1FCKA

Structure of diceric human lactoferrin
Total Genus 230
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
230
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
RRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Metal substitution in transferrins: specific binding of cerium(IV) revealed by the crystal structure of cerium-substituted human lactoferrin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
molecule tags Metal transport
total genus 230
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-07-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fckA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fckA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fckA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fckA02
2Y7KA 1MPBA 1II5A 1P1NA 1SW2A 2HFBA 2I58A 4JDFA 1AH5A 5DVIA 1PBPA 2A5TB 1MQGA 2UYFA 2ZNUA 2D3IA 3TCHA 2BJJX 3PPOA 3LSLA 2Y7PA 1QULA 5KCJB 1IXGA 1H44A 2F36A 4OENA 3W9VA 5ISUA 1MQHA 1MY4A 2GHBA 4BDLA 2F97A 1SDXA 3Q28A 3USDA 4Z7EA 1D4NA 4X1BA 3ILUB 4MH5A 2UVIA 1MXYA 2DVCA 3PPQA 3VDFA 1B4ZA 1B5JA 3ZKKA 1B4HA 1MXVA 3IAZA 2O7UA 2HXWA 4XKQA 4KI0E 2NWJA 2D21A 3C33A 4I62A 2F34A 2Y7IA 4H8JA 3TZAA 2UXAA 2RCBA 3GLBA 3FVKA 3Q27A 1NL5A 2OWTA 4YKKA 2YPNA 1Y3NA 4IO4A 2VOZA 4QFKA 1PB8A 2AL4A 4U1ZA 3B6QA 3KZGA 1JEUA 2REJA 3H3GA 2DQVA 1B6HA 2ESNA 5ICQA 1LGBC 2F7BA 1HSEA 3G3HA 1JW5A 1B3HA 3K6UA 3T66A 3UP9A 4GVOA 4NF6B 3PUXE 5I2KB 4H8IA 2VP1A 4F1YA 4OWDA 2RC9A 2QJEA 2P1SA 3W9WA 1YCJA 3TUSA 2O6AA 2PMSA 2H98A 4OZ9A 3TKDA 3EHSA 3ZS6A 3O97A 2RKMA 4ZZEA 4IO6A 3V8XB 1MPCA 1QUJA 1UTHA 2XHDA 1JETA 1B3EA 4BDOA 4C1TA 5I57A 1NNTA 1B1HA 3VLUA 3O2AA 2ONSA 4QRZA 3TTNA 3C35A 4XIGQ 5FTIA 1R6ZA 3MVXA 4R72A 4QSDA 2A5SA 2V3QA 3O6IA 4EF2A 5K2YA 3FVOA 4NF4A 3KFMA 3HV1A 1VR5A 4WEPA 2DXRA 1SYIA 4DXCA 4F3SA 5H8QA 5ITOA 4Q8RA 4R73A 5TPAA 4WKMA 4Q30B 3T93B 1FTJA 4I9DA 4TOZA 1LFHA 3CIJA 2ZXTA 4LATA 3MP6A 3I3VA 4LQ2A 3C32A 2V3UA 2Z22A 1B3FA 4F19A 3CRBA 1CE2A 4YB5A 3RQTA 3LC8A 2FA7A 1JW4A 4KQPA 