1F37A

Structure of a thioredoxin-like [2fe-2s] ferredoxin from aquifex aeolicus
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
AEFKHVFVCVQDRPPGHPQGSCAQRGSREVFQAFMEKIQTDPQLFMTTVITPTGCMNACMMGPVVVVYPDGVWYGQVKPEDVDEIVEKHLKGGEPVERLVISKGKPPGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin from Aquifex aeolicus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FERREDOXIN [2FE-2S]
source organism Aquifex aeolicus
molecule tags Electron transport
total genus 32
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01257 2Fe-2S_thioredx Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1f37A00
1AQWA 4KDYA 1HYUA 4L0UA 3WT2A 1O7UA 4AGSA 1MD3A 5D9WA 1TOFA 3DEXA 5DALA 4NHWA 2HRFA 5CNWA 8GSSA 1V57A 1JZOA 2DC5A 5AN1A 3TCOA 2G0FA 5CRDA 5G5EA 3MSZA 1I5GA 3ZRDA 1XIYA 3UIWA 2GQLA 5ECOB 1LU4A 1K0AA 1WPIA 2GS3A 3DD3A 2YOIA 2FA8A 2A2SA 1PGTA 1GRXA 5F05A 4CW9A 2F8FA 2IJYA 1HNCA 2C0DA 4ZL9A 4G2EA 2FWHA 1GSEA 3A3TA 3UVTA 3GFKA 3M3MA 4JEDA 1PN9A 5ENUA 2HYXA 1UN2A 2PPTA 2M80A 2VLTA 4MH3A 2LNSA 4LL1B 1TU8A 1MDJA 1UA5A 2PN8A 1O85A 3IAS2 4MZCA 4V1Ap 2MBTA 2LKUA 2A4VA 5CRHA 2FY6A 3HZ8A 5CP1A 2QC7A 4CHSA 1XW6A 4PURA 4RI6A 4XS4B 1MD4A 5IM9A 2P31A 2GZZA 2V6OA 3VLNA 4TR1B 1BX9A 5F0GA 3P8WA 3TJFA 1FHEA 4O5RA 3QFAC 1PL1A 4YH2A 5J5NA 1Z3EA 3F3RA 2B5YA 3TKSA 2WB9A 3KP9A 2HZEA 4IVFA 3MDKA 4HZ2A 13GSA 2DJ0A 2AV4A 1GSDA 1YEPA 2K18A 3LFLA 5COHA 2YWIA 5D9TA 2MMNA 2PVQA 3LJRA 3IA1A 3GHAA 1GSYA 3HJOA 3R2QA 3QR6A 4LL4B 3L9VA 2E0QA 3FK8A 3E9JB 5JWOB 1O73A 2PUKC 2KHPA 2P5QA 2B1KA 3ZFLA 4HZ4A 3DXBA 1YQ1A 2PWJA 2EIRA 5ECPB 4TR0A 3TJBA 1Z6NA 2TIRA 1J0FA 2PU9C 4GCIA 2DJ1A 1LBKA 1V9WA 1SYXA 1SKSB 3PH9A 1F9MA 2C80A 3I69A 1U3AA 3BCIA 3GTUA 5DALB 3KH9A 1K3YA 3HDCA 3IXRA 2VCTA 1UVZA 2L6DA 4KDXA 1MEKA 2YANA 1K0MA 5B8AA 5FWGA 4BA7A 5GSTA 5IO2A 2CZ2A 1SJ6A 5ECHB 4PUFC 2NPBA 2LRCA 4HJMA 5ELAA 4HQSA 4XRAA 3EMXA 4OMVA 3RHCA 3KM6A 5F8BA 2ZCTA 1PSQA 2OE1A 1B8XA 4KGIA 4WR4A 1ON4A 2IMFA 5ECIB 3CBUA 4NWYA 1EOHA 1B4QA 1MTCA 2I4AA 3HJPA 3TKPA 