1EZOA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
total genus 57
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA01
2O84X 1SW1A 4NF8B 1URDA 3MUQA 3IB0A 1B7ZA 1MY1A 1P1QA 1QJMA 1PB8A 1MH4A 2YPNA 3OSQA 4LQ5A 3UN6A 3WAEA 5I58B 5AA2D 3MQ9A 4ESWA 1MG1A 2R9JA 2PBWA 3V5AA 4OENA 5TU0A 1T0KA 2H9BA 2OLBA 3HSTA 4YAHX 1BLFA 3PUWE 2ZMBA 4H8IA 3FD3A 1DSNA 4GVOA 5I84A 3I5OA 3G3GA 3KBRA 3ECRA 2A5SA 3CG1A 1Y9UA 3S2VA 3H03A 2F78A 1DMBA 1NH8A 3RNNA 2B65A 2OZZA 1YPNA 1B1XA 3HN0A 1MQJA 4OHNA 3SEWA 1B32A 1OQGA 1HSJA 3RUMA 3IL1B 1SDXA 4XXUA 3TMGA 3IOTA 4KYSA 1UIUA 2ESNA 4GIZA 4KR5A 4MLQA 3T66A 1H76A 3O97A 5BUUA 3N26A 1B46A 2F6GA 4F1VA 3PPOA 2DWAA 4JDFA 1H45A 1JVXA 4PP0A 2HZLA 4R6HA 1MPBA 1DTGA 1POY1 4GF8A 3SESA 5B70A 5AA4B 3MZ9A 2I0CA 4WEPA 2P1SA 3EHTA 1ELJA 1LCFA 3FXRA 4KFQA 5DVFA 1NNFA 2V84A 2Y7WA 3TTLA 1YAEA 1UTHA 3KJ7A 1LAHE 2O7IA 4XKNA 4YB7A 5DEXA 5BWJA 1MY2A 1L5TA 4G8NA 4EQ9A 4JWXA 4QSCA 5K2XA 3JZJA 4IB2A 1B05A 4EUOA 2F8DA 2RCAA 3MP6A 1UTBB 3PPPA 4R75A 2DVCA 4PE5B 4U1OA 3WAFA 5A5XB 4RYAA 2OJTA 3IJXB 1FQDA 1MQHA 3QYTA 4R6YA 3S9LC 2V25A 3TELA 2DVZA 2VD2A 4DXUA 1ZLQA 1P1OA 3O6GA 1US5A 3RTFB 4RA1A 5TP9A 4X1BA 4DLDA 4X9TA 1LB9A 4WXJA 1MM6A 2DQVA 4JWOA 1LAXA 4EF2A 5L9MA 2I58A 3FJGA 3M3LA 4P0IA 1MQDA 4XKPA 4BLAA 2RCBA 4FEDA 4IGRA 2XXWA 1TXFA 4G8MA 4NF6A 4R9GA 3RGYA 5AA4A 4LZ7A 4F3GA 1MY3A 1VSOA 2RF1A 1NKXA 4HCYA 2QS3A 2VOZA 3EF7A 1IXHA 1Y20A 2XXQA 1O64A 2HZKA 1FTLA 1EZOA 3DM0A 3H6TA 3U1OA 1R6ZA 2DSFA 4G2ZA 3VVDA 4H5FA 4WEDA 3BFUA 3S9NC 2GHBA 1XOCA 4NF5A 2I49A 2Z8FA 1OMPA 3OELA 4EDPA 2UVIA 1VR5A 4IO3A 3RQTA 1ATGA 2HAUA 2QMWA 5L8DA 3GZGA 3S9MC 1KWHA 2H5YA 3KN3A 4LA9A 3DP8A 5F7VA 4AB6A 4N6PA 1PDAA 1Y3PA 4P0GA 4YB6A 4KYEA 3EHUA 4F2QA 3O28A 1A8FA 1IUDA 4I62A 4LZ5A 4MFIA 5ICQA 5TPAA 5LOMA 4EQBA 2AL5A 1N7WA 4JBZA 3I3VA 1SD3A 1Y3QA 2XXRA 4GL0A 5EHSA 1TWYA 3H3GA 3PPQA 4GRKA 4R2FA 