1EZWA

Structure of coenzyme f420 dependent tetrahydromethanopterin reductase from methanopyrus kandleri
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
AEVSFGIELLPDDKPTKIAHLIKVAEDNGFEYAWICDHYNNYSYMGVLTLAAVITSKIKLGPGITNPYTRHPLITASNIATLDWISGGRAIIGMGPGDKATFDKMGLPFPCKIPIWNPEAEDEVGPATAIREVKEVIYQYLEGGPVEYEGKYVKTGTADVKARSIQGSDIPFYMGAQGPIMLKTAGEIANGVLVNASNPKDFEVAVPKIEEGAKEAGRSLDEIDVAAYTCFSIDKDEDKAIEATKIVVAFIVMGSPDVVLERHGIDTEKAEQIAEAIGKGDFGTAIGLVDEDMIEAFSIAGDPDTVVDKIEELLKAGVTQVVVGSPIGPDKEKAIELVGQEVIPHFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
publication title Structure of coenzyme F(420) dependent methylenetetrahydromethanopterin reductase from two methanogenic archaea.
pubmed doi rcsb
molecule keywords COENZYME F420-DEPENDENT N5,N10-METHYLENETETRAHYDROMETHANOPTE
total genus 128
structure length 347
sequence length 347
ec nomenclature ec 1.5.98.2: 5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase.
pdb deposition date 2000-05-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00296 Bac_luciferase Luciferase-like monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.30 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Luciferase-like domain 1ezwA00
1BRLA 5LXEA 1F07A 1XKJA 1TVLA 3FGCB 1NQKA 1RHCA 1LUCA 4UWMA 3B4YA 1BRLB 2B81A 1NFPA 1Z69A 5AECA 1EZWA 4J2PA 4US5A 1LUCB 1YW1A 3C8NA 3RAOA 1BSLA 3B9OA 3SDOA 1M41A 1FVPA 3B9NA 5DQPA 3FGCA 2I7GA 4US5D
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GVYA 3GHRA 4J40A 1L8PA 2QUVA 4KWUA 3KOFA 8XIAA 2NV1A 2X42A 5G5IA 4IMEA 4UTUA 1AQHA 3T4CA 4S3CA 4QP0A 1FCBA 1TWWA 2WNQA 3PP7A 3UPWA 4GIAA 1RLCL 5AVNA 3XIMA 3B0UX 2ZC8A 1WKFA 3VKDA 2FB2A 3W1NA 2RH9A 4QEEA 3GNOA 2C3ZA 3ONCA 2Q8XA 1W54A 3T9PA 3NSNA 1CTNA 