1FAAA

Crystal structure of thioredoxin f from spinach chloroplast (long form)
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
LELALGTQEMEAIVGKVTEVNKDTFWPIVKAAGDKPVVLDMFTQWCGPCKAMAPKYEKLAEEYLDVIFLKLDCNQENKTLAKELGIRVVPTFKILKENSVVGEVTGAKYDKLLEAIQAARS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of two functionally different thioredoxins in spinach chloroplasts.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Spinacia oleracea
molecule keywords THIOREDOXIN F
total genus 36
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1faaA00
3QPMA 3EURA 3LXTA 4CDOA 2DJJA 3IAS2 1R5PA 2B7JA 3RHCA 1EEMA 5CRDA 1GL8A 3BCKA 5B6MA 2AYTA 1GTBA 2I4AA 4HJMA 1V40A 3QR6A 1XFLA 3MDKA 3CRTA 4ZB6A 4PNFA 1T7PB 2PWJA 2X99A 1O73A 2VLVA 3D22A 5D9TA 2YN1A 1V57A 5A4VA 3IRAA 1TXXA 3L9UA 2V6KA 1NW2A 4IJ3A 2LJRA 13GSA 2HZEB 3P7XA 3IOSA 2I9HA 3D6IA 1XWBA 12GSA 1ZMAA 3VWWA 4KSMA 1QFNA 4NMUA 5DALB 1K0CA 6GSYA 2L57A 1X0RA 2AV4A 2QSIA 3LG6A 2HSHA 2P31A 3GN3A 3HVSA 1XW5A 2OA7A 5CRHA 5H5QA 4KDXA 3F3QA 1UA5A 4XRDA 4O32A 1VF3A 3F4SA 3CSIA 3L0HA 1TI1A 4MLYA 1XOBA 2B5XA 1YEXA 4ILFA 3EE2A 1GSEA 4Q5QA 1U3IA 1W4VA 2GQMA 1VF4A 3A2WA 3H79A 3KIJA 4MF7A 5CRGA 1DE1A 2VCVA 3E9JB 2PUKC 2N5AA 2WFCA 2H72A 3FKFA 4XS4A 5IPHA 2ES7A 4I8BA 10GSA 4J2FA 3LORA 3QFBC 3ZZXA 2PVQA 2FY6A 1B4PA 2GSRA 2GDRA 1XPVA 3RDWA 1GTAA 3TJJA 1PQNA 1UN2A 1ZOFA 1AUCA 1O6JA 1SU9A 4BA7A 2O87A 4G10A 2E2MA 4KCEA 1PN9A 1OAZA 4N0ZA 5GAND 2B5EA 1X9MB 3UAPA 1GTIA 1HD2A 4YQMA 4AJ6A 2AUVA 1CQGA 1E6BA 5C00A 3F4TA 1LBKA 2CVBA 1O85A 4GXZA 1HQOA 1JZDA 5E4WA 4K9ZA 4Z7XA 1WPIA 4POLA 1TTZA 2IWTA 3Q18A 2B1KA 1Q98A 4F2IA 4BWSA 2HLSA 5GAPD 2ZUPA 3ME8A 4EDYA 3P90A 3I69A 4HQZA 4AGSA 2L5OA 3BJ5A 3QCPA 1H75A 3GTUA 3J7Yk 3HCZA 5ECLB 2VCQA 3GRXA 4IP6A 4IKHA 4HOJA 4BVYA 1G7OA 2V2GA 3ED3A 1WRYA 2OE1A 2PPTA 4MK3A 3FY7A 2H75A 3IAM2 4RQXA 1HYUA 2H71A 4JEDA 1S3DA 2PERA 3LYKA 1WP0A 3CYNA 5ECHB 5L71A 3TKSA 2DJ2A 4YAPA 3M1GA 4K7NA 4V1Ap 4FYUA 5G30A 2BTOT 2NTOA 2C0GA 3ME7A 5B6NA 3HD5A 2C1YA 2P5RA 