1EZOA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 57
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA01
5I58A 1SBPA 2F5XA 3V83A 1BKAA 1B9JA 4KPTA 4OETA 2QMXA 1JVYA 5I84A 2VD3A 1OQHA 4WXJA 1SW4A 1ZU0A 1XVYA 1R9QA 1MH3A 2LAOA 3PD9A 2NUVA 2ZNUA 3WAFA 4FECA 2ONSA 1B40A 4QFPA 1SVXB 4U4SA 3C32A 4POXA 3K1NA 4KQPA 4R2FA 3SEVA 3DELB 1Y4CA 3BBRA 4RPNA 4ZEBA 4ZECA 4HCYA 4NF8B 1CE2A 1RYXA 3PUZE 4KYEA 1N7WA 3AXFA 4DLDA 2FYIA 3R6UA 3RT8A 4U1ZA 2A5TA 1FTKA 4YKKA 2QSXA 5JTYA 1LAXA 1N76A 4RXLA 2H98A 1B5JA 4H1XA 1A7LA 2XXUA 3IB2A 2PT2A 4LQ5A 4ZEDA 2UYFA 4QFLA 3T9VA 2FNCA 3UORA 2RCAA 1FQDA 3MVXA 1IUDA 4IO3A 5CMKA 3TYHA 2G93A 4OHNA 4MH5A 1H44A 4ZZEA 3MW0A 3HO7A 5KCJA 3T96B 2D21A 3VVFA 3MBPA 4QSEA 4JWYA 4FEDA 4U21A 2XHDA 4PETA 4O3AA 2A5TB 3FJMA 1MY1A 3C33A 1JETA 5JTYB 1DSNA 1GVCA 3PPNA 2GHBA 2RF1A 5AE4A 4XKPA 3T9XB 2BJJX 1NNKA 2Q88A 3I3VA 1LGBC 3S9MC 3W15C 3IX1A 4N13A 4KYSA 3PV0E 2VHAA 1MQHA 4I8CA 1A40A 5M2VA 3FV1A 5I59B 1B1XA 5I57A 1ZLQA 5B7DA 3U8QA 1J1NA 3O2AA 2ZXTA 3D4GA 2Z23A 4F3PA 4R6YA 4GIZA 4H5FA 5KCJB 1B7HA 1WVJA 1MPBA 4DXUA 3K1PA 4F1VA 2V3UA 4ONYA 1Y9UA 2ZYOA 3FJGA 3EHUA 1YCJA 2UVJA 4YB6A 3IOTA 2OLBA 1NL5A 1I6AA 2F35A 1JEUA 1R9LA 3SEWA 3QUFA 3IO4A 3TFLA 1FQBA 3THIA 4ZDMA 1MY0A 1P1QA 2XXRA 3JZJA 1TWYA 4Q8RA 5CMCA 5J1DA 3SKPA 1A55A 2I3VA 3VVDA 3KSXA 2IEEA 1S50A 4DCXA 1FQFA 1S9TA 1QUIA 1UTBA 1PEBA 2O84X 1PB7A 3E3KA 4OXVA 4R2BA 5I57B 3N26A 4F29A 4YKPA 1UQWA 4KR5A 2F34A 1P1WA 1FQAA 2F7BA 1SI1A 3RY3A 3S9NC 4IGRA 1RYOA 1VE4A 5DYHA 3U93A 3TPAA 2ABHA 3LUYA 3RPWA 4IB2A 3O6HA 4MF3A 5L8DA 4N6PA 1H76A 1N7XA 1TT1A 3T22A 1B32A 4RA1A 1H43A 5DVJA 4TOZA 4OZ9A 4GOTA 1FTMA 4LZ5A 2F78A 4BLAA 5I2NA 4KCCA 4NEDA 3C31A 3U72A 1GGGA 1DOTA 4OVJA 3K6XA 3K02A 4MLVA 3TZAA 1URGA 3MVYA 4XXUA 2I58A 3O29A 4ISUA 3HV1A 2F6GA 1O63A 3MZ1A 1MY2A 4GFRA 1IXGA 3FIRA 3CRBA 1B6HA 4H8JA 5ICTA 5F1QA 2Q8JA 