4LA1A 1GUMA 1EV4A 5JWQB 1X9MB 2JADA 1VF3A 5G1LA 1BAYA 4POBA 4KUNA 4MMMA 5G5FA 4WKWA 1WMJA 3UARA 1RW1A 3DVXA 2K9FA 4KAEA 3DGQA 4MPGA 1K0CA 2VO4A 1JLVA 4K7NA 4E8HA 5JCUA 2CAIA 3EYTA 1SK1A 4F03A 2KP2A 1FB0A 1FVKA 2BJXA 1AUCA 2XBIA 4NHZA 2NVLA 2WZ9A 1S3DA 1XCCA 3O6TA 5G1KA 3WGDA 3ZYWA 2V41A 1GWCA 2NBSA 4OFNA 3P90A 1V58A 2HZEB 1SL2B 5IOWA 4MJBA 2FA4A 1GSSA 1TRVA 2RIIA 3QFBC 3CYNA 3H8QA 4GWRA 2N5BA 3VK9A 5IQYA 2YPMA 3D5JA 2IN3A 4WR5A 2HNLA 4MJCA 3F3QA 2RLIA 2XBQA 1W4VA 2WS2A 3LEFA 1R5AA 2VCXA 3QMXA 2GSTA 1WJKA 2CVKA 2LUSA 4HOJA 3A2WA 2HZFA 3HXSA 4XS1A 3TOTA 5ABRA 5LD0A 2JSYA 4I8BA 1PKWA 1WWJA 5A4VA 2VLVA 2VUPA 2GT6A 5IMZA 5G2ZA 1PD21 2YWNA 4EVMA 1PX6A 3HVSA 3IV4A 4EF0A 1NSWA 3IOSA 1IYIA 1XWAA 4K1FA 3ZREA 2HT9A 1K0BA 3KMNA 1XWBA 4V2LA 3TKQA 4TXVA 1E2YA 4RQRA 4IKHA 5IMFA 2GQMA 2KLXA 4J57E 1EV9A 4Q5RA 1FG4A 3CTFA 4JR6A 4EXJA 3F4RA 4MJEA 3ME8A 3FZ4A 4LMVA 4WBJA 1OC9A 2MBSA 1PL2A 3VWVA 5ECMB 5EVOA 3LG6A 2VL9A 4AJ7A 1TRSA 3GA4A 2MZCA 1K3OA 1WRYA 4GSSA 2L59A 5D9VA 2CX4A 2HLSA 2OKAA 3CSHA 4MF5A 1TKDB 4XS6A 4HDEA 3LQ7A 1WOUA 1QGVA 1V2AA 2F8AA 4KA0A 3VWXA 3ZTLA 4ZBAA 1THOA 3KZQA 3EMPA 1MDKA 1O8WA 1HNBA 3HZ4A 3IK9A 5F06A 1YKAA 2AAWA 5KN3A 3H4KA 3VPTA 4TOPA 3TRXA 4P3YB 2N5FA 4XS4A 2GQKA 3CTGA 4AJ8A 2VCVA 2X8HA 5GZZB 4QL7A 3BOAA 4I2UA 3F4SA 1SKRB 4NV5A 5CO3A 3W8JA 1A23A 2LS5A 2R3XA 1AQVA 2XC2A 4IBPA 1EEMA 1X9WB 1O81A 4ECIA 1A0FA 4WEYA 2CZ3A 5D73A 2WFCA 3DKSA 1G0TA 1QUWA 3BD2A 2B7JA 3F4TA 1XWGA 1SK0A 2H76A 2H8LA 5KN2A 1GUHA 4WBRD 1TW9A 3E3EA 3DYRA 2DJ2A 3IHQA 2VM1A 4V2MA 3FR9A 4DVCA 4KH7A 2P5RA 1YJ6A 3C73A 4O32A 3G7IA 1ZZYA 5DCGA 2HFDA 1NM3A 1R4WA 1XXUA 2I3YA 3QAWA 4TVEA 4ACSA 2MMAA 4L8EA 1B9XC 3C71A 3QAGA 3DIEA 1HQOA 2H66A 2VD0A 3M9KA 2NDOA 1X5DA 1J9BA 2H01A 3ERWA 2PBJA 5GAND 3EWLA 4FYUA 1OKDA 2GLRA 3V1WA 1GNEA 4POMA 1OC9B 4OWYA 1ABAA 3CMIA 5IO0A 2IMEA 3GURA 1BG5A 2H0HA 2JZRA 3Q19A 4NAXA 3U6VA 4I2TA 2C0EA 3KEBA 4L5OA 1T1VA 1UC7A 3KCMA 1THXA 5ELGA 17GSA 4K9ZA 2CX3A 4K8MA 3GIXA 1ZCPA 4F0CA 2YZHA 5AIXA 3F8UA 3BCKA 