1FAAA

Crystal structure of thioredoxin f from spinach chloroplast (long form)
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
b'LELALGTQEMEAIVGKVTEVNKDTFWPIVKAAGDKPVVLDMFTQWCGPCKAMAPKYEKLAEEYLDVIFLKLDCNQENKTLAKELGIRVVPTFKILKENSVVGEVTGAKYDKLLEAIQAARS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of two functionally different thioredoxins in spinach chloroplasts.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN F
source organism Spinacia oleracea
molecule tags Electron transport
total genus 36
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1faaA00
4RI7A 4DSSB 4L5OA 4D73A 2YP6A 2LS5A 3H93A 1U87A 3PINA 5FHIA 1V40A 1UC7A 2WB9A 4HDEA 3MWHA 2CVBA 2GQKA 3KM6A 3GIXA 4HJ2A 3IXRA 4OFTA 3W6GA 5CAXA 1K0AA 5ECSA 1AQXA 3L4NA 5J5NA 1A2JA 2JZRA 3TJFA 2LQQA 1ERTA 4F03A 2VD0A 2IN3A 3LJRA 2X8CA 1J0FA 3ERWA 3N5OA 4EO3A 1HQOA 4P3YB 1AQWA 4KB3A 4QL7A 4DVCA 1DE1A 3VLNA 1VF4A 4GSNA 1AC1A 3R2QA 1EOHA 4MLYA 1WMJA 1CQHA 2FY6A 5ECPB 4RQRA 5AGYA 3QR6A 1OE8A 2JSZA 2I4AA 1B4PA 4E8EA 2LEGA 4KCEA 2V6OA 3IBHA 1FG4A 2EC4A 3CSIA 4ZBDA 2XBIA 3OR5A 4NMUA 4XTSA 3EMXA 1GULA 2FWEA 1R4WA 4IP6A 4Q5NA 1Z9HA 1W4VA 4KGIA 4V2NA 1PMTA 3P90A 5CRHA 2XHFA 4KNDA 4DSQA 5B8AA 2YOIA 1TTZA 2LNTA 2XPDA 2KP2A 4PURA 3WT2A 3VK9A 2CX4A 1M2BA 1O7UA 2C0FA 2GQMA 3FR6A 2KLXA 3QD9A 3ZVJA 2HZEB 4KE3A 3DGQA 3HD5A 2G0FA 3TUEA 4PGTA 2FWHA 2HI7A 1KEBA 1XCCA 1F6MC 4CW9A 1HYUA 20GSA 1FB6A 1GRXA 1XW5A 5IMAA 1KTEA 4XIHA 3F4TA 1J9BA 4GSSA 2F51A 3G7JA 5AIXA 1G6WA 3EINA 2H30A 5G5FA 3DXBA 2I3YA 1OKDA 3HVVA 1FOVA 2C4JA 4EDZA 4EF0A 1V9WA 2JSYA 2M80A 2Z9SA 5JCUA 2QSIA 5DQSA 3M1GA 2GLRA 1GLQA 1JFUA 2DC5A 1MDJA 2HFDA 1J08A 5ELGA 5CNWA 2VUPA 5KN0A 1ZZYA 1TP9A 2CV4A 3H8QA 2GT5A 1NM3A 1K0MA 2KOKA 2B1LA 5CRWA 2FLSA 5HR2A 1JZWA 2FA8A 4POLA 5L71A 2LTKA 2B5YA 2O7KA 1G7EA 3GFKA 3BOAA 1BQ7A 2DMMA 2K6VA 1R5AA 4IS0A 3FKFA 3D0ZA 2VL2C 5ENUA 1JLWA 2B5XA 2VL2A 1UN2A 2GS3A 1EP8A 5CREA 4BWQA 1M9BA 3CSJA 1YY7A 4ZBBA 3TOUA 2OJLA 4LLRA 1I5GA 2A2RA 2MMNA 2JZTA 5D73A 4ZILA 