4R9FA 1SVXB 4I8CA 4QFLA 3KSXA 4IO7A 1RYOA 5DEXB 2DWJA 2P0SA 1SD3A 3SEUA 3BFTA 4YB6A 5H8FA 1N3XA 2DP8A 1FQFA 1NKXA 3OOAA 4OETA 1FQCA 3R6UA 3SEXA 5H8SA 3A09A 1R9LA 2G29A 2H99A 2XXVA 3OEKA 1SYHA 5AA4B 2XXUA 3EHTA 1MQDA 3K1NA 3B6WA 4EQ9A 4ZEBA 3O28A 1UQWA 1A8FA 4U22A 1IXIA 2DWHA 1OVBA 1B0LA 3RT6B 3OXNA 4F2QA 5J1DA 1OLAA 4XKPA 3OO7A 1XHYA 4ELRA 1H3DA 4N13A 4AB6A 5JTYA 1MQIA 3H6VA 4ZEKA 4DDDA 2REGA 3DP4A 4JSOA 1LLSA 3H6WA 3IR1A 3IJOB 1DPPA 2ZNSA 1B7UA 4G8HA 1MY1A 4FJPA 3TCGA 2DYXA 5HM4B 3EHUA 1Y20A 4IO2A 1US5A 3RGYA 3N94A 3PUZE 3FJ7A 2Z23A 1MXUA 2F7CA 2O1LA 4GIZA 4BDRA 3TTKA 1J1NA 1DOTA 3G3FA 3ONMA 2HAUA 3JV9A 2YJPA 3MVWA 5EYFA 1GVCA 1B46A 1QKAA 1URDA 3RTWB 4P0GA 3ILTB 1MS7A 1KWHA 3E9XA 3TODA 1JEVA 4YKPA 3FJGA 3TPAA 1S7YA 3KJ7A 1ZKBA 2ZYMA 3KSJA 4JWOA 4M4GA 2V84A 4M1VA 3SKPA 1EZOA 1I6AA 3CSGA 3S9LC 4OEUA 1OQGA 1B51A 3CSBA 4OTEA 4NF5A 3QYTA 3HSTA 3TQLA 4WXJA 4R9GA 1DTZA 1B2HA 4DCXA 3FATA 1MDP1 2AL5A 3M3KA 4TLMB 3B7DA 4DXUA 4FECA 4HCYA 3CFZA 1DMBA 2NXOA 1SW4A 3I6VA 4LONB 1AIVA 4ECFA 1NH7A 5F1QA 3IOUA 2AIXA 5AA4A 2ANJA 3K1MA 4ZEDA 4TLLB 1BIYA 4DZ1A 1O7TA 1S9TA 4IO5A 4RK2A 4G68A 2Q8JA 4PFYA 4R6HA 4G8NA 3PUVE 1PEBA 2FNCA 3RTFB 1LFIA 2ONRA 4KCCA 4MLQA 4EXKA 2E0SA 1UTHB 3O66A 4PFUA 1QJMA 2XXWA 3GBBA 1M5CA 4QFNA 2GHAA 1IQ7A 5I57B 4BDQA 1SI1A 4O3CA 3O6GA 1M5DA 3OENA 3K02A 4FE8A 3CI8A 2UVHA 4BLAA 3LR1A 1A40A 4U2RA 4NF4B 1GTKA 2YLNA 5I59B 4YU0A 2Z8FA 3PGFA 2XXTA 3LSXA 3C34A 4POXA 4LVQA 5H8QB 4BDNA 5TPAB 3R26A 2DWIA 4ELQA 3UA8A 4RXLA 1MXZA 2M8CA 3FUZA 4DIGA 1LB9A 3THIA 1R9QA 1EZ9A 5AA1A 1LAHE 3KN3A 1B1XA 4F22A 1XT8A 3PD9A 1A7LA 4KYSA 4KR5A 1EU8A 2HEUA 3LSWA 4X9TA 2QS4A 2WKYA 1YTVA 1B5HA 2ONKE 2B3BA 1MXWA 1OLCA 3V89B 4GXSB 5H8FB 4TQUQ 3IOVA 4EXLA 2O7IA 5CMBA 4R2BA 4FEDA 1H76A 2OBGA 4RK9A 3SEWA 4R6KA 3TDJA 2Q9TA 4OFJA 3UORA 4F3GA 1OVTA 4PE5B 3HHFA 2O68A 4YICA 4G8MA 5CRYA 4EDPA 4AB5A 3IL1B 2HQ0A 5JEIA 2QSXA 1BLFA 1Z7ME 3PD8A 3H6UA 3PMXA 4G4PA 3DLNA 3FV2A 4RYAA 3CG3A 3HPIA 3RLFE 4YZZA 1LBBA 5I2NB 2VHAA 1NNFA 