1F6KA

Crystal structure analysis of n-acetylneuraminate lyase from haemophilus influenzae: crystal form ii
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
MRDLKGIFSALLVSFNEDGTINEKGLRQIIRHNIDKMKVDGLYVGGSTGENFMLSTEEKKEIFRIAKDEAKDQIALIAQVGSVNLKEAVELGKYATELGYDCLSAVTPFYYKFSFPEIKHYYDTIIAETGSNMIVYSIPFLTGVNMGIEQFGELYKNPKVLGVKFTAGDFYLLERLKKAYPNHLIWAGFDEMMLPAASLGVDGAIGSTFNVNGVRARQIFELTKAGKLKEALEIQHVTNDLIEGILANGLYLTIKELLKLEGVDAGYCREPMTSKATAEQVAKAKDLKAKFLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Haemophilus influenzae
publication title Active site modulation in the N-acetylneuraminate lyase sub-family as revealed by the structure of the inhibitor-complexed Haemophilus influenzae enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-ACETYLNEURAMINATE LYASE
total genus 120
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2000-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1f6kA00
2CZEA 3A9IA 3H53A 3W6YA 1ZHAA 1VZWA 4LC6A 2ZRXA 4X3ZA 1H5YA 1AL8A 2E77A 2V2HA 3QFEA 2HTMA 4ML9A 1FWTA 4ZQCA 3NZRA 3TH6A 3U2OA 3UPWA 1LRNA 2HMCA 4QIUA 4NXKA 1FWRA 1UUMA 5DY2A 1IXOA 3DKJA 4DF0A 2QUVA 3L2IA 3TC6A 2V9DA 1W31A 1FWWA 4UFLA 2A7PA 3P84A 4MYAA 4O53A 4OV9A 3OVQA 1EP2A 2W6RA 1LDCA 4NVTA 1KV8A 2Z6IA 4TMCA 3W1AA 2JGQA 3HOJA 1B57A 1YYAA 4K6AA 3TAKA 3M1ZA 1CX9A 1SZEA 4JGDA 4LVFA 1FY6A 3G1AA 4ZQOA 2YX0A 3Q58A 3R5EA 3CU2A 3TC7A 3W76A 2G96A 3W1LA 1PL9A 3S1WA 4ZQPA 3DFSA 3W9ZA 4RK8A 2ZRUA 3CEPA 4DELA 1KTCA 3TIMA 3LBCA 4Z1CA 1QDSA 4BK9A 1TSIA 3BPWA 2DZWA 1FCBA 3KRUA 2WNQA 4XQ6A 2NXGA 1H51A 1VJIA 5LHEA 5TBOA 3EWUA 1OFEA 4NX5A 4UFKA 2VELA 3I6RA 4EIVA 1P4CA 2ZRWA 1IIHA 3QW3A 1IGSA 4O1DA 2KZHA 4XKYA 1GTEA 4UC5A 3A21A 1WA3A 3DBPA 2Y7DA 3M5XA 4JTUA 4B5NA 1RQHA 4MY8A 1RQEA 1XM3A 4LS0A 3L0KA 1G4SA 4M7TA 3RLUA 5L9FA 3LX9A 4Y9AA 5FESA 1YDVA 2NX3A 2DZXA 4EF8A 4RJEA 1VLWA 3KFTA 1NF0A 1FUYA 1MEWA 1VHCA 4IMFA 4O18A 2V82A 4PODA 3LDVA 3IEBA 2VKZG 5AFDA 3NM1A 2GUUA 3GR8A 5D2XA 4UTJA 2EKCA 3G0UA 2QCDA 5FF3A 3T44A 4FNTA 3BW2A 3G0SA 3QC3A 4WY0A 1PE1A 1AW5A 1T0OA 2Z1BA 3W3OA 3OBKA 3W88A 2WSYA 