3CG1A 1R6ZA 4IGTA 2V84A 3M3FA 4FORA 1D9VA 2R71A 3K00A 1H3DA 1MG1A 1MPCA 3MWBA 4ELOA 2XX8A 2VOZA 3A3UA 3TELA 4NWDA 2XX9A 1DPPA 1LAHE 4R6KA 2W7YA 2UVIA 4OQOA 4Q5TA 5K2YA 1MXUA 5I2NB 3MP1A 4C1TA 4E0WA 1B3HA 4FATA 2H99A 3IO6A 4EF2A 2PT1A 3RN8A 5H8SA 3G3IA 4WEPA 5DEXA 1XC1A 2DQVA 1LBCA 1IZ1A 4LATA 3CG3A 4L17A 4IO7A 1VFEA 2IA4A 2AIXA 4Z0IA 3MC2A 1B4ZA 4Z7EA 1PC3A 5L9OA 4OEVA 4Q30B 4U1OA 1OMPA 4ECFA 3O28A 3PUYE 1AMFA 3Q29A 2QMWA 1FCKA 3S2VA 2YLNA 4LONB 4BDRA 2XXQA 2DYXA 1MM7A 1AL3A 4LP2B 1MXVA 1ZBMA 2R6GE 2ZYNA 3G3GA 3CSBA 2AL4A 2OWTA 2QRYA 3A09A 3OO9A 5FHMA 5DEXB 1SW5A 4H5GA 3V89B 3GBBA 3FVOA 1MH4A 4QFNA 1ATGA 4G8NA 1ANFA 4FE8A 1HSJA 1MY4A 1N04A 1GR2A 3CFLA 2Z22A 4ZEFA 1M5CA 2XXIA 3TTMA 2VD2A 2X7QA 3G3FA 1B2HA 4AB6A 2RCBA 1MDP1 4F22A 1IXHA 2A5SA 3EQ1A 2HAUA 2DE3A 4G2ZA 1OVBA 4QF9A 3TCFA 2YPNA 4K3FA 4UA8A 2DVCA 3S9LC 2Y7RA 3OSQA 4LA9A 3VLUA 4X48A 1SD3A 1OIBA 2OBGA 4OFLA 1XHYA 3IJOB 4POWA 3Q25A 5JEIA 3B6TA 1SW2A 4IO6A 2DE2A 3EPEA 1YAEA 3IB0A 3LSLA 2V93A 2QS3A 3EHTA 3H6WA 5CM6A 1VSOA 2G29A 1B46A 5A5XA 3OENA 3PMWA 4JBZA 4YU0A 3PD8A 4EDPA 4QFOA 3QSLA 3VE1B 2HAVA 1URSA 5EYFA 3TTLA 3OEMA 5I58B 4R73A 4JB7A 2RC7A 1DMBA 3MUQA 4AQ4A 5TP9A 1POY1 2XXYA 3VFJA 1YTVA 1JVXA 2Y7KA 3PPOA 4H6DA 1P1NA 3KN8A 2X7PA 4PFYA 1PDAA 1OQGA 2Y7WA 3TODA 3TKDA 2HEUA 2PX1A 4ZEIA 3ONMA 4GVOA 3H06B 5HBCA 4GF8A 5L9MA 1I6QA 4PQJA 3OD7A 3OO6A 4NF5A 4ELPA 2QPQA 3K1MA 5JK4A 5A5XB 4NE4A 3PUXE 1FQEA 3K2DA 1ELJA 4H67A 4OWDA 2H5YA 3RNNA 3TUSA 4PFUA 4ESWA 2F6PA 4G8MA 5TP9B 2XXPA 2NXOA 1A99A 2Y84A 3ZKKA 1B5IA 3MP8A 3MAMA 3IB1A 2DSFA 3TQLA 3ZKLA 3EN3A 2V3TA 4MFIA 4XKRA 1YPNA 1KWHA 3ZS6A 1B5HA 1XOCA 1EZPA 3SEYA 4R75A 4JSDA 5DTBA 4U2RA 1Y20A 3KG2A 2NOOA 3VV5A 1IIWA 4OTEA 4NF5B 3B7DA 1I69A 1IXCA 3SDFA 4EF1A 4X9TA 4I1DA 1NMUA 2D3IA 2OWSA 3RLFE 2GRVA 2RC9A 4GRKA 4OFOA 4F18A 3H6UA 4FEBA 4GL0A 3RGYA 1UIVA 2OCUA 3BKIB 4OMBA 