2XXRA 4RPNA 2I6EA 2PT1A 3QUFA 3JYRA 4GL0A 1QUKA 3PU5A 5CI5A 2I4BA 2XD3A 3A3UA 5JTYB 3WAFA 3FJMA 3UIFA 4R2FA 3N26A 2I4CA 2I48A 3OEMA 3Q26A 4R74A 5CMCA 4HW8A 5HPQA 1N3WA 3H7MA 4OHNA 1ZJLA 4NMYA 4YMAA 5M2VA 1OMPA 1WVJA 1LAXA 3K6WA 3UN6A 1ZMGA 5A5XA 3A3CA 3BKIB 2I0BA 2Q2AA 4LA9A 3RT8A 2Z8DA 4RA1A 4OMBA 5I59A 5L9SA 4OERA 3VFJA 3FZVA 1AL3A 2GFEA 4YKIA 4RJZA 1LBCA 3IO4A 1N04A 4OFOA 4THIA 4XKNA 3IOWA 1SBPA 4YB7A 3LBSA 3GZGA 3QK6A 2F35A 3U93A 4ZECA 5K2XA 4DLDA 1JQFA 4O3BA 4MFIA 4ESXA 3OO9A 4OFLA 3N5LA 3T22A 5I58A 2UVGA 2OLBA 4PETA 3FXUA 3ECRA 3OSQA 3EN3A 1XOCA 5DYHA 4HS7A 4F3PA 2R71A 4NF5B 4G2ZA 2FYIA 4NF8A 1Z7NE 4G68C 3LSFB 5DTBA 5EHSA 4C1UA 3S9EA 2F6PA 4C0RA 1HSJA 3KG2A 2LAOA 3MJNA 3Q29A 2DOJA 5KDTB 3VLWA 1D9VA 3MVYA 1A55A 2GRVA 2ALUA 4OXVA 1MY2A 4ZE8A 1P99A 4QSEA 1FQAA 4U1OA 4ISUA 4G68B 2R9JA 1FQDA 3R7XA 4H65A 4H1XA 3PUWE 3VLVA 1ATGA 5I2NA 3PMWA 1WODA 3TMGA 2B3FA 2DVZA 4EF1A 3MBPA 1ELJA 2PVUA 1H45A 3MZ1A 4QFOA 1B05A 1EZPA 4JXIA 1SW5A 3KOSA 5CMMA 2RINA 3RY3A 3K4UA 1B52A 2VGQA 5I56A 5B7DA 1R1NA 2F5XA 3JZJA 5FHMA 3QAXA 3O29A 4MBPA 5HBCA 4YKJA 1LCTA 1B5IA 1ZTYA 5H8NB 2V93A 2W7YA 1B0HA 1LB8A 3VE1B 1IIWA 1XVYA 3AXFA 3CR9A 4GF8A 3C4MA 3MZBA 3N6TA 1IZ1A 1HSLA 4YAHX 1WDNA 4BDMA 2XX8A 2V3TA 3T9HB 1MG1A 4LP2B 2ZYNA 1AMFA 4P0IA 3ZSFA 3HN0A 4UACA 4P11A 1LFGA 4ZDMA 3MPLA 3PPRA 1QUIA 3FASA 4MF3A 4ESWA 4GQOA 4IY5A 3VVDA 5L9MA 1ZBMA 5DT6A 3B6TA 4NE4A 4U4XA 4U4SA 3M3LA 1Y4TA 4XKRA 4OQOA 3K6XA 2HZLA 3T9XB 4U21A 3SEVA 3RN8A 3UK4A 4H6DA 4F1VA 5L9OA 4KFQA 1POY1 4ZS9A 3DP6A 1FTKA 4RY1A 2X7QA 2E1SA 4FIMA 3TAJA 5CC2A 3S2VA 3MAMA 1Q35A 5KDTA 5TP9A 2H25A 3MP8A 1Y3QA 1F9BA 2XXIA 3G3GA 1NMUA 5IAIA 1MDQA 2UVJA 2I49A 3K00A 1VFEA 5FHOA 1B3LA 1TT1A 1PB9A 1T0KA 4ELPA 1TWYA 4F2OA 5I84A 2HAVA 2F7AA 1FTMA 1I69A 2G93A 2IA4A 4PFWA 3DM0A 1M5EA 1PDAA 2NOOA 2IEEA 1ZLQA 1BKAA 2AYSA 1NFTA 1N7WA 4H0WA 1FTLA 3E3KA 4IGRA 2V25A 4GOTA 2DSFA 3U92A 3C31A 2CZLA 1IITA 4OESA 3C9HA 4DE8A 3K2DA 3KN8A 3WAEA 2HZKA 3RUMA 5FTHA 4JWXA 4E0XA 3QSLA 2XXHA 