1EZOA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
total genus 57
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA01
3VV5A 4R72A 2UVJA 1FQCA 2Z23A 1CE2A 1B4HA 1N76A 3LC8A 1JW4A 3FZVA 1NH8A 3PUYE 3OSRA 5AA2B 3QYTA 4NF6B 3G3KA 2QMWA 3RLFE 4F19A 4JWOA 5TU0A 5AA4B 1B46A 2FA7A 3E13X 2XXTA 4NF4A 5F7VA 1B0LA 3IO6A 3FJ7A 3Q26A 1D4NA 3GBBA 5I84A 2GRVA 3OO6A 4F39A 2O68A 1MDP1 2DYXA 2I4BA 3U8QA 3T93B 3HN0A 1OVTA 2H5YA 4R74A 4KFQA 2XXQA 1I6AA 3TZAA 3TTNA 3JV9A 3MPKA 1L5TA 5EHMA 1GVCA 5BUUA 3KBRA 1M5FA 5KDTB 4LZ7A 1D9VA 5IAIA 3R7XA 1MM6A 3FATA 4G68A 1NH7A 4TQUQ 1NNPA 4F29A 3MVWA 4NTLA 4M4GA 3DLNA 3K1NA 4XKRA 4ZE8A 3CI8A 2Y84A 4H6DA 2R6GE 4EQ9A 4E0WA 3RY3A 4KQPA 4PE5B 3ECRA 3PPOA 5DT6A 4NF8A 2NOOA 1B3EA 2XXVA 2DS9A 4TLLB 3S9MC 4OERA 4QSDA 3M8UA 5B7DA 1QVSA 4THIA 3FUZA 4F1VA 1Q35A 1Y1ZA 3U72A 4KR5A 4R2BA 1IEJA 3OEKA 1PEBA 3LUYA 1QW0A 3KGCA 1SYIA 3ZKKA 4LVQA 4OESA 3CR9A 4OHNA 4YKIA 3F11A 2OBGA 5I57B 3BBRA 4BDMA 2F6GA 4OETA 1MY4A 3GLBA 3USDA 2PBWA 1TWYA 1H76A 3S9NC 3PMXA 3SEWA 4IB2A 4JB7A 4EDPA 2P1SA 1OMPA 3TODA 3H6WA 1AMFA 4G77A 3SDFA 5I2NA 1MS7A 1EZOA 1POTA 3K00A 1S7YA 5CMKA 4OQOA 4X48A 4Q5TA 1MY1A 1EZ9A 4R2FA 1VFDA 4PFYA 1AH5A 2Y7KA 3E4RA 1N3WA 1LAFE 1FCKA 2GH9A 2WKYA 2I48A 2W7YA 1LBCA 1JVXA 1B52A 3FJGA 4YU0A 1IUDA 3B7DA 3KOSA 1PB7A 3EF7A 5H8SA 4HW8A 3QXMA 3TKDA 3K1PA 1T0KA 2Y7IA 1MM7A 3T9UA 4YB5A 3OO9A 2PX1A 4RPNA 3H03A 4U1ZA 4DDDA 3MW0A 3CVGA 4POXA 1LCTA 1MQDA 3M3FA 1QUJA 4G8MA 3TAJA 1RKMA 4ZEDA 3IX1A 2I49A 1A8FA 1S50A 3MVYA 1B7HA 1FTKA 2XXUA 3VXBA 1AL3A 1NMUA 1OLCA 3FD3A 4Q0CA 2RCAA 5AE4A 1XS5A 4IGRA 1URSA 3RT8A 1ZTYA 1FTLA 4IO5A 1VSOA 3RTFB 4PETA 3S4UA 1B1HA 3T9HB 2VHAA 3FVKA 2M8CA 4U1OA 2Q89A 4OEUA 3C4MA 4F1YA 4U2RA 2V3UA 2O51A 2I0CA 4BDOA 2AYSA 1B7ZA 3KSJA 1Z7ME 3QIMA 3S2VA 1TFDA 1F9BA 4JWYA 3C32A 1MH3A 3TYHA 1UTBB 3CFLA 5DTBA 2O1MA 3VLVA 3UN6A 4LUBA 3P7IA 5ICTA 3V8XB 1I69A 1A7LA 4BDNA 3TELA 2UXAA 1P1OA 3LR1A 2YPNA 1N04A 3HSTA 1SI0A 1R9LA 4X1BA 2QS1A 1R1NA 3JYRA 2FNCA 2YLNA 3MBPA 3PU5A 1LAHE 4GD5A 1FQEA 2DXYA 2XXXA 4ZE9A 3PPPA 4U4SA 4RYAA 