1EZOA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 57
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA01
4GWOA 1M5BA 3F11A 2XHDA 1Z7NE 2D21A 1MH3A 2DP8A 1S50A 1B4HA 3LC8A 5CMCA 2V3UA 2HXWA 3EF7A 5I56B 4XKNA 3K01A 1VR5A 1NNTA 5K2XA 1URGA 4RK9A 1N3XA 4ZZAA 2P2AA 1AL3A 2XXUA 5TU0A 3SEXA 4PQJA 3C33A 2A5TA 1MS7A 4YB6A 2O51A 3MVYA 5ITPA 2PT2A 3WAEA 1B5HA 2OZZA 4DE8A 3PUXE 5CC2A 2ALUA 2RC7A 5L9SA 3PV0E 2Y7RA 4OETA 3RN8A 5DT6A 1DTZA 3V89B 4QFNA 3VVEA 4G68A 2ONRA 1N3WA 1MQIA 1ZIUA 4BLAA 5F1QA 2H9BA 3IB0A 2ZNTA 2UVIA 4DCYA 1PB8A 1FQEA 4JWYA 4U2RA 1A8FA 4H0WA 4ZEDA 3S4UA 2D3IA 2DWIA 1FTKA 4JDFA 1WVJA 2F7BA 5DYHA 1OLAA 1IIWA 4QHQA 5ITOA 2I6EA 3TTLA 3RLFE 5HPQA 3IOTA 2GH9A 1ELJA 2E0SA 4IGTA 2Z22A 2QSXA 2PT1A 3TCHA 3FVGA 2I3WA 1RYXA 5BWJA 4R73A 3TUSA 1HSJA 1POTA 1ZMGA 2CZLA 4DCXA 3FV1A 1IUDA 3SKPA 4RPNA 1MM6A 4FAJA 2YJPA 1J1NA 5KZTA 2Z8EA 4RYAA 2HCAA 3VE1B 2HZLA 4GXSB 2GHBA 4EDPA 1TXFA 3ILTB 4ELOA 1GTKA 3IJXB 5AA2B 4FE8A 3UP9A 5H8NB 4KR5A 4YKJA 3RGYA 1MPBA 2QJEA 4GXAA 1LAGE 3T66A 1DSNA 3U94A 1MQGA 1FQDA 4EXLA 1PB9A 4NF8B 4ESWA 1QW0A 3LBSA 3HN0A 1JQFA 3VDFA 1UTBB 2OBGA 4QSEA 4ELPA 1I6BA 1MQDA 2Z23A 3ZKKA 2B3FA 2OWTA 2XXXA 4KD5A 2PBWA 3MZBA 5M2VA 3IOVA 1AOVA 4IY6A 1MQJA 3MVWA 3VXBA 3O2AA 4RPOA 4F2OA 3S9NC 2HAVA 1FW0A 2QS4A 5L9OA 3KOTA 1HSEA 4LONB 2Y7PA 5KCJA 3G3IA 5AE4A 1Q1KA 3K1PA 3M8UA 4ESXA 5FHOA 1BP5A 3TPAA 3K6XA 2I49A 4WKMA 3IK6B 1QUKA 3PD8A 4OZ9A 4YU0A 3OO9A 3HSTA 1ZU0A 3CVGA 1YTVA 2Q89A 3V5AA 3GBBA 4H8IA 2F6PA 4GIZA 3IOUA 2H5YA 2Q2AA 3E4RA 3O97A 3U92A 3TFLA 1OMPA 2DOJA 1D9YA 2UVGA 4XKPA 5DVJA 3VVFA 4OFJA 1UTHB 3MVZA 3IB1A 4JWXA 1SI0A 5I56A 2HAUA 3TMGA 4O3CA 1JW4A 3IOWA 1LFHA 3M3FA 3R6UA 2XD2A 5FTIA 1QKAA 4NF6A 4EF1A 1B0HA 2HZKA 4M4GA 4H5GA 5B70A 3C36A 2Q2CA 2I58A 1MXWA 1A99A 3GLBA 3OO8A 2O1MA 5EHSA 4FEDA 2ABHA 1P1WA 3D4GA 3FVNA 3BFTA 3O28A 2IEEA 1FTLA 3OEKA 