1QKBA 5A5XB 3MQ9A 1B9JA 3EF7A 1UTBA 3TTMA 3G3KA 3U94A 1S50A 3SERA 1B7HA 3SDFA 4RNSA 1A54A 4F31B 1XVXA 2OK2A 3T9UA 4E0WA 4H5GA 4QF9A 3GBAA 4XXUA 4LZ5A 3TTRA 4RPOA 2XD2A 3KJTA 2RC8A 1MPDA 5H8NA 3ZKLA 2I3VA 1TXFA 5KZTA 1DSNA 4Q5TA 2RCAA 5CM6A 3IB0A 4JWYA 5I58B 4L17A 1L5TA 4H5FA 2Q89A 2O1MA 2F78A 4F3BA 3U8QA 1B3GA 2X26A 1MY0A 2F8DA 1FQEA 3Q25A 4NF8B 4X48A 2NUVA 3E13X 3TELA 2XXQA 4XTCQ 3T9VA 3U72A 1M5BA 5CBRA 1ZU0A 5AA2A 1VFDA 4QHQA 3P7IA 5CBSA 1UIVA 4KYDA 4IB2A 2Y7WA 3PV0E 1LSTA 2XXYA 5B70A 2QS2A 5DVJA 1Q1KA 4ZEFA 1B40A 1VSOA 1DPEA 1URGA 3FVGA 1I6BA 2DXYA 3LUYA 1GGGA 1AOVA 3CFXA 2DE3A 1USYH 2PT2A 2OZZA 4FAJA 4MLVA 4KYEA 3O6HA 4DCYA 4N07A 2B65A 4HCWA 4KPTA 3FV1A 1MXXA 3T96B 2QRYA 3TFLA 1XC1A 4JB7A 3IOTA 3MPKA 2PYYA 3E4RA 1PC3A 3VV5A 3DP8A 2F6GA 2H4IA 3VXCA 3VXBA 3IB1A 3K6VA 4R6YA 3PUYE 4N6PA 1O63A 2Z8EA 1USYE 3SESA 2DE2A 1ANFA 4LQ5A 4EUOA 2GH9A 5DVFA 4O3AA 4HTGA 3PMVA 4YMBA 5I56B 5ITPA 1A99A 4ONYA 3KBRA 2ZMBA 1B58A 1PB7A 4ZEIA 4IO3A 2OJTA 1Y1MA 1IUDA 2PBWA 5ICTA 3I5OA 4LZ8A 3BFUA 5H8HA 4AQ4A 4Q0CA 2OWSA 2XXPA 4PP0A 3EPEA 1CB6A 4FATA 4OVJA 2Y7RA 1OIBA 3S9NC 2VD3A 2ZNTA 3H06B 4I1DA 5F7VA 2P2AA 1N84A 3H6TA 2ABHA 2A5TA 1OQHA 2KLFA 2DS9A 3FXRA 1Y1ZA 5FHNA 1N0TA 2QL3A 3FIRA 3OD7A 4GD5A 1M5FA 5KCJA 4PQJA 4F29A 2CMOA 3VVFA 2RC7A 2I0CA 1P1WA 4ELOA 1EH3A 2Y84A 4KD5A 5IKBA 1JVXA 1O64A 3QUJA 4FEBA 1LCFA 3G3JA 5AA3A 2D5WA 3RNNA 2THIA 4QSCA 1Y3PA 3IX1A 3PPPA 1IXCA 3IJXB 2R6GE 3H4ZA 3OO6A 2XXXA 4ND9A 3MWBA 3DELB 3QXMA 1B7ZA 1TFAA 3U1OA 3MVZA 3F11A 1LAFE 3G3IA 1MY3A 5TP9B 3FXQA 2Q88A 3CG1A 2QMWA 1NH8A 4H67A 3K0VA 1NNKA 1TFDA 1SQYA 3MC2A 4X1DA 5BUUA 3N6UA 5AA2D 4GLIA 4QFPA 3TYHA 1I6QA 4GFRA 4GL8A 1FCKA 4JSDA 5ELVA 2QS3A 1IEJA 1P1OA 3QIMA 4POWA 4EQ7A 1MRPA 1GR2A 1GV8A 4IY6A 4NWCA 4PFTA 4KHZE 4UA8A 3W15C 4NF6A 1YPNA 5I2KA 5CMKA 1Y9UA 4U23A 3EQ1A 3KN7A 1PBQA 2OCUA 3OELA 1UTBB 2PX1A 3IORA 2O84X 3M3FA 4IGTA 4NTLA 2XX7A 3RPWA 3OO8A 4EQBA 2NVUB 1URSA 4ZZAA 4K3FA 4F39A 2X7PA 3K01A 4GWOA 4DXBA 4KCDA 3OMBA 3SEYA 1QVSA 