3BG9A 4OV9A 1KM2A 5AHNA 2D1ZA 3OVPA 3GU2A 2EHHA 4O0KA 4Q6XA 4O52A 1ONXA 4PSRA 1FHVA 3ZVHB 3DKJA 4CCZA 1HKMA 4GI6A 4LCSA 3NPXA 1H7OA 1TWDA 5E0FA 3UYCA 4ZQPA 1Q6EA 2QAPA 3UR8A 1R38A 1JCJA 1F7BA 1HL8A 3KDNA 3WK0A 2OELA 3TWBA 1LLZA 4F0RA 2EPKX 1QI2A 1XICA 3PFMA 3ZSSA 4QEHA 1H7WA 3ITVA 2WSYA 1C8VA 2X7VA 1KBIA 1XL9A 4YLWA 2FTPA 1TRDA 2X0YA 2VGFA 3I3BA 1WCGA 3P0WA 4UFHA 3D3FA 4JDBA 4UZSA 2VI0A 4PMYA 3PUOA 3QY8A 3W53A 3R12A 2JK2A 1RBAA 2EG6A 4MZ1A 4TVUA 2J7FA 3BGAA 2PU1A 3GHUA 3LBOA 1J0ZA 2PGRA 1J6PA 4IGMA 2DZVA 3S4TA 4B3LA 5D30A 3GY1A 2J7GA 3AQUA 5LIWX 5BYWA 2BOFX 2YW3A 3ABOA 5C9RA 3N18A 3WQ6A 4GNKB 1DIEA 4FX8A 4L6OA 2FJKA 5I02A 4Q8MA 1F3WA 1G0CA 2A7RA 1ZS2A 3VC5A 3ITCA 3WH9A 2FZ9A 1NF0A 1TPVA 4ZQRA 1BQCA 3CNYA 4CNPA 3OODA 3O8AA 3BAKA 3K4AA 3LD5A 4UR7A 1YBQB 4W4QA 1XLDA 4AY7A 1EUNA 3EMQA 5HJLA 5EMUA 4ZR8A 5CZTA 1TWZA 4XSMA 1RUSA 3B8SA 3WJZA 4DJDC 5HA7A 1D3GA 1VGAA 1BXBA 2AL2B 2NVDA 2GWGA 1KBJA 3TFCA 3OQ8A 4L7ZA 5FL1A 3NQ2A 1XLJA 3G1YA 3B97A 3GS6A 4LUIA 1F61A 4BI6A 1BYCA 1LOLA 4JTEA 3WQWA 4LWWA 3G3DA 4IL2A 1HKIA 2A7NA 1I1WA 3O16A 4H8UA 5DFAA 3NPUA 2EG8A 4AIBA 3AUJA 1V3IA 4L61A 3LZ3A 1OFDA 5A69A 1SSDA 3H54A 1DBTA 4LF1A 2XHYA 1IWAA 4S3FA 4MYAA 4S3EA 5AHLA 4HOWA 1FDJA 3LOTA 3N19B 2ZA2A 3C0QA 4HGXA 4Y2WA 1XLBA 4MM1A 3CASA 2PTYA 4Q6JA 4A29A 1M04A 3EDDA 4L56A 4HPGA 1JQXA 3WLHA 4QJ3B 1QNOA 2HS6A 3ARUA 4NNBA 4A3QA 4E4FA 4LUTA 5CPQA 4H7CA 1O12A 4Z2IA 2GUUA 1S2VA 3CK5A 2J4GA 2E28A 5G4WA 2DPEA 4XBSA 5L9FA 2D69A 3GC2A 3R7MA 4HA4A 4IP7A 1FWJC 3W00A 4FOUA 3ZVIA 2QAFA 4C6IA 4D6EA 1UPMB 4WDTA 3GTNA 2EAWA 2PDCA 2VNCA 3GTXA 4GUHA 2QUTA 1PIIA 4NASA 5FEPA 2VENA 4QLJA 3P5ZA 1I75A 2VEIA 1F6KA 3AALA 1EZ2A 2QLYA 1PIFA 3W29A 1ZLPA 2VDGA 2F6XA 2Y61A 1VPYA 3RRXA 4AIUA 1S1RA 1WX0A 3EB3A 4NI8A 1F07A 