2VHAA 3LSLA 4NF6B 3MP1A 1B6HA 4MF3A 3TTNA 3KSJA 1PEBA 1Z7ME 1I6QA 5I2KB 3RT8A 3GXAA 1WODA 4M4GA 3TAJA 4POXA 3CFXA 2CMOA 4QFPA 4YMBA 1EZPA 4FIMA 1I6BA 1LFHA 4F3BA 1QKAA 3SKPA 3G3FA 1B5HA 2I48A 3IK6B 5DVIA 3TEPA 3PUYE 1LAGE 4F22A 4DCYA 1D4NA 4R72A 2AL4A 1NNKA 4YKPA 1SI0A 1UQWA 2DWJA 1FQAA 3KEIA 4M1VA 3UIFA 4G77A 3I6VA 4QRZA 1FQBA 2NOOA 1NFTA 1N3XA 2HAVA 2XD3A 4Q5TA 4HW8A 4THIA 3QAXA 2WKYA 4NEDA 3L6HA 1MPDA 2HQ0A 4X48A 2I6EA 1JVYA 2D3IA 5H8SA 1UTBA 1H43A 1B5IA 1QW0A 1ZIUA 2X7PA 4H1XA 3TCFA 3OMBA 4R73A 1B0LA 2O1MA 1ZJLA 3ONMA 2ZNUA 1II5A 5L9SA 4YZZA 3TKDA 3PU5A 4DIGA 1S7YA 3A3CA 3VXBA 3P7IA 3IOUA 1IQ7A 3UK4A 5IKBA 2OK2A 1SBPA 3PMXA 4F3PA 3CI8A 5AE4A 1B7HA 1A54A 5AA2A 1Y3NA 2UYEA 1FTJA 1JW1A 3H6VA 4G8HA 4RK2A 1PBPA 4U4XA 1B3GA 2YJPA 3OEKA 3PD9A 4FORA 4G68B 4DDDA 1YCJA 3EQ1A 4F2OA 3T96B 1XS5A 4OQOA 3T93B 3RT6B 3VLVA 4BDMA 4H0WA 5HBCA 3T9VA 3ZSFA 2LAOA 3TUSA 2H25A 1N0TA 4OETA 2F6PA 1IEJA 3IB2A 1N7XA 2AYSA 2F7BA 4G4PA 4NF4B 4U23A 5H8QA 4BDRA 4QSDA 3U72A 2RC7A 4F31B 3Q29A 5CMKA 1LAFE 1QVSA 4UACA 4R74A 5H8FA 3LR1A 2FYIA 2O69A 5KCJA 3OD7A 1P99A 1B3HA 2GHAA 4BDOA 2KLFA 1TFDA 2OCUA 2XXTA 2NVUB 5J1DA 4GXAA 2X26A 3B6TA 3VVFA 2P2AA 4IO6A 4H5GA 3V8XB 2GRVA 3VDFA 1Y1MA 2V3TA 3MAMA 1IIWA 3TTKA 3RY3A 4H6DA 3HHFA 4I8CA 5H8NA 3K6UA 3K1PA 2Q8JA 2F34A 1J1NA 2Y7IA 3DP4A 3MBPA 2Z22A 3R6UA 2XHDA 5JEIA 3L6GA 4EXKA 4NMYA 1M5BA 2E1SA 3W9VA 1B51A 1MM7A 1SVXB 3SETA 1LFIA 4DCXA 4NTLA 2F7AA 2RC8A 3TTMA 3FASA 5KDTB 1I69A 1ANFA 1B7UA 3PUZE 4I1DA 1B3LA 3R26A 1PB9A 1GV8A 5CMBA 1QUIA 4QFKA 1IXGA 1FCKA 3CFZA 4NF4A 4WKMA 3TPAA 3FVOA 5JTYB 2NXOA 2H4IA 3C33A 4NE4A 1LFGA 1IZ1A 2UXAA 1N76A 2Y84A 3IORA 3KN8A 5H8FB 4XKQA 1PBQA 3UP9A 3ZKKA 3ZKLA 1MXVA 1PC3A 5HPQA 2HEUA 4OXVA 2QS2A 5I2NA 1P1WA 3U8QA 2IEEA 2I3VA 3V89B 1Y4CA 4YKIA 5AA3A 1GGGA 3CG3A 3VV5A 5KZTA 1DTZA 2ZXTA 2F35A 4C1UA 4DZ1A 3USDA 4IY5A 3CSGA 2M8CA 