1FLUA

Hen egg white lysozyme mutant with alanine substituted for glycine
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDARTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Gallus gallus
publication title Relationship between local structure and stability in hen egg white lysozyme mutant with alanine substituted for glycine
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1fluA00
4H9CA 1GE4A 4KPMA 4H91A 5A3EA 1GBZA 3ULRA 4LT1A 3TXKA 4NHQA 2LZ2A 4RLMA 5F14A 4H94A 1CKDA 1LZTA 1KIQC 1HMKA 4XYYA 1I56A 3P66A 5APDA 4M6DA 1QDTA 1HENA 4DDAA 2BQGA 1LSZA 4WG7A 3B0KA 1XGQC 2FBBA 1FLYA 1JKAA 1IEEA 5APCA 1C08C 4DWXA 1WQMA 1JTTL 1LSNA 3LYOA 4H9FA 1C10A 5FHWA 8LYZA 2ZWBA 4LZTA 3W6EA 2G4NA 4RW2A 1NBYC 1UIEA 1OUHA 4LGKA 2HUBA 2DKVA 1B9OA 1BWJA 1D6QA 1F0WA 1V7TA 4H1PA 4PRQA 4XJGA 1IX0A 2YSSC 5B1GA 2ZNWY 4A7DA 1YAPA 3ZVQA 1QIOA 4BAPA 4DDBA 1WQNA 1LSGA 3SP3A 1YROA 1OQMA 1XGRC 4MSTA 1CJ7A 4TTDA 1GFTA 3A96A 1OUDA 1GBWA 4DDCA 1IP2A 1GF9A 1BVXA 1JPOA 4N8ZA 1GB0A 3N9AA 4CGEA 3HBEX 3GXKA 2C8PA 3CSRA 3AGGG 4DT3A 4NHIA 1JITA 1UIBA 3TXDA 1D6PA 1ZVYB 3ATOA 5D5FA 1B5UA 3HFMY 1LHHA 1TEWA 2MEFA 2BLYA 1FLQA 2ZQ3A 3T6UA 1VDSA 1GFUA 1OUCA 3ZEKA 5J7CA 1HEPA 3E3DA 1LPIA 3K3TA 1IR9A 1YKXX 3WVYA 1ZMYL 4HPIA 1KXYA 4RLNA 1B7LA 1CKHA 1GF8A 2A7DA 5LVGA 1BGIA 3RT5X 4NWEA 4WO9A 5KXRA 1LSPA 4LFXA 1LJGA 5HNCA 1IWVA 2HEEA 2YBNA 5ILFA 1OUBA 4NGZA 1LZGA 1PS5A 4R0FA 3A6BY 1UICA 1SLYA 1IWYA 1GB7A 1REZA 3G3BB 3P64A 4NFVA 4EOFA 2Q0MX 1GE0A 2BQHA 3TMVA 3P4ZA 1HEMA 4WM1A 1UCOA 1LJIA 3CB7A 1LSAA 4HV2A 4L41A 4OW1A 1NKHA 4NWHA 1LZ4A 4WLDA 1RCMA 4ETBA 5LXWA 3RW8A 2NWDX 1EQEA 2XBRA 1HEWA 5E9RA 135LA 4NG1A 1GFEA 4C5FA 2DQJY 4GLVA 3ZVQB 4GCEA 4Z98A 3FI7A 2YBHA 1J1OY 4RDSA 5M1YA 3TXFA 1F10A 2A7FA 1SQ2L 4H9AA 4QY9A 1EQ5A 1GFKA 5KXMA 1LHJA 2XBSA 1HSWA 208LA 1JHLA 4CJ2A 4N1EI 5EBHA 3KAMA 3RU5A 4XENA 2BQLA 3T36A 4GCFA 4YOPA 2D4JA 5L9JA 1FKQA 1C43A 1UC0A 1LHIA 4UWVA 1PZYA 3WPKA 1TDYA 4OWAA 1IR7A 4LT0A 1IC7Y 1FBIX 4ZFPA 1JSEA 1G7JC 1XFPL 2BQNA 3IJUA 1GFRA 4WM4A 1YAQA 4B4JA 1FKVA 4ET8A 3LN2A 1IY4A 2N5ZA 5L3HA 