1FB0A

Crystal structure of thioredoxin m from spinach chloroplast (reduced form)
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
EVQDVNDSSWKEFVLESEVPVMVDFWAPWCGPCKLIAPVIDELAKEYSGKIAVYKLNTDEAPGIATQYNIRSIPTVLFFKNGERKESIIGAVPKSTLTDSIEKYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of two functionally different thioredoxins in spinach chloroplasts.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN M
molecule tags Electron transport
source organism Spinacia oleracea
total genus 30
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1fb0A00
4MJBA 16GSA 3KM6A 3JCML 1F2EA 3M9JA 2GT5A 3D0ZA 5CREA 3G7YA 4FIWA 3HJPA 1XW5A 2IMDA 1V98A 4PQHA 3IPZA 2HT9A 6GSSA 2XPEA 4ECBA 2ON7A 1U6TA 3RHBA 1YQ1A 3P2AA 2LS5A 1JZOA 2CV4A 4ZB9A 4MPGA 4KNDA 3IAM2 5DCHA 2V2GA 4H86A 2LTKA 2B5YA 3ZMKA 1THOA 2TRCP 4I6XA 2X99A 5DALA 2VLTA 2L4QA 1GUKA 1SL1B 2VOCA 5B7CA 2DBCA 2PGTA 4OWYA 2IMFA 2DJKA 2RIIA 3SBCA 2L6DA 4MDCA 4DEJA 2PPTA 2B1KA 4NWYA 2L59A 2OACA 4KDXA 1GNWA 8GSSA 5KN0A 4KW6A 1JLVA 1F3AA 4O92A 1OC9B 5IIZA 1G6YA 1A0RP 1EP8A 5ECPB 4I2UA 1T8EB 6GSXA 1NM3A 1J0FA 3VWUA 4D73B 4GQCA 4OD7A 4XCSA 3NIVA 2C0GA 3APQA 20GSA 3ZITA 2VL2C 3GYKA 1PN9A 3IRAA 3ZTLA 4K1FA 2OE0A 1NHYA 4F03A 5J9BA 1B9YC 4FO5A 2H70A 1ERVA 2GSTA 3F4SA 3GA4A 3N9JA 5ECIB 1EV4A 3CSHA 2CAIA 4WEYA 1CQHA 2LKUA 3DYRA 3GTUA 3A2WA 3H93A 4EKZA 2EIOA 1CQGA 5IMVA 2HXKA 1MDIA 2C8UA 4ML1A 2HRNA 3DGQA 3WYWA 2H1BA 1F9MA 2NDOA 3GX8A 2VM2A 1XW6A 3HZ8A 2LSTA 4OCEA 1XXUA 2WULA 4RI7A 3HXSA 1O8WA 3ME7A 2GS3A 1FO5A 1U87A 2DJ3A 2YWOA 4JR4A 1K3OA 2MMNA 3FZ5A 2PBJA 5IO0A 1BEDA 1F3BA 3UBKA 1DE1A 3EWLA 2IPAA 1GLPA 2VLVA 3MAKA 4P3YB 5KEJA 2HI7A 4I97A 4NV5A 2QKEA 1HNCA 2VCTA 3WD6A 1FG4A 5B6NA 4L5LA 2HFDA 2PUKC 4TR0A 3GKMA 1A2LA 1M9BA 4ZB8A 3TKSC 2FLSA 1TK0B 2YOIA 1ON4A 2YANA 3BBYA 4IQ1A 4IKHA 1W89A 4HQSA 4ZL7A 2OE1A 4WKWA 4D73A 3KJYA 2C80A 4TOPA 2VCWA 4GLTA 1KEBA 5AIXA 1JFUA 2MYGA 3CSJA 5GAND 4YQVA 1R5AA 3CSIA 2B7JA 5CP1A 4G10A 2DJ0A 4MLYA 4MCUA 5ECHB 3TKQA 2E2MA 4PURA 2O89A 