4PUAA 4IQ1A 3M9JA 4J56E 3IAS2 4IHUA 4PX1A 1F9MA 1TRVA 3F8UA 2WS2A 1U88A 2GZPA 1ZGNA 2K18A 1JZRA 4I2TA 2HE3A 1DE2A 1USBA 2K9FA 4OO4A 4F0CA 2WZ9A 5ECOB 2XBQA 2VOCA 2WCIA 4G2EA 2DJJA 4JR4A 2H76A 14GSA 2VL3A 3A2XA 2B1KA 3Q6OA 2X8HA 4WF5A 3UBKA 3W8JA 2RIIA 5ECRB 1S3CA 3HDCA 5IM9A 4I97A 1OC3A 1SKRB 1AQVA 3FZ4A 5DALB 1SD8A 2LNSA 4RQXA 1B48A 1HNCA 2CVKA 4NWYA 1VRSD 1MD3A 2J23A 3QFBC 1EV4A 3TKSE 5INYA 5JCGA 1XWAA 2D2ZA 19GSA 4NV5A 2H1GA 3M8NA 1OYJA 2JU5A 4NAXA 2AV4A 3C1SA 2IFQA 4IELA 3P7XA 2FCHA 1HD2A 1O8WA 2IMKA 3DVWA 1ZCPA 1F37A 4WEYA 1RK4A 1SL1B 3ISOA 2AAWA 1H4OA 4ZBAA 4N10A 2RUFA 1BG5A 1H75A 2IWTA 3HJMA 1TU7A 2G2QA 6GSTA 2QGVA 1GSQA 1YF0A 3QFAC 2DIYA 5B8BA 2H71A 3FR9A 4NHWA 2PBJA 4TN8A 4FYBA 3GH9A 4X1UA 1M0UA 1LU4A 2I81A 3UAPA 1M9AA 4K7OA 4K2DA 3GX8A 4F9ZA 2H0IA 3C8EA 1TXXA 1XIYA 1EWXA 3LQ7A 2VCWA 3H1NA 2NVLA 3I9V2 3TKSC 4AJ8A 2C3NA 5GAPD 5ID2A 3PGTA 4L8EA 3TKSA 2O8VB 2V41A 3NZNA 1X9MB 1NW2A 2HSHA 1ZL9A 1ABAA 1ZOFA 4ECCA 2WRTA 3ZLPA 3NIVA 3ZMLA 1HNAA 3GKKA 3KD0A 5D8IA 2RM6A 4KH7A 2IIYA 2HSYA 3TJKA 4ZB8A 3FW2A 2DLXA 4OD7A 2DBCA 5H5QA 1QQ2A 3DIEA 2JACA 4D73B 1XWKA 4G9HA 5D96A 4TXOA 1X9WB 4KW6A 4OCFA 3GSSA 2M72A 2H19A 4K0GA 2RLIA 1XPVA 3ZVJD 1SKWB 4HUAA 2OE1A 2REMA 3DWVA 1A8YA 5ECKB 2YNXA 3TB2A 3VI7A 2H73A 4TKYA 9GSSA 2IPAA 3VWUA 4EUYA 3QCPA 5A4VA 1KBNA 3TJBA 3KP9A 1DSBA 1XOAA 1OC9A 4V1Ap 3Q18A 2H6YA 4E8HA 1Y25A 4LL4B 1GSDA 4I6XA 4CHSA 3FR3A 3ZL5A 3QAVA 1YJ6A 3F9UA 4GWRA 3ZMKA 1GUMA 1B9XC 3GKMA 4EL1A 1R26A 6GSWA 4YH2A 2EIRA 1DUGA 1PD21 3BBYA 2LQOA 3G9BA 5ELAA 3KMOA 4EC0A 1SD9A 5IMVA 3ZYWA 2P0GA 1QK8A 3HCZA 3N9JA 1ON4A 3DVXA 5COHA 2JZSA 3FZAA 5IIZA 4RI6A 4AGSA 3I69A 1LBKA 4OFNA 3HY2A 4X0XA 4F2IA 4KAEA 1K3LA 2R3XA 2V2GA 3ME7A 3APQA 4GRFA 4ZL8A 3F63A 4X43A 4N11A 5GSSA 4Q5RA 3TJGA 1GTBA 3RDWA 1SKSB 2A4VA 2R37A 3HA9A 3KH7A 3F3QA 3A3TA 1GWCA 2H66A 1AAZA 3TRQA 3J7Yb 4ZB9A 1NHOA 2F3MA 4YAVA 2OADA 2H1DA 3TGZA 4LL1B 1VF3A 2VLTA 3GKXA 6GSSA 2K8VA 3GV1A 3RHBA 1X5EA 2C0GA 2H1BA 4O32A 4KCAA 3IV4A 4PQ1A 1GLPA 4TR1A 5DJLA 5ECHB 2E7PA 2R6KA 2L57A 1O8XA 3ZIVA 2DJ0A 4POMA 3MAKA 1YQ1A 4POKA 4Q5QA 4MMMA 5H5SA 2MYGA 5IPHA 3GL3A 1YF1A 5G5EA 5AIVA 5IOXA 1O81A 3KMNA 2FNOA 4KUNA 2AHEA 4FYUA 5DAKA 3IRAA 1V2AA 1QMVA 5IMCA 3APSA 4ZXGA 4DSSA 2XPEA 1M99A 3GRXA 1Z6NA 3DYRA 3P2AA 2L59A 1TI3A 3ERGA 3KZQA 1GTAA 3A5WA 4ZL7A 3UJ1A 2HYXA 2PN8A 4ML1A 4IGJA 5HR0A 4HEA2 4JE1A 3WGEA 1SJZA 2H1AA 3I6AA 4L0UA 1QGVA 4TVEA 5ECIB 5JWOB 1YKCA 4MJBA 1FAAA 1PKWA 5CRDA 3U5RE 3EURA 2MBSA 4O5RA 2TRCP 3C7MA 1TU8A 1JLVA 3CRTA 4WETA 4HS1A 3F3RA 1JZOA 1EEMA 1OC8A 3KIJA 4ECBA 3F6DA 4WKWA 2H8LA 1WWJA 2ALBA 1B8XA 5LD0A 1WIKA 2KUCA 3D4MA 4I5QA 2P31A 2BMXA 2VCZA 4Z7XA 1G0TA 5HFKA 4IJ3A 1GSUA 1QXHA 1F3BA 1SL0B 3WD6A 4TXVA 3EU4A 1MTCA 2LRTA 3GNJA 4QQ7A 1WOUA 4J57E 1K0OA 2YV9A 1ERVA 2N5BA 2VO4A 1SL2B 2CZ2A 1Z3EA 1TJDA 1EP7A 4K9ZA 1GTUA 3HJPA 3CBUA 3F4SA 1PRXA 3D5JA 1M7TA 2DJKA 2VCQA 4HI7A 2YN1A 5DJMA 3PR8A 1KNGA 2ZUPA 4N0VA 1XZOA 2GZZA 2B7JA 3ME8A 7GSSA 3HHVA 3DKSA 2B5EA 2HZEA 3H79A 4FO5A 3CSHA 2H0HA 4POBA 4JEDA 3EYTA 3GMFA 4O92A 4IBPA 2R5GA 1BYEA 5D9XA 2R2JA 3F4RA 3L9VA 1X5CA 1NSWA 2IFQB 4DEJA 3TJJA 4EE0A 3LXZA 1XVQA 3IA1A 2CZ3A 2LJRA 2DJ2A 3IHQA 4XS1A 2ZCTA 5IOWA 1AUCA 1HNBA 2TIRA 5G31A 2EIQA 1PA3A 2IMDA 5FWGA 3F6FA 4GF0A 2L5OA 2X64A 1K3YA 3C73A 1ZYEA 4OMVA 2N5FA 4BL7A 1BAYA 3J7Yk 1EGRA 1YZXA 5CP1A 1PL2A 1T4ZA 3ERFA 4MF5A 2OKAA 1K0DA 4KSOA 3FRCA 1E2YA 3IR4A 2OE3A 4L5LA 1V57A 2OBIA 4JBBA 3TOTA 2HT9A 5KEJA 3ZFLA 11GSA 3EE2A 3FZ5A 3UL3A 5G30A 3GTUB 4IW9A 2B6MA 5KN3A 1MDIA 1AIUA 5ID2B 2ZNMA 5ECQB 1GNWA 5ECMB 2PMTA 1F2EA 3CXGA 4F0BA 3D22A 4MF6A 2VIMA 1GUKA 2CVDA 2IJYA 5FT3A 2JL4A 2AJQB 1VF2A 1Z7RA 2LRCA 3O6TA 3MNGA 3I43A 3ZTLA 4IJIA 5IO2A 2XC2A 2IL3A 1T4YA 1YDKA 1TRSA 1Z7PA 1PN9A 5F0GA 5G1LA 4ML6A 4MK3A 5LCZA 1R7HA 4IVFA 5F06A 5CYYA 3L0HA 4ID0A 1G7OA 1N8JA 3M0FA 1O85A 3ZFBA 2L6CA 1O6JA 1GNEA 1WPIA 3QAWA 4KA0A 5G1KA 2WFCA 2MMZA 2OACA 1XOBA 2E2MA 4DSRA 1LJRA 3CTGA 1A0FA 5GZZB 2IMIA 4ZL9A 1R5PA 1PX7A 2YJ7A 4QL9A 1A24A 5C00A 3WGXA 1IYIA 1GH2A 1O73A 2GZYA 4K7IA 1X9SB 