3FUZA 1POTA 2CMOA 5B70A 3OSRA 1EZ9A 5TU0A 1Z7NE 4RK9A 4O3BA 3OMBA 5F7VA 3H6VA 1I6BA 3O97A 4LVQA 1B7UA 3MVZA 2QJEA 3SEXA 3TAJA 1H45A 3CSGA 1IQ7A 2DXRA 2B3FA 5IKBA 1AH5A 4DXCA 1LSTA 2Q2AA 4IY5A 3IR1A 3B6QA 2PBWA 4DZ1A 3IORA 3OEKA 5CRYA 2XXWA 2F8DA 1Y1MA 2KLFA 1OLCA 3MP6A 4PFTA 4N07A 3VXCA 3T9UA 3KBRA 2DWAA 3E9XA 5AA3A 3PGFA 2I0CA 1N84A 3A3CA 2AYSA 3HSTA 4G77A 2PVUA 2NWJA 3LSWA 1MY3A 1ZMGA 5FTHA 1JW1A 2X26A 4EXLA 2F36A 4U4XA 1N3WA 4FIMA 1MXYA 3MPLA 2XXXA 3IOUA 1UTBB 2GH9A 3C35A 5LOMA 1LFHA 4THIA 4WEDA 5CBRA 2OZZA 3N94A 2XXVA 3TTNA 1PBQA 3VVEA 1Y4TA 3HHGA 3H4ZA 3N5LA 1II5A 3FVGA 3F11A 3ILUB 1QKBA 3MZ9A 1QUKA 3G7WA 1NKXA 1B3LA 3O6GA 3K01A 3U94A 2DS9A 1AIVA 4R72A 3GXAA 3PPQA 4FAJA 2ZNSA 3TDJA 4F31B 4F3GA 1FTLA 2I49A 3SEUA 4BDNA 1B3GA 1USYH 4X1BA 3TCHA 2OJTA 5CI5A 3TQWA 1JNFA 3RQTA 5ITOA 1TXFA 2WKYA 1P1UA 2F7AA 3KOSA 3QXMA 1D3KA 4NF4A 2D5WA 4JDFA 4ZE8A 4OESA 4EXKA 2ZMBA 3BFUA 2VGQA 3QUJA 1JW4A 3DP8A 4RNSA 4I9DA 4F3SA 1NNPA 4KHZE 2GFEA 5AA1A 3HN0A 4KD5A 3SESA 4U22A 3RT6B 5K2XA 4RYAA 3FATA 1Y3PA 4GXSB 2HFBA 3IAZA 1QULA 3KSJA 4JXIA 3Q28A 3M8UA 2YJPA 2DWIA 5DT6A 5I2KA 4MBPA 2NVUB 3K6UA 3T66A 1US4A 1FTJA 1IEJA 1RKMA 4KFQA 1WDNA 1SW1A 2XX7A 2HZLA 1A54A 1GV8A 4KCDA 2DOJA 2Y7IA 1LB8A 3K6VA 4G4PA 4YKJA 2H25A 3FXRA 3O66A 4NF4B 2P0SA 3K0VA 3GZGA 1OVTA 2I4CA 3IL1B 2THIA 3P7IA 1TFDA 2O1LA 4P0IA 4YMAA 1HSEA 3TCGA 1QUJA 3M3LA 3CVGA 1Y3QA 3FD3A 4KYDA 4UACA 2Q9TA 4R9FA 4H65A 3MPKA 1UTHA 3K6WA 2QS2A 5DVIA 3KN7A 2O68A 4M4GA 1Y1ZA 3PMVA 3G3HA 1B3EA 3R7XA 4JWXA 1USYE 3E13X 4GD5A 3V8XB 5I2KB 3RTWB 1ZIUA 2PYYA 2UYEA 4U23A 4YAHX 3C34A 2DP8A 5AA2A 1O7TA 3KJTA 5DVFA 2ALUA 1JQFA 3ILTB 2E0SA 1D9YA 3D4CA 1VR5A 3L6HA 1MS7A 1QJMA 1BP5A 4ZEKA 5CMMA 5AA2D 1SYIA 3VLWA 3LSFB 3CI8A 1OLAA 4QSDA 3QYTA 1IITA 4GWOA 1MXXA 1Q35A 4PE5B 4BDQA 2QS4A 2P2AA 1UTHB 1BLFA 3C9HA 4EQ9A 3GBAA 4GLIA 1NFTA 3GLBA 3C4MA 