1FLWA

Hen egg white lysozyme mutant with alanine substituted for glycine
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPASRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Relationship between local structure and stability in hen egg white lysozyme mutant with alanine substituted for glycine
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1flwA00
1UUZC 2ZQ3A 4N0JA 1HERA 1YL1X 4GLVA 1QDRA 1IVMA 4Z41A 4HP0A 1F6RA 3W6CA 2H9KA 3A95A 2FBDA 2C8OA 2F4AA 4H93A 1BB7A 4G4CA 5IELA 4HV2A 5B07A 3WUMA 1LSZA 4KXIA 1IOSA 1IY4A 3CT1A 3TXBA 1FN5A 5I5QA 2Z37A 1XEJA 3LHMA 5T3FA 1BVXA 1JIYA 1DI4A 5E9RA 4M4OA 1QTEA 1LCNA 4YEMA 4LZTA 2DQJY 5B06A 4H8YA 3W6BA 4ML7A 2BQLA 1D6QA 3A90A 4H9EA 1LSCA 1LJFA 1WQPA 2BQBA 2C8PA 1YAMA 1LAAA 3CSRA 4DWXA 1JKBA 1LZ8A 3LYZA 2HU3A 3EXDA 4ETAA 4J7VA 2Z38A 3ATOA 1UACY 2Z2FA 1GFRA 2F30A 1IP7A 4WM5A 4OW1A 4NHTA 4DT3A 1CJ8A 5FCPA 1BQLY 3A6BY 4DD2A 3EBAB 5IDDA 1IR7A 1OUAA 1OUCA 1VDSA 1HNLA 2LHMA 4QEQA 4G4BA 4H9IA 4ZEEA 1UIBA 1OUEA 3SP3A 2Z12A 2WARA 1YQVY 1LYSA 1LZGA 2ZNWY 1QTKA 134LA 2HEBA 4C3WA 5L9JA 2BQEA 3LYOA 1HEQA 1GF9A 1GFTA 5KKJA 5LVHA 2BLYA 2IHLA 1LMOA 1GF4A 2BQNA 1VDQA 2HTXA 4WM3A 1LZBA 1G7MC 5LVIA 5KXWA 4ETEA 5AMYA 1O23A 3HBEX 2MEDA 1DKKA 5B05A 1LHHA 1JTPL 2W1MA 1LJ3A 1SQ2L 3LYMA 4NGLA 1OUHA 1HMKA 1GBOA 3B0KA 4MCKA 4PGJB 1LKSA 1LTMA 1ZVYB 1GE3A 1IWWA 4NGJA 1B2KA 2DQIY 4H8ZA 5EBHA 1DXJA 1TDYA 4GCFA 6LYZA 1CJ6A 1VATA 3CSZA 1LYOA 1LMNA 1GFGA 3A6CY 4ETBA 1PS5A 1YILA 3CB7A 5B1FA 1WQRA 5LAFA 2H9JA 4LYCA 1UBZA 1B0DA 1F10A 1HF4A 2IFFY 2ZILA 4RW1A 4U3XB 2MEAA 1LZCA 1D6PA 2X0AA 4DDAA 3AZ7A 1YROA 3F6ZA 1KXYA 4G9SA 1HSXA 1GF6A 4RW2A 1JITA 1XEIA 3RNXA 1IY3A 4NHSA 1LHIA 3TXEA 3WXTA 5JENB 5KXRA 3LN2A 4H9BA 1LJGA 3TMWA 1IP2A 1DI5A 1HHLA 1XGRC 7LYZA 1LZ5A 1NMMA 1OQMA 5KXNA 1LZSA 4UWVA 5HNCA 1JKDA 1GD6A 2DQEY 5LA5A 1HENA 2I25L 5KXKA 1ZV5L 4BAFA 4J1BA 1WQMA 4WLTA 1DZBX 5II3A 2YBLA 2DQGY 1WVVA 3T6UA 3A8ZA 1G7IC 2HECA 3A34A 1DI3A 5DL9A 4H9CA 3TMXA 1GF5A 4NWHA 4B1AA 132LA 1QQYA 1ZMYL 1FLYA 2YBIA 1B5YA 1A4VA 1IWVA 3QE8A 5B1GA 4NSJA 4RLNA 