2V93A 1JW4A 3PMWA 3Q27A 4OERA 4Q30B 2OBGA 3HCQA 4TLLB 4U2RA 3FXQA 4ELRA 1ZTYA 1A99A 2R71A 2B3FA 3RTWB 1FQCA 3LSFB 5ISUA 4GOTA 1FW0A 3G3JA 3IB1A 2Z8DA 4ZEKA 4F1UA 3PPRA 4PQJA 1BP5A 1CB6A 3VVEA 5I59B 3H4ZA 3OSRA 2F36A 2F97A 5KDTA 3QXMA 2Q2CA 4P11A 2IA4A 3N5LA 3O6IA 5DT6A 3IOWA 3PUVE 3SERA 1MY4A 4OFLA 3C4MA 3Q25A 1NH7A 1SW2A 1D9YA 1TT1A 2XXXA 2Q88A 5F1QA 4YU0A 1MDP1 3GLBA 5FHMA 2I4BA 3TTRA 4QF9A 1QUJA 4ELQA 3RPWA 3O9PA 3PMVA 3K6XA 1B58A 5DYHA 5H8QB 2V3UA 3EN3A 5I2NB 2Q2AA 4NWCA 4ZEIA 4ZE9A 1SW5A 4ZEBA 5I57B 1QULA 1JEVA 3B7DA 5I56B 5ICTA 2PVUA 4PFYA 3OXNA 1XVYA 4H8JA 4ONYA 4TOZA 2DE2A 4BDQA 5ITPA 5CMMA 4KYDA 4F1YA 3G3HA 1URGA 3H6WA 4KI0E 5CBSA 4JSDA 4Q0CA 3QK6A 5EHMA 3PGFA 1Q1KA 3EPEA 1LB8A 1VE4A 3TZAA 3OEMA 3JV9A 2ALUA 5I59A 3K4UA 2REGA 4LQ2A 4NF8A 2I0BA 1NMUA 1DPPA 3K6VA 4JXIA 1B1HA 4LUBA 2DS9A 2E0SA 2XX9A 4U1ZA 3RN8A 3UORA 2ONKE 5DVJA 3O66A 5I58A 4F18A 2PYYA 1GTKA 3OENA 2BJJX 1H44A 1MDQA 3H06B 5FTHA 3SEYA 1SW4A 4QHQA 3K02A 3MZBA 4TQUQ 4FECA 1N04A 2W7YA 3DP6A 4KHZE 3W15C 1MPCA 1BIYA 4L17A 4KQPA 3E9XA 1OLCA 1USYH 4IY6A 1OIBA 3F11A 3EHSA 3FJ7A 2ANJA 4OVJA 3KG2A 5H8HB 3CRBA 1B0HA 4YKKA 4O3BA 4TLMB 3CFLA 3HPIA 2PT1A 3FXUA 3ILUB 3ILTB 3OO6A 4LZ8A 4OESA 3SEVA 1P1NA 4HS7A 1R1NA 4JB7A 2DWHA 1POTA 3TODA 4AQ4A 1EZ9A 3T22A 1XT8A 3O29A 3QSLA 5CM6A 2F7CA 4EF1A 3THIA 4ZS9A 2ONSA 3QUFA 2QPQA 3KZGA 3OO7A 4E0WA 4QFNA 1F9BA 2ZYOA 3O2AA 1M5FA 4OYVA 1OVTA 1NNTA 1AH5A 5DEXB 2A5TB 4BDLA 3TQLA 4LONB 2YLNA 4FJPA 5JK4A 4QFLA 1UTHB 1MXUA 3H7MA 3HV1A 4UA8A 4H67A 3BKIB 3TQWA 4ZZEA 2XXIA 3HHGA 3ODBA 1LLSA 4YB5A 5EYFA 5TPAB 4F19A 2Z8EA 2B3BA 1FTOA 2F5XA 3E3KA 4OWDA 2RC9A 4FE8A 3M3KA 4JSOA 4U22A 3N6UA 4ZZAA 4KCDA 3T9HB 2NUVA 3IX1A 1DOTA 1M5DA 5CRYA 1AIVA 2XD2A 5AA1A 4IGTA 1ZMGA 1OQHA 2DXYA 2V3QA 3PPNA 1XVXA 2FNCA 4EXLA 3CSBA 2PMSA 1SQYA 2Q89A 3PD8A 3KOTA 3G3IA 4JWYA 5TP9B 2VP1A 3H6UA 4OEUA 3TCHA 1BTJA 