4BDMA 3ZSFA 3U92A 4LZ8A 5H8HA 2REJA 4GXAA 5EHSA 1NNTA 3VDFA 2QL3A 1JEVA 4IO4A 3QIMA 3KN3A 4XKNA 2ESNA 1XS5A 2DXYA 2O7UA 3H7MA 5AA2B 2Z8EA 1B0LA 3MVWA 3CFZA 2O69A 2V3QA 3KEIA 4P11A 3W9WA 1P99A 2M8CA 3MJNA 5H8FA 4ZZAA 3SETA 4ND9A 1LFGA 1MQIA 3FJ7A 3FVKA 1B58A 4EQ7A 4F1YA 3LSXA 4NMYA 4ELQA 3S9EA 4M1VA 3VLVA 1DTZA 5I59A 3OO7A 1T0KA 1MPDA 1O64A 3G3KA 1ZKBA 2F7CA 4XIGQ 4C0RA 4QSCA 3PMXA 4DIGA 1EZOA 4DCYA 1TFAA 3H6TA 4RPOA 5BUUA 5H8HB 4F3BA 2RKMA 1FTOA 4OERA 1GTKA 2DE4A 2I0BA 5H8QA 4IO2A 4E0XA 1URDA 3O9PA 3EHSA 3LR1A 4YKIA 1SDXA 4F39A 4DXBA 3HHFA 2HQ0A 3USDA 5ISUA 5H8FB 4HCWA 2O1MA 3UN6A 1Z7ME 4JWOA 2GHAA 3VXBA 3HPIA 4F2QA 2Z8FA 2ONRA 1PBPA 3ODBA 2B65A 4RK2A 4R74A 1ZTYA 2VP1A 1B3FA 2CZLA 3UA8A 5BWJA 1SI0A 2O7IA 3RTFB 2ZNTA 3M3KA 3O6IA 4GL8A 2HZKA 3CR9A 1FW0A 4X1DA 3N6TA 4OYVA 2UVGA 3Q26A 5H8QB 3DM0A 3DP4A 1S7YA 1B52A 3C36A 3H3GA 3LBSA 1NNFA 2DWHA 3U1OA 3I6VA 4RJZA 4LQ2A 1NH7A 4FJPA 4TLMB 1B4HA 3PUWE 3MQ9A 1UIUA 3FVNA 4JSOA 1SQYA 1PB9A 4AB5A 3KJ7A 3H03A 5CC2A 3PUVE 4XKQA 3E4RA 3I5OA 1LCTA 3IK6B 5CMBA 1B0HA 2I48A 3IOWA 4ZE9A 3S4UA 5KDTA 1HSLA 3FZVA 2XXTA 2AL5A 2HXWA 3PPPA 1F9BA 1MXZA 5CBSA 3FV2A 3JV9A 3LC8A 3MZBA 3SERA 5TPAA 4YB5A 4XTCQ 4NF6A 4G68A 1ZJLA 4F19A 1DPEA 3UIFA 3G3JA 5FHOA 5IAIA 2I3WA 4TLLB 1MRPA 3PPRA 2XD3A 4RY1A 3UP9A 3N6UA 4NTLA 4EQBA 4Q0CA 4H8IA 1EU8A 3TMGA 3B6WA 4QFKA 3OOAA 1LCFA 2Z8DA 1D4NA 2R9JA 2V25A 1LBBA 1R1NA 4C1UA 4G68C 4PP0A 1US5A 1LFIA 2ANJA 3KFMA 1LAGE 1QKAA 5KDTB 3IOVA 4WKMA 1Q1KA 5AA4A 5ITPA 4BDLA 1L5TA 1NH8A 3DP6A 2ZYKA 4HS7A 1BIYA 4LZ7A 1BTJA 5TPAB 5EHMA 2RC8A 4G8HA 3TTKA 3QK6A 4NF6B 4G68B 4QRZA 3IJXB 1MXWA 2F97A 2REGA 3PU5A 2XD2A 4HTGA 4HW8A 4IO5A 4YB7A 2XXHA 4OEUA 3T93B 4F2OA 4YICA 4YMBA 1VFDA 5L9SA 2ONKE 2FA7A 4P0GA 3UGWA 1M5FA 1XT8A 2QS1A 1MDQA 1WODA 3CIJA 5FHNA 1SYHA 1P1OA 4NWCA 3L6GA 1MQJA 1QVSA 3OO8A 4R6HA 5ELVA 2B3BA 2H4IA 3DLNA 3KZGA 