1MXVA 4R9FA 3RQTA 3QUFA 2Q8JA 1JNFA 1P1OA 5JK4A 1JEUA 3O9PA 4FECA 1B1HA 3LSWA 2HFBA 4KHZE 4C0RA 3HHFA 1KWHA 1AIVA 4GL0A 4POWA 5H8FA 1OIBA 2RF1A 1R9QA 4NTLA 1B2HA 3KOSA 4MF3A 5CRYA 4TQUQ 3ILUB 1B4ZA 2XD3A 2RC9A 2Y7KA 4PE5B 5CMMA 3O6IA 4BDQA 4RJZA 3CIJA 1AMFA 5CI5A 4KPTA 4OYVA 2F6GA 3RUMA 4LZ8A 2CMOA 4XXUA 3N26A 3MC2A 1MH4A 1QULA 3PPNA 4NWDA 1SVXB 2AYSA 4H5FA 1D3KA 2ZYKA 1XS5A 1ATGA 1IXHA 1MM7A 2I0CA 5FHNA 5H8HA 2QS3A 2XXTA 5H8QB 3V8XB 4KQPA 4OESA 3PD9A 2NXOA 1QKBA 4OHNA 2I4BA 1Y20A 5AA2A 4EQ7A 1VFEA 3MJNA 3KGCA 4MFIA 3RT6B 5H8NA 4R75A 1ZBMA 4ECFA 3S9MC 3FJGA 3TKDA 2DXRA 3FASA 1B0LA 5I58B 3N6UA 2OWSA 3QYTA 3PMXA 2REJA 1QVSA 3LSLA 4M1VA 4QFOA 1POY1 3EHUA 2RCAA 4K3FA 2VOZA 3C9HA 4TOZA 4R6HA 3CSBA 2VGQA 4PFTA 1FTOA 1H43A 1SW1A 1NNPA 2H4IA 1EZPA 3WAFA 5I57B 3IL1B 3BFUA 2X26A 2H99A 3MAMA 4U23A 1A7LA 2ANJA 4F1YA 1JW5A 2UYEA 3TEPA 3OSQA 4IGRA 4IB2A 2GFEA 1BKAA 1II5A 3GBAA 3E9XA 5I2NB 3MZ1A 3TQLA 2DVZA 4LQ2A 4I9DA 3PPRA 4ZEBA 3LR1A 2F5XA 3FJMA 4I8CA 4FJPA 4NF4A 3UA8A 3JYRA 2Y84A 3FZVA 4PFWA 1N7WA 3HCQA 3K00A 1MY1A 5TP9B 1B3GA 2ONKE 3CG1A 3K0VA 1B32A 2B65A 1SBPA 1Y3PA 4HS7A 4Q30B 3SDFA 3KN3A 3SERA 1HSLA 3C34A 4F22A 2F78A 2Z8DA 2Y7IA 3G7WA 4OQOA 4IO4A 1LCFA 4IO3A 3C4MA 3CI8A 1DPEA 1MDP1 3USDA 2M8CA 4TLMB 3G3HA 1MDQA 3HPIA 4YKIA 3TTKA 2O69A 1MY4A 1O7TA 2G29A 3GZGA 1O63A 1B9JA 1I69A 4H8JA 1B58A 3RPWA 4POXA 4OWDA 2OJTA 4OERA 4QSCA 5I2KB 3IJOB 4R2FA 5AA1A 2NOOA 2F7AA 1NNFA 4F19A 1N84A 2FA7A 4F3GA 3KN8A 3H6WA 5A5XA 2REGA 1PB7A 3U8QA 1US4A 2F35A 5DVIA 1EU8A 3IR1A 3G3GA 4LP2B 4N13A 2O1LA 3K1MA 3MP6A 2ZMBA 1N04A 3OSRA 1MPDA 2F36A 1MXYA 1OVTA 1NFTA 3T9VA 3KG2A 1NNKA 1JW1A 5L9MA 4NWCA 4OEUA 4GFRA 1IEJA 3H6VA 3PPQA 2O68A 3TTNA 2DE3A 4U1ZA 4LVQA 3T96B 3EHSA 1JVYA 5DTBA 5CMKA 2I3VA 1IZ1A 3KN7A 3R7XA 3VFJA 4ND9A 3KFMA 3TTRA 3S9LC 3FVKA 4UACA 3KZGA 5H8QA 4GRKA 4R6YA 4LZ7A 1LAXA 1USYH 1AH5A 