4O92A 4PX1A 1ZYEA 4ML6A 3KMOA 3GSTA 4I6XA 4WF4A 2LEGA 5DJMA 3TGZA 2O7KA 2ALBA 3FZ9A 4MH2A 5JCGA 1GSQA 2OA7A 3F63A 4TR4A 2DIYA 4KCEA 2C0FA 3GX0A 4V1Ag 1OC8A 1F37A 2IMKA 4I5QA 4OCFA 5F07A 1SL1B 2K6VA 2H30A 2CVDA 3TKSE 2CAQA 3VWWA 3M8NA 2FWEA 3D4MA 2CVBA 5CREA 3NZNA 1U88A 1GUKA 2E7PA 1SJIA 4BPYA 2GGTA 3LXTA 22GSA 1K0NA 1RK4A 1M2AA 2G2QA 19GSA 2WCIA 3VI7A 3KXOA 4D73A 2VL2A 5DJLA 3F0IA 3UEMA 2O85A 2H70A 1F3BA 2MMZA 16GSA 3KGKA 3UAPA 4BWSA 2OE0A 1KTEA 2DBCA 2H6XA 3C1RA 3QPMA 3SWLA 1N8JA 4YQVA 2L4QA 2GZYA 2FWFA 3TB2A 1TK8B 4K2DA 4IGJA 4FH8A 4K6XA 10GSA 2C4JA 2LQOA 1K0DA 1N2AA 1ACVA 4XHMA 1U87A 3RPPA 3IC4A 4ZILA 1FO5A 1SKWB 2XHFA 4ECCA 3F9UA 4KX4A 2R37A 3ZIJA 3TJJA 2EIQA 2YWOA 4ZBDA 2I81A 3QDNA 2H6ZA 1F6MC 2L57A 4PQIA 1Y25A 4DEJA 3EU4A 5IMCA 4MABA 2FCHA 4IP6A 4F0BA 3EE2A 2QGVA 1LJRA 1C72A 5IPGA 1A24A 2J23A 3M9JA 4PNGA 1OYJA 3FR6A 2RUFA 3LYPA 1IYHA 4IP1A 1ST9A 2X64A 1M9BA 5H5RA 1Z7PA 5IOXA 4N30A 4X43A 1X5EA 2O89A 4L5LA 2V32A 3HY2A 5D93A 2B3SA 5ECNB 4HU9A 1GSUA 5ECLB 4F2IA 3A2VA 2R5GA 4LLRA 5A5KA 7GSSA 1J08A 1PX7A 3FW2A 4MZBA 6GSVA 1X5CA 2OE3A 4NMUA 4POLA 1GTIA 2JZTA 2L6CA 2RM5A 3TRQA 12GSA 5AGYA 1XVQA 3Q18A 1OVNA 2GT5A 1TDIA 1VGLA 3GH6A 3Q74A 2ON5A 3FRCA 3RAZA 3F6FA 1SL0B 4PUAA 1M2BA 4PXOA 2H75A 2J9HA 3HVVA 3EURA 4ECJA 1WIKA 2GZPA 1Z9HA 1OE7A 3I6AA 2WGRA 1SENA 1PKZA 1M2DA 5GSSA 5L71A 4JZQA 1YY7A 4OFTA 1SK2A 1VF2A 4D73B 3M0FA 3GRXA 1U6TA 5KN1A 1FVJA 2VOCA 4J2FA 1A8YA 3CXGA 1JZRA 2XPEA 2H71A 1BJXA 3TKSC 2AB6A 3HYPA 3HVXA 4EDYA 1YZXA 1ERVA 2OBIA 3VWUA 1PA3A 2DMMA 2IL3A 2PMTA 5CYYA 2VL2C 1XOAA 2CT6A 2O87A 5IMDA 3PR8A 2REMA 4GF0A 3J7Yb 3H93A 5IPHA 2H73A 2AYTA 3QCPA 3IE3A 4ZB6A 4BWQA 4GTUA 1AIUA 5AIVA 2B1LA 2GSRA 2Z9SA 1ZYQB 1PRXA 1WP0A 4HI7A 5GAPD 4RUVA 2H1GA 1SU9A 5DCHA 3IAM2 2YNXA 4KSMA 1K3LA 3DRNA 1DE2A 5HFIA 3CSJA 4PNFA 4MDCA 3N5OA 4JU5A 3DMLA 1GULA 4MA9A 1O6JA 2N5AA 6GSSA 3KIJA 2M72A 1AAZA 1EP7A 2H1BA 2ES7A 3FY7A 1XWCA 4NV2A 2LJAA 4EO3A 4IQAA 1XVWA 4IHUA 4HU7A 4KSOA 1FAAA 3EC3A 2XPDA 1GNWA 5INYA 4DSRA 