1EZOA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
total genus 57
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA01
1FQBA 5H8QB 4X48A 4DCYA 1SYHA 2ABHA 3KJTA 1MH3A 2XX8A 2Y7RA 3MWBA 1H43A 4ZEIA 1MQHA 3Q27A 3DLNA 2IA4A 4WXJA 4H0WA 1POY1 2AL4A 1BLFA 4HW8A 3GLBA 4TQUQ 3IOUA 2QS3A 4GVOA 3ZS6A 3RTFB 2ONRA 3G3IA 3HCQA 4ZEBA 4KYSA 4PQJA 3KFMA 3QYTA 5AA2A 1ZU0A 4YKIA 4PETA 2ZNTA 1LB9A 4G68B 4GLIA 3E13X 2R9JA 5AA1A 4ZEKA 4G8HA 3QXMA 2Y7WA 1S50A 3H7MA 2O7IA 3M3KA 4F3BA 3CFZA 3FGSA 3TUSA 3PU5A 4F31B 3CG1A 1ZLQA 4GRKA 5AA4A 5I57B 2PVUA 2DWAA 3T96B 1N3XA 5HBCA 3MPLA 5IKBA 5CBRA 4EDPA 3HPIA 3O9PA 1JETA 3O2AA 1MM7A 3QUJA 4R73A 4GFRA 2ANJA 1B52A 3IB0A 2B3FA 3H3GA 1N7XA 4PFWA 3H6UA 4IO7A 2ZYMA 3CR9A 2P0SA 1I6AA 3IR1A 1VR5A 3U93A 1IUDA 3PMVA 1P1QA 4N6PA 3PPQA 3DP6A 3TCFA 4F1YA 3SKPA 1NNTA 5FHNA 3W9WA 4U4SA 3FUZA 4WEPA 4TLMB 1A54A 4I8CA 1B0LA 1HSEA 2GRVA 2V93A 2ZYKA 5DT6A 2Q2CA 3EHTA 3MZ1A 4OHNA 1Q1KA 1A99A 4OVJA 1M5DA 1GGGA 4P0GA 3CVGA 5I57A 3B6WA 1ZIUA 4NF4B 3B6TA 2I4BA 3KBRA 2GH9A 1UTHA 4DZ1A 2F78A 3IJXB 5DTBA 1R1NA 2PX1A 3PPNA 3FD3A 1AOVA 1SI0A 1LFGA 4BDRA 2VP1A 1EZOA 5EHMA 3G3GA 2UYFA 4P0IA 3TQWA 3EHSA 2CZLA 2HFBA 3TAJA 3S9NC 2I3VA 4LZ7A 1SQYA 4EQBA 2QL3A 3Q26A 1LAGE 3F11A 5KDTB 1QUKA 4ZEFA 4E0WA 2DE4A 5KCJB 4ELPA 2QMXA 4GXAA 1B9JA 1OQGA 3FVNA 1URDA 3U8QA 2HZKA 3GBBA 1SVXB 3L6GA 1TXFA 4I9DA 1B3HA 3CSBA 4ZEDA 3CSGA 4HCYA 1PBQA 1LGBC 3JYRA 1US4A 4JB7A 4QFLA 4NF8B 1H44A 3DELB 4NF4A 2ZNUA 2V84A 3IB1A 4FATA 3FXQA 2Z8EA 3RGYA 3SDFA 3MVZA 4Q5TA 3KOTA 4GXSB 1ZMGA 4BDLA 1II5A 2UXAA 3B7DA 1UTBB 3GZGA 2PT2A 5B70A 4KCDA 2H4IA 1QKBA 4WKMA 1B0HA 3PPPA 5H8NB 1LAXA 2W7YA 2Z8DA 2ZXTA 4F18A 4QF9A 3LSLA 2ZMBA 5K2YA 4ZDMA 3UK4A 5FTHA 1B5IA 4L17A 1D4NA 3TYHA 2O7UA 3HHFA 3K00A 4QSCA 5J1DA 1PB8A 5KCJA 2I49A 1HSJA 4ISUA 4YB5A 1NL5A 3SEWA 1D9VA 5AA3A 5CRYA 5KZTA 5L9OA 3IAZA 3O6GA 3VLVA 