3CSQA 1CKCA 3RT5X 2HEFA 4LFPA 4IATA 2MEGA 1GB5A 3RZ4A 4DD7A 4HPIA 1FDLY 4WMGA 1GE4A 1XGPC 5LVJA 3KAMA 5FSTA 1GBXA 1J1OY 3TXFA 1IOTA 4NSGA 1GDWA 3WPLA 1B7PA 5APEA 2D91A 1FKVA 2CGIA 2MEIA 5F14A 3A92A 1B7LA 4WG7A 1H6MA 207LA 1QIOA 5KXSA 2Z19A 5KXZA 1QSAA 2EKSC 2XBSA 4ETDA 1AT6A 1J1XY 1LYZA 3CT5A 3A67Y 2BQDA 3A96A 5A3ZA 3HBHA 4TTDA 1G7LC 2BQMA 5DN4A 1AT5A 3FI7A 3TXKA 3W6FA 1C45A 1GFHA 1JTTL 4IASA 6LYTA 5LVGA 2DKVA 4CJ2A 1MLCE 2YBMA 1T6VL 5F81A 4PRQA 1UCOA 1LJ4A 1GPQC 1VDTA 1YAOA 1B7NA 5L3HA 1QSWA 1VEDA 3AZ5A 1GB3A 4XJBA 2DQFC 4QDNA 5L3IA 4WM1A 4WLXA 2Z39A 4H1PA 1VDPA 1IOQA 1B7SA 2BLXA 3G3AB 4XYYA 2EQLA 3HBDA 4H91A 3ZVQA 1OUFA 1XEKA 4GCBA 3WW6A 1OUGA 5LYTA 1GAZA 3AZ4A 5KXTA 5IHGA 3P66A 5FEKA 1V7SA 2XBRA 5LINA 4BADA 1BWJA 4NG8A 4Z98A 4QY9A 3FE0A 1QDTA 4TSBA 1IP1A 1C10A 4PRUA 1G7HC 3P64A 3TXJA 3WW5A 3WYHA 4TSCA 2F2NA 4RDSA 5KXMA 4WL7A 5DM9A 4CFPA 1UIHA 1IWUA 1GWDA 1B5XA 3P4ZA 4H94A 1LZ1A 5ILFA 4XN6A 2BQGA 1F0WA 4NY5A 2W1XA 1B5UA 4GN4A 4P2EA 1T3PA 2Y8PA 1IP3A 5F9UA 1UA6Y 2EPEA 1IR9A 1LZ4A 3LYTA 4YENA 3TMUA 1XGQC 3IJUA 1OUJA 2ZQ4A 4ET9A 154LA 1IWZA 1EL1A 4E3UA 3GXKA 4H90A 1EQEA 2CWIA 3AB6A 4WO9A 1GB9A 1BB3A 5I4YA 1REMA 3B72A 1NQIA 1LYYA 1XGUC 1LSAA 1AM7A 1UIDA 3BKHA 3TMVA 3RU5A 4L41A 2FYCA 3LZTA 3VWOA 4B4IA 5M1YA 4MSTA 2W1LA 208LA 2YDGA 1LJEA 1YAQA 4LT2A 5B59A 3GXRA 3T36A 1YKXX 4WM6A 1DKJA 4DD0A 5KXOA 3AYQA 3ZEKA 4KT3A 4HTKA 1JKAA 4HJVA 4LYOA 4HTQA 4AXTA 3W6AA 3WU8A 2MEFA 2VB1A 4GLAA 2ZYCA 3WH1A 1KIRC 1LZEA 1C46A 1GAYA 1LMPA 3N9AA 1IP6A 1LZRA 3M3UA 3HFMY 1GEZA 1B5WA 4LYMA 4NEBA 4LYTA 1NDMC 1JHLA 1JKCA 1P2CC 2BQKA 1TBYA 3WMKA 1HC0A 5J7CA 2GV0A 4HJZA 3J6KA 3QY4A 1GB2A 2DQCY 5FDJA 2MEHA 1LJJA 4HPEA 2PC2A 1LSEA 1JISA 2Z2EA 4B49A 1LMAA 2H5ZA 2MEEA 4NGKA 1QUSA 2LYOA 1B7MA 1LHJA 3P65A 1UC0A 5HMJA 5A3EA 8LYZA 4NGVA 1LMCA 1EQ5A 2BQOA 1D9UA 5LIOA 5DLAA 2HEDA 1GBZA 1CJ7A 1J1PY 2LZ2A 4NGYA 2BQIA 3RW8A 1GB6A 5ILCA 2BQFA 1B7QA 1WVUA 3CT0A 4PPOA 4YM8A 3W6EA 1GF3A 2D4JA 1LSYA 2XTHA 3EO5A 4MR1A 1NDGC 5HMVA 2G4QA 4KL7A 2W1YA 2XJWA 2YBHA 4HJYA 3J4GA 135LA 1IWTA 1LMQA 2HEAA 