1F9BA

Melanin protein interaction: x-ray structure of the complex of mare lactoferrin with melanin monomers
Total Genus 210
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
210
sequence length
689
structure length
689
Chain Sequence
APRKSVRWCTISPAEAAKCAKFQRNMKKVRGPSVSCIRKTSSFECIQAIAANKADAVTLDGGLVYEAGLHPYKLRPVAAEVYQTRGKPQTRYYAVAVVKKGSGFQLNQLQGVKSCHTGLGRSAGWNIPIGTLRPYLNWTGPPEPLQKAVANFFSASCVPCADGKQYPNLCRLCAGTEADKCACSSQEPYFGYSGAFKCLENGAGDVAFVKDSTVFENLPDEAERDKYELLCPDNTRKPVDAFKECHLARVPSHAVVARSVDGREDLIWKLLHRAQEEFGRNKSSAFQLFKSTPEEQDLLFKDSALGFVRIPSQIDSGLYLGANYLTATQNLRETAAEVAARRERVVWCAVGPEEERKCKQWSDVSNRKVACASASTTEECIALVLKGEADALNLDGGFIYVAGKCGLVPVLAENQKSQNSNAPDCVHRPPEGYLAVAVVRKSDADLTWNSLSGKKSCHTGVGRTAAWNIPMGLLFNQTGSCKFDKFFSQSCAPGADPQSSLCALCVGNNENENKCMPNSEERYYGYTGAFRCLAEKAGDVAFVKDVTVLQNTDGKNSEPWAKDLKQEDFELLCLDGTRKPVAEAESCHLARAPNHAVVSQSDRAQHLKKVLFLQQDQFGGNGPDCPGKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAELQGKTTYEQYLGSEYVTSITNLRRCSSSPLLEACAFLRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Lactoferrin-melanin interaction and its possible implications in melanin polymerization: crystal structure of the complex formed between mare lactoferrin and melanin monomers at 2.7-A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOTRANSFERRIN
molecule tags Metal transport
total genus 210
structure length 689
sequence length 689
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-07-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA03
2VGQA 3JYRA 3E13X 4R9FA 2F36A 5AA2A 3RT8A 1MPCA 4P11A 2QSXA 3G3FA 3L6GA 3OENA 5H8HA 4XTCQ 5IKBA 2QRYA 2DS9A 5DEXA 3FZVA 3GBBA 4PFTA 1MXZA 1SDXA 3TEPA 4GWOA 2D21A 3N6UA 3PV0E 4E0XA 1MQHA 2HZLA 5LOMA 4TQUQ 3RQTA 3QYTA 3RLFE 3DP6A 2PBWA 2AYSA 1II5A 3U1OA 4RPNA 3C4MA 5CI5A 2GH9A 4NWCA 3VXCA 3PPRA 1RKMA 3M3KA 3U94A 1Y1MA 4O3BA 2PT1A 2PVUA 2VD2A 2ZNSA 3Q28A 3TAJA 2ZYOA 1LFIA 3TCFA 1UTHA 1O63A 