4ISUA 4I8CA 2UVHA 1RYXA 2ZYNA 3OMBA 2H25A 4G8HA 1GTKA 3MP8A 4TLMB 5I59A 4F18A 3OELA 1LFHA 3TCGA 4IY6A 3VFJA 3MC2A 3H6TA 3PD9A 4YMAA 1DPPA 5H8HA 1JW5A 2Q2AA 4ZDMA 2F36A 2R71A 4GL8A 2O6AA 4H0WA 4ZZAA 2B3BA 1B3LA 2XXRA 4F2OA 2I4CA 4XKNA 3CG3A 4YB6A 2OJTA 1GR2A 1P1UA 2ZXTA 2F8DA 2ONSA 2X26A 4H8IA 5L9OA 1MDQA 5DEXB 5FHOA 5FHNA 3FIRA 2E1SA 4EXKA 2F5XA 2IA4A 3S9LC 2HEUA 3O9PA 3OSQA 4DXCA 3UGWA 2A5TB 4FEDA 4L17A 2DWHA 2ANJA 3VLUA 3TEPA 1B6HA 2VGQA 2ZMBA 1JETA 1PBQA 3KFMA 2Z22A 4KYDA 2RINA 1ANFA 2XHDA 4DXUA 4MLQA 3I3VA 1MY3A 2CZLA 1LB8A 1SW5A 4F3BA 4MFIA 4F3PA 2O69A 1SVXB 4RXLA 4YZZA 2V93A 4GWOA 4Q30B 1XC1A 5CMBA 4YICA 3G3IA 2NXOA 3K0VA 1B9JA 1LAXA 3GXAA 1SQYA 4OMBA 4YAHX 4R6KA 4QFNA 3JZJA 1VE4A 3RUMA 2OCUA 1P1NA 4P0GA 2GFEA 1R6ZA 2KLFA 1O7TA 5FTHA 1YAEA 3K4UA 3VXCA 1UQWA 1H3DA 2XXHA 4QFPA 5H8FA 4O3CA 2YJPA 1A55A 1MY2A 5EYFA 4H67A 4YMBA 4FIMA 1URGA 5I2KA 2V25A 1EH3A 3QK6A 5JTYB 3V89B 1D3KA 3FGSA 1A8EA 1BLFA 5HPQA 1XVYA 2XX9A 3IK6B 4BDRA 2DE4A 1IQ7A 4G68B 2QL3A 1IZ1A 1BIYA 4FAJA 3KN3A 5L9SA 3LSLA 4KCDA 3RT6B 4MLVA 2VD3A 3K6VA 4OFLA 2I58A 2PMSA 3MUQA 5K2YA 4RNSA 2ONKE 4NF8B 4R75A 4XKPA 4LZ5A 4G8NA 3SEYA 4EXLA 4I62A 1JVYA 5ICQA 2RF1A 5I58A 1PBPA 5CC2A 4BDQA 5A5XB 3TMGA 4R6YA 4IGTA 2H99A 1ZIUA 1UTHA 2QRYA 3EHTA 5L9MA 1IITA 1B2HA 3C9HA 4ZEKA 3W15C 4NF6A 3GBAA 2ZNUA 5I56B 2F7BA 1B4ZA 5AA4A 3T22A 2F78A 1B51A 2H98A 3QUFA 2I3VA 4RK2A 1POY1 5CRYA 3KZGA 3A3UA 3C35A 3V5AA 1H45A 1B1XA 3K6WA 1P1QA 3DP4A 2ZNSA 3I5OA 3MQ9A 1R9QA 1DOTA 1II5A 2O7UA 1A40A 3SETA 4NF5A 3O28A 4H5FA 1IXHA 2XXIA 3QUJA 4NEDA 1LCFA 5AA3A 2LAOA 4GLIA 4YB7A 2PVUA 2QS2A 2Q9TA 1XOCA 2RC7A 3BFTA 1Y9UA 3HV1A 1PDAA 3KG2A 2AL5A 4KPTA 4JSDA 1Y1MA 4LATA 2RC9A 3OO8A 1EU8A 3N6TA 1H43A 3M3KA 3E9XA 1CB6A 1FW0A 5H8NA 2HZKA 1KWHA 1AOVA 3K2DA 1SW2A 4Q8RA 1DTZA 1MPCA 4GL0A 4C1UA 2UVIA 2DWIA 2DSFA 4LQ2A 1QUIA 5ELVA 5M2VA 3G3GA 2QSXA 3E3KA 4YKKA 3UK4A 5I57A 2XX8A 1PB8A 2HQ0A 2DVCA 3O6GA 4IO2A 2XD3A 1Y4TA 2D3IA 4FEBA 3TCHA 4LP2B 4DXBA 4H1XA 3HO7A 2DE3A 3BKIB 3FV2A 1B05A 2Q2CA 4LA9A 4QFKA 5DVJA 3RQTA 4LQ5A 1MG1A 2ONRA 2G29A 