4WLDA 4WM4A 2DQDY 5C6LA 5I4XA 1XSFA 4M6DA 1GE1A 1FLQA 1C43A 5LVKA 3WPJA 4XJIA 4FJRA 3MGWA 2HU1A 2ZIJA 1B7RA 3A91A 4AGAA 2CDSA 2A7DA 1AKIA 3D3DA 1BB5A 5KKIA 1IWXA 4DD3A 1DPWA 5LYZA 1IC5Y 4N8ZA 1FBIX 194LA 2D4IA 2YBNA 5KXLA 1LZ9A 1FLWA 4NGWA 1IORA 1JEFA 9LYZA 1HFZA 1YANA 1GE0A 2BPUA 3P68A 1D0LA 3G3BB 4LT0A 4G49A 1JWRA 1HFYA 3AGHA 1REYA 4OWEA 1LJIA 1GXV2 4N9RA 1YAPA 2I26L 1VAUA 4XJHA 2Q0MX 5C6IA 2BAAA 4H9AA 5KXYA 4DYGA 4Z3MA 1LSGA 1ZVHL 4WG1A 1REZA 1CNSA 3WU9A 2DBTA 3AW7A 1AZFA 1RFPA 4N1CC 4DC4A 4YF2A 5LA8A 1TCYA 3D9AC 1UIEA 1LSBA 1IEEA 4DD9A 1CKFA 1IIZA 1MELL 1SLYA 1LZAA 1A2YC 1B5ZA 1JUGA 5I54A 5FHWA 1HEMA 3OK0A 4A7DA 5LAGA 1B5VA 1KIPC 1YKYX 2HEEA 3A3RX 3AJNA 1BGIA 4I8SA 1IP5A 1GE2A 1B7OA 1F6SA 1HEOA 1KXWA 133LA 1JSFA 1PZYA 4LT3A 5KY1A 1UIAA 2FYDA 5FELA 1RCMA 2LYZA 3TXIA 1IR8A 1IO5A 5I53A 1LSMA 1OP9B 2DQAA 1XGTC 1GFUA 2G4PA 4LYZA 5KXPA 4GN5C 4HTNA 1UICA 5KJ9A 1KXXA 4B0DA 1W6ZA 2Z18A 1GDXA 1CKGA 4OWAA 4UWUA 4UWNA 2EIZC 3ATNA 1BB6A 3WUAA 4IJ4A 4NG1A 1IC7Y 4NGIA 5C6JA 4NGOA 3A3QA 1XFPL 1YL0X 1GFJA 3TXGA 4OWHA 4II8A 2BQJA 5LYMA 3K3TA 4GCDA 5APCA 1QUTA 1LHKA 4OOTA 1G7JC 4I0CA 1OUDA 4NWEA 4WL6A 153LA 5E4PA 1E8LA 1FLUA 1OUBA 3TXHA 1LHLA 1GFEA 1GBYA 3N9CA 3WPKA 4J1AA 1WTNA 2CJLA 1LSDA 1V7TA 1LSPA 3AW6A 4XJGA 1INUA 1LMTA 4NIJA 5D5FA 2RSCA 4BS7A 5D5CA 4XADA 5HNLA 1LPIA 3IWRA 4R0FA 4ET8A 1DPXA 1JJ3A 5HQ1A 2ZYPA 4C5FA 1GB8A 1I20A 1UIFA 4EOFA 1H87A 5DN5A 1NBYC 4RLMA 3TXDA 2ZIKA 1LSNA 1LZNA 1LZTA 3M18B 1GFAA 1CKHA 4OWBA 1KIQC 1I1ZA 1LJKA 1LKRA 1GF7A 2NWDX 4H9HA 4WOAA 4ETCA 4NSHA 4PHIA 1GHLA 2D4KA 1GB7A 1C08C 3WUNA 3E3DA 4NHIA 2ZWBA 1NF5A 1LJHA 1RI8B 5HLLA 1REXA 1LOZA 3IJVA 4G4HA 4CHXA 4DDCA 2BQHA 1LSFA 4J0LA 4NSIA 3WL2A 4CGEA 2MECA 4NHQA 1GF0A 1JTOL 1BHZA 1HELA 4GCCA 1LZYA 2MEBA 4GCEA 4H8XA 3ULRA 4TUNA 1LJNA 1WQQA 4LGKA 1C7PA 193LA 1EQ4A 4CFOA 4DD1A 1IX0A 2LZTA 2F4GA 3CQLA 2A7FA 4XJFA 1JJ0A 1YKZX 1D0KA 1NWGA 4BAPA 1LHMA 1HEWA 2LYMA 1D0MA 4OOOA 4TWSA 4ZFPA 1NBZC 5I4WA 1IP4A 3WXUA 1HFXA 1JJ1A 1GFKA 2YVBA 1HSWA 4WO6A 4WM2A 1CKDA 3AZ6A 1YIKA 3LZ2A 1GF8A 1UIGA 1VFBC 