1FFQA 3RITA 2XH7A 5LIXX 5EGRA 5AHMA 2YB4A 4IIBA 4M7SA 4AH7A 3VK5A 1W1PA 1Q8JA 4DBWA 3UT0A 3UWQA 1WP6A 3GZ3A 3V35A 4BQ4A 1B90A 1F4HA 3EX1A 3URAA 4KEZA 2E6YA 3C2FA 3VGGA 5EL1A 3WEMA 3K5XA 5A6LA 4G56A 4C6PA 5EU9A 3QOKA 4B16A 4OHQA 5A8GA 3SCOA 1JPDX 5D37A 3LMZA 1XI3A 5AY7A 2ZOXA 1Z3NA 3E0WA 4X61A 3EX6A 1EF2A 3S5ZA 3ZSTA 4H83A 2VD8A 3INPA 3ZWSA 1R2SA 1X1OA 5AYIA 4NAFA 4GI8A 1TV4A 1Y8BA 1EC8A 3TEVA 1KKOA 4UTIA 3QMSA 2EF9A 3EOUA 3ARWA 2XDFA 2G8ZA 3W1PA 4BQ2A 4ILSA 3VDCA 4O17A 5FF7A 1C9WA 4ZGYA 3G24A 2PC4A 2PDJA 3M0MA 4I8YA 1OCNA 4P8VA 1R47A 2NQLA 3V7PA 4K8GA 2BGSA 4LBRA 3JZEA 1IV8A 3NEHA 3GVGA 2YFNA 3QW3A 4KERA 3ARPA 1EO5A 2JKEA 1FBAA 4FAMA 2QKFA 3GTIA 3LRKA 2O56A 3IJLA 2V3FA 2RDWA 3TN3A 4UFIA 4JX4A 4LVFA 2H8ZA 4DXVA 2QULA 3L2MA 1R46A 2I5QA 3E5BA 3P7YA 2ZX9A 4C7GA 3OJGA 3OLDA 4LBUA 1LLWA 2BVDA 4WSKA 1A5OC 2DGAA 1GQKA 5G1MA 3O06A 2QUNA 1BWKA 3T0BA 3BURA 2A4AA 4OU1A 2NLYA 2ZVIA 2XGBA 4KBXA 2ZICA 1OGBA 4WR3A 2ZQ0A 1BYAA 2VZOA 1N82A 3N2TA 2GL5A 1VYSX 1UCWA 4J35A 2WVVB 3RLVA 3UXIA 4DJEA 2E67A 1MDLA 4IPIA 3TR2A 3WBAA 1H7NA 1E3ZA 3SRFA 1WZAA 3O0KA 3WF0A 3PBGA 3UU0A 1NAL1 2CESA 2F2HA 5ABTA 2VZVA 4XIAA 1BQGA 1TWSA 3M5ZA 4O19A 5EYWA 3RR1A 3WBWA 1SZFA 1PCWA 2E5DA 1OINA 4ZXOA 3PWIA 4PA8A 3SCQA 1B3YA 4K39A 4KFOA 3BCFA 1KV5A 4JNZA 2DH2A 2VX6A 4PTNA 1RY8A 3IEBA 4JQ3A 5HANA 3MUIA 3OHMB 1ZBCA 3SEPA 3T2OA 5H8PA 3EYPA 3KAOA 5HWJA 3NPVA 3TZNA 3PZGA 1X6NA 3ZJ8A 2L5HA 3HZ3A 4FR6A 1OX4A 1XD1A 3QYSA 4MB3A 3S42A 1EBHA 1LRNA 2V9DA 3WL0A 2W6RA 4QNEA 1CLXA 2RGLA 4L5ZA 4Z42C 4B2DD 2BB0A 3TA9A 2BZNA 7PTDA 4GIEA 2Y63A 5A1AA 1GOOA 3TSMA 4XO6A 2OO6A 3UNDA 3S2NA 2QXWA 1ISYA 4PCSA 4O15A 4CLMA 2JF7A 1YEYA 1L2QA 1VBGA 3QJAA 4Q8WA 1GW9A 3T0TA 3HGRA 4UTTA 2OOFA 1E9IA 4XD6A 2Z27A 4IXXA 4XZHA 4KS0A 1QI3A 3D3AA 