1FOVA 5HR1A 2YWMA 5LCZA 4BL7A 1BYEA 1M7TA 1M0UA 2VCQA 1T8EB 4G10A 4EE0A 1B4PA 2LRNA 3H79A 1I9DA 2L4CA 4F82A 2YN1A 4EC0A 4ILFA 4ZBBA 2QKEA 1TU7A 4KB3A 2RM6A 4OO4A 1YDKA 2VCWA 1T7PB 5B7CA 3ZMLA 2BMXA 4K7IA 4FYBA 2M46A 2LJKA 1EP8A 4AJ6A 1S3CA 1YKCA 4ULXA 3IR4A 3ERFA 3BJ5A 2R2JA 2NTOA 1USBA 1CQHA 3G7JA 1JLWA 2KP1A 1TTZA 2TRCP 2DJJA 1RQMA 2DMLA 5J9BA 4GSNA 2H0GA 2FD3A 1S3AA 3GH9A 3IK7A 1GL8A 4XTSA 2H72A 1XPVA 2DJKA 4ECBA 3NIVA 4DSSA 11GSA 5J3RA 1CQGA 1SJZA 5C04A 2IMDA 3L4NA 4ID0A 2ZNMA 3A2XA 4IN0A 4E8EA 3LORA 2X8GA 1NHOA 4N0ZA 1M99A 3RBTA 3ZL5A 4POKA 3EVIA 2LRTA 3ZITA 3WGXA 3ZZXA 3E0UA 1QQ2A 2E2MA 1T4ZA 2C1YA 1AQXA 1YEXA 3L78A 4OFMA 2WJUA 2AJQB 1VF1A 2H1AA 4IW9A 3HKRA 3UBKA 1B48A 1QMVA 2E2GA 4WETA 2RUEA 2R6KA 4J56E 4HS1A 2YZUA 4JRRA 3PGTA 2LJRA 2JACA 5DDLA 4AF2A 3EINA 1PMTA 1JHBA 1VF4A 3M1GA 4ML1A 1OE8A 1A2MA 5A4UA 3ME7A 1TP9A 3DVWA 1ZGNA 3TKRA 3MAKA 2B6MA 1X0RA 3PINA 4FO5A 4O7HA 1V98A 1TK5B 1EZKA 3ZVJA 5D96A 1XZOA 4TKYA 3ZMKA 3BBYA 4GLTA 5B6MA 4TW5A 1YF0A 2H74A 1OAZA 3C1SA 2FHEA 1MDIA 2FGXA 4MPFA 3KD0A 2VCZA 4GQCA 2HRNA 2DIZA 2C3NA 1R26A 4H86A 3CRUA 5ID2A 4YAPA 1GTAA 4N0VA 3Q6OA 1GLPA 1ILOA 3W6GA 5J4UA 1T3BA 1ERWA 2I9HA 2PVOC 4JE1A 4KCAA 5D9XA 5HFKA 3D6IA 4IS0A 2VAFA 4XIHA 3KJYA 1KEBA 2C3TA 2B7KA 4JR4A 5DAKA 5G31A 2ZUPA 4KDUA 1A2JA 1V40A 1R7HA 4MF6A 3FZ5A 1DUGA 1TK0B 4Z7XA 1TI1A 3G7YA 3D0ZA 1FB6A 2PERA 2VD1A 3APSA 1AXDA 3GUSA 3P2AA 2R4VA 5DVBA 3RDWA 3J7Yk 5J41A 4FYCA 3TUEA 3APQA 1G6YA 2V1MA 1XW5A 2PGTA 5ECRB 4DSSB 5G30A 2HSHA 4MK3A 1ML6A 3I43A 6GSUA 3L9UA 4HUAA 3QD9A 4K0GA 3D21A 3IBHA 4GSTA 2MYGA 1JZWA 1E6BA 4IELA 5H5QA 3DWVA 6GSXA 4KW6A 2H0IA 1ZMAA 3RHBA 4TN8A 3JCML 4HEA2 4WF5A 3GMFA 1XFLA 2CV4A 4EDZA 1ERUA 2OJLA 20GSA 4HQZA 2WULA 5E4WA 2HE3A 2FLSA 5DQSA 3US3A 4IJ3A 2JSZA 3QOUA 2FUG2 2K8VA 1NW2A 3HJMA 2HXKA 4XRDA 1DBYA 4YQMA 5J9CA 3U5RE 2VM2A 4RQXA 1BEDA 1OKTA 1DE1A 1SD9A 4I97A 2TRXA 3A5WA 3C8EA 1H75A 4G19A 1K0OA 3IRAA 2DSAA 2F3MA 4F9ZA 4MLYA 3VI5A 5DBQA 3HCZA 3W8SA 4YAVA 2D2ZA 4BVYA 1HD2A 5ECQB 