5EL8A 2N5AA 4I2TA 2LEGA 1QQ2A 3TJFA 5F0GA 2HE3A 1R7HA 1VGLA 3HA9A 5E59A 1PX6A 3GHAA 5J4UA 1K0OA 2VCZA 2CVDA 2MBTA 3DVWA 5KN1A 3UVTA 1O81A 1YJ6A 1U88A 5COHA 1WJKA 2MMOA 1O73A 3LWAA 3ZLPA 4XIHA 5ECKB 1ZMAA 4PNGA 3C7MA 1GSUA 1SL0B 3U5RE 4AF2A 2R5GA 3QDNA 1HYUA 2XC2A 2EC4A 3IK7A 4LA1A 1HNBA 5ECOB 3FR6A 3MWHA 4K2DA 2YPMA 4Q5NA 1TXXA 5D9WA 4GQFA 4IVFA 1V9WA 3VWVA 2V41A 4QL7A 1QGVA 3KMOA 3P7XA 1OE7A 2F51A 4LLRA 2CVBA 3DMLA 1QMVA 18GSA 5KN2A 2R6KA 5J9CA 5G2ZA 3FK8A 2VL9A 3VPTA 2WCIA 4LL4B 4EL1A 5EY6A 1ERUA 1XCCA 3Q18A 1VRSD 1F6MC 4OFMA 2V6OA 3LXZA 4HJMA 1MD4A 1PRXA 4MH2A 3GMFA 2FWEA 2H01A 4CDOA 4E8EA 4ECJA 1THXA 4YH2A 3UARA 1XWKA 2L6CA 1TDIA 3MSZA 1B4QA 1WE0A 3QAWA 1AAZA 2H30A 4ISDA 4G2EA 3LORA 1IYIA 2XBQA 1R26A 4V2MA 3TRPA 2CVKA 3L0HA 3NOFA 3QAVA 3VI5A 2KP1A 3IHQA 1V58A 2AJQB 2WGRA 1ABAA 2OKAA 4KH7A 3Q74A 1FB0A 1H75A 4F0BA 2OA7A 3C73A 3I6AA 4WBRD 4I5QA 1J08A 1SK2A 4ZXGA 3WT1A 1OVNA 1A23A 2VIMA 2XPDA 3DVXA 4WR5A 1XWCA 5D73A 2VAFA 2X8GA 3GN3A 2V6KA 4N10A 3ZIJA 2JSYA 2R2JA 1AW9A 2JZRA 4N30A 3TB2A 3LG6A 4QQ7A 4IJ3A 2JADA 4OMVA 5H5RA 1HNAA 3RHCA 1Z7RA 4ZBAA 3ZREA 1WOUA 2V32A 2KOKA 5F06A 3Q19A 4RQRA 2WZ9A 1AXDA 2HZFA 2I9HA 1EWXA 1GTBA 2FWFA 3HJOA 5H5QA 4GCIA 1GTAA 4YAVA 2B3SA 3VK9A 4BPYA 3FRCA 2H74A 4Q5QA 2H1AA 1UA5A 1GSDA 2GT6A 1RQMA 2N5BA 1M7TA 4AJ6A 3G7IA 4PXOA 5JCWA 5G5EA 3QFAC 4XS4B 5D93A 2VM1A 13GSA 3M3MA 3UL3A 4AGSA 4G19A 1JZWA 1X9MB 4GXZA 1TI3A 2A2SA 4HUAA 4F0CA 3KH7A 3L9SA 4X1UA 2H1GA 2HYXA 1DUGA 2GZZA 1S3CA 1V40A 2ON5A 3F3RA 2P5QA 6GSWA 3CRTA 1OE8A 4PUFC 1M0UA 2MZCA 2HLSA 2REMA 2V1MA 2H0HA 2JU5A 1T7PB 5J3RA 4MA9A 1SKWB 2YJHA 1S3DA 4DVCA 2NVLA 2LQQA 2RUEA 2DJ2A 1AIUA 1M2DA 5G30A 4V2NA 3PR8A 1YEXA 5IPGA 4KUNA 2LV3A 4MJCA 3F6FA 3TJBA 4ECCA 3K8NA 2C0DA 2O87A 3HKRA 4ML6A 3BD2A 1BYEA 1TU7A 2K6VA 3P90A 4K0GA 5HQPA 4HEA2 2AB6A 1FAAA 4PQIA 2E2GA 1TJDA 3CTGA 5DCGA 1KBNA 3FEUA 4F82A 1A8YA 4MZCA 1N2AA 4K7OA 4MJEA 4V1Ap 4POBA 4OFNA 4FH8A 3GH9A 3QR6A 3HY2A 3A2XA 2L57A 1K0BA 3EVIA 1K0CA 3G7JA 1XWGA 1TK5B 2NTOA 