3UORA 2DWJA 3M3LA 4NF8A 4H8IA 3MUQA 1TFDA 3KSJA 3RLFE 1Y20A 3CIJA 1B7UA 2Y7PA 2O6AA 1QVSA 4XKNA 3RUMA 3PGFA 2YJPA 1R9LA 4IO4A 1UTBA 1NKXA 1FQEA 2NUVA 3UN6A 5H8NA 3SEXA 4ESXA 2XXXA 2H98A 3EN3A 3H03A 2V25A 3V89B 1SW4A 2FYIA 2XD3A 3OSQA 1B05A 3ECRA 3RT6B 2XXYA 3FJGA 4XTCQ 4F1UA 2X7QA 4IY6A 1Y1ZA 4G4PA 3VVFA 1N76A 3FJ7A 1QKAA 4RPNA 1EU8A 1VFDA 4LQ5A 2VD3A 1B40A 2RF1A 1A8EA 2FA7A 3Q25A 4RJZA 1Y3PA 4R6KA 1MY0A 4YU0A 3TMGA 1PEBA 2Q88A 2Q9TA 2PMSA 2QS2A 5CMMA 4F1VA 5L9MA 2I4CA 1SBPA 3PPRA 3OENA 2XXPA 2QRYA 4F3GA 2V3QA 1LFIA 2NWJA 3U1OA 4F3SA 4X1DA 4Q30B 1LBBA 3OEMA 1DSNA 3H6VA 2HZLA 5DVJA 1WDNA 2QSXA 5AE4A 5AA2B 1MDP1 3PUWE 4ZE8A 1DPEA 4MH5A 3RNNA 3HO7A 3IX1A 3FATA 3KG2A 1VSOA 4E0XA 3PD8A 1B5JA 2D21A 3C4MA 3TTRA 2DVCA 4NF6B 3MP8A 3K6UA 4MLVA 1OIBA 2O84X 1DOTA 3PV0E 1XC1A 1MQGA 5EHSA 3TTLA 3N5LA 4H5GA 3S4UA 4DDDA 1URGA 3MVYA 5TP9A 3IOWA 4YB6A 3V5AA 4YMBA 2NVUB 3R7XA 4LUBA 1P1UA 1TWYA 3OO8A 2XXTA 1LAFE 1YTVA 3SESA 3H6WA 2VOZA 2XXIA 4M1VA 2H25A 1LB8A 4EXLA 1EZ9A 2PBWA 3K1MA 5DVFA 1BIYA 2OBGA 3TCGA 3BFUA 5L9SA 1OLAA 2E1SA 2Z8FA 3G3FA 5CMKA 1DMBA 3K4UA 2HAUA 3PPOA 3A3CA 3G3JA 1MXVA 4FIMA 1LBCA 2DE3A 5CI5A 2REGA 1P1OA 3C32A 1CE2A 1UIVA 2I0CA 3CRBA 4NF6A 4LZ8A 4F39A 2XXHA 1NNFA 4C1UA 3EQ1A 3TCHA 1Y3QA 2X26A 4YAHX 1B1HA 4UA8A 1FTLA 3VV5A 5ELVA 5B7DA 2AIXA 2DWIA 4HCWA 1MY1A 4DE8A 1UTHB 4ZECA 4NWDA 3UA8A 3U72A 4QFKA 1MPBA 3H06B 1XVXA 2I48A 2RC7A 1SW1A 5TPAB 1IITA 4OZ9A 3V83A 1OLCA 1RKMA 4BDMA 1B6HA 1XVYA 3K6WA 3MP6A 3SERA 3UIFA 2X7PA 3MPKA 5L8DA 3MBPA 3T66A 4OQOA 4R74A 4U2RA 1B32A 1FQFA 3MC2A 4OWDA 4EQ9A 1N0TA 2FNCA 3HV1A 3W9VA 3LR1A 2D3IA 1ZJLA 4ELOA 4NWCA 1SI1A 1I6BA 3B6QA 3KN8A 4Q8RA 2D5WA 2DVZA 1GTKA 4C0RA 2XHDA 2OZZA 2GHBA 3V8XB 4DXUA 2NXOA 4RPOA 3N6TA 4AB5A 2O68A 3GXAA 1GV8A 1B3GA 1WVJA 1NH7A 2F6GA 2QS4A 4RA1A 1H76A 1IXHA 4F29A 4IY5A 3TQLA 3KZGA 3CFLA 2DXRA 4FEBA 1JQFA 2GFEA 