1F37A

Structure of a thioredoxin-like [2fe-2s] ferredoxin from aquifex aeolicus
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
AEFKHVFVCVQDRPPGHPQGSCAQRGSREVFQAFMEKIQTDPQLFMTTVITPTGCMNACMMGPVVVVYPDGVWYGQVKPEDVDEIVEKHLKGGEPVERLVISKGKPPGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin from Aquifex aeolicus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FERREDOXIN [2FE-2S]
molecule tags Electron transport
source organism Aquifex aeolicus
total genus 32
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01257 2Fe-2S_thioredx Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1f37A00
3E0UA 1CQGA 3UARA 2FWHA 1B9YC 3KH9A 2I81A 4TRXA 4FIWA 4OFMA 5HQPA 3R2QA 2PU9C 5H5QA 1Z5YE 2VOCA 1KEBA 4QL7A 2IMKA 4NMUA 5EL8A 3WD6A 1AXDA 2CQ9A 2O7KA 1THXA 3DD3A 4GQCA 4BVXA 2P5RA 3TUEA 2NTOA 2H6ZA 1TK5B 2H8LA 3ZMLA 3KM6A 5EPFA 1A0RP 2CV4A 2YCDA 1YKCA 1Y6EA 4AJ8A 1QXHA 3ZYWA 5F8BA 3TCOA 1GSQA 1SD8A 1TRWA 4KNDA 2MMOA 1JZOA 2LRNA 4IBPA 2L6CA 5L71A 2IL3A 2OKAA 4TVEA 3J7Yb 3HXSA 3IA1A 4D73A 3F4TA 1YQ1A 2HRFA 4G10A 5ECLB 3F4RA 1A2LA 4JRRA 5IMCA 2C0DA 2IWTA 1GSSA 5D9XA 4AF2A 2H1GA 3KMNA 3CRUA 5DJMA 4HQSA 4TXVA 3LORA 4IKHA 19GSA 4POLA 1GUHA 3NOFA 3APQA 2HZEA 3ZTLA 1OVNA 2IFQB 3RHBA 4IHUA 4MH2A 2I1UA 4NAXA 5ECIB 1R26A 2X99A 3DGQA 1O8XA 2GQKA 4BA7A 4MJCA 3GH9A 5IO2A 2EIRA 3WGEA 1MEKA 3UOMA 5IPGA 2LSTA 4PQ1A 1GSEA 2B3SA 4K7OA 3F8UA 6GSWA 4GRFA 1SYRA 4ZBDA 4YQMA 1M0UA 4GQFA 4ZL9A 2CVBA 2K18A 2REMA 5AN1A 1G6YA 3CMIA 2GSRA 1Z9HA 2L59A 2NPBA 1EP8A 2H0GA 3WYWA 1GTUA 3RPPA 2GT5A 5DQSA 2JZTA 2E2GA 1V57A 3GFKA 4TR1B 1GSFA 4TN8A 2HRNA 1PX6A 4POKA 5FHIA 4K1FA 1J0FA 2H6YA 3ED3A 2C80A 3QR6A 3VPQA 2YZHA 4CDOA 3MDKA 2JADA 3HVXA 4HU7A 2YV7A 4G9HA 5CP1A 5DCHA 4DSSA 4BPYA 3UJ1A 1I5GA 3ISOA 4NWYA 2B7KA 1RQMA 4PURA 5ECMB 1XWCA 1MDKA 3CYNA 1GTBA 6GSTA 2O89A 1B9XC 3H4KA 1OAZA 3BBYA 3PH9A 2NDOA 3DVXA 3O76A 1VF4A 2D2ZA 4ECCA 2WZ9A 4L5OA 4TXOB 5HFKA 1XVWA 3LWAA 1OC9A 5KN0A 1MTCA 1HQOA 5D96A 3V1WA 1GTIA 5DCGA 1UA5A 1XWGA 2DJ2A 2FCHA 5B7CA 4V1Ag 4N30A 3IE3A 3C1RA 3HA9A 5D93A 2JACA 3CXGA 1PSQA 3D21A 4GSTA 3TRPA 1DSBA 1S3DA 1XW9A 2VLUA 3BCKA 1T00A 5CRHA 4F82A 2PN8A 2GVPA 4TR4A 3HJMA 1TJDA 3TOTA 5F0GA 1BQ7A 1M9BA 3TOUA 1AC1A 1R7HA 3H93A 3VI5A 2MBSA 3D0ZA 1TI3A 1F3AA 2OADA 3VWXA 2B1LA 1YEPA 6GSYA 2DMLA 3F63A 2V32A 2WB9A 2HFDA 4JR4A 13GSA 5J5NA 3GX0A 1WE0A 4HJMA 3IHQA 2JU5A 1U3IA 4ID0A 2LKUA 3TKPA 1JLWA 1YY7A 3E9JB 2OACA 1SK0A 4ILFA 2JZSA 2RM5A 4BWSA 4MJBA 3FY7A 4D73B 1IYHA 2F9SA 1ML6A 1X5DA 5ECPB 2YWIA 4OFNA 1GSYA 3UBLA 3NIVA 5D73A 3TJBA 5IOXA 3QFAC 2WCIA 1DE2A 2YV9A 3HY2A 2B5YA 3GUSA 3GURA 2GQMA 4HS1A 3M1GA 2HZEB 5F05A 2Z9SA 2DJJA 3ZFLA 2VIMA 2YWOA 1SJ6A 6GSSA 4MPGA 3GKMA 4FH8A 2XHFA 1TTZA 2WGRA 1UC7A 1U87A 1F37A 5JCGA 5IO0A 3H79A 2N5AA 3MSZA 3LJRA 5CRDA 5HFIA 4ECBA 1K3LA 2OBIA 1TI1A 3GX8A 2B6MA 1K0NA 4LLRA 4JR6A 2AB6A 2B7JA 4X1UA 1AQXA 3M0FA 5GZZB 2ES7A 2IFQA 2KUCA 5JCUA 1EZKA 4I5QA 3GN3A 2GZZA 2VCVA 5ENUA 3UIWA 4E8EA 3GHAA 5EVOA 1GUMA 1AW9A 3FKFA 3VWUA 14GSA 4ZB9A 5J9CA 1XFLA 1PD21 4RI6A 1XWKA 1TKDB 5G31A 5G2ZA 5INYA 3UEMA 5FT3A 2I9HA 2YPMA 4GF0A 4MDCA 4MZCA 2H0HA 4YQUA 1AIUA 2V41A 4JE1A 16GSA 2PWJA 1XZOA 1PGTA 3UVHA 2CZ2A 4F03A 5D8IA 5HFGA 4V1Ap 3L0HA 4EDYA 2WJUA 2PUKC 4RUVA 1GULA 2R5GA 2H71A 1M7TA 2GLRA 2XBQA 5ECHB 2VM1A 3EE2A 1K0CA 1QK8A 4KB3A 4ZL8A 2QC7A 1OC9B 2FGXA 2E2MA 2PVOC 4L0UA 2E7PA 5ECNB 3L9VA 4MF7A 1Q98A 1GH2A 3QAWA 3GSTA 3L9UA 1FAAA 4J2FA 4OMVA 3TKSA 3NZNA 1TU8A 3HHVA 1OC8A 1UN2A 2JSZA 3O3TA 3A5WA 2HYXA 2MMNA 3IV4A 1NW2A 2LRCA 4NHZA 3EVIA 3RDWA 3TDGA 1EWXA 1FB6A 1ZMAA 5ECOB 3U5RE 5B8AA 2P31A 1U6TA 1PX7A 3RHCA 2PVQA 2R3XA 3TKSC 2C3QA 3GNJA 4WR5A 3FHKA 2TRXA 3IXRA 1SYXA 5DJLA 2RUFA 1J08A 2MMAA 2R4VA 1F9MA 3H1NA 3DVWA 1FW1A 1NHOA 2MYGA 4FYBA 3CRTA 5DBQA 4ZIJA 4K0NA 2CAQA 4ZBBA 1TRUA 3D4TA 4QQ7A 3ZIVA 2IMDA 4PNFA 1A2JA 1DUGA 4OFTA 1USBA 3M3MA 3HDCA 2ZCTA 4KAEA 2CT6A 3FK8A 4ZL7A 3QMXA 1WIKA 2HE3A 2HT9A 1B4QA 4EUYA 4RQXA 3WT2A 5DAKA 3A2WA 4I97A 1G7OA 1NM3A 2GSTA 4TKYA 3D6IA 3Q18A 4OCEA 1ERUA 2VL2A 5JWRB 2AYTA 2K8SA 2DSAA 5J4UA 2CAIA 1ZOFA 4NV2A 3CSJA 4K8MA 4MP4A 3GRXA 2VL2C 4FYCA 1Y25A 2HI7A 3W6GA 3C71A 3ME7A 1T3BA 2VUPA 4EKZA 1GWCA 2K9FA 5EY6A 5HR2A 4TOPA 5IIZA 3EURA 4IP1A 3M9JA 2YWMA 1O85A 10GSA 2VL3A 3ZZXA 1X9WB 1ACVA 3HJPA 2H75A 2FY6A 9GSSA 2VLTA 3VI7A 2V1MA 3GSSA 3TRQA 4IELA 2QGVA 4PQIA 3FZ4A 1S3AA 3ERGA 3UAPA 1SL0B 4F2IA 4KCAA 4ZB6A 1NSWA 5H5RA 1K0BA 2X8GA 7GSSA 3A3TA 4K0GA 1A8LA 1K0AA 5GAPD 2CX4A 4KDUA 1O8WA 3GKKA 4N10A 4PXOA 5G1LA 1YZXA 4BWQA 5IMFA 5ECKB 2RIIA 1WJKA 3PINA 2YZUA 1GSDA 1G6WA 4ECIA 4WEYA 2GZYA 4J57E 3CBUA 4LL4B 1O73A 4MH3A 2JZRA 3DMLA 1GUKA 5G5EA 3QPMA 2OE0A 4NPBA 1QUWA 4ZILA 1FOVA 3IPZA 5B8BA 3HVVA 4ZB8A 3FR9A 1CQHA 4ML6A 5CRGA 2GSQA 2NVLA 3VFIA 4EL1A 3MAKA 2MBTA 2LQOA 5J41A 4POBA 1G0TA 3IAS2 1PKZA 1V98A 2I3YA 5IOWA 3D5JA 4F9ZA 4KSMA 1PA3A 1X9SB 3TJKA 3ZITA 1HNAA 2X8CA 1EOGA 1GL8A 5D9TA 1SJIA 2AUVA 1V2AA 1HD2A 4KCEA 4PUFC 4MLYA 4HDEA 4GCIA 4ZBAA 1MD4A 3I6AA 1JZWA 4HUAA 5HR3A 3FZ9A 5F06A 1GSUA 1DE1A 2WRTA 3TRXA 4K7IA 2LNSA 2HSHA 1YEXA 1KTEA 1O7UA 4GLTA 1OE7A 3WGDA 3ME8A 1ST9A 2KLXA 4G2EA 1H75A 2IMFA 3TB2A 1EGRA 5A4WA 4XS1A 5ABRA 4KA0A 3IK7A 4KSOA 5DAKB 4N11A 2FA4A 1ERWA 4E8HA 3ZMKA 2MMZA 2GT6A 2G0FA 2LJAA 1O81A 3QAGA 1K3YA 2GGTA 3ZFBA 3RAZA 4EF0A 2PBJA 2PERA 2FUG2 2IPAA 1SK2A 3JCML 2H76A 3P8WA 4K6XA 2G2QA 2A4VA 2FHEA 3VWWA 1XVQA 4KDYA 1ON4A 1IYIA 4OCFA 3E3EA 3BD2A 1URMA 2F3MA 2L4CA 1YF0A 4KH7A 5E4WA 1N8JA 2M80A 3GA4A 3HKRA 4GSNA 2AAWA 3EU3A 5IM9A 4AJ6A 1A23A 1PL1A 1ABAA 5E59A 2NBSA 3GTUA 3F6DA 5J9BA 3LEFA 3DRNA 3CSIA 3TKQA 2XBIA 1HNBA 2YANA 3W8SA 6GSUA 5GAND 4IS0A 4HI7A 4TW5A 1MD3A 5C04A 3LXZA 3LYKA 2DJ3A 3F6FA 4FO5A 4YH2A 4IQAA 3G7YA 1E2YA 4KDXA 2RUEA 3IBHA 4YQVA 2H0IA 1TP9A 4O7HA 3M9KA 1DBYA 1K0MA 1OE8A 1AQVA 3C1SA 1BAYA 2WS2A 4IVFA 2M46A 1SJZA 1V9WA 4WR4A 4GXZA 4EC0A 3A2XA 4I2UA 1ERTA 3QFBC 1LBKA 1V58A 4MA9A 2LUSA 1GP1A 1XPVA 2GS3A 3EYTA 1MDIA 2IJYA 2QSIA 3DXBA 3QAVA 3LQ7A 5ELGA 3ERFA 5KN2A 4WXTA 3PR8A 3WGXA 2J23A 2ON7A 4GSSA 4MF5A 1S3CA 1M2AA 4XS4A 4Z7XA 1PL2A 4PUAA 2FWGA 3HZ4A 3TJJA 1VF3A 3C73A 1NHYA 3FR3A 2VCWA 4I8BA 2F8FA 2F8AA 3P7XA 4HZ4A 4H86A 2LTKA 3OR5A 5B6MA 2C0GA 4KX4A 6GSVA 2CZ3A 2LS5A 1B4PA 1XWBA 4ISDA 4ULXA 1OYJA 2VCQA 3KXOA 3DKSA 4YAPA 3GKNA 2CVDA 3L78A 2OJLA 3VURA 3KCMA 2GDRA 4V2MA 4OO4A 2P5QA 3LXTA 3TKRA 5KN3A 2DC5A 4PNGA 5ID2A 4HJ2A 2IMEA 1KBNA 2L57A 4Q5NA 1JFUA 1TK0B 3LGCA 1K3OA 2PMTA 2CVKA 1BJXA 4L5LA 2RLIA 4XIHA 5DALA 3APOA 2PGTA 1ZCPA 1SKWB 3HJOA 2VD1A 2C3TA 17GSA 4K7NA 5JWQB 3KMOA 3KTLA 3DEXA 2J9HA 4LMVA 1RK4A 3K8NA 3GV1A 2YP6A 4WBRD 4MK3A 4WBJA 5G5FA 1LJRA 2IMIA 2KOKA 2H1BA 1Z6NA 3D22A 4O32A 1F2EA 1QFNA 5FWGA 2YN1A 3KZQA 4NV5A 1R5PA 2MZCA 5CRWA 4KW6A 3KTBA 1SD9A 1EV9A 3C8EA 2C3NA 3US3A 1PRXA 1TW9A 1XXUA 3ZIJA 3KIJA 3G9BA 3L4NA 1ZYEA 3LSZA 3N5OA 5LCZA 4MZWA 3HYPA 1K0DA 2VAFA 5ECQB 2TRCP 5GSSA 4YAVA 5IPHA 2OBKA 2R2JA 2DJ1A 5AISA 3I69A 4KE3A 2CX3A 4XTSA 1YKAA 2M72A 2EC4A 1JLVA 3UL3A 2N5BA 3IOSA 3IRAA 3BOAA 3LG6A 1G7EA 3GTUB 2TIRA 2LQQA 2R37A 5C00A 1VF1A 4ML1A 1GNWA 4WF4A 3F9UA 4P3YB 2AJQB 2VL9A 4I6XA 3CSHA 3M8NA 4POMA 3GL3A 3LYPA 2R6KA 2OA7A 4ZXGA 3F4SA 4OWYA 1ZYQB 3I43A 2LRTA 2O8VB 2VCTA 1SL1B 3A2VA 1PMTA 1K0OA 2P0GA 1E6BA 1QGVA 4MF6A 2H30A 4WF5A 4WKWA 4IJ3A 1GNEA 3DIEA 1EV4A 3U6VA 4EDZA 2F51A 1AQWA 2BJXA 4HQZA 1M2DA 1WRYA 3RPNA 1LU4A 3IR4A 2XPDA 4F0CA 2WDUA 1WWJA 3UVTA 3ZVJA 1EOHA 1C72A 1XBSA 4X43A 5AIXA 4IW9A 4JEDA 4XS4B 3C7MA 2XPEA 2FLSA 1UVZA 2C1YA 4ECJA 1FG4A 2BTOT 3D4MA 3FZ5A 3HZ8A 4HOJA 1TRVA 2GZPA 3DYRA 4XS6A 2FWFA 2OE3A 2VD0A 1JHBA 5ELAA 1T1VA 1VGLA 1XIYA 5F07A 1BEDA 4WETA 3ZREA 4MCUA 3TJFA 1GLPA 3BCIA 2C0EA 2A2SA 2IN3A 3FR6A 2ALBA 3P90A 4IP6A 2KP2A 5CYYA 3L9SA 1BX9A 5JCWA 3O6TA 2FD3A 2AHEA 5IMAA 4OO5A 1GTAA 5IMVA 5KN1A 5JWOB 1Q4JA 2LJKA 1OKDA 2DLXA 4G19A 5B6NA 4Q5QA 3GL5A 1JZDA 5DDLA 1RW1A 2L5LA 3WT1A 11GSA 2ON5A 2DIZA 5A5KA 3F3RA 5ID2B 1A24A 3Q74A 2DJKA 5A4VA 8GSSA 1KNGA 4NHWA 3GIXA 4Q5FA 2C0FA 2HZFA 1I9DA 1N2AA 5DALB 2FWEA 3VK9A 3UMAA 2JL4A 2YJHA 3KP8A 4J56E 1X9MB 2JSYA 2ZUPA 3LFLA 3TGZA 4QL9A 4MPFA 4CHSA 1V40A 1TOFA 5CREA 2K8VA 4LA1A 1SKSB 1PN9A 5DVBA 3UBKA 5D9WA 2EIQA 3GMFA 3HVSA 1ZZYA 2YWNA 1T8EB 1B48A 4NXIA 1WMJA 1X0RA 4IGJA 1EEJA 4PQHA 1YF1A 1Z3EA 2YOIA 2B5XA 3MWHA 3GYKA 1Z7PA 4X0XA 5HR1A 1M2BA 2KHPA 1R5AA 4V2NA 3HD5A 3N9JA 1YJ6A 1U3AA 2DJ0A 1AAZA 2LEGA 2IIYA 2WULA 4JU5A 1EGOA 1X5EA 2LJRA 3IAM2 3QCPA 2H6XA 4V2LA 4EO3A 1ILOA 4N0VA 4MMMA 3G7JA 5A4UA 1EEMA 5KEJA 1VF2A 4LMWA 4DSRA 4FYUA 1T7PB 1TK8B 3ERWA 4GWRA 4K9ZA 2V2GA 3QOUA 4TR3A 1WPIA 1TDIA 2K6VA 1M9AA 1TXXA 3GKXA 2DIYA 1WP0A 3KEBA 1XW6A 2LNTA 1SL2B 2L6DA 1W4VA 3FZAA 1GLQA 4XCSA 4HZ2A 1SENA 3Q19A 1PKWA 4EXJA 1SU9A 1M99A 4LL1B 4O92A 4MJAA 5IMZA 3ZL5A 2CA8A 3BJ5A 1FB0A 4CW9A 3APSA 3KGKA 3QDNA 2X8HA 3KP9A 2GSSA 4IN0A 6GSXA 4DSQA 3F3QA 4ACSA 1BG5A 4O5RA 4EVMA 1XW5A 4KGIA 5LD0A 5COHA 1FVJA 1THOA 2O87A 5LNKe 1AUCA 4HU9A 1GRXA 20GSA 2VO4A 3FRCA 5DQYA 4Q5RA 3MNGA 2AV4A 2B5EA 4XRDA 5AGYA 3FYGA 4L0WA 3F0IA 4PX1A 1F3BA 4BVYA 2V6KA 2H74A 1F6MC 2HLSA 3EWLA 1XOBA 4XHMA 4RQRA 2ZNMA 4DEJA 2PPTA 1B8XA 2GTUA 5AIVA 4MABA 2H01A 3VLNA 1W89A 1PQNA 2GQLA 3DWVA 2EIOA 2HNLA 1TRSA 1BYEA 1QQ2A 2C4JA 2I4AA 2HSYA 3GH6A 4GTUA 1A8YA 2N5FA 3ZRDA 3P2AA 3AY8A 5GSTA 3IDVA 4AGSA 1HYUA 4JBBA 5ECSA 4OD7A 2FA8A 2H70A 3Q6OA 1R4WA 1ZGNA 3VWVA 1YDKA 2HXKA 5IQYA 3EMXA 5H5SA 3EMPA 4L8EA 4PGTA 1JZRA 1FO5A 1MDJA 2A2RA 2VM2A 5J3RA 4XRAA 3EC3A 2LV3A 5D9VA 4DSSB 2B1KA 3EINA 4IQ1A 1H4OA 2WFCA 3FW2A 3VPTA 1OC3A 4RI7A 1T4ZA 3FEUA 2H66A 2H1AA 2E0QA 5ECRB 4MZBA 2C8UA 22GSA 2O85A 2RM6A 1U88A 1XCCA 3KD0A 3KH7A 2H72A 3KJYA 5CO3A 4TR1A 1XOAA 2L4QA 18GSA 3HCZA 2OE1A 2VLVA 2H73A 1A0FA 1FVKA 1ZL9A 3SBCA 3SWLA 4F0BA 2X64A 1OKTA 2XC2A 3ZLPA 5G1KA 3G7IA 3IK9A 2VCZA 2DBCA 3J7Yk 2DMMA 3TJGA 1VRSD 2YNXA 2L5OA 5CAXA 4EE0A 3CTGA 1ERVA 5CNWA 4DVCA 2KP1A 2YJ7A 4I2TA 1T4YA 4AJ7A 5HR0A 1FHEA 3RBTA 3IC4A 3S9FA 1EP7A 1Z7RA 3TKSE 1WOUA 4TXOA 1O6JA 5IMDA 2VCXA 4KUNA 2QKEA 4N0ZA 3CTFA 3ZVJD 2BMXA 1QMVA 5G30A 1A2MA 4HEA2 4BL7A 3PGTA 4MJEA 1Z6MA 2H1DA 12GSA 3EU4A 3W8JA 2V6OA 4IJIA 1XWAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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