9MA 1B40A 3ECRA 3HPIA 3TELA 3UIFA 1B3EA 3MVXA 1MQDA 3WAFA 5H8QA 4C0RA 2QRYA 4LUBA 2OCUA 1B32A 2Q88A 3TTRA 4GL8A 4LZ8A 3KJ7A 4LP2B 4Q30B 3KG2A 1GV8A 4H8IA 2VD3A 4IO2A 4P0GA 5H8NB 1AOVA 5CMKA 2YLNA 2Y7WA 3TZAA 4Z7EA 2VD2A 3C33A 1T0KA 4HCWA 4XIGQ 4QRZA 3EHSA 4MLQA 3VFJA 4H65A 2GFEA 4PQJA 1BTJA 5CI5A 1MY1A 2XXXA 1IEJA 3S2VA 3KZGA 4XKPA 3SERA 4R9GA 5HM4B 1EU8A 4GXSB 3R26A 1LFIA 1MXUA 3GZGA 1O64A 4PFUA 3V8XB 5FHMA 3IOVA 1B5JA 1R6ZA 4RNSA 1WVJA 3IB0A 4O3BA 2ANJA 2X7PA 3TTNA 3MZ1A 1EZOA 2HQ0A 2X26A 1MQJA 4TQUQ 3K6XA 1ZU0A 4F31B 4H5GA 1B5HA 1MY4A 1JQFA 4TOZA 3TCHA 4H1XA 1S9TA 3QK6A 4LQ5A 1QVSA 1VFDA 1ZBMA 2P1SA 3OELA 2O68A 4ZZAA 1B3HA 4G77A 3IOWA 4YMBA 4R73A 4NF4A 1LSTA 1IIWA 2E0SA 1P1UA 4G8MA 1LBBA 4WEDA 4KQPA 4EXLA 3PUWE 1PC3A 3SETA 4DXCA 4QHQA 4IGTA 4N13A 3RLFE 3HO7A 3TYHA 1MPDA 1FTMA 4X9TA 3QAXA 2I3VA 1XOCA 4U22A 5TU0A 2ONKE 1OQGA 4EF1A 3CSGA 2DP8A 4F39A 4G8HA 2DWJA 3K01A 3SEUA 4FATA 1I6QA 1NFTA 2REJA 3VV5A 1N3XA 2ZYKA 2REGA 3UA8A 1HSEA 3IJOB 4Q0CA 5ICQA 1O7TA 1YPNA 1JEUA 4OTEA 4MH5A 4OWDA 3W15C 4F3PA 3ILUB 3CFLA 3PUXE 2F78A 1F9BA 1RYOA 3SEVA 1WODA 3FVKA 4GFRA 1P99A 4DCXA 2HCAA 2Y7RA 4NF4B 5JTYB 3HN0A 3EQ1A 3C35A 3VLVA 1AL3A 4JSOA 4YU0A 2XXRA 2GRVA 4IO4A 2XXHA 3QYTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2WBBA 4FBPA 4DLDA 2I0BA 1N84A 3B7DA 4RPOA 3TTLA 4GOTA 2OK2A 1US5A 3MSTA 2R71A 1POTA 4NEDA 4R9FA 2QPQA 4QFPA 1LB9A 4XFEA 3PPNA 3K0VA 4NE4A 2F3DA 5L9OA 4AB6A 4FAJA 2FA7A 1FBEA 4IO7A 4R74A 4E0WA 4FIMA 4PAKA 2XWVA 4GLIA 4NN3A 1J1NA 5DT6A 4PTKA 3S9LC 1H3DA 4HE0A 5I58A 5IM2A 2DWHA 3PPOA 3RPLA 2JJKA 1FQEA 2LAOA 4M1VA 1NNPA 5AA4A 3HSTA 1OLAA 4ZEIA 4NX1A 1D4NA 1FRPA 5CMBA 3Q25A 5KDTB 3O28A 1P1QA 4ZECA 3MPLA 4Z0IA 3A29A 4FORA 3IB2A 5IZ1A 2QVRA 4QF9A 2F36A 1VSOA 4U4XA 4N8YA 1OLCA 3FJMA 3OSQA 1NUWA 1B52A 1LAXA 3N94A 2Y7PA 1NUYA 1Y9UA 1KA0A 1Y3QA 1N3WA 3RTWB 1B46A 2F3BA 3HFUA 2O6AA 1B3GA 1EYJA 4RJZA 1Y1ZA 3T93B 5DVIA 4OESA 5EHSA 2KQZA 2XX9A 1B3FA 4U1ZA 3MYUA 2WYKA 3MC2A 4I8CA 3T22A 4FEBA 1B9JA 1ATGA 1SI1A 3MZBA 2RC7A 3KSXA 4NQ8A 3RY3A 1SQYA 5IAIA 3K1MA 4ZS9A 2THIA 5EQ9A 3K1NA 3MP8A 3GBBA 4P56A 1SPIA 2I4BA 4NF8A 4DIGA 1IMEA 3KSJA 2H9BA 3ZS6A 4ELQA 2PT2A 2DXYA 5CMMA 3RYDA 1LB8A 3O97A 4QSDA 4I40A 2NVUB 1Y4CA 3M3LA 4YB5A 3IB1A 3VE1B 1Y3NA 1A40A 3T96B 1NUXA 2PX1A 4MFIA 2O51A 4ZEFA 2QS3A 1MXWA 1BIYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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