3CRTA 2OADA 2CA8A 4K0NA 3CSIA 4XCSA 1SYRA 3KTLA 3ZLPA 4ZIJA 4OD7A 2L5OA 5EL8A 4ZB8A 3F6DA 4N11A 2C8UA 1Q98A 4QQ7A 4G9HA 1XBSA 1XOBA 5LNKe 5FHIA 2WDUA 4BVXA 3NOFA 2B5EA 5ID2B 2GSSA 4DSQA 3UMAA 9GSSA 6GSWA 1TJDA 3C7MA 4MF7A 4RI7A 2LTKA 1QFNA 4Q5QA 4V2NA 2EC4A 4GQFA 2OACA 4MJAA 5C00A 1AW9A 3GL3A 1SD8A 3GKMA 4MZWA 1PQNA 1Z5YE 3FYGA 3O3TA 3FEUA 3ZFBA 2LV3A 1H4OA 2C3QA 2AUVA 3H1NA 3VURA 1VRSD 5DAKB 1HNAA 4IJIA 1Z6MA 4Q5NA 4ZXGA 2JL4A 2IFQA 5EY6A 2P0GA 4QL9A 3UOMA 2FNOA 2H6YA 4OO5A 2VIMA 2FWGA 1EWXA 5HR2A 5CRGA 3UBLA 3WGEA 1F2EA 2LQQA 1KNGA 2DLXA 4KE3A 4PQ1A 4JBBA 1NHYA 1GTUA 2MMOA 1GTBA 5HR0A 3D22A 4ISDA 3GKXA 5ECSA 3TDGA 5IMAA 3ZIVA 3SBCA 2V2GA 1JFUA 2DJ3A 1X9SB 3LGCA 3LSZA 5KN0A 1A8LA 1EOGA 3G9BA 3I9V2 3HD5A 3AY8A 2F9SA 5AISA 3APOA 4EKZA 14GSA 3FHKA 6GSTA 3UL3A 4NXIA 3IPZA 3FZAA 3ERGA 1Z7RA 1F3AA 2YJ7A 2YV9A 3HA9A 2IIYA 1ERTA 1B9YC 1G7OA 5B6NA 3GKNA 1GH2A 1TI3A 3LXZA 3OR5A 1O8XA 5KEJA 3L0HA 2IWTA 3K8NA 5JWRB 3O76A 3GTUB 5A4WA 3GNJA 3WT1A 2F51A 4TXOA 5CRWA 2HSYA 2X99A 2LNTA 1WE0A 3TJGA 4ZB9A 1QXHA 4GXZA 4KNDA 2GVPA 5JCWA 2VL3A 3KP8A 4Q5FA 2EIOA 1TXXA 3LYKA 2GDRA 2VLUA 2K8SA 3ISOA 1QK8A 2LSTA 3N9JA 5HQPA 4X1UA 2A2RA 2B5XA 3KTBA 1TRWA 5B8BA 2X8CA 4OCEA 3L9SA 4TRXA 3GV1A 1BQ7A 1A2LA 5IMVA 1T4YA 5CAXA 2CQ9A 2KOKA 2H19A 3IDVA 4CDOA 6GSYA 3ED3A 1R5PA 2GTUA 2YJHA 5IIZA 2O8VB 2IFQB 2V6KA 1U3IA 3GX8A 1URMA 3GKKA 4EUYA 1Q4JA 3UJ1A 1EEJA 2GSQA 2WRTA 4GRFA 3GYKA 1ZL9A 1GLQA 2YV7A 2YP6A 2JZSA 2H1DA 1XW9A 4ZL7A 4PGTA 1EGOA 2C0GA 2HI7A 1A0RP 5EPFA 3RPNA 1G7EA 2IMIA 4EL1A 4ZL8A 1Y6EA 4X0XA 3WD6A 1GP1A 1G6WA 5HFGA 5ECKB 1EGRA 3WYWA 3FR3A 1FW1A 3QAVA 3KH7A 2I1UA 1XWKA 1YF1A 1AC1A 3HHVA 4TR1A 1TRUA 4NPBA 2L5LA 4IQ1A 3ZVJD 3D4TA 3GSSA 1DSBA 3VFIA 2IPAA 1OC3A 4MCUA 1M9AA 2KUCA 1ZOFA 5HR3A 3MNGA 2YCDA 2AHEA 3VPQA 3TJKA 3TOUA 3GN3A 5FT3A 5DQYA 5E59A 1JZDA 3FKFA 4WXTA 4TR3A 3UVHA 3GL5A 4N10A 2JU5A 4FIWA 3EU3A 1T00A 3S9FA 2ON7A 4MP4A 2OBKA 3LWAA 4PQHA 2QSIA 1GSFA 4HJ2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite