1F9BA

Melanin protein interaction: x-ray structure of the complex of mare lactoferrin with melanin monomers
Total Genus 210
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
210
sequence length
689
structure length
689
Chain Sequence
APRKSVRWCTISPAEAAKCAKFQRNMKKVRGPSVSCIRKTSSFECIQAIAANKADAVTLDGGLVYEAGLHPYKLRPVAAEVYQTRGKPQTRYYAVAVVKKGSGFQLNQLQGVKSCHTGLGRSAGWNIPIGTLRPYLNWTGPPEPLQKAVANFFSASCVPCADGKQYPNLCRLCAGTEADKCACSSQEPYFGYSGAFKCLENGAGDVAFVKDSTVFENLPDEAERDKYELLCPDNTRKPVDAFKECHLARVPSHAVVARSVDGREDLIWKLLHRAQEEFGRNKSSAFQLFKSTPEEQDLLFKDSALGFVRIPSQIDSGLYLGANYLTATQNLRETAAEVAARRERVVWCAVGPEEERKCKQWSDVSNRKVACASASTTEECIALVLKGEADALNLDGGFIYVAGKCGLVPVLAENQKSQNSNAPDCVHRPPEGYLAVAVVRKSDADLTWNSLSGKKSCHTGVGRTAAWNIPMGLLFNQTGSCKFDKFFSQSCAPGADPQSSLCALCVGNNENENKCMPNSEERYYGYTGAFRCLAEKAGDVAFVKDVTVLQNTDGKNSEPWAKDLKQEDFELLCLDGTRKPVAEAESCHLARAPNHAVVSQSDRAQHLKKVLFLQQDQFGGNGPDCPGKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAELQGKTTYEQYLGSEYVTSITNLRRCSSSPLLEACAFLRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Lactoferrin-melanin interaction and its possible implications in melanin polymerization: crystal structure of the complex formed between mare lactoferrin and melanin monomers at 2.7-A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOTRANSFERRIN
molecule tags Metal transport
total genus 210
structure length 689
sequence length 689
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-07-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1f9bA03
3MQ9A 2DE4A 3QUJA 1P1WA 1MY2A 3EHUA 4OESA 4JWXA 1VSOA 3OO6A 4FIMA 5AA4A 1H76A 2I3VA 1FTKA 4U1ZA 3OEMA 1XT8A 5I57A 3M3LA 2V93A 4MLQA 4NE4A 1B32A 2I6EA 1FQDA 5CI5A 3UK4A 5ITPA 4FORA 3Q26A 1EZPA 3E4RA 1WDNA 3LR1A 3BBRA 2P0SA 1D9VA 1HSJA 1DSNA 4R75A 3BFUA 4BDQA 1A8FA 3TQLA 2UXAA 1AH5A 3EPEA 3OO9A 3Q28A 1B4HA 1BKAA 1NL5A 1MPDA 4G8MA 4G8NA 4M1VA 4LATA 5I2NB 3HHGA 2X26A 1MXUA 3LC8A 3K00A 1QUJA 3VLUA 4YB5A 2GH9A 3PUXE 1DTZA 5EHMA 3U92A 1NNTA 2D3IA 2H4IA 3LSLA 4PQJA 4PFWA 1B3LA 1QVSA 2RF1A 4QF9A 5ISUA 4OQOA 1OVBA 3RQTA 3TCHA 1B5IA 3IJOB 4F18A 4G68C 4U21A 4Q5TA 4RA1A 2THIA 1LGBC 5I59B 1XC1A 3P7IA 2Z22A 3K6WA 1JVXA 4IY5A 4F39A 2AYSA 3O28A 3PUWE 4UA8A 3USDA 3MP1A 2LAOA 4M4GA 2F7AA 1ANFA 4ZDMA 3FZVA 2B3FA 5CMMA 3G3IA 4ELRA 4AB6A 4BDLA 3FJ7A 3FJMA 2DQVA 3H6WA 1XVXA 1A8EA 4FAJA 4F3PA 3ZKLA 1MXWA 2Z8EA 4C1UA 2Y84A 1MS7A 3KOTA 3O6GA 5ICTA 3VV5A 4YB7A 1MQDA 1MM6A 4Q8RA 3B6WA 2DWHA 4P11A 2H98A 2DP8A 4QSCA 4NWDA 1B51A 2VOZA 2VHAA 3FXQA 4THIA 2Z8DA 5DVFA 1A55A 1UTBB 1BLFA 1A99A 1B5HA 1F9BA 4GQOA 1L5TA 2DYXA 4GFRA 2ZNSA 4DIGA 3ECRA 2XXRA 3MJNA 4KYSA 4N6PA 1RYXA 4JSDA 1PB9A 3O66A 1DMBA 1BIYA 1B3HA 1IXHA 3U1OA 3O6IA 1LAXA 1Y3NA 2QPQA 1LFHA 3VVDA 1HSLA 1SBPA 3MBPA 2XX7A 4GLIA 4HCWA 1B40A 3UIFA 1H45A 2HCAA 3SEUA 3DP8A 2NOOA 4HTGA 4FATA 2UVJA 3N94A 4KFQA 4XXUA 1JEVA 4X1DA 4U23A 2O69A 3V89B 3OO7A 4LQ2A 1Y4CA 5L9OA 3ILTB 4NF8A 2I4BA 1LLSA 2H99A 1IITA 3RNNA 4GIZA 5JK4A 3E9XA 4ECFA 5L9MA 5TU0A 4I62A 3IJXB 1OLCA 4OFLA 1P1QA 3RT6B 2RINA 1LFIA 1IXCA 3OEKA 1USYE 3OD7A 3KGCA 3TODA 3MZBA 5BUUA 3PD9A 4NF4B 5H8HB 1FCKA 1UQWA 1N84A 3PV0E 2GRVA 2VD3A 4OEUA 3U72A 3MP6A 3C35A 3HCQA 1PBQA 3LUYA 1FTMA 3VXCA 4ZZEA 2R9JA 5F7VA 3MC2A 4JWYA 3PUZE 4TLMB 1Z7ME 4KHZE 1I69A 3H4ZA 2XX8A 1Y20A 1YAEA 1MQJA 3RY3A 2A5TB 5BWJA 4KQPA 4RK9A 3Q25A 3UN6A 3ILUB 1LSTA 3HV1A 5CBSA 3S9EA 3SESA 4KR5A 3HN0A 2PMSA 1IXGA 2F35A 4F3BA 2Q88A 4XIGQ 3MW0A 2Y7WA 3RGYA 4NF6B 1LB8A 3TTRA 4AB5A 3MZ1A 2QS3A 4QFPA 4FEBA 3R26A 2RC9A 3MPKA 3F11A 2OCUA 1B0HA 5DYHA 3IB2A 1SD3A 2I0BA 5DEXB 1Y4TA 1QKBA 1B1XA 3PUVE 1CE2A 1ZKBA 3RUMA 4POWA 5B70A 4NF8B 3H06B 1GV8A 1MH3A 2F6GA 2GHBA 5DT6A 1LBCA 1LCTA 3FV2A 2XXVA 2ZYKA 4EF1A 2F36A 1OMPA 4BDMA 3VFJA 3DLNA 2XXXA 1DTGA 1SW1A 1NFTA 4QFNA 1M5BA 3S9MC 4R73A 2DSFA 4YB6A 1YCJA 2RC7A 2O51A 4OFJA 2NUVA 3HHFA 2PX1A 1JW4A 1ZMGA 4IB2A 3MVWA 4QSEA 3IAZA 3FVGA 3K1NA 5KCJB 2DWJA 1R9QA 3WAFA 2PVUA 3IOVA 2OWTA 3TMGA 4KI0E 2HZLA 4JSOA 5EHSA 5AA2A 2I4CA 3G3KA 3QK6A 3L6GA 1Y3QA 4ZS9A 4FEDA 2AL4A 1MPBA 1B1HA 3H7MA 4DE8A 1PB7A 3VXBA 2REJA 3KG2A 1SQYA 2DOJA 2F5XA 2GFEA 1B6HA 4U1OA 3GBBA 1ZIUA 1T0KA 1VE4A 1B7HA 2O7UA 1IXIA 1I6AA 1YTVA 3I3VA 1PDAA 3KN7A 5H8QB 4POXA 4NMYA 1R9LA 4GD5A 3BKIB 4EF2A 4WEPA 1UTHB 4OHNA 3PPNA 4H5GA 3FJGA 4IO7A 1M5DA 1AIVA 2DWIA 4ISUA 2H9BA 1OQGA 3RPWA 1US4A 3OELA 2DVZA 1JW1A 5ITOA 3TCGA 1MQGA 5H8SA 4C1TA 2NVUB 1EZ9A 3OXNA 3K0VA 1ZJLA 4I1DA 5H8FA 2XX9A 3B6TA 5I2KB 3Q27A 1N7XA 3K2DA 2ONRA 1IUDA 1B7ZA 5TP9B 2ONSA 4YKPA 4O3BA 2OK2A 1CB6A 4ZEIA 1N3WA 5FHNA 1Y1MA 3Q29A 2YLNA 3CSGA 3IX1A 4YKKA 2VP1A 4X9TA 1SYHA 3CSBA 4GXAA 2H25A 3DP6A 3VLVA 3FD3A 5CMKA 4WXJA 4PFTA 4ZEKA 4RPOA 3TCFA 2Z23A 4R72A 4GOTA 1MQHA 3FXRA 3RT8A 4H8IA 3IB0A 1TFAA 5FTHA 3TPAA 4E0XA 4OTEA 3TFLA 4MFIA 5AA2B 3TQWA 4X48A 5K2XA 3UORA 3EHTA 5KDTB 3N26A 4R9GA 2FNCA 1MY4A 4U4SA 3GBAA 2F6PA 4RK2A 1LCFA 4DXBA 3FASA 3O97A 3T96B 3IOTA 2DE2A 2HXWA 1XOCA 3TAJA 5CM6A 3PPRA 4R2FA 2Q9TA 1AOVA 3W9VA 3PUYE 3K6XA 1NNPA 1US5A 3V8XB 2VD2A 2UVHA 1B0LA 2QSXA 4MH5A 1EU8A 1Q35A 1NKXA 3UGWA 4R9FA 5AA4B 4F3SA 3D4CA 1NMUA 2YJPA 5I57B 2QS2A 5B7DA 2XXTA 3KJ7A 1LBBA 1B7UA 2QL3A 1A7LA 3JYRA 1JVYA 3PPOA 3MVZA 3I6VA 1AMFA 1PC3A 4AQ4A 1I6BA 4G68A 1FQFA 4Z7EA 5H8FB 4RXLA 3WAEA 3TDJA 4H67A 4IO3A 1MH4A 1J1NA 3DELB 3OOAA 1B9JA 1H43A 3MAMA 4YKJA 4I8CA 2DE3A 1O7TA 5AA1A 2HAVA 5A5XA 4OERA 2DXYA 1MXVA 2UVIA 3THIA 1LFGA 3GXAA 4TLLB 1P1OA 1P1NA 4KYDA 4BLAA 1S7YA 2X7QA 1LAGE 4OXVA 4QFKA 1SDXA 2YPNA 2QRYA 4NTLA 2W7YA 1DOTA 2Y7KA 2IEEA 3T9HB 3DP4A 3G3JA 4IY6A 3EN3A 4N13A 3CFZA 1N76A 1Z7NE 2CZLA 1ELJA 4GF8A 3O6HA 4LQ5A 3QYTA 1OLAA 3S9LC 3K1MA 2Y7RA 2O68A 4TQUQ 3VLWA 2P2AA 2O7IA 3QSLA 1GR2A 1FTLA 2XD2A 2XXPA 1USYH 4YAHX 3S4UA 1MDQA 1MY3A 2PBWA 5TPAA 4LZ5A 3ONMA 3K01A 4U2RA 4NEDA 1B3EA 3M8UA 2F78A 4OETA 2OLBA 4LONB 4KCCA 2ZNTA 5DVIA 4X1BA 5ICQA 1QUIA 2R6GE 3TYHA 4XKNA 3I5OA 1URDA 4XKQA 3VVEA 3E13X 3H3GA 5H8NA 4JBZA 4G68B 2O84X 4ZECA 3CIJA 3H6VA 1O64A 2UVGA 4PP0A 1FQCA 2V3QA 1IZ1A 1TXFA 4GL0A 4YICA 3MP8A 1MY1A 1ATGA 1M5EA 1D3KA 4OEVA 1FW0A 4U22A 5CMCA 2AL5A 1B46A 4DZ1A 3FIRA 1PEBA 3A3UA 1WODA 3T9UA 4RYAA 3CFXA 4WEDA 1BP5A 3C33A 3FXUA 2OZZA 1ZU0A 4QHQA 4EXKA 4XTCQ 1SW4A 2AIXA 3FATA 1MDP1 5FHOA 1II5A 5I58A 4JXIA 2UYFA 3G7WA 4ZEFA 2D5WA 3S9NC 1NH7A 4JB7A 3U8QA 2CMOA 1URGA 3HO7A 4DCYA 4H65A 2F97A 4OWDA 2Y7IA 3M3FA 4GRKA 1M5FA 5L8DA 5KZTA 1NNFA 4F22A 3D4GA 3H6TA 3TZAA 3JZJA 5IAIA 1LAFE 3HSTA 1MY0A 2ESNA 5CMBA 2Q2AA 3ZSFA 4I9DA 4GXSB 4H8JA 2BJJX 4KCDA 2PT1A 2OWSA 2HEUA 5FHMA 1RYOA 4YZZA 4DXCA 2NWJA 3SERA 4DLDA 3L6HA 2FYIA 3A3CA 5I2NA 5TPAB 2R71A 3KN3A 4KYEA 5CC2A 1JETA 1SW2A 1RKMA 1N0TA 2XXHA 2ZMBA 1N7WA 4P0GA 3N6UA 2ZYNA 3CR9A 3T22A 4ZEDA 2I3WA 2ZNUA 1DPEA 4R6YA 3LSXA 4OVJA 3R6UA 4U4XA 1N3XA 4DCXA 3OO8A 1R1NA 1OVTA 3KN8A 1VFDA 3C32A 3C4MA 3M3KA 1A54A 5I59A 2E1SA 3IO4A 2I48A 3JV9A 1MXXA 4R2BA 1IIWA 2G93A 3K4UA 3IO6A 5AE4A 4LUBA 3UA8A 5L9SA 4GWOA 1MPCA 2VGQA 4F2QA 2UYEA 2Y7PA 1S50A 1S9TA 3PPQA 4PFUA 4HW8A 2ALUA 5F1QA 4WKMA 4NWCA 5FTIA 3B7DA 2V3TA 4KPTA 1TFDA 4LZ7A 4XKRA 4EQBA 2ZYMA 4HCYA 2F7BA 2I0CA 5I58B 3N5LA 3V5AA 5I56A 1B5JA 1KWHA 3KFMA 4R74A 2F34A 1FQEA 1WVJA 3KEIA 2DS9A 4Q0CA 4ZEBA 3KJTA 3SKPA 2ABHA 3IK6B 2XHDA 1D4NA 3IOUA 3HPIA 4MF3A 2I49A 4H5FA 1N04A 1PB8A 2D21A 2Q8JA 1B4ZA 3H03A 4F29A 4F31B 3QUFA 2V3UA 4PETA 5M2VA 1XHYA 4NF5A 1UTBA 2REGA 2QJEA 2O1MA 4F2OA 1PBPA 3A09A 1H3DA 3K02A 4BDOA 1QUKA 4ESXA 3OSQA 3UP9A 3KBRA 4ELPA 2WKYA 1IEJA 3T9VA 3O2AA 2E0SA 2B3BA 1H44A 5ELVA 4EXLA 1D9YA 2PYYA 3MWBA 4ONYA 3CG1A 3KSJA 4LZ8A 2FA7A 3TTMA 1FTJA 2I58A 3SEWA 1LAHE 1A40A 5JTYA 1XVYA 1QULA 1POTA 4ZE8A 4P0IA 2DXRA 4IO6A 3IR1A 3FVKA 3TTNA 3U94A 3KSXA 3QAXA 3T9XB 5EYFA 4QFLA 1FTOA 3PMVA 2DVCA 4RNSA 1SYIA 4DDDA 2OJTA 3C9HA 2PT2A 1JW5A 1ZBMA 2Q89A 1B05A 2QMXA 2O1LA 3CI8A 1M5CA 1JEUA 4EUOA 1NNKA 4C0RA 2F8DA 2RKMA 2V25A 4LP2B 3C31A 5I84A 2O6AA 4FJPA 3W15C 5I56B 1POY1 4GL8A 4H1XA 3DM0A 3C34A 1YPNA 4L17A 4LVQA 4OZ9A 5HBCA 1P1UA 3VDFA 3SEYA 1QJMA 4NF4A 3CFLA 1URSA 5LOMA 5H8HA 1MRPA 1B2HA 3MUQA 4QSDA 4O3CA 4DXUA 4PE5B 4MLVA 3MVXA 3ODBA 2Z8FA 4NF5B 1GTKA 4H6DA 3RLFE 3G3GA 1UIVA 1VR5A 4FECA 3PMWA 1SW5A 1MXYA 1P99A 3T66A 4ELOA 5CBRA 2NXOA 4ELQA 4LA9A 2A5TA 2XXYA 3TEPA 4N07A 1GVCA 3R7XA 4ZE9A 3TKDA 3OMBA 3SETA 4IO5A 3K6UA 1DPPA 1TWYA 4E0WA 3QIMA 4QFOA 5HPQA 2H5YA 4F1UA 5HM4B 5JTYB 3LSWA 4NF6A 4OMBA 2KLFA 1GGGA 1QKAA 1XS5A 2XXQA 1ZLQA 5IKBA 3MPLA 3MZ9A 4KD5A 1SI0A 4R6KA 2DWAA 2QMWA 4G4PA 3LSFB 5DEXA 4F19A 2G29A 3FVNA 4RY1A 3FUZA 1EH3A 3GLBA 1LB9A 2P1SA 4Q30B 4ESWA 3ZS6A 1FQAA 4EQ9A 4RPNA 2ONKE 3VVFA 4F1VA 5CRYA 1MM7A 1UIUA 4Z0IA 3CRBA 1B58A 2XD3A 4BDNA 2ZYOA 1MXZA 3W9WA 1Y1ZA 1ZTYA 3TTLA 1AL3A 1NH8A 3IL1B 4K3FA 3CVGA 3S2VA 3RN8A 1B3GA 5KCJA 5J1DA 2XXIA 1Q1KA 3FV1A 1VFEA 4G77A 4R6HA 4OYVA 2QS1A 3OENA 3CG3A 2XXWA 3TELA 5A5XB 3IB1A 4YMAA 1SVXB 3PMXA 4TOZA 4IGTA 3U93A 3EF7A 3PPPA 3SEVA 5AA3A 2V84A 3TUSA 4IO2A 4F3GA 3C36A 3EQ1A 5H8QA 3E3KA 1B52A 1MG1A 4OENA 3N6TA 3V83A 4PFYA 1OIBA 4IO4A 3AXFA 1UTHA 2HZKA 2Q2CA 4YU0A 3IORA 4GVOA 3OSRA 1Y3PA 3BFTA 3RTWB 5K2YA 3PU5A 1SI1A 4MBPA 3K6VA 2HFBA 4QRZA 2GHAA 1JQFA 2RC8A 3G3HA 3MVYA 1JNFA 1I6QA 5DVJA 5JEIA 4G8HA 5I2KA 2M8CA 2HAUA 5AA2D 3G3FA 1BTJA 2ANJA 3KOSA 5TP9A 3PD8A 3EHSA 2F7CA 3IOWA 1OQHA 4IGRA 3VE1B 3FVOA 2HQ0A 2RCBA 3KZGA 4EDPA 4F1YA 4RJZA 3LBSA 2IA4A 2QS4A 2OBGA 4ND9A 3QXMA 4JDFA 3K1PA 3T93B 3O9PA 3FGSA 1QW0A 4JWOA 5H8NB 4FE8A 4HS7A 3H6UA 4BDRA 3SDFA 4O3AA 3SEXA 2B65A 1EZOA 1TT1A 3RTFB 3B6QA 4UACA 1B3FA 5KDTA 1HSEA 2ZXTA 2A5SA 1O63A 3PGFA 4G2ZA 3ZKKA 4EQ7A 2X7PA 3GZGA 5DTBA 2RCAA 4XKPA 4YKIA 1R6ZA 1MQIA 4H0WA 2XXUA 3O29A 1Y9UA 3TTKA 4YMBA 4OFOA 4ZZAA 1IQ7A 1FQBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PFYA 3MQ9A 2DE4A 3QUJA 1P1WA 1MY2A 3EHUA 4OESA 2XA5A 5I5PA 4JWXA 1VSOA 3OO6A 4FIMA 5AA4A 4GX4A 1H76A 2I3VA 1FTKA 4U1ZA 3OEMA 1XT8A 3FBPA 5I57A 3M3LA 3KC1A 2V93A 4MLQA 4NE4A 1B32A 2I6EA 1FPFA 1AWBA 1FPBA 1FQDA 5CI5A 3UK4A 5ITPA 4FORA 3Q26A 1EZPA 3E4RA 1WDNA 3LR1A 3BBRA 3GYYA 2P0SA 1D9VA 1HSJA 1FBEA 1DSNA 4R75A 3BFUA 4BDQA 1A8FA 3TQLA 2UXAA 1AH5A 3EPEA 3OO9A 3Q28A 1B4HA 1BKAA 1NL5A 1MPDA 4G8MA 4G8NA 4M1VA 4LATA 5I2NB 3HHGA 2X26A 1MXUA 3LC8A 3K00A 1QUJA 3VLUA 4YB5A 1IMFA 2GH9A 3PUXE 1DTZA 5EHMA 3U92A 1NNTA 2D3IA 2H4IA 1FJ9A 3LSLA 4PQJA 4DI3D 4PFWA 1B3LA 1QVSA 2RF1A 4QF9A 5ISUA 4OQOA 1OVBA 3RQTA 3TCHA 1B5IA 3IJOB 4F18A 4G68C 4U21A 4Q5TA 4LN5A 4RA1A 2THIA 1LGBC 5I59B 1XC1A 3NOHA 3P7IA 2Z22A 3K6WA 1JVXA 4IY5A 4F39A 2AYSA 3O28A 3LUZA 3PUWE 4UA8A 3USDA 4N15A 1IMCA 3MP1A 2LAOA 4M4GA 2F7AA 1ANFA 2L5VA 4ZDMA 3FZVA 2B3FA 5CMMA 3G3IA 4ELRA 4AB6A 4BDLA 3FJ7A 3FJMA 2DQVA 3H6WA 1XVXA 1A8EA 4FAJA 4F3PA 3ZKLA 1KZ8A 1MXWA 2Z8EA 4C1UA 2Y84A 1MS7A 3KOTA 3O6GA 5ICTA 3VV5A 2OWZA 4P47A 4PFRA 4YB7A 1MQDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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