5K2XA 1JEUA 1PB9A 2UVGA 5TPAA 2ONKE 2Z23A 3LSXA 5CBSA 3ILUB 3IOTA 4R2FA 4DXBA 4NTLA 2RC9A 1AIVA 4X9TA 3BFTA 3C31A 2PYYA 2I6EA 1LCTA 4KR5A 1B5HA 3KSXA 3VLWA 4YMAA 1IQ7A 4OETA 2A5TB 1SD3A 3LBSA 3OXNA 1JEVA 5AA2D 2I58A 1XHYA 2ZYNA 3H4ZA 4O3BA 4FEDA 5I58B 1AH5A 1N04A 3Q29A 1NNKA 3IK6B 2AYSA 2I0BA 4UACA 3AXFA 1IZ1A 3MJNA 5ITPA 3R6UA 1QUJA 1ZBMA 2Q2AA 2Y84A 5CMCA 5HM4B 3OO6A 1D3KA 4EF2A 3IJOB 3THIA 1B2HA 3KEIA 4JWYA 4OYVA 3ILTB 2DSFA 4FAJA 3VXCA 2V3UA 1RYOA 2QJEA 3VFJA 5HPQA 5I56B 3N94A 2OJTA 1LAHE 4I1DA 1NNPA 4POXA 3KN3A 4F2OA 4PFUA 4KPTA 1PC3A 1F9BA 2UVIA 3PUZE 2UVHA 2HEUA 5LOMA 3RT8A 3PMXA 4RXLA 4IO6A 4KFQA 3TFLA 1EH3A 1QJMA 4OMBA 3LUYA 3I6VA 2A5TA 2GHAA 1LCFA 2H5YA 3TTNA 1UQWA 3SEYA 3OMBA 3FZVA 5I58A 2VGQA 3CFXA 1LFHA 3P7IA 2O69A 4JDFA 1S7YA 2HCAA 1XS5A 2IEEA 3CI8A 1LLSA 3O97A 4QHQA 4EQ7A 1B4ZA 2BJJX 4YKJA 1FCKA 1YAEA 4YB7A 3VDFA 1IXIA 3U94A 4H8JA 1YPNA 1JVYA 3G3HA 1JVXA 2HAVA 4DLDA 4RNSA 4H65A 2THIA 3S9EA 4ELRA 3IO6A 1S9TA 1R9QA 3MVXA 4OFOA 1JW1A 1J1NA 5H8SA 4FORA 4MLQA 1Y3NA 2WKYA 5I56A 1A8FA 1Y4CA 1BTJA 4O3AA 4H5FA 3UP9A 1B7ZA 1GVCA 3S9MC 2F7AA 5DEXA 2PT1A 2XXWA 5TP9B 1B3EA 1BKAA 4YKPA 3TEPA 2F8DA 4THIA 3DP4A 3RQTA 4Z7EA 2R71A 4Q0CA 4DXCA 1B46A 4U1OA 4U1ZA 1MXUA 3D4GA 1MS7A 1JW5A 4OEVA 2P2AA 3T9XB 1MDQA 4U22A 1FQAA 4QFPA 5F1QA 2O1LA 4R9FA 4IO5A 2ONSA 2DWHA 1MG1A 1P99A 1P1WA 1Z7NE 1USYH 2OWTA 3A3UA 3OO7A 3VVEA 1M5BA 1MPDA 5IAIA 4HTGA 1O63A 1VFEA 3A09A 3MW0A 3W15C 1MQIA 2O1MA 4JWXA 4I62A 5I59A 4JXIA 2AL5A 5H8HB 3U92A 1MRPA 2OWSA 4ZE9A 3T22A 2XXQA 2ZYOA 1TT1A 4RK9A 2P1SA 3C34A 2RINA 1SW2A 4G77A 4JSDA 4DCXA 1KWHA 2DYXA 5TU0A 4IB2A 1Y4TA 2RCAA 5DYHA 3ZKKA 1DTZA 1MY2A 1OVBA 2NOOA 2YPNA 1UIUA 3JZJA 2G93A 4FJPA 2F97A 5I2NB 3IORA 3K0VA 1XT8A 1MQDA 2DQVA 2ZNSA 5ICTA 1B4HA 3M8UA 3RN8A 3T93B 1QW0A 4K3FA 4GQOA 1M5FA 4KD5A 4FECA 2XXRA 4KYDA 1Y9UA 4BDQA 1VE4A 4QSEA 4BDOA 4C1TA 2F7CA 