4H0WA 1B51A 3TEPA 1EH3A 3W9VA 5AA4B 1N3XA 2HCAA 3FXUA 1XVXA 2I4BA 1A8EA 5HPQA 2DVZA 1LLSA 4EUOA 1M5DA 3T9HB 1MQDA 3KGCA 4IY6A 3OELA 2PMSA 3JYRA 2ZYMA 1IXIA 1N0TA 1AOVA 3RUMA 2DWJA 3KOTA 1LAFE 5H8NA 5I56A 3K4UA 1QW0A 2Q89A 5KZTA 2Y7PA 4KI0E 1MM6A 3R26A 3FASA 4ESXA 1LB9A 3FXQA 1FQCA 4GQOA 1B05A 4I62A 2UXAA 1DTGA 1PB8A 1Y3NA 2E1SA 3WAEA 1M5BA 1B7ZA 1A8FA 1MQGA 3HCQA 2P1SA 4DE8A 4PFWA 5FTIA 4ZS9A 2Q2CA 3UK4A 3CFXA 3TTRA 3EF7A 3OXNA 3BFTA 4OENA 4TQUQ 2O51A 2OK2A 1M5EA 3FGSA 4OFJA 4BDOA 1JW5A 4NF8A 4ELRA 5HM4B 1CB6A 4R9GA 5ICQA 2O6AA 3ECRA 4O3CA 2RINA 3Q27A 3QAXA 1B1HA 4QHQA 4MLQA 4YZZA 2I6EA 4F1UA 4LUBA 3V5AA 2UVHA 4DDDA 5H8NB 5I56B 2H9BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I58A 1SBPA 2F5XA 3V83A 1BKAA 1B9JA 4KPTA 1IMDA 4OETA 2QMXA 1JVYA 2B4LA 5I84A 2VD3A 1OQHA 4WXJA 4N4UA 3KC0A 3FBPA 1SW4A 2ZZXA 1ZU0A 1XVYA 1R9QA 4KXPA 1MH3A 1FBGA 2LAOA 3PD9A 2NUVA 5EYGA 2ZNUA 3WAFA 4FECA 2ONSA 4LN5A 1B40A 4QFPA 4HE2A 1SVXB 4U4SA 2P3VA 3C32A 4POXA 3K1NA 4KQPA 4R2FA 3SEVA 3DELB 1Y4CA 3BBRA 4RPNA 4ZEBA 1BK4A 4ZECA 4HCYA 4NF8B 1CE2A 4HXVA 1RYXA 3PUZE 4KYEA 1N7WA 4OVPA 3AXFA 4DLDA 2FYIA 3R6UA 3RT8A 4U1ZA 2A5TA 3GYYA 1FTKA 4YKKA 2QSXA 5JTYA 1LAXA 2CZIA 1FPDA 1NI9A 2QVRA 1N76A 4RXLA 2H98A 1B5JA 1G0HA 4H1XA 4PDHA 3HFUA 1A7LA 2XXUA 3IB2A 2PT2A 3SZPA 4LQ5A 4ZEDA 2UYFA 4QFLA 3T9VA 2FNCA 3UORA 2RCAA 1FQDA 3MVXA 1IUDA 4IO3A 3T1BA 5CMKA 3TYHA 2G93A 4OHNA 4MH5A 1H44A 1YXIA 4ZZEA 3MW0A 3HO7A 5KCJA 3T96B 2D21A 3VVFA 3MBPA 4QSEA 4JWYA 4FEDA 4U21A 2XHDA 4PETA 4O3AA 2A5TB 3FJMA 1MY1A 3C33A 1JETA 5JTYB 1DSNA 1GVCA 3PPNA 2P3NA 2WYKA 2GHBA 2RF1A 5AE4A 4XKPA 3T9XB 2BJJX 1NNKA 5F24A 2Q88A 1NUWA 1IMFA 3I3VA 2XWOA 1LGBC 3S9MC 3W15C 1FPKA 3IX1A 4N13A 4KYSA 4P1LA 3PV0E 2XA5A 2VHAA 1MQHA 2BJIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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