5INYA 3J7Yk 1NW2A 4E8HA 2CX4A 5ABRA 5DQSA 3DXBA 1SJZA 1XVWA 2OBKA 2A2RA 5IOWA 3ZL5A 4YQMA 2GZPA 2YZUA 1PX7A 2CZ3A 2I3YA 1ZZYA 5CRDA 1G7EA 2KHPA 5B6MA 4XS4A 3EC3A 1NHOA 1MD3A 2GSSA 1A2MA 4HU7A 3MNGA 4OFTA 5ECMB 4KCAA 3TKRA 1TW9A 4EC0A 2FHEA 2N5FA 2ZNMA 1TP9A 1A24A 3DD3A 2G2QA 2R3XA 4O32A 2WJUA 2YCDA 2H0IA 1WP0A 3TRQA 4MK3A 1GTUA 3I69A 1YF0A 3KTLA 5G31A 3QCPA 1XZOA 2VL2A 1GSFA 4IN0A 1BAYA 1GNEA 3QAGA 5IMFA 1AUCA 1X5DA 2L5LA 3EURA 2R4VA 1HD2A 5ECSA 5B8AA 3LYPA 2C0EA 1N8JA 3QPMA 4POLA 7GSSA 2I1UA 3W6GA 2C4JA 2IFQB 2J9HA 2TIRA 4K0NA 3ERWA 5IPHA 1MDJA 2EIRA 5EPFA 1PQNA 4L0WA 4BL7A 3L9VA 3DRNA 6GSUA 3KTBA 4MZWA 2H66A 1AC1A 2DIZA 5JWRB 3HVXA 2GQMA 5A4UA 4KDYA 3UIWA 2GSQA 4ULXA 14GSA 5HR1A 2QC7A 4XRAA 5DQYA 5F07A 5G1KA 2LNTA 3EU4A 2LRNA 1Y6EA 3ZRDA 5CO3A 2JACA 2AUVA 4EF0A 1GTIA 3UJ1A 1X5EA 4KSOA 4ECIA 4GF0A 5CYYA 4LMVA 2VCXA 4EDZA 3F9UA 2GQLA 1Z5YE 2AYTA 3F63A 4JEDA 2C3NA 2PVQA 2I4AA 4BWQA 2WS2A 2D2ZA 4JE1A 1PL2A 3O76A 3CBUA 4JBBA 2P0GA 2ALBA 4DSRA 4MH3A 1RK4A 4IBPA 3EMPA 1OC9A 3M1GA 2FA4A 2VO4A 3O6TA 4RI6A 5A5KA 1A8LA 3M9KA 5CRHA 1GLQA 4TW5A 3KMNA 3TKSA 4ID0A 4CW9A 2GSRA 5C04A 4HI7A 1EOHA 2YWIA 1YEPA 3FHKA 5IMZA 4J57E 4NPBA 4AJ7A 5ECQB 3TJJA 3HD5A 2CZ2A 2DMMA 3ERFA 2XHFA 1EGOA 5IMAA 5ID2B 3UOMA 2B5EA 4ZL9A 4F9ZA 3APSA 2BMXA 4K9ZA 1M2AA 2FGXA 5ECNB 4I8BA 3FR9A 2M72A 4ILFA 1E2YA 2FCHA 4X0XA 2RUFA 3ZFBA 1BJXA 1PD21 1ZYEA 3EU3A 4FYBA 3ZVJD 1RW1A 4XTSA 4K6XA 2K18A 4L0UA 4OO4A 3RPPA 1X9WB 1O7UA 4TKYA 1MDKA 3BCKA 2EIQA 4HQZA 2P31A 4IHUA 1FVKA 2CAQA 4WXTA 2F8AA 2HZEB 3WGDA 1TOFA 2ES7A 5CAXA 5HR2A 5ENUA 2FY6A 3APOA 5D9TA 2K8VA 4WF5A 3VWXA 4EE0A 2PN8A 3N5OA 5C00A 2PMTA 1EGRA 5JWOB 4TXOB 2KLXA 3KEBA 3BJ5A 1FB6A 3BCIA 1ILOA 5E4WA 2ZCTA 3EMXA 2HSYA 2GGTA 1PSQA 4EXJA 4IW9A 1AQWA 3QOUA 4N11A 2YNXA 3D21A 5GAPD 10GSA 4L8EA 3KP9A 3C1SA 5JCGA 4TR1B 1Z6NA 4OO5A 2LJAA 1FHEA 1HQOA 5GZZB 1E6BA 1TRUA 3H4KA 2IMEA 4LMWA 1H4OA 5IOXA 4GSTA 1BG5A 1QK8A 4O5RA 4EO3A 2HNLA 2X8HA 2DIYA 2I81A 2Z9SA 4GWRA 2AV4A 2F3MA 5AISA 5CRWA 