4K8MA 2GQLA 5J5NA 3ZITA 4F82A 5CNWA 3VK9A 5F8BA 5IO0A 4EKZA 2DJKA 4WEYA 1T8EB 4RI7A 4MA9A 2OKAA 1QUWA 4MZBA 3LGCA 2M80A 5HR2A 1EWXA 2O7KA 4MH3A 1ZCPA 1FVKA 1G0TA 1X5EA 2RM5A 1PL1A 2F8FA 2TRCP 2PMTA 1JLWA 3H93A 5ECKB 1TOFA 2GTUA 3F8UA 3TJKA 4MJCA 5KN1A 1VF1A 4KX4A 1Z6NA 2HRNA 1O8XA 3LQ7A 4MDCA 4L8EA 1U6TA 4KNDA 4H86A 4EDZA 2X8GA 3IK9A 5A5KA 5J9BA 1PGTA 1KTEA 4P3YB 4MJAA 5KN0A 2JZSA 3Q19A 1EP8A 4WBRD 2GGTA 2ON5A 3IA1A 4X1UA 1A2JA 1YKCA 19GSA 1QQ2A 1WOUA 2JZTA 2XC2A 2AHEA 2L6CA 3PR8A 1G7EA 1A2LA 5DQSA 4HI7A 4HDEA 2C8UA 4BWQA 2DJ0A 4OCFA 3LEFA 4PXOA 2YCDA 3APOA 3HYPA 3KP9A 5F07A 4DSRA 4ZIJA 1FOVA 1GWCA 2WULA 3TKRA 4JZQA 1T00A 3FYGA 1SENA 1BEDA 4ZL8A 1GSUA 1XVQA 4ZB9A 1HNCA 3TKSC 1THXA 9GSSA 3L9VA 4MJBA 4G19A 2LJAA 4KCAA 1FB0A 3WGEA 3IHQA 4ZXGA 1C72A 1JLVA 5EPFA 5IO2A 2FUG2 2PU9C 1K0NA 4V1Ag 2H73A 3QD9A 3HJOA 2TIRA 4MP4A 2O8VB 5IOXA 1YDKA 6GSWA 4N30A 1PD21 2F51A 5IM9A 3H1NA 4TN8A 5EY6A 1B8XA 1LU4A 2O89A 1T4YA 3QFAC 1B48A 1Y25A 5ELAA 2LQQA 1E2YA 1PSQA 4OFTA 1TRSA 2R6KA 3O76A 4MMMA 2H6XA 4K2DA 1TU7A 1XWGA 2JL4A 1G6WA 3FK8A 4LL1B 2K8SA 2H6ZA 2L59A 4I2UA 3RPNA 5ELGA 1O81A 1ZYEA 5IMDA 4GSTA 2LV3A 2GSQA 4KUNA 22GSA 3KMNA 4IJIA 2AAWA 5ECOB 2OJLA 3P2AA 1ERUA 2VAFA 5D9XA 5HR1A 3GA4A 1I5GA 2MBSA 1OC9A 3WGXA 3KTLA 3I9V2 3HJPA 5G1LA 4HEA2 4NXIA 5FHIA 3AY8A 1F2EA 3GSSA 2BMXA 1TJDA 1U3AA 3C1RA 4I2TA 3RBTA 5D93A 2CQ9A 2EIOA 3RHBA 4N10A 3TGZA 1AW9A 3FZAA 5HFGA 6GSTA 2JZRA 5INYA 3QMXA 1ERTA 1SL1B 2G0FA 2HXKA 3BD2A 2RUEA 5ABRA 2VD0A 1RK4A 2F9SA 3D21A 2VL2A 2PBJA 1EGOA 1M99A 3V1WA 3UEMA 4DSQA 1FAAA 4OD7A 4CHSA 2PGTA 4ML6A 3F4RA 1ABAA 4PNGA 3GH9A 5J4UA 3DWVA 3IPZA 1A8YA 3GKNA 3BCIA 1RQMA 1OYJA 2VCZA 4RQRA 1A23A 3HXSA 1NHOA 1T4ZA 2CX3A 4POBA 3F0IA 3MWHA 4EXJA 1M9AA 2VLUA 3EU3A 1TK8B 3WYWA 2V6OA 1A24A 4MF6A 2QC7A 4FIWA 1V58A 1DSBA 3GNJA 1EOGA 4EVMA 3IE3A 1GLPA 4POKA 1ZL9A 2DJ1A 1YY7A 4MCUA 3IC4A 2G2QA 4KW6A 3ZFLA 4ZBDA 3TRPA 6GSSA 5CO3A 1RW1A 2ALBA 2H30A 4POMA 2F3MA 3LSZA 1T3BA 1SKWB 5DCGA 1DE2A 3ERFA 3L9SA 1SJ6A 