2WKYA 4PFYA 3C31A 5TPAB 4AQ4A 4UA8A 5CM6A 3E13X 2RCBA 1N7XA 3KBRA 3OO6A 1M5DA 3O66A 3TYHA 4ZE9A 4GVOA 2QS1A 4H1XA 4YAHX 4LQ5A 4DLDA 3B6TA 1SW4A 3K6WA 4GOTA 1QUIA 1L5TA 2XXPA 3SEUA 2ZXTA 3PUZE 3K2DA 5I58A 2FNCA 5JTYB 2V3TA 2O7UA 1PEBA 4XTCQ 3EHTA 1VE4A 2DWAA 4HCYA 4OFOA 4LZ5A 2BJJX 3KSXA 1A54A 4DIGA 4F39A 2DE2A 4KYDA 4U4SA 2QMWA 2V3QA 4N07A 5KDTA 5JEIA 1B7UA 4C1UA 3IO4A 2P1SA 1SYIA 1NH8A 1MRPA 1XVYA 1USYE 5I57A 5HBCA 1S7YA 4FATA 1B3FA 3JZJA 3DELB 4JWOA 3T93B 1MXUA 5IKBA 4RY1A 3C32A 4ZE8A 1B5JA 3SESA 3TDJA 1SI1A 3V83A 4PFUA 3QAXA 4EXKA 2VHAA 2UVJA 2RC8A 2XX8A 4G2ZA 1IXGA 4U22A 3IORA 3CFLA 4JBZA 4P11A 4NMYA 2B3BA 4OTEA 3RTFB 3HHGA 2XX7A 2G93A 1R9LA 2A5TB 2P0SA 2F8DA 4JB7A 2DE4A 2ZNUA 3LSXA 1MY3A 1I6AA 1P1QA 4PP0A 3JV9A 1H76A 1SW2A 2D5WA 4FORA 2H98A 3H6UA 4YICA 4ELQA 4ZEIA 3A3UA 3EN3A 2F97A 5FTHA 4TLLB 4X1DA 5L8DA 2H25A 3VLUA 3U72A 3UORA 4ZEFA 3KJ7A 3ODBA 4FIMA 4G68B 4QFLA 3PUVE 1DPPA 1B3HA 1RKMA 4H65A 4R2BA 4ZEKA 4DXCA 1F9BA 1GV8A 3FXQA 4O3AA 1T0KA 3A3CA 4KCCA 2V93A 4F3PA 3I3VA 2ZNSA 2OLBA 2HEUA 4GF8A 4NEDA 3QIMA 1LAHE 5ICTA 1BTJA 2A5SA 2QL3A 3S2VA 4EQ9A 3PUWE 4ZZEA 1H44A 3VLWA 3TTMA 1SW5A 1RYOA 1Y3QA 4ISUA 2QMXA 1GVCA 4JXIA 5I2KA 3MUQA 3EPEA 2GHAA 4E0WA 5DVFA 1PBPA 2XXHA 3PGFA 4EF2A 3OO7A 2NVUB 4IO6A 1BLFA 1B51A 5CMBA 2QPQA 2ZYMA 4RK2A 4THIA 3MBPA 2PMSA 1UIVA 1NH7A 4YMAA 3W9WA 3MP1A 4G68C 4ZECA 2XXWA 3KSJA 5ISUA 3FXRA 2O7IA 1IQ7A 1TWYA 3FV2A 4HW8A 4DXUA 4IO2A 3P7IA 4IY5A 3DLNA 3FGSA 4C1TA 1B5IA 2XXYA 4GQOA 3SEWA 1YCJA 1M5EA 5EYFA 4ZDMA 4YMBA 5AA4B 2V84A 5FHMA 4QF9A 4MH5A 2THIA 3UGWA 4NF8A 3M3LA 5B7DA 5I59B 3PU5A 4P0IA 2PYYA 4OMBA 1UTBA 4YKPA 4KYEA 4OVJA 2F34A 5KCJB 4YB7A 2ZYOA 4BDRA 2AIXA 3SETA 2QS2A 4Z0IA 3UIFA 3D4CA 3KJTA 3IAZA 1URSA 3K02A 4F2QA 2OK2A 4H67A 1JVXA 5DEXB 1QUJA 3K6VA 5F7VA 4DXBA 3W9VA 3N6TA 3K4UA 4F18A 4YKKA 2VP1A 3B6QA 4KFQA 4U1OA 2NUVA 3E3KA 