2HRFA 2DSAA 1AQXA 4XS1A 3H79A 5L71A 2KUCA 1XVQA 1X9SB 5DAKB 1SKSB 4KSMA 2VUPA 1YKAA 1B9XC 1EOGA 2O8VB 3TGZA 3UVHA 1GSEA 2PERA 3A5WA 4L5OA 4GRFA 3TKSE 4RUVA 4GTUA 5D9XA 2AAWA 1AQVA 2AHEA 3FY7A 3TKPA 3IBHA 2BTOT 2YZHA 1S3AA 2IN3A 1GSQA 1OAZA 2KP2A 2G0FA 4ZL8A 1G6WA 1U3IA 3US3A 1EV9A 3H1NA 1ACVA 4Q5RA 2VLUA 1K0DA 2IJYA 3VLNA 4N0VA 1ZGNA 1YZXA 1GH2A 4IGJA 4TXOA 1EP7A 3GX0A 4NAXA 4RQXA 3FYGA 1GULA 12GSA 5JCUA 4ACSA 2F9SA 2H76A 5DJMA 1Q4JA 4XRDA 1K0MA 5HFGA 1U3AA 3PINA 3D6IA 3FR3A 2FNOA 4WF4A 3RBTA 2VCVA 3L4NA 3C8EA 3FZ9A 1PMTA 4ZILA 3DIEA 4IP1A 2H6XA 3C1RA 4HZ2A 5D8IA 3M8NA 3ZZXA 4V1Ag 3H8QA 3M0FA 1ZYQB 1GP1A 1YKCA 1PKZA 1XW9A 4OCFA 3EYTA 3PH9A 2FWGA 5CNWA 4EUYA 5ELAA 1XWAA 5F05A 2H8LA 1JZDA 4KA0A 4ZIJA 1LJRA 4HJ2A 2JZTA 5F8BA 1VF1A 2H72A 4BVXA 5J41A 1NSWA 1SK0A 3F3QA 1QFNA 6GSTA 5DAKA 5ECLB 4J2FA 3P8WA 5FT3A 2MMAA 3VI7A 3HVVA 3ZFLA 2P5RA 4MMMA 1VF3A 3GKNA 1OYJA 4TR3A 4NMUA 2XBIA 2VD1A 2GTUA 4HU9A 2H0GA 3C71A 5HFIA 1SD8A 2M46A 1XWBA 3CTFA 3CYNA 1IYHA 4KGIA 3KH9A 4EVMA 1GUMA 3GH6A 3E9JB 2DC5A 2NPBA 4BA7A 9GSSA 2RLIA 5JWQB 3LEFA 2CQ9A 1R4WA 3ERGA 2YN1A 3TOUA 3LXTA 3QD9A 19GSA 1SK1A 3GUSA 3FZ4A 2H71A 4CHSA 2YV9A 3TRXA 3TUEA 3TCOA 3ED3A 6GSYA 3WGEA 1FW1A 1UVZA 1QUWA 3LJRA 5IMCA 1TRWA 3LFLA 4K7NA 2H1DA 3IE3A 4FYCA 4N0ZA 4HOJA 3DKSA 5A4WA 4X43A 5CRGA 2YWMA 1URMA 1GSSA 4YQUA 6GSVA 2K9FA 1MEKA 4IQAA 4NV2A 1DE2A 1X5CA 5IO2A 2MMZA 2LNSA 3UBLA 1O6JA 4TR4A 1Q98A 1OC3A 2PVOC 3QFBC 5HR0A 5IM9A 2WFCA 3IC4A 4LL1B 1GUHA 1JHBA 3I9V2 1Z9HA 3QMXA 4KCEA 4KX4A 2HSHA 11GSA 2VL3A 4PQ1A 3E3EA 3HYPA 3WGXA 4TRXA 2E7PA 2FA8A 3GRXA 1T00A 3NZNA 4Q5FA 1WRYA 1A0FA 4QL9A 3DWVA 2JSZA 3GFKA 3HHVA 3TJKA 4DSQA 2FWHA 5G5FA 5AIVA 1ZCPA 3SWLA 2O85A 2A4VA 1X0RA 4YAPA 1PA3A 1B8XA 2LJRA 2FD3A 2M80A 3VFIA 2IMIA 2LJKA 2QGVA 3GURA 1SJIA 3LSZA 2PWJA 17GSA 4G9HA 2RM6A 3EINA 1SKRB 3CRUA 3ZMLA 3VWWA 3W8JA 4MZBA 4HDEA 4POMA 1I9DA 1Y25A 4JRRA 3UMAA 4WR4A 4PNFA 5D9VA 2VCQA 4GSSA 2MBSA 3BOAA 3TOTA 3RAZA 4O7HA 3F4RA 5G1LA 2LUSA 1GWCA 5D96A 4DSSB 4WETA 