3G7JA 3F6FA 3US3A 3O6TA 4HUAA 4RI6A 5GSTA 3QAGA 3GH6A 1X9SB 3ISOA 2MBTA 5GSSA 3M9JA 5IMCA 3F63A 4EUYA 4EO3A 1N8JA 1DUGA 4AJ7A 2L4CA 1GP1A 4FYBA 1ERWA 1U87A 4J56E 4ML1A 3NOFA 4WBJA 4QL7A 3QOUA 3ZTLA 4X43A 4TR3A 2KHPA 1ON4A 4HQSA 1AQWA 2IJYA 3TB2A 4MPGA 1YF1A 3NIVA 5JCGA 1IYIA 2J23A 3HVVA 4GSSA 4HU9A 4Q5FA 5IQYA 2IFQB 3ZIJA 2YWNA 1USBA 2DMLA 4O5RA 1V2AA 1Y6EA 5G1KA 4QL9A 1F37A 1K3YA 3HZ8A 3K8NA 4F9ZA 5JCUA 3FR9A 2C0EA 1SK1A 2L6DA 2VCXA 1K0AA 3A3TA 17GSA 1PKZA 5FT3A 2LRNA 4TOPA 3ZFBA 3LFLA 1O8WA 2R37A 4GQFA 4F0CA 4TR4A 3APQA 2FA4A 1YF0A 1HNBA 4ZBBA 3VPTA 3ZVJD 5H5SA 5ECSA 3KCMA 2LRTA 14GSA 1GRXA 3VFIA 3APSA 4WF5A 5AIVA 3FRCA 1QXHA 4L0WA 1X5DA 1ML6A 4ZL7A 2V32A 3JCML 3RPPA 2MMNA 1Z7RA 4GSNA 3UVTA 4N11A 1BG5A 3MAKA 2M72A 4NWYA 4KAEA 2JU5A 1BX9A 4DVCA 4IQAA 2R5GA 4E8HA 3A2XA 1FO5A 3GHAA 4HU7A 4PUFC 5ECNB 4XCSA 2FD3A 2FGXA 3HKRA 2HZEA 2XPEA 1NM3A 2E2GA 5IMAA 1URMA 5HQPA 2P0GA 2H8LA 1SKRB 2C80A 1XXUA 5DALA 3EWLA 3TRXA 1GUMA 3DVXA 1WWJA 2YNXA 5DVBA 2ON7A 1DBYA 4LLRA 4IVFA 2FLSA 3W8SA 4J57E 1B9YC 5A4WA 1OC8A 2V41A 3EMPA 3GURA 4G9HA 2R4VA 4NHWA 4BPYA 1GSYA 2NVLA 1Z6MA 2XPDA 3IBHA 4TXOB 3NZNA 5H5RA 3IXRA 5D96A 1VF2A 3FZ4A 3QAVA 2REMA 4LA1A 2CT6A 1JZRA 3I6AA 4DEJA 3KH7A 4FH8A 2E7PA 4XTSA 3GYKA 2H6YA 3TOTA 2O85A 3VWUA 1XW9A 3TKSE 1FB6A 5AN1A 2YZUA 1SJIA 3QDNA 3SBCA 1SJZA 1YJ6A 3ERWA 4Q5RA 1R7HA 3D4TA 4GCIA 2PN8A 2H76A 2HT9A 3KM6A 1M0UA 3HHVA 2IFQA 3M3MA 2FA8A 2RLIA 1AAZA 1XOAA 2X64A 4TRXA 5EL8A 1XCCA 5COHA 3VPQA 1F3BA 3FR3A 2IN3A 1BJXA 1SD8A 1AQXA 1TRVA 3PH9A 1EZKA 4MABA 3EYTA 1KBNA 3UJ1A 2DBCA 2LEGA 2LRCA 1M7TA 3UBKA 5F05A 1GNEA 2H0IA 3KD0A 1OVNA 3J7Yb 4PGTA 4E8EA 4ECJA 4GQCA 1KEBA 2B3SA 5IMVA 4PQIA 5IIZA 2GZPA 4IP1A 3VI5A 4IELA 1GUHA 5D73A 3FHKA 4NAXA 4TVEA 5G2ZA 4D73B 3WGDA 3UL3A 3G7IA 3A2VA 4WR5A 5J9CA 2B7KA 1ERVA 4YQVA 2M46A 5AIXA 5LNKe 4WXTA 5IMZA 3IDVA 5G5EA 4NPBA 5C04A 3GSTA 2L5LA 1JZOA 2RIIA 2HYXA 4TW5A 3VI7A 1XW6A 5DDLA 4PUAA 4EF0A 4GRFA 4AJ8A 1YKAA 3KEBA 3BOAA 1THOA 5CREA 1GLQA 1M2BA 1TKDB 6GSUA 