4JTKA 4K39A 2YYTA 1XUUA 1YLVA 4GFSA 4GXMA 1VRDA 4UNLA 5BMXA 3LHWA 5C5YA 3NPXA 3NQVA 3B4UA 1D9EA 1LOQA 4JX5A 4AEOA 3M47A 4KKXA 4LC8A 3NA8A 1HO4A 4CNNA 2V2DA 5U7SA 1Q6QA 4A21A 3MP4A 1SW7A 1NEYA 2E6AA 4Z0SA 2J6XA 1ZNNA 1H50A 2F84A 4WD0A 1Z42A 2J88A 3QRHA 3TSMA 1Q6OA 3B8DA 3W87A 1SW3A 2DORA 3P80A 5DELA 1QPNA 1LBLA 2DZTA 2YW3A 1PIIA 4CNOA 3EX6A 4UTWC 3GXPA 2J24A 3MP5A 2A6NA 1OK4A 1F5ZA 3UY8A 3P82A 3EX2A 3W7DA 5CKSA 4HPJA 2RH9A 4IPJA 3GDKA 4XBSA 1F6PA 2ZBTA 3W2MA 3N9SA 3GX9A 5D32A 5DY3A 1JULA 3ZFHA 5CZJA 3HIJA 1OX5A 3NQFA 4WOZA 3W75A 3LERA 2C3ZA 4LS2A 4GE8A 4O1BA 1PHWA 3DFPA 1RZMA 1BTMA 1K7XA 3F03K 3HG5A 3O07A 5F2MA 3C4UA 3QMSA 5F2GA 3P8IA 4MZ1A 3UNDA 4O52A 3DI0A 2NUXA 3BK0A 2ISVA 1BKSA 4H3DA 2P10A 2ABBA 4OGZA 4RXFA 4AAJA 3QEZA 3EWBX 1IXNA 1A5AA 4WJEA 3BW4A 1PVNA 2VEIA 1G6CA 1OFOA 3RLVA 1WAUA 6ALDA 1JCMP 4Y8FA 4UFJA 5CG7A 3W1TA 3DZ1A 3MYOA 3LHYA 3NQMA 4MOZA 4FXRA 1OABA 1RR2A 4MFEA 1W0MA 4CCCA 1EP3A 3FJ6A 4W9TA 3W1UA 2FDSA 3P62A 1KM5A 1SZFA 4O50A 3TW6A 3F1QA 1F7BA 3NQEA 4A29A 2F7FA 4PL2A 4HSOA 3MBFA 2OZ0A 3NQ2A 1C8VA 5LNSA 2W79A 1GEQA 4NNAA 5D2VA 3C2EA 5KZMA 4JTLA 1S3HA 2GVJA 3BARA 4WY0F 1LOSA 3LHTA 5KZEA 4YXGA 1HFBA 1Q6RA 1UCWA 3NL3A 3B0PA 3UZJA 3WJZA 3TU9A 4AHOA 3B03A 4I7UA 4EWND 3NPUA 4MLRA 4N02A 3UXDA 3HPZA 3TUUA 2C0AA 2E6FA 4D2JA 3O6YX 4ORIA 3NVTA 5KITA 3ELFA 1JUEA 4UIOA 3QZEA 3KVLA 2Y89A 4ZQNA 3QMRA 3FJLA 3L0NA 2QCFA 3GDRA 4UNKA 4ZVJA 1QFEA 1QO5A 1LP6A 4OT7A 1KM6A 5LGXA 3EWXA 2CU0A 4N4PA 1VCVA 1GJPA 5CSSA 4UTLA 2BZNA 3O06A 5K9DA 3C3NA 2Q3RA 3BG9A 3W7QA 1RQBA 3IVUA 3S1XA 3QQ0A 4RX0A 4MZ8A 1G4PA 3ZWTA 4JR5A 2TYSA 3TSBA 2CLMA 2E6YA 4IJBA 1XDLA 3L5LA 5TQLA 5LKYA 4O14A 1YTEA 1ZAIA 4O4WA 2E6DA 1TPFA 1J5TA 2PURA 4FX8A 1SFLA 3PC0A 4NJGA 3O16A 3DFQA 3VE9A 2H8ZA 3CC1A 1JVNA 4NU7A 4XTIA 2FQIA 1G4TA 2C1HA 3CWNA 3FKRA 3UXAA 1TMHA 3S5YA 1TCDA 3PUEA 3JS3A 1SZNA 4N9BA 2Y88A 1TTPA 1TRDA 3EX3A 3IIVA 4AXKA 1HO1A 1FX6A 1UUOA 4DF2A 1NSJA 3C2OA 4Z1DA 1XBVA 4UTWA 1W5OA 3P8JA 3M9YA 3GAYA 2QCNA 2YFNA 2J27A 5CPNA 1KM1A 3MHGA 1I2OA 3LV5A 1LORA 4YCPA 3W7NA 3EEGA 1VYPX 2VFEA 4ZZ9A 2NX9A 3PUDA 