3PD9A 3ZKLA 4G68C 3IOVA 4PFTA 4YKKA 3E4RA 3D4CA 2A5SA 2DE2A 5JEIA 1MY3A 4LQ2A 1M5EA 4NE4A 1USYE 5H8HA 1P1NA 2F36A 4R2BA 4EUOA 1A40A 1NH8A 5CC2A 4GIZA 2RCBA 3MVWA 1OMPA 4NF5A 4AQ4A 3QK6A 5A5XB 3KGCA 3SETA 3C36A 4U23A 3VVDA 5JK4A 1Q35A 5H8QA 1ANFA 1MH4A 1N84A 3TTMA 5I2NA 4O3CA 4NEDA 3T9UA 1OVTA 2REJA 2F5XA 3KN7A 4OFLA 4IO3A 2UVJA 1ZKBA 2F34A 4KHZE 3S2VA 3IL1B 4R9GA 5EYFA 2OLBA 1A7LA 4ZZAA 3S9LC 4R6HA 4POWA 4G8MA 4ZS9A 4QFOA 3DM0A 1FTJA 3RY3A 4EXKA 1IEJA 2G29A 1MY4A 4KYEA 5BUUA 2OCUA 4XKQA 2VHAA 1POTA 3T9VA 2F6PA 1D9YA 4EF1A 3O28A 4JWOA 4G68A 1B51A 2VD2A 1WODA 4OEUA 4MF3A 3RTWB 2QPQA 2Y7IA 4JBZA 2OK2A 4XKPA 3C33A 4FE8A 3R26A 4N13A 3TPAA 5A5XA 3PUXE 3GBAA 1SYIA 2XX7A 1LSTA 3HN0A 1MXXA 4BLAA 2M8CA 3UGWA 5BWJA 2XXVA 3N6UA 4KI0E 1JW4A 1BP5A 3BKIB 4GOTA 2QMWA 4OFJA 3FVKA 1A55A 3K02A 3WAEA 2UYEA 4QFNA 3FIRA 1AMFA 2XXUA 4NMYA 3K01A 5H8FB 3MZBA 1HSLA 1RYXA 3BBRA 1PDAA 1MM6A 4PFYA 4F19A 1O7TA 2F35A 4GF8A 2HQ0A 3MQ9A 4G2ZA 1OQHA 3KOSA 4ECFA 4R6YA 2H99A 4LATA 2HXWA 4ND9A 1MPCA 5CM6A 2Z22A 3O66A 3Q28A 4TLLB 4H67A 3K6XA 5FHMA 3FXUA 3G7WA 3K2DA 4AB6A 3E9XA 3QUFA 3EF7A 1IXGA 4YZZA 1FQCA 1ZTYA 1CB6A 1FW0A 3TKDA 2ESNA 3OO9A 2LAOA 3C9HA 1AL3A 4YICA 3JV9A 4G8NA 3LC8A 2XD2A 2XX9A 4OTEA 3FJMA 4OESA 4WEDA 4ZZEA 4GL8A 2Q8JA 3WAFA 5H8FA 4GWOA 1B3LA 1JNFA 2I3WA 3OSRA 2F7BA 1PBPA 3HHGA 1ELJA 1I6QA 3K6VA 5FTIA 4BDNA 1QULA 4H6DA 5DEXB 4LZ5A 3VLUA 4MFIA 2DP8A 1FQDA 1FTKA 4U4XA 3O6IA 5KDTA 1TFAA 3LSWA 3O6HA 3H6TA 3G3KA 4ONYA 3TTKA 4KQPA 3OELA 2ALUA 4N07A 3K1PA 1N3WA 3I5OA 3TELA 4P11A 3TZAA 5I2KB 1URSA 1B1XA 3EPEA 1XOCA 2RC8A 3QAXA 4LP2B 3MZ9A 4DIGA 4M4GA 5DVIA 3LSFB 4RK2A 4OERA 3E3KA 1H45A 4JSOA 4ESWA 3I3VA 3QSLA 2Y7KA 3OOAA 4R75A 5FHOA 5ICQA 3SEUA 3C35A 3OEKA 1DTGA 2H9BA 5JTYB 3QIMA 4PE5B 4IGTA 3MAMA 1GR2A 3VE1B 1EZPA 4LVQA 4TOZA 4F2QA 2CMOA 1FTMA 1FTOA 1IIWA 4GL0A 5I59B 2KLFA 1NFTA 3OD7A 5I84A 