1HSEA 1GVCA 4YICA 4U21A 3MPKA 2P0SA 3W9WA 4LVQA 4DXBA 4IO2A 3K00A 1I6AA 1Z7NE 1ZKBA 1A55A 2G29A 3E13X 3VXCA 1JETA 2PX1A 1YTVA 3FV1A 3K01A 1XHYA 3FIRA 4ELOA 4POWA 5CC2A 1MXZA 1LBCA 4ZECA 2D21A 5M2VA 4C0RA 2UVJA 2AIXA 1MQIA 3BFTA 4H65A 4ND9A 4R6KA 4FEBA 4N13A 3U93A 5DTBA 1FTKA 2R6GE 3K6WA 4C1TA 2XXUA 2ZYKA 4MBPA 4NF5B 1LGBC 3MP8A 1B3EA 4GL8A 1OVBA 2HXWA 3A09A 4ELPA 4YMAA 1JQFA 2OWSA 1FTMA 1VFEA 1OLAA 2ONRA 3VE1B 4GLIA 1BKAA 3VLWA 1AL3A 2O68A 5CBRA 4O3AA 2UVGA 5FHOA 4BDNA 4XTCQ 1R9QA 3KJTA 2QL3A 1JNFA 1LCTA 3FATA 1NNPA 1EH3A 4OMBA 4U4SA 2HFBA 4IO7A 5FTIA 5H8HA 4XIGQ 1RKMA 2X7QA 3MWBA 1VFDA 3UGWA 4G68A 1N3WA 1O63A 4GFRA 3MW0A 3SDFA 2H99A 3C31A 3FUZA 1GR2A 2ZYMA 5ELVA 3ZS6A 1ZU0A 4QSEA 4F3SA 5AA2B 4G68C 2REJA 4I9DA 5I2KA 2ZYNA 1SI1A 1Y1ZA 3C36A 1UIVA 3KGCA 5K2YA 1LBBA 4FAJA 1M5EA 4RXLA 2XXHA 3FZVA 4GD5A 4HCWA 4OFOA 5ITOA 4EQ7A 1AOVA 1HSLA 3PUXE 4FATA 3B6WA 3IOVA 1Y4TA 2Y7RA 1JW5A 2O51A 3MJNA 3C35A 3MVYA 2DP8A 4HTGA 2NWJA 3CIJA 2A5TA 1URSA 4Q8RA 1IITA 1CE2A 3GBBA 3HO7A 3MPLA 3IO6A 1SYIA 3JYRA 1S9TA 3SEUA 1MXYA 2PT2A 4N07A 1Q35A 3KOSA 3D4GA 3Q28A 4ZE8A 3C9HA 4PFTA 4LATA 2ABHA 3AXFA 3D4CA 4GXSB 4DXCA 3N6TA 4Z7EA 2XXYA 2Z23A 1B3FA 3A3UA 3OO8A 4OZ9A 4OTEA 4PFUA 5HM4B 1O7TA 4PFWA 1IXIA 3G7WA 1H3DA 3LC8A 3C32A 1B40A 3IJOB 1RYXA 2QS4A 3LSXA 1MXWA 4R9FA 3QIMA 3LUYA 5FHNA 3TCGA 4IO5A 2VD3A 4GWOA 2DYXA 2Y7KA 1IXCA 2UYFA 2RKMA 1A40A 2XXVA 3FV2A 3FVKA 4ZEDA 3K0VA 4ISUA 1B5JA 2XX8A 3MVZA 2UVHA 2XX7A 3T9XB 3TDJA 3OO9A 2DOJA 3LSWA 3TYHA 2DE3A 1D3KA 3DELB 4RPNA 2QMXA 1MXXA 1P1UA 2O1LA 2QSXA 2Q9TA 2FA7A 3KN7A 4KPTA 3IAZA 3BBRA 2O6AA 3K1MA 3MC2A 5JTYA 3RLFE 1DPEA 3B6QA 1WVJA 3FGSA 1ZBMA 5CI5A 4Z0IA 3IR1A 4RNSA 1MY0A 1A8EA 2ZNSA 3MZ1A 4YKJA 3KSXA 3K1NA 4KD5A 3OOAA 1SYHA 1N84A 1D9VA 3GBAA 3CR9A 2I4CA 3TFLA 2CZLA 1QKBA 1MS7A 1FQEA 3Q26A 2Y7PA 5KCJB 2O7UA 1MRPA 2THIA 4O3CA 3R7XA 3VFJA 2G93A 