2I58A 2I48A 1Y4TA 3QSLA 4G8NA 3K2DA 3S9NC 4TLLB 2O69A 4IO2A 3RTFB 1I69A 3SKPA 4Q5TA 4GQOA 1YAEA 3MVWA 4ECFA 5IAIA 3A3CA 5AA4B 1JEUA 2Z8DA 2UVHA 3IL1B 1ZLQA 4EF1A 4FECA 4LA9A 1IXHA 4U4XA 3C35A 3IK6B 5DVIA 4OESA 4AB5A 4JBZA 1NH7A 2Z22A 1USYH 3M3LA 3EHSA 2HXWA 1NNPA 1FTJA 2O1MA 1OIBA 1LAGE 4RY1A 3MJNA 1DPPA 3ILTB 5CMMA 5CMBA 1S7YA 1M5BA 1B9JA 2I3WA 4YKKA 3TQLA 5ITPA 2RCBA 1GGGA 3W9WA 2OCUA 3IOTA 1Y1ZA 1B0LA 1AMFA 1ZJLA 3IO4A 5I57B 4PETA 4GLIA 3IOVA 4C1UA 4TLMB 3EF7A 1SI0A 2REJA 1A40A 1NKXA 1TFDA 3FASA 1BKAA 1A55A 2DWIA 3VVDA 2O84X 5K2XA 4GL0A 1JEVA 4F3PA 5H8NB 3TELA 4P0GA 2ONRA 3MZ9A 3KN7A 1QKAA 4ZECA 2F78A 4NF8B 5I56B 5I2NB 1PC3A 3OSQA 3CG3A 3FXUA 4F1UA 1DTGA 1MY2A 1RYOA 3CFXA 2CZLA 4QRZA 4OEVA 3OO9A 4NMYA 1XS5A 3PPQA 2XXXA 2RCAA 5KZTA 3VLWA 3RGYA 3TUSA 2ZYMA 2ABHA 3C9HA 3KJTA 2AIXA 3TTNA 5F1QA 3RY3A 3TQWA 3VV5A 4BDLA 2Y7WA 4ONYA 1BIYA 4F2QA 2HAUA 1TWYA 5TP9A 3HHGA 2DE4A 4H67A 3V89B 3TKDA 1ATGA 1LBBA 1MXUA 1S9TA 4I9DA 3FV2A 3FJGA 2QS2A 3MP6A 4U23A 2QS3A 5I2NA 2VOZA 1ZIUA 4IGRA 3AXFA 1B3FA 2F7BA 1ZTYA 1B5IA 2YJPA 1SW5A 4DXCA 4IGTA 1LSTA 3TPAA 4LVQA 3DM0A 4RK2A 1GVCA 4F2OA 4N6PA 4NF4B 1QW0A 1PB8A 3TTLA 4F3GA 3W9VA 3MVYA 1B6HA 1OMPA 4R2FA 1OQGA 1QKBA 5CBSA 4U21A 3LSLA 3FVNA 1UTBB 1LAFE 2Q89A 5BUUA 4XKPA 1MM6A 4QSEA 1ANFA 4FJPA 4OQOA 3T96B 2NVUB 1WDNA 1JVYA 2QS1A 4WXJA 3JV9A 1D3KA 1MM7A 5TPAB 3V5AA 3G3JA 3PUWE 4O3AA 5L9SA 2H9BA 2DWJA 4U1OA 2ONKE 4F22A 4EUOA 1N3WA 5I58A 2QJEA 5CC2A 2XX8A 1NNTA 4IO6A 3OOAA 1OLCA 3HSTA 4YB6A 2THIA 3SERA 1FQEA 2UVGA 4NWDA 4QFLA 1FQFA 3QK6A 4F3BA 3B7DA 3EN3A 1ZBMA 5H8FB 1SW4A 4BDNA 2XXQA 1Y9UA 2ANJA 4YKJA 2Q8JA 4OWDA 2IEEA 1B40A 3UN6A 1LB8A 2I49A 2Q9TA 5CBRA 1IUDA 1FTKA 3MW0A 4H5GA 2VD3A 3ZSFA 1H45A 4RNSA 3U92A 5JTYA 2GFEA 1Y20A 3S9MC 4MBPA 2O7IA 3GZGA 4AQ4A 1GTKA 1M5EA 2F6GA 4POWA 5H8HB 4ZZAA 4ELRA 2D5WA 4K3FA 4LZ7A 2Q2AA 5DEXB 5KDTA 3OO7A 2Q2CA 1R6ZA 3GXAA 3H7MA 3T9XB 1NNKA 2KLFA 1OVTA 3K4UA 