2YWOA 1TRWA 1FO5A 5LNKe 2C1YA 5F8BA 3LG6A 2H6XA 5IPGA 1ST9A 2WDUA 2P5RA 3US3A 3GL5A 3UBLA 1JZDA 3BJ5A 1A23A 2E2GA 3M3MA 1YKAA 2CAIA 4FIWA 1M2DA 2H70A 5J9BA 4MCUA 5DCGA 4K8MA 4F82A 5DALA 5IQYA 1IYHA 3AY8A 4BWSA 2GSSA 5H5RA 4IQAA 2B7KA 4HQSA 3W8SA 5EVOA 1SYRA 3RPPA 3FK8A 5IO0A 2YPMA 1K0BA 4MZBA 3DMLA 3KGKA 1V58A 3FHKA 3UVHA 3UMAA 4NHZA 1PKZA 4HQZA 1UA5A 1XVWA 1A8LA 3QAGA 1FVKA 5DDLA 3ZIJA 1BJXA 1GTIA 1SYXA 2DMLA 5GAND 3RAZA 1NHYA 4TR0A 4KDYA 2O89A 3WT1A 1TW9A 5F05A 4JRRA 1K0NA 3LEFA 5HR1A 3QMXA 1W89A 4XCSA 16GSA 8GSSA 1A2LA 3FEUA 2LV3A 2YCDA 4K7NA 4LMVA 2K8SA 1S3DA 2KHPA 4MH3A 1Q98A 2PPTA 4AJ6A 4MPGA 2TRXA 4IN0A 5GSTA 3L9SA 3LORA 2VCTA 4XHMA 3TKPA 2GQLA 5EY6A 4NV2A 3UIWA 4XS4A 3G7YA 3K8NA 5ABRA 2WJUA 2GVPA 1FHEA 1GUHA 3HVXA 4BA7A 4BPYA 1GSYA 2YWIA 5DVBA 1GL8A 3BCIA 2H01A 4PUFC 4XS6A 4XRAA 3IK9A 2H72A 2C0EA 2ON5A 4Q5FA 2P5QA 5J3RA 4G10A 3JCML 2FWFA 1WJKA 3VWXA 2C3TA 3G7IA 1CQGA 4MDCA 2GGTA 1Y6EA 5AISA 2VCVA 1EZKA 2DJ3A 13GSA 1SK1A 5CO3A 1RW1A 3GH6A 5HQPA 2GSQA 1VF1A 2VAFA 5G2ZA 4WF4A 1GSEA 2FD3A 1G6YA 1T1VA 3FZ9A 2PERA 3H4KA 1EV9A 3VFIA 4KX4A 2IMEA 1BEDA 3M9KA 1VGLA 3C1RA 4TR3A 3ZREA 3LSZA 2JADA 1U3IA 2YV7A 1GP1A 1TI1A 1T00A 3GUSA 5EPFA 1FW1A 2YANA 3O3TA 4NXIA 3TDGA 1Q4JA 3GX0A 3O76A 2AB6A 1GSFA 3HZ8A 3KEBA 3HXSA 3BCKA 2LJKA 3FY7A 1RQMA 2R4VA 3IK7A 3A2WA 2HNLA 4GSTA 3IAM2 4BVYA 4ECJA 4K1FA 2ON7A 2V32A 2ES7A 3S9FA 4PQHA 4ILFA 1THXA 2X8GA 3GKNA 4HZ4A 5CRGA 1QFNA 2EIOA 4J2FA 3LXTA 2PVQA 18GSA 2LSTA 1YEXA 3LFLA 4BVXA 1DBYA 4WXTA 4MF7A 1F3AA 3UOMA 1PGTA 2AYTA 3L9UA 4HJMA 17GSA 2F9SA 4I2UA 4I8BA 3C71A 5DBQA 1X0RA 2C8UA 3FYGA 3QDNA 5JWRB 5A5KA 5ECNB 2NTOA 3KTBA 1XW9A 1TK5B 4CDOA 2RUEA 2C80A 1EEJA 1TDIA 1T7PB 1T8EB 2LUSA 2E0QA 4MJAA 2O85A 2DSAA 1U6TA 2A2SA 1WP0A 2BJXA 3U6VA 3HZ4A 4YQVA 5A4WA 3KP8A 3WGDA 3DD3A 5A4UA 3TKRA 5KN2A 1PX6A 1C72A 2RM5A 3ZZXA 1XFLA 1SU9A 3GSTA 4LA1A 3D6IA 3EC3A 4MA9A 4O7HA 3VURA 1URMA 1TKDB 3EWLA 1A2MA 4MJEA 1OVNA 2GSRA 2H6ZA 2CQ9A 2X99A 5E59A 2LKUA 2FA4A 2NDOA 3TRXA 4PXOA 4MP4A 22GSA 