3U93A 5HBCA 4H8JA 5CBSA 1US4A 4M1VA 3O2AA 3KJTA 1SI1A 5BWJA 3M3LA 5ITPA 4K3FA 2GHAA 1LSTA 1H44A 4HS7A 4G2ZA 1DSNA 3VLWA 2RC8A 1M5BA 3GZGA 2ZNTA 3A09A 2GHBA 2ZYMA 4F1UA 3KJ7A 4QFLA 3TTKA 3RPWA 2HAUA 3CG1A 1B7UA 2NWJA 1A99A 3N94A 4XTCQ 3MWBA 3LSWA 1LFIA 3Q25A 3SEXA 5I59B 2HCAA 4ND9A 2O7IA 4PP0A 4ESWA 1Y3PA 5H8HB 1HSEA 4OTEA 4GRKA 1URDA 3TUSA 4C1TA 2UVGA 2ABHA 2DVZA 1IXIA 1MXXA 4PFTA 1VFEA 3PPRA 3S9EA 1N7WA 4KHZE 3W9VA 3HHFA 3TPAA 4LONB 3ZS6A 3IOWA 1FTJA 3SEUA 4AB5A 1LBBA 1LAGE 2G93A 3LBSA 3QSLA 4XIGQ 1B3FA 4ZEBA 2H4IA 3G3HA 3UA8A 4EF1A 3H3GA 5KCJB 1I6QA 4P0IA 4ELPA 3IAZA 3O6HA 1UTBA 1HSLA 2OK2A 2I0BA 3WAEA 3C33A 4F2QA 4YKPA 1MXZA 5H8QB 3ILUB 3UP9A 1USYH 4JBZA 2D21A 3R26A 4H5GA 4F31B 1LFGA 4WXJA 4RJZA 2O84X 4G4PA 4BDLA 1ZKBA 4U4XA 2DP8A 2P2AA 4QSCA 5TPAA 2I6EA 2ZYKA 1YTVA 4DCYA 5FTIA 4JXIA 3RNNA 2OLBA 4KYEA 1VR5A 3A3CA 3K01A 1MPDA 1SW4A 2Z8FA 3DP6A 2OZZA 1WVJA 2F35A 2THIA 3O66A 1MQJA 4EQBA 1BKAA 4NE4A 3IOTA 1ZU0A 5ISUA 1OVBA 1UIVA 2RCBA 3LSXA 2REGA 3V83A 5I2KB 3ODBA 4LZ8A 2H9BA 1B40A 1O64A 1IXGA 4EUOA 3T66A 4GIZA 3CSGA 1M5EA 2Q8JA 2A5SA 3L6GA 3PV0E 4H65A 2QMXA 3OXNA 4GFRA 4DIGA 1N3XA 2F7CA 4QRZA 1IIWA 4DLDA 1DTGA 1FQBA 2X7QA 4KD5A 4OEVA 2V84A 3G3JA 2REJA 1MH4A 3UORA 3PUWE 4NF4B 4FECA 1QULA 2Z8EA 4RY1A 4E0XA 4PQJA 3OOAA 3IR1A 3T9XB 1FTOA 3KSXA 3PUXE 3L6HA 3G7WA 4RK9A 1OIBA 4ESXA 2A5TA 3FJMA 3CRBA 3PUZE 1MPBA 4OYVA 1XT8A 2DE2A 4U22A 4QF9A 1WODA 1NFTA 2IEEA 1DPEA 3PMWA 4ZS9A 4GOTA 5KZTA 1ZJLA 4UACA 2ESNA 1EZPA 3MZ9A 1UTHB 1NNFA 2QJEA 3FVNA 4ZEFA 3Q28A 2PT1A 3H06B 3H4ZA 3OO7A 4YKJA 3Q27A 2UYFA 4JDFA 1USYE 3IOVA 4QFOA 1ZBMA 3T9VA 4OFJA 4JWXA 3C34A 3RTWB 5TP9A 4XKQA 4GXAA 3VDFA 1FQAA 3ONMA 1N7XA 2XXYA 4F3GA 3HHGA 2DOJA 3O6IA 3K6XA 4AQ4A 1B0HA 1ELJA 4R6HA 2F97A 4OENA 4QHQA 5JTYA 1BP5A 4IO6A 3MZBA 3TCFA 4NF5B 1GGGA 1PC3A 4N07A 2OWTA 4PFWA 5AA2A 5CMCA 1FQDA 3DP8A 2P0SA 3OENA 5LOMA 2V3QA 4DCXA 1XHYA 2I3WA 3O97A 5ITOA 1Z7NE 2Y7PA 4GQOA 2NVUB 1JQFA 2Y7WA 2DWAA 4GVOA 4POWA 4O3BA 3MAMA 3C31A 5HM4B 5I2NB 4WEDA 5CM6A 4IO7A 4FE8A 5EHSA 3MVZA 1NNKA 1SD3A 2DWJA 3HPIA 