2DSFA 4FAJA 3MVXA 3N6TA 1F9BA 3CI8A 2UYEA 5B7DA 3T66A 2NXOA 2RINA 2XXVA 5BWJA 2OK2A 4ISUA 1SQYA 3S9LC 1GR2A 1WVJA 4G68A 2X26A 1US5A 1MXXA 4IY5A 4HW8A 2ZNUA 4PE5B 4UA8A 2H4IA 3CSBA 3EHUA 2V3QA 2O51A 4IO3A 1PEBA 3DELB 2O1LA 3H6WA 3IOWA 1UTHB 1URDA 4YU0A 4KYEA 4N13A 1IITA 4YAHX 3IO6A 4OFOA 3VVFA 1JW1A 3UA8A 2A5SA 2A5TA 4GOTA 4HCWA 1MXVA 5FHNA 3D4GA 3IOUA 5EHMA 1OLAA 3I3VA 1MH4A 1O64A 2XXRA 1LGBC 4DCYA 3MPLA 1MPBA 1N04A 4RK9A 1N76A 1M5DA 2O68A 4YKIA 4C1TA 3OXNA 2I6EA 3K1MA 3B6WA 3HCQA 1VSOA 1FTLA 2O6AA 1MG1A 4EF2A 3PD8A 4ZZEA 1IXIA 2R9JA 3VLUA 5DTBA 4H0WA 5DYHA 1FQCA 3USDA 3FXRA 4RXLA 4OYVA 1LBCA 3O6IA 4GF8A 1IXGA 3PMXA 2G29A 1N7WA 1B7HA 4KYSA 2CMOA 1I6AA 4OFJA 3MWBA 1PBQA 4QF9A 1EZPA 5M2VA 1A8FA 3UIFA 2ZYNA 3S4UA 4X1DA 1MQDA 4FIMA 1J1NA 3SESA 5H8QA 3ONMA 3KZGA 3OEMA 4QHQA 4Q30B 3CG1A 2HFBA 3K6UA 3IJXB 3LSXA 3CVGA 3PMWA 2OZZA 1T0KA 1P1NA 2ESNA 4H8JA 1MY3A 4IO4A 1H76A 3CRBA 3KBRA 1LAHE 4I62A 2ONSA 1TT1A 1EZOA 4DZ1A 3Q27A 3T9VA 1P1WA 4QSDA 3FXQA 4KPTA 4R6YA 4GXSB 3TTKA 3IR1A 3K01A 2P1SA 3N5LA 3RUMA 1ZKBA 4MFIA 5AA3A 2Y7KA 5L8DA 5TP9B 1Q1KA 2E1SA 2HCAA 1EZ9A 1A7LA 5DT6A 1B1XA 3F11A 5AA1A 4M1VA 1FTOA 4G77A 2PT2A 1NH8A 4JSOA 4PFUA 4KI0E 2PX1A 3DP4A 1UQWA 4NTLA 3MP1A 3H6UA 3VLVA 2Y84A 3LSFB 5I59A 5EHSA 3R7XA 4GFRA 4JWOA 4F19A 2XXYA 3SDFA 4GVOA 4THIA 3FVGA 3KGCA 4R75A 4H5FA 4YB5A 2RC7A 4Z7EA 3QAXA 2XX9A 4LUBA 3RTWB 2DE2A 1B7UA 1B51A 3S9EA 1N3XA 3ECRA 1PDAA 5ELVA 5B70A 5A5XA 1XVYA 1S50A 3TDJA 2XD2A 1B46A 1LAXA 1JETA 4BDRA 2ZNTA 4PP0A 5HM4B 2H98A 4JDFA 5HPQA 2V3UA 4F3SA 5FTHA 2REGA 3SEVA 3IX1A 3TODA 3A09A 2H25A 1FQBA 4I1DA 4EQ9A 1FQDA 1B5JA 5FTIA 1URGA 3K6WA 1PBPA 2VP1A 2V93A 5I58B 3SEUA 4ZE8A 1LFGA 1JNFA 4U4SA 3UORA 5H8SA 3IB2A 4LQ5A 5ITOA 4OHNA 3OO6A 1SVXB 3IORA 1DOTA 1DTZA 3V83A 4PQJA 1JW4A 1B3HA 4ESWA 2XX7A 3LUYA 3UP9A 1VR5A 5F7VA 3CSGA 1BTJA 3LC8A 5FHOA 2O7UA 3GBAA 2GHBA 1TXFA 3PUVE 3Q25A 3JZJA 5JTYB 5DVJA 4ELQA 2DVCA 5AE4A 4IO7A 