2BQMA 1GB6A 1GDXA 1JSFA 2BQOA 4FDYA 4DD7A 1DI4A 2PC2A 5FDJA 4LYTA 1H6MA 4HV1A 4OWHA 4QEQA 2ZYCA 2DQGY 3P65A 3EBAB 3AYQA 1IP1A 1IOTA 1IY3A 1LZEA 1GF4A 2RSCA 2ZIKA 1HMLA 5FEKA 5I5QA 1WTNA 2MEHA 1IP6A 1AT5A 1LHLA 1C7PA 3QNGA 1TAYA 4H8YA 2FBDA 1DKJA 1D0LA 1JKDA 2HEAA 2H9KA 4HPEA 5DLAA 1NDMC 1LZ8A 4J1BA 4GCDA 4QDNA 2BLXA 3WVXA 1T3PA 1C46A 5B05A 1B5XA 1B7OA 2HEFA 1AT6A 1REXA 2X0AA 1REMA 2W1XA 1YAMA 2BAAA 3AZ6A 3FE0A 1D0KA 1IP5A 1IIZA 1IC5Y 1WQPA 1ZVHL 1GF0A 2FYDA 1VAUA 4NSGA 1IP3A 1MLCE 3TXGA 3M18B 1YILA 4WG1A 2BQIA 4WM5A 2ZILA 1YIKA 4BS7A 4N9RA 153LA 2F2NA 2AUBA 5LA8A 3EO5A 2EKSC 1GFGA 3WW5A 4LYZA 1GXV2 1ZV5L 2D6BA 1QUTA 2DQIY 4H93A 2YBMA 3N9EA 5FELA 1LYSA 1F6SA 4OWBA 4NSIA 4TWSA 3D9AC 5I4YA 1N4FA 1CKGA 5LAGA 1IWXA 3LYZA 4B4IA 1QQYA 2HEDA 1HNLA 1ALCA 1LSFA 4UWUA 3MGWA 4NIJA 1B7SA 5JENB 1XGTC 2W1YA 2ZYPA 4RW1A 3A34A 2LYOA 2MEBA 5B06A 1J1XY 3M3UA 2WARA 3WYHA 1LYYA 2CDSA 4LYBA 1WQRA 1CKCA 1J1PY 3LHMA 4OWEA 3LYMA 4ZIXA 9LYZA 1HELA 4KT3A 1CJ8A 1JIYA 4OOTA 4O34A 1OUAA 5FCPA 1E8LA 1GWDA 1UUZC 1VFBC 3AJNA 4G4HA 4PGJB 5F9UA 4E3UA 4ANRA 1V7SA 4LYOA 4YEMA 5KXKA 2DQEY 4NGJA 1GF6A 1LSMA 1QUSA 3A92A 4GCCA 4QGZA 1O23A 1IOQA 1YAOA 5E4PA 4WM6A 4UWNA 3RZ4A 1OUGA 5HLLA 2Z19A 1XGUC 4HJYA 2HU1A 4NHTA 4B0DA 1DQJC 1W08A 4LYCA 4TUNA 4G4BA 4NSJA 1GBYA 1JJ3A 1WQOA 5D5CA 1LSDA 1NHEA 1UA6Y 2H9JA 4BAFA 4NGIA 2I6ZA 4HJVA 4GN5C 1YANA 2G4PA 132LA 1B5VA 1GBSA 1XEKA 5DN5A 1Z55A 5LYMA 1A4VA 1HEOA 2ZIJA 5KKJA 1OUJA 1B5YA 1LOZA 1I1ZA 1LZ5A 1RJCB 4YEOA 1EQ4A 1QSAA 2D4KA 5KXXA 1GEZA 1LZ6A 1GDWA 1HFXA 4WLXA 5KXNA 5LAFA 4HP0A 1HF4A 1NWGA 4NGKA 3A6CY 3AGHA 1F6RA 3J6KA 5I4XA 3TXEA 5KXLA 3AW6A 1KIRC 4KXIA 4MCKA 4PJ2C 4DD9A 2EPEA 1BWIA 2BQKA 1KXWA 4NGYA 2I26L 3HBHA 5LVKA 4ETCA 1CJ6A 1NBZC 1LZNA 2DQAA 1D9UA 4H9IA 5L3IA 1LYOA 1GAZA 1JISA 1NDGC 3WH1A 2IHLA 3AZ5A 1A2YC 4CFPA 1AKIA 2F4GA 3HBDA 1REYA 1LMPA 1LZCA 4OOOA 2MEEA 3W6AA 1DZBX 4HSFA 1VDTA 4P2EA 3CSQA 4HTNA 4R6CA 5IDDA 4WO6A 1LMOA 4OWCA 4DYGA 4YF2A 1AM7A 3A8ZA 3TXJA 1XEJA 1D0MA 1GHLA 2LHMA 5FSTA 1IORA 1JKCA 3N9CA 1FN5A 3ATNA 4G49A 1QDRA 4ML7A 1RFPA 