3IB0A 4DZ1A 5H8NB 3WAFA 1MRPA 5CMMA 1ZLQA 5DVFA 5KDTA 3LSFB 3PMVA 1MQHA 4OFOA 1US5A 5A5XA 3K02A 4WEPA 3FASA 4IO3A 5F1QA 1NL5A 5AA1A 1UIUA 2CMOA 1DMBA 1N0TA 3RN8A 5I56A 3N26A 2B3FA 5JK4A 1TT1A 3PPQA 4IO4A 3FVGA 1MQIA 2AIXA 4UA8A 1JEUA 3D4CA 4XXUA 4R73A 4QSEA 5B70A 4Z0IA 4X1DA 1SBPA 5CI5A 2QS4A 4P11A 4FORA 2F7AA 1XVXA 3FXQA 1Y3NA 1LB9A 4NMYA 3DELB 3AXFA 1MXYA 1AIVA 3FXUA 3B6TA 4FJPA 3H6VA 4EF2A 4KYSA 1MY0A 1MXVA 4HCWA 3U1OA 4R9GA 4MBPA 3TQLA 1PB9A 1RYOA 1SDXA 4I1DA 4ECFA 2VD2A 3MP6A 1I6BA 3D4GA 3FXRA 2X7PA 3VVFA 3ZSFA 3U94A 4N13A 3T96B 4IY5A 3DM0A 2QS3A 4N6PA 4RPOA 4HCYA 2XX7A 1A54A 1TXFA 3FV1A 4ZEIA 1FTMA 3KEIA 4ELQA 1NKXA 4KI0E 5AA2D 3U92A 4OXVA 4MH5A 1HSJA 2O1LA 2D5WA 4ELOA 3EN3A 1B3HA 3KN8A 1WDNA 5K2XA 4RA1A 3IJXB 1ZMGA 1LLSA 3VE1B 2PYYA 2ZYOA 3TFLA 1P1WA 4BLAA 3ILTB 3IJOB 2FYIA 3B6WA 4ELRA 1N84A 3CFXA 1JW1A 2F6PA 4FATA 1P99A 5DVIA 3OEMA 3IO4A 4OVJA 1IXCA 1SW1A 2B65A 2Y7RA 3EHUA 4KCCA 4Z7EA 3KN7A 5JEIA 1Q1KA 1QKBA 3H6UA 3MP1A 4NWDA 4F3SA 3N5LA 4G68C 3B6QA 4F22A 3Q29A 3FVOA 3TDJA 2XXWA 3K6UA 3UIFA 3PUVE 4GXSB 4ZECA 1B58A 3N6UA 2BJJX 1ATGA 4U23A 3PGFA 2Q88A 4U21A 1B5IA 3O29A 3PD8A 1OLAA 5TPAB 2HFBA 4OZ9A 2E0SA 2V3TA 1MXWA 1JEVA 2HXWA 2HAVA 3MPLA 1B5HA 3CIJA 1B32A 2DXRA 2AL4A 2DQVA 1MQGA 1B5JA 2NUVA 3TTLA 1OQHA 3OD7A 5IKBA 4C0RA 1QJMA 3BFUA 2ALUA 3I6VA 3VVEA 1D9YA 2QPQA 2R9JA 2XD2A 4EQ7A 3IL1B 3IB2A 4JSOA 1QKAA 1Y4CA 1YCJA 3SEVA 2VOZA 3EQ1A 3R6UA 1M5CA 1GV8A 2Z8DA 3ZKLA 4WKMA 2VP1A 2HZLA 3W9WA 3TTMA 1M5DA 4MF3A 1O63A 3CFZA 3K1MA 4O3AA 5H8FB 4X9TA 4AB6A 1OQGA 3H7MA 4HTGA 3IB1A 2RKMA 1S9TA 2F34A 1TFAA 1LGBC 5KCJA 3EPEA 3HCQA 3IORA 3MVXA 1FQFA 3SKPA 5FHMA 3QAXA 1BTJA 1JNFA 4R9FA 4NWCA 5H8QA 2PT2A 1NNTA 2UYEA 4OWDA 3SESA 3CSBA 4I9DA 4TOZA 1QUKA 5J1DA 1SYHA 4PFUA 3THIA 3VVDA 1MXUA 3PPNA 3TTRA 5CBRA 3EHSA 5DEXA 1Y3QA 3KOTA 4GF8A 2OWSA 4DE8A 4ONYA 1YPNA 3G3FA 1B3GA 4ZZEA 3MJNA 5TP9B 3RGYA 1Y20A 1J1NA 2XXPA 3IOUA 3SERA 3TQWA 5L8DA 3MZ1A 5DYHA 5I58B 3C36A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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