2I0BA 3OO8A 3FIRA 2RC8A 4ZDMA 1IEJA 2OWSA 4KD5A 4AB6A 4JB7A 4LONB 1DMBA 3FUZA 5KDTB 2HQ0A 3A3UA 3K02A 5JK4A 4ND9A 1YCJA 1B3LA 1EH3A 4X1BA 1SYHA 3C36A 4G8HA 2DP8A 1H44A 5L9MA 4BDMA 4Q8RA 3K6VA 3FJMA 3PMVA 3KOSA 2QPQA 4ELOA 1MY0A 2W7YA 4G68B 1A99A 4XKNA 3PGFA 2V84A 3T9UA 3PUYE 4YMBA 3MP8A 1I6BA 3PPOA 3OELA 2F8DA 4GL8A 2B3FA 4U22A 1IIWA 5AA2D 4ZEBA 3S2VA 1OQHA 1JQFA 1NNFA 3PPNA 1MXWA 4FEDA 2B3BA 4IO5A 3OMBA 4R6HA 2ALUA 1B1HA 3RN8A 4EXKA 1H43A 3R6UA 3ZS6A 3CFLA 2HZKA 2A5TB 4ZS9A 2YPNA 1IZ1A 1Y3PA 4U1ZA 5CMCA 1N84A 4R2BA 3VVEA 3KFMA 5KCJA 4F1VA 3FD3A 3KN3A 4KCCA 1IQ7A 3KG2A 1CE2A 4BDOA 4F31B 2XXUA 4KQPA 1MS7A 1M5CA 3H4ZA 1LCFA 4DCXA 4H1XA 1MH3A 2AL5A 1B58A 1XOCA 1M5FA 2GHAA 3TCGA 2F7AA 3U72A 4MLQA 5I2KA 4BLAA 5TU0A 3WAFA 1Y3QA 2DVZA 1KWHA 1PB9A 2RC9A 2Y7RA 2DYXA 4H65A 3SETA 4X48A 4F1YA 3FVKA 4H8IA 4R74A 2I4BA 3CFZA 3KJ7A 3O2AA 3LR1A 1XVXA 4QFNA 3OD7A 1A8EA 3KN8A 1USYE 3MAMA 1POY1 1UIVA 1D9VA 4ELPA 3Q29A 5H8QB 1FW0A 4R72A 4P0IA 3PUZE 4X9TA 1D9YA 4R73A 3OSRA 1DPEA 1ZMGA 4YZZA 4LZ5A 4NE4A 1BLFA 1CB6A 1FQAA 1LCTA 4MH5A 2F97A 4LATA 3HV1A 3DP8A 4FEBA 1MY4A 3G3IA 3C34A 2UXAA 3R26A 4LQ2A 2DWHA 2X7PA 3PPPA 4YMAA 3HHFA 2OWTA 2Z8FA 1SI1A 2ZYKA 1VE4A 2E0SA 2XXIA 3K0VA 1HSLA 3FGSA 1Q35A 3QIMA 1TFAA 3EQ1A 4EXLA 2M8CA 1I6QA 3T22A 1Y3NA 2R71A 3VDFA 2XXPA 4OEUA 1QULA 2H5YA 1P1QA 5HBCA 4LZ8A 4DE8A 2F7CA 5CMKA 3H06B 3ILUB 5CM6A 1QUJA 3B6TA 3BBRA 4KR5A 5L9OA 3W15C 1ELJA 4QSCA 4ZEKA 2F35A 3VE1B 1B4ZA 4ESXA 3KSXA 4HTGA 1HSEA 3RT6B 4E0WA 2X7QA 4OXVA 1VFEA 1MQIA 1QVSA 2P0SA 1NFTA 2HAVA 1R1NA 4OZ9A 3QXMA 1O7TA 1MQJA 1MDP1 3WAEA 4NF6B 1P1UA 1N0TA 3TTRA 1B3EA 1B52A 3V8XB 1AH5A 5I59B 2XHDA 2RF1A 2DQVA 3MC2A 2UVJA 1QUIA 3I5OA 1SYIA 4GXAA 3KOTA 2Y7PA 4R6KA 2BJJX 3H6VA 3TZAA 4OVJA 4UACA 3FV1A 2PMSA 3DLNA 1P99A 5A5XB 1LFHA 4IB2A 2QL3A 4MF3A 2QS4A 4IY6A 3KSJA 2B65A 3CR9A 3PD9A 4YB7A 4YICA 3E9XA 4MLVA 1POTA 3O9PA 3QUJA 3O28A 3ODBA 2I3VA 3FVOA 3O6HA 4G4PA 1LB9A 