3MW7A 3G0XA 2WOQA 1OFBA 2FPTA 2GPTA 4WXZA 1VHNA 1TPC1 4HHPA 1Z41A 1DHPA 3THQA 5K2ZA 2OMAA 4UTKA 3BG3A 4DBDA 5IM51 2FB3A 3DFNA 3NYZA 3P61A 4DF1A 4JDYA 4IMCA 1XUZA 4RXGA 4Z0JA 1OF8A 1KW1A 2PRHA 1DOSA 5HINA 3B0UX 4TMBA 1K8YA 4K36A 3P5YA 4FIQA 4MVAA 1SFJA 3PBWA 3LHZA 3L0GA 1ZFJA 3SR7A 1UASA 1P5BA 1KLYA 3TV8A 1SSGA 1ME9A 1EWDA 4MJZA 5KMYA 3GLCA 4OV4A 4UFHA 3RU6A 2QJHA 4BR1A 2CWNA 3FKKA 1GZGA 3GNNA 2X1UA 1G67A 1DQWA 1L9WA 3S6DA 4N6FA 5EYWA 1LZOA 2A7RA 4GUGA 4JXCA 1OX6A 4CCDA 2C16A 4NUWA 3HJZA 1W3NA 1LBMA 1R46A 3LTYA 1OFRA 2A4AA 5G2WA 1FXQA 1W3IA 3F4NA 1T96A 1KLZA 3EXTA 2Y7FA 1T8XA 1GG0A 1VCGA 3STGA 5F4WA 4JY9A 3GXTA 3CWOX 4K38A 4Y96A 3IVTA 1H7RA 1K02A 3NOEA 4JIQA 4JS3A 4GUIA 4NJIA 1KFBA 1KFJA 1EX5A 1K3UA 2CW6A 1TRIA 1TTQA 3LBMA 1KA9F 7TIMA 3UWYA 5F2IA 2QCGA 1MO0A 1JRCA 4TO8A 1B4EA 2TSYA 4LUJA 4CQ8A 3W7GA 2QDGA 1M7OA 4O0ZA 3NQCA 5K3VA 4IMDA 5AHMA 2OCZA 4CCEA 4OQVA 3TSDA 3PVFA 2RHGA 5J5DA 5IBXA 4ZMGA 1YXYA 5FF2A 4FXSA 1XKYA 3ABRA 2WO5A 1W8SA 1S5WA 3A23A 4FNQA 2ZZ1A 3B04A 5CPMA 5F1UA 5HQEA 8TIMA 2ZZ7A 4WZHA 3S42A 5D2YA 5HWJA 3WFAA 1MEHA 5E93A 4L4MA 4BF9A 4HNVA 3Q94A 3P5ZA 4HNUA 3QH2A 3C0JA 2VFIA 3WJWA 2ZZ6A 1F74A 1G69A 3QSTA 5EA9A 4GWEA 1DJNA 1VYRA 2V81A 3PS7A 3C52A 5EBUA 1YTDA 3DENA 3T78A 3ZWSA 4E38A 2A6LA 5E0KA 5EKYA 1GOXA 1QWGA 3EWWA 4QSHA 1P1XA 2ZZ2A 3TQKA 1NAL1 1H1ZA 5G2HA 4FNPA 3IGXA 3GDTA 4TX9A 4YCOA 3H55A 3STEA 2G95A 4AH7A 3NL2A 3LV6A 2B0MA 3W2NA 4HKPA 3RMJA 1V7YA 4Z1BA 4GUHA 1FDJA 4RZ5A 3SECA 3GYEA 4DEFA 3G1XA 1JCJA 3SGUA 2QEZA 2RDUA 1VR6A 4O8RA 2A2IA 4Y90A 3T4CA 3OHIA 4LW7A 2H8XA 1KV5A 4NT0A 1P0NA 1SPQA 1VH7A 2ZRVA 3M16A 4GRSA 2QUTA 1A5CA 3QYQA 3L9CA 4QNEA 3MUXA 2CLEA 3D0CA 3KVJA 3SGZA 5D38A 3UPBA 1LLZA 1OX4B 1R2RA 3L65A 2Z2UA 4EOUA 3GDLA 1TREA 5KZDA 5FEPA 4FNRA 1H62A 1UBSA 2OT1A 2YPIA 2ZCGA 1TJRA 5T26A 1VLIA 2NX1A 3R8RA 4JTIA 2GVGA 3DHFA 4UMAA 5AHEA 2CFFA 4PH6A 3HG3A 1YXCA 3G1YA 3BGJA 1TIMA 2YW4A 1YADA 2AQWA 4JD4A 4M6VA 4XUGA 2NWSA 3NNTA 3HGRA 3IIZA 5H91A 5AC8A 4A22A 1ZALA 2BWGA 3O63A 1XBYA 3TXVA 5BMWA 1MSSA 4O54A 4M6QA 1F2JA 3NR0A 4PL1A 4YLWA 3W7KA 3W7MA 4DQWA 4ICNA 1KBIA 1LYXA 2Y61A 3E96A 3LHVA 4S2BA 3BLIA 3LCFA 3W72A 3T40A 2VFHA 1TJPA 3KHJA 3E0IA 3YPIA 3W1QA 4FO4A 1J2WA 2R14A 3CB8A 1O5KA 3CM4A 1FWSA 3W73A 5DXXA 3DAQA 1GYNA 4MJMA 1O60A 3W1MA 4JYFA 3A22A 3PBYA 4HNTA 3S5OA 5D2TA 3TNOA 1L6YA 4KWWA 4OWGA 5CZTA 1KFLA 5FF4A 1EA0A 1DORA 1ONRA 4MY9A 4O1CA 1W5PA 1M7PA 5U4NA 4I9AA 3SI9A 1P0KA 4DBEA 1F73A 3NGJA 1PS9A 2A1YA 2TMDA 3NAVA 3MI6A 1ME7A 3W7CA 4Q4KA 2PC4A 4KFOA 1GTHA 1GQNA 1OFAA 3R12A 4IUOA 2BSLA 1H1YA 5I3FA 3W70A 1I8JA 5AHLA 3OEXA 2CLLA 2QDHA 2JK2A 5DBTA 4UTTA 2ISSA 3BV4A 1C9DA 4ALDA 2WNNA 3N14A 1VC4A 4OHQA 5I3GA 1HG3A 4JTEA 1KM4A 2CLHA 1XL9A 1Q6LA 1JCXA 5K4XA 4R33A 2JKPA 4QM1A 1W3TA 3T7VA 3W22A 2ZYFA 3KRZA 1WOAA 4O0KA 4UCGA 2ZA1A 4LT9A 2RFGA 3TFCA 2EF9A 1R2TA 1TPH1 2B7OA 2ZZ3A 3FEMA 3V1PA 1X6UA 2WJZA 2QJGA 4Z08A 3B0VC 3QMTA 3LI0A 3NQ8A 3W7HA 1YDNA 1Q3NA 3LCGA 2YSWA 1VGAA 3PB0A 1HUVA 4S2CA 3RNDA 3WJSA 2Q8ZA 3MI3A 4UFIA 2FLIA 3DKLA 3N19B 1L2UA 3LHUA 4FEZA 2CLKA 4WX2A 3IIPA 1KBJA 3GNDA 3OVRA 2VC6A 4E2DA 3HGJA 6TIMA 3UZ5A 1OG0A 4PEKA 4IMEA 2W0UA 1EUNA 3GIYA 2JBMA 3O05A 3O6DA 1TPDA 2P1FA 4UMCA 3INPA 3W7OA 1F6KA 3E12A 1LTDA 4LRTA 3QSRA 1JRBA 3NL5A 4WXYA 3HPXA 4ZQMA 4X9SA 1YTKA 1GVFA 3CT7A 1W5QA 1WBJA 5HUPA 4R34A 2CLIA 4R53A 1LCOA 4N9DA 3G3MA 1ML1A 1XI3A 1Q45A 2I14A 1IXPA 4N6EA 5K7JA 4AHQA 4AWTA 3W7RA 1ADOA 4M5PA 5H2ZA 3G3DA 3KXQA 5DCEA 2QUUA 2CLOA 3SSJA 1H7PA 3FIGA 2P0OA 3NQDA 3TFXA 1T99A 4UMBA 2PRMA 2FB2A 2J9XA 3O15A 2E1DA 4O57A 2NZLA 3R13A 1RV8A 4NJJA 3OG3A 5A8GA 2V5LA 2GVLA 2C6QA 1D3HA 4XBKA 3DU0A 2E5CA 3G8RA 1IIGA 1QPRA 1JCNA 1KTNA 4DXVA 3E9AA 3G1SA 5D04C 5DN1A 2C13A 4O12A 4JTGA 1H60A 3PB2A 1OK6A 3TQ0A 2WNZA 3TW7A 1H7OA 4ADUA 1PCKA 3TXZA 2OT0A 1FDYA 3EWYA 2A7NA 4CQAA 3PBVA 3DH7A 2A21A 5CSRA 1NF7A 2WKJA 3HGOA 2Z0IA 4UR8A 1RPXA 4LUIA 4JTFA 1JCLA 3N2MA 2NV2A 1AL7A 1DKWA 3B05A 4UTIA 2TRSA 3OVPA 5AC7A 3W23A 5D30A 2GOUA 3PG8A 3N3MA 2GQ9A 1XCFA 1GYLA 1GVSA 1G4EA 4LV4A 3UWZA 1EIXA 3QF0A 1TTJA 1N8FA 4WUIA 1QNVA 5I3JA 4N9CA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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