3EMSA 5KXXA 4B4EA 4N1EI 1BWIA 1CJ9A 1N4FA 4NHPA 1I56A 4R6CA 4HV1A 4LFXA 4XJDA 5APDA 1IOCA 1LZDA 1Z55A 4TX7A 4XENA 4W96A 4H9FA 4HSFA 4LYBA 1ALCA 4GN3A 4O34A 4LT1A 4Z46A 2YBJA 1GBWA 1OUIA 3AGIA 4QGZA 4DDBA 2AUBA 1NHEA 2ZNXY 1TAYA 4EMNA 4NGZA 3AGGG 1TEWA 1IWYA 2N5ZA 4YOPA 2D6BA 5F16A 1W08A 1LZ6A 1GEVA 3WU7A 2FBBA 4X3BA 1NKHA 1GBSA 2B5ZA 4B4JA 3N9EA 4H92A 2BQAA 4OWCA 1WQOA 1BWHA 4YEOA 3WVXA 5LXWA 1BVKC 1RJCB 3W6DA 1GB0A 1IC4Y 3A93A 1RE2A 3B0IA 1WTMA 4D9ZA 1HEPA 1HMLA 2HUBA 1JSEA 4PJ2C 5F9XA 4ANRA 4W94A 5APFA 4NFVA 4WLYA 2G4NA 3QNGA 4ZIXA 3BKVA 1B9OA 1GFVA 1BB4A 3WVYA 1DQJC 2BQCA 3B0OA 1WQNA 3B6LA 5K7OA 3OJPA 4N5RA 3ZVQB 1FKQA 2DQHY 3A94A 4FDYA 2I6ZA 4KPMA 2YSSC 1GXXA 3W3EA 3WULA 1JPOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZQ3A 217LA 1HERA 4Z41A 3W6CA 260LA 2F4AA 4G4CA 3G3WA 195LA 5LZMA 209LA 1XEJA 1BVXA 1JIYA 2DQJY 4ML7A 1L48A 1C6MA 1C6AA 197LA 4DWXA 1LZ8A 3LYZA 3GUKA 2HU3A 3EXDA 4ETAA 3V2YA 2Z2FA 1GFRA 2F30A 2RAYX 4NHTA 4OW1A 1C61A 2F47A 1IR7A 1VDSA 1LGUA 4H9IA 4ZEEA 1OUEA 1G0QA 1YQVY 2ZNWY 134LA 5KKJA 1LMOA 1VDQA 1LW9A 130LA 4ETEA 1L40A 247LA 201LA 4NGLA 1CV1A 1CV3A 1GBOA 1LKSA 1ZVYB 1L54A 1GE3A 1B2KA 4GCFA 3CDTA 1SX2A 3CB7A 1WQRA 4LYCA 4W96A 4RW1A 196LA 252LA 241LA 1HSXA 4NHSA 1LHIA 3TXEA 3WXTA 3LN2A 3GUJA 7LYZA 1XGRC 5KXNA 1ZWNA 243LA 1GD6A 3HUKA 1L42A 1L71A 1WQMA 4WLTA 2DQGY 2HULA 1C6KA 1CU2A 1L21A 2Z6BA 3A8ZA 3A34A 3TMXA 1CUQA 132LA 1FLYA 3FADA 1A4VA 249LA 4NSJA 1CKCA 3RT5X 2HEFA 3DMVA 1FDLY 4WMGA 1QT5A 1XGPC 1IOTA 5APEA 2CGIA 1L94A 126LA 1C67A 2OE9X 1QSAA 2EKSC 1QTHA 2XBSA 1AT6A 3A67Y 1G7LC 1AT5A 1C45A 2XQOA 6LYTA 229LA 1CUPA 4CJ2A 1UCOA 1LJ4A 140LA 5L3HA 1VEDA 1GB3A 159LA 1KNIA 1VDPA 1OUFA 1XEKA 5FEKA 1V7SA 2XBRA 3PDSA 4TSBA 1C10A 1G7HC 3P64A 3TXJA 4RDSA 1L56A 1GWDA 1B5XA 4H94A 1LZ1A 4XN6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UUZ C;  2ZQ3 A;  4N0J A;  1HER A;  1YL1 X;  4GLV A;  1QDR A;  1IVM A;  4Z41 A;  4HP0 A;  1F6R A;  3W6C A;  2H9K A;  3A95 A;  2FBD A;  2C8O A;  2F4A A;  4H93 A;  1BB7 A;  4G4C A;  5IEL A;  