1BB7A 3WUAA 2VB1A 3IJVA 4H90A 5LA5A 1H87A 1YKZX 1B5WA 5AMYA 3A91A 1B5ZA 5DM9A 2HEBA 3WPLA 2DQFC 1GFHA 1DKKA 4I0CA 3CT0A 3BKHA 4NGLA 3TXHA 4U3XB 1LYZA 4XJDA 3BKVA 3WU8A 1LJNA 5F9XA 5KJ9A 4HTQA 7LYZA 5F16A 4XJBA 1BVKC 4WLYA 4XN6A 4W96A 4W94A 5HMJA 3W6DA 1KXXA 1LJ4A 1HFZA 1GB5A 4NGOA 1DXJA 2Z38A 4TSBA 1HC0A 4NSHA 4PRUA 1GFJA 1VDPA 1VATA 1TBYA 1FDLY 1HHLA 4II8A 4WM3A 1LJHA 1GB2A 1OP9B 3RNXA 4XADA 3D3DA 1XSFA 5KXOA 3A93A 3G3AB 3TXBA 3OK0A 3WUNA 4D9ZA 3AZ7A 1B0DA 3WULA 4BADA 3OJPA 4TSCA 4GN3A 1GD6A 1GBXA 1IWZA 4Z46A 1VDQA 2I25L 193LA 1CKFA 1WVVA 3A67Y 3B0OA 1WVUA 5F81A 3TXIA 4CFOA 4IJ4A 4H9HA 1JEFA 2BQEA 2F4AA 2G4QA 1GFVA 2MEDA 4X3BA 4CHXA 4DC4A 3A90A 3EXDA 1LMCA 5KXYA 1HSXA 1IO5A 4J0LA 2BQDA 1LMAA 1YQVY 1LZ1A 4LT3A 4GN4A 1UACY 4N0JA 1XGPC 4IATA 3WUMA 5ILCA 3WMKA 1KIPC 1B7MA 1IP4A 2YBIA 4HJZA 1GB9A 207LA 4AXTA 4DD2A 5APFA 1CJ9A 2YVBA 1OUEA 4XJIA 2EIZC 4GCBA 1G7LC 5B07A 2LYZA 4AGAA 3B72A 1JTPL 2MEIA 5KXSA 2CGIA 1BWHA 4ETEA 1BHZA 4WL6A 1JWRA 133LA 3F6ZA 4LFPA 4H9EA 4NG8A 1UIDA 4WL7A 1UIHA 2Z18A 3TMXA 5HQ1A 3B6LA 3A3QA 4NY5A 1P2CC 3AZ4A 1INUA 1BB4A 5HNLA 4H8ZA 3LZTA 3QY4A 4WMGA 1LMNA 5KXTA 1LHKA 1OUIA 1GF3A 2Z39A 5LVJA 3CQLA 4XJHA 6LYTA 5DN4A 1LJKA 4KL7A 1IWTA 4Z3MA 4HTKA 1AZFA 1CNSA 4PHIA 4WLTA 6LYZA 1EL1A 2XJWA 3B0IA 5KXPA 4B4EA 4J7VA 1BB6A 4ETAA 2HECA 1DPWA 1IC4Y 1GE2A 4DD1A 1JTOL 4ETDA 1QTKA 2LZTA 5LYTA 1GFAA 1LJ3A 2MECA 1WQQA 1QSWA 1LCNA 3P68A 5DL9A 4H9BA 1YL0X 4C3WA 1TCYA 5I4WA 1RE2A 5KKIA 4DD0A 5LINA 4LT2A 1LKSA 3LYTA 1IOCA 2W1LA 1UIFA 4Z41A 2BQAA 2DBTA 4G4CA 1UBZA 2H5ZA 1G7IC 1LSYA 3TMWA 5LIOA 3GXRA 1JKBA 4GLAA 4NHPA 3A94A 1LJEA 1LTMA 1LZDA 1LZ9A 4H92A 4NGWA 5LYZA 3W6FA 1VEDA 4DD3A 1LSEA 2D4IA 1YKYX 4LYMA 3WXTA 2BPUA 2LYMA 1DI3A 3W6BA 1LMQA 4N5RA 4M4OA 1GAYA 5KXZA 5B59A 2C8OA 5K7OA 1G7MC 1LZYA 5IELA 4MR1A 2BQJA 5IHGA 1IOSA 1NQIA 1G7HC 2D91A 2EQLA 2Z12A 4NGVA 1BB5A 1NF5A 3A3RX 5KY1A 2Y8PA 1GB8A 3EMSA 1IVMA 1MELL 4EMNA 5C6LA 1JUGA 2DQHY 2DQCY 2FYCA 1I20A 2CWIA 2ZNXY 4ZEEA 5C6JA 1W6ZA 2Z2FA 1LZBA 4FJRA 3WPJA 1IWUA 4WOAA 3IWRA 1GBOA 154LA 4WM2A 1FLWA 4I8SA 