2YLNA 5ITOA 4F3PA 3PMWA 3FVOA 4QSDA 4KCCA 4XIGQ 3CG3A 1US5A 2RKMA 3MP1A 3HSTA 1NMUA 3M3FA 1M5CA 4ELQA 3FVGA 2O51A 2B65A 1I69A 4F22A 1ATGA 1O64A 3N26A 5I2KA 1MXWA 3FXRA 4PP0A 1IXCA 1SDXA 3K1NA 2V3TA 3ONMA 4Z0IA 2B3BA 1Y1MA 4XKRA 2DXYA 3IB2A 1L5TA 3KJ7A 4H1XA 1B7HA 1YCJA 3SEVA 3EHUA 3IO4A 3RPWA 5M2VA 4XXUA 3VXBA 2QS1A 4LA9A 3ZSFA 3USDA 4IGRA 4OXVA 4RY1A 5JTYA 3FV1A 2E0SA 2DS9A 1SW5A 3FASA 4OENA 5F7VA 1H3DA 1QUIA 4U21A 5ISUA 3PUYE 4QRZA 4X1BA 3FV2A 3O29A 4IO2A 1PB7A 4RYAA 3TODA 1N7WA 2Q89A 4GD5A 1MQJA 3TDJA 4MBPA 1MXYA 4LONB 3T9HB 1MXZA 4R72A 1B3FA 1B58A 3PUVE 3ODBA 1DPPA 4NF5B 1R6ZA 5CMBA 2DOJA 3L6HA 5AA4B 3DP8A 1T0KA 1Z7ME 4HS7A 2R6GE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FQBA 5H8QB 4X48A 1NV6A 4DCYA 1SYHA 1VDWA 2ABHA 4MMPA 3KJTA 1MH3A 3KC1A 2XX8A 2Y7RA 3MWBA 1H43A 1YZ0A 4ZEIA 1YYZA 1MQHA 3Q27A 3DLNA 2IA4A 4WXJA 4H0WA 1POY1 2AL4A 1BLFA 4HW8A 4OVPA 3GLBA 4TQUQ 3IOUA 2QS3A 4GVOA 3ZS6A 2CZIA 3RTFB 2ONRA 3G3IA 4NGUA 3HCQA 4ZEBA 4G61A 4KYSA 4PQJA 3KFMA 3QYTA 4PF6A 5AA2A 1FPEA 2Y5KA 1ZU0A 4YKIA 4PETA 1SPIA 2ZNTA 1LB9A 4G68B 4GLIA 3E13X 2R9JA 5AA1A 4ZEKA 4G8HA 3QXMA 2R8TA 2Y7WA 1S50A 3H7MA 2O7IA 4P56A 3M3KA 1FPKA 4F3BA 3CFZA 3FGSA 3TUSA 3PU5A 4F31B 3CG1A 1ZLQA 4GRKA 5AA4A 5I57B 2PVUA 2DWAA 4NF0A 3T96B 4AS4A 3T0JA 1JP4A 1N3XA 5HBCA 3MPLA 5IKBA 4GX3A 4P47A 5CBRA 1G0HA 2HXRA 4EDPA 3HPIA 2QVRA 3O9PA 1JETA 3CHGA 3O2AA 1MM7A 3QUJA 4R73A 4GWUA 4GFRA 4GWWA 2ANJA 1B52A 3IB0A 2B3FA 3H3GA 1N7XA 3FBPA 4PFWA 3H6UA 4IO7A 2ZYMA 3CR9A 2P0SA 1I6AA 3IR1A 1VR5A 3U93A 3T1BA 1IUDA 3PMVA 1P1QA 3RYDA 1LBZA 4N6PA 3PPQA 3DP6A 3TCFA 4F1YA 2ZZVA 3SKPA 1NNTA 5FHNA 3B8BA 3W9WA 4U4SA 3FUZA 4WEPA 4TLMB 1A54A 1AWBA 1IMBA 4I8CA 1B0LA 1HSEA 2GRVA 2V93A 2ZYKA 3E78A 5DT6A 2Q2CA 3EHTA 3MZ1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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