3WQVA 3S8HA 3BCDA 2F61A 1WZKA 2QEZA 4WEVX 4ZB2A 3G1SA 1H7XA 5SWUA 4Y90A 1JULA 1W9PA 3RJYA 1Y0EA 1JCMP 2WPBA 2ISVA 3COTA 4EPKA 3TAOA 5K7JA 2PRMA 2V2CA 5T91A 2R1MA 3C8FA 1DEDA 5K3VA 1RALA 1XLEA 3MPGA 3L4TA 1R9XA 3VUSA 3TLLA 1M53A 2X2YA 5M2FX 3GDMA 4LUSB 1RAKA 1MZRA 3M0KA 4OBTA 4ERAA 4K38A 3SR7A 1CEOA 4GVIA 4BQ5A 2GFTA 1FH7A 4ML9A 4GUIA 4AAJA 4GQRA 3BGGA 3IVSA 2NVAA 3MHGA 5HPCA 1V02E 1EEXA 4LFYA 1XRFA 1YNQA 4GGBA 2PZ0A 1XH1A 3NZQA 2D2HA 2PCQA 2X1SA 3NEVA 1JRCA 1NWTA 2VCCA 2CKRA 1H2JA 1I2PA 2ATSA 2OSYA 4YCOA 1OQFA 4H6QA 3TQVA 2A3HA 3B8TA 3TYZA 3KP1A 2WZIA 2CPUA 1Q4NX 4J3VA 2TSYA 1QK0A 1NF7A 2XINA 1PS9A 1SJCA 4WKAA 4IF2A 2YFOA 1PZ3A 2CNCA 3R5EA 4KEVA 3DECA 1K9TA 2I5IA 3M16A 4K7VA 4C6QA 2WNNA 5CPTA 3PHAA 4R88A 1QNQA 3BE7A 4B5UA 1ISZA 2FGBA 1A5MC 3BGJA 4EXBA 4E38A 3E2QA 1V6WA 1YQ2A 1HP4A 4JR5A 3WUEA 1UH3A 1JDCA 3FDKA 1FQ0A 1K6WA 1Q45A 3IJ6A 4I6KA 5KSWA 2CEQA 3MSDA 4QE5A 3L0KA 4F9DA 1IEQA 3AZSA 4UC5A 1CXKA 3HOJA 1LQAA 2ZBTA 5LZLA 2BVWA 1RCOB 1TTPA 5F4WA 3GIPA 5AZ1A 1ME9A 1FKXA 1EJWC 3W7LA 1GZJA 1K02A 3PC0A 4Q8VA 3QLDA 3QR0A 1X6LA 1EJXC 3S5OA 1NWRA 1A49A 2WSRA 2QZRA 1H3GA 3IGUA 1XP3A 2ZADA 3QGVA 4NJJA 4PFHA 5GJMA 4US5D 3W85A 3GE7A 5F2IA 3H55A 2BOEX 2ZRWA 2YXXA 2A3LA 4UTMA 2VHLA 1VFOA 1JPMA 2DU2A 4DI9A 1PHQA 4EKJA 4QG9A 3UWWA 4O1DA 3LS9A 3GDRA 3WMCA 2KAUC 3IAQA 4CEXC 2WPGA 1B0IA 2VFEA 1B2YA 2V5JA 3KOXA 1XH2A 3LCFA 3F5LA 5CGTA 3UZWA 2PWHA 3USBA 3EMZA 1ZY9A 1TPH1 3H2CA 1M68A 4H3DA 3W6LA 3NQBA 3CQKA 1BSLA 4PBGA 4RW3A 1K1DA 1SZGA 5CZKA 3EWXA 3KBNA 4MGGA 2WZTA 1V79A 4WGHA 2EG7A 3GVRA 2VVSA 4ZEPA 1JI1A 1U30A 4FPSA 2BP1A 1JNDA 2J7EA 5A95A 3UY8A 1T41A 3CZEA 1SJAA 2CLOA 1XHGA 1Z8AA 4JKKA 3W7OA 2ZZ7A 4GNJA 2FPTA 3E0LA 1TV8A 1JAEA 1WDRA 2EBNA 1E55A 3R2GA 1QVBA 3GW3A 4UOZA 2KZHA 2PDKA 4Y8FA 