1BQLY 134LA 3AW7A 3WU9A 2Z37A 5KXWA 1GE1A 1LZRA 1LZAA 5A3ZA 2BQCA 1GF7A 5LVHA 2HU3A 1LAAA 2YBLA 4J1AA 3WU7A 4B49A 2XTHA 1LZSA 5C6IA 1C45A 4IASA 1LJFA 2ZQ4A 1LSCA 1GPQC 4YENA 1B7RA 1NMMA 1IWWA 2IFFY 2MEAA 3WL2A 3WW6A 1LJJA 3W6CA 2HTXA 2B5ZA 5II3A 1JJ0A 1GB3A 2MEGA 1UIAA 3CT1A 4N1CC 4TX7A 3W3EA 5T3FA 1GEVA 3WXUA 5I54A 5I53A 2GV0A 4ET9A 4NEBA 1B7PA 2BQFA 2CJLA 1RI8B 2W1MA 1LSBA 2YDGA 4G9SA 3CT5A 3J4GA 3A95A 5B1FA 4YM8A 1HFYA 1GXXA 1WTMA 1LKRA 1IR8A 1QTEA 2DQDY 1B7NA 1DPXA 2Z2EA 1B7QA 1T6VL 1HEQA 4NHSA 3AB6A 4XJFA 3LZ2A 3VWOA 1YL1X 194LA 1LHMA 3CSZA 3QE8A 1GF5A 2BQBA 1OUFA 5APEA 5HMVA 4H8XA 1BB3A 1B2KA 1GE3A 5LVIA 3TMUA 1XEIA 3AGIA 2YBJA 2F30A 4B1AA 1LMTA 1IP7A 1FLUA 4PPOA 1DI5A 1JJ1A 1UIGA 1HERA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H9CA 2F2QA 1GE4A 4H91A 3HTFA 5A3EA 4ARMB 2XQOA 4LT1A 1L27A 4XYYA 1HMKA 1WTHA 3P66A 1L18A 2BQGA 1LSZA 3B0KA 2FBBA 1FLYA 1C08C 3LYOA 4OO9A 4LZTA 1L62A 5LAFA 1F0WA 2B6ZA 4XJGA 1T97A 1YAPA 3ZVQA 1ZURA 3SP3A 4MSTA 1CJ7A 1GFTA 251LA 1OUDA 4DDCA 1IP2A 4DAJA 1L08A 244LA 1L29A 2C8PA 3CSRA 3AGGG 4DT3A 4NHIA 1L89A 3FA0A 5D5FA 1B5UA 2MEFA 2OU8A 5J7CA 1L20A 3NY9A 2A7DA 3NY8A 4I7LA 1L65A 3RT5X 4WO9A 1PQIA 5HNCA 1IWVA 1LZGA 1PS5A 2OEAX 3C82A 254LA 126LA 1P2LA 245LA 1IWYA 2QARC 1REZA 4NFVA 2Q0MX 1GE0A 4WM1A 1UCOA 1LJIA 4L41A 1NKHA 4WLDA 1HEWA 135LA 4RDSA 3TXFA 1F10A 4H9AA 4QY9A 1LHJA 3QAKA 4EKSA 3RU5A 3GUKA 2LC9A 2D4JA 2B72A 2RH1A 4LT0A 1IC7Y 4ZFPA 3IJUA 4I7JA 1YAQA 3SB5A 4ET8A 127LA 3LN2A 1IY4A 5L3HA 253LA 2BQMA 1JSFA 4DD7A 2PC2A 5FDJA 4LYTA 4HV1A 3P65A 1IP1A 1IOTA 2RSCA 3SB7A 1HMLA 1AT5A 1LHLA 4YXCA 257LA 5DLAA 4I7SA 190LA 4GCDA 1L49A 155LA 2RB0X 225LA 2X0AA 1B7OA 1REXA 2HEFA 2W1XA 1REMA 2OTZX 1P64A 1D0KA 2FYDA 1MLCE 1QUGA 192LA 4WG1A 2BQIA 4WM5A 2ZILA 164LA 2F2NA 2AUBA 3EO5A 1C6NA 2EKSC 3GUOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4H9C A;  1GE4 A;  4KPM A;  4H91 A;  5A3E A;  1GBZ A;  3ULR A;  4LT1 A;  3TXK A;  4NHQ A;  2LZ2 A;  4RLM A;  5F14 A;  4H94 A;  1CKD A;  1LZT A;  1KIQ C;  1HMK A;  4XYY A;  1I56 A;  3P66 