1YAEA 3DP8A 5CBSA 3CRBA 2GRVA 5EHMA 1UIUA 1LB9A 2I4CA 4HTGA 5H8SA 3FIRA 1ZKBA 3FUZA 4F3BA 1Y1ZA 3FVOA 1LGBC 1LB8A 4NF6B 2PVUA 4MLQA 2E1SA 3FD3A 3RTWB 4I1DA 2YPNA 3PPPA 3QK6A 3SEVA 3C35A 4WEDA 3EQ1A 1ANFA 1DOTA 1UTHA 2XXRA 5BUUA 2DVCA 3H4ZA 2Q9TA 4U4XA 3OD7A 4WXJA 1FQAA 4PETA 1OQHA 1D4NA 2DS9A 1LAFE 2DYXA 1FCKA 1NL5A 2IA4A 1B7ZA 2LAOA 5HM4B 1Z7ME 1FTJA 3K6UA 3MZ9A 4BDNA 5H8FB 1SQYA 4H6DA 1Q35A 4AB6A 1SYHA 1B52A 3U1OA 3OELA 1CE2A 4G8HA 5J1DA 1ZTYA 2DQVA 1B05A 2R71A 2UYFA 2O84X 2I0BA 1VSOA 2W7YA 1LBCA 3L6GA 3T9UA 5I84A 1B3EA 3O6GA 4MBPA 3Q28A 5LOMA 1D9VA 2DSFA 4ELRA 4OENA 3UK4A 3IX1A 5H8HB 1H45A 3ZKLA 3ONMA 4Q5TA 1P99A 1H3DA 1MY2A 3BBRA 2DXYA 4GD5A 3VXCA 1US5A 1P1NA 1MPCA 3H6TA 3OMBA 3T22A 2YLNA 4XKQA 3Q29A 4NF5B 3MPKA 1A55A 2OCUA 4AB5A 1PC3A 1LBBA 2R6GE 3R26A 3BKIB 3TZAA 4F29A 1QJMA 4RNSA 1MXXA 1UQWA 3W15C 1DTGA 4GLIA 1EZ9A 1EZOA 3DM0A 1M5FA 3N94A 4O3BA 1ZLQA 3I6VA 1YPNA 5AA4A 4MLVA 1URDA 4G4PA 3VLVA 1SDXA 2HQ0A 4DDDA 4BDOA 3G3JA 5I59A 5CBRA 2O6AA 1JETA 3GXAA 4F3SA 4Z7EA 1P1UA 4LUBA 3G3KA 4RXLA 1XOCA 4EQBA 1MG1A 3RNNA 4ONYA 2NWJA 1M5CA 4N6PA 3PMWA 4NE4A 3QSLA 1MQHA 1OVBA 1R6ZA 4NF4B 1R1NA 4WEPA 4YB5A 1A8EA 2RINA 5DEXA 1Y3NA 3ECRA 4LATA 1NMUA 3OEMA 3QUJA 1FQCA 4KI0E 4KYSA 3TODA 5I2NA 1B1XA 5IAIA 2UVHA 1N76A 4R9GA 4YZZA 3T9HB 3TAJA 1TFDA 3LSFB 1MY0A 3MWBA 3B7DA 1DMBA 3THIA 2QRYA 1CB6A 1I6QA 1Y4CA 4X9TA 3TQWA 4BDMA 3MP8A 3UN6A 4QFKA 5TP9A 3HV1A 2XXQA 4G8NA 4FEBA 2I48A 4RA1A 1LLSA 4E0XA 4I62A 1XHYA 1Y1MA 1XT8A 1B6HA 4OFLA 4R74A 1LSTA 3LUYA 1XVXA 4X48A 1IITA 2ZYNA 2PX1A 4F1UA 3DP6A 1VFDA 2ONSA 4ZS9A 4QFPA 4KCDA 1EH3A 4QSDA 4JSOA 4L17A 4GL8A 4R6KA 3TCFA 4G8MA 1B7HA 3MQ9A 4G77A 2X7PA 4X1BA 3AXFA 1OQGA 1O64A 2X7QA 3TELA 5K2YA 2XXIA 4F1VA 3OXNA 4XKRA 5AA2D 2Z8FA 5ELVA 3H7MA 2AL4A 3RY3A 1TT1A 3ZSFA 5A5XB 4XIGQ 3FJ7A 2KLFA 4LA9A 1WDNA 2XXVA 3PPOA 4P0GA 1ZJLA 1PDAA 3KEIA 3FXUA 