4HV2 A;  5B07 A;  3WUM A;  1LSZ A;  4KXI A;  1IOS A;  1IY4 A;  3CT1 A;  3TXB A;  1FN5 A;  5I5Q A;  2Z37 A;  1XEJ A;  3LHM A;  5T3F A;  1BVX A;  1JIY A;  1DI4 A;  5E9R A;  4M4O A;  1QTE A;  1LCN A;  4YEM A;  4LZT A;  2DQJ Y;  5B06 A;  4H8Y A;  3W6B A;  4ML7 A;  2BQL A;  1D6Q A;  3A90 A;  4H9E A;  1LSC A;  1LJF A;  1WQP A;  2BQB A;  2C8P A;  1YAM A;  1LAA A;  3CSR A;  4DWX A;  1JKB A;  1LZ8 A;  3LYZ A;  2HU3 A;  3EXD A;  4ETA A;  4J7V A;  2Z38 A;  3ATO A;  1UAC Y;  2Z2F A;  1GFR A;  2F30 A;  1IP7 A;  4WM5 A;  4OW1 A;  4NHT A;  4DT3 A;  1CJ8 A;  5FCP A;  1BQL Y;  3A6B Y;  4DD2 A;  3EBA B;  5IDD A;  1IR7 A;  1OUA A;  1OUC A;  1VDS A;  1HNL A;  2LHM A;  4QEQ A;  4G4B A;  4H9I A;  4ZEE A;  1UIB A;  1OUE A;  3SP3 A;  2Z12 A;  2WAR A;  1YQV Y;  1LYS A;  1LZG A;  2ZNW Y;  1QTK A;  134L A;  2HEB A;  4C3W A;  5L9J A; 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 3CQL A;  2A7F A;  4XJF A;  1JJ0 A;  1YKZ X;  1D0K A;  1NWG A;  4BAP A;  1LHM A;  1HEW A;  2LYM A;  1D0M A;  4OOO A;  4TWS A;  4ZFP A;  1NBZ C;  5I4W A;  1IP4 A;  3WXU A;  1HFX A;  1JJ1 A;  1GFK A;  2YVB A;  1HSW A;  4WO6 A;  4WM2 A;  1CKD A;  3AZ6 A;  1YIK A;  3LZ2 A;  1GF8 A;  1UIG A;  1VFB C;  3EMS A;  5KXX A;  4B4E A;  4N1E I;  1BWI A;  1CJ9 A;  1N4F A;  4NHP A;  1I56 A;  4R6C A;  4HV1 A;  4LFX A;  4XJD A;  5APD A;  1IOC A;  1LZD A;  1Z55 A;  4TX7 A;  4XEN A;  4W96 A;  4H9F A;  4HSF A;  4LYB A;  1ALC A;  4GN3 A;  4O34 A;  4LT1 A;  4Z46 A;  2YBJ A;  1GBW A;  1OUI A;  3AGI A;  4QGZ A;  4DDB A;  2AUB A;  1NHE A;  2ZNX Y;  1TAY A;  4EMN A;  4NGZ A;  3AGG G;  1TEW A;  1IWY A;  2N5Z A;  4YOP A;  2D6B A;  5F16 A;  1W08 A;  1LZ6 A;  1GEV A;  3WU7 A;  2FBB A;  4X3B A;  1NKH A;  1GBS A;  2B5Z A;  4B4J A;  3N9E A;  4H92 A;  2BQA A;  4OWC A;  1WQO A;  1BWH A;  4YEO A;  3WVX A;  5LXW A;  1BVK C;  1RJC B;  3W6D A;  1GB0 A;  1IC4 Y;  3A93 A;  1RE2 A;  3B0I A;  1WTM A;  4D9Z A;  1HEP A;  1HML A;  2HUB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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