3VIPA 4DWSB 2BTMA 3L0NA 1W5OA 5F7UA 2NWSA 2OWCA 5BXTA 3KVLA 3TYDA 5BROA 3KEHA 3TNBA 3ERPA 2B4GA 5CGQA 1XINA 3E74A 4GGHA 2PDWA 3LLFA 1REQA 5HAOA 1OG0A 5HUPA 1UWIA 1E1CA 3BC9A 5K9XA 4J3SA 3WFAA 4GK8A 2YBUA 1OD8A 2W3ZA 4Z2GA 4A8RA 1XLCA 2C16A 2QCLA 1IXPA 3AJ7A 3MKKA 3MYPA 3UGRA 3WMLA 3CAKA 1GPFA 1HKJA 2Z1VA 1QFEA 5DF0A 1MMFA 4WSHA 1K70A 2V5LA 2GSJA 1TA3A 3CTLA 3P3BA 5BXPA 5D8WA 3IANA 1GVRA 4IP4A 3DC0A 4LAOA 1W91A 3DC8A 1RK6A 1BEUA 1B30A 1PYMA 1HJUA 4OOZA 4GXPA 3VPLA 1EWEA 1EBGA 1GYLA 1DJNA 1GORA 4LYQA 3SUVA 2CZFA 2VX5A 1ISXA 3IUDA 2ISSA 2GGIA 4NZJA 4TTUA 3DIPA 4KRUA 3WUBA 3W26A 1CGWA 2ISWA 4LJ3A 2YDSA 1RXOB 1QTWA 3CWOX 2XN0A 2WSKA 1XKJA 4NZFA 2ZTKA 3GXFA 3U7BA 2QCNA 3F4WA 1KXQA 2I5GA 1T40A 3A3XA 3H26A 3OIXA 1H1NA 1F8MA 1YNPA 3SN4A 4HMNA 1LWIA 3EKLA 1KM6A 5E6ZA 2F8QA 4MB4A 1NDVA 5DCDA 4Y7EA 4I9AA 1K8ZA 4Y8EA 3I6RA 1P43A 4FF5A 4NXKA 3QKZA 3V75A 3C56A 3TN4A 3W81A 3VNKA 4UMCA 2WSQA 1F2JA 1G7VA 3QY7A 3P80A 2XIOA 4N02A 4PTMA 5CKSA 1FWNA 3TTEA 2J79A 3P67A 2R91A 1YMYA 1GVIA 4MOZA 2PURA 3GD6A 3WYZA 4C6OA 3WNOA 3DGRA 3WNPA 2DDXA 2V6AA 3EPNA 4QDMA 2VR5A 1CECA 1RBOB 1I9CB 1G9HA 2FLIA 2VYOA 3M44A 2YKKA 4OIFA 4C6LA 4ROPA 3V5FA 4E3VA 4WIWA 2AGTA 4K1GA 4LU0A 1FFRA 1U33A 2BX7A 3CJPA 2DSZA 2J9YA 3IIOA 4NNAA 4UFLA 2NQJA 3OBAA 3EPOA 3JZUA 2QJJA 3M1ZA 1F05A 1B3OA 3EDKA 1EX5A 3FW6A 4WLCA 2X1TA 1LUCA 3EAUA 3W1XA 3A21A 3LHWA 1A5KC 1KQZA 4KGJA 3W1QA 1E43A 3EXTA 3D0CA 3MCNA 3FKKA 3CEPA 3O6CA 1ZALA 4RPPA 4XZIA 1CYGA 3AIVA 1UUMA 3KRBA 3UZ5A 4W85A 3VFCA 2VZTA 5CAKA 1E56A 4ZZ9A 3UJFA 4BHYA 3PWGA 1IXNA 2QGYA 1UWRA 1AZ1A 1O1ZA 1SO5A 2CLKA 2Y70A 3K1DA 3S2CA 4UOJA 2EXOA 4TOQA 4NRRA 1UOZA 3BLPX 3L67A 3WD4A 2VVNA 4D9PA 1WPCA 3N4FA 2A21A 1WUEA 2FDSA 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