4U21A 1GGGA 1B3LA 3T9XB 2F7CA 2R9JA 2FYIA 4R72A 3O6HA 4F31B 4DZ1A 1LFIA 3VVDA 3FATA 3O29A 1S9TA 2Y7WA 2VD3A 4OXVA 1N0TA 4OEVA 3U93A 3A09A 3MPLA 3K1NA 1IXIA 3L6HA 3ZS6A 1IXCA 3CFZA 3DP4A 4IO5A 5ICQA 1B46A 1MXZA 3Q27A 1LFGA 2XX9A 4IO7A 3IB2A 4EUOA 3PUYE 3PMVA 2ESNA 5AA3A 3QXMA 3VV5A 3SEYA 1JEVA 3MW0A 1Y9UA 1Y4TA 1FTMA 2DWHA 4NF5A 1OLCA 4JSDA 3OOAA 3OENA 1SD3A 1GR2A 3M3KA 2RKMA 3CSGA 3RT8A 4Q0CA 2VD2A 3S9EA 3B6WA 1BIYA 2Q88A 3HO7A 1NKXA 3N5LA 1TFAA 4Q8RA 2AL5A 1LCTA 5TPAA 1FQFA 3IO6A 3CR9A 3CFXA 3H3GA 3MVXA 4BDLA 3H06B 4QRZA 1B40A 3G3FA 1XC1A 3TCGA 3CG3A 2V25A 3I5OA 3Q25A 4HCWA 5KDTB 1FQBA 2UXAA 3Q26A 1PBQA 3H03A 2DWJA 5JTYA 1A40A 1WODA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P3NA 4GWOA 1M5BA 3F11A 2XHDA 1Z7NE 2D21A 1G0IA 1BK4A 1MH3A 2DP8A 1S50A 1B4HA 3LC8A 5CMCA 4GBVA 2V3UA 2HXWA 3EF7A 5I56B 2XXKA 4XKNA 3K01A 4PF6A 5EQ9A 1VR5A 1NNTA 5K2XA 1URGA 4RK9A 1N3XA 4ZZAA 4OVTA 2P2AA 1AL3A 2XA5A 2WX9A 4PF8A 2XXUA 5TU0A 3SEXA 4PQJA 3C33A 2A5TA 1INPA 1MS7A 4PC9A 4YB6A 2O51A 4N81A 3MVYA 5ITPA 2PT2A 3WAEA 1B5HA 2OZZA 4DE8A 5IM2A 3PUXE 5CC2A 1FPEA 2ALUA 2RC7A 5L9SA 3PV0E 2Y7RA 4OETA 3RN8A 2B4MA 5DT6A 1DTZA 5ET6A 3V89B 1NV2A 1G0HA 4QFNA 3VVEA 4G68A 2ONRA 1N3WA 1MQIA 1ZIUA 4BLAA 5F1QA 4MJOA 2H9BA 3IB0A 2ZNTA 2UVIA 4DCYA 1PB8A 1FQEA 4JWYA 4U2RA 1A8FA 4H0WA 4ZEDA 3S4UA 2D3IA 2DWIA 1FTKA 4JDFA 1WVJA 2F7BA 1FJ6A 1NUZA 5DYHA 1OLAA 1IIWA 4QHQA 5ITOA 2I6EA 1NV4A 3TTLA 2PFZA 3RLFE 3LV0A 5HPQA 3IOTA 2GH9A 1ELJA 4MEVA 2E0SA 4IGTA 2Z22A 2QSXA 2PT1A 5ESYA 3TCHA 3FVGA 2I3WA 1RYXA 4GWYA 4O7IA 5BWJA 4R73A 3TUSA 1HSJA 1POTA 1ZMGA 2CZLA 4DCXA 3FV1A 1IUDA 3SKPA 4RPNA 1MM6A 4FAJA 5EQ7A 2YJPA 4NF0A 3IFAA 1J1NA 4MAGA 5KZTA 2Z8EA 4RYAA 2HCAA 3VE1B 2FVZA 2HZLA 4GXSB 2GHBA 4EDPA 1TXFA 3ILTB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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