4ACSA 3TOUA 5JWOB 2IPAA 1TK5B 4RUVA 1H4OA 2CV4A 3HDCA 2VIMA 1JHBA 3C73A 3DIEA 1VGLA 5DJLA 7GSSA 4KB3A 4TXOA 3VURA 2LS5A 5F0GA 1QGVA 3ZMKA 1TI3A 2WGRA 2WB9A 4L0UA 4OMVA 3MSZA 2GZZA 3TRQA 2WDUA 3CRUA 3LWAA 4TR0A 3TJGA 4PX1A 4DSSB 2QKEA 4JRRA 1PKWA 2C4JA 4ECIA 3DEXA 2FWEA 3D4MA 4ISDA 3KZQA 2F8AA 2H1DA 4KGIA 3M9KA 1Z3EA 2DSAA 1G6YA 1NHYA 2MYGA 5ECQB 4V2MA 3UMAA 4KDYA 2LUSA 1FHEA 2ZNMA 5CAXA 1EP7A 5HR3A 1CQHA 1AIUA 3GL5A 2H74A 1VRSD 3IK7A 4K6XA 4YQUA 2AJQB 5D9WA 1NSWA 3HA9A 4KE3A 2OE0A 4JR6A 3CTFA 1FG4A 3H4KA 3EMXA 1I9DA 3GKKA 1W89A 5ECPB 3HY2A 3E3EA 2HI7A 3OR5A 1N2AA 2YV7A 3P8WA 4PQHA 5ECMB 5DCHA 4TKYA 1PMTA 5J41A 1GSSA 3M0FA 2CX4A 1WIKA 5KN3A 5AGYA 2H70A 4TXVA 4ZL9A 5LD0A 3IV4A 5DJMA 3ZREA 4NV2A 4XIHA 1GUKA 1PL2A 2GZYA 1F9MA 2IMFA 1EV9A 5DQYA 2DLXA 4MPFA 2JSZA 1F3AA 4QQ7A 2DJ3A 1TU8A 4FO5A 3L78A 3TDGA 1MD3A 4HZ2A 3DD3A 2C0DA 1M2DA 1ST9A 1AC1A 2X8HA 3ERGA 3F9UA 4ZBAA 2LKUA 2IMEA 1XZOA 4KDUA 2GS3A 3Q74A 5ENUA 4HZ4A 2VLTA 1YEPA 4XHMA 5A4UA 3GTUB 4ZB8A 3ZRDA 3L4NA 4OWYA 3GX8A 4LMWA 1ZGNA 1F6MC 1PX6A 2OADA 1WJKA 1R5AA 3LYPA 4IQ1A 1BQ7A 3UOMA 2XHFA 4K7IA 1ILOA 1XWKA 3GV1A 2H66A 3CSHA 4JBBA 3EINA 4DSSA 3DGQA 5EVOA 4LL4B 2X8CA 11GSA 4ZILA 2EIRA 5JCWA 4I97A 4JR4A 1X9WB 3W6GA 4CW9A 1K0DA 2MMOA 2ZCTA 3F6DA 3TCOA 3E0UA 4I6XA 2VCTA 4PURA 4MF5A 3FR6A 4PQ1A 3WD6A 1SD9A 4JE1A 3LJRA 2VM2A 2VUPA 2YPMA 1SYXA 5IMFA 3IR4A 5D9VA 1XIYA 3I43A 1KNGA 2LTKA 5B8AA 3FW2A 3TJBA 2R3XA 1YZXA 2DIYA 2YJHA 4HS1A 2KP1A 1U88A 1EGRA 2H1BA 2HNLA 2VL2C 2YV9A 2YWOA 1J0FA 1J9BA 1AQVA 2GVPA 2I81A 2YWMA 1PA3A 5B7CA 2CAIA 1XVWA 1EEJA 2FCHA 4IS0A 1K0OA 2KUCA 2K18A 4WR4A 3C71A 1TK0B 2OACA 1R4WA 5IOWA 3A5WA 3DXBA 4K0GA 2CVDA 5HFKA 2NBSA 2GQKA 4O7HA 3FZ5A 2XBIA 4ID0A 1OE7A 5F06A 4OFMA 2H0HA 1X5CA 4BVXA 1GTUA 3CSJA 4G2EA 2JSYA 4I5QA 2CZ2A 4TR1B 2C3NA 4NHZA 1IYHA 2OBKA 3LXZA 2C3TA 4KH7A 3D5JA 1O7UA 4K1FA 2FWFA 1JFUA 2K6VA 3KXOA 4JU5A 2OE3A 5KN2A 2PVOC 3U5RE 1SK0A 4EC0A 1A0FA 2KOKA 3H8QA 2VL3A 1Z9HA 3C7MA 2YP6A 5ECRB 3RAZA 3TJFA 4OO4A 3KH9A 4HJ2A 