A;  5APD A;  4M6D A;  1QDT A;  1HEN A;  4DDA A;  2BQG A;  1LSZ A;  4WG7 A;  3B0K A;  1XGQ C;  2FBB A;  1FLY A;  1JKA A;  1IEE A;  5APC A;  1C08 C;  4DWX A;  1WQM A;  1JTT L;  1LSN A;  3LYO A;  4H9F A;  1C10 A;  5FHW A;  8LYZ A;  2ZWB A;  4LZT A;  3W6E A;  2G4N A;  4RW2 A;  1NBY C;  1UIE A;  1OUH A;  4LGK A;  2HUB A;  2DKV A;  1B9O A;  1BWJ A;  1D6Q A;  1F0W A;  1V7T A;  4H1P A;  4PRQ A;  4XJG A;  1IX0 A;  2YSS C;  5B1G A;  2ZNW Y;  4A7D A;  1YAP A;  3ZVQ A;  1QIO A;  4BAP A;  4DDB A;  1WQN A;  1LSG A;  3SP3 A;  1YRO A;  1OQM A;  1XGR C;  4MST A;  1CJ7 A;  4TTD A;  1GFT A;  3A96 A;  1OUD A;  1GBW A;  4DDC A;  1IP2 A;  1GF9 A;  1BVX A;  1JPO A;  4N8Z A;  1GB0 A;  3N9A A;  4CGE A;  3HBE X;  3GXK A;  2C8P A;  3CSR A;  3AGG G;  4DT3 A;  4NHI A;  1JIT A;  1UIB A;  3TXD A;  1D6P A;  1ZVY B;  3ATO A;  5D5F A;  1B5U A; 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 3A3R X;  5KY1 A;  2Y8P A;  1GB8 A;  3EMS A;  1IVM A;  1MEL L;  4EMN A;  5C6L A;  1JUG A;  2DQH Y;  2DQC Y;  2FYC A;  1I20 A;  2CWI A;  2ZNX Y;  4ZEE A;  5C6J A;  1W6Z A;  2Z2F A;  1LZB A;  4FJR A;  3WPJ A;  1IWU A;  4WOA A;  3IWR A;  1GBO A;  154L A;  4WM2 A;  1FLW A;  4I8S A;  1BQL Y;  134L A;  3AW7 A;  3WU9 A;  2Z37 A;  5KXW A;  1GE1 A;  1LZR A;  1LZA A;  5A3Z A;  2BQC A;  1GF7 A;  5LVH A;  2HU3 A;  1LAA A;  2YBL A;  4J1A A;  3WU7 A;  4B49 A;  2XTH A;  1LZS A;  5C6I A;  1C45 A;  4IAS A;  1LJF A;  2ZQ4 A;  1LSC A;  1GPQ C;  4YEN A;  1B7R A;  1NMM A;  1IWW A;  2IFF Y;  2MEA A;  3WL2 A;  3WW6 A;  1LJJ A;  3W6C A;  2HTX A;  2B5Z A;  5II3 A;  1JJ0 A;  1GB3 A;  2MEG A;  1UIA A;  3CT1 A;  4N1C C;  4TX7 A;  3W3E A;  5T3F A;  1GEV A;  3WXU A;  5I54 A;  5I53 A;  2GV0 A;  4ET9 A;  4NEB A;  1B7P A;  2BQF A;  2CJL A;  1RI8 B;  2W1M A;  1LSB A;  2YDG A;  4G9S A;  3CT5 A;  3J4G A;  3A95 A;  5B1F A;  4YM8 A;  1HFY A;  1GXX A;  1WTM A;  1LKR A;  1IR8 A;  1QTE A;  2DQD Y;  1B7N A;  1DPX A;  2Z2E A;  1B7Q A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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