2DE4A 5CMCA 5L9OA 4OFJA 3N94A 3SEXA 4ZDMA 2GH9A 4NWDA 3O6HA 1QUKA 4RK9A 4AB5A 4F39A 1PB7A 1B52A 2GFEA 3FVNA 4ECFA 5H8NB 1EU8A 1RYOA 4E0XA 1WDNA 2XXPA 1B9JA 4IO4A 4ZEFA 2OWTA 1A7LA 4F29A 3IO4A 3S9EA 1TFAA 4X1DA 3K2DA 3CVGA 2QS1A 4DE8A 1XC1A 2QRYA 4MLVA 4K3FA 2QJEA 5A5XA 1B2HA 1R9LA 1MH3A 3C34A 4R2BA 2D5WA 1JEUA 3PV0E 5B7DA 3U94A 4RY1A 3QUJA 5I57A 5I56A 3U92A 3LBSA 3MVWA 1B4HA 2ZNTA 3KFMA 4GQOA 4ESXA 3VLUA 3UA8A 2I3WA 3M3FA 2HCAA 3DLNA 1S50A 3V83A 1B4ZA 1FQFA 3FJMA 3FVGA 4MH5A 4RPOA 2H98A 4LP2B 4OEVA 3S4UA 1NL5A 2DWIA 1US4A 3E4RA 1LSTA 4RJZA 3T9UA 1AMFA 5IAIA 3MVXA 2RINA 3G3KA 1MQGA 4KCCA 4QFOA 2DXRA 3M8UA 2VGQA 1M5CA 4XKRA 4PETA 1USYE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O84X 4NF8B 1NV6A 3MUQA 5IGAA 1P1QA 1QJMA 2YPNA 3WAEA 3OSQA 5AA2D 1BLFA 2A5SA 3S2VA 3H03A 2F78A 3RNNA 2B65A 1YPNA 2ZZWA 3SEWA 2FHYA 4OHNA 4AS5A 1OQGA 2FBPA 3IOTA 2ESNA 4KR5A 2F3DA 1H45A 2HZLA 1MPBA 1POY1 3SESA 5AA4B 2CZIA 3FXRA 4XKNA 4I3YA 1MY2A 1L5TA 3MP6A 4R75A 4PE5B 3IJXB 1MQHA 3S9LC 2DVZA 3O6GA 4RA1A 5TP9A 1FBPA 4DLDA 4N8GA 4EF2A 3FJGA 4PGPA 1TXFA 1VSOA 1G0IA 2QS3A 1LBZA 2HZKA 2DSFA 4WEDA 3S9NC 1XOCA 4NF5A 3KN3A 4QXDA 3DP8A 4N6PA 1PDAA 4YB6A 4KYEA 3EHUA 4MFIA 1DCUA 5LOMA 2AL5A 3I3VA 2XXRA 4P1LA 1TWYA 3H3GA 4GRKA 4R2FA 3LSLA 1B6HA 3RT8A 1Z7ME 1I6QA 5I2KB 3TAJA 4N91A 1QKAA 3PUYE 2AL4A 1NNKA 4YKPA 3UIFA 1FQAA 3KEIA 4HE2A 1FQBA 2NOOA 4GBWA 4Q5TA 2D3IA 1B5IA 4H1XA 2X7PA 3OMBA 1B0LA 1ZJLA 4I3EA 2ZNUA 3PU5A 4DIGA 3A3CA 5IKBA 3VXBA 2OK2A 3PMXA 3CI8A 5AA2A 1FTJA 4RK2A 3MSTA 3T1BA 4NN3A 4F2OA 4OQOA 2H25A 1LBXA 5H8QA 4QSDA 2RC7A 4R74A 2KLFA 3B6TA 3V8XB 3K6UA 2F34A 1J1NA 2Y7IA 1CNQA 3MBPA 2Z22A 3R6UA 2V4CA 1NUWA 3SETA 1LFIA 4N15A 2WBBA 1I69A 4P3LA 4I1DA 1B3LA 3R26A 4NF4A 2H4IA 3C33A 1LFGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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