4MJAA 3IDVA 1KTEA 5B8BA 2H75A 3WT2A 2OE3A 3UEMA 1TRSA 1TTZA 2IWTA 1M99A 5DVBA 1Z3EA 1YY7A 3KD0A 1OC8A 2H6ZA 1C72A 1K3YA 4GSNA 3F4TA 3IOSA 2ZUPA 1OKTA 3ME8A 1YF1A 3I43A 3D22A 3LYKA 2K8SA 1SD9A 3MDKA 2IFQA 2H19A 2C3QA 1F37A 5H5SA 3D5JA 3GSTA 1LU4A 1UN2A 1SYXA 1DBYA 2GZYA 1FOVA 3W8SA 4NHZA 2GVPA 5A4VA 1K0NA 4J56E 1V2AA 2VD0A 3FW2A 1I5GA 4MF6A 3KIJA 2YJ7A 2B1LA 1TKDB 4TVEA 2O7KA 5LCZA 3L9UA 1MTCA 1B48A 5ECRB 5LNKe 3IXRA 2JZSA 1GSYA 4MF7A 1XFLA 1TK8B 1Z6MA 2WDUA 1VF2A 4JZQA 4KAEA 3IAS2 2WB9A 1O8XA 1WIKA 4POKA 4AJ8A 3GL3A 2R37A 1SJ6A 1WMJA 4KB3A 3CMIA 1PGTA 3IV4A 1EEJA 2BJXA 2X64A 4MABA 2LRCA 5ELGA 3F8UA 3GV1A 5FWGA 3FZAA 1QXHA 1USBA 2IMKA 3KCMA 5IQYA 4PUAA 5FHIA 3U6VA 3HZ4A 3GSSA 4IP6A 2GDRA 4TXVA 3A2VA 3VPQA 3ZIVA 2JL4A 1R5PA 2C0FA 1XPVA 2YP6A 3RDWA 3F0IA 2B7KA 2H6YA 1J9BA 1XBSA 4PX1A 4DSSA 5GSTA 1T3BA 1K3LA 2F8FA 2L4CA 3ZVJA 3OR5A 4IS0A 4Z7XA 3LGCA 4MF5A 1FVJA 2YV7A 4JR6A 5LD0A 1K0AA 5ID2A 1M2BA 3L78A 4NHWA 2RM5A 2CX3A 1B4PA 3Q6OA 2PU9C 2L5OA 2DLXA 3GL5A 3HVSA 3TDGA 3O3TA 1XOBA 3GKXA 2X8CA 1ML6A 2LRTA 1JLWA 1PL1A 5DDLA 1ERWA 2YWNA 4BWSA 1M9AA 4ZBBA 4HZ4A 2GLRA 1SENA 3ZYWA 1ERTA 1TU8A 1T4ZA 2DJ1A 1DSBA 1G7OA 1JZRA 3IR4A 2HZEA 5EVOA 3E0UA 2CT6A 3TJGA 3F6DA 1GL8A 1TI1A 1SYRA 1UC7A 1BX9A 4EDYA 1EZKA 4KE3A 1XOAA 5DBQA 1GRXA 2QSIA 2OADA 5J5NA 5HFKA 3IA1A 3RPNA 2B5XA 4ZBDA 3D4MA 1YDKA 4XS6A 1OKDA 5DALB 1ZOFA 3IK9A 4IJIA 4PGTA 1T4YA 3KGKA 2WRTA 5HR3A 5AN1A 3KZQA 1G0TA 3V1WA 3A3TA 2H73A 4BVYA 3HJMA 2GQKA 3LQ7A 2OJLA 4IELA 1ZL9A 2J23A 1T1VA 2DMLA 4JU5A 1Z7PA 1KNGA 2C3TA 1O85A 1ST9A 1W4VA 5IMDA 4TR1A 3AY8A 3HCZA 2E0QA 4ZB6A 4FYUA 1WWJA 3G9BA 2LQOA 5GSSA 2FUG2 3GNJA 5AGYA 1BQ7A 3R2QA 1LBKA 2IIYA 4K7IA 4XHMA 1V57A 3DEXA 1SL2B 1EEMA 2B6MA 2OBIA 3D4TA 4V2LA 3FKFA 3GIXA 1WPIA 3UAPA 1TRVA 5KN3A 4KDUA 4MP4A 3GTUB 1SU9A 5DJLA 3CXGA 2CA8A 3VURA 3PGTA 3KXOA 4HS1A 3S9FA 4F2IA 2IL3A 22GSA 2NBSA 4WBJA 1PKWA 4NXIA 1XIYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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