4WEDA 2Z8EA 5ISUA 3H3GA 3UGWA 3KEIA 4OFLA 1NL5A 4NF6A 1R9QA 2FNCA 2G93A 2DWAA 2I0CA 1N7XA 1QUKA 2DXRA 1B4HA 1B2HA 3HPIA 5AA4A 2PYYA 2RKMA 3E3KA 4U2RA 3P7IA 4R9GA 3TMGA 4DDDA 1B3GA 1FCKA 4TOZA 4G68C 1R9LA 2ZXTA 1HSJA 1B0HA 1MRPA 3Q26A 4L17A 4XXUA 3O97A 2FA7A 2FYIA 3TCHA 4WKMA 5J1DA 4YKPA 4DIGA 3C31A 4XIGQ 1SBPA 1PB7A 5JEIA 3T93B 3TTMA 1YTVA 3FJ7A 4OENA 4H6DA 3MZ1A 4DLDA 5CRYA 4LP2B 1UIUA 3QUFA 2R6GE 4RJZA 5I57A 1AIVA 1XC1A 4F39A 1RYXA 3H03A 2XXHA 4JWXA 4ZEDA 2V3TA 2F5XA 5H8NA 2ZMBA 4F29A 4XKQA 3HN0A 2F34A 3N26A 1D4NA 3K6XA 4HCYA 4NF8A 5I56A 2VHAA 2DE3A 2H99A 4BDQA 3O66A 1H3DA 2V25A 2DXYA 4M4GA 1DSNA 1NMUA 4FATA 3FATA 1L5TA 3K00A 4JWYA 4DXUA 3LSWA 2Z23A 5ICTA 4PFWA 3IAZA 1AL3A 2F6PA 4QFOA 1P1OA 4RA1A 3PU5A 1B32A 4I8CA 4C0RA 1Z7ME 3GLBA 3MBPA 3MPKA 2NOOA 3M8UA 1B05A 3RPWA 1JW5A 2HEUA 3D4CA 3U8QA 4NF5B 2NWJA 3O6GA 4KCDA 3MUQA 1US4A 4QFKA 3CIJA 4EDPA 3K1NA 4RPOA 4DXBA 5KCJB 4OETA 1FTMA 3T9HB 1XHYA 3SEYA 1OVBA 2GRVA 1EU8A 4ZE9A 5K2YA 5FHMA 3HO7A 3C32A 2XXWA 3E4RA 3ZKKA 1SW2A 2WKYA 3EPEA 1GV8A 3TYHA 1AOVA 4KFQA 1LLSA 4GRKA 5I84A 4GIZA 2NUVA 1MPDA 5I2KB 1MY1A 4NF4A 3IB1A 4PFYA 4F18A 4O3CA 3PUXE 1ZU0A 4EQ7A 3MZBA 5ICQA 1Z7NE 3VXBA 2P2AA 3TFLA 5DVFA 1UTBA 4OTEA 1SD3A 1WODA 2XXTA 4KHZE 1YPNA 2LAOA 5EYFA 2OJTA 3EHTA 4KYDA 1MDQA 2UYFA 1MXYA 4NF5A 2IA4A 3IB0A 3G3GA 4XKRA 2AL4A 3B6QA 2XD3A 3L6HA 4OMBA 4Q0CA 1SW1A 2UVIA 3G3KA 2D3IA 3SEXA 4G8MA 3VFJA 4POXA 3RNNA 3SEWA 1VFDA 4FE8A 5AA2B 4ZEIA 3BFUA 3MVZA 3ZKLA 3N94A 5TPAA 4JSDA 4JXIA 3I6VA 1QJMA 3IJOB 4QFPA 4FORA 3OEKA 3O29A 2I4CA 1XT8A 4ZEFA 1URSA 4NEDA 3BFTA 4OERA 3BKIB 1Y4CA 4G2ZA 5H8FA 2QMWA 4RYAA 1MQGA 3H6TA 2OBGA 4EQBA 1B7ZA 2YLNA 3MQ9A 3C33A 4WEPA 2QMXA 3U93A 3K1PA 2OLBA 1BP5A 1IXCA 3THIA 2Q88A 2DOJA 2Y7IA 4HS7A 3LBSA 1B5HA 4Z0IA 3G7WA 3M3FA 4GD5A 3UK4A 1JVXA 4N07A 3G3HA 1A54A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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