2I1UA 2N5AA 3CMIA 3ED3A 1THOA 1Z6MA 3PH9A 4TOPA 4OWYA 4WR5A 4YQMA 4JR6A 2HRNA 5C04A 3GA4A 4V2LA 1FVJA 1ZYQB 4AF2A 4TW5A 2MZCA 2AUVA 2NPBA 2F8AA 2PGTA 4N30A 1GSSA 2CT6A 4GQFA 4V2MA 2NBSA 2PWJA 3DEXA 4HU9A 4HZ2A 3APOA 4L0WA 4MJCA 1Z5YE 3UVTA 4ZIJA 2VLVA 2YZUA 1TK8B 1SJIA 2CAQA 2VD1A 4EDYA 1XBSA 2L6DA 5HFGA 1UVZA 6GSUA 4ACSA 1TOFA 3KH9A 5IMDA 1PSQA 2H75A 4IP1A 5F07A 2FUG2 3KCMA 3UEMA 1SK2A 4N0ZA 5EL8A 4ULXA 5D9VA 3IPZA 4EKZA 4HU7A 4KSMA 1K3OA 5JCWA 2M46A 1XW6A 2VM1A 1EOGA 5DQYA 2VM2A 5ECLB 3ZITA 2QKEA 5B6MA 2DIZA 1XWCA 2GDRA 4YQUA 4ZB6A 2WULA 6GSXA 2VCXA 4ISDA 3ZRDA 2HLSA 3LGCA 3VPQA 1OE7A 3D21A 3LYKA 10GSA 5B7CA 4EVMA 1E6BA 5AN1A 1ILOA 3WYWA 2FGXA 2CX3A 3CTFA 3GURA 3E0UA 3QPMA 2YWMA 1A0RP 1MDKA 2GTUA 2YZHA 1AXDA 1TK0B 2VL9A 1EGOA 4GCIA 4WBJA 1QUWA 2KP1A 3IE3A 3MSZA 3EMPA 3HVSA 5KN1A 4V1Ag 1BX9A 2H74A 2L5LA 1SENA 1WE0A 5J9CA 4MH2A 4AJ7A 4TXOB 4MZCA 2PVOC 4OFMA 4MZWA 3HYPA 2OE0A 4EXJA 3L78A 3HKRA 1V98A 2L4CA 2YJHA 3EVIA 4XRDA 2FWGA 1M2AA 4K6XA 1XXUA 2IMFA 3CRUA 1JHBA 5J4UA 4KDUA 3CYNA 4GQCA 3KXOA 4GXZA 4NPBA 5IMFA 2I9HA 3SBCA 1S3AA 5HFIA 1MEKA 2C0DA 4K0NA 1FB0A 1OC9B 1X5DA 1SJ6A 3E9JB 3TKQA 2WGRA 3F0IA 3HJOA 3IC4A 5HR3A 4KDXA 4JZQA 5IMZA 3Q19A 2HZFA 4MPFA 3UARA 3GN3A 2PU9C 1I9DA 2PUKC 3Q74A 12GSA 4LMWA 3IOSA 3GYKA 1U3AA 2GSTA 3RHCA 3KJYA 4TR4A 2LRNA 3GTUA 5D9WA 3VI5A 4WR4A 2HRFA 1ZMAA 3V1WA 3KTLA 1XWGA 4XS4B 6GSYA 4IKHA 2BTOT 4G19A 4H86A 1TRUA 1OAZA 1ERUA 2CA8A 1ERWA 2J9HA 3DRNA 2O87A 2H0GA 2VLUA 3GHAA 4PQIA 2MMOA 1ACVA 1PQNA 1B4QA 3EU3A 3NOFA 2V6KA 4JU5A 5B6NA 2C3QA 5JWQB 3IDVA 5E4WA 1B9YC 2YWNA 3VWVA 1N2AA 1MD4A 2B3SA 3D4TA 1T3BA 3MDKA 4WBRD 3LWAA 1ML6A 3BD2A 5J41A 2F8FA 5DCHA 2GT6A 3TRPA 1SK0A 2DJ1A 1WRYA 4PNFA 5D93A 3LYPA 2OBKA 4GLTA 4RUVA 2FHEA 4PNGA 4YAPA 3VWWA 2LJAA 2QC7A 3E3EA 3P8WA 4FH8A 4MABA 1K0CA 1XWBA 1YEPA 4TRXA 4GTUA 4OO5A 4TR1B 4OCEA 2HXKA 3RBTA 4HOJA 4FYCA 3RPNA 3TCOA 5D9TA 2L4QA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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