3GX0A 2KLXA 3KMOA 5GZZB 4XRAA 3G9BA 1UVZA 3TKQA 3EU4A 3ZYWA 1TRWA 3PINA 3VWVA 3W8JA 4F03A 2CZ3A 3GMFA 1FW1A 2VL9A 2TRXA 3DYRA 3GIXA 1MDKA 4XS1A 4IN0A 2HRFA 2MMAA 2WS2A 3DMLA 3UVHA 5CYYA 1ZYQB 5J3RA 2E0QA 4N0VA 2C3QA 2QGVA 1M2AA 5LCZA 4Q5NA 3N9JA 3HVXA 3DVWA 2D2ZA 3UARA 2IIYA 2DIZA 1LJRA 5KEJA 5CP1A 5HFIA 3CTGA 3ZVJA 2HFDA 2JADA 2YWIA 5CRWA 4V2LA 2VD1A 1R26A 4LMVA 2KP2A 1GSFA 3EVIA 1A0RP 1BYEA 2LJKA 3BBYA 2Z9SA 4YAVA 5FWGA 3ZLPA 3GUSA 2I1UA 4GF0A 2DC5A 1GH2A 2EIQA 2MZCA 2GT5A 1OC9B 3GKXA 1TW9A 2K8VA 2OBIA 16GSA 1SK2A 5ECIB 2RM6A 5ID2B 5DAKB 3TKPA 1K3LA 1M9BA 1TRUA 2JACA 3ZMLA 5JWQB 3S9FA 1XBSA 2J9HA 2R2JA 2VO4A 2H0GA 4FYCA 4MJEA 4IGJA 5G31A 2VOCA 2K9FA 2IL3A 3KP8A 2I3YA 4L5OA 3F3RA 3R2QA 1K0MA 1XWCA 2FWHA 3M8NA 1EOHA 4TR1A 20GSA 5DBQA 1TDIA 4IW9A 2H01A 1WMJA 2CA8A 1A8LA 3U6VA 1GNWA 2WRTA 2YJ7A 2NDOA 1J08A 1MDJA 4BL7A 3GL3A 4MZWA 1V9WA 3HJMA 2H1GA 2B5YA 3CXGA 2YZHA 1MTCA 4AF2A 3PGTA 1Z5YE 5B8BA 1OKTA 2LSTA 2VM1A 3HZ4A 2A2SA 1K0BA 2XBQA 4WETA 1K3OA 2P5QA 1A2MA 4WF4A 4OCEA 1BAYA 4NV5A 1SKSB 2AB6A 2GSTA 3DRNA 4KA0A 1UC7A 2YANA 1EV4A 4EL1A 2WZ9A 1Z7PA 4XS6A 1OE8A 3C8EA 1GULA 1WE0A 3ZL5A 3TUEA 2YOIA 4GTUA 4MH2A 4V2NA 3QAWA 2VCWA 4IBPA 6GSVA 3FEUA 2CVKA 3Q6OA 2EC4A 3CMIA 2GLRA 3MNGA 1ZZYA 2RUFA 5E59A 3FZ9A 2BJXA 2LQOA 1GSQA 1HNAA 3UIWA 4OFNA 4K7OA 3SWLA 1SL2B 4MZCA 4ECBA 3O3TA 2FWGA 2NPBA 2N5BA 2B6MA 1XWAA 4KSOA 1V98A 4X0XA 6GSXA 1B9XC 2A4VA 1Q4JA 1MD4A 3KGKA 1S3AA 2DMMA 4F0BA 5HR0A 1QK8A 4GLTA 1AXDA 1SYRA 2GT6A 3KJYA 3DKSA 2FHEA 4IHUA 2MMZA 2HSYA 2IMKA 2LNTA 1PX7A 8GSSA 1B4QA 1S3CA 3D0ZA 5G5FA 2B1LA 5IPGA 2WJUA 3VLNA 1OC3A 2IMIA 4GWRA 2L4QA 5ID2A 5DAKA 3ZIVA 1T1VA 2FNOA 3C1SA 3VWXA 2HZFA 4EE0A 2V1MA 1JZWA 4O92A 4L5LA 3WT2A 3WT1A 1MDIA 4XS4B 2CAQA 3GKMA 2GSSA 2LNSA 1ACVA 2IMDA 2N5FA 3UBLA 4YH2A 1GSDA 3N5OA 4K0NA 2H1AA 1MEKA 3EC3A 18GSA 1PRXA 4ULXA 4D73A 1TP9A 2WCIA 4WKWA 2HE3A 3CBUA 1SL0B 1OKDA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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