2I3WA 2DE4A 1MQJA 3HCQA 4OYVA 1B32A 3UGWA 3D4CA 3HHGA 5AE4A 1P1QA 3VVEA 3S9MC 1N76A 3KOTA 2O51A 2H9BA 3TQWA 3CVGA 3TTLA 3V83A 1JW1A 4NEDA 3ODBA 3S4UA 3HO7A 3IB2A 1A8EA 4Z0IA 5L8DA 2ZYKA 3L6HA 5TU0A 3FVNA 5LOMA 3MP1A 2RF1A 1FTOA 3SETA 2VD2A 5AA2B 1D9YA 4GXAA 2DWAA 4ZE9A 2QPQA 4JBZA 3M8UA 2O69A 1XS5A 1FW0A 1RYXA 3G7WA 1VE4A 2XX9A 3D4GA 3V5AA 2UYEA 1NNPA 4R75A 4GRKA 1Y4CA 1RKMA 3H03A 3FD3A 5DEXA 4LUBA 3PPNA 4LZ7A 4FORA 1JNFA 3OSRA 1SW1A 3MW0A 4F18A 1YAEA 3MZ9A 1FQBA 1IXHA 1N7XA 1POTA 1MM7A 1DTGA 4F1UA 1QW0A 2Q2CA 2ZYOA 2H5YA 3GXAA 3O9PA 5BWJA 5JK4A 1SI0A 1US4A 2QMXA 3IO6A 4NWDA 3K1PA 3BBRA 3KGCA 1D3KA 3CFLA 1P1UA 2HCAA 4WEDA 5EHMA 3L6GA 1LAGE 1BP5A 3KEIA 1H43A 3IK6B 1BTJA 3FGSA 1MH4A 1ZIUA 5H8HB 4OEVA 3TCFA 3C36A 3TEPA 1UIUA 2QS1A 4G77A 1MM6A 3MUQA 1JVYA 1MH3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XEQA 2Y7KA 4GWXA 1MPBA 2V4CA 1II5A 1P1NA 1SW2A 2HFBA 2I58A 4JDFA 1AH5A 5DVIA 1PBPA 2XXKA 2A5TB 1MQGA 2UYFA 2ZNUA 2D3IA 3TCHA 2BJJX 3PPOA 3LSLA 2Y7PA 1QULA 3IFCA 5KCJB 2QVVA 1IXGA 1H44A 2F36A 4OENA 4PTKA 3W9VA 2KR0A 5ISUA 1MQHA 1MY4A 5IZ3B 2GHBA 4BDLA 2F97A 1SDXA 3Q28A 3USDA 4Z7EA 1D4NA 4X1BA 3ILUB 4MH5A 2UVIA 1MXYA 2DVCA 3PPQA 3VDFA 5T3JA 1B4ZA 1B5JA 3ZKKA 1B4HA 1FRPA 1MXVA 2KQZA 3IAZA 2O7UA 2HXWA 4XKQA 1DBZA 4KI0E 2NWJA 2D21A 3C33A 4I62A 2F34A 1KA1A 2Y7IA 4H8JA 3TZAA 2UXAA 1YYZA 2RCBA 3GLBA 4FBPA 3FVKA 3Q27A 1NL5A 2OWTA 4YKKA 2YPNA 1Y3NA 4I3YA 4IO4A 2VOZA 4QFKA 1PB8A 1VDWA 1K9YA 2AL4A 4U1ZA 1NV2A 3B6QA 1CNQA 3KZGA 1JEUA 2REJA 3H3GA 2DQVA 1B6HA 2ESNA 5ICQA 4NGUA 1LGBC 4PE3A 2F7BA 1HSEA 2QFLA 3G3HA 1JW5A 4NHBA 4JVIA 1B3HA 5ET6A 3K6UA 3T66A 3UP9A 4GVOA 4P9KA 4NF6B 3PUXE 5I2KB 4H8IA 2VP1A 4F1YA 4OWDA 1FPGA 2RC9A 2QJEA 2P1SA 1EYJA 3W9WA 1YCJA 3TUSA 4O7IA 2O6AA 2PMSA 2H98A 4OZ9A 3TKDA 3EHSA 3ZS6A 3O97A 1NUWA 3T0JA 2RKMA 4ZZEA 4IO